Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	54860193	21023	19690	0.0032	NA	NA	NA	4.2429405718371e-10	54857788	54860193
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	54862228	54866506	3	3	-0.7882	4.2429405718371e-10	54857788	54860193	3.77593939100036e-11	54866506	54876067
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	54876067	72525842	6862	6431	-0.0046	3.77593939100036e-11	54866506	54876067	3.29178554365228e-12	72524413	72533804
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72528790	72537426	6	6	-0.5837	3.29178554365228e-12	72524413	72533804	4.56808055556573e-60	72537426	72537426
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	10	2.0678	4.56808055556573e-60	72537426	72537426	2.16247937059679e-214	72579311	72579311
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	73319763	104	92	-0.0136	2.16247937059679e-214	72579311	72579311	7.44969846635332e-12	73319763	73319763
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	73325618	73332687	2	2	-1.0077	7.44969846635332e-12	73319763	73319763	8.27028770616059e-13	73332687	73332687
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	73336034	79364942	2171	2035	-6e-04	8.27028770616059e-13	73332687	73332687	1.06219050631452e-09	79364942	79364942
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	79369664	79373212	2	2	-0.8812	1.06219050631452e-09	79364942	79364942	6.1611744892556e-10	79373212	79380417
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	79380417	86159135	1940	1825	0.0032	6.1611744892556e-10	79373212	79380417	4.35906055219776e-13	86156802	86159135
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	86171390	86175273	3	3	-0.8237	4.35906055219776e-13	86156802	86159135	2.90496524645358e-12	86175273	86175273
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	86179068	150823073	13335	12540	-4e-04	2.90496524645358e-12	86175273	86175273	6.44435855330952e-152	150823073	150836481
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150851439	10	7	-1.8506	6.44435855330952e-152	150823073	150836481	2.0322241225188e-145	150848509	150851439
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	167479184	6869	6433	-0.0043	2.0322241225188e-145	150848509	150851439	7.40554401223342e-10	167473499	167495719
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167481271	167523140	12	12	-0.3806	7.40554401223342e-10	167473499	167495719	1.86780394010437e-10	167506259	167534190
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167525669	200602881	11347	10626	-0.0032	1.86780394010437e-10	167506259	167534190	1.16514366713064e-16	200596027	200618814
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200609726	200667381	22	21	-0.3592	1.16514366713064e-16	200596027	200618814	8.3913172346787e-16	200649025	200673525
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200668993	247186514	17423	16322	-0.0036	8.3913172346787e-16	200649025	200673525	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	24452394	7082	6637	-0.009	NA	NA	NA	2.60131782989935e-15	24452394	24452394
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	24455322	24462631	4	3	-0.9177	2.60131782989935e-15	24452394	24452394	2.27100193403637e-14	24462631	24462631
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	24467164	37810001	5823	5439	-0.0069	2.27100193403637e-14	24462631	24462631	1.46352792720173e-10	37787637	37815049
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37812045	37855837	22	21	0.2907	1.46352792720173e-10	37787637	37815049	4.22589785381681e-11	37848754	37872988
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	54862058	6569	6144	-9e-04	4.22589785381681e-11	37848754	37872988	3.41358174207389e-133	54862058	54869538
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	54863774	54867828	2	0	NA	3.41358174207389e-133	54862058	54869538	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	54869538	54913661	25	24	-0.9231	NA	NA	NA	1.90482333498192e-130	54912354	54913661
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	54914902	66357387	3767	3512	0.0041	1.90482333498192e-130	54912354	54913661	4.58982343598133e-22	66357387	66357387
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	1.3329	4.58982343598133e-22	66357387	66357387	2.84342679346836e-22	66360747	66360747
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	89093646	6993	6537	-0.0015	2.84342679346836e-22	66360747	66360747	1.69145494533022e-39	89054185	89222214
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89208480	89730278	47	41	-0.3929	1.69145494533022e-39	89054185	89222214	1.6977801790516e-14	89727788	89744398
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89742890	89902365	20	19	-0.8988	1.6977801790516e-14	89727788	89744398	5.28685254700666e-97	89890854	89902365
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	91057122	198301821	31351	29330	-0.0014	5.28685254700666e-97	89890854	89902365	1.57708761175574e-19	198301821	198301821
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	198307946	198313546	4	4	-0.8953	1.57708761175574e-19	198301821	198301821	1.91643655148491e-19	198313546	198313546
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	198316089	242689978	16116	15052	-0.0023	1.91643655148491e-19	198313546	198313546	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10101	-0.0071	NA	NA	NA	2.95762354495074e-232	32074432	32074432
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	-4.25	2.95762354495074e-232	32074432	32074432	4.81656683161322e-222	32080848	32080848
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	47460892	5420	5075	-6e-04	4.81656683161322e-222	32080848	32080848	0	47460892	47460892
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	-5.3422	0	47460892	47460892	0	47466921	47466921
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	75479859	10656	9927	-0.0066	0	47466921	47466921	1.00855366663319e-09	75445864	75784655
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75783255	76000715	19	17	-0.3162	1.00855366663319e-09	75445864	75784655	1.3359677041761e-10	75874255	76034950
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76006248	99891210	5288	4962	0.0023	1.3359677041761e-10	75874255	76034950	0	99891210	99891210
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-5.0072	0	99891210	99891210	1.8231022331542e-321	99897201	99897201
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	133189686	11524	10833	-0.006	1.8231022331542e-321	99897201	99897201	5.75513564607921e-12	133189686	133189686
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	0.9882	5.75513564607921e-12	133189686	133189686	4.95260759303069e-12	133194685	133194685
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	150443815	5401	5051	-0.0019	4.95260759303069e-12	133194685	133194685	3.50280353641687e-12	150443815	150443815
