Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	11910598	4117	3955	0.0177	NA	NA	NA	3.82826003158464e-07	11909267	11910598
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	11912493	11915125	3	3	-0.9353	3.82826003158464e-07	11909267	11910598	2.02047834198201e-07	11915125	11918032
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	11918032	34734522	8755	8357	0.0085	2.02047834198201e-07	11915125	11918032	6.18461251064653e-14	34734522	34734522
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34739490	34758017	3	3	-1.2594	6.18461251064653e-14	34734522	34734522	5.57981518312641e-14	34758017	34758017
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34761645	72536231	15015	14384	3e-04	5.57981518312641e-14	34758017	34758017	2.90519246540076e-126	72536231	72540240
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72537426	72537426	1	0	NA	2.90519246540076e-126	72536231	72540240	NA	NA	NA
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72574479	13	9	-2.1387	NA	NA	NA	2.02058058148824e-133	72568009	72574479
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72579311	110014625	11702	11240	-9e-04	2.02058058148824e-133	72568009	72574479	6.88183865748083e-09	110010176	110014625
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110015739	110039388	5	5	-0.7665	6.88183865748083e-09	110010176	110014625	1.0588375061268e-08	110039388	110058441
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	110041712	1	0	NA	1.0588375061268e-08	110039388	110058441	NA	NA	NA
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	116029725	2221	2126	-0.0047	NA	NA	NA	1.80667617955291e-08	116028595	116029725
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116031670	116033402	2	2	-1.1924	1.80667617955291e-08	116028595	116029725	4.56789965975288e-09	116033402	116035435
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116035435	146297175	2331	2233	-0.0151	4.56789965975288e-09	116033402	116035435	2.27602264746175e-24	146283719	147311437
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147203277	148081741	40	37	-0.46	2.27602264746175e-24	146283719	147311437	2.99403006724544e-24	147508217	148088285
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	148081769	150819879	1255	1212	6e-04	2.99403006724544e-24	147508217	148088285	3.14955442968228e-11	150818222	150819879
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150839754	4	4	-0.9487	3.14955442968228e-11	150818222	150819879	2.38451232145499e-05	150839754	150843192
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150851439	7	5	-2.4984	2.38451232145499e-05	150839754	150843192	6.36165711611299e-74	150851439	150851439
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	75	-0.012	6.36165711611299e-74	150851439	150851439	3.21558153707413e-200	151026228	151026228
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	-4.3075	3.21558153707413e-200	151026228	151026228	6.44921278523236e-234	151036435	151036435
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2573	0.0051	6.44921278523236e-234	151036435	151036435	3.85049990941305e-37	157133150	157133150
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	2.4462	3.85049990941305e-37	157133150	157133150	4.37065875516357e-40	157136342	157136342
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167483267	4108	3947	-0.0103	4.37065875516357e-40	157136342	157136342	0	167483267	167483267
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	-3.993	0	167483267	167483267	0	167507898	167507898
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	185979586	7209	6888	-0.002	0	167507898	167507898	1.37393609564727e-85	185979586	185979586
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	-3.6461	1.37393609564727e-85	185979586	185979586	2.76228698505307e-83	185988138	185988138
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	227875096	14099	13557	4e-04	2.76228698505307e-83	185988138	185988138	3.97306002702902e-217	227875096	227875096
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227879152	227882805	4	4	-4.1563	3.97306002702902e-217	227875096	227875096	6.48353010657671e-220	227882805	227882805
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227889619	246769018	7355	7085	-7e-04	6.48353010657671e-220	227882805	227882805	3.65722936042180e-55	246755298	246794552
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246794552	246862029	27	27	-0.8049	3.6572293604218e-55	246755298	246794552	2.52179050947038e-51	246860551	246863179
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246863179	247186514	98	90	0.0411	2.52179050947038e-51	246860551	246863179	NA	NA	NA
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	66357387	23294	22382	-0.0022	NA	NA	NA	2.98557290662267e-11	66357387	66357387
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	1.3426	2.98557290662267e-11	66357387	66357387	5.89766113890567e-11	66360747	66360747
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	146571330	21778	20952	-0.0021	5.89766113890567e-11	66360747	66360747	9.24595167646025e-20	146571330	146571330
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	1.2527	9.24595167646025e-20	146571330	146571330	1.54204690011914e-21	146592775	146592775
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	154599133	2202	2102	-0.0062	1.54204690011914e-21	146592775	146592775	2.63789365197893e-167	154599133	154599133
