Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	36361655	13535	13181	0.003	NA	NA	NA	4.37877787604641e-07	36360208	36361655
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	36362761	36364509	2	2	1.2241	4.37877787604641e-07	36360208	36361655	2.87055447742320e-08	36364509	36366824
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	36366824	72537426	14357	14023	0.0032	2.8705544774232e-08	36364509	36366824	6.50708245879163e-144	72537426	72537426
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	1.9162	6.50708245879163e-144	72537426	72537426	3.63153771203986e-156	72579311	72579311
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	103904723	10105	9869	0.0095	3.63153771203986e-156	72579311	72579311	3.84679996402819e-09	103842977	103909053
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103906464	104012520	16	16	0.4408	3.84679996402819e-09	103842977	103909053	3.65042777506979e-09	103929627	104120086
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	104108153	142719230	5474	5339	-5e-04	3.65042777506979e-09	103929627	104120086	7.14233927460995e-32	121015302	143635542
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	142721264	144113654	114	113	-0.3065	7.14233927460995e-32	121015302	143635542	1.16915063501338e-29	144093719	144136752
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144120542	150819879	1847	1791	0	1.16915063501338e-29	144093719	144136752	7.35997169098089e-128	150819879	150819879
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	11	1.9636	7.35997169098089e-128	150819879	150819879	3.89830275763510e-101	150851439	150851439
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	76	-0.041	3.8983027576351e-101	150851439	150851439	4.61646793899338e-07	151022179	151026228
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.7601	4.61646793899338e-07	151022179	151026228	1.66231000560256e-06	151036435	151040463
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	167483267	6789	6636	-0.0069	1.66231000560256e-06	151036435	151040463	1.98117286007299e-07	167475635	167483267
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	0.5695	1.98117286007299e-07	167475635	167483267	1.58689458598758e-07	167507898	167529221
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	200613454	11352	11050	0.0067	1.58689458598758e-07	167507898	167529221	1.75443783491363e-10	200585836	200638221
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200616638	200804838	38	37	-0.2987	1.75443783491363e-10	200585836	200638221	2.47983902954613e-09	200693672	200816497
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200806319	247186514	17404	16978	-0.0016	2.47983902954613e-09	200693672	200816497	NA	NA	NA
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	11258	-0.0036	NA	NA	NA	3.56508123265997e-51	34542224	34551222
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	18	0.9586	3.56508123265997e-51	34542224	34551222	2.57092549142706e-55	34583814	34591681
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	37800512	1367	1334	-0.0134	2.57092549142706e-55	34583814	34591681	1.28444117969110e-25	37792669	37813211
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37803744	37858379	25	25	-0.5839	1.2844411796911e-25	37792669	37813211	3.62196152122585e-27	37848754	37862351
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37859985	52600588	5800	5651	0.0058	3.62196152122585e-27	37848754	37862351	4.87902476815301e-10	52588009	52600588
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	0.8192	4.87902476815301e-10	52588009	52600588	1.61544986306787e-10	52635695	52639605
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	66357387	4557	4443	0.0089	1.61544986306787e-10	52635695	52639605	8.16811943296256e-11	66357387	66357387
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	1.3063	8.16811943296256e-11	66357387	66357387	4.06207773709548e-10	66360747	66360747
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	154601442	23985	23410	0.0011	4.06207773709548e-10	66360747	66360747	5.21786735870447e-135	154601442	154601442
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154605621	154606943	2	2	-4.5779	5.21786735870447e-135	154601442	154601442	3.2626030125474e-139	154606943	154606943
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154608095	180117780	9106	8883	5e-04	3.2626030125474e-139	154606943	154606943	7.31830366430524e-18	180115198	180117780
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	180121271	180129680	6	6	-0.9629	7.31830366430524e-18	180115198	180117780	4.39984083539749e-17	180129680	180131608
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	180131608	242689978	21432	20885	0.0049	4.39984083539749e-17	180129680	180131608	NA	NA	NA