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	150446135	150448380	2	2	-0.9979	3.50280353641687e-12	150443815	150443815	1.20097761076076e-12	150448380	150448380
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	150453399	164005577	4377	4080	0.0019	1.20097761076076e-12	150448380	150448380	4.54098517913811e-87	164005577	164012645
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164009321	1	0	NA	4.54098517913811e-87	164005577	164012645	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164012645	164027724	4	3	-2.1257	NA	NA	NA	2.02408536494165e-85	164019640	164027724
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	190844369	8933	8370	0.0036	2.02408536494165e-85	164019640	164027724	5.68292323576762e-20	190844369	190844369
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	190847899	190850562	3	3	-1.0333	5.68292323576762e-20	190844369	190844369	2.40865330433375e-19	190850562	190850562
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	190854164	192546280	632	587	0.005	2.40865330433375e-19	190850562	190850562	3.79332478420904e-15	192544305	192546280
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192548135	192552734	4	4	-0.7936	3.79332478420904e-15	192544305	192546280	3.17544653022407e-15	192552734	192554451
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192554451	194354505	578	542	-0.0068	3.17544653022407e-15	192552734	192554451	0	194354505	194354505
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-3.7006	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	194570564	83	74	-0.04	0	194366950	194366950	4.76810516263823e-17	194564913	194571351
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194571351	194586598	10	10	0.465	4.76810516263823e-17	194564913	194571351	4.20771514965171e-14	194585098	194590859
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194588632	196822133	903	841	-0.015	4.20771514965171e-14	194585098	194590859	1.08927803638152e-122	196822133	196822133
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196929826	21	20	-1.0218	1.08927803638152e-122	196822133	196822133	1.30573030279436e-07	196928503	196942158
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196940125	196961238	10	10	-0.4304	1.30573030279436e-07	196928503	196942158	2.01811906816527e-10	196957322	196966631
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196964180	199329592	953	893	0.013	2.01811906816527e-10	196957322	196966631	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	5560951	1865	1750	-0.0016	NA	NA	NA	8.2252423981132e-18	5560951	5560951
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	5561147	5566928	2	2	-1.2532	8.2252423981132e-18	5560951	5560951	5.38505896135188e-18	5566928	5566928
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	5567010	9815760	1526	1425	-0.0019	5.38505896135188e-18	5566928	5566928	1.68233612100043e-10	9800777	9815760
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	0.6802	1.68233612100043e-10	9800777	9815760	4.31610050716955e-12	9842644	9853710
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	25161316	4337	4038	-0.0089	4.31610050716955e-12	9842644	9853710	5.30201566177473e-21	25155479	25161316
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	25165832	25189046	6	6	0.7257	5.30201566177473e-21	25155479	25161316	4.63271092785898e-20	25189046	25192333
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	25192333	87193253	16627	15546	-0.0048	4.63271092785898e-20	25189046	25192333	4.73994245424245e-08	87189062	87193253
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	87196350	87198840	2	2	-0.8298	4.73994245424245e-08	87189062	87193253	3.53591539951637e-14	87198840	87198840
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	87201443	87460591	116	105	0.0119	3.53591539951637e-14	87198840	87198840	8.07638117140633e-09	87458815	87464223
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	87462649	87462649	1	0	NA	8.07638117140633e-09	87458815	87464223	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	87464223	87472196	4	4	0.4933	NA	NA	NA	4.32832323283733e-06	87470409	87475172
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	87473426	88884770	593	554	-6e-04	4.32832323283733e-06	87470409	87475172	1.84515838927645e-11	88884770	88884770
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88889260	88891810	2	2	-0.945	1.84515838927645e-11	88884770	88884770	2.57587592435414e-11	88891810	88891810
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88896895	94073863	1810	1701	1e-04	2.57587592435414e-11	88891810	88891810	7.0528905565287e-11	94070673	94073863
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94076749	94084961	3	3	-0.7578	7.0528905565287e-11	94070673	94073863	1.8793918243825e-10	94084961	94086315
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94086315	107274138	4253	3981	-0.0023	1.8793918243825e-10	94084961	94086315	5.24994012903338e-11	107271000	107274138
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107275274	107275274	1	0	NA	5.24994012903338e-11	107271000	107274138	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107276428	107283257	5	5	-0.6021	NA	NA	NA	1.08656042329431e-10	107283257	107284892
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107284892	191153613	24004	22477	-0.0033	1.08656042329431e-10	107283257	107284892	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	8750027	2603	2452	-0.0014	NA	NA	NA	8.69252253545678e-32	8750027	8750027
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	8758735	8800001	6	6	-0.9333	8.69252253545678e-32	8750027	8750027	1.80013574529452e-33	8800001	8800001
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	8809384	97060205	24862	23287	-0.003	1.80013574529452e-33	8800001	8800001	1.18008458330991e-41	97060205	97060205
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	97074064	97119376	7	7	-0.9613	1.18008458330991e-41	97060205	97060205	1.57543396226479e-41	97119376	97119376
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	97126918	137831933	11610	10865	-0.003	1.57543396226479e-41	97119376	97119376	2.2007085712042e-16	137830334	137831933
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	137833920	137842107	4	4	-0.8101	2.2007085712042e-16	137830334	137831933	8.27216224290274e-15	137842107	137844931
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	137843309	137843309	1	0	NA	8.27216224290274e-15	137842107	137844931	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	137844931	140201609	986	927	0.0025	NA	NA	NA	4.98984734067186e-11	140198797	140201609
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140203440	140216524	8	8	0.5003	4.98984734067186e-11	140198797	140201609	2.11642943257287e-12	140216524	140221835
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	140219465	1	0	NA	2.11642943257287e-12	140216524	140221835	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140221835	150181399	3766	3504	-0.0016	NA	NA	NA	2.46744892879172e-38	150181399	150181399
