Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	24391166	8834	8456	0.0034	NA	NA	NA	5.8670957725306e-11	24391166	24391166
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	24394076	24395691	2	2	-0.9901	5.8670957725306e-11	24391166	24391166	6.65301272250075e-12	24395691	24395691
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	24397212	72525842	19052	18227	-0.0045	6.65301272250075e-12	24395691	24395691	2.74619271356965e-11	72524413	72533804
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72528790	72537426	6	6	-0.5599	2.74619271356965e-11	72524413	72533804	1.46118711371267e-73	72537426	72537426
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	12	3.0429	1.46118711371267e-73	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	108533257	11128	10684	0.0011	0	72579311	72579311	1.33908305765417e-08	108531247	108535814
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108535814	108538662	3	3	0.6841	1.33908305765417e-08	108531247	108535814	3.61565659951427e-09	108537259	108541074
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108541074	109373255	275	261	0.0066	3.61565659951427e-09	108537259	108541074	2.4099983886266e-238	109373255	109373255
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109374790	109376249	2	2	-4.1093	2.4099983886266e-238	109373255	109373255	2.64309766911807e-189	109376249	109376249
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109379566	110033018	296	280	2e-04	2.64309766911807e-189	109376249	109376249	2.89971339567137e-07	110023268	110033018
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110034542	110041712	3	3	0.6737	2.89971339567137e-07	110023268	110033018	1.84171957183356e-08	110041712	110058441
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	113841017	1469	1401	0	1.84171957183356e-08	110041712	110058441	7.88391508258957e-12	113841017	113841017
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	113847479	113848985	2	2	-0.9675	7.88391508258957e-12	113841017	113841017	1.56814490245816e-12	113848985	113848985
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	113850483	150819879	4378	4201	0	1.56814490245816e-12	113848985	113848985	4.01961459514689e-132	150819879	150823073
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	11	1.32	4.01961459514689e-132	150819879	150823073	1.21421372722187e-119	150848509	150851439
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2658	0.0067	1.21421372722187e-119	150848509	150851439	2.41816334331911e-77	157133150	157133150
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	2.4625	2.41816334331911e-77	157133150	157133150	3.77136806447569e-80	157136342	157136342
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167483267	4108	3920	-0.0033	3.77136806447569e-80	157136342	157136342	2.20884186830975e-12	167481271	167497116
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	0.4921	2.20884186830975e-12	167481271	167497116	4.7321762968115e-12	167504854	167520743
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	194978218	9180	8816	0.0052	4.7321762968115e-12	167504854	167520743	8.39788278936259e-39	194978218	195011344
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195065867	9	9	-0.8033	8.3978827893626e-39	194978218	195011344	4.79410840189874e-36	195048208	195065867
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	195091758	1	0	NA	4.79410840189874e-36	195048208	195065867	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195095156	200598243	2157	2064	-9e-04	NA	NA	NA	2.14437302901090e-18	200587846	200616638
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200600795	200787319	38	37	-0.287	2.1443730290109e-18	200587846	200616638	4.18662357570391e-18	200683992	200803726
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200797743	227875096	9925	9533	-0.0046	4.18662357570391e-18	200683992	200803726	2.92953039518474e-209	227875096	227875096
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227879152	227882805	4	3	-3.3056	2.92953039518474e-209	227875096	227875096	9.79138241608283e-221	227882805	227882805
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227889619	237866190	3736	3577	-0.0028	9.79138241608283e-221	227882805	227882805	6.33992656135655e-10	237866190	237866190
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	237867621	237873835	2	2	-0.8854	6.33992656135655e-10	237866190	237866190	3.63096195063341e-09	237873835	237873835
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	237875245	246769018	3617	3498	-0.0136	3.63096195063341e-09	237873835	237873835	1.26856707759318e-111	246769018	246794552
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246794552	246862029	27	26	-0.8362	1.26856707759318e-111	246769018	246794552	2.17807566104956e-88	246860551	246862029
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246863179	247186514	98	92	-0.0045	2.17807566104956e-88	246860551	246862029	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	3708749	1388	1331	-0.0075	NA	NA	NA	1.75452144575406e-96	3708749	3708749
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	3713664	3714236	3	3	-2.3617	1.75452144575406e-96	3708749	3708749	3.62399118778509e-109	3714236	3714236
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	3718746	34543992	10131	9712	-0.0018	3.62399118778509e-109	3714236	3714236	1.23788192487091e-86	34543992	34551222
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	16	0.9105	1.23788192487091e-86	34543992	34551222	3.51938932353178e-82	34582272	34589997
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	35821494	484	470	-0.0061	3.51938932353178e-82	34582272	34589997	3.20213953184459e-08	35818921	35821494
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	-0.8245	3.20213953184459e-08	35818921	35821494	2.21530528323057e-08	35844884	35851593
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	52600588	6706	6437	-0.0045	2.21530528323057e-08	35844884	35851593	1.90915990501569e-14	52600588	52600588
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	1.90915990501569e-14	52600588	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	0.7453	NA	NA	NA	3.09594708370576e-15	52635695	52635695
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	66357387	4557	4368	-0.0054	3.09594708370576e-15	52635695	52635695	2.06009318084028e-21	66357387	66357387
