Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	10291741	3444	3252	-0.0014	NA	NA	NA	2.07461134578958e-14	10288989	10291741
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	10293260	10300490	4	4	-1.3095	2.07461134578958e-14	10288989	10291741	3.77362318002499e-15	10300490	10302152
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	10302152	72537426	24446	23157	-6e-04	3.77362318002499e-15	10300490	10302152	6.92409404834412e-166	72537426	72539143
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	12	-2.4396	6.92409404834412e-166	72537426	72539143	2.69177595402786e-171	72574479	72579311
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	109987341	11688	11066	0.0085	2.69177595402786e-171	72574479	72579311	9.16607422106671e-09	109984914	109987341
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109988743	109989998	2	2	-1.3982	9.16607422106671e-09	109984914	109987341	7.5905484177524e-09	109989998	109989998
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109994195	143702972	3932	3727	8e-04	7.5905484177524e-09	109989998	109989998	1.26137616346146e-22	143644120	143718575
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143706304	144099302	78	76	-0.3591	1.26137616346146e-22	143644120	143718575	1.25440329521438e-21	143923947	144112795
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144099712	150819879	1856	1764	-0.0114	1.25440329521438e-21	143923947	144112795	1.52368585578310e-45	150819879	150819879
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	11	1.2823	1.5236858557831e-45	150819879	150819879	2.30397420437338e-39	150851439	150852858
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	71	-0.0226	2.30397420437338e-39	150851439	150852858	1.84083630270661e-127	151026228	151026228
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	-4.3996	1.84083630270661e-127	151026228	151026228	3.9011701414966e-182	151036435	151036435
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2552	6e-04	3.9011701414966e-182	151036435	151036435	1.04911869066017e-21	157133150	157133150
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-2.1623	1.04911869066017e-21	157133150	157133150	7.88603079015517e-22	157136342	157136342
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	195062793	13304	12592	0.0022	7.88603079015517e-22	157136342	157136342	1.79960163856739e-51	195048208	195091758
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195065867	195158448	28	28	-0.8786	1.79960163856739e-51	195048208	195091758	1.04421688514445e-49	195149962	195187023
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195187023	247186514	19578	18598	-0.0041	1.04421688514445e-49	195149962	195187023	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	10906	0.0019	NA	NA	NA	1.06252024773211e-29	34542224	34551222
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34580533	15	15	0.9117	1.06252024773211e-29	34542224	34551222	1.19564311124229e-29	34579933	34582272
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34582272	66357387	11757	11140	-0.0025	1.19564311124229e-29	34579933	34582272	5.36952592421411e-09	66355634	66357387
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	1.414	5.36952592421411e-09	66355634	66357387	1.36365808194261e-09	66360747	66360747
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	71195546	1688	1589	-0.0056	1.36365808194261e-09	66360747	66360747	2.61075251831819e-165	71195546	71195546
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	71198108	71200120	2	2	-5.7539	2.61075251831819e-165	71195546	71195546	1.95993211619091e-157	71200120	71200120
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	71202174	99715903	6876	6530	-0.0023	1.95993211619091e-157	71200120	71200120	3.23559066902908e-09	99714752	99715903
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	99721070	99722194	3	3	-1.1771	3.23559066902908e-09	99714752	99715903	1.52671059017979e-09	99722194	99726452
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	99726452	106244482	2045	1953	0.0032	1.52671059017979e-09	99722194	99726452	3.44097364649959e-11	106240400	106244482
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106247167	106256521	4	4	-1.1009	3.44097364649959e-11	106240400	106244482	4.56803992755168e-11	106256521	106261767
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106261767	146571330	11160	10627	0.006	4.56803992755168e-11	106256521	106261767	6.38622277211578e-13	146562545	146571330
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	1.1965	6.38622277211578e-13	146562545	146571330	1.31793361459768e-12	146592775	146597405
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	242689978	32749	31111	9e-04	1.31793361459768e-12	146592775	146597405	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	46769081	15925	15115	0.0028	NA	NA	NA	1.89005005265514e-17	46767765	46771035
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46771035	46825048	8	8	-0.9555	1.89005005265514e-17	46767765	46771035	1.21276662197936e-16	46823673	46829442
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46827727	46827727	1	0	NA	1.21276662197936e-16	46823673	46829442	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46829442	133189686	27775	26277	0.002	NA	NA	NA	4.35923202788368e-08	133187633	133189686