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150185190	150202601	7	7	-0.93	2.46744892879172e-38	150181399	150181399	5.75209035869596e-38	150202601	150202601
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	180342860	9785	9154	-0.0024	5.75209035869596e-38	150202601	150202601	2.70329092949087e-25	180194323	180342860
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	7	-0.7635	2.70329092949087e-25	180194323	180342860	3.61066958318741e-21	180358977	180364670
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180362342	1	0	NA	3.61066958318741e-21	180358977	180364670	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180364670	180644810	111	102	0.0095	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	191387	38	31	0.0036	NA	NA	NA	4.8247859152465e-11	183349	198124
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	198124	234115	15	13	0.5376	4.8247859152465e-11	183349	198124	1.47214375506183e-06	224667	241674
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	236535	326323	48	45	0.223	1.47214375506183e-06	224667	241674	1.88193591270043e-14	309211	340696
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	29950805	10486	9807	-0.0022	1.88193591270043e-14	309211	340696	1.68662565937756e-15	29941766	29962849
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	29986370	8	7	0.5871	1.68662565937756e-15	29941766	29962849	6.67310066949836e-12	29981912	29992946
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29992946	31304224	559	523	0.0131	6.67310066949836e-12	29981912	29992946	1.54962898967894e-05	31290478	31304224
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31307314	31344056	8	7	-0.3817	1.54962898967894e-05	31290478	31304224	0.00162875718506920	31344056	31367935
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31344382	31385778	20	20	-0.0126	0.0016287571850692	31344056	31367935	8.14587360746658e-09	31385778	31387708
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31418006	6	6	-0.7168	8.14587360746658e-09	31385778	31387708	2.90459014483228e-17	31418006	31425113
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	32564884	491	456	-0.0102	2.90459014483228e-17	31418006	31425113	2.75006417420436e-150	32564884	32588005
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32567462	32600962	7	7	-2.3284	2.75006417420436e-150	32564884	32588005	0.00265623554245633	32595402	32609525
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	32633691	8	8	-0.5243	0.00265623554245633	32595402	32609525	0.399572122141431	32609525	32634977
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32659328	6	6	0.0918	0.399572122141431	32609525	32634977	2.91867973529778e-05	32657601	32663181
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32663181	32680035	7	7	-0.6356	2.91867973529778e-05	32657601	32663181	4.10201867552801e-15	32677939	32682366
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32682366	35862502	1369	1292	-0.0068	4.10201867552801e-15	32677939	32682366	5.02046628037533e-12	35862270	35864636
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35864636	35873335	6	5	-0.6714	5.02046628037533e-12	35862270	35864636	1.10198431872586e-13	35872078	35878656
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35875112	35875112	1	0	NA	1.10198431872586e-13	35872078	35878656	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35878656	79018959	13341	12468	0.0024	NA	NA	NA	9.31139292790906e-62	79018959	79018959
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	12	-0.902	9.31139292790906e-62	79018959	79018959	4.10688935177254e-65	79091850	79091850
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	103841482	6762	6347	0.0016	4.10688935177254e-65	79091850	79091850	0	103841482	103841482
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-4.9841	0	103841482	103841482	0	103868154	103868154
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	165643653	21106	19749	-0.0044	0	103868154	103868154	3.05933421264275e-24	165643653	165643653
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	0.9806	3.05933421264275e-24	165643653	165643653	2.33975628685565e-22	165650610	165650610
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1693	-0.0047	2.33975628685565e-22	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	109966116	35266	33003	-0.0018	NA	NA	NA	3.97809146291435e-14	109966116	109966116
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109967918	109974402	3	3	-0.8928	3.97809146291435e-14	109966116	109966116	2.14834504066652e-14	109974402	109974402
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109976628	125827896	7167	6695	-0.0057	2.14834504066652e-14	109974402	109974402	2.59480554702712e-12	125827896	125827896
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125829681	125831554	2	0	NA	2.59480554702712e-12	125827896	125827896	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	0.8174	NA	NA	NA	1.03401095939692e-12	125837524	125837524
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133432281	3653	3393	-0.0038	1.03401095939692e-12	125837524	125837524	9.34981534533571e-23	133426996	133432281
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133433384	133433384	1	0	NA	9.34981534533571e-23	133426996	133432281	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.6628	NA	NA	NA	2.59876074116808e-21	133448277	133453811
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141406414	3697	3478	-7e-04	2.59876074116808e-21	133448277	133453811	1.39874988685789e-26	141405145	141409512
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141408013	141431668	12	12	-0.6059	1.39874988685789e-26	141405145	141409512	4.74936755939154e-24	141426846	141432778
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141432778	141690753	121	114	-0.0093	4.74936755939154e-24	141426846	141432778	1.3103134966223e-70	141690753	141698634
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	1.0769	1.3103134966223e-70	141690753	141698634	1.06011277361400e-61	141712786	141714168
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	141720303	1	0	NA	1.060112773614e-61	141712786	141714168	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720324	142152205	166	154	-6e-04	NA	NA	NA	6.26302528843495e-16	142152205	142152205
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142156165	142166710	4	4	-0.8663	6.26302528843495e-16	142152205	142152205	5.01839221171703e-34	142166710	142166710
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142167901	142167908	2	2	-4.6242	5.01839221171703e-34	142166710	142166710	1.92680225416801e-303	142167908	142167908
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142176074	142176074	1	0	NA	1.92680225416801e-303	142167908	142167908	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142187073	142927390	336	317	-0.0104	NA	NA	NA	3.35867174755947e-55	142927390	142927390
