Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72537426	27894	26501	0.0034	NA	NA	NA	4.06042604953351e-182	72537426	72537426
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72574479	13	9	-2.9041	4.06042604953351e-182	72537426	72537426	1.06287320456221e-186	72574479	72574479
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72579311	72579311	1	0	NA	1.06287320456221e-186	72574479	72574479	NA	NA	NA
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	109987341	11688	11016	0.0011	NA	NA	NA	2.63673404034079e-08	109984914	109987341
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109988743	109989998	2	2	1.3543	2.63673404034079e-08	109984914	109987341	2.05080065836823e-08	109989998	109994195
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109994195	150839754	5870	5565	-0.0082	2.05080065836823e-08	109989998	109994195	5.02998893711045e-139	150839754	150839754
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150848509	6	5	-3.3947	5.02998893711045e-139	150839754	150839754	3.64127561196125e-143	150848509	150848509
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150851439	157133150	2762	2608	0.0038	3.64127561196125e-143	150848509	150848509	1.49018562498062e-26	157133150	157133150
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	2.3351	1.49018562498062e-26	157133150	157133150	7.94114309029387e-26	157136342	157136342
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	194978218	13296	12587	8e-04	7.94114309029387e-26	157136342	157136342	0	194978218	194978218
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195065867	9	9	-3.8454	0	194978218	194978218	1.03475761666550e-313	195065867	195065867
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	200609726	2161	2049	0.0065	1.03475761666550e-313	195065867	195065867	1.36245495883170e-09	200589108	200618814
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200612164	200678532	27	26	-0.3956	1.3624549588317e-09	200589108	200618814	5.85141434431318e-09	200668993	200701140
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200679934	246769018	17292	16374	-0.0055	5.85141434431318e-09	200668993	200701140	7.21249428016006e-42	246753652	246805521
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246794552	246864725	29	28	-0.7902	7.21249428016006e-42	246753652	246805521	4.04917229302609e-33	246862029	246882156
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246875016	246875016	1	0	NA	4.04917229302609e-33	246862029	246882156	NA	NA	NA
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246878405	247186514	95	92	0.0268	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	10917	0.0019	NA	NA	NA	0	34543992	34543992
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34579933	14	13	-4.1107	0	34543992	34543992	5.03768591061125e-06	34574224	34579933
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34580533	34589997	4	3	-2.0211	5.03768591061125e-06	34574224	34579933	4.33149041638259e-30	34589997	34589997
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	115249749	24590	23287	-0.0028	4.33149041638259e-30	34589997	34589997	2.57714599753373e-09	115244646	115249749
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	115251898	115258615	5	5	-0.9017	2.57714599753373e-09	115244646	115249749	5.19113399454182e-09	115258615	115261866
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	115260545	242689978	41692	39568	-2e-04	5.19113399454182e-09	115258615	115261866	NA	NA	NA
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	89475107	30641	29042	0.0015	NA	NA	NA	1.02762394384403e-29	89473678	89475107
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89477163	89502757	14	14	-0.9267	1.02762394384403e-29	89473678	89475107	7.03177100027755e-27	89502757	89504141
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89504141	99891210	1528	1457	0.0181	7.03177100027755e-27	89502757	89504141	3.15450856397551e-120	99891210	99891210
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-5.2062	3.15450856397551e-120	99891210	99891210	3.08911891030931e-133	99897201	99897201
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	163992903	21303	20152	-3e-04	3.08911891030931e-133	99897201	99897201	5.24238063217375e-40	163992903	163992903
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164027724	8	7	1.5369	5.24238063217375e-40	163992903	163992903	0.0065620260551643	164001657	164042397
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164112873	21	19	0.9154	0.0065620260551643	164001657	164042397	1.94806703233280e-39	164107951	164115417
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164115417	196835413	11132	10543	-0.0057	1.9480670323328e-39	164107951	164115417	2.15596506954002e-17	196809098	196905767