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.3763	4.35923202788368e-08	133187633	133189686	2.14404324345958e-08	133194685	133194685
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	133197276	1	0	NA	2.14404324345958e-08	133194685	133194685	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133198618	164005577	9779	9296	9e-04	NA	NA	NA	4.66017388995604e-23	164005577	164005577
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	1.4061	4.66017388995604e-23	164005577	164005577	4.86150317664095e-23	164027724	164027724
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	199329592	12136	11486	-0.0039	4.86150317664095e-23	164027724	164027724	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	68899247	18431	17451	0	NA	NA	NA	2.01942928497600e-14	68893816	68905670
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	68901210	69165814	16	15	0.6462	2.019429284976e-14	68893816	68905670	3.08818383975446e-14	69153675	69665979
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	107156970	12666	12020	0.0037	3.08818383975446e-14	69153675	69665979	2.21126096879000e-08	107156970	107156970
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107159916	107161814	2	2	-1.3701	2.21126096879e-08	107156970	107156970	2.50485394511796e-08	107161814	107163423
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107163423	173224400	18525	17558	-8e-04	2.50485394511796e-08	107161814	107163423	9.21787507770303e-80	173224400	173224400
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-4.0561	9.21787507770303e-80	173224400	173224400	5.18244479028283e-79	173228860	173228860
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	190710812	5409	5132	0.0049	5.18244479028283e-79	173228860	173228860	5.21042922989259e-31	190692881	190749363
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190717801	190921041	65	63	-0.4545	5.21042922989259e-31	190692881	190749363	1.59436826453860e-12	190907760	190927969
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190924564	191041481	38	33	0.0262	1.5943682645386e-12	190907760	190927969	0.0242131232697046	191017024	191133609
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	191111451	191153613	7	7	-0.3473	0.0242131232697046	191017024	191133609	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	155411053	45484	43204	-7e-04	NA	NA	NA	6.54368353593277e-13	155405839	155411053
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155416484	155427637	6	6	0.9746	6.54368353593277e-13	155405839	155411053	1.09463178953070e-12	155427637	155432745
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155432745	180189516	8153	7740	0.004	1.0946317895307e-12	155427637	155432745	9.70335760233467e-08	180182580	180346557
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180192214	180357210	10	9	-0.6259	9.70335760233467e-08	180182580	180346557	1.87806206024956e-07	180348365	180364670
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180358977	180644810	113	104	-0.0077	1.87806206024956e-07	180348365	180364670	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	29950805	10587	10034	0.0043	NA	NA	NA	8.37408242796465e-09	29930018	29980445
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30031367	20	19	0.4583	8.37408242796465e-09	29930018	29980445	6.94665916195585e-08	30004636	30053354
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30033946	32558677	1070	1016	0.01	6.94665916195585e-08	30004636	30053354	4.79672535330807e-157	32558677	32564884
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32633691	17	17	-2.1706	4.79672535330807e-157	32558677	32564884	4.86800081720072e-27	32629848	32633691
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32713363	28	27	-0.0339	4.86800081720072e-27	32629848	32633691	1.47203026163655e-05	32711957	32721872
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32723722	6	5	-0.8877	1.47203026163655e-05	32711957	32721872	1.71868404765818e-05	32723722	32723722
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32728285	32728487	2	2	-2.8209	1.71868404765818e-05	32723722	32723722	3.18209396496310e-20	32728487	32728487
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	32745036	8	8	0.147	3.1820939649631e-20	32728487	32728487	2.94449112767333e-05	32739800	32745036
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32745693	32762061	5	5	-0.8976	2.94449112767333e-05	32739800	32745036	5.66057150644773e-09	32762061	32767722
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32766023	54035000	8246	7829	-0.0031	5.66057150644773e-09	32762061	32767722	8.07255785383655e-24	54035000	54035000
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	1.8359	8.07255785383655e-24	54035000	54035000	4.82563922129415e-24	54042734	54042734
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	74647491	5288	5024	0.0042	4.82563922129415e-24	54042734	54042734	3.98025220783022e-105	74647491	74647491
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74650995	74653360	2	2	-4.6369	3.98025220783022e-105	74647491	74647491	3.36282852315724e-103	74653360	74653360
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74655219	103841482	7917	7556	0.0016	3.36282852315724e-103	74653360	74653360	3.44317504523152e-11	103827105	103841482
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	1.1111	3.44317504523152e-11	103827105	103841482	2.87771514389773e-11	103868154	103873584
