Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	41118001	15379	14845	0.0168	NA	NA	NA	1.21380017819895e-06	41109676	41124219
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	41120407	41153389	7	7	0.5961	1.21380017819895e-06	41109676	41124219	3.45906418239879e-08	41145216	41159448
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	41156568	72537426	12508	12109	0.0028	3.45906418239879e-08	41145216	41159448	1.55610967454563e-163	72537426	72537426
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	11	2.0302	1.55610967454563e-163	72537426	72537426	4.60473541168151e-169	72579311	72579311
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	150823073	17557	16934	-0.0016	4.60473541168151e-169	72579311	72579311	1.43952412549885e-11	150819879	150836481
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150839754	3	3	-1.0528	1.43952412549885e-11	150819879	150836481	0.00475661313667749	150839754	150844444
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150851439	7	6	-2.9481	0.00475661313667749	150839754	150844444	2.92983258196828e-171	150851439	150851439
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2657	0.0084	2.92983258196828e-171	150851439	150851439	3.64815161563763e-60	157133150	157133150
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	3.0143	3.64815161563763e-60	157133150	157133150	2.40442200375880e-69	157136342	157136342
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	200613454	15468	14971	-0.0047	2.4044220037588e-69	157136342	157136342	3.61941208578227e-13	200600795	200616638
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200616638	200672373	22	22	-0.4112	3.61941208578227e-13	200600795	200616638	8.20151749285477e-13	200668993	200683992
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200673525	246794552	17296	16718	-0.0043	8.20151749285477e-13	200668993	200683992	2.4999944260527e-78	246769018	246805521
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246805521	246862029	26	25	-0.9237	2.4999944260527e-78	246769018	246805521	1.2527936643054e-50	246860551	246863179
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246863179	247186514	98	94	-0.0219	1.2527936643054e-50	246860551	246863179	NA	NA	NA
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	11132	0.0026	NA	NA	NA	8.79720562120016e-49	34542224	34543992
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34582272	16	16	0.9125	8.79720562120016e-49	34542224	34543992	1.70218418672727e-53	34582272	34582272
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34583814	34583814	1	0	NA	1.70218418672727e-53	34582272	34582272	NA	NA	NA
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34589997	35553983	382	368	-0.0208	NA	NA	NA	7.20331463067379e-20	35553983	35553983
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35556102	35562007	2	2	-1.6148	7.20331463067379e-20	35553983	35553983	2.51395722462098e-18	35562007	35562007
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35564203	37810001	986	958	-0.0183	2.51395722462098e-18	35562007	35562007	4.91621353058935e-26	37800512	37813211
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37812045	37854350	21	21	-0.615	4.91621353058935e-26	37800512	37813211	1.98725902699628e-29	37847519	37858379
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37855837	52600588	5802	5594	0.0019	1.98725902699628e-29	37847519	37858379	7.82269994139051e-11	52588009	52600588
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	0.7801	7.82269994139051e-11	52588009	52600588	1.66961842893511e-10	52635695	52639605
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	242689978	59090	57042	-3e-04	1.66961842893511e-10	52635695	52639605	NA	NA	NA
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	37075	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	43644	29583050	9990	9649	0.0035	NA	NA	NA	1.78078233165422e-09	29583050	29583050
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	29586593	29594534	2	2	-1.1415	1.78078233165422e-09	29583050	29583050	9.41779967211563e-09	29594534	29594534
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	29595898	75783255	16884	16305	0.0024	9.41779967211563e-09	29594534	29594534	1.64097711410145e-11	75469606	75787094
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75784655	75875904	17	15	-0.4716	1.64097711410145e-11	75469606	75787094	4.78203595758916e-12	75870144	76013273
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76000715	163992903	26594	25676	8e-04	4.78203595758916e-12	75870144	76013273	1.90969371242772e-78	163992903	164001657
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164027724	8	8	1.5457	1.90969371242772e-78	163992903	164001657	0.00441512958288724	164005577	164038917
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164112873	21	19	0.8877	0.00441512958288724	164005577	164038917	3.66535670488134e-57	164107951	164115417
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164115417	194354505	10129	9781	-0.0061	3.66535670488134e-57	164107951	164115417	4.15410030698759e-09	194353315	194360242
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194368145	7	7	0.6003	4.15410030698759e-09	194353315	194360242	7.60177562195557e-09	194365648	194375211