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	1.2458	2.06009318084028e-21	66357387	66357387	8.88454061733018e-20	66360747	66360747
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	136408064	18541	17764	-0.0042	8.88454061733018e-20	66360747	66360747	2.5235868781024e-09	136408064	136408064
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	136409999	136411508	2	2	-0.8826	2.5235868781024e-09	136408064	136408064	4.12754243612127e-10	136411508	136411508
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	136416781	146571330	3235	3098	0.0035	4.12754243612127e-10	136411508	136411508	4.58947956017926e-49	146571330	146571330
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	1.3546	4.58947956017926e-49	146571330	146571330	1.51543228493611e-48	146592775	146592775
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	213219060	22220	21300	0.0047	1.51543228493611e-48	146592775	146592775	4.6245315958703e-11	213219060	213219060
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	213224962	213224962	1	0	NA	4.6245315958703e-11	213219060	213219060	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	213233047	213240662	2	2	0.9438	NA	NA	NA	2.22065349315924e-10	213240662	213240662
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	213252006	242689978	10526	10087	0.0011	2.22065349315924e-10	213240662	213240662	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	592415	200	190	0.0094	NA	NA	NA	2.18801833856940e-08	580586	599376
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	595451	635754	10	10	-0.3797	2.1880183385694e-08	580586	599376	3.55469359652204e-09	626604	646735
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	641257	11383299	3877	3720	-0.0014	3.55469359652204e-09	626604	646735	2.98034277306812e-30	11383299	11383299
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	11386892	11389624	3	3	-1.2279	2.98034277306812e-30	11383299	11383299	4.3205602127016e-29	11389624	11389624
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	11392863	11392863	1	0	NA	4.3205602127016e-29	11389624	11389624	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	11396431	22250408	3700	3540	-0.0024	NA	NA	NA	8.7719355395529e-13	22243355	22250408
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	22256317	22260558	3	3	-0.8253	8.7719355395529e-13	22243355	22250408	1.85146589664099e-12	22260558	22260558
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	22263265	45516991	7674	7383	-0.0069	1.85146589664099e-12	22260558	22260558	4.0827422273203e-22	45516991	45516991
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	45520074	45527010	5	5	-0.842	4.0827422273203e-22	45516991	45516991	7.58820368104034e-21	45527010	45527010
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	45528765	53001678	3189	3058	-0.0019	7.58820368104034e-21	45527010	45527010	1.33053308557934e-07	52997045	53001678
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53003136	53011885	5	5	0.5164	1.33053308557934e-07	52997045	53001678	1.56787346142646e-08	53011885	53016261
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53014254	89475107	11974	11464	-0.0042	1.56787346142646e-08	53011885	53016261	2.18999463334048e-78	89475107	89475107
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89477163	89500935	13	13	-0.9465	2.18999463334048e-78	89475107	89475107	3.54830523697645e-72	89500935	89500935
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89502757	99891210	1529	1475	0.0092	3.54830523697645e-72	89500935	89500935	1.75435068423636e-61	99891210	99891210
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-2.3552	1.75435068423636e-61	99891210	99891210	1.39785906443901e-71	99897201	99897201
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	164005577	21306	20459	-0.0036	1.39785906443901e-71	99897201	99897201	9.83931483778805e-52	164005577	164005577
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	1.2587	9.83931483778805e-52	164005577	164005577	1.03614951170217e-51	164027724	164027724
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	193785530	9953	9561	0.0062	1.03614951170217e-51	164027724	164027724	7.62407693339994e-26	193785530	193785530
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	193787655	193794411	4	4	-0.9901	7.62407693339994e-26	193785530	193785530	3.51723078005602e-20	193794411	193797190
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	193797190	194354505	193	182	-0.006	3.51723078005602e-20	193794411	193797190	1.52139059366352e-294	194354505	194354505
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-3.8187	1.52139059366352e-294	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196822133	996	955	-0.0059	0	194366950	194366950	1.70899605851923e-35	196820428	196904349
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196940125	22	22	-0.5222	1.70899605851923e-35	196820428	196904349	3.29195237949841e-32	196929805	196943380
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196942158	199329592	962	926	-0.0136	3.29195237949841e-32	196929805	196943380	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3254	0.004	NA	NA	NA	0	9815760	9815760
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.8	0	9815760	9815760	0	9842644	9842644
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	63346612	13826	13229	-0.0066	0	9842644	9842644	7.83705952845508e-16	63346612	63346612
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	63357811	63358506	2	2	-1.1215	7.83705952845508e-16	63346612	63346612	3.65997735605603e-16	63358506	63358506
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	63360367	68905670	1208	1160	0.0039	3.65997735605603e-16	63358506	63358506	1.28674125373156e-38	68901210	69069651
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	0.6606	1.28674125373156e-38	68901210	69069651	5.76561489652168e-41	69163312	69643272
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	191153613	36714	35202	-0.0063	5.76561489652168e-41	69163312	69643272	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	180644810	53766	51581	-0.0012	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	29950805	10587	10158	-4e-04	NA	NA	NA	6.54522880806705e-10	29937319	29972382
