Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72537426	27894	26939	0.0037	NA	NA	NA	3.12246400252345e-71	72537426	72540240
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72574479	13	12	-1.889	3.12246400252345e-71	72537426	72540240	3.58082351051879e-78	72571158	72574479
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72579311	143700072	15622	15126	-8e-04	3.58082351051879e-78	72571158	72574479	2.43483396901078e-25	143644120	143719710
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143702972	144113654	88	86	-0.4075	2.43483396901078e-25	143644120	143719710	7.62421162327994e-23	144003068	144133104
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144120542	150839754	1851	1793	-0.009	7.62421162327994e-23	144003068	144133104	1.36163855075737e-63	150839754	150839754
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150851439	7	6	-2.4547	1.36163855075737e-63	150839754	150839754	5.51931786316707e-61	150851439	150851439
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2673	-0.0033	5.51931786316707e-61	150851439	150851439	5.37895823844347e-23	157133150	157133150
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-2.6136	5.37895823844347e-23	157133150	157133150	5.78900509885516e-26	157136342	157136342
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167483267	4108	3981	-0.0207	5.78900509885516e-26	157136342	157136342	4.33003456811099e-186	167483267	167483267
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	7	-3.7078	4.33003456811099e-186	167483267	167483267	6.62234279579937e-174	167507898	167507898
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	246769018	28669	27716	-0.0038	6.62234279579937e-174	167507898	167507898	5.27614203786385e-29	246755225	246794552
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246794552	246875016	30	29	-0.7565	5.27614203786385e-29	246755225	246794552	2.70077381802185e-17	246863179	246902470
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246878405	247186514	95	93	-0.0418	2.70077381802185e-17	246863179	246902470	NA	NA	NA
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	35553983	11921	11530	-0.0036	NA	NA	NA	4.87139574580364e-10	35553983	35553983
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35556102	35562007	2	2	-1.7123	4.87139574580364e-10	35553983	35553983	1.02112068068048e-09	35562007	35562007
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35564203	242689978	65904	63716	-0.0025	1.02112068068048e-09	35562007	35562007	NA	NA	NA
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	164001657	53490	51714	-0.0011	NA	NA	NA	9.58917782482534e-51	163997228	164005577
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164005577	164107951	26	24	1.0742	9.58917782482534e-51	163997228	164005577	8.56706279729177e-51	164105613	164112873
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	199329592	12116	11706	-0.0011	8.56706279729177e-51	164105613	164112873	NA	NA	NA
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	116373928	34201	33091	0.0028	NA	NA	NA	3.08089213207839e-73	116373928	116373928
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	116387109	116392122	2	2	-4.4142	3.08089213207839e-73	116373928	116373928	1.92965891860655e-75	116392122	116392122
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	116396677	187331981	19716	19047	0.0021	1.92965891860655e-75	116392122	116392122	9.17821654515722e-09	187330240	187331981
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187333619	187338465	3	3	1.2839	9.17821654515722e-09	187330240	187331981	3.13268594801486e-09	187338465	187346058
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187346058	190772330	1141	1100	-0.0043	3.13268594801486e-09	187338465	187346058	9.46786717699343e-14	190717801	190802789
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190777444	190921041	53	53	-0.3846	9.46786717699343e-14	190717801	190802789	2.1617503541194e-06	190888913	190940021
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190924564	191041481	38	36	-0.0096	2.1617503541194e-06	190888913	190940021	0.028654912148905	191004049	191133609
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	191111451	191153613	7	7	-0.3526	0.028654912148905	191004049	191133609	NA	NA	NA
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	180644810	53766	51964	-0.0017	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	32558677	11677	11241	0.0016	NA	NA	NA	9.99365767288897e-61	32558677	32567462
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32600962	9	8	-2.0218	9.99365767288897e-61	32558677	32567462	4.18231547082423e-06	32595402	32600962
