Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	34739490	12876	12495	0.0109	NA	NA	NA	7.27562431441597e-10	34739490	34739490
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34744470	34758017	2	2	-1.3361	7.27562431441597e-10	34739490	34739490	2.45787631669491e-10	34758017	34758017
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34761645	72537426	15016	14622	0.0049	2.45787631669491e-10	34758017	34758017	8.23003888232788e-55	72537426	72545984
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72574479	13	10	-1.3386	8.23003888232788e-55	72537426	72545984	1.50631352159398e-55	72567555	72574479
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72579311	72579311	1	0	NA	1.50631352159398e-55	72567555	72574479	NA	NA	NA
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	150819879	17556	17064	0.0025	NA	NA	NA	2.75328230709333e-140	150819879	150819879
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	11	2.0215	2.75328230709333e-140	150819879	150819879	9.8058401564838e-142	150851439	150851439
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	247186514	35673	34793	-0.0018	9.8058401564838e-142	150851439	150851439	NA	NA	NA
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	11212	-0.0062	NA	NA	NA	0	34543992	34543992
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34579933	14	14	-3.7003	0	34543992	34543992	1.84456255572799e-07	34574224	34579933
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34580533	34589997	4	4	-1.6021	1.84456255572799e-07	34574224	34579933	5.23275438329343e-33	34589997	34589997
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	66357387	11754	11397	1e-04	5.23275438329343e-33	34589997	34589997	2.42118731968223e-14	66357387	66357387
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	1.515	2.42118731968223e-14	66357387	66357387	5.79456197197713e-14	66360747	66360747
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	146571330	21778	21185	-0.005	5.79456197197713e-14	66360747	66360747	2.77671493425078e-204	146571330	146571330
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-4.0031	2.77671493425078e-204	146571330	146571330	1.01260236480399e-205	146592775	146592775
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	242689978	32749	31896	-0.0028	1.01260236480399e-205	146592775	146592775	NA	NA	NA
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10498	-0.0095	NA	NA	NA	3.10079380366111e-36	32074432	32074432
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	-2.3662	3.10079380366111e-36	32074432	32074432	3.75241501031751e-34	32080848	32080848
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	163992903	42690	41551	-0.0052	3.75241501031751e-34	32080848	32080848	1.52039599455517e-77	163989367	163992903
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164107951	28	28	0.9383	1.52039599455517e-77	163989367	163992903	1.07791804260855e-77	164107951	164112873
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	194354505	10130	9852	3e-04	1.07791804260855e-77	164107951	164112873	9.52622756953081e-49	194354505	194354505
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	1.6071	9.52622756953081e-49	194354505	194354505	1.12011428286733e-47	194366950	194366950
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	199329592	1980	1921	-7e-04	1.12011428286733e-47	194366950	194366950	NA	NA	NA
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	685953	215	211	-0.0435	NA	NA	NA	1.51580105392975e-10	685953	685953
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	689619	691065	2	2	1.1584	1.51580105392975e-10	685953	685953	5.48954721897112e-08	691065	693668
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	693668	9815760	3176	3095	-0.0016	5.48954721897112e-08	691065	693668	1.61634221765462e-211	9815760	9815760
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.0844	1.61634221765462e-211	9815760	9815760	1.43108100339243e-215	9842644	9842644
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	63653336	13871	13501	-0.0032	1.43108100339243e-215	9842644	9842644	1.01908555219090e-12	63627016	63676717
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	63661991	63789020	14	14	0.5424	1.0190855521909e-12	63627016	63676717	8.61243613893223e-12	63771337	63821962
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	63803025	68899247	1149	1118	0.0036	8.61243613893223e-12	63771337	63821962	3.27298735196537e-20	68896316	68901210
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	68901210	69165814	16	16	0.6578	3.27298735196537e-20	68896316	68901210	1.46549312612419e-21	69163312	69656183