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	163992903	53488	52197	5e-04	NA	NA	NA	1.1603381611131e-77	163989367	163997228
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164112873	29	28	0.9396	1.1603381611131e-77	163989367	163997228	1.02885019855220e-79	164107951	164115417
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164115417	190844369	8912	8688	0.0078	1.0288501985522e-79	164107951	164115417	1.78601526267285e-09	190841946	190844369
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	190847899	190850562	3	3	-1.002	1.78601526267285e-09	190841946	190844369	3.50843759547865e-10	190850562	190854164
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	190854164	194354505	1214	1185	-0.0051	3.50843759547865e-10	190850562	190854164	4.23884801651932e-258	194354505	194354505
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-3.4935	4.23884801651932e-258	194354505	194354505	3.02070472954159e-228	194366950	194366950
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196822133	996	977	-0.0252	3.02070472954159e-228	194366950	194366950	2.94168256199201e-18	196809098	196907040
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196943380	24	24	-0.5281	2.94168256199201e-18	196809098	196907040	5.51805333594914e-16	196929805	196950095
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196945209	199329592	960	933	-0.0238	5.51805333594914e-16	196929805	196950095	NA	NA	NA
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3302	0.014	NA	NA	NA	2.57832568018211e-201	9815760	9815760
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.4975	2.57832568018211e-201	9815760	9815760	2.9236131106323e-276	9842644	9842644
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	68905670	15036	14671	0.0033	2.9236131106323e-276	9842644	9842644	1.28476387158995e-22	68901210	69085386
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69069651	1	0	NA	1.28476387158995e-22	68901210	69085386	NA	NA	NA
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69075140	69165814	13	13	0.7296	NA	NA	NA	2.5455152362278e-22	69153675	69643272
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	173660684	31388	30631	0.0092	2.5455152362278e-22	69153675	69643272	1.35251113535073e-38	173660684	173660684
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	2.4023	1.35251113535073e-38	173660684	173660684	9.4921696692104e-40	173666072	173666072
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	187330240	4081	3985	0.005	9.4921696692104e-40	173666072	173666072	8.37591246375697e-10	187329037	187330240
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187335827	3	3	0.9992	8.37591246375697e-10	187329037	187330240	1.71015286485922e-09	187335827	187338465
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187338465	191153613	1240	1201	-0.0228	1.71015286485922e-09	187335827	187338465	NA	NA	NA
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	180644810	53766	52453	0.0014	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	38	-0.0368	NA	NA	NA	1.36913411880178e-08	186875	210326
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	237952	15	14	-0.5156	1.36913411880178e-08	186875	210326	1.62218629247730e-11	232366	244363
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	240119	29950805	10532	10298	0	1.6221862924773e-11	232366	244363	2.94282282291229e-08	29937319	29966336
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	29992946	9	9	0.5509	2.94282282291229e-08	29937319	29966336	2.23711696091706e-06	29985620	30004636
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29995247	31385778	586	568	-0.0086	2.23711696091706e-06	29985620	30004636	5.60889837259927e-147	31385778	31389372
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31418006	6	6	-3.5614	5.60889837259927e-147	31385778	31389372	8.2523309387237e-161	31393624	31418006
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	32558677	489	481	0.0111	8.2523309387237e-161	31393624	31418006	4.51760684178556e-98	32558677	32588005
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32633691	17	17	-1.72	4.51760684178556e-98	32558677	32588005	8.62058039974911e-164	32626619	32633691
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	103841482	21505	21006	0.0036	8.62058039974911e-164	32626619	32633691	3.20704019258815e-110	103841482	103841482
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-2.8978	3.20704019258815e-110	103841482	103841482	3.95813728007422e-113	103868154	103868154
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	165643653	21106	20595	0.0026	3.95813728007422e-113	103868154	103868154	3.18109765934335e-23	165643653	165643653