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142967639	143097006	9	9	-0.9573	3.35867174755947e-55	142927390	142927390	8.95564308259936e-46	143097006	143097006
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143150737	143500499	139	130	-0.0023	8.95564308259936e-46	143097006	143097006	7.46957394209574e-08	143495552	143582864
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143503317	143706194	6	6	-0.4843	7.46957394209574e-08	143495552	143582864	4.29192305726346e-08	143584350	143712446
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143709272	145375972	702	656	-0.0041	4.29192305726346e-08	143584350	143712446	1.49699785016515e-06	145371915	145375972
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	145377212	145378873	2	2	0.7415	1.49699785016515e-06	145371915	145375972	1.33306059243749e-06	145378873	145387010
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	145387010	147702365	1144	1073	-0.0063	1.33306059243749e-06	145378873	145387010	2.04226258059718e-20	147702365	147707161
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147710037	4	4	-0.9366	2.04226258059718e-20	147702365	147707161	8.23028996315298e-19	147707161	147710037
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147711471	158821263	4236	3953	-0.0076	8.23028996315298e-19	147707161	147710037	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	2234351	737	684	-0.0113	NA	NA	NA	7.75843475919875e-14	2231804	2234351
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2242849	2251011	4	4	-0.8477	7.75843475919875e-14	2231804	2234351	7.88437666686594e-17	2251011	2251011
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2257255	7260442	1653	1557	-0.0211	7.88437666686594e-17	2251011	2251011	7.28043256689726e-09	6926661	7260442
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7322035	7824059	7	6	-0.5175	7.28043256689726e-09	6926661	7260442	7.09151535168007e-09	7824059	8139999
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	25119007	5757	5380	-0.0024	7.09151535168007e-09	7824059	8139999	1.73559826893120e-55	25119007	25119007
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25120552	25120552	1	0	NA	1.7355982689312e-55	25119007	25119007	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25125700	3	3	1.7694	NA	NA	NA	1.10854938241147e-58	25125700	25125700
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	39350798	4912	4572	-0.0028	1.10854938241147e-58	25125700	25125700	9.5608980775181e-295	39350798	39350798
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	54	0.9328	9.5608980775181e-295	39350798	39350798	4.54445913738369e-268	39505256	39505256
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40892587	441	413	-0.0078	4.54445913738369e-268	39505256	39505256	1.92450723192036e-54	40892587	40892587
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-2.6039	1.92450723192036e-54	40892587	40892587	3.48497248420446e-87	40897469	40897469
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	85687135	11781	11010	-0.0053	3.48497248420446e-87	40897469	40897469	5.53170172222865e-09	85687135	85687135
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	85690246	85696461	2	2	-0.8607	5.53170172222865e-09	85687135	85687135	3.90703580882296e-09	85696461	85696461
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	85698213	115701209	9512	8908	-0.0036	3.90703580882296e-09	85696461	85696461	1.82802789396337e-09	115701209	115701209
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115705898	115711730	2	2	-0.8748	1.82802789396337e-09	115701209	115701209	1.68985977974401e-08	115711730	115718942
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115718942	146264846	9693	9069	-0.0065	1.68985977974401e-08	115711730	115718942	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	70926188	13072	12209	-0.0063	NA	NA	NA	4.31746073014138e-40	70926188	70926188
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.8086	4.31746073014138e-40	70926188	70926188	8.6648332340952e-42	70930528	70930528
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	100348045	9919	9246	-0.0034	8.6648332340952e-42	70930528	70930528	3.58291533068525e-74	100348045	100348045
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	-2.4338	3.58291533068525e-74	100348045	100348045	1.12533307770899e-71	100350814	100350814
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	100353031	1	0	NA	1.12533307770899e-71	100350814	100350814	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100354878	116124007	5546	5194	2e-04	NA	NA	NA	4.65383198252092e-12	116124007	116124007
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-1.0015	4.65383198252092e-12	116124007	116124007	1.29501587967659e-10	116130333	116130333
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	140145683	9400	8782	-0.004	1.29501587967659e-10	116130333	116130333	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	31284926	11292	10573	-0.003	NA	NA	NA	1.32334218849578e-08	31284756	31284926
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31287101	31291525	3	3	0.7082	1.32334218849578e-08	31284756	31284926	3.55576508367288e-09	31291525	31293140
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31293140	44912878	2962	2792	-0.0034	3.55576508367288e-09	31291525	31293140	2.74117240130947e-07	44911473	44912878
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	44916453	44923158	3	3	0.6352	2.74117240130947e-07	44911473	44912878	7.67714761050482e-08	44923158	44925797
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	44925797	45489823	197	184	-0.0029	7.67714761050482e-08	44923158	44925797	1.34981931257725e-222	45489823	45489823
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46384985	46568496	72	65	0.8429	1.34981931257725e-222	45489823	45489823	3.33280434613297e-18	46552024	47040444
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47017598	47172534	48	45	0.5081	3.33280434613297e-18	46552024	47040444	1.50630282440116e-73	47167144	47938346
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47938346	87835309	12865	12051	-0.0016	1.50630282440116e-73	47167144	47938346	2.16129829896580e-10	87835309	87835309
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	87836745	87838296	2	2	-0.9373	2.1612982989658e-10	87835309	87835309	2.8416444043664e-10	87838296	87847532
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	87847532	100676022	4913	4637	-4e-04	2.8416444043664e-10	87838296	87847532	1.18922359130951e-14	100672415	100676022
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100678817	100686787	4	4	-0.7849	1.18922359130951e-14	100672415	100676022	4.63833530927458e-14	100686787	100693036