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	119334954	16298	15866	0.003	1.46549312612419e-21	69163312	69656183	4.94170751277953e-34	119334954	119345371
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119345371	119348829	3	3	-1.8881	4.94170751277953e-34	119334954	119345371	1.4317585236673e-33	119346804	119348829
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119350354	187330240	19170	18682	0.0032	1.4317585236673e-33	119346804	119348829	6.84871789613905e-49	187330240	187330240
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-2.7755	6.84871789613905e-49	187330240	187330240	2.77261575647991e-48	187333619	187333619
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1203	-0.0233	2.77261575647991e-48	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	97060205	27471	26775	-0.005	NA	NA	NA	4.91855745379667e-14	97057534	97060205
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	97074064	97119376	7	7	-0.8178	4.91855745379667e-14	97057534	97060205	4.78317240077393e-14	97119376	97126918
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	97126918	150181399	16376	15944	-0.0044	4.78317240077393e-14	97119376	97126918	5.73619939051937e-12	150171154	150181399
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150185190	150202601	7	7	-0.7589	5.73619939051937e-12	150171154	150181399	7.24451785709949e-12	150202601	150207307
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	180189516	9782	9509	-0.0036	7.24451785709949e-12	150202601	150207307	1.03456605788113e-07	180178589	180346557
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180192214	180362342	12	12	-0.4762	1.03456605788113e-07	180178589	180346557	9.91523905908166e-09	180352261	180365977
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180364670	180644810	111	105	0.0142	9.91523905908166e-09	180352261	180365977	NA	NA	NA
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	240119	56	55	0.0111	NA	NA	NA	2.58027774341562e-10	232366	248239
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	241674	311748	38	38	-0.3863	2.58027774341562e-10	232366	248239	9.22129098746241e-18	303353	326323
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	313153	31385778	11088	10805	0.0016	9.2212909874624e-18	303353	326323	3.084345958105e-29	31385778	31389372
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31418006	6	6	-1.2409	3.084345958105e-29	31385778	31389372	1.35599233948317e-30	31393624	31418006
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	32558677	489	481	0.0253	1.35599233948317e-30	31393624	31418006	2.83206416864436e-56	32558677	32558677
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32600962	9	9	1.4126	2.83206416864436e-56	32558677	32558677	2.86860782131337e-55	32600962	32600962
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	54035000	8303	8084	-6e-04	2.86860782131337e-55	32600962	32600962	3.61204344789036e-112	54035000	54035000
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-3.4708	3.61204344789036e-112	54035000	54035000	8.62908299921932e-114	54042734	54042734
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	79018959	6432	6264	0.0067	8.62908299921932e-114	54042734	54042734	3.76785205093508e-27	79015901	79024557
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-0.8177	3.76785205093508e-27	79015901	79024557	3.51781390453979e-27	79085247	79095415
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	165643653	27872	27143	-6e-04	3.51781390453979e-27	79085247	79095415	4.39726092862391e-50	165643653	165643653
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.9836	4.39726092862391e-50	165643653	165643653	2.77905780015632e-49	165650610	165650610
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1755	-0.0221	2.77905780015632e-49	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	163711	12	12	0.4219	NA	NA	NA	4.5042939610164e-06	156409	183594
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	176344	20230695	6746	6551	0.0035	4.5042939610164e-06	156409	183594	0.303196925441455	20132748	20230695
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	20234398	20236099	2	2	0.5062	0.303196925441455	20132748	20230695	3.20857522381423e-20	20236099	20236099
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	20238450	20243406	3	3	-0.9562	3.20857522381423e-20	20236099	20236099	3.7934428257536e-09	20243406	20245704
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	20245704	141410894	43040	41850	0.0013	3.7934428257536e-09	20243406	20245704	4.48857810604558e-09	141402937	141417702
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	13	0.4565	4.48857810604558e-09	141402937	141417702	1.47231171679997e-06	141432778	141452085