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.3361	3.18109765934335e-23	165643653	165643653	4.30705842050493e-21	165650610	165650610
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1756	-0.0236	4.30705842050493e-21	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	109217320	34961	34142	0.0046	NA	NA	NA	3.21797065505595e-222	109217320	109217320
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109230336	109231462	2	2	-5.955	3.21797065505595e-222	109217320	109217320	1.241941278355e-237	109231462	109231462
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109233214	118611324	4302	4204	-0.0041	1.241941278355e-237	109231462	109231462	1.02111819126388e-169	118611324	118611324
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	-4.1251	1.02111819126388e-169	118611324	118611324	2.97709412074214e-158	118620875	118620875
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	133433384	6827	6667	0.0028	2.97709412074214e-158	118620875	118620875	7.7464876351988e-302	133433384	133433384
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133443388	5	5	-4.4469	7.7464876351988e-302	133433384	133433384	0.0150160125912127	133437464	133443388
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133444486	133448277	3	3	-1.8974	0.0150160125912127	133437464	133443388	3.42526455357605e-36	133448277	133448277
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	134856657	655	637	2e-04	3.42526455357605e-36	133448277	133448277	8.26585003213391e-10	134854194	134858375
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	134858375	134867303	5	5	-0.7775	8.26585003213391e-10	134854194	134858375	2.14833037000482e-09	134865531	134870292
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	134870292	141410894	3040	2968	0.0103	2.14833037000482e-09	134865531	134870292	1.09813792270737e-07	141402937	141417702
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	13	0.4552	1.09813792270737e-07	141402937	141417702	1.17954018678346e-05	141432778	141453012
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	142166710	298	291	-0.0042	1.17954018678346e-05	141432778	141453012	3.42098571815920e-56	142166710	142166710
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142167901	142167908	2	2	-3.5854	3.4209857181592e-56	142166710	142166710	6.92990770921747e-73	142167908	142167908
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142176074	158821263	6579	6416	-0.0056	6.92990770921747e-73	142167908	142167908	NA	NA	NA
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	7226901	2393	2343	-0.0085	NA	NA	NA	9.25280771872955e-09	6909487	7260442
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7260442	7824059	8	8	-0.5955	9.25280771872955e-09	6909487	7260442	6.25918049464664e-08	7790934	8143301
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	25022606	5728	5590	-0.0019	6.25918049464664e-08	7790934	8143301	5.59269500647509e-10	25022606	25022606
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25034970	2	2	1.3194	5.59269500647509e-10	25022606	25022606	5.45415699981974e-11	25034970	25034970
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25039370	25039370	1	0	NA	5.45415699981974e-11	25034970	25034970	NA	NA	NA
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	40892587	5442	5299	0.0034	NA	NA	NA	6.20062712898547e-147	40892587	40892587
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-4.6833	6.20062712898547e-147	40892587	40892587	7.38660089108304e-143	40897469	40897469
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	62541656	5082	4951	0.0038	7.38660089108304e-143	40897469	40897469	5.39248181610668e-08	62540280	62543646
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	62543646	62549547	4	4	0.8165	5.39248181610668e-08	62540280	62543646	1.40798093005685e-07	62547680	62555881
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	62555881	146264846	25904	25295	0.006	1.40798093005685e-07	62547680	62555881	NA	NA	NA
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	22477358	7837	7657	1e-04	NA	NA	NA	9.12761316177453e-22	22477358	22477358
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	-1.7743	9.12761316177453e-22	22477358	22477358	7.56231807020633e-20	22492603	22492603
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	70926188	5233	5092	0.0068	7.56231807020633e-20	22492603	22492603	2.73199590326993e-11	70926188	70926188
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.3616	2.73199590326993e-11	70926188	70926188	2.79984338489685e-10	70930528	70930528
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	137352394	23765	23194	-0.006	2.79984338489685e-10	70930528	70930528	1.52180320295317e-27	137352394	137352394