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	32626619	4	4	0.8494	4.18231547082423e-06	32595402	32600962	5.63542913971221e-14	32626619	32631315
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32628420	54035000	8299	8047	-0.007	5.63542913971221e-14	32626619	32631315	1.08187125323053e-52	54035000	54035000
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-3.2032	1.08187125323053e-52	54035000	54035000	3.14096037653149e-58	54042734	54042734
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	165643653	34317	33194	-7e-04	3.14096037653149e-58	54042734	54042734	6.69589733850303e-15	165643653	165643653
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	3	1.6589	6.69589733850303e-15	165643653	165643653	3.60168043582267e-14	165650610	165650610
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1740	-0.0067	3.60168043582267e-14	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	16135701	5388	5208	0.0129	NA	NA	NA	1.75031674265140e-50	16135701	16135701
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-3.7012	1.7503167426514e-50	16135701	16135701	1.02389674548944e-50	16140018	16140018
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	48549993	11673	11283	-0.0074	1.02389674548944e-50	16140018	16140018	9.33380065997214e-09	48546315	48549993
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	48551463	48551463	1	0	NA	9.33380065997214e-09	48546315	48549993	NA	NA	NA
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	48554059	48562631	7	7	-0.8565	NA	NA	NA	1.00562532537901e-08	48562631	48575004
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	48572106	109217320	17890	17288	0.0025	1.00562532537901e-08	48562631	48575004	1.06137741214779e-84	109217320	109217320
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109230336	109231462	2	2	-4.7999	1.06137741214779e-84	109217320	109217320	1.59022923625491e-10	109231462	109231462
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109233214	109240210	3	3	-1.6148	1.59022923625491e-10	109231462	109231462	1.04186446174951e-13	109240210	109240210
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109244233	109967918	301	292	0.0049	1.04186446174951e-13	109240210	109240210	1.56273302050072e-105	109967918	109967918
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109970524	109974402	2	2	-5.4427	1.56273302050072e-105	109967918	109967918	4.24257434200406e-113	109974402	109974402
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109976628	118611324	3996	3869	-0.0064	4.24257434200406e-113	109974402	109974402	5.01077964443215e-73	118611324	118611324
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	-3.5862	5.01077964443215e-73	118611324	118611324	1.15422896232791e-71	118620875	118620875
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	125831554	3170	3057	0.002	1.15422896232791e-71	118620875	118620875	6.1771907973041e-99	125831554	125831554
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-4.1995	6.1771907973041e-99	125831554	125831554	6.56416642522375e-93	125837524	125837524
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	158821263	14254	13740	7e-04	6.56416642522375e-93	125837524	125837524	NA	NA	NA
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	113	0.0061	NA	NA	NA	9.04055409660259e-09	581533	581533
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-1.7338	9.04055409660259e-09	581533	581533	2.60713158779160e-10	588865	588865
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	2234351	616	594	0.0193	2.6071315877916e-10	588865	588865	7.30313317130706e-07	2231804	2234351
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2242849	2251011	4	4	-0.9994	7.30313317130706e-07	2231804	2234351	9.0586740319279e-07	2251011	2261571
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2257255	25022606	7388	7137	-0.006	9.0586740319279e-07	2251011	2261571	2.3116781451921e-56	25022606	25030003
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	-3.195	2.3116781451921e-56	25022606	25030003	3.0311965109781e-16	25034970	25039370
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	25120552	27	27	0.0274	3.0311965109781e-16	25034970	25039370	5.72734065341316e-08	25120552	25120552
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	5.72734065341316e-08	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	-1.7206	NA	NA	NA	4.58597402512769e-10	25125700	25125700
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	146264846	36404	35173	0	4.58597402512769e-10	25125700	25125700	NA	NA	NA
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	70926188	13072	12638	-0.0016	NA	NA	NA	2.92088816715396e-09	70923005	70926188
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.6042	2.92088816715396e-09	70923005	70926188	2.62596884040386e-08	70930528	70935055