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194371608	196822133	995	963	-0.0078	7.60177562195557e-09	194365648	194375211	7.19389960541487e-32	196809098	196907040
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196961238	31	31	-0.5596	7.19389960541487e-32	196809098	196907040	6.1429773032503e-29	196950095	196968244
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196964180	199329592	953	922	-0.0051	6.1429773032503e-29	196950095	196968244	NA	NA	NA
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3294	0.0296	NA	NA	NA	0	9815760	9815760
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-5.5368	0	9815760	9815760	0	9842644	9842644
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	187330240	50521	48715	-0.0091	0	9842644	9842644	5.35301259466254e-28	187330240	187330240
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	1.8884	5.35301259466254e-28	187330240	187330240	1.06255571229191e-28	187333619	187333619
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1194	-0.0099	1.06255571229191e-28	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	776194	223	219	0.0071	NA	NA	NA	8.29143939639429e-09	730853	813837
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	812169	873365	7	7	-0.632	8.29143939639429e-09	730853	813837	2.08536549300618e-10	819038	910211
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	905462	12857302	3745	3615	0.0172	2.08536549300618e-10	819038	910211	2.58605923513149e-09	12853151	12857302
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	1.1677	2.58605923513149e-09	12853151	12857302	2.39446888136305e-09	12873052	12873052
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	180194323	49668	48034	-0.0018	2.39446888136305e-09	12873052	12873052	5.46930216279852e-10	180189516	180342860
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180342860	180362342	10	9	-0.5696	5.46930216279852e-10	180189516	180342860	5.51488279882389e-09	180362342	180365977
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180364670	180644810	111	104	0.034	5.51488279882389e-09	180362342	180365977	NA	NA	NA
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	204881	42	37	-0.0515	NA	NA	NA	9.5711718072418e-24	200350	211079
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	210326	326323	59	59	-0.6527	9.5711718072418e-24	200350	211079	2.90201842377316e-98	322557	327962
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	17516113	6040	5835	0.0084	2.90201842377316e-98	322557	327962	1.32321791431234e-09	17512316	17516113
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	17518034	17522355	3	3	-0.9293	1.32321791431234e-09	17512316	17516113	4.56613699861573e-09	17522355	17524473
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	17524473	29950805	4443	4295	-0.0067	4.56613699861573e-09	17522355	17524473	1.41883467792338e-09	29937319	29986370
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30010234	15	14	0.4337	1.41883467792338e-09	29937319	29986370	5.60047632798354e-08	29986370	30030032
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30021908	32558677	1075	1043	-0.0057	5.60047632798354e-08	29986370	30030032	1.77523654719374e-84	32558677	32588005
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32600962	9	8	-1.9342	1.77523654719374e-84	32558677	32588005	4.88252909043167e-11	32593151	32605300
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	32713363	36	36	-0.1841	4.88252909043167e-11	32593151	32605300	3.4716947903004e-06	32703109	32718991
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	7	-1.2293	3.4716947903004e-06	32703109	32718991	7.64546628712083e-38	32723722	32728487
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	54035000	8259	7967	0.0069	7.64546628712083e-38	32723722	32728487	4.81404024988059e-23	54035000	54035000
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54039814	2	2	1.8187	4.81404024988059e-23	54035000	54035000	1.38671288885318e-25	54039814	54039814
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54042734	54042734	1	0	NA	1.38671288885318e-25	54039814	54039814	NA	NA	NA
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	103841482	13207	12757	-0.0069	NA	NA	NA	2.79497835757156e-244	103841482	103841482
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	3	-4.5664	2.79497835757156e-244	103841482	103841482	4.08205962713053e-249	103868154	103868154
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	132154299	9540	9205	-0.0037	4.08205962713053e-249	103868154	103868154	5.51343049556361e-12	132154299	132154299
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	132156778	132159522	2	2	-1.2583	5.51343049556361e-12	132154299	132154299	2.50115316540002e-12	132159522	132159522
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	132161292	139643729	2838	2751	-0.0182	2.50115316540002e-12	132159522	132159522	1.90443752326325e-18	139643729	139643729
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139645417	139648318	3	3	-1.248	1.90443752326325e-18	139643729	139643729	5.51373503711042e-17	139648318	139648318
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139651247	165643653	8723	8403	-0.0059	5.51373503711042e-17	139648318	139648318	1.75946621111820e-35	165643653	165643653
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.533	1.7594662111182e-35	165643653	165643653	2.65125871789276e-31	165650610	165650610
