Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	12769521	4515	4320	0.0169	NA	NA	NA	6.60074199812281e-10	12762774	12769521
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12789063	12831942	4	4	-0.928	6.60074199812281e-10	12762774	12769521	2.77102765255386e-10	12831942	12835156
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12835156	16704522	1262	1200	0.0072	2.77102765255386e-10	12831942	12835156	2.28032209192203e-16	16666760	16816180
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16713074	17104345	20	19	-0.5359	2.28032209192203e-16	16666760	16816180	1.27529684116547e-17	17080364	17114337
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17107476	72537426	22093	21102	0.0076	1.27529684116547e-17	17080364	17114337	2.84991899764298e-156	72537426	72537426
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	1.922	2.84991899764298e-156	72537426	72537426	3.78366351490096e-167	72579311	72579311
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	109987341	11688	11153	0.0034	3.78366351490096e-167	72579311	72579311	1.77993066170641e-21	109987341	109987341
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109988743	109989998	2	2	-1.7775	1.77993066170641e-21	109987341	109987341	1.9323158377506e-20	109989998	109989998
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109994195	150818222	5865	5607	-8e-04	1.9323158377506e-20	109989998	109989998	3.36256837566464e-06	150811736	150818222
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150819879	150839754	5	5	-0.6387	3.36256837566464e-06	150811736	150818222	1.99966231219094e-22	150839754	150839754
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150846148	4	4	-3.2236	1.99966231219094e-22	150839754	150839754	1.45298019946321e-07	150846148	150846148
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150847304	150847304	1	0	NA	1.45298019946321e-07	150846148	150846148	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150848509	150851439	2	2	-1.0935	NA	NA	NA	2.14577173112247e-07	150851439	150852858
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2647	0.0123	2.14577173112247e-07	150851439	150852858	1.30618089054653e-41	157133150	157133150
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	2.5612	1.30618089054653e-41	157133150	157133150	2.25659304284922e-46	157136342	157136342
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	194978218	13296	12694	-0.0065	2.25659304284922e-46	157136342	157136342	1.23102197151781e-14	194976022	195011344
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195097118	12	12	-0.6062	1.23102197151781e-14	194976022	195011344	5.58811290477208e-14	195065867	195104207
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195103883	247186514	19602	18744	-0.0017	5.58811290477208e-14	195065867	195104207	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	10990	-0.004	NA	NA	NA	3.11067707896003e-49	34542224	34543992
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	16	0.9481	3.11067707896003e-49	34542224	34543992	5.88982715090097e-50	34589997	34591681
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	52600588	7192	6909	-0.0032	5.88982715090097e-50	34589997	34591681	1.51491168259796e-275	52600588	52600588
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	1.51491168259796e-275	52600588	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	-4.4552	NA	NA	NA	2.26820963423912e-284	52635695	52635695
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	55542425	1054	997	-0.0101	2.26820963423912e-284	52635695	52635695	8.04889799553407e-08	55504596	55574784
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	55554898	55610164	27	26	0.285	8.04889799553407e-08	55504596	55574784	2.56318210138407e-07	55592433	55630604
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	55611805	66038336	3403	3243	0.0014	2.56318210138407e-07	55592433	55630604	2.13498554260032e-09	66032733	66038336
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66041319	66060693	5	4	-0.8075	2.13498554260032e-09	66032733	66038336	3.17160801597033e-07	66060693	66065935
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66063033	66357387	68	64	-0.0322	3.17160801597033e-07	66060693	66065935	1.73180224640769e-13	66357387	66357387
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	1.4386	1.73180224640769e-13	66357387	66357387	1.33248152785304e-13	66360747	66360747
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	131416670	16909	16137	0	1.33248152785304e-13	66360747	66360747	6.32126270468819e-08	131415122	131416670
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	131420554	131424524	3	3	-0.9156	6.32126270468819e-08	131415122	131416670	1.50043943910236e-08	131424524	131432905
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	131432905	146571330	4866	4664	-0.0056	1.50043943910236e-08	131424524	131432905	1.83370944115173e-314	146571330	146571330