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	140145683	24870	24064	-0.0083	2.62596884040386e-08	70930528	70935055	NA	NA	NA
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	77917893	24592	23792	-0.0051	NA	NA	NA	7.24010772281369e-25	77917893	77917893
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-2.6338	7.24010772281369e-25	77917893	77917893	1.98336122162871e-23	77928669	77928669
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	135285645	20214	19535	-0.0039	1.98336122162871e-23	77928669	77928669	NA	NA	NA
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1706	0.0018	NA	NA	NA	1.74879512456675e-115	4923300	4923300
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-3.99	1.74879512456675e-115	4923300	4923300	4.8563010143392e-147	4932214	4932214
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	46096588	13774	13342	-4e-04	4.8563010143392e-147	4932214	4932214	5.23181433669134e-10	46095353	46096588
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	46099212	46103800	4	4	1.2034	5.23181433669134e-10	46095353	46096588	2.74048607264935e-10	46103800	46105220
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	46105220	55118214	1350	1297	-0.0072	2.74048607264935e-10	46103800	46105220	1.88103326521318e-18	55095200	55134486
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55217189	40	38	-0.536	1.88103326521318e-18	55095200	55134486	1.10086614915552e-18	55200744	55229096
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	134450318	28359	27482	-0.0017	1.10086614915552e-18	55200744	55229096	NA	NA	NA
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	132289090	45161	43676	0.0016	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	36969571	7039	6812	-0.0101	NA	NA	NA	9.5335346933671e-67	36969571	36969571
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36976441	36982877	2	2	-4.3009	9.5335346933671e-67	36969571	36969571	1.40013804509618e-71	36982877	36982877
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36989091	51296396	5767	5607	0.0011	1.40013804509618e-71	36982877	36982877	1.28249691292582e-08	51293672	51296396
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	51298094	51300398	3	3	-1.2569	1.28249691292582e-08	51293672	51296396	4.71582233052561e-08	51300398	51301682
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	51301682	56657371	1215	1179	0.0082	4.71582233052561e-08	51300398	51301682	9.9454351345523e-22	56646284	56657371
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56658479	56686863	15	14	0.9612	9.9454351345523e-22	56646284	56657371	2.76878971265939e-24	56686863	56693033
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56688605	89657473	8251	7975	0.0064	2.76878971265939e-24	56686863	56693033	8.76885880759753e-80	89657473	89657473
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89659397	89659397	1	0	NA	8.76885880759753e-80	89657473	89657473	NA	NA	NA
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	-4.5197	NA	NA	NA	3.6277845347415e-76	89662326	89662326
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	114123340	9349	9028	-0.004	3.6277845347415e-76	89662326	89662326	NA	NA	NA
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	105597555	31642	30603	-4e-04	NA	NA	NA	2.21057332082708e-208	105597555	105597555
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	-3.1147	2.21057332082708e-208	105597555	105597555	1.62052703506472e-130	105632168	105632168
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	106358491	231	220	-0.0161	1.62052703506472e-130	105632168	105632168	NA	NA	NA
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	75115806	21885	21177	-0.0057	NA	NA	NA	6.44557076713436e-18	75115806	75115806
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	-2.321	6.44557076713436e-18	75115806	75115806	4.24900657125927e-18	75119713	75119713
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	100298352	9435	9123	-0.0064	4.24900657125927e-18	75119713	75119713	NA	NA	NA
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	33628	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	37560	34333833	10709	10356	0.0049	NA	NA	NA	3.25151519982769e-09	34280904	34397154
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34339543	34552260	39	38	0.407	3.25151519982769e-09	34280904	34397154	1.38337433675267e-10	34533735	34602318
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34556917	72918129	9013	8722	-0.0017	1.38337433675267e-10	34533735	34602318	5.43612130152425e-09	72915477	72929786
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72929786	72964783	7	7	0.8795	5.43612130152425e-09	72915477	72929786	7.04722460927265e-08	72963578	73030029