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	134629897	10480	9940	0.0037	2.87771514389773e-11	103868154	103873584	6.48029354674607e-08	134627341	134629897
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134631701	134631701	1	0	NA	6.48029354674607e-08	134627341	134629897	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134633117	134635779	3	3	-1.0818	NA	NA	NA	3.70323913858825e-08	134635779	134639397
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134639397	151542179	5796	5518	-0.0051	3.70323913858825e-08	134635779	134639397	7.3691392680052e-81	151542179	151542179
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	151546355	151546355	1	0	NA	7.3691392680052e-81	151542179	151542179	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	151549525	151552684	3	3	-3.2823	NA	NA	NA	2.22399664596763e-76	151552684	151552684
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	151554478	165643653	4822	4569	-2e-04	2.22399664596763e-76	151552684	151552684	2.34269050249496e-14	165642393	165643653
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.2539	2.34269050249496e-14	165642393	165643653	1.56471797757886e-13	165650610	165653315
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1700	0.0115	1.56471797757886e-13	165650610	165653315	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	16135701	5388	5100	-2e-04	NA	NA	NA	1.74150108955022e-09	16135701	16135701
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	1.4719	1.74150108955022e-09	16135701	16135701	9.79584241828568e-10	16140018	16140018
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	64523575	14172	13392	1e-04	9.79584241828568e-10	16140018	16140018	7.18610622980667e-10	64523575	64523575
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64532019	64532949	2	2	-1.4809	7.18610622980667e-10	64523575	64523575	1.85328825966066e-09	64532949	64532949
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64534167	141690753	30369	28840	9e-04	1.85328825966066e-09	64532949	64532949	5.19471486481916e-259	141690753	141690753
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141712786	9	9	-3.4877	5.19471486481916e-259	141690753	141690753	8.37184043351755e-209	141712786	141712786
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141714168	144399712	977	922	0.0169	8.37184043351755e-209	141712786	141712786	6.35858693401646e-14	144399712	144399712
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144403133	144404463	2	2	-1.8946	6.35858693401646e-14	144399712	144399712	1.72751341344504e-15	144404463	144404463
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144411778	158821263	5774	5454	0.003	1.72751341344504e-15	144404463	144404463	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	116	0.0114	NA	NA	NA	9.6120618797899e-24	581533	581533
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	2.1619	9.6120618797899e-24	581533	581533	7.49328104880671e-20	588865	588865
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	1731817	390	370	0.0347	7.49328104880671e-20	588865	588865	2.11543600728152e-08	1731817	1731817
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	1733696	1734365	2	2	-1.3621	2.11543600728152e-08	1731817	1731817	1.47116697509251e-07	1734365	1735274
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	1735274	2234351	224	216	0.0081	1.47116697509251e-07	1734365	1735274	3.1776757557246e-30	2234351	2234351
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2242849	2251011	4	4	-1.9079	3.1776757557246e-30	2234351	2234351	3.5354390044563e-34	2251011	2251011
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2257255	146264846	43825	41595	0.0012	3.5354390044563e-34	2251011	2251011	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	189055	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	194104	5623484	2088	1986	0.0069	NA	NA	NA	2.17924002332148e-07	5621129	5623484
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	5632749	5634019	2	2	-1.2573	2.17924002332148e-07	5621129	5623484	1.96850280468771e-07	5634019	5646414
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	5646414	22477358	5746	5443	-0.0016	1.96850280468771e-07	5634019	5646414	1.74228757053147e-18	22477358	22477358
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	1.9324	1.74228757053147e-18	22477358	22477358	2.11951418591124e-17	22492603	22492603
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	137352394	29000	27464	-0.0053	2.11951418591124e-17	22492603	22492603	1.00160648056279e-13	137352394	137352394
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.7282	1.00160648056279e-13	137352394	137352394	5.24593531516188e-11	137356880	137356880
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1042	-0.0315	5.24593531516188e-11	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	47017598	14530	13796	-0.012	NA	NA	NA	4.7346444082749e-34	46561216	47057097
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47021415	47117942	24	23	-0.7979	4.7346444082749e-34	46561216	47057097	1.92808945841569e-34	47106750	47125093
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47124718	47124718	1	0	NA	1.92808945841569e-34	47106750	47125093	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47125093	77917893	10037	9499	-0.0027	NA	NA	NA	1.04776960931276e-22	77917893	77917893