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-4.6649	1.83370944115173e-314	146571330	146571330	1.97931808296552e-305	146592775	146592775
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	242689978	32749	31271	-0.0019	1.97931808296552e-305	146592775	146592775	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	12535747	4538	4335	0.0012	NA	NA	NA	4.45031535801073e-12	12534612	12535747
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	12538941	12546448	6	5	-0.8247	4.45031535801073e-12	12534612	12535747	4.67862060235785e-11	12546448	12551742
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	12548325	12549785	2	0	NA	4.67862060235785e-11	12546448	12551742	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	12551742	32074432	6250	5948	-0.0124	NA	NA	NA	1.81397248792882e-100	32074432	32074432
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	-3.7858	1.81397248792882e-100	32074432	32074432	1.35632782773269e-98	32080848	32080848
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	145712831	37293	35629	-0.003	1.35632782773269e-98	32080848	32080848	1.85924169282778e-19	145697210	145718842
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	145718842	145843345	16	15	0.6232	1.85924169282778e-19	145697210	145718842	7.16925256126777e-20	145813133	145861201
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	145853338	164005577	5384	5137	0.0038	7.16925256126777e-20	145813133	145861201	9.5456765907064e-31	164005577	164005577
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	1.3291	9.5456765907064e-31	164005577	164005577	2.0869628945264e-30	164027724	164027724
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	199329592	12136	11573	-0.0032	2.0869628945264e-30	164027724	164027724	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	94073863	26895	25683	5e-04	NA	NA	NA	3.88030612216777e-11	94070673	94073863
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94076749	94084961	3	3	-1.07	3.88030612216777e-11	94070673	94073863	1.49000703612968e-11	94084961	94084961
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94086315	187330240	27020	25794	-0.0013	1.49000703612968e-11	94084961	94084961	5.60660504485344e-12	187329037	187330240
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187335827	3	3	1.0853	5.60660504485344e-12	187329037	187330240	3.16152965017435e-13	187335827	187335827
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187338465	190921041	1195	1142	-0.0127	3.16152965017435e-13	187335827	187335827	2.16346472845097e-10	190915643	190927969
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190924564	190958901	10	9	0.5531	2.16346472845097e-10	190915643	190927969	7.41061240468296e-10	190950585	190960746
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190960746	191153613	35	34	-0.0641	7.41061240468296e-10	190950585	190960746	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	32144814	8732	8337	-0.0031	NA	NA	NA	2.39561175261647e-32	32141434	32147780
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	32146491	32209048	32	29	0.5619	2.39561175261647e-32	32141434	32147780	2.30961229816117e-32	32202136	32213546
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	32210714	101067931	19482	18642	-0.0029	2.30961229816117e-32	32202136	32213546	1.67776775673983e-08	101062341	101067931
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	101073400	101084943	2	2	-1.1449	1.67776775673983e-08	101062341	101067931	1.40430542168676e-08	101084943	101090131
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	101090131	140203440	11832	11283	2e-04	1.40430542168676e-08	101084943	101090131	2.58504730355161e-07	140198797	140207585
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140204823	140216524	7	7	-0.569	2.58504730355161e-07	140198797	140207585	5.14037725516256e-07	140213216	140224323
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	180194323	13558	12986	-0.001	5.14037725516256e-07	140213216	140224323	1.73771660562198e-11	180189516	180342860
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180342860	180362342	10	9	-0.6291	1.73771660562198e-11	180189516	180342860	5.90099003179954e-11	180358977	180365950
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180364670	180644810	111	105	0.0258	5.90099003179954e-11	180358977	180365950	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	99130	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	109360	32564884	11678	11154	-5e-04	NA	NA	NA	7.2300232241259e-93	32564884	32593151
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32567462	32567462	1	0	NA	7.2300232241259e-93	32564884	32593151	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32588005	32600962	6	5	-2.3498	NA	NA	NA	2.7109004381023e-72	32595402	32600962