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	141690753	117	110	0.0111	1.47231171679997e-06	141432778	141452085	4.53041749169109e-34	141689547	141690753
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	1.1394	4.53041749169109e-34	141689547	141690753	3.55459559280018e-39	141714168	141720324
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	141720303	1	0	NA	3.55459559280018e-39	141714168	141720324	NA	NA	NA
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720324	147702365	2511	2446	0.0024	NA	NA	NA	2.18274210063989e-11	147702365	147702365
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	1.3959	2.18274210063989e-11	147702365	147702365	4.91455440257614e-11	147707161	147707161
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	147708382	1	0	NA	4.91455440257614e-11	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147710037	151728811	1629	1579	-0.0144	NA	NA	NA	8.75203349007914e-07	151702948	151732266
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151730250	151743145	8	8	-0.5737	8.75203349007914e-07	151702948	151732266	5.05050500631672e-07	151739173	151751920
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151745100	158821263	2600	2524	-0.0075	5.05050500631672e-07	151739173	151751920	NA	NA	NA
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	117	-0.0086	NA	NA	NA	6.98531810464425e-28	581533	581533
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	1.8301	6.98531810464425e-28	581533	581533	1.98114148957547e-23	588865	588865
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	591112	1	0	NA	1.98114148957547e-23	588865	588865	NA	NA	NA
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	594169	1322896	226	223	0.0061	NA	NA	NA	3.60053605605753e-16	1319628	1327660
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	1325747	1351655	8	7	-0.8284	3.60053605605753e-16	1319628	1327660	8.6367706498638e-15	1346695	1353512
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	1353512	7226901	2037	1983	-0.0171	8.6367706498638e-15	1346695	1353512	8.11339624990063e-12	6926661	7260442
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7260442	7824059	8	8	-0.6971	8.11339624990063e-12	6926661	7260442	2.62537907170897e-11	7790934	8139999
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	25022606	5728	5597	-0.0056	2.62537907170897e-11	7790934	8139999	1.13992487965413e-61	25022606	25030003
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	-2.6033	1.13992487965413e-61	25022606	25030003	4.79990052784277e-15	25034970	25039370
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	25123025	28	28	-0.0283	4.79990052784277e-15	25034970	25039370	2.77695745228216e-11	25123025	25123025
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	-1.3107	2.77695745228216e-11	25123025	25123025	5.76296351500612e-10	25125700	25125700
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	146264846	36404	35434	5e-04	5.76296351500612e-10	25125700	25125700	NA	NA	NA
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	23343915	8000	7796	-0.0028	NA	NA	NA	8.03664430646687e-91	23343915	23343915
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	-3.0057	8.03664430646687e-91	23343915	23343915	8.97253474199208e-84	23365926	23365926
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	70926188	5069	4908	0.0012	8.97253474199208e-84	23365926	23365926	2.13046626823102e-63	70926188	70926188
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-3.2087	2.13046626823102e-63	70926188	70926188	1.95503018273352e-67	70930528	70930528
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	89532028	6173	6013	-0.0082	1.95503018273352e-67	70930528	70930528	4.14189986238682e-13	89521713	89536676
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	89533160	89590808	26	26	0.3915	4.14189986238682e-13	89521713	89536676	5.19837329020803e-13	89582528	89599396
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	89592176	116124007	9269	9038	-0.0137	5.19837329020803e-13	89582528	89599396	1.92103932258671e-10	116124007	116124007
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-1.3294	1.92103932258671e-10	116124007	116124007	4.07971079359308e-10	116130333	116130333
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	116132839	1	0	NA	4.07971079359308e-10	116130333	116130333	NA	NA	NA
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116137111	130739911	5670	5512	-0.0066	NA	NA	NA	3.88686486072641e-08	130738405	130739911
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	130741207	130744079	2	2	1.1879	3.88686486072641e-08	130738405	130739911	2.28545659509851e-07	130744079	130745994