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196904349	196957322	28	28	-0.5154	2.15596506954002e-17	196809098	196905767	2.64447257558928e-14	196946355	196970927
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196958467	196958467	1	0	NA	2.64447257558928e-14	196946355	196970927	NA	NA	NA
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196961238	199329592	954	909	-0.0335	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	40330949	11507	10919	0.0024	NA	NA	NA	0.000112789603385118	40302176	40330949
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	40333097	40351270	7	5	0.5119	0.000112789603385118	40302176	40330949	2.91751819697737e-08	40351270	40351270
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	40354480	40371259	4	4	-0.098	2.91751819697737e-08	40351270	40351270	0.000146083425182697	40371259	40391129
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	40378413	40488847	35	32	0.4815	0.000146083425182697	40371259	40391129	3.53492549302261e-19	40473728	40503748
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	40492422	68899247	6878	6509	-0.0096	3.53492549302261e-19	40473728	40503748	8.37478173764e-19	68896316	68905670
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	68901210	69165814	16	15	0.7004	8.37478173764e-19	68896316	68905670	1.13393227395355e-17	69153675	69656183
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	88752705	6585	6255	-0.0015	1.13393227395355e-17	69153675	69656183	2.38976273317016e-07	88752705	88752705
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88754121	88756721	2	2	-1.2694	2.38976273317016e-07	88752705	88752705	3.36451483653906e-07	88756721	88757953
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88757953	107275274	6118	5803	2e-04	3.36451483653906e-07	88756721	88757953	6.19458243637548e-134	107275274	107275274
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107276428	107281410	4	3	-4.3016	6.19458243637548e-134	107275274	107275274	1.49561325352821e-137	107281410	107281410
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107283257	173660684	18679	17678	-0.0039	1.49561325352821e-137	107281410	107281410	1.96243760236867e-27	173660684	173660684
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	2.3737	1.96243760236867e-27	173660684	173660684	9.49897126141343e-29	173666072	173666072
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	187330240	4081	3900	-0.0015	9.49897126141343e-29	173666072	173666072	5.61875891108264e-07	187327270	187330240
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187338465	4	4	0.851	5.61875891108264e-07	187327270	187330240	1.37077222936637e-07	187338465	187346097
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187346058	191153613	1239	1181	-0.011	1.37077222936637e-07	187338465	187346097	NA	NA	NA
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	104294127	28965	27477	-0.0039	NA	NA	NA	4.51929409462337e-18	104292254	104294127
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	104300193	104325016	8	8	-0.97	4.51929409462337e-18	104292254	104294127	1.80901148289576e-18	104325016	104327699
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	104327699	127434789	6345	6011	0.0042	1.80901148289576e-18	104325016	104327699	1.80881649795755e-99	127434789	127434789
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	127436376	127438118	2	2	-4.4483	1.80881649795755e-99	127434789	127434789	5.11417773829657e-99	127438118	127438118
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	127439603	180644810	18446	17514	0.0027	5.11417773829657e-99	127438118	127438118	NA	NA	NA
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	32558677	11677	11034	5e-04	NA	NA	NA	1.7949848505404e-35	32558677	32558677
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32605300	10	9	1.2372	1.7949848505404e-35	32558677	32558677	1.69097752636047e-33	32605300	32609525
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32609525	74647491	13593	12895	-3e-04	1.69097752636047e-33	32605300	32609525	1.02779117549928e-101	74647491	74647491
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74650995	74653360	2	2	-4.5376	1.02779117549928e-101	74647491	74647491	1.81954410322424e-100	74653360	74653360
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74655219	103841482	7917	7524	-0.0055	1.81954410322424e-100	74653360	74653360	1.46343608017818e-142	103841482	103841482
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-3.8184	1.46343608017818e-142	103841482	103841482	3.02570450596272e-150	103868154	103868154
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	110498221	2256	2115	-0.0073	3.02570450596272e-150	103868154	103868154	9.90362950497493e-11	110490286	110498221