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	35862502	1390	1344	-0.0028	2.7109004381023e-72	32595402	32600962	6.33341727029616e-09	35856922	35864636
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35864636	35873335	6	6	-0.7522	6.33341727029616e-09	35856922	35864636	3.6008534708274e-11	35870753	35875112
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35875112	54035000	6907	6590	-0.002	3.6008534708274e-11	35870753	35875112	2.26111045394782e-32	54035000	54035000
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	1.7693	2.26111045394782e-32	54035000	54035000	2.71388310450004e-33	54042734	54042734
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	79018959	6432	6147	0.0013	2.71388310450004e-33	54042734	54042734	0	79018959	79018959
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	12	-5.4859	0	79018959	79018959	0	79091850	79091850
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	103841482	6762	6448	4e-04	0	79091850	79091850	3.01171937029077e-14	103827105	103841482
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	1.0365	3.01171937029077e-14	103827105	103841482	8.22354598745214e-15	103868154	103873584
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	165643653	21106	20174	-0.0043	8.22354598745214e-15	103868154	103873584	1.41345201623683e-23	165643653	165643653
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.295	1.41345201623683e-23	165643653	165643653	1.99494663160795e-21	165650610	165650610
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1736	-0.0206	1.99494663160795e-21	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	16135701	5388	5145	0.0061	NA	NA	NA	1.10210987193737e-10	16135701	16135701
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	1.2901	1.10210987193737e-10	16135701	16135701	7.71989764328426e-11	16140018	16141776
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	75186980	17096	16359	-0.0029	7.71989764328426e-11	16140018	16141776	1.39878177796627e-07	75179630	75192598
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	75188956	75207560	8	8	0.5465	1.39878177796627e-07	75179630	75192598	9.9727890612497e-08	75203575	75213905
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	75210882	100161629	8566	8185	0.0033	9.9727890612497e-08	75203575	75213905	9.29803711002352e-09	100155830	100161629
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100162851	100174991	6	6	0.6411	9.29803711002352e-09	100155830	100161629	2.54464906217727e-07	100174991	100182350
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100178968	109217320	3895	3708	0.0119	2.54464906217727e-07	100174991	100182350	1.41515227375672e-248	109217320	109217320
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109230336	109233214	3	3	-5.0476	1.41515227375672e-248	109217320	109217320	0.000557128117039453	109231462	109233214
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109236813	109240210	2	2	-1.2023	0.000557128117039453	109231462	109233214	3.45041907033399e-09	109240210	109240210
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109244233	133433384	11129	10621	1e-04	3.45041907033399e-09	109240210	109240210	8.17540088473043e-11	133426996	133436265
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.6487	8.17540088473043e-11	133426996	133436265	5.34013785821778e-11	133447868	133455682
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141408013	3698	3530	0.0024	5.34013785821778e-11	133447868	133455682	2.40574780127268e-08	141398471	141417702
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141409512	141438504	15	14	0.4319	2.40574780127268e-08	141398471	141417702	4.17003938072018e-09	141431668	141449014
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	141440184	1	0	NA	4.17003938072018e-09	141431668	141449014	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141690753	116	107	-0.0172	NA	NA	NA	4.68187279448145e-84	141690753	141690753
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	9	1.6064	4.68187279448145e-84	141690753	141690753	1.78776804559953e-47	141714168	141714168
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	141720303	1	0	NA	1.78776804559953e-47	141714168	141714168	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720324	142161005	169	156	0.0704	NA	NA	NA	2.90044993937931e-33	142161005	142161005
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142166710	142167908	3	3	-2.3452	2.90044993937931e-33	142161005	142161005	1.52205779770270e-48	142167908	142167908
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142176074	143503317	486	466	0.0011	1.5220577977027e-48	142167908	142167908	5.55133943581628e-12	143500499	143503317
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143582864	143584350	3	3	-1.1266	5.55133943581628e-12	143500499	143503317	1.40919199817924e-11	143584350	143584350