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	1.7901	1.04776960931276e-22	77917893	77917893	7.4185644415602e-22	77928738	77928738
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	77936034	1	0	NA	7.4185644415602e-22	77928738	77928738	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77940201	135285645	20212	19185	0.0015	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	134450318	45304	42985	0.0019	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	11116883	4329	4104	0.0051	NA	NA	NA	2.19154014628602e-20	11112600	11116883
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	6	1.2251	2.19154014628602e-20	11112600	11116883	1.49591943375374e-20	11140421	11140421
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	33270966	7600	7190	0.0032	1.49591943375374e-20	11140421	11140421	9.89961833692358e-144	33270966	33270966
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33278235	33283825	2	2	-5.5098	9.89961833692358e-144	33270966	33270966	9.69786735759194e-143	33283825	33283825
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33290235	132289090	33223	31510	-0.0014	9.69786735759194e-143	33283825	33283825	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	56657371	14026	13325	-3e-04	NA	NA	NA	1.08274793165813e-32	56650373	56657371
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56658479	56686863	15	15	0.963	1.08274793165813e-32	56650373	56657371	2.22575613816897e-32	56686863	56688605
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56688605	68142120	2693	2559	0.0062	2.22575613816897e-32	56686863	56688605	8.73113984821962e-16	68136198	68146755
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68144264	68161714	9	8	-0.9169	8.73113984821962e-16	68136198	68146755	1.99915101538627e-16	68155925	68167758
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68163523	68163523	1	0	NA	1.99915101538627e-16	68155925	68167758	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68167758	100690991	10336	9788	0.0073	NA	NA	NA	1.25121412053822e-85	100690991	100690991
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-4.1353	1.25121412053822e-85	100690991	100690991	2.23337374848599e-77	100693892	100693892
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	100695073	1	0	NA	2.23337374848599e-77	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100696985	113562925	4349	4133	-8e-04	NA	NA	NA	1.49122599554115e-35	113562925	113562925
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113565415	113568600	3	3	-2.3048	1.49122599554115e-35	113562925	113562925	2.41450247951280e-28	113568600	113568600
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113571085	114123340	209	200	0.0044	2.4145024795128e-28	113568600	113568600	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19437192	36	34	-0.3897	NA	NA	NA	2.11065740162967e-11	19415745	19456276
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19441654	19441654	1	0	NA	2.11065740162967e-11	19415745	19456276	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19442895	73075500	19385	18326	-0.001	NA	NA	NA	8.1691438302658e-14	73071404	73075500
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73082262	73092112	5	4	1.2373	8.1691438302658e-14	73071404	73075500	2.27783287260497e-13	73092112	73101327
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	105856591	12276	11576	-0.0033	2.27783287260497e-13	73092112	73101327	8.89679322660556e-20	105856591	105856591
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856972	105875924	4	4	-1.4989	8.89679322660556e-20	105856591	105856591	8.22487479945074e-17	105875924	105881677
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881677	106221696	128	122	0.0347	8.22487479945074e-17	105875924	105881677	2.90797808680579e-06	106199156	106232699
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106223137	106280415	22	21	0.4669	2.90797808680579e-06	106199156	106232699	0.000658312379559972	106253648	106308263
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106281746	106358491	28	27	0.1064	0.000658312379559972	106253648	106308263	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18886649	30	30	-0.1116	NA	NA	NA	8.91399107679063e-11	18874259	19421704
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19109124	19537035	69	65	-0.548	8.91399107679063e-11	18874259	19421704	9.65013507596237e-44	19412049	19803092
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	100298352	31223	29609	-0.0037	9.65013507596237e-44	19412049	19803092	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	14876356	5468	5208	-0.0129	NA	NA	NA	3.32509296434245e-07	14669740	14958374
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14956177	14956177	1	0	NA	3.32509296434245e-07	14669740	14958374	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14956252	15037844	15	14	-0.5064	NA	NA	NA	1.53930663680484e-07	15034210	15045430
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15039224	32379126	5089	4828	-0.0053	1.53930663680484e-07	15034210	15045430	3.02070409155428e-21	31843922	32518665
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33559207	45	42	0.4711	3.02070409155428e-21	31843922	32518665	2.03318219436276e-22	33528385	33846647
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33647856	68693086	7681	7297	-0.0078	2.03318219436276e-22	33528385	33846647	9.17030813975884e-11	68687301	68710277