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100693036	135281503	12445	11641	-0.0064	4.63833530927458e-14	100686787	100693036	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	135284109	135285645	2	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	18896166	7372	6901	-0.0029	NA	NA	NA	1.90960678049335e-10	18892456	18896166
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18906505	18917191	6	6	0.5668	1.90960678049335e-10	18892456	18896166	2.23943261884252e-11	18917191	18929375
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18929375	55118214	9527	8900	-0.0013	2.23943261884252e-11	18917191	18929375	1.15689593358711e-146	55118214	55124730
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55217189	40	37	-0.8032	1.15689593358711e-146	55118214	55124730	1.69633493574651e-144	55207305	55217189
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	134450318	28359	26594	-0.0031	1.69633493574651e-144	55207305	55217189	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	7884886	3246	3015	-0.005	NA	NA	NA	2.50399925531076e-11	7872503	7894681
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7890143	7944668	21	19	0.3175	2.50399925531076e-11	7872503	7894681	2.96917887486927e-12	7936700	7951531
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7946271	9523923	475	447	0.0033	2.96917887486927e-12	7936700	7951531	0	9523923	9523923
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9554149	5	5	-5.3626	0	9523923	9523923	0	9554149	9554149
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	9555181	1	0	NA	0	9554149	9554149	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9563866	11116883	581	543	-0.0225	NA	NA	NA	4.09885068304491e-237	11116883	11121204
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	7	-3.082	4.09885068304491e-237	11116883	11121204	9.23122517128472e-83	11130871	11140421
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	11395862	70	65	-0.0275	9.23122517128472e-83	11130871	11140421	2.33468930281555e-53	11395862	11395862
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11435643	6	6	1.2485	2.33468930281555e-53	11395862	11395862	2.38319242891810e-58	11435643	11435643
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	31196787	6751	6348	-0.0015	2.3831924289181e-58	11435643	11435643	2.85609145466486e-13	31188761	31200356
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31200356	31237505	9	9	0.423	2.85609145466486e-13	31188761	31200356	8.06513623234038e-07	31230579	31245432
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31242528	31298659	26	21	0.9002	8.06513623234038e-07	31230579	31245432	1.13431627517501e-110	31298659	31298659
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31299898	33178741	723	666	-0.0101	1.13431627517501e-110	31298659	31298659	1.01990595543649e-18	33178741	33178741
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33184017	33184017	1	0	NA	1.01990595543649e-18	33178741	33178741	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33193255	33198331	2	2	-1.2098	NA	NA	NA	9.71885858998096e-18	33198331	33198331
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33201796	41303729	1739	1627	7e-04	9.71885858998096e-18	33198331	33198331	3.75661895710526e-18	41303729	41303729
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	41307749	41312478	3	3	-0.9992	3.75661895710526e-18	41303729	41303729	1.77538733751586e-18	41312478	41312478
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	41315922	100127175	19571	18375	0	1.77538733751586e-18	41312478	41312478	1.93897441053173e-09	100127175	100127175
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	100128988	100135186	3	2	-0.8936	1.93897441053173e-09	100127175	100127175	4.24758928190055e-09	100135186	100135186
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	100137200	130690343	11274	10582	-0.0021	4.24758928190055e-09	100135186	100135186	7.21300391259954e-15	130690343	130690343
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130694393	130701040	3	3	0.9149	7.21300391259954e-15	130690343	130690343	5.79330511369107e-13	130701040	130701040
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	612	-7e-04	5.79330511369107e-13	130701040	130701040	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	114123340	31644	29609	-0.0032	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	54	-0.6928	NA	NA	NA	1.5300111491177e-169	19492531	19497023
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	40670538	7587	7102	0.0052	1.5300111491177e-169	19492531	19497023	1.66526335946270e-18	40663660	40670538
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40676611	40676611	1	0	NA	1.6652633594627e-18	40663660	40670538	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40722360	7	7	-0.6425	NA	NA	NA	3.34778492267674e-18	40722360	40726930
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40726930	73061942	11764	10951	4e-04	3.34778492267674e-18	40722360	40726930	8.82409447850139e-54	73061942	73061942
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73092112	8	6	-1.1778	8.82409447850139e-54	73061942	73061942	1.16695195710327e-49	73092112	73092112
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	105595302	12214	11451	-0.0029	1.16695195710327e-49	73092112	73092112	0	105595302	105602602
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105597555	105597555	1	0	NA	0	105595302	105602602	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	11	-3.5018	NA	NA	NA	2.77000076264018e-36	105630089	105632168
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105787390	21	21	0.0383	2.77000076264018e-36	105630089	105632168	1.37786571028105e-18	105787390	105787390
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105788623	105798116	6	6	-0.9193	1.37786571028105e-18	105787390	105787390	3.71981988891463e-12	105798116	105798116
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105799261	105839439	17	17	-0.092	3.71981988891463e-12	105798116	105798116	8.8980668235025e-07	105834932	105843086
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105843086	105881893	11	11	0.3384	8.8980668235025e-07	105834932	105843086	0.00151311441555128	105872360	105904455
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	105948347	17	17	-0.0103	0.00151311441555128	105872360	105904455	1.65476371215261e-14	105946993	105951399
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105951399	106002179	17	15	-0.7112	1.65476371215261e-14	105946993	105951399	8.06070951794526e-25	105998412	106013552
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106358491	142	133	-0.0093	8.06070951794526e-25	105998412	106013552	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	-0.0164	NA	NA	NA	3.67536904510658e-11	18452491	18452491
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	18837737	10	9	0.6178	3.67536904510658e-11	18452491	18452491	2.51403240510085e-09	18837737	18837737
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18842565	18848213	4	4	0.118	2.51403240510085e-09	18837737	18837737	1.51215855777729e-08	18848213	18854068