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73022578	75097331	755	729	0.0016	7.04722460927265e-08	72963578	73030029	8.03879678110616e-16	75097331	75097331
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75099083	75100865	2	2	-2.2896	8.03879678110616e-16	75097331	75097331	1.10094198515761e-19	75100865	75100865
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76923844	609	586	-0.0142	1.10094198515761e-19	75100865	75100865	3.63055336835016e-64	76923844	76931247
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76925748	76925748	1	0	NA	3.63055336835016e-64	76923844	76931247	NA	NA	NA
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	-2.1775	NA	NA	NA	1.12121859373001e-56	76937156	76940218
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4358	-2e-04	1.12121859373001e-56	76937156	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1903358	853	824	0.0191	NA	NA	NA	8.9867120354603e-07	1901302	1904451
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1904451	1906391	4	4	1.1126	8.9867120354603e-07	1901302	1904451	1.31499534879538e-07	1906352	1909371
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	36673853	13014	12565	0.0046	1.31499534879538e-07	1906352	1909371	7.70207372200782e-37	36673853	36673853
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	5	-2.0941	7.70207372200782e-37	36673853	36673853	3.00133174918917e-35	36683509	36683509
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	41521544	2013	1941	0.014	3.00133174918917e-35	36683509	36683509	1.82363950353938e-77	41518222	41522429
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41522429	41710400	66	65	-0.8582	1.82363950353938e-77	41518222	41522429	3.28055636729706e-80	41708551	42147225
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	78653545	13679	13166	0.0083	3.28055636729706e-80	41708551	42147225	NA	NA	NA
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	53110731	16206	15703	-0.0092	NA	NA	NA	6.7084222912575e-09	53110731	53110731
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53114028	53116053	2	2	-1.6069	6.7084222912575e-09	53110731	53110731	1.12534631855827e-08	53116053	53118362
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53118362	76116026	6756	6547	-0.0064	1.12534631855827e-08	53116053	53118362	NA	NA	NA
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	63788698	23059	22230	0.0104	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	571	-0.0256	NA	NA	NA	1.65503369832260e-19	1499421	1511632
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	1.0789	1.6550336983226e-19	1499421	1511632	1.7526359296964e-19	1531162	1544485
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	20316	-0.0058	1.7526359296964e-19	1531162	1544485	NA	NA	NA
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13012	-0.0041	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	22667608	2982	2902	0.0132	NA	NA	NA	3.04350944226434e-23	22643742	22682428
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22720195	20	19	0.9407	3.04350944226434e-23	22643742	22682428	5.61081509095681e-27	22713972	22721042
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22721042	35472378	6549	6329	0.0044	5.61081509095681e-27	22713972	22721042	3.69687342492258e-10	35472378	35472378
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	1.8046	3.69687342492258e-10	35472378	35472378	6.08295597222538e-09	35476942	35476942
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	35478503	1	0	NA	6.08295597222538e-09	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35479767	49571068	7002	6745	0.0139	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	266212	127	126	-0.1537	NA	NA	NA	1.06243667331170e-06	264886	266212
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	267060	267079	2	2	1.6216	1.0624366733117e-06	264886	266212	5.84365934270279e-08	267079	268402
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	268402	1431411	660	641	-0.0128	5.84365934270279e-08	267079	268402	5.69180502112657e-09	1431411	1431411
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-1.7442	5.69180502112657e-09	1431411	1431411	2.18769145304584e-07	1432953	1434970
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2303192	610	587	-0.0467	2.18769145304584e-07	1432953	1434970	2.34471832889656e-28	2303192	2303192
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303218	2304398	3	3	-2.7163	2.34471832889656e-28	2303192	2303192	9.45177131142066e-32	2304398	2304398
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2708291	389	379	-0.0774	9.45177131142066e-32	2304398	2304398	0	2708113	2711273