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154601442	154601442	1	0	NA	2.63789365197893e-167	154599133	154599133	NA	NA	NA
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154605621	154606943	2	2	-4.9069	NA	NA	NA	1.66595076286626e-156	154606943	154606943
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154608095	242689978	30544	29307	-6e-04	1.66595076286626e-156	154606943	154606943	NA	NA	NA
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	163347163	53399	51281	-0.0019	NA	NA	NA	8.87800106263155e-09	163325000	163364841
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163364841	163433686	10	10	0.5501	8.87800106263155e-09	163325000	163364841	3.23319030071189e-11	163428770	163449758
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163442988	164005577	82	81	0.0104	3.23319030071189e-11	163428770	163449758	7.62448177235027e-32	164005577	164005577
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	1.2981	7.62448177235027e-32	164005577	164005577	3.7999338074188e-27	164027724	164027724
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	194354505	10150	9754	-0.0032	3.7999338074188e-27	164027724	164027724	1.14270385344949e-31	194354505	194354505
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	5	1.3998	1.14270385344949e-31	194354505	194354505	1.72881409362344e-32	194366950	194366950
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196820428	995	960	-0.004	1.72881409362344e-32	194366950	194366950	1.74436074176438e-20	196809098	196835413
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196822133	196822133	1	0	NA	1.74436074176438e-20	196809098	196835413	NA	NA	NA
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196942158	23	22	-0.5401	NA	NA	NA	1.51961191590634e-21	196940125	196946355
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196943380	197853308	353	333	0.0061	1.51961191590634e-21	196940125	196946355	3.0496966348011e-34	197848634	197856323
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	197854548	197939195	42	39	0.5353	3.0496966348011e-34	197848634	197856323	5.25226088765272e-30	197935996	197946848
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	197942100	199329592	566	541	0.0106	5.25226088765272e-30	197935996	197946848	NA	NA	NA
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3279	0.0252	NA	NA	NA	2.16327933634241e-168	9815760	9815760
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-3.6481	2.16327933634241e-168	9815760	9815760	9.2568378891288e-175	9842644	9842644
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	173659100	46437	44475	-0.0041	9.2568378891288e-175	9842644	9842644	3.89966173489258e-86	173659100	173659100
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173660684	173660684	1	0	NA	3.89966173489258e-86	173659100	173659100	NA	NA	NA
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	3.6237	NA	NA	NA	8.63026544899225e-91	173666072	173666072
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	191153613	5324	5105	0.0058	8.63026544899225e-91	173666072	173666072	NA	NA	NA
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	21480789	6352	6125	0.0014	NA	NA	NA	8.72838905671286e-10	21475818	21480789
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21485944	21487474	2	2	-1.2534	8.72838905671286e-10	21475818	21480789	2.71649187411765e-09	21487474	21487474
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21488938	140200229	33724	32358	-0.0062	2.71649187411765e-09	21487474	21487474	8.976023509116e-09	140195260	140200229
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140201609	140216524	9	9	-0.5793	8.976023509116e-09	140195260	140200229	3.79324614978643e-09	140216524	140221835
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	178037603	12648	12138	0.0014	3.79324614978643e-09	140216524	140221835	1.44097164640732e-08	178037603	178037603
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178040439	178044111	2	2	-1.1936	1.44097164640732e-08	178037603	178037603	2.94837918520175e-08	178044111	178045608
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178045608	180644810	1029	977	0.0328	2.94837918520175e-08	178044111	178045608	NA	NA	NA
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	29950805	10587	10184	0.0041	NA	NA	NA	1.63897619342891e-12	29939288	29962849
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	29995247	10	10	0.6274	1.63897619342891e-12	29939288	29962849	4.14756447261468e-11	29992946	30004636
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29998009	31382291	583	554	0.0065	4.14756447261468e-11	29992946	30004636	1.12918857311815e-06	31372946	31385778
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31383925	31418006	8	8	0.5503	1.12918857311815e-06	31372946	31385778	7.41527985701703e-07	31390982	31429184
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	32548736	488	473	0.0346	7.41527985701703e-07	31390982	31429184	2.21434336521419e-125	32548736	32548736
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32600962	10	10	-1.9997	2.21434336521419e-125	32548736	32548736	7.2599642553279e-128	32600962	32600962
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	54035000	8303	7973	0	7.2599642553279e-128	32600962	32600962	9.65935189548271e-126	54035000	54035000
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-3.6073	9.65935189548271e-126	54035000	54035000	9.13769102462604e-132	54042734	54042734