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	-2.1872	1.52180320295317e-27	137352394	137352394	1.04124057508698e-17	137356880	137356880
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1072	-0.0197	1.04124057508698e-17	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9509	-6e-04	NA	NA	NA	3.64065283947472e-16	27038538	27038538
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-1.6088	3.64065283947472e-16	27038538	27038538	1.29848784041046e-15	27041812	27041812
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	77917893	14861	14499	-0.0018	1.29848784041046e-15	27041812	27041812	3.41650015615986e-71	77917893	77917893
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-3.3662	3.41650015615986e-71	77917893	77917893	1.53527835029181e-66	77928669	77928669
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	135285645	20214	19734	-0.0027	1.53527835029181e-66	77928669	77928669	NA	NA	NA
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5741031	2138	2090	-0.0125	NA	NA	NA	4.65811751252815e-16	5736384	5742476
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	15	-0.6943	4.65811751252815e-16	5736384	5742476	2.80094412535566e-21	5763749	5769776
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	134450318	43151	42124	-7e-04	2.80094412535566e-21	5763749	5769776	NA	NA	NA
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	2109441	920	900	-0.0034	NA	NA	NA	8.13121164207166e-09	2105615	2115933
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2115933	2127537	7	7	-0.6546	8.13121164207166e-09	2105615	2115933	1.23491147056962e-07	2125504	2130138
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2128807	9523923	2815	2751	-0.0063	1.23491147056962e-07	2125504	2130138	0	9523923	9523923
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9554149	5	5	-5.1169	0	9523923	9523923	1.09443876450054e-82	9554149	9554149
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	9555181	1	0	NA	1.09443876450054e-82	9554149	9554149	NA	NA	NA
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9563866	9610054	10	10	-1.1403	NA	NA	NA	4.29695316196122e-41	9607363	9610054
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	11116883	571	556	-0.0169	4.29695316196122e-41	9607363	9610054	5.14741380321992e-91	11116883	11116883
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11126558	4	4	-2.7859	5.14741380321992e-91	11116883	11116883	2.59528428941122e-101	11126558	11126558
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11128557	31081498	6818	6664	0.005	2.59528428941122e-101	11126558	11126558	2.74713518630308e-16	31071789	31132716
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31084265	31242528	22	22	-0.4785	2.74713518630308e-16	31071789	31132716	7.02659331003069e-15	31231952	31249495
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31245432	132289090	33988	33147	0.0043	7.02659331003069e-15	31231952	31249495	NA	NA	NA
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	49964838	12219	11925	-0.0012	NA	NA	NA	2.87412636551978e-15	49964838	49964838
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	1.5744	2.87412636551978e-15	49964838	49964838	5.25598837044447e-16	49971732	49971732
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	89659397	10072	9827	0.01	5.25598837044447e-16	49971732	49971732	1.53595635646198e-71	89659397	89659397
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	-3.2404	1.53595635646198e-71	89659397	89659397	8.13317197820941e-66	89662326	89662326
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	113788788	9197	8973	-0.0041	8.13317197820941e-66	89662326	89662326	1.28482651740418e-10	113788788	113788788
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113791151	113792974	2	2	1.3321	1.28482651740418e-10	113788788	113788788	5.0113792321263e-10	113792974	113792974
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113794669	114123340	150	144	-0.0014	5.0113792321263e-10	113792974	113792974	NA	NA	NA
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19497023	61	61	-0.2894	NA	NA	NA	4.17546694907192e-16	19478367	19552203
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19535787	40680589	7588	7414	5e-04	4.17546694907192e-16	19478367	19552203	1.77192309237144e-08	40670538	40680589
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40687108	40722360	6	6	-0.6798	1.77192309237144e-08	40670538	40680589	1.83544765397226e-08	40722360	40741934
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40726930	69086125	9973	9739	-0.0017	1.83544765397226e-08	40722360	40741934	5.21492218368884e-09	69084841	69086125
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69092211	3	3	0.9854	5.21492218368884e-09	69084841	69086125	5.938577357611e-09	69092211	69093444