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68753209	10	10	-0.6963	9.17030813975884e-11	68687301	68710277	8.13997836461855e-09	68747578	68844016
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	70647078	803	774	-0.0385	8.13997836461855e-09	68747578	68844016	1.48811778915505e-21	70647078	70647078
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	70653499	70665447	4	4	1.5622	1.48811778915505e-21	70647078	70647078	1.75442853668368e-22	70665447	70665447
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	70669873	70669873	1	0	NA	1.75442853668368e-22	70665447	70665447	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	70675760	75093957	1406	1330	-0.0188	NA	NA	NA	1.40311060855583e-56	75093957	75093957
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	2.8524	1.40311060855583e-56	75093957	75093957	2.45878466151680e-63	75100865	75100865
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76923844	609	589	-0.0078	2.4587846615168e-63	75100865	75100865	3.16926736163112e-36	76923844	76929598
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76925748	76925748	1	0	NA	3.16926736163112e-36	76923844	76929598	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	1.337	NA	NA	NA	6.85542081126295e-31	76938723	76942679
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4276	-0.0061	6.85542081126295e-31	76938723	76942679	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1903358	853	809	-0.02	NA	NA	NA	1.19284900322162e-11	1902148	1906319
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1904451	1909874	6	6	0.9414	1.19284900322162e-11	1902148	1906319	5.6579309991396e-12	1906391	1910544
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1910544	36673853	13012	12321	-0.0072	5.6579309991396e-12	1906391	1910544	7.13716027728763e-59	36673853	36673853
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	5	-2.2557	7.13716027728763e-59	36673853	36673853	3.94129622060888e-58	36683509	36683509
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	41521544	2013	1915	-0.01	3.94129622060888e-58	36683509	36683509	4.58314085527777e-21	41515622	41522429
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41522429	41566540	20	20	-0.6758	4.58314085527777e-21	41515622	41522429	1.30237018551417e-05	41553226	41572001
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41624013	27	27	-1.039	1.30237018551417e-05	41553226	41572001	0.00582241746842508	41608837	41644979
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41625390	41708551	18	18	-0.7686	0.00582241746842508	41608837	41644979	3.30597535255442e-23	41706870	42143048
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41710400	41710400	1	0	NA	3.30597535255442e-23	41706870	42143048	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	78653545	13679	12953	-0.0068	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	21820	-0.0012	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	465	-0.036	NA	NA	NA	3.31864011974626e-29	1398325	1398325
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	2.6993	3.31864011974626e-29	1398325	1398325	2.62579290214887e-32	1400840	1400840
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	63788698	22565	21421	-0.0214	2.62579290214887e-32	1400840	1400840	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	559	-0.0236	NA	NA	NA	8.14437990390605e-67	1506379	1515948
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	9	-1.8907	8.14437990390605e-67	1506379	1515948	1.57608811814325e-77	1525300	1531162
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	12095485	3691	3512	-9e-04	1.57608811814325e-77	1525300	1531162	2.13812695452342e-08	12083473	12095485
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12108105	12113855	2	2	1.3459	2.13812695452342e-08	12083473	12095485	8.38423522120377e-08	12113855	12127349
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12127349	62419534	17291	16401	-0.0032	8.38423522120377e-08	12113855	12127349	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12708	4e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	35472378	9551	9065	-8e-04	NA	NA	NA	3.33066115526380e-14	35472378	35472378
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	1.7936	3.3306611552638e-14	35472378	35472378	3.14507525282358e-13	35476942	35476942
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6625	-0.011	3.14507525282358e-13	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	266212	127	123	-0.1386	NA	NA	NA	3.42860205469439e-09	266212	266212
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	267060	267079	2	2	1.7217	3.42860205469439e-09	266212	266212	1.12059601474221e-14	267079	267079
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	268402	268402	1	0	NA	1.12059601474221e-14	267079	267079	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	268555	1431411	659	633	-0.0666	NA	NA	NA	3.65103687079796e-18	1431411	1431411
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-2.0506	3.65103687079796e-18	1431411	1431411	2.18030334373728e-14	1432953	1432953
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2708291	1002	948	-0.0886	2.18030334373728e-14	1432953	1432953	0	2708113	2711273
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	118917875	34072	32293	1.0012	0	2708113	2711273	6.00709292646271e-13	118915469	118928356