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30000990	12	12	0.3627	6.54522880806705e-10	29937319	29972382	1.99108447501449e-08	29992946	30021908
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30004636	31387708	584	554	-0.0067	1.99108447501449e-08	29992946	30021908	3.94546892466142e-07	31385778	31387708
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31389372	31393624	3	3	0.6703	3.94546892466142e-07	31385778	31387708	2.06137407734233e-08	31390982	31395330
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31395330	32558677	491	467	0.0232	2.06137407734233e-08	31390982	31395330	5.73995042670491e-80	32558677	32563252
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32595402	7	7	1.3545	5.73995042670491e-80	32558677	32563252	5.18909552525715e-61	32593151	32595402
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	35862502	1392	1347	0.0082	5.18909552525715e-61	32593151	32595402	4.65956867783835e-14	35856922	35862502
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35864636	35873335	6	6	-0.6927	4.65956867783835e-14	35856922	35862502	1.55273221026059e-18	35873335	35875112
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35875112	54035000	6907	6622	-0.0016	1.55273221026059e-18	35873335	35875112	3.24125783285588e-313	54035000	54035000
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-3.9511	3.24125783285588e-313	54035000	54035000	3.64969181121127e-311	54042734	54042734
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	74647491	5288	5059	0.0013	3.64969181121127e-311	54042734	54042734	2.61556914132908e-09	74647491	74647491
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74650995	74653360	2	2	0.8652	2.61556914132908e-09	74647491	74647491	1.79168676450901e-09	74653360	74653360
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74655219	79018959	1142	1095	-0.0027	1.79168676450901e-09	74653360	74653360	1.12261568271552e-71	79018959	79018959
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-0.9238	1.12261568271552e-71	79018959	79018959	2.10468123625582e-74	79091850	79091850
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	132154299	16306	15562	-0.0036	2.10468123625582e-74	79091850	79091850	4.47695902708233e-11	132154299	132154299
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	132156778	132159522	2	2	-0.9365	4.47695902708233e-11	132154299	132154299	1.60002315777905e-09	132159522	132159522
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	132161292	132748175	197	190	-0.0113	1.60002315777905e-09	132159522	132159522	1.05326599442261e-08	132745678	132748175
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	132749309	132752481	3	3	-0.7342	1.05326599442261e-08	132745678	132748175	5.91234596562436e-10	132752481	132754426
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	132754426	165643653	11364	10922	-0.005	5.91234596562436e-10	132752481	132754426	5.03143252290669e-316	165643653	165643653
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165649379	3	3	-3.9695	5.03143252290669e-316	165643653	165643653	3.12514170323453e-263	165649379	165649379
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165650610	165650610	1	0	NA	3.12514170323453e-263	165649379	165649379	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1726	-0.0028	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	16135701	5388	5167	0.0015	NA	NA	NA	3.09556045319613e-219	16135701	16135701
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-4.2664	3.09556045319613e-219	16135701	16135701	1.02524525998700e-246	16140018	16140018
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	38270942	8214	7863	0.0024	1.025245259987e-246	16140018	16140018	1.17777961196045e-09	38247267	38285237
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38274436	38340009	36	34	0.2147	1.17777961196045e-09	38247267	38285237	3.94404130525973e-09	38325369	38381921
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38341239	100164752	17422	16709	0.0032	3.94404130525973e-09	38325369	38381921	2.73254922119077e-207	100164752	100164752
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100166257	100174991	4	4	-2.8128	2.73254922119077e-207	100164752	100164752	1.86107411941978e-197	100174991	100174991
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100178968	109966116	4200	4032	0.0047	1.86107411941978e-197	100174991	100174991	1.62609103147186e-08	109964306	109966116
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109967918	109974402	3	3	-0.692	1.62609103147186e-08	109964306	109966116	3.33888621300917e-09	109974402	109976628
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109976628	133433384	10826	10392	0.0094	3.33888621300917e-09	109974402	109976628	4.88607804430142e-21	133432281	133436265
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.6453	4.88607804430142e-21	133432281	133436265	3.72083204830003e-22	133447868	133453811
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141410894	3700	3543	0.0016	3.72083204830003e-22	133447868	133453811	3.0102391518575e-14	141408013	141413352
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	12	0.4262	3.0102391518575e-14	141408013	141413352	1.24549122362423e-14	141435643	141442231
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	141690753	117	112	-0.0162	1.24549122362423e-14	141435643	141442231	1.20607036604562e-87	141690753	141690753
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	1.1847	1.20607036604562e-87	141690753	141690753	3.80095368310995e-81	141714168	141714168
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	147702365	2512	2422	0.0075	3.80095368310995e-81	141714168	141714168	1.93702964887136e-36	147702365	147702365
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.7618	1.93702964887136e-36	147702365	147702365	1.30479915527813e-37	147707161	147707161
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	156483966	3181	3049	0.0027	1.30479915527813e-37	147707161	147707161	9.90985871081335e-14	156483966	156485711
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156485711	156490484	3	3	0.8884	9.90985871081335e-14	156483966	156485711	2.75957784908441e-12	156488598	156490484