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143705425	143706194	2	0	NA	1.40919199817924e-11	143584350	143584350	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143709272	158821263	6088	5828	-0.0075	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	116	-0.0011	NA	NA	NA	2.56842742842514e-27	581533	581533
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-1.8417	2.56842742842514e-27	581533	581533	1.68544916970127e-20	588865	588865
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	2234351	616	592	-0.0017	1.68544916970127e-20	588865	588865	5.41818935850896e-11	2231804	2234351
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2242849	2251011	4	4	-0.958	5.41818935850896e-11	2231804	2234351	7.81303887051501e-12	2251011	2257255
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2257255	25463846	7584	7227	-0.0056	7.81303887051501e-12	2251011	2257255	7.20408467035046e-09	25463846	25463846
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25467611	25469017	2	2	-1.182	7.20408467035046e-09	25463846	25463846	8.88288841174513e-09	25469017	25469017
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25470598	146264846	36239	34582	0	8.88288841174513e-09	25469017	25469017	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5210	-0.0054	NA	NA	NA	4.8216595674561e-103	15802255	15802255
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	-3.7583	4.8216595674561e-103	15802255	15802255	3.49887194436472e-98	15807123	15807123
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	22477358	2377	2265	-0.0089	3.49887194436472e-98	15807123	15807123	3.87942479290658e-16	22477358	22477358
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	1.5339	3.87942479290658e-16	22477358	22477358	7.53803304791467e-17	22492603	22492603
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	23343915	161	154	0.0106	7.53803304791467e-17	22492603	22492603	8.35832043684628e-168	23343915	23343915
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	-3.9225	8.35832043684628e-168	23343915	23343915	1.09388220045279e-164	23365926	23365926
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	70926188	5069	4846	-0.0012	1.09388220045279e-164	23365926	23365926	1.37780392647566e-11	70926188	70926188
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.3053	1.37780392647566e-11	70926188	70926188	1.22813212842499e-11	70930528	70930528
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	116124007	15468	14806	-0.0109	1.22813212842499e-11	70930528	70930528	2.42445533417247e-09	116124007	116124007
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-1.1999	2.42445533417247e-09	116124007	116124007	4.98317489732228e-09	116130333	116130333
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	130456151	5553	5283	-0.0032	4.98317489732228e-09	116130333	116130333	4.61954021978942e-10	130454192	130458341
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	130458341	130464445	4	3	1.0263	4.61954021978942e-10	130454192	130458341	2.62350733559027e-08	130461269	130465664
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	130465664	137352394	2738	2609	0.0102	2.62350733559027e-08	130461269	130465664	1.56016165313098e-12	137352394	137352394
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.5209	1.56016165313098e-12	137352394	137352394	6.59491562952938e-11	137356880	137356880
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1049	-0.0068	6.59491562952938e-11	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	135285645	44808	42820	-0.0037	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	3191670	1222	1181	0.0011	NA	NA	NA	1.48483555895836e-07	3191396	3191670
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	3194235	3194235	1	0	NA	1.48483555895836e-07	3191396	3191670	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	3196874	3200134	2	2	-1.1998	NA	NA	NA	4.93672538758563e-09	3200134	3200134
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	3202804	55118214	15680	14945	0.0013	4.93672538758563e-09	3200134	3200134	0	55118214	55123719
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	37	-4.8575	0	55118214	55123719	0	55207305	55209626
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	134450318	28360	27065	-1e-04	0	55207305	55209626	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	11104973	4325	4128	0.0063	NA	NA	NA	6.54012134390211e-34	11104085	11109483
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11109483	11140421	11	10	1.0198	6.54012134390211e-34	11104085	11109483	1.28499345190928e-35	11130871	11143592
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	46992235	11147	10687	-0.001	1.28499345190928e-35	11130871	11143592	5.4052360032201e-67	46992235	46992235