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69093444	73071404	1789	1742	-0.0056	5.938577357611e-09	69092211	69093444	5.55813013293947e-26	73071404	73071404
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73092112	7	7	1.082	5.55813013293947e-26	73071404	73071404	1.89096313900247e-22	73092112	73092112
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	105948347	12299	11985	-0.0033	1.89096313900247e-22	73092112	73092112	4.99058063635538e-15	105945006	105951399
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105951399	105989160	13	13	-0.6602	4.99058063635538e-15	105945006	105951399	6.55402685695479e-15	105985458	105996176
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105994646	106358491	146	144	0.0084	6.55402685695479e-15	105985458	105996176	NA	NA	NA
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	19465359	98	97	-0.2039	NA	NA	NA	3.4949845910097e-14	19427350	19800789
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19537035	19927262	18	17	0.4323	3.4949845910097e-14	19427350	19800789	7.68765867701773e-09	19845942	19935729
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19927496	74669752	21595	21075	-0.0029	7.68765867701773e-09	19845942	19935729	1.51959188348171e-121	74669752	74671626
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-3.1839	1.51959188348171e-121	74669752	74671626	1.90084536893904e-88	74680338	74680439
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	75114211	169	161	0.0157	1.90084536893904e-88	74680338	74680439	4.55738830332601e-11	75114211	75114211
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75115806	75119713	3	3	-1.1674	4.55738830332601e-11	75114211	75114211	2.22211907142086e-11	75119713	75121466
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	98232932	8521	8309	-0.0107	2.22211907142086e-11	75119713	75121466	5.40536644249654e-12	98228743	98232932
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98239454	3	3	1.1748	5.40536644249654e-12	98228743	98232932	9.99404121974386e-13	98239454	98239454
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	100298352	911	891	-0.0385	9.99404121974386e-13	98239454	98239454	NA	NA	NA
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	31854794	10571	10303	0.0074	NA	NA	NA	1.93935451884242e-25	31838577	32513457
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	31862577	34059589	57	57	-0.4053	1.93935451884242e-25	31838577	32513457	1.70186064215548e-26	33868686	34067812
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34061029	75093957	9895	9647	-0.0024	1.70186064215548e-26	33868686	34067812	2.8553527023935e-23	75093957	75093957
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-1.648	2.8553527023935e-23	75093957	75093957	9.51212391875444e-27	75100865	75100865
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	593	-0.0107	9.51212391875444e-27	75100865	75100865	5.50937119173722e-88	76925748	76929598
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	7	-2.072	5.50937119173722e-88	76925748	76929598	8.31663890318043e-75	76937156	76940218
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4398	-0.0124	8.31663890318043e-75	76937156	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	36673853	13871	13517	0.0035	NA	NA	NA	8.38713278480027e-24	36673853	36673853
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36680557	3	2	-2.0811	8.38713278480027e-24	36673853	36673853	9.62405963186346e-23	36680557	36680557
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36682031	36683509	2	0	NA	9.62405963186346e-23	36680557	36680557	NA	NA	NA
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	41521544	2013	1965	0.0053	NA	NA	NA	1.17794288530470e-21	41515622	41522429
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41522429	41566540	20	19	-0.6584	1.1779428853047e-21	41515622	41522429	3.13346537674795e-22	41564408	41570512
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	78653545	13725	13417	-4e-04	3.13346537674795e-22	41564408	41570512	NA	NA	NA
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22438	-0.004	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	49368756	16359	15957	0.0101	NA	NA	NA	9.54053388992206e-90	49367185	49370511
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	49370511	49472566	44	43	-0.9241	9.54053388992206e-90	49367185	49370511	2.11424282439224e-92	49471295	49475714
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	49475714	63788698	6656	6473	0.0076	2.11424282439224e-92	49471295	49475714	NA	NA	NA
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	572	-0.0341	NA	NA	NA	4.36981291851616e-71	1506379	1516966