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156492262	158821263	1054	1018	-0.0084	2.75957784908441e-12	156488598	156490484	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	2523397	812	783	-0.0257	NA	NA	NA	3.78383308854610e-07	2514408	2523397
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2526661	2542532	5	5	0.4893	3.7838330885461e-07	2514408	2523397	3.37901895303272e-08	2542532	2549456
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2546679	7156900	1575	1511	-0.0224	3.37901895303272e-08	2542532	2549456	2.61850153834399e-63	7156900	7156900
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7226901	7824059	9	8	-1.127	2.61850153834399e-63	7156900	7156900	1.13940808611735e-62	7824059	7824059
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	25120552	5758	5507	-0.0139	1.13940808611735e-62	7824059	7824059	2.49007103815273e-65	25120552	25120552
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25125700	3	3	1.8376	2.49007103815273e-65	25120552	25120552	1.95140536091566e-67	25125700	25125700
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	33619366	3275	3127	-0.0208	1.95140536091566e-67	25125700	25125700	2.80718345925669e-37	33619366	33619366
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	33622780	33648173	8	7	-0.9296	2.80718345925669e-37	33619366	33619366	5.05061364913662e-40	33648173	33648173
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	33655224	36481039	699	678	-0.0142	5.05061364913662e-40	33648173	33648173	2.15089158292397e-17	36481039	36481039
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	36484304	36499058	4	4	-0.8198	2.15089158292397e-17	36481039	36481039	4.62027132774085e-18	36499058	36499058
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	36504380	87255865	13672	13089	0.0181	4.62027132774085e-18	36499058	36499058	3.88888976112516e-14	87255865	87255865
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87258019	87262662	3	3	-0.8425	3.88888976112516e-14	87255865	87255865	1.26551210093229e-13	87262662	87262662
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87265435	146264846	18743	17985	0.0191	1.26551210093229e-13	87262662	87262662	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5210	-0.0065	NA	NA	NA	1.56905102281753e-22	15802255	15802255
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	1.3114	1.56905102281753e-22	15802255	15802255	2.59061925233843e-23	15807123	15807123
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	22477358	2377	2281	-0.0129	2.59061925233843e-23	15807123	15807123	6.27606405450897e-28	22477358	22477358
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	1.4339	6.27606405450897e-28	22477358	22477358	7.0017571269052e-28	22492603	22492603
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	39062211	4888	4670	-0.004	7.0017571269052e-28	22492603	22492603	1.86008623838583e-12	38731378	43530076
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	39088753	67923904	24	24	-0.2863	1.86008623838583e-12	38731378	43530076	1.83827059958688e-09	67910461	70207320
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	67927172	70926188	321	304	-0.0243	1.83827059958688e-09	67910461	70207320	1.5795721636067e-14	70926188	70926188
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.0289	1.5795721636067e-14	70926188	70926188	3.54573914721684e-13	70930528	70930528
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	137352394	23765	22817	-0.0115	3.54573914721684e-13	70930528	70930528	1.61571782162867e-18	137352394	137352394
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.2099	1.61571782162867e-18	137352394	137352394	3.04151507838415e-13	137356880	137356880
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1063	-0.0237	3.04151507838415e-13	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	13553503	4682	4516	-0.003	NA	NA	NA	2.78212927933361e-11	13553503	13553503
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13555034	13556315	2	2	-0.9526	2.78212927933361e-11	13553503	13553503	2.36825457163580e-11	13556315	13556315
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13557998	42519043	8921	8522	-0.0091	2.3682545716358e-11	13556315	13556315	8.14422993385651e-21	42505176	42522711
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	42522711	42576282	19	19	0.4002	8.14422993385651e-21	42505176	42522711	5.15081168302844e-18	42567150	42586761
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	42583626	53683740	2678	2546	0.0037	5.15081168302844e-18	42567150	42586761	1.69871522324260e-07	53679935	53683740
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53686515	53689554	3	3	0.6586	1.6987152232426e-07	53679935	53683740	7.1398706945078e-08	53689554	53691276
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53691276	77917893	8287	7936	0	7.1398706945078e-08	53689554	53691276	1.04090950609573e-14	77917893	77917893
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	0.8835	1.04090950609573e-14	77917893	77917893	2.06952229009615e-14	77928738	77928738
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	135285645	20213	19356	-3e-04	2.06952229009615e-14	77928738	77928738	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5741031	2138	2060	-0.0042	NA	NA	NA	1.34565350985948e-30	5738494	5741031
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	14	-0.6367	1.34565350985948e-30	5738494	5741031	2.20356617549584e-35	5765438	5766615
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	55118214	14752	14130	-0.0031	2.20356617549584e-35	5765438	5766615	1.45616942840396e-13	55093758	55131703
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55205278	37	37	0.2426	1.45616942840396e-13	55093758	55131703	8.80659120172593e-13	55197848	55230765
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55207305	81530809	9957	9558	0.0022	8.80659120172593e-13	55197848	55230765	4.17618513858346e-09	81524127	81530809
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81536990	81540765	3	3	-0.7172	4.17618513858346e-09	81524127	81530809	1.06153145257196e-09	81540765	81544262
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81544262	134450318	18402	17621	0.004	1.06153145257196e-09	81540765	81544262	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	11116883	4329	4163	0.0081	NA	NA	NA	3.97242376178512e-62	11116883	11116883