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46995053	46996769	2	2	-3.1129	5.4052360032201e-67	46992235	46992235	5.07173448375624e-66	46996769	46996769
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46998876	110666479	21786	20794	0.0061	5.07173448375624e-66	46996769	46996769	2.79749767068607e-54	110664043	110673067
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	110668504	110799506	55	53	0.5572	2.79749767068607e-54	110664043	110673067	7.39720339396192e-54	110790766	110803956
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	110802429	130694393	7189	6869	0.0037	7.39720339396192e-54	110790766	110803956	3.10974822083973e-09	130694393	130694393
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	1.2115	3.10974822083973e-09	130694393	130694393	4.24854028250475e-08	130701040	130718440
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	608	0.0132	4.24854028250475e-08	130701040	130718440	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	33030946	5595	5346	-0.0046	NA	NA	NA	0	33030946	33030946
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33033905	33042557	3	3	-5.6186	0	33030946	33030946	0	33042557	33042557
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33046417	56657371	8428	8030	-0.0043	0	33042557	33042557	4.81295736166293e-44	56657371	56657371
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56658479	56685341	14	13	0.9815	4.81295736166293e-44	56657371	56657371	1.22639163602929e-43	56685341	56686863
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	100690991	13040	12431	0.0015	1.22639163602929e-43	56685341	56686863	4.65913807345516e-164	100690991	100690991
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-4.8069	4.65913807345516e-164	100690991	100690991	5.92028836393543e-161	100693892	100693892
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4358	-0.0145	5.92028836393543e-161	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	57	-0.2395	NA	NA	NA	4.7499469137825e-12	19463384	19553991
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	40680589	7589	7255	0.0142	4.7499469137825e-12	19463384	19553991	8.1158405750819e-14	40676611	40680589
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40687108	40722360	6	6	-0.8167	8.1158405750819e-14	40676611	40680589	9.99126969401441e-14	40722360	40726930
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40726930	69086125	9973	9492	0.0026	9.9912696940144e-14	40722360	40726930	1.72679027358514e-09	69083716	69086125
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69092211	3	3	0.9765	1.72679027358514e-09	69083716	69086125	1.55940365823581e-09	69092211	69093444
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69093444	73071404	1789	1699	-0.0051	1.55940365823581e-09	69092211	69093444	1.47510911275787e-24	73061942	73071404
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73072457	1	0	NA	1.47510911275787e-24	73061942	73071404	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73075500	73092112	6	6	1.095	NA	NA	NA	1.42098335041942e-22	73092112	73092112
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	105597555	12215	11631	-0.0026	1.42098335041942e-22	73092112	73092112	3.12230957375566e-10	105588527	105607572
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105681007	14	14	0.4907	3.12230957375566e-10	105588527	105607572	1.42868722039042e-09	105632168	105724133
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105703388	105850033	46	46	-0.0834	1.42868722039042e-09	105632168	105724133	5.98745371641807e-11	105846004	105856972
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105898108	9	8	-0.9149	5.98745371641807e-11	105846004	105856972	5.63143133441106e-20	105898108	105900253
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105900253	106358491	174	167	0.0163	5.63143133441106e-20	105898108	105900253	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.1586	NA	NA	NA	0.124191419685125	18432558	19176037
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	20006117	134	133	-0.229	0.124191419685125	18432558	19176037	2.65214713673323e-22	19927262	20042683
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20006701	100298352	31183	29828	6e-04	2.65214713673323e-22	19927262	20042683	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	57203733	14909	14259	0.006	NA	NA	NA	7.74246109713526e-07	57201427	57203733
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	1.1055	7.74246109713526e-07	57201427	57203733	1.23241288088721e-07	57206772	57208375
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	76923844	6224	5951	0.0034	1.23241288088721e-07	57206772	57208375	3.17927876955574e-129	76923844	76923844
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76925748	76925748	1	0	NA	3.17927876955574e-129	76923844	76923844	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	2.1862	NA	NA	NA	1.14628143429913e-114	76940218	76940218