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	130745994	140145683	3727	3621	-0.0079	2.28545659509851e-07	130744079	130745994	NA	NA	NA
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9483	-0.0071	NA	NA	NA	1.23088207302173e-86	27038538	27038538
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-3.6426	1.23088207302173e-86	27038538	27038538	1.55375248862925e-84	27041812	27041812
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	67738803	10519	10226	-0.0081	1.55375248862925e-84	27041812	27041812	4.00365453323226e-42	67737174	67745379
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	67741440	67742738	2	0	NA	4.00365453323226e-42	67737174	67745379	NA	NA	NA
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	67745379	67784457	18	17	-0.8928	NA	NA	NA	8.48533272876505e-43	67782096	67787935
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	67787935	77917893	4322	4198	0.0064	8.48533272876505e-43	67782096	67787935	8.5319554921154e-36	77917893	77917893
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-2.3891	8.5319554921154e-36	77917893	77917893	1.95123423998188e-35	77928669	77928669
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	127566573	17497	17053	-0.0038	1.95123423998188e-35	77928669	77928669	7.92888115677231e-12	127552919	127568592
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127568592	127608087	16	16	-0.5023	7.92888115677231e-12	127552919	127568592	2.27394760770583e-10	127607438	127618412
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127612608	135122727	2655	2583	-0.0362	2.27394760770583e-10	127607438	127618412	8.27402646505815e-21	135108641	135129257
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	135124875	135229796	37	36	0.4003	8.27402646505815e-21	135108641	135129257	0.000328103566574598	135215037	135255927
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	135252519	135285645	9	9	0.0261	0.000328103566574598	135215037	135255927	NA	NA	NA
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5744034	2140	2086	-0.0119	NA	NA	NA	3.44400783560987e-19	5741031	5744034
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5745329	5765438	13	13	-0.7447	3.44400783560987e-19	5741031	5744034	2.6047224448046e-21	5765438	5766615
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	35904408	10739	10462	-0.0046	2.6047224448046e-21	5765438	5766615	9.26668404652746e-10	35901199	35904408
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	35906394	35913533	4	4	-0.9252	9.26668404652746e-10	35901199	35904408	2.27372435791898e-10	35913533	35917126
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	35917126	55118214	4009	3894	7e-04	2.27372435791898e-10	35913533	35917126	4.00781859285218e-42	55112618	55129329
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55217189	40	40	-0.5808	4.00781859285218e-42	55112618	55129329	1.00347707317080e-40	55203706	55221692
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	61788047	2607	2532	-4e-04	1.0034770731708e-40	55203706	55221692	2.98734515586436e-07	61779902	61790379
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	61790379	61817078	10	10	0.4853	2.98734515586436e-07	61779902	61790379	1.44538643805084e-06	61808121	61825252
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	61817995	107157031	15609	15213	-4e-04	1.44538643805084e-06	61808121	61825252	2.0476964516055e-10	107153485	107157031
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107160270	107176389	8	8	0.6688	2.0476964516055e-10	107153485	107157031	4.84309089157349e-11	107176389	107178916
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107177546	118854073	4266	4155	-0.004	4.84309089157349e-11	107176389	107178916	5.5443794138688e-08	118837376	118868011
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	118858983	118896283	13	13	0.4498	5.5443794138688e-08	118837376	118868011	1.18550550601805e-08	118880819	118911135
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	118899159	134450318	5846	5687	-0.0137	1.18550550601805e-08	118880819	118911135	NA	NA	NA
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	11395862	4406	4300	0.0086	NA	NA	NA	1.55192330496266e-12	11393473	11429642
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11435643	6	5	-0.9215	1.55192330496266e-12	11393473	11429642	9.6318509132692e-13	11430887	11440927
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	34141562	7740	7546	0.0033	9.6318509132692e-13	11430887	11440927	8.30388449051698e-21	34141562	34141562
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	34148629	34155431	3	3	-1.5077	8.30388449051698e-21	34141562	34141562	1.04839963772879e-20	34155431	34155431