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	6	1.282	3.97242376178512e-62	11116883	11116883	1.15968644818088e-63	11140421	11140421
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	130936199	40272	38625	-0.0022	1.15968644818088e-63	11140421	11140421	1.14082378393848e-22	130936199	130936199
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130943064	130943064	1	0	NA	1.14082378393848e-22	130936199	130936199	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.344	NA	NA	NA	4.29436954197944e-20	130946248	130946248
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	526	-0.002	4.29436954197944e-20	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	33030946	5595	5378	-0.0104	NA	NA	NA	1.82410825952975e-11	33028007	33030946
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33033905	33042557	3	3	-0.815	1.82410825952975e-11	33028007	33030946	3.4046143309074e-12	33042557	33042557
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33046417	37953582	1740	1670	-0.0053	3.4046143309074e-12	33042557	33042557	8.99996389483973e-314	37953582	37953582
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-4.9292	8.99996389483973e-314	37953582	37953582	4.86576020724779e-316	37957844	37957844
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	56650373	6685	6389	-0.0081	4.86576020724779e-316	37957844	37957844	5.01800648024606e-53	56650373	56657371
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56685341	15	15	0.7337	5.01800648024606e-53	56650373	56657371	6.82549280559248e-53	56681665	56686863
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	114123340	17604	16910	-0.0039	6.82549280559248e-53	56681665	56686863	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18798641	7	6	0.2065	NA	NA	NA	6.30679931430254e-07	18527871	19271102
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18864561	19473780	45	43	-0.2389	6.30679931430254e-07	18527871	19271102	3.90261079185733e-15	19463384	19492531
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19475864	21528132	999	949	0.001	3.90261079185733e-15	19463384	19492531	3.51828518544460e-45	21503195	21549262
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21529816	22061243	268	257	0.1886	3.5182851854446e-45	21503195	21549262	6.16904090871738e-57	22044438	22081092
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22062453	69086125	16309	15581	0.0041	6.16904090871738e-57	22044438	22081092	3.15317147742284e-14	69086125	69086125
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69092211	3	3	0.868	3.15317147742284e-14	69086125	69086125	6.64096386893497e-15	69092211	69092211
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69093444	73071404	1789	1705	-0.0077	6.64096386893497e-15	69092211	69092211	5.46783401929703e-22	73071404	73071404
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73072457	1	0	NA	5.46783401929703e-22	73071404	73071404	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73075500	73092018	5	5	0.8133	NA	NA	NA	1.56908866887705e-21	73092018	73092018
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73092112	73092112	1	0	NA	1.56908866887705e-21	73092018	73092018	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	90318343	6148	5867	-0.0082	NA	NA	NA	6.88389822409089e-18	90318343	90319509
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	90319509	90323329	3	3	-0.9818	6.88389822409089e-18	90318343	90319509	2.01516481334004e-16	90321398	90323329
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	90324694	105602602	6065	5795	-8e-04	2.01516481334004e-16	90321398	90323329	5.23462572177214e-10	105595302	105602602
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105606424	105632168	11	10	-0.4239	5.23462572177214e-10	105595302	105602602	1.58365342073938e-08	105632168	105673157
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105787390	21	19	0.039	1.58365342073938e-08	105632168	105673157	1.17860293484793e-18	105787390	105787390
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105788623	105798116	6	6	-0.7585	1.17860293484793e-18	105787390	105787390	1.70529710651947e-11	105798116	105799261
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105799261	105856972	23	23	0.0261	1.70529710651947e-11	105798116	105799261	5.99551993896981e-10	105856591	105856972
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105872360	105875924	3	3	-0.936	5.99551993896981e-10	105856591	105856972	1.30835038091923e-11	105875924	105881677
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881677	106358491	178	176	0.0098	1.30835038091923e-11	105875924	105881677	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	74664249	21709	20813	-0.0069	NA	NA	NA	2.38258119013949e-10	74655153	74664249
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74665386	74680439	6	6	0.5337	2.38258119013949e-10	74655153	74664249	1.70145981995788e-09	74680439	74700488
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	75115806	170	157	0.0063	1.70145981995788e-09	74680439	74700488	7.02163021182542e-22	75115806	75115806
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	1.3992	7.02163021182542e-22	75115806	75115806	6.61188342317065e-25	75119713	75119713
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	95609756	7443	7109	-0.0033	6.61188342317065e-25	75119713	75119713	3.96643192448471e-22	95609756	95609756
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95616750	95632390	6	5	-0.8405	3.96643192448471e-22	95609756	95609756	3.56298446282645e-24	95632390	95632390
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95656272	98232932	1072	1023	0.0029	3.56298446282645e-24	95632390	95632390	6.88483970836868e-13	98232932	98232932
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98234519	1	0	NA	6.88483970836868e-13	98232932	98232932	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98237721	98239454	2	2	0.983	NA	NA	NA	5.47724777813779e-14	98239454	98239454
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	99632987	637	613	-0.0119	5.47724777813779e-14	98239454	98239454	9.70020090479647e-22	99632987	99632987
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.2225	9.70020090479647e-22	99632987	99632987	5.33832322452779e-19	99635701	99635701