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4322	-0.0085	1.14628143429913e-114	76940218	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1904451	854	811	0.0395	NA	NA	NA	8.69199184185123e-07	1902148	1906319
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906319	1906391	3	3	0.9641	8.69199184185123e-07	1902148	1906319	2.57805951400675e-08	1906391	1909371
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	4070339	962	909	0.0176	2.57805951400675e-08	1906391	1909371	2.07549948314487e-07	4067150	4070339
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	4071961	4073225	2	2	-1.0758	2.07549948314487e-07	4067150	4070339	3.30415004639867e-07	4073225	4075507
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	4075507	15727076	4481	4301	0.0142	3.30415004639867e-07	4073225	4075507	1.53631908533737e-166	15727076	15727076
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15731356	15733964	2	2	-5.0291	1.53631908533737e-166	15727076	15727076	3.63619830709456e-159	15733964	15733964
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15737241	21435308	1911	1815	0.008	3.63619830709456e-159	15733964	15733964	6.89635752530938e-40	21420583	21446641
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	21439422	22142513	71	67	0.4528	6.89635752530938e-40	21420583	21446641	8.57617517795143e-42	22078642	22418006
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	22399576	36673853	5585	5308	0.0115	8.57617517795143e-42	22078642	22418006	6.61987176104985e-103	36673853	36673853
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	2.3023	6.61987176104985e-103	36673853	36673853	8.35423452694844e-100	36684619	36684619
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41521544	2012	1918	0.0255	8.35423452694844e-100	36684619	36684619	2.84261416560905e-31	41519702	41521544
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41522429	41570512	22	22	-0.6458	2.84261416560905e-31	41519702	41521544	6.3301280593367e-06	41558893	41574775
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41572001	41624013	25	25	-0.9576	6.3301280593367e-06	41558893	41574775	0.00697315822531782	41602646	41644979
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41625390	41708551	18	17	-0.7173	0.00697315822531782	41602646	41644979	6.04375327670456e-28	41708551	42142363
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41710400	41710400	1	0	NA	6.04375327670456e-28	41708551	42142363	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	78653545	13679	13017	0.0132	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	53092949	16199	15518	-0.0043	NA	NA	NA	5.35759213818632e-09	53090140	53092949
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	1.1715	5.35759213818632e-09	53090140	53092949	1.71230046670999e-08	53099601	53099601
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6474	-0.0077	1.71230046670999e-08	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	471	0.0194	NA	NA	NA	9.21996820377978e-19	1398325	1398325
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.9793	9.21996820377978e-19	1398325	1398325	4.01580831811867e-22	1400840	1400840
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	56823430	19379	18473	0.0209	4.01580831811867e-22	1400840	1400840	0	56823430	56823430
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	6	-4.6877	0	56823430	56823430	0	56840346	56840346
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	63788698	3178	3029	0.003	0	56840346	56840346	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	12719	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	15778	1506379	585	562	-0.0143	NA	NA	NA	1.65494324800478e-33	1506379	1511632
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	0.992	1.65494324800478e-33	1506379	1511632	1.09958168614594e-31	1531162	1532433
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	20084	-0.004	1.09958168614594e-31	1531162	1532433	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	9882922	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9886732	46922972	13440	12892	-0.0059	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	35472378	9552	9125	0.0106	NA	NA	NA	4.71556726258078e-65	35472378	35472378
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.2584	4.71556726258078e-65	35472378	35472378	1.86917878727549e-59	35476942	35476942
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6673	0.0123	1.86917878727549e-59	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	266212	127	122	-0.1297	NA	NA	NA	2.86084304708828e-07	264886	266212
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	267060	267079	2	2	1.2583	2.86084304708828e-07	264886	266212	1.17634724502822e-09	267079	267079