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	110503513	110520229	7	7	-0.7953	9.90362950497493e-11	110490286	110498221	3.32899204392039e-10	110520229	110521603
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	110521603	134629897	8217	7805	0.0016	3.32899204392039e-10	110520229	110521603	7.64037127537131e-08	134627341	134629897
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134631701	134635779	4	4	-0.9314	7.64037127537131e-08	134627341	134629897	5.04791857020044e-08	134635779	134639397
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134639397	165643653	10622	10101	-0.0034	5.04791857020044e-08	134635779	134639397	6.78076230262345e-25	165643653	165643653
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.5842	6.78076230262345e-25	165643653	165643653	8.32506046088409e-23	165650610	165650610
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1704	0.022	8.32506046088409e-23	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	176344	13	12	0.5846	NA	NA	NA	3.99515826095968e-09	159130	181901
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	178408	125831554	42425	40128	-4e-04	3.99515826095968e-09	159130	181901	1.22303859124103e-126	125831554	125831554
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-4.1361	1.22303859124103e-126	125831554	125831554	9.965453855353e-127	125837524	125837524
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	125839386	1	0	NA	9.965453855353e-127	125837524	125837524	NA	NA	NA
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125840585	141410894	7361	6982	-2e-04	NA	NA	NA	1.25719154774819e-07	141405145	141419692
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141435643	12	12	0.5282	1.25719154774819e-07	141405145	141419692	5.00247448411465e-07	141426846	141446728
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141438504	151728811	4272	4060	0.0028	5.00247448411465e-07	141426846	141446728	2.14574362688174e-08	151702948	151732266
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151730250	151747905	10	10	-0.6219	2.14574362688174e-08	151702948	151732266	5.74768922712547e-09	151743145	151755714
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151750057	158821263	2598	2438	0.006	5.74768922712547e-09	151743145	151755714	NA	NA	NA
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	25022606	8129	7733	0	NA	NA	NA	2.49981470542053e-10	25017905	25022606
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	1.2001	2.49981470542053e-10	25017905	25022606	8.53669323273612e-10	25039370	25057567
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	25047250	1	0	NA	8.53669323273612e-10	25039370	25057567	NA	NA	NA
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25057567	146264846	36433	34520	-9e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5152	7e-04	NA	NA	NA	1.23714642508564e-09	15799225	15802255
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	1.4217	1.23714642508564e-09	15799225	15802255	7.58885559240015e-10	15807123	15807123
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	70926188	7612	7213	-0.0035	7.58885559240015e-10	15807123	15807123	6.58895499459388e-08	70923005	70926188
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.2834	6.58895499459388e-08	70923005	70926188	2.16833137011462e-07	70930528	70930528
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	137352394	23765	22569	-0.0077	2.16833137011462e-07	70930528	70930528	2.67604292923951e-11	137352394	137352394
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.5562	2.67604292923951e-11	137352394	137352394	8.17569396295298e-10	137356880	137356880
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1042	-0.0188	8.17569396295298e-10	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9175	-0.0127	NA	NA	NA	3.30476354147242e-20	27038538	27038538
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-2.0408	3.30476354147242e-20	27038538	27038538	6.0861993596243e-20	27041812	27041812
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	47017598	4799	4571	-0.0184	6.0861993596243e-20	27041812	27041812	1.26403233630632e-31	46561216	47040444
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47021415	47117942	24	24	-0.7499	1.26403233630632e-31	46561216	47040444	2.24870993261921e-32	47110288	47125093
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47124718	77917893	10038	9489	-0.0037	2.24870993261921e-32	47110288	47125093	1.62235173144653e-59	77917893	77917893
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-3.4852	1.62235173144653e-59	77917893	77917893	6.54923275749602e-60	77928669	77928669
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	135285645	20214	19138	0.0016	6.54923275749602e-60	77928669	77928669	NA	NA	NA
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	55127355	16908	16005	0.0039	NA	NA	NA	9.57488216361662e-09	55093758	55140052