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	262	-0.0045	5.33832322452779e-19	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	33348511	10594	10151	-0.0123	NA	NA	NA	2.96314660708692e-22	33278944	33370459
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33370459	33841331	27	26	-0.3946	2.96314660708692e-22	33278944	33370459	7.2821300182953e-26	33647856	33868686
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33842125	54352394	3075	2955	0.004	7.2821300182953e-26	33647856	33868686	3.30096984282051e-24	54348362	54363713
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54353978	54379839	10	10	-0.6228	3.30096984282051e-24	54348362	54363713	4.34932609027897e-23	54366535	54390060
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	74092696	6515	6254	-0.0163	4.34932609027897e-23	54366535	54390060	4.2040796083124e-08	74080956	74099704
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	74095899	74134999	18	17	-0.2975	4.2040796083124e-08	74080956	74099704	3.29592881927435e-08	74124510	74146468
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	74137609	75093957	284	269	-0.0174	3.29592881927435e-08	74124510	74146468	2.7085679085879e-63	75093957	75093957
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.783	2.7085679085879e-63	75093957	75093957	3.28801334829523e-61	75100865	75100865
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76923844	609	587	-0.0284	3.28801334829523e-61	75100865	75100865	8.74569775160731e-313	76923844	76929598
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76925748	76925748	1	0	NA	8.74569775160731e-313	76923844	76929598	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	-2.7524	NA	NA	NA	0	76938723	76940218
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4327	-0.0125	0	76938723	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1904451	854	810	-0.0107	NA	NA	NA	1.02428023835239e-20	1904451	1904451
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906319	1906391	3	3	1.1213	1.02428023835239e-20	1904451	1904451	1.35435306628634e-23	1906391	1906391
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	31457889	11180	10680	-0.0043	1.35435306628634e-23	1906391	1906391	2.86509359617478e-10	31441419	31467971
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31503774	19	18	0.305	2.86509359617478e-10	31441419	31467971	2.54926118773191e-12	31493990	31895551
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	32828797	365	353	-0.0258	2.54926118773191e-12	31493990	31895551	3.50915755457378e-09	32828797	32828797
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	0.8179	3.50915755457378e-09	32828797	32828797	2.86189711221127e-08	32832642	32833765
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36673853	1448	1387	-0.0133	2.86189711221127e-08	32832642	32833765	6.25024536859572e-178	36673853	36673853
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	2.1741	6.25024536859572e-178	36673853	36673853	1.95325755182708e-182	36684619	36684619
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	40869151	1806	1719	-0.0019	1.95325755182708e-182	36684619	36684619	1.42290915774867e-07	40863808	40869151
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	40874079	41007660	2	0	NA	1.42290915774867e-07	40863808	40869151	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41011530	41031191	5	5	-0.4997	NA	NA	NA	1.53535332817515e-08	41031191	41066163
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41062669	41519702	198	190	-0.0088	1.53535332817515e-08	41031191	41066163	5.18617906355041e-58	41518222	41519702
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41566540	21	21	-0.6253	5.18617906355041e-58	41518222	41519702	1.25031827399220e-07	41562786	41576147
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41710400	46	45	-0.869	1.2503182739922e-07	41562786	41576147	4.78888110567388e-196	41710400	41710400
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	78653545	13679	13086	-0.0095	4.78888110567388e-196	41710400	41710400	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22010	-0.0067	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	470	-0.0142	NA	NA	NA	2.15155434697914e-35	1398325	1398325
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	2.0399	2.15155434697914e-35	1398325	1398325	3.0077704346259e-44	1400840	1400840
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	11448975	4678	4451	-0.0166	3.0077704346259e-44	1400840	1400840	1.65704213531522e-13	11448975	11448975
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.1377	1.65704213531522e-13	11448975	11448975	4.21697452714129e-16	11452390	11452390
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	12515957	418	403	-0.0268	4.21697452714129e-16	11452390	11452390	2.19631742497344e-15	12515957	12515957
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	12519320	12521681	3	3	-0.9558	2.19631742497344e-15	12515957	12515957	1.50041376853153e-15	12521681	12521681
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	12523812	19694025	3432	3291	-0.002	1.50041376853153e-15	12521681	12521681	0	19694025	19694025
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19699024	19700620	3	3	-4.3106	0	19694025	19694025	0	19700620	19700620
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19702214	55797866	10336	9902	-0.0027	0	19700620	19700620	3.03085117573761e-217	55797866	55797866
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55802034	55803449	2	2	-4.1973	3.03085117573761e-217	55797866	55797866	1.05156897105396e-197	55803449	55803449
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55819553	63788698	3691	3556	-0.0186	1.05156897105396e-197	55803449	55803449	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	564	-0.0214	NA	NA	NA	3.91265356822224e-56	1506379	1511632
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	0.9697	3.91265356822224e-56	1506379	1511632	4.7320294838482e-60	1531162	1532433
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	20145	-0.001	4.7320294838482e-60	1531162	1532433	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	44096915	12121	11577	-0.0048	NA	NA	NA	4.72522837166307e-10	44096915	44096915
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	44098280	44099472	2	2	-0.9178	4.72522837166307e-10	44096915	44096915	5.9300537063194e-09	44099472	44099472