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	34185272	132289090	33006	32121	0.006	1.04839963772879e-20	34155431	34155431	NA	NA	NA
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	56657371	14026	13682	-0.0031	NA	NA	NA	5.12216101639123e-37	56650373	56657371
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56658479	56685341	14	14	0.9304	5.12216101639123e-37	56650373	56657371	3.51960033157705e-38	56685341	56686863
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	63118944	1460	1425	-0.01	3.51960033157705e-38	56685341	56686863	1.52435891920590e-08	63113626	63118944
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	63123793	63140078	3	3	-0.9866	1.5243589192059e-08	63113626	63118944	2.02173484725978e-08	63140078	63146866
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	63146866	113788788	15989	15567	-0.0018	2.02173484725978e-08	63140078	63146866	8.98640383094853e-08	113787620	113788788
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113791151	113794669	3	3	0.948	8.98640383094853e-08	113787620	113788788	2.99579242044913e-08	113794669	113797828
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113797828	114123340	149	145	-0.0018	2.99579242044913e-08	113794669	113797828	NA	NA	NA
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18544772	6	5	-0.1202	NA	NA	NA	0.000112512754544694	18544772	19287128
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	19494416	54	53	-0.6998	0.000112512754544694	18544772	19287128	1.39765688720734e-88	19490630	19497023
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	22163851	1312	1276	0.0422	1.39765688720734e-88	19490630	19497023	7.14341624851271e-09	22161950	22163851
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22164967	22166283	2	2	-1.1688	7.14341624851271e-09	22161950	22163851	3.04753239508151e-08	22166283	22168823
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22168823	40680589	6275	6115	0.0081	3.04753239508151e-08	22166283	22168823	5.59030829371778e-11	40676611	40680589
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40687108	40722360	6	6	-0.7692	5.59030829371778e-11	40676611	40680589	7.86379077048666e-11	40722360	40726930
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40726930	69086125	9973	9683	0.0034	7.86379077048666e-11	40722360	40726930	5.30084496099024e-08	69083716	69086125
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69093444	4	4	0.8258	5.30084496099024e-08	69083716	69086125	2.09835838603986e-08	69093444	69095909
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69095909	73071404	1788	1727	-0.0084	2.09835838603986e-08	69093444	69095909	4.38708703452622e-16	73061942	73071404
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73072457	1	0	NA	4.38708703452622e-16	73061942	73071404	NA	NA	NA
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73075500	73092112	6	6	0.9229	NA	NA	NA	3.53335035113977e-15	73092112	73101327
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	105607572	12218	11863	-0.008	3.53335035113977e-15	73092112	73101327	1.18647092420321e-08	105597555	105607572
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105609466	105632168	9	9	0.5762	1.18647092420321e-08	105597555	105607572	1.71392089195750e-11	105632168	105681007
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105856972	50	49	-0.0813	1.7139208919575e-11	105632168	105681007	7.21374619804549e-08	105856591	105856972
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105872360	105875924	3	3	-1.0223	7.21374619804549e-08	105856591	105856972	1.46254241183441e-10	105875924	105881677
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881677	106179949	108	104	-0.0162	1.46254241183441e-10	105875924	105881677	0.000319476500908622	106141604	106212061
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106183280	106253648	34	34	-0.247	0.000319476500908622	106141604	106212061	0.000145722567269375	106234009	106285879
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106255190	106358491	36	35	0.0888	0.000145722567269375	106234009	106285879	NA	NA	NA
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.1304	NA	NA	NA	4.19310941049988e-05	18427151	18749895
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	19537035	94	93	-0.4725	4.19310941049988e-05	18427151	18749895	9.40830665016898e-62	19427350	19805960
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	98232932	30309	29477	-0.0051	9.40830665016898e-62	19427350	19805960	1.06283153436411e-13	98232932	98232932
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98239454	3	3	1.2519	1.06283153436411e-13	98232932	98232932	9.35193823142583e-16	98239454	98239454