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	65767409	2398	2314	-0.0107	9.13769102462604e-132	54042734	54042734	2.27988442380504e-11	65767409	65767409
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65769146	65771532	2	2	-1.333	2.27988442380504e-11	65767409	65767409	9.00753000418947e-12	65771532	65771532
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65778663	72919733	2135	2058	0.0085	9.00753000418947e-12	65771532	65771532	3.80982147817925e-174	72919733	72919733
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72920894	72924440	3	3	-4.1413	3.80982147817925e-174	72919733	72919733	1.98444887614367e-167	72924440	72924440
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72931542	79018959	1894	1819	0.0043	1.98444887614367e-167	72924440	72924440	4.97250498262758e-31	79015901	79024557
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-0.8558	4.97250498262758e-31	79015901	79024557	2.30285323992137e-30	79085247	79095415
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	162947140	27120	26038	-0.0053	2.30285323992137e-30	79085247	79095415	9.39065811645636e-20	162945231	162950935
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	162950935	162964354	9	9	-0.8365	9.39065811645636e-20	162945231	162950935	1.46442465349371e-16	162962727	162966892
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	162966892	165643653	743	710	-0.0176	1.46442465349371e-16	162962727	162966892	1.91357506464895e-24	165643653	165643653
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.4589	1.91357506464895e-24	165643653	165643653	2.2280367948702e-26	165650610	165650610
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1714	0.014	2.2280367948702e-26	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	49885022	17321	16589	-9e-04	NA	NA	NA	2.82721289357978e-16	49882700	49885022
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	49887071	49893842	5	5	-1.0194	2.82721289357978e-16	49882700	49885022	5.48816344829073e-16	49893842	49895804
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	49895804	86771217	8814	8446	1e-04	5.48816344829073e-16	49893842	49895804	1.08878731569647e-09	86752356	86779294
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	86777920	86799569	8	7	-0.6802	1.08878731569647e-09	86752356	86779294	5.0991062366219e-10	86790013	86803235
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	86803235	103863630	6395	6153	0.0094	5.0991062366219e-10	86790013	86803235	7.99096473135466e-10	103863630	103863630
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	103868277	103868375	2	2	-1.2673	7.99096473135466e-10	103863630	103863630	1.75033672289618e-09	103868375	103868375
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	103870016	125831554	9893	9484	-6e-04	1.75033672289618e-09	103868375	103868375	1.19773442404881e-151	125831554	125831554
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-3.9963	1.19773442404881e-151	125831554	125831554	2.1024511396639e-155	125837524	125837524
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	141410894	7362	7100	6e-04	2.1024511396639e-155	125837524	125837524	8.57903512733825e-09	141406414	141417702
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	12	0.4933	8.57903512733825e-09	141406414	141417702	9.37825106682193e-08	141431668	141449014
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	147702365	2639	2521	0.0032	9.37825106682193e-08	141431668	141449014	1.39436022612276e-29	147702365	147702365
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-2.2817	1.39436022612276e-29	147702365	147702365	1.33970472317944e-30	147707161	147707161
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	151728811	1630	1551	-0.0086	1.33970472317944e-30	147707161	147707161	6.98636504699662e-12	151724590	151730250
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151730250	151747905	10	9	-0.6853	6.98636504699662e-12	151724590	151730250	8.466279339522e-13	151743145	151750057
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151750057	158821263	2598	2492	0.016	8.466279339522e-13	151743145	151750057	NA	NA	NA
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	2234351	737	694	0.0271	NA	NA	NA	0	2234351	2234351
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2242849	2251011	4	4	-5.8378	0	2234351	2234351	0	2251011	2251011
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2257255	25463846	7584	7278	-0.0046	0	2251011	2251011	2.20616786439332e-08	25460793	25463846
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25467611	25469017	2	2	-1.1926	2.20616786439332e-08	25460793	25463846	2.63273426943655e-08	25469017	25469017
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25470598	144968840	35786	34383	-0.0013	2.63273426943655e-08	25469017	25469017	2.14470684103116e-09	144968840	144968840
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144970607	144970777	2	2	1.2569	2.14470684103116e-09	144968840	144968840	5.17877669616048e-07	144970777	144972090
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144972090	146264846	451	438	0.0385	5.17877669616048e-07	144970777	144972090	NA	NA	NA
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	23343915	8000	7673	-4e-04	NA	NA	NA	1.21570007371294e-163	23343915	23343915
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	-4.0537	1.21570007371294e-163	23343915	23343915	4.24477156226912e-167	23365926	23365926