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	44101044	46922972	1318	1275	-0.0056	5.9300537063194e-09	44099472	44099472	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	18125356	1131	1098	0.0015	NA	NA	NA	2.86148836766285e-14	18125356	18125356
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18127933	18131561	3	3	0.9158	2.86148836766285e-14	18125356	18125356	1.01434174370436e-12	18131561	18131561
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18132555	22667608	1848	1786	0.0149	1.01434174370436e-12	18131561	18131561	8.05574845084291e-70	22667608	22679305
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	21	0.8092	8.05574845084291e-70	22667608	22679305	3.94200179049264e-87	22720195	22725305
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	32110063	5042	4815	-0.0012	3.94200179049264e-87	22720195	22725305	4.70736727159984e-13	32110063	32110063
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	32110939	32112051	2	2	-1.0324	4.70736727159984e-13	32110063	32110063	3.57119017692939e-13	32112051	32112051
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	32114341	35472378	1503	1432	-0.0088	3.57119017692939e-13	32112051	32112051	5.65732176452012e-165	35472378	35472378
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.5644	5.65732176452012e-165	35472378	35472378	1.12139405997753e-152	35476942	35476942
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	41219395	3050	2919	-0.0109	1.12139405997753e-152	35476942	35476942	5.26055609036147e-09	41211303	41237731
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41220567	41220567	1	0	NA	5.26055609036147e-09	41211303	41237731	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41226643	41279485	11	10	0.3876	NA	NA	NA	5.17225794536175e-08	41248301	41289552
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41286119	49571068	3941	3761	-0.0086	5.17225794536175e-08	41248301	41289552	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	124528	29	27	-0.0684	NA	NA	NA	0.00100732403945561	119680	127779
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	132689	6	5	-0.5245	0.00100732403945561	119680	127779	1.42506642320432e-05	129544	133501
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132721	742385	461	449	-0.0508	1.42506642320432e-05	129544	133501	2.38871422162276e-08	739660	742385
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	742470	747220	3	3	-0.7865	2.38871422162276e-08	739660	742385	1.18747849993189e-08	747220	747837
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	747837	1431411	290	279	-0.0592	1.18747849993189e-08	747220	747837	1.26587658061461e-16	1431411	1431411
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-1.2822	1.26587658061461e-16	1431411	1431411	7.86421714951629e-15	1432953	1432953
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2708291	1002	957	-0.0695	7.86421714951629e-15	1432953	1432953	0	2708291	2711273
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	8452395	1791	1720	0.9097	0	2708291	2711273	1.18039133977276e-13	8446489	8459880
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8456422	8473482	8	8	0.3696	1.18039133977276e-13	8446489	8459880	1.40690508321065e-15	8463131	8477126
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8475091	76998610	21140	20237	0.9399	1.40690508321065e-15	8463131	8477126	1.38458208582190e-15	76998610	76998610
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	2.0253	1.3845820858219e-15	76998610	76998610	6.50573638026793e-24	77010018	77010018
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154038318	22060	21165	0.9481	6.50573638026793e-24	77010018	77010018	8.46091513416239e-32	154038318	154038318
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154044828	1	0	NA	8.46091513416239e-32	154038318	154038318	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154046681	154078819	10	9	1.8536	NA	NA	NA	9.05664627849476e-26	154078819	154079002
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154442377	90	86	0.9415	9.05664627849476e-26	154078819	154079002	1.24196558511164e-183	154442377	154442377
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	4	-3.1911	1.24196558511164e-183	154442377	154442377	1.41524648889344e-134	154450309	154450309
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	27	0.9658	1.41524648889344e-134	154450309	154450309	5.47380517533885e-139	154582414	154582414
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	192	-0.0192	5.47380517533885e-139	154582414	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	2710450	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2711665	3034907	120	115	-4.0321	NA	NA	NA	4.91804125684503e-33	2973379	3219200
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3219200	4431527	13	12	-0.4463	4.91804125684503e-33	2973379	3219200	5.1810014006697e-12	4425391	4948824
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4597974	7259689	235	222	-3.3681	5.1810014006697e-12	4425391	4948824	7.48781889258272e-05	7197846	7311948
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7261174	7461576	67	66	-2.4277	7.48781889258272e-05	7197846	7311948	0.000379675484526754	7333934	7640681
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7465453	8010446	162	156	-3.2682	0.000379675484526754	7333934	7640681	8.44588925790193e-05	7850883	8069958
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8016395	8280065	62	57	-4.1238	8.44588925790193e-05	7850883	8069958	0.0199624270076503	8167434	8557343
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8289709	8928870	186	176	-3.6408	0.0199624270076503	8167434	8557343	2.49281288554987e-07	8809464	8967247
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8933640	10515697	120	113	-4.2637	2.49281288554987e-07	8809464	8967247	4.86985411936175e-52	10515697	10515697
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10622062	10	9	-0.3714	4.86985411936175e-52	10515697	10515697	0.02871983235465	10622062	11673476
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10631941	10645500	2	0	NA	0.02871983235465	10622062	11673476	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12452734	7	7	-2.2295	NA	NA	NA	0.00625872759372528	10655750	12452734