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	118918876	118941322	12	12	1.7736	6.00709292646271e-13	118915469	118928356	3.84763738637702e-13	118931241	118944710
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	118942995	154025967	10913	10406	1.0007	3.84763738637702e-13	118931241	118944710	1.36914179869956e-09	153867340	154028488
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154028488	154038318	4	4	1.4202	1.36914179869956e-09	153867340	154028488	0.0153821302739260	154038318	154054530
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154079002	12	11	1.8811	0.015382130273926	154038318	154054530	2.10685105556602e-13	154078819	154086636
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154085354	154442377	89	83	1.0106	2.10685105556602e-13	154078819	154086636	5.09976309289352e-06	154441943	154442377
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154449960	3	3	2.1056	5.09976309289352e-06	154441943	154442377	5.22133336496917e-08	154449960	154449960
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154450309	154582414	29	27	0.9954	5.22133336496917e-08	154449960	154449960	7.93692522509216e-54	154578922	154586690
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	190	-0.0176	7.93692522509216e-54	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3034907	121	115	-3.6416	NA	NA	NA	1.06998883235343e-20	2969891	3223585
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3219200	5593746	19	18	-0.9722	1.06998883235343e-20	2969891	3223585	6.72894568068392e-11	4948824	6696721
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7161694	188	176	-3.1638	6.72894568068392e-11	4948824	6696721	2.37947040411049e-06	7029972	7242656
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7165588	7495687	115	109	-2.2842	2.37947040411049e-06	7029972	7242656	0.000441840837464462	7311948	7653082
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	8010446	155	149	-2.9897	0.000441840837464462	7311948	7653082	0.000230948542660762	7751430	8245608
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8016395	10515697	368	352	-3.4578	0.000230948542660762	7751430	8245608	6.19726950694557e-23	10504879	11249952
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	12682301	84	79	-2.0262	6.19726950694557e-23	10504879	11249952	0.00107456936927437	12614562	12725675
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	19	-3.5794	0.00107456936927437	12614562	12725675	3.56807456680486e-05	12786515	12861657
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	13129843	113	109	-2.0417	3.56807456680486e-05	12786515	12861657	0.000809018271067546	13066543	13153920
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13133803	1	0	NA	0.000809018271067546	13066543	13153920	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13136828	13254711	40	38	-3.0175	NA	NA	NA	0.0073725037856924	13153117	13328273
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13256555	13606316	164	154	-3.652	0.0073725037856924	13153117	13328273	2.48760823681942e-05	13587025	13644667
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13633041	13699223	10	9	-2.118	2.48760823681942e-05	13587025	13644667	2.62096701494272e-11	13692518	13701755
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13700962	13823928	31	30	-4.002	2.62096701494272e-11	13692518	13701755	7.16140481371527e-09	13816133	13828384
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13828384	13863657	8	8	-2.354	7.16140481371527e-09	13816133	13828384	8.91191724106291e-07	13863616	13869106
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13866668	14045293	86	80	-3.8733	8.91191724106291e-07	13863616	13869106	1.52972142801651e-07	14039969	14045293
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14046104	14056906	3	3	-1.3258	1.52972142801651e-07	14039969	14045293	0.000137692641641690	14056906	14070165
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14063795	14352278	68	62	-3.778	0.00013769264164169	14056906	14070165	0.000111392130655057	14321882	14411113
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14353244	14508021	93	90	-2.9344	0.000111392130655057	14321882	14411113	6.2552684628887e-06	14492454	14546195
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	6.2552684628887e-06	14492454	14546195	NA	NA	NA
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14687556	39	37	-1.6673	NA	NA	NA	4.71486663083011e-10	14598838	14700040
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14689490	15299931	190	183	-3.1578	4.71486663083011e-10	14598838	14700040	2.50478129305249e-06	15263754	15309005
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15301380	15388044	56	52	-4.0988	2.50478129305249e-06	15263754	15309005	0.000150991331197942	15378329	15433122
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15389388	15915466	157	145	-3.3147	0.000150991331197942	15378329	15433122	0.000540875161286336	15658114	16027648
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16182565	108	101	-2.6296	0.000540875161286336	15658114	16027648	4.51093770357787e-13	16103913	16221882
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16183348	22930737	1094	1041	-3.5222	4.51093770357787e-13	16103913	16221882	3.27143228709323e-80	22924754	26870361
MSK_252152916521_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	84	-1.2127	3.27143228709323e-80	22924754	26870361	NA	NA	NA