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55129329	55197848	30	29	0.3704	9.57488216361662e-09	55093758	55140052	6.20046847089286e-09	55187282	55221692
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55200744	134450318	28366	26887	0.003	6.20046847089286e-09	55187282	55221692	NA	NA	NA
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3561	0.0127	NA	NA	NA	4.02546082825045e-141	9523923	9528590
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9554149	5	4	-3.8912	4.02546082825045e-141	9523923	9528590	3.84770083365336e-05	9543817	9554149
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	9607363	10	10	-1.0833	3.84770083365336e-05	9543817	9554149	8.28001191253064e-28	9599999	9610054
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9610054	31079618	7393	7034	0.003	8.28001191253064e-28	9599999	9610054	5.02463403867475e-11	31058854	31084265
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31081498	31242528	23	23	-0.4556	5.02463403867475e-11	31058854	31084265	1.33783199726933e-10	31233136	31253273
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31245432	130694393	33342	31563	-0.0028	1.33783199726933e-10	31233136	31253273	3.35441504897695e-10	130694393	130694393
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	1.506	3.35441504897695e-10	130694393	130694393	7.03471909886221e-12	130701040	130701040
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	603	-0.007	7.03471909886221e-12	130701040	130701040	NA	NA	NA
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	6896	-0.0023	NA	NA	NA	3.31746889941553e-120	37953582	37953582
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-4.9845	3.31746889941553e-120	37953582	37953582	8.3988801319776e-125	37957844	37957844
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	56650373	6685	6329	-0.0026	8.3988801319776e-125	37957844	37957844	5.98611075740136e-24	56646284	56657371
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56681665	14	14	0.8333	5.98611075740136e-24	56646284	56657371	1.14720678270870e-22	56680346	56686863
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56685341	68142120	2695	2546	-0.0012	1.1472067827087e-22	56680346	56686863	1.19359008996360e-15	68138912	68144264
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68144264	68163523	10	9	-0.8686	1.1935900899636e-15	68138912	68144264	2.63160613018623e-16	68160625	68167758
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68167758	100690991	10336	9819	0.002	2.63160613018623e-16	68160625	68167758	1.06456942710854e-13	100690991	100690991
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	1.7012	1.06456942710854e-13	100690991	100690991	2.87816182575517e-13	100693892	100693892
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4325	0.0052	2.87816182575517e-13	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19441654	37	36	0.0351	NA	NA	NA	0.000297115057667405	19418899	19446048
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19442895	19461755	9	8	0.5219	0.000297115057667405	19418899	19446048	8.63501009006483e-05	19456276	19471494
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19463384	40680589	7603	7175	0.0029	8.63501009006483e-05	19456276	19471494	8.73311848599442e-08	40670538	40680589
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40687108	40722360	6	5	-0.8144	8.73311848599442e-08	40670538	40680589	2.83840500575709e-07	40722360	40741934
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40726930	73061942	11764	11102	-0.0088	2.83840500575709e-07	40722360	40741934	3.99719031719865e-19	73058103	73061942
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73101327	9	8	-1.0112	3.99719031719865e-19	73058103	73061942	4.93692344420091e-19	73101327	73104540
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73104540	106358491	12457	11779	-3e-04	4.93692344420091e-19	73101327	73104540	NA	NA	NA
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	19845942	110	100	0.2061	NA	NA	NA	6.93138541379546e-06	19844217	19845942
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19874677	19882711	3	3	1.1319	6.93138541379546e-06	19844217	19845942	3.31616567979397e-09	19882711	19910696
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19910696	32456500	3714	3514	2e-04	3.31616567979397e-09	19882711	19910696	1.94108159612594e-23	32451841	32517839
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32514939	32583146	24	21	-0.6854	1.94108159612594e-23	32451841	32517839	1.23234395722794e-22	32576881	32664506
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32594200	32594200	1	0	NA	1.23234395722794e-22	32576881	32664506	NA	NA	NA