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	268402	1427392	658	634	0.0085	1.17634724502822e-09	267079	267079	9.04974873526592e-19	1427392	1431240
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-1.2251	9.04974873526592e-19	1427392	1431240	4.29056204669556e-14	1432891	1434970
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2708291	1002	954	-0.0407	4.29056204669556e-14	1432891	1434970	0	2708113	2711273
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	154025967	44997	42983	0.9818	0	2708113	2711273	1.77969959080901e-18	154022916	154028488
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154028488	154079002	16	14	1.6547	1.77969959080901e-18	154022916	154028488	3.28404635689509e-16	154078819	154086636
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154085354	154561691	116	112	0.9886	3.28404635689509e-16	154078819	154086636	2.0961114041037e-222	154561606	154561691
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154570075	154888224	206	197	0.0044	2.0961114041037e-222	154561606	154561691	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	115	-4.0591	NA	NA	NA	4.13361136084492e-23	3034907	3223585
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3733715	1	0	NA	4.13361136084492e-23	3034907	3223585	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-1.2896	NA	NA	NA	1.613562969718e-10	5531459	6692482
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	163	-3.6231	1.613562969718e-10	5531459	6692482	2.98595958148078e-06	7016002	7211779
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7495687	128	126	-2.7092	2.98595958148078e-06	7016002	7211779	2.53848739483897e-06	7379019	7606496
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7709619	66	65	-3.9059	2.53848739483897e-06	7379019	7606496	0.00144414991909473	7672477	7784314
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	8010446	89	84	-3.0584	0.00144414991909473	7672477	7784314	5.14961907153517e-05	7895945	8069958
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8016395	8289709	63	59	-3.9947	5.14961907153517e-05	7895945	8069958	2.19287383737088e-10	8259766	8289709
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8292347	8324291	12	11	-1.9953	2.19287383737088e-10	8259766	8289709	3.78245583400341e-08	8316416	8333193
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8324328	10515697	293	282	-3.8767	3.78245583400341e-08	8316416	8333193	7.26622850114995e-28	10513747	10515697
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10622062	10	10	-0.2995	7.26622850114995e-28	10513747	10515697	2.67329960141452e-05	10622062	12502304
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10631941	10645500	2	0	NA	2.67329960141452e-05	10622062	12502304	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	13129843	208	198	-2.5079	NA	NA	NA	0.00392558799067593	13022741	13151875
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13262997	45	44	-3.3645	0.00392558799067593	13022741	13151875	7.9884822891219e-05	13173328	13347152
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13264329	14342834	363	339	-4.0548	7.9884822891219e-05	13173328	13347152	1.45964653626379e-13	14321882	14381372
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14500820	91	86	-3.134	1.45964653626379e-13	14321882	14381372	7.28677451020097e-10	14489032	14508021
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14502379	14579298	31	28	-1.4167	7.28677451020097e-10	14489032	14508021	8.4326235727993e-19	14566592	14597771
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15915466	417	394	-3.626	8.4326235727993e-19	14566592	14597771	1.16977644986949e-05	15661862	16004746
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16160997	92	85	-2.8523	1.16977644986949e-05	15661862	16004746	6.64978366413074e-15	16094964	16179567
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16162358	21036411	740	707	-3.9051	6.64978366413074e-15	16094964	16179567	2.06888216402129e-07	21026715	21041164
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21036503	21054519	7	7	-1.4899	2.06888216402129e-07	21026715	21041164	2.03345930558962e-08	21047798	21060047
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	21054605	1	0	NA	2.03345930558962e-08	21047798	21060047	NA	NA	NA
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21057446	22930737	362	343	-3.97	NA	NA	NA	4.63187147228937e-65	22924754	23283689
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	27019256	50	47	-1.2512	4.63187147228937e-65	22924754	23283689	8.4444621005867e-09	27009433	27019256
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27039222	4	4	-4.1431	8.4444621005867e-09	27009433	27019256	1.76688201205192e-11	27039222	27053237
MSK_252152916515_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	30	-0.7658	1.76688201205192e-11	27039222	27053237	NA	NA	NA