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	154025967	44997	43543	1.0309	0	2708113	2711273	3.51777864943073e-13	154021108	154031239
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154028488	154079002	16	14	1.8337	3.51777864943073e-13	154021108	154031239	5.50845476879946e-11	154070953	154088378
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154085354	154442377	89	85	1.0323	5.50845476879946e-11	154070953	154088378	1.65532377969981e-72	154442377	154442377
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	4	-2.4835	1.65532377969981e-72	154442377	154442377	6.59388571050361e-141	154450309	154450309
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	27	1.0668	6.59388571050361e-141	154450309	154450309	8.96702145251777e-51	154578922	154586690
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	195	-0.0288	8.96702145251777e-51	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	121	-3.5097	NA	NA	NA	7.20170372730617e-18	2973379	3773948
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3733715	1	0	NA	7.20170372730617e-18	2973379	3773948	NA	NA	NA
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5672441	17	17	-1.0404	NA	NA	NA	8.17456356382266e-11	5531459	6711090
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6652845	7054924	174	167	-3.2831	8.17456356382266e-11	5531459	6711090	9.68989483259928e-07	7007724	7196517
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7495687	128	122	-2.3927	9.68989483259928e-07	7007724	7196517	0.00143715760290904	7320048	7625006
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7723783	75	72	-3.2058	0.00143715760290904	7320048	7625006	0.00544140958567224	7693377	7734410
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7782532	18	17	-2.0766	0.00544140958567224	7693377	7734410	4.67806881290166e-05	7758635	7827650
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	10515697	430	411	-3.3486	4.67806881290166e-05	7758635	7827650	3.68213159325417e-16	10513747	10515697
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10622062	10	10	-0.4747	3.68213159325417e-16	10513747	10515697	7.71132559870585e-06	10622062	12502304
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10631941	10645500	2	0	NA	7.71132559870585e-06	10622062	12502304	NA	NA	NA
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12999095	154	151	-2.6452	NA	NA	NA	0.000301336833992982	12959689	13008662
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13001517	13040293	18	18	-1.2271	0.000301336833992982	12959689	13008662	0.00286581453143836	13029929	13076862
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13041812	13128515	35	34	-2.453	0.00286581453143836	13029929	13076862	0.000186671284082976	13078432	13162723
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13606316	206	202	-3.2861	0.000186671284082976	13078432	13162723	0.000358686986312441	13573345	13649497
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13633041	13692518	9	9	-1.8828	0.000358686986312441	13573345	13649497	6.56181484823784e-07	13691261	13705594
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13699223	14358464	201	193	-3.4964	6.56181484823784e-07	13691261	13705594	1.82648349642622e-08	14352278	14359748
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14359748	14380301	12	12	-1.9516	1.82648349642622e-08	14352278	14359748	0.0183009688190489	14376942	14439890
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14381372	14508021	77	75	-3.0594	0.0183009688190489	14376942	14439890	0.000116075871240821	14492454	14547168
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	0.000116075871240821	14492454	14547168	NA	NA	NA
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	25	-1.7862	NA	NA	NA	3.20513700531237e-10	14555872	14601309
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	21036503	1250	1210	-3.3415	3.20513700531237e-10	14555872	14601309	3.42908970493126e-06	21028489	21041164
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054519	6	6	-0.8786	3.42908970493126e-06	21028489	21041164	3.03808592820500e-11	21048365	21057446
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	21403482	117	114	-3.6304	3.038085928205e-11	21048365	21057446	0.00117619416428131	21304680	21768833
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21406812	22178964	154	148	-3.1578	0.00117619416428131	21304680	21768833	0.000723607392501559	21980270	22252446
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22179794	22923722	89	84	-3.7303	0.000723607392501559	21980270	22252446	1.10877331631095e-50	22918955	22926726
MSK_252152916685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22924754	57440809	89	85	-1.384	1.10877331631095e-50	22918955	22926726	NA	NA	NA