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18851513	20088256	137	129	0.7928	1.51215855777729e-08	18848213	18854068	0	20065525	20088256
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	29149365	2395	2230	-0.0149	0	20065525	20088256	2.91483564456348e-15	29148907	29149365
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	29149886	29150844	3	3	-0.9383	2.91483564456348e-15	29148907	29149365	3.7134203646887e-16	29150844	29150844
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	29155420	41638388	4956	4638	2e-04	3.7134203646887e-16	29150844	29150844	2.06708321453585e-18	41637456	41676221
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41676219	41723580	11	11	0.523	2.06708321453585e-18	41637456	41676221	3.28331025545664e-18	41717029	41776053
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41776053	52517110	4479	4163	0.0026	3.28331025545664e-18	41717029	41776053	3.39463759210333e-14	52517110	52517110
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	52519074	52533227	2	2	-1.0776	3.39463759210333e-14	52517110	52517110	4.12228335143152e-13	52533227	52533227
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	52540479	74669752	9709	9092	0.0018	4.12228335143152e-13	52533227	52533227	0	74669752	74669752
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-4.3485	0	74669752	74669752	0	74680439	74680439
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	98232932	8693	8133	-0.0042	0	74680439	74680439	4.01677014851670e-248	98232932	98232932
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98234519	1	0	NA	4.0167701485167e-248	98232932	98232932	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98237721	98239454	2	2	-4.4499	NA	NA	NA	1.67781176322991e-239	98239454	98239454
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	100298352	911	851	-0.0037	1.67781176322991e-239	98239454	98239454	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	32379126	10573	9896	0.0012	NA	NA	NA	1.01757408640620e-101	31862577	32513457
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33559207	45	41	0.6459	1.0175740864062e-101	31862577	32513457	1.03862397504835e-105	33536526	33647856
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33647856	74087338	9600	8914	0.0023	1.03862397504835e-105	33536526	33647856	7.36894599251845e-08	74071531	74099704
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	74088894	74137609	22	21	-0.2523	7.36894599251845e-08	74071531	74099704	2.69004623764825e-08	74119480	74156372
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	74139612	75093957	283	260	-0.0038	2.69004623764825e-08	74119480	74156372	1.39793153679452e-33	75093957	75093957
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	1.5232	1.39793153679452e-33	75093957	75093957	1.02914613581636e-29	75100865	75100865
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76923844	609	563	-0.0027	1.02914613581636e-29	75100865	75100865	8.9046770458583e-139	76923844	76923844
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76925748	76929598	2	0	NA	8.9046770458583e-139	76923844	76923844	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76931247	76940218	7	6	-1.9757	NA	NA	NA	7.60461765810241e-137	76940218	76940218
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4239	-0.0048	7.60461765810241e-137	76940218	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	392	0.0078	NA	NA	NA	2.61968675968253e-08	1028979	1028979
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	0.9499	2.61968675968253e-08	1028979	1028979	4.31281768401306e-10	1030766	1030766
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	24195451	8550	8018	0.007	4.31281768401306e-10	1030766	1030766	3.16964643994411e-24	24195451	24195451
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	24198397	24201924	5	4	-1.0066	3.16964643994411e-24	24195451	24195451	1.73521995334812e-23	24201924	24201924
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	24204545	32850723	3458	3228	-0.0028	1.73521995334812e-23	24201924	24201924	6.84738818324896e-11	32850723	32850723
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32853293	32854956	2	2	-0.9823	6.84738818324896e-11	32850723	32850723	3.63227535602454e-11	32854956	32854956
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32857473	36673853	1437	1344	0.0108	3.63227535602454e-11	32854956	32854956	3.5260552163112e-150	36673853	36673853
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	5	2.2985	3.5260552163112e-150	36673853	36673853	4.1345011635671e-138	36684619	36684619
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41519702	2011	1876	0.0147	4.1345011635671e-138	36684619	36684619	1.93034736458641e-13	41512318	41522429
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41566540	21	21	0.3669	1.93034736458641e-13	41512318	41522429	3.05398755128013e-18	41562786	41572001
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	78653545	13725	12879	0.0055	3.05398755128013e-18	41562786	41572001	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	36509250	10982	10274	-0.0024	NA	NA	NA	1.79333541768098e-92	36509250	36509250
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36514792	36519728	2	2	-2.7066	1.79333541768098e-92	36509250	36509250	2.22338566744043e-91	36519728	36519728
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36524577	76116026	11980	11243	-0.0043	2.22338566744043e-91	36519728	36519728	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	51313257	17300	16202	0.0024	NA	NA	NA	6.76888834425616e-14	51313257	51313257
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	51316654	51319006	3	3	-0.9232	6.76888834425616e-14	51313257	51313257	2.26305731465262e-14	51319006	51319006
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	51320617	51320617	1	0	NA	2.26305731465262e-14	51319006	51319006	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	51322506	56823430	2569	2403	0.0073	NA	NA	NA	4.6866795318582e-12	56819531	56825794
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	8	0.5313	4.6866795318582e-12	56819531	56825794	1.59342991471741e-13	56837593	56844304
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	58174756	570	532	-0.0135	1.59342991471741e-13	56837593	56844304	1.86710422768491e-06	58125598	58201323
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58176026	58252109	34	30	-0.2138	1.86710422768491e-06	58125598	58201323	1.26014436999006e-07	58223991	58277383
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58254174	63788698	2574	2407	-0.0014	1.26014436999006e-07	58223991	58277383	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	563	0.0014	NA	NA	NA	2.12722279447941e-197	1506379	1506379
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	9	-2.0253	2.12722279447941e-197	1506379	1506379	2.65454139114241e-229	1532433	1532433