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1525300	7	6	-2.3061	4.36981291851616e-71	1506379	1516966	6.79404038295227e-90	1516966	1525300
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1528899	62419534	20986	20474	-0.0066	6.79404038295227e-90	1516966	1525300	NA	NA	NA
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13106	-0.004	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22667608	2983	2918	0.0093	NA	NA	NA	4.26393414311478e-42	22644243	22679305
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22720195	20	20	0.9482	4.26393414311478e-42	22644243	22679305	1.46157797972467e-48	22715919	22721042
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22721042	35472378	6549	6354	0.0055	1.46157797972467e-48	22715919	22721042	1.03066436217976e-70	35472378	35472378
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.5714	1.03066436217976e-70	35472378	35472378	3.26159566145751e-64	35476942	35476942
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	35833039	203	200	0.027	3.26159566145751e-64	35476942	35476942	1.72357680807902e-06	35830000	35833039
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35834092	35839922	4	4	0.8559	1.72357680807902e-06	35830000	35833039	2.68414641976149e-06	35839922	35843305
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35842351	49571068	6796	6618	-0.0024	2.68414641976149e-06	35839922	35843305	NA	NA	NA
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	106242	14	14	0.2962	NA	NA	NA	0.0142898620040322	4926	145592
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	108902	1404483	751	739	-0.0016	0.0142898620040322	4926	145592	0.00107138654546675	1372858	1416262
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1404529	1431411	24	23	0.2746	0.00107138654546675	1372858	1416262	5.89074415305392e-08	1431411	1431411
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-1.1043	5.89074415305392e-08	1431411	1431411	3.90151603304295e-07	1432953	1434970
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2373235	686	672	0.0084	3.90151603304295e-07	1432953	1434970	9.08584142979692e-08	2355802	2387756
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2374031	2418980	54	53	-0.2493	9.08584142979692e-08	2355802	2387756	1.30942537607216e-08	2404613	2428167
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2419541	2673365	237	231	0.0108	1.30942537607216e-08	2404613	2428167	3.18915187094489e-06	2670510	2674962
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2674375	2692523	9	9	-0.4552	3.18915187094489e-06	2670510	2674962	0.010392629208731	2687501	2698769
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2693493	2708291	16	16	-0.0764	0.010392629208731	2687501	2698769	9.34718908026865e-47	2708291	2711273
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	62321946	19237	18754	0.9986	9.34718908026865e-47	2708291	2711273	1.41292416610866e-19	62321946	62321946
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	62390645	62418434	4	4	2.306	1.41292416610866e-19	62321946	62321946	4.89270761812122e-22	62418434	62418434
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	62435471	154582414	25893	25253	0.9942	4.89270761812122e-22	62418434	62418434	0	154578922	154586690
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	195	-0.0241	0	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	120	-3.6231	NA	NA	NA	8.59809904903484e-20	3034907	3733715
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	5593746	17	17	-0.9779	8.59809904903484e-20	3034907	3733715	1.59934733811126e-07	5422507	6720552
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7259689	229	221	-3.0855	1.59934733811126e-07	5422507	6720552	1.64079552195374e-06	7210018	7294545
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7261174	7485594	72	71	-2.0092	1.64079552195374e-06	7210018	7294545	7.15118813552642e-06	7418921	7495687
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7491280	7608619	15	15	-3.8554	7.15118813552642e-06	7418921	7495687	0.00135226656115440	7603458	7630477
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7612732	7653082	18	17	-2.2227	0.0013522665611544	7603458	7630477	0.000464682208028476	7631265	7664085
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7723783	44	43	-3.666	0.000464682208028476	7631265	7664085	1.71164762417026e-11	7716001	7723783
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7782532	18	17	-1.6649	1.71164762417026e-11	7716001	7723783	0.00119549643571543	7776265	7835361
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	8010446	62	61	-2.8492	0.00119549643571543	7776265	7835361	8.13428485655058e-05	7911990	8073018