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	70926188	5069	4841	0.0011	4.24477156226912e-167	23365926	23365926	5.37522351855137e-15	70926188	70926188
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-1.5183	5.37522351855137e-15	70926188	70926188	1.65163301142399e-14	70930528	70930528
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	116124007	15468	14882	-0.0119	1.65163301142399e-14	70930528	70930528	1.10704344095704e-09	116124007	116124007
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-1.2584	1.10704344095704e-09	116124007	116124007	5.3672309069634e-09	116130333	116130333
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	137352394	8295	7961	9e-04	5.3672309069634e-09	116130333	116130333	4.91885131114353e-14	137352394	137352394
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.5537	4.91885131114353e-14	137352394	137352394	7.64567622451546e-12	137356880	137356880
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1057	0.0067	7.64567622451546e-12	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	135285645	44808	42995	-0.0036	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	8913952	3498	3350	0.0114	NA	NA	NA	7.71721728627587e-13	8912822	8913952
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	8915712	8921243	4	4	-1.0558	7.71721728627587e-13	8912822	8913952	1.28185429488583e-13	8921243	8925451
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	8925451	55118214	13403	12840	-8e-04	1.28185429488583e-13	8921243	8925451	3.7659995462558e-10	55088012	55131703
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55197848	33	32	0.3246	3.7659995462558e-10	55088012	55131703	7.0683700528506e-09	55187282	55225136
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55200744	66463477	4644	4476	0.0142	7.0683700528506e-09	55187282	55225136	6.86538286717249e-08	66460753	66463477
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	1.1859	6.86538286717249e-08	66460753	66463477	6.53274052222179e-08	66469412	66473397
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	81530809	5315	5134	0.0011	6.53274052222179e-08	66469412	66473397	1.27819103600507e-07	81524127	81530809
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81536990	81540765	3	3	-0.9495	1.27819103600507e-07	81524127	81530809	5.20580957189685e-08	81540765	81544262
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81544262	134450318	18402	17658	-4e-04	5.20580957189685e-08	81540765	81544262	NA	NA	NA
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3615	0.0194	NA	NA	NA	6.92171279725606e-14	9456107	9543817
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9599999	13	12	0.6458	6.92171279725606e-14	9456107	9543817	3.25241104569892e-16	9582696	9607363
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	11112600	573	545	-0.0175	3.25241104569892e-16	9582696	9607363	1.73589554516296e-06	11104085	11123452
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11116883	11140421	8	7	0.5321	1.73589554516296e-06	11104085	11123452	3.16732931690269e-05	11123452	11164905
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	11395862	70	67	0.0038	3.16732931690269e-05	11123452	11164905	3.05276248406463e-13	11393473	11395862
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11435643	6	6	0.8879	3.05276248406463e-13	11393473	11395862	4.17002970594773e-14	11435643	11440927
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	130694393	40103	38506	0.001	4.17002970594773e-14	11435643	11440927	6.15238045278368e-14	130694393	130694393
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	1.5285	6.15238045278368e-14	130694393	130694393	4.67422060159962e-13	130701040	130701040
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	617	0.02	4.67422060159962e-13	130701040	130701040	NA	NA	NA
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	49964838	12219	11756	-0.0079	NA	NA	NA	9.34945391189688e-66	49964838	49964838
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-3.2133	9.34945391189688e-66	49964838	49964838	1.92511774964261e-59	49971732	49971732
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56650373	1804	1748	-0.005	1.92511774964261e-59	49971732	49971732	1.22184505388699e-30	56646284	56650373
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56685341	15	15	0.8427	1.22184505388699e-30	56646284	56650373	2.30440437670014e-34	56685341	56686863
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	113029410	17174	16487	0	2.30440437670014e-34	56685341	56686863	7.55053718905966e-08	113029410	113029410
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113030794	113032131	2	2	1.1466	7.55053718905966e-08	113029410	113029410	6.19427871559842e-07	113032131	113033532
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113033532	114123340	428	416	0.033	6.19427871559842e-07	113032131	113033532	NA	NA	NA
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	57	-0.7325	NA	NA	NA	2.84040083222369e-99	19490630	19497023
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	40680589	7589	7283	-7e-04	2.84040083222369e-99	19490630	19497023	1.04840069152254e-16	40676611	40680589
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40687108	40722360	6	6	-0.9369	1.04840069152254e-16	40676611	40680589	3.45480600612630e-16	40722360	40726930