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	47283115	15464	14509	-0.0069	2.65454139114241e-229	1532433	1532433	1.47525106057246e-77	47279301	47286263
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	47286263	47330180	33	32	0.6167	1.47525106057246e-77	47279301	47286263	7.38789426782787e-72	47329207	47330980
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	47330980	62419534	5486	5123	-0.0058	7.38789426782787e-72	47329207	47330980	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	18982113	1933	1813	0.0062	NA	NA	NA	1.27129456535370e-11	18982113	18982113
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	18985550	18993605	3	3	0.782	1.2712945653537e-11	18982113	18982113	5.20177552047762e-11	18993605	18996912
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	18996912	46922972	11505	10759	-0.0062	5.20177552047762e-11	18993605	18996912	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	22667608	2982	2814	-0.0022	NA	NA	NA	2.45230864805172e-74	22667608	22679305
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	22	0.7917	2.45230864805172e-74	22667608	22679305	9.62843674916802e-76	22720195	22735036
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	49571068	13552	12666	0.0053	9.62843674916802e-76	22720195	22735036	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	-0.0309	NA	NA	NA	5.46783231430681e-11	94062	94062
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	6	-1.7847	5.46783231430681e-11	94062	94062	4.01284355008987e-90	104732	104732
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	843648	553	520	0.0131	4.01284355008987e-90	104732	104732	6.46914271729334e-09	841738	849437
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	845758	845758	1	0	NA	6.46914271729334e-09	841738	849437	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	848806	856655	8	8	0.5038	NA	NA	NA	3.23185129160486e-11	853836	859493
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	859452	859452	1	0	NA	3.23185129160486e-11	853836	859493	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	859493	2672401	1190	1108	-0.0136	NA	NA	NA	2.48785126546902e-07	2666344	2695630
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672477	2708291	27	23	-0.2661	2.48785126546902e-07	2666344	2695630	4.79668068057524e-84	2708291	2711273
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	6455262	1199	1135	0.8396	4.79668068057524e-84	2708291	2711273	0	6451204	6465033
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	6459644	8091751	495	458	1.4715	0	6451204	6465033	1.02382453600015e-101	8085225	8093113
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8093113	8432497	87	83	0.8915	1.02382453600015e-101	8085225	8093113	4.81749496363954e-08	8417817	8447855
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8437023	8481280	21	20	0.5776	4.81749496363954e-08	8417817	8447855	2.34558746939742e-09	8461739	8488693
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8481816	47748627	14736	13732	0.9128	2.34558746939742e-09	8461739	8488693	1.85112222298604e-131	47747688	47765476
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	47756715	47756715	1	0	NA	1.85112222298604e-131	47747688	47765476	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	47765476	47845497	38	35	-0.0014	NA	NA	NA	2.62721304368844e-113	47843433	47898068
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	47898068	76998610	6362	5954	0.8965	2.62721304368844e-113	47843433	47898068	4.48433319349792e-87	76998610	76998610
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	-2.3918	4.48433319349792e-87	76998610	76998610	8.69898659798814e-97	77010018	77010018
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	152655026	21520	20191	0.9075	8.69898659798814e-97	77010018	77010018	2.58002616852699e-12	152655026	152655026
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152656332	152657445	2	2	-0.3054	2.58002616852699e-12	152655026	152655026	3.67063170764424e-06	152657445	152669192
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152669192	153062482	182	166	0.8521	3.67063170764424e-06	152657445	152669192	5.26821750486507e-05	153059368	153062482
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153067477	153158679	2	2	-0.1905	5.26821750486507e-05	153059368	153062482	2.88035082508784e-08	153158679	153176364
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153176364	153329988	71	68	0.8229	2.88035082508784e-08	153158679	153176364	0.000131310025638993	153320618	153335752
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153332114	153344718	7	7	0.3913	0.000131310025638993	153320618	153335752	3.78213454882343e-07	153340901	153352463
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153348763	154038318	276	262	0.897	3.78213454882343e-07	153340901	153352463	1.84816534528679e-37	154038318	154038318
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154078819	11	8	1.947	1.84816534528679e-37	154038318	154038318	5.51159885447416e-29	154078819	154078819
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154442377	90	86	0.9184	5.51159885447416e-29	154078819	154078819	1.91131612813101e-199	154442377	154442377
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	3	-3.4836	1.91131612813101e-199	154442377	154442377	1.98694159376727e-161	154450309	154450309
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	28	0.9053	1.98694159376727e-161	154450309	154450309	7.62136339468849e-110	154578922	154582414
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	185	-0.0086	7.62136339468849e-110	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	116	-4.625	NA	NA	NA	2.34110246745537e-30	3219200	3772482
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	15	-1.2471	2.34110246745537e-30	3219200	3772482	1.16337668531771e-12	5422507	6692482
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	5672441	1	0	NA	1.16337668531771e-12	5422507	6692482	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6652845	7266323	232	215	-3.8912	NA	NA	NA	6.60380075842675e-11	7259689	7277048
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7267235	7304209	19	14	-1.3174	6.60380075842675e-11	7259689	7277048	1.13334612794850e-12	7300600	7307884
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7305143	7722458	125	121	-4.0221	1.1333461279485e-12	7300600	7307884	0.000235249237794241	7698960	7733351
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7723783	7782532	19	16	-2.5503	0.000235249237794241	7698960	7733351	1.79111842042617e-07	7751430	7785973
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7905286	37	34	-4.0903	1.79111842042617e-07	7751430	7785973	1.70589781417679e-08	7897073	7905286
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7905553	7914104	3	3	-1.5042	1.70589781417679e-08	7897073	7905286	7.27013268074572e-05	7914104	7928317