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8016395	8289709	63	61	-3.7363	8.13428485655058e-05	7911990	8073018	1.30304065695723e-11	8259766	8289709
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8292347	8324291	12	12	-1.7957	1.30304065695723e-11	8259766	8289709	4.17125078738719e-06	8324291	8341218
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8324328	10515697	293	286	-3.4666	4.17125078738719e-06	8324291	8341218	8.45130399018513e-20	10512616	10515697
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10631941	11	11	-0.3761	8.45130399018513e-20	10512616	10515697	0.165251589089954	10631941	11660512
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10645500	10645500	1	0	NA	0.165251589089954	10631941	11660512	NA	NA	NA
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12452734	7	6	-1.7457	NA	NA	NA	0.00588222125180463	10655750	12452734
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12541506	11	11	-3.9786	0.00588222125180463	10655750	12452734	1.59385096368307e-07	12541506	12550566
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	53	-1.841	1.59385096368307e-07	12541506	12550566	5.21757138950546e-06	12634446	12700767
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	23	-3.2908	5.21757138950546e-06	12634446	12700767	0.00146011130861778	12786515	12876008
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	12999095	59	58	-2.1758	0.00146011130861778	12786515	12876008	0.000153119083634687	12965378	13001517
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13001517	13040293	18	18	-0.8623	0.000153119083634687	12965378	13001517	5.89274181430617e-07	13035511	13055925
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13041812	13104920	26	25	-2.3974	5.89274181430617e-07	13035511	13055925	4.71146765803298e-05	13066849	13109337
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13106723	13129843	10	10	-1.0638	4.71146765803298e-05	13066849	13109337	9.63958460452559e-13	13129843	13136828
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	14342834	408	395	-3.5688	9.63958460452559e-13	13129843	13136828	3.18342406060499e-08	14203911	14383746
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14508021	96	95	-2.8237	3.18342406060499e-08	14203911	14383746	8.15292352761162e-08	14500052	14530328
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	8.15292352761162e-08	14500052	14530328	NA	NA	NA
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	25	-1.2933	NA	NA	NA	9.19499623719062e-12	14563486	14598838
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15523178	328	322	-3.1975	9.19499623719062e-12	14563486	14598838	0.000221354615382925	15514330	15523178
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15531144	5	5	-0.6359	0.000221354615382925	15514330	15523178	4.28838544669358e-06	15531144	15538983
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15532597	15915466	84	80	-3.1044	4.28838544669358e-06	15531144	15538983	0.00845599310921029	15687088	16039703
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16224597	133	129	-2.5079	0.00845599310921029	15687088	16039703	2.28948909015444e-15	16201830	16282623
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16228031	17482749	202	196	-3.6544	2.28948909015444e-15	16201830	16282623	4.74060735060017e-05	17429989	17492482
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17487972	17548302	12	12	-1.9393	4.74060735060017e-05	17429989	17492482	0.00749041903048697	17533546	17681974
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17557953	17832657	65	63	-3.2757	0.00749041903048697	17533546	17681974	0.0599893594450115	17772524	17853106
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17833945	17893954	13	11	-2.0901	0.0599893594450115	17772524	17853106	4.06189963536499e-05	17853106	17928492
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17901399	21036503	408	394	-3.6667	4.06189963536499e-05	17853106	17928492	3.54077855314807e-09	21035621	21042490
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054519	6	6	-0.8584	3.54077855314807e-09	21035621	21042490	6.65911755149742e-07	21048365	21059229
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	22181855	273	268	-3.398	6.65911755149742e-07	21048365	21059229	5.4225837390639e-05	22033016	22200078
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22182080	22379285	31	31	-4.3595	5.4225837390639e-05	22033016	22200078	0.000104788601567895	22308420	22803154
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22382215	25737663	61	58	-3.4469	0.000104788601567895	22308420	22803154	9.8951238598439e-30	22930737	26873861
MSK_252152916199_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	57440809	84	79	-1.2263	9.8951238598439e-30	22930737	26873861	NA	NA	NA