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12536761	9	8	-4.5499	0.00625872759372528	10655750	12452734	1.80987442557974e-05	12536761	12546917
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12537944	12682301	56	53	-2.1928	1.80987442557974e-05	12536761	12546917	0.00032230664711552	12625208	12710000
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12804329	19	18	-3.6719	0.00032230664711552	12625208	12710000	0.000153130229757277	12772155	12859309
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12809152	13128515	116	111	-2.2425	0.000153130229757277	12772155	12859309	0.00212035689462338	13054694	13151875
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13129843	1	0	NA	0.00212035689462338	13054694	13151875	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13256555	42	41	-3.118	NA	NA	NA	1.02411462580092e-09	13232295	13262997
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13259414	13422642	69	69	-4.1468	1.02411462580092e-09	13232295	13262997	9.26046865073208e-06	13414670	13424959
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13424959	13433476	5	5	-2.6728	9.26046865073208e-06	13414670	13424959	0.00192472455242803	13430638	13440916
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13434942	13489773	33	32	-4.0352	0.00192472455242803	13430638	13440916	0.000169569151576057	13474983	13490810
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13490810	13522778	14	13	-3.0482	0.000169569151576057	13474983	13490810	1.72214314096912e-06	13521449	13530614
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13524481	13597813	40	38	-4.249	1.72214314096912e-06	13521449	13530614	1.41247933365864e-06	13580493	13606316
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13603478	13705594	15	13	-2.9564	1.41247933365864e-06	13580493	13606316	4.64204110385783e-06	13699223	13765657
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716000	14342834	190	178	-4.204	4.64204110385783e-06	13699223	13765657	6.44657702795602e-17	14326935	14372581
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14508021	96	93	-3.149	6.44657702795602e-17	14326935	14372581	2.90988875724873e-15	14502379	14526446
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	2.90988875724873e-15	14502379	14526446	NA	NA	NA
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	24	-1.1023	NA	NA	NA	1.40580341090675e-10	14569287	14579298
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14598838	6	6	-3.9559	1.40580341090675e-10	14569287	14579298	0.000112559013407546	14587291	14598838
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14601309	14687556	8	8	-1.708	0.000112559013407546	14587291	14598838	1.96645146221699e-08	14687556	14691724
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14689490	15139441	99	91	-3.8342	1.96645146221699e-08	14687556	14691724	8.29438844247162e-06	15118268	15149506
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15140278	15165820	17	17	-2.4915	8.29438844247162e-06	15118268	15149506	0.0165762811500475	15144239	15179500
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15169415	15201695	17	17	-3.3117	0.0165762811500475	15144239	15179500	0.000290772243815871	15191780	15201695
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15203221	15208612	6	6	-4.7441	0.000290772243815871	15191780	15201695	2.80922562380022e-10	15208612	15220050
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15209166	15241527	10	10	-1.8862	2.80922562380022e-10	15208612	15220050	0.00238996099631476	15225775	15255162
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15242592	15284717	31	27	-3.2128	0.00238996099631476	15225775	15255162	0.000618989766784801	15273305	15308025
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15286805	15388044	66	64	-4.092	0.000618989766784801	15273305	15308025	0.000426105952615346	15360059	15446156
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15389388	15583573	101	99	-3.4055	0.000426105952615346	15360059	15446156	0.0365474322523254	15465021	15585797
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15585797	15617621	7	7	-4.6689	0.0365474322523254	15465021	15585797	4.95988210960264e-11	15617621	15617621
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15621613	15630463	3	3	-2.254	4.95988210960264e-11	15617621	15617621	1.25621379091310e-05	15630463	15639408
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15639408	15915466	46	43	-4.1103	1.2562137909131e-05	15630463	15639408	4.77483593270432e-06	15898644	15974702
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16035717	43	41	-3.0034	4.77483593270432e-06	15898644	15974702	0.00302746596963873	16002819	16035717
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16036892	16043782	7	7	-1.23	0.00302746596963873	16002819	16035717	6.26205222531688e-06	16043782	16065378
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16059723	16387273	112	108	-3.4071	6.26205222531688e-06	16043782	16065378	4.50628557069223e-05	16191571	16685944
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	21036503	671	637	-3.9408	4.50628557069223e-05	16191571	16685944	4.05116347180566e-08	21035621	21042490
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054519	6	6	-1.3364	4.05116347180566e-08	21035621	21042490	2.97669292686402e-12	21047798	21054605
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	21403482	117	113	-4.053	2.97669292686402e-12	21047798	21054605	8.78241525466027e-05	21355253	21439923
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21406812	21559551	27	25	-3.1511	8.78241525466027e-05	21355253	21439923	0.00202320107379612	21459388	21702495
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21569358	22139807	117	112	-4.0108	0.00202320107379612	21459388	21702495	3.86864500909762e-06	22052726	22157319
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-2.2407	3.86864500909762e-06	22052726	22157319	9.69138779042112e-15	22177335	22178964
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22930737	93	84	-4.4046	9.69138779042112e-15	22177335	22178964	1.79311883256576e-92	22926726	25737663
MSK_252152916045_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	83	-1.2263	1.79311883256576e-92	22926726	25737663	NA	NA	NA