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32661846	74669752	17859	16910	-0.0026	NA	NA	NA	1.03393725945398e-80	74669752	74671626
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	3	-3.3721	1.03393725945398e-80	74669752	74671626	3.92505287780138e-83	74678353	74680439
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	100298352	9607	9078	6e-04	3.92505287780138e-83	74678353	74680439	NA	NA	NA
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	1296506	472	445	0.0125	NA	NA	NA	2.07560806513901e-05	1289711	1296506
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1296767	1300341	3	3	0.9651	2.07560806513901e-05	1289711	1296506	5.24518784088336e-06	1300341	1304232
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1302875	2600740	538	512	-0.0234	5.24518784088336e-06	1300341	1304232	1.46427550504046e-45	2600740	2638581
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2638581	2639798	3	3	-2.928	1.46427550504046e-45	2600740	2638581	5.81824887168826e-63	2638643	2639798
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2649851	75093957	19507	18508	-0.0071	5.81824887168826e-63	2638643	2639798	5.43368690402351e-30	75093957	75093957
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	2.0173	5.43368690402351e-30	75093957	75093957	4.07747533649101e-31	75100865	75100865
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76923844	609	570	-0.0151	4.07747533649101e-31	75100865	75100865	1.23570362366842e-18	76922411	76929598
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76925748	76925748	1	0	NA	1.23570362366842e-18	76922411	76929598	NA	NA	NA
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	7	1.0256	NA	NA	NA	3.01914666416883e-16	76938723	76942679
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4282	0.0031	3.01914666416883e-16	76938723	76942679	NA	NA	NA
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	395	0.0051	NA	NA	NA	1.19980612747559e-18	1028979	1028979
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.992	1.19980612747559e-18	1028979	1028979	5.26003215583127e-19	1030766	1030766
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	36673853	13452	12756	-0.0022	5.26003215583127e-19	1030766	1030766	3.40441136188607e-157	36673853	36673853
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	5	3.5618	3.40441136188607e-157	36673853	36673853	1.05449293452467e-156	36684619	36684619
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41515622	2009	1889	-0.0032	1.05449293452467e-156	36684619	36684619	1.00194465652340e-37	41501967	41519702
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41518222	41647135	60	57	-0.5288	1.0019446565234e-37	41501967	41519702	1.92129368185474e-37	41644148	41702238
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41648545	78653545	13688	12973	-0.0014	1.92129368185474e-37	41644148	41702238	NA	NA	NA
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	53092949	16199	15345	-0.0037	NA	NA	NA	4.1392031949978e-39	53092949	53092949
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-2.8012	4.1392031949978e-39	53092949	53092949	5.1586623339455e-38	53099601	53099601
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6428	-0.0015	5.1586623339455e-38	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	466	-0.0054	NA	NA	NA	7.33873155061299e-20	1398325	1398325
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	2.099	7.33873155061299e-20	1398325	1398325	2.60526249831951e-20	1400840	1400840
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	46046859	14659	13903	-0.0127	2.60526249831951e-20	1400840	1400840	1.59722448660567e-97	46046859	46046859
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	46054503	46063357	5	5	-2.8948	1.59722448660567e-97	46046859	46046859	2.39628026255364e-104	46063357	46063357
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	46086240	58208527	5309	5026	-0.0075	2.39628026255364e-104	46063357	46063357	1.23730850461195e-07	58196296	58213220
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58212113	58244012	15	15	-0.4754	1.23730850461195e-07	58196296	58213220	4.01413879444271e-07	58239871	58262497
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58247367	63788698	2577	2437	-0.015	4.01413879444271e-07	58239871	58262497	NA	NA	NA
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	558	-0.015	NA	NA	NA	5.73688154026468e-31	1499034	1515948
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	9	1.1655	5.73688154026468e-31	1499034	1515948	1.76244400548228e-29	1525300	1532433
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	19861	0.0026	1.76244400548228e-29	1525300	1532433	NA	NA	NA
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12728	-2e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	16521073	405	384	-0.0127	NA	NA	NA	3.19564440622026e-75	16521073	16521073