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	10515697	390	353	-4.2237	7.27013268074572e-05	7914104	7928317	1.47192338019339e-34	10513747	10535786
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10631941	11	11	-0.4974	1.47192338019339e-34	10513747	10535786	1.19188894475036e-08	10622062	11698871
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10645500	10645500	1	0	NA	1.19188894475036e-08	10622062	11698871	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12926941	128	116	-3.3637	NA	NA	NA	0.0160174325606672	12871057	12926941
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12928074	12958620	6	5	-1.0741	0.0160174325606672	12871057	12926941	1.64117942095281e-08	12958620	12958620
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12959689	12992839	16	15	-2.5447	1.64117942095281e-08	12958620	12958620	0.0100795733423674	12978637	13012038
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12994193	12994193	1	0	NA	0.0100795733423674	12978637	13012038	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12996552	13029929	16	15	-1.9197	NA	NA	NA	0.00907026428875248	13008662	13032760
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13031576	13048283	8	7	-1.0648	0.00907026428875248	13008662	13032760	9.30185796213692e-08	13048283	13052633
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13050965	13104920	23	19	-3.6288	9.30185796213692e-08	13048283	13052633	0.00305189441639632	13081856	13112411
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13106723	13129843	10	10	-2.0244	0.00305189441639632	13081856	13112411	7.71275434258433e-06	13119344	13138841
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13259414	43	39	-3.9701	7.71275434258433e-06	13119344	13138841	0.00105698055974290	13159901	13320153
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13261173	13663517	166	151	-4.5945	0.0010569805597429	13159901	13320153	3.50415233520295e-10	13649497	13663517
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13670791	13691261	3	0	NA	3.50415233520295e-10	13649497	13663517	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13691319	13692518	2	2	-0.9485	NA	NA	NA	1.2497353981218e-10	13692518	13692518
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13699223	14342834	194	182	-4.6596	1.2497353981218e-10	13692518	13692518	1.37541430336562e-13	14328579	14382361
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14508021	96	85	-3.7392	1.37541430336562e-13	14328579	14382361	3.68423965930973e-15	14502379	14528771
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	3.68423965930973e-15	14502379	14528771	NA	NA	NA
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	24	-1.6087	NA	NA	NA	1.51310769126339e-10	14572190	14579298
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14598838	6	6	-4.7274	1.51310769126339e-10	14572190	14579298	8.8559690948126e-05	14598838	14681738
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14601309	14695441	13	13	-2.2837	8.8559690948126e-05	14598838	14681738	3.10904656211637e-16	14694578	14696387
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14696387	14883615	47	45	-4.5843	3.10904656211637e-16	14694578	14696387	4.44440799749391e-13	14875973	14883615
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14894476	14909937	4	4	-1.8646	4.44440799749391e-13	14875973	14883615	6.94148214198912e-19	14909937	14909937
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14913412	14986956	11	11	-4.5601	6.94148214198912e-19	14909937	14909937	5.6083929177805e-11	14986956	14986956
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14994704	15018205	4	4	-2.2826	5.6083929177805e-11	14986956	14986956	6.70258663021447e-10	15018205	15018205
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15022037	15139441	28	27	-4.4825	6.70258663021447e-10	15018205	15018205	4.10513699025221e-16	15139441	15139441
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15140278	15149506	7	6	-2.0949	4.10513699025221e-16	15139441	15139441	9.0580089546977e-06	15149506	15155598
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15152354	15208612	33	32	-4.3476	9.0580089546977e-06	15149506	15155598	6.16369715339534e-07	15204346	15220050
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15209166	15241527	10	10	-2.2659	6.16369715339534e-07	15204346	15220050	0.000274226453429505	15227049	15251900
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15242592	15284717	31	27	-3.9218	0.000274226453429505	15227049	15251900	0.000315303298749919	15266772	15298885
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15286805	15389388	67	63	-4.8406	0.000315303298749919	15266772	15298885	2.54707849157251e-06	15378329	15423625
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15390599	15915466	156	147	-4.0212	2.54707849157251e-06	15378329	15423625	3.01091008781472e-05	15765251	16019249
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16177411	104	93	-3.2308	3.01091008781472e-05	15765251	16019249	4.89840465645988e-05	16100397	16189066
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16178192	16371504	55	47	-4.2536	4.89840465645988e-05	16100397	16189066	2.48688825249002e-08	16362978	16371504
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16377188	16387273	3	3	-1.0124	2.48688825249002e-08	16362978	16371504	2.75585879950174e-08	16387273	16399608
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	19610243	377	348	-4.5121	2.75585879950174e-08	16387273	16399608	1.65468325876865e-07	19608039	19610243
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19612530	19613864	2	2	-0.4401	1.65468325876865e-07	19608039	19610243	4.06586428736068e-08	19613864	19614809
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19614809	22930737	661	609	-4.4543	4.06586428736068e-08	19613864	19614809	4.73805734099027e-83	22926726	22930737
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	29	-1.1228	4.73805734099027e-83	22926726	22930737	3.31755874164870e-08	26943701	26980386
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27003308	12	11	-2.7873	3.3175587416487e-08	26943701	26980386	0.000357761235625918	26989053	27003308
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27006628	27019256	5	5	-0.6328	0.000357761235625918	26989053	27003308	1.45837064998628e-73	27019256	27019256
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27039222	4	4	-4.5095	1.45837064998628e-73	27019256	27019256	9.19129502885674e-74	27039222	27039222
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	27137064	16	16	-0.6644	9.19129502885674e-74	27039222	27039222	1.15878243734505e-08	27137064	27163598
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27163598	27176933	5	4	-3.1604	1.15878243734505e-08	27137064	27163598	4.38846166384752e-09	27172283	27176933
MSK_252152916608_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27188740	57440809	11	11	-0.39	4.38846166384752e-09	27172283	27176933	NA	NA	NA