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	99632987	637	620	-0.0518	9.35193823142583e-16	98239454	98239454	3.40239998481191e-17	99632987	99632987
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.616	3.40239998481191e-17	99632987	99632987	1.02738251073162e-14	99635701	99635701
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	265	0.0056	1.02738251073162e-14	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	75093957	20523	20017	0.004	NA	NA	NA	8.09111233899641e-38	75093957	75093957
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-2.0482	8.09111233899641e-38	75093957	75093957	1.11702649624268e-37	75100865	75100865
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76923844	609	593	-0.0316	1.11702649624268e-37	75100865	75100865	2.96534569741243e-107	76923844	76923844
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76925748	76925748	1	0	NA	2.96534569741243e-107	76923844	76923844	NA	NA	NA
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	2.0679	NA	NA	NA	6.62332156796765e-99	76940218	76940218
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4396	-0.0195	6.62332156796765e-99	76940218	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	78653545	29634	28865	0.0128	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22361	-0.0074	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	790526	219	211	0.0205	NA	NA	NA	4.27817652341262e-11	790526	790526
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	794973	794978	2	2	1.3416	4.27817652341262e-11	790526	790526	5.27802106003341e-09	794978	798817
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	798817	1398325	271	263	0.0294	5.27802106003341e-09	794978	798817	2.79643643787979e-24	1398325	1398325
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	2.1655	2.79643643787979e-24	1398325	1398325	7.64600200355655e-24	1400840	1400840
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	11448975	4678	4522	0.0286	7.64600200355655e-24	1400840	1400840	4.5612136000555e-09	11448975	11448975
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.3722	4.5612136000555e-09	11448975	11448975	7.21459327281796e-10	11452390	11452390
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	17302993	2655	2584	0.0256	7.21459327281796e-10	11452390	11452390	1.36372396234859e-06	17301566	17302993
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	17304245	17308363	3	3	0.9344	1.36372396234859e-06	17301566	17302993	9.46379206134906e-07	17308363	17311470
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	17311470	63788698	15227	14785	0.0176	9.46379206134906e-07	17308363	17311470	NA	NA	NA
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	570	-0.0149	NA	NA	NA	1.89012884516818e-06	1499421	1511632
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1516966	3	3	-0.8642	1.89012884516818e-06	1499421	1511632	0.00250134547375921	1516966	1516966
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1518825	1525300	4	4	-2.124	0.00250134547375921	1516966	1516966	1.65153150076818e-56	1525300	1525300
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1528899	52080395	17248	16812	-0.0039	1.65153150076818e-56	1525300	1525300	3.43601317201131e-09	52074911	52081719
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52081719	52092989	6	6	-0.728	3.43601317201131e-09	52074911	52081719	6.68610510802319e-08	52090393	52095933
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52094361	62419534	3732	3629	-0.0269	6.68610510802319e-08	52090393	52095933	NA	NA	NA
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	10136303	16	15	-0.2271	NA	NA	NA	5.34417173725224e-07	10115958	10136303
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	10144881	10152384	3	3	-0.9773	5.34417173725224e-07	10115958	10136303	3.09600004005845e-08	10152384	10154777
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	10154777	46922972	13422	13068	-0.0083	3.09600004005845e-08	10152384	10154777	NA	NA	NA
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	22667608	2982	2909	0.0063	NA	NA	NA	1.94984106476717e-314	22667608	22679305
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	21	-2.3723	1.94984106476717e-314	22667608	22679305	0	22720195	22725305
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	35472378	6547	6363	-8e-04	0	22720195	22725305	1.34892210465548e-14	35472378	35472378
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-1.5657	1.34892210465548e-14	35472378	35472378	2.88058184420555e-13	35476942	35476942