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40726930	69086125	9973	9561	-0.0076	3.4548060061263e-16	40722360	40726930	5.25525876779495e-11	69084841	69086125
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69092211	3	3	1.0867	5.25525876779495e-11	69084841	69086125	3.51636239608119e-10	69092211	69093444
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69093444	106358491	14254	13663	-0.001	3.51636239608119e-10	69092211	69093444	NA	NA	NA
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	32456500	3827	3666	-0.0179	NA	NA	NA	7.84885574018284e-44	32454294	32514939
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32514939	32594200	25	25	-0.7893	7.84885574018284e-44	32454294	32514939	2.89760659203798e-46	32581730	32661846
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32661846	41682937	3662	3494	-0.0087	2.89760659203798e-46	32581730	32661846	2.46558740488163e-18	41682925	41682937
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41704248	41776053	8	8	-0.8818	2.46558740488163e-18	41682925	41682937	8.38827919472878e-19	41776053	41803782
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41803782	74669752	14189	13627	-0.0055	8.38827919472878e-19	41776053	41803782	2.30615853928586e-180	74669752	74669752
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-3.7751	2.30615853928586e-180	74669752	74669752	2.48652967837814e-176	74680439	74680439
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	91933764	6601	6350	-0.0071	2.48652967837814e-176	74680439	74680439	4.5280776738029e-13	91928232	91942638
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	91937335	91965744	8	7	-0.8006	4.5280776738029e-13	91928232	91942638	3.1030835297545e-14	91957361	91968739
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	91968739	99632987	2724	2620	0.0038	3.1030835297545e-14	91957361	91968739	1.65311806350472e-09	99632987	99632987
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.2421	1.65311806350472e-09	99632987	99632987	1.29146138674741e-07	99635701	99636724
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	257	0.0598	1.29146138674741e-07	99635701	99636724	NA	NA	NA
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	75093957	20523	19693	0.0019	NA	NA	NA	6.28275304487725e-34	75093957	75093957
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.928	6.28275304487725e-34	75093957	75093957	1.86847695913535e-34	75100865	75100865
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76923844	609	587	-0.011	1.86847695913535e-34	75100865	75100865	4.21490234332942e-36	76923844	76929598
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76925748	76925748	1	0	NA	4.21490234332942e-36	76923844	76929598	NA	NA	NA
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	1.2201	NA	NA	NA	7.68373910678029e-34	76938723	76940218
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4329	0.0034	7.68373910678029e-34	76938723	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	36673853	13871	13338	0.0076	NA	NA	NA	4.4673605923663e-116	36673853	36673853
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	2.5088	4.4673605923663e-116	36673853	36673853	6.1371067150678e-124	36684619	36684619
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	40869151	1806	1727	0.0179	6.1371067150678e-124	36684619	36684619	4.97412734326114e-07	40847517	40874079
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	40874079	41031191	7	7	-0.5494	4.97412734326114e-07	40847517	40874079	5.24684612648549e-07	41026062	41067756
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41062669	41521544	199	194	0.0262	5.24684612648549e-07	41026062	41067756	6.28853680119662e-111	41519702	41522429
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41522429	41710400	66	61	-0.8217	6.28853680119662e-111	41519702	41522429	7.95456862901942e-127	41708551	42142363
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	78653545	13679	13108	0.0063	7.95456862901942e-127	41708551	42142363	NA	NA	NA
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22049	-0.0066	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	56825794	19874	19058	0.0154	NA	NA	NA	1.45273153409172e-12	56823430	56825794
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56828073	56840346	7	7	-0.7896	1.45273153409172e-12	56823430	56825794	7.89889910297505e-13	56840346	56844304
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	63788698	3178	3047	0.0134	7.89889910297505e-13	56840346	56844304	NA	NA	NA
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	564	0.0076	NA	NA	NA	9.80363321083157e-36	1499421	1506379
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	1.1292	9.80363321083157e-36	1499421	1506379	9.88999499443888e-40	1532433	1532433
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	20147	5e-04	9.88999499443888e-40	1532433	1532433	NA	NA	NA
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12915	0.0011	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	22667608	2982	2849	0.0091	NA	NA	NA	3.32084915779571e-43	22644243	22682428
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22677959	1	0	NA	3.32084915779571e-43	22644243	22682428	NA	NA	NA
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22679305	22725305	21	20	0.8899	NA	NA	NA	5.26453784487983e-45	22718614	22735036
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	49571068	13552	13040	0.0117	5.26453784487983e-45	22718614	22735036	NA	NA	NA