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16523019	16524408	2	2	-4.2327	3.19564440622026e-75	16521073	16521073	1.18916722596652e-86	16524408	16524408
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16525922	16526376	2	0	NA	1.18916722596652e-86	16524408	16524408	NA	NA	NA
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16533439	35472378	9142	8633	0.0027	NA	NA	NA	7.23587993366748e-47	35472378	35472378
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.1246	7.23587993366748e-47	35472378	35472378	2.83646572780684e-44	35476942	35476942
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6635	0.0043	2.83646572780684e-44	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	1431411	789	755	-0.0272	NA	NA	NA	4.10556851568852e-12	1431411	1431411
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-1.6769	4.10556851568852e-12	1431411	1431411	8.41463644304235e-12	1432953	1432953
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2708291	1002	951	-0.0703	8.41463644304235e-12	1432953	1432953	0	2708113	2711273
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	154054530	45007	42675	0.9884	0	2708113	2711273	2.13285983812725e-06	154050185	154054530
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154056623	154056623	1	0	NA	2.13285983812725e-06	154050185	154054530	NA	NA	NA
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154070179	154078819	4	4	1.8968	NA	NA	NA	2.22764250376975e-05	154078819	154086636
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154442377	90	84	0.9868	2.22764250376975e-05	154078819	154086636	6.40168207000644e-61	154442377	154442377
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	4	-2.1684	6.40168207000644e-61	154442377	154442377	1.60021475305693e-98	154450309	154450309
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	27	1.1023	1.60021475305693e-98	154450309	154450309	9.1654260620534e-69	154578922	154586690
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	193	-0.0475	9.1654260620534e-69	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	124	-3.8271	NA	NA	NA	5.68926548787913e-28	3223585	3773948
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-0.7706	5.68926548787913e-28	3223585	3773948	1.09211756398239e-12	5422507	6692482
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7051884	173	164	-3.4138	1.09211756398239e-12	5422507	6692482	2.87987302486514e-05	7001716	7219774
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7495687	130	118	-2.5909	2.87987302486514e-05	7001716	7219774	0.0183282585796486	7261174	7703962
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	8005148	154	150	-3.1385	0.0183282585796486	7261174	7703962	0.000150806866255726	7774773	8193270
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8010446	8010446	1	0	NA	0.000150806866255726	7774773	8193270	NA	NA	NA
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8016395	10515697	368	345	-3.6575	NA	NA	NA	2.59299637288459e-30	10513747	10535786
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	11698871	18	18	-0.6313	2.59299637288459e-30	10513747	10535786	7.11269993828947e-06	11660512	12536761
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	13104920	192	183	-2.4815	7.11269993828947e-06	11660512	12536761	0.00196939837339964	12970269	13109337
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13106723	13128515	9	9	-0.9718	0.00196939837339964	12970269	13109337	3.84151710846624e-08	13121152	13136828
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13261173	45	45	-3.0825	3.84151710846624e-08	13121152	13136828	6.82435785117287e-06	13208776	13323419
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13262997	14342834	364	340	-3.8358	6.82435785117287e-06	13208776	13323419	1.99745860351170e-11	14312365	14382361
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14500820	91	85	-2.9906	1.9974586035117e-11	14312365	14382361	2.09451085906872e-10	14489032	14506319
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14502379	14579298	31	30	-1.3242	2.09451085906872e-10	14489032	14506319	1.03134678500853e-18	14572190	14597771
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15915466	417	391	-3.4677	1.03134678500853e-18	14572190	14597771	2.42481513761101e-06	15658114	15986595
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16177411	104	98	-2.6997	2.42481513761101e-06	15658114	15986595	2.08343593212228e-16	16143653	16199764
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16178192	25737663	1100	1053	-3.7294	2.08343593212228e-16	16143653	16199764	1.60988254708266e-83	22926726	26871442
MSK_252152915973_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	57440809	84	83	-1.264	1.60988254708266e-83	22926726	26871442	NA	NA	NA