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6792	0.0026	2.88058184420555e-13	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	797536	534	523	0.0137	NA	NA	NA	3.09067593511773e-55	786791	806941
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	800669	1182356	156	153	0.443	3.09067593511773e-55	786791	806941	1.9283574246008e-68	1176608	1297192
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1274736	2372138	786	756	0.0191	1.9283574246008e-68	1176608	1297192	3.27874897206831e-12	2357267	2378667
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2373235	2418980	55	53	-0.2697	3.27874897206831e-12	2357267	2378667	3.40876424054643e-07	2409743	2435595
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2419541	2708291	262	251	-0.0341	3.40876424054643e-07	2409743	2435595	0	2708113	2711273
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	8452395	1791	1743	0.9605	0	2708113	2711273	1.35938615279877e-10	8446489	8456422
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8456422	8473482	8	8	0.3153	1.35938615279877e-10	8446489	8456422	1.41811219145529e-08	8466917	8481280
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8475091	37699655	11264	10949	0.9842	1.41811219145529e-08	8466917	8481280	4.33562555418216e-08	37698330	37699655
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	37700374	37706063	2	2	-0.3182	4.33562555418216e-08	37698330	37699655	7.28077644686131e-15	37706063	37718969
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	37718969	154038318	31936	31074	0.9722	7.28077644686131e-15	37706063	37718969	1.31077790589778e-17	154037006	154038318
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154078819	11	10	1.846	1.31077790589778e-17	154037006	154038318	2.63589375006090e-17	154078819	154079002
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154442377	90	86	0.9925	2.6358937500609e-17	154078819	154079002	2.28513718567872e-70	154442377	154442377
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	4	-1.7037	2.28513718567872e-70	154442377	154442377	1.08832560462808e-69	154450309	154450309
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	27	0.9696	1.08832560462808e-69	154450309	154450309	1.63941596124475e-62	154578922	154586690
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	193	-0.0202	1.63941596124475e-62	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	118	-3.2275	NA	NA	NA	1.40715117571302e-18	3034907	3773948
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3733715	1	0	NA	1.40715117571302e-18	3034907	3773948	NA	NA	NA
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	15	-0.7823	NA	NA	NA	1.25195511955317e-08	5422507	6692482
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7259689	229	222	-2.8082	1.25195511955317e-08	5422507	6692482	5.10705366005469e-09	7229089	7286087
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7261174	7495687	74	73	-1.7551	5.10705366005469e-09	7229089	7286087	1.16066347593775e-10	7446842	7598374
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7723783	75	74	-3.1021	1.16066347593775e-10	7446842	7598374	0.00022711422625106	7703962	7733351
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7782532	18	17	-1.7835	0.00022711422625106	7703962	7733351	0.00567934491024934	7755522	7833760
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7936024	46	45	-2.792	0.00567934491024934	7755522	7833760	0.00887714316717001	7860364	7942730
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7938700	7997485	13	12	-1.7121	0.00887714316717001	7860364	7942730	5.09752776943285e-15	7996758	8005148
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7999759	8174858	37	36	-3.457	5.09752776943285e-15	7996758	8005148	1.05796930777436e-05	8158234	8174858
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8176058	8185182	5	5	-1.9521	1.05796930777436e-05	8158234	8174858	2.06078961659674e-07	8185182	8193270
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8186463	8280065	23	22	-3.2686	2.06078961659674e-07	8185182	8193270	1.27297215926058e-12	8277707	8292347
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8289709	8327502	16	16	-1.9506	1.27297215926058e-12	8277707	8292347	0.000129072465918037	8324328	8378918
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8333193	10515697	290	283	-3.1319	0.000129072465918037	8324328	8378918	8.6746682068887e-23	10512616	10537808
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	11698871	18	17	-0.6144	8.6746682068887e-23	10512616	10537808	9.66060571573754e-30	11673476	11698871
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12541506	12	12	-3.6739	9.66060571573754e-30	11673476	11698871	2.42075917726022e-06	12541506	12556034