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.3641	NA	NA	NA	6.38934530270715e-28	94062	94062
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	-1.3922	6.38934530270715e-28	94062	94062	1.43380673547549e-40	104732	104732
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	1431411	776	745	0.0106	1.43380673547549e-40	104732	104732	1.78075264297449e-07	1431240	1431411
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-1.1367	1.78075264297449e-07	1431240	1431411	9.22763510521514e-07	1432953	1434970
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2426938	749	722	-0.0057	9.22763510521514e-07	1432953	1434970	6.06701683652725e-12	2426938	2426938
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2428167	2428307	2	2	1.4857	6.06701683652725e-12	2426938	2426938	1.22778688193408e-14	2428307	2428307
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2430156	2708291	251	238	-0.0482	1.22778688193408e-14	2428307	2428307	0	2708291	2711273
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	76998610	22939	22004	0.997	0	2708291	2711273	3.57109556967556e-81	76998610	76998610
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	-2.8939	3.57109556967556e-81	76998610	76998610	4.9163473078635e-82	77010018	77010018
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154025967	22056	21187	1	4.9163473078635e-82	77010018	77010018	1.60373589103015e-19	154022916	154028488
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154028488	154079002	16	15	1.7056	1.60373589103015e-19	154022916	154028488	3.62608020844548e-21	154078819	154086636
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154085354	154582414	121	116	1.0241	3.62608020844548e-21	154078819	154086636	3.4687082012549e-230	154582414	154586690
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	193	0.0059	3.4687082012549e-230	154582414	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	121	-3.7932	NA	NA	NA	3.58516752843838e-25	3223585	3777766
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-1.2178	3.58516752843838e-25	3223585	3777766	9.59070110596272e-14	4948824	6688691
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7051884	173	171	-3.4348	9.59070110596272e-14	4948824	6688691	1.05265304919755e-08	7024303	7193174
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7495687	130	126	-2.552	1.05265304919755e-08	7024303	7193174	1.44669216767050e-05	7350629	7608619
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7726921	76	75	-3.4773	1.4466921676705e-05	7350629	7608619	0.000208637720187871	7708716	7740903
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7729757	7782532	17	17	-2.2048	0.000208637720187871	7708716	7740903	2.96990536862498e-08	7756907	7788596
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7905286	37	35	-3.7396	2.96990536862498e-08	7756907	7788596	6.0935315453592e-08	7897073	7905286
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7905553	7914104	3	3	-1.1562	6.0935315453592e-08	7897073	7905286	0.000136374228479289	7914104	7926989
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	10515697	390	379	-3.5566	0.000136374228479289	7914104	7926989	6.70213314004546e-25	10513747	10595079
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10535786	1	0	NA	6.70213314004546e-25	10513747	10595079	NA	NA	NA
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10537808	11673476	16	14	-0.9208	NA	NA	NA	2.23898378524086e-08	10631941	12527445
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	12926941	123	113	-2.9691	2.23898378524086e-08	10631941	12527445	6.43586908354972e-06	12855363	12972283
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12928074	13128515	79	77	-2.0365	6.43586908354972e-06	12855363	12972283	1.72627319690994e-42	13111594	13137597
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	14508021	505	478	-3.535	1.72627319690994e-42	13111594	13137597	5.71855900262785e-25	14502379	14536962
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14687556	40	40	-1.9947	5.71855900262785e-25	14502379	14536962	2.81656776790919e-18	14603508	14692847
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14689490	15206674	137	131	-3.6037	2.81656776790919e-18	14603508	14692847	1.81303068137094e-05	15180502	15241527
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15207522	15268792	30	29	-2.6722	1.81303068137094e-05	15180502	15241527	6.0575514076303e-06	15253683	15287893
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15270384	15915466	236	225	-3.6637	6.0575514076303e-06	15253683	15287893	5.84228783642593e-05	15658114	16017681
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16177411	104	100	-3.0996	5.84228783642593e-05	15658114	16017681	3.48039443431755e-06	16068838	16282623
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16178192	22930737	1098	1056	-3.6101	3.48039443431755e-06	16068838	16282623	1.46048433636491e-53	22926726	23283689
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	32	-1.1525	1.46048433636491e-53	22926726	23283689	0.00477973048038673	26927707	27006628
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	21	-2.2505	0.00477973048038673	26927707	27006628	2.93880004292803e-05	27003308	27067889
MSK_252152915980_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	32	-0.7888	2.93880004292803e-05	27003308	27067889	NA	NA	NA