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	53	-1.7618	2.42075917726022e-06	12541506	12556034	4.86848148229946e-08	12646477	12687167
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	21	-3.4554	4.86848148229946e-08	12646477	12687167	8.23786275199033e-05	12809152	12872417
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	12997864	58	58	-2.1762	8.23786275199033e-05	12809152	12872417	0.000243291909576015	12958620	13004854
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12999095	13050965	23	23	-1.0315	0.000243291909576015	12958620	13004854	2.79991789179549e-11	13048283	13052633
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13052633	13066849	9	8	-2.9107	2.79991789179549e-11	13048283	13052633	0.00133697322950984	13061201	13086552
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13076862	13128515	22	22	-1.4565	0.00133697322950984	13061201	13086552	0.000111626211953101	13109337	13149825
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13254711	42	42	-2.6378	0.000111626211953101	13109337	13149825	0.00343845549157967	13153117	13329968
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13256555	13594931	160	158	-3.1844	0.00343845549157967	13153117	13329968	3.68464806906407e-10	13573345	13603478
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13596448	13716000	18	18	-1.8895	3.68464806906407e-10	13573345	13603478	2.0565180900968e-09	13701755	13718946
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716331	13823928	27	25	-3.4702	2.0565180900968e-09	13701755	13718946	7.53226442032196e-05	13782396	13853174
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13828384	13870622	13	13	-2.2402	7.53226442032196e-05	13782396	13853174	0.000127541133622805	13863657	13892432
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13872200	14352278	152	145	-3.3204	0.000127541133622805	13863657	13892432	1.25884142099930e-06	14321882	14404284
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14353244	14508021	93	92	-2.6377	1.2588414209993e-06	14321882	14404284	1.14344531671148e-08	14496442	14530134
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	1.14344531671148e-08	14496442	14530134	NA	NA	NA
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	25	-1.1534	NA	NA	NA	5.5199241943424e-16	14566592	14596156
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	21036503	1250	1221	-2.9997	5.5199241943424e-16	14566592	14596156	3.88079254475193e-06	21028489	21036503
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054519	6	6	-0.6322	3.88079254475193e-06	21028489	21036503	1.34897532244286e-09	21054519	21057446
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	21443476	130	128	-3.1834	1.34897532244286e-09	21054519	21057446	5.66156476287513e-05	21430496	21473338
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21444509	21559551	14	14	-1.9199	5.66156476287513e-05	21430496	21473338	8.70873651521013e-05	21497583	21616877
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21569358	21569358	1	0	NA	8.70873651521013e-05	21497583	21616877	NA	NA	NA
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21574425	21691199	20	20	-3.3942	NA	NA	NA	3.55933576277463e-05	21680697	21692175
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21692175	21761022	11	11	-1.9527	3.55933576277463e-05	21680697	21692175	3.39884164023397e-05	21752451	21787852
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21763911	22139807	85	82	-3.2529	3.39884164023397e-05	21752451	21787852	1.91766875379008e-07	22049641	22139807
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.5704	1.91766875379008e-07	22049641	22139807	8.81259200037148e-07	22177335	22178964
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22192409	5	5	-3.1898	8.81259200037148e-07	22177335	22178964	0.0123625024008958	22179794	22208351
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22200078	22371003	27	27	-4.0409	0.0123625024008958	22179794	22208351	0.000214397521442855	22268552	22782417
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22373608	25737663	63	58	-3.212	0.000214397521442855	22268552	22782417	3.3965028737784e-39	22930737	26870361
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26952278	33	33	-0.8818	3.3965028737784e-39	22930737	26870361	1.42095243315380e-15	26950080	26952278
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26957814	26980386	3	3	-3.8678	1.4209524331538e-15	26950080	26952278	4.90325056003816e-05	26980386	26990807
MSK_252152916688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26984336	57440809	48	47	-1.1739	4.90325056003816e-05	26980386	26990807	NA	NA	NA