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1735	0.0014	2.65125871789276e-31	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	38248761	13595	13129	0.0022	NA	NA	NA	5.99539283033381e-16	38229583	38264758
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38251281	38384435	57	54	-0.2838	5.99539283033381e-16	38229583	38264758	8.51431396192104e-15	38360187	38403343
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38385708	118611324	25613	24751	-0.0052	8.51431396192104e-15	38360187	38403343	8.21425592114207e-11	118609124	118611324
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	1.0156	8.21425592114207e-11	118609124	118611324	2.27389312186985e-11	118620875	118622742
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	125831554	3170	3053	-0.0043	2.27389312186985e-11	118620875	118622742	1.07049957446905e-07	125829681	125831554
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	0.8436	1.07049957446905e-07	125829681	125831554	8.46993141599634e-07	125837524	125839386
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133433384	3654	3514	0.0052	8.46993141599634e-07	125837524	125839386	6.28870140811738e-11	133426996	133433384
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.6477	6.28870140811738e-11	133426996	133433384	1.08619124878592e-11	133448277	133453811
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141409512	3699	3571	-1e-04	1.08619124878592e-11	133448277	133453811	0	141409512	141414719
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141410894	141413352	2	0	NA	0	141409512	141414719	NA	NA	NA
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141414719	141440184	13	13	-4.2444	NA	NA	NA	3.91567693590843e-161	141435643	141440184
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141690753	116	113	0.0074	3.91567693590843e-161	141435643	141440184	4.36542579793916e-207	141690753	141690753
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	-3.8927	4.36542579793916e-207	141690753	141690753	0	141714168	141714168
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	147702365	2512	2432	-0.0171	0	141714168	141714168	3.31737801705849e-13	147702365	147702365
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.3527	3.31737801705849e-13	147702365	147702365	1.13002376479569e-11	147707161	147707161
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4079	0.0029	1.13002376479569e-11	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	25022606	8129	7842	0.0017	NA	NA	NA	8.08702985211392e-19	25022606	25022606
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	1.3302	8.08702985211392e-19	25022606	25022606	9.5419719179796e-20	25039370	25047250
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	25120552	27	26	0.0094	9.5419719179796e-20	25039370	25047250	7.10284309262614e-23	25120552	25120552
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25125700	3	3	1.4408	7.10284309262614e-23	25120552	25120552	4.99765541711662e-24	25125700	25125700
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	102688379	22771	21976	-0.0064	4.99765541711662e-24	25125700	25125700	7.46382847146673e-11	102686166	102688379
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	102690502	102695889	4	4	-0.8676	7.46382847146673e-11	102686166	102688379	2.73075034062442e-10	102695889	102697333
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	102697333	146264846	13629	13173	0.0063	2.73075034062442e-10	102695889	102697333	NA	NA	NA
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	189055	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	194104	140145683	37943	36645	-0.0017	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9392	-0.0072	NA	NA	NA	1.26443533221350e-108	27038538	27038538
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-3.8277	1.2644353322135e-108	27038538	27038538	5.1504418160722e-108	27041812	27041812
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	45489823	4726	4568	-0.0163	5.1504418160722e-108	27041812	27041812	1.02322312180325e-114	45478162	46389734
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46384985	47167144	119	116	0.5089	1.02322312180325e-114	45478162	46389734	1.61110733542589e-105	47159404	47938346
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47172534	135285645	30232	29205	0.002	1.61110733542589e-105	47159404	47938346	NA	NA	NA
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	21379192	8423	8116	0.0065	NA	NA	NA	1.98443083567076e-23	21379192	21379192
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	21380486	21381731	2	2	-1.8869	1.98443083567076e-23	21379192	21379192	1.82491528795482e-26	21381731	21381731
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	21383023	49666382	8293	7996	6e-04	1.82491528795482e-26	21381731	21381731	0.000106451606603274	49655667	49666382
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49671267	49683052	2	2	0.7211	0.000106451606603274	49655667	49666382	1.40456231902652e-05	49683052	49694659
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49685235	66463477	4862	4705	0.0044	1.40456231902652e-05	49683052	49694659	8.90695294717089e-40	66463477	66463477
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	-2.4504	8.90695294717089e-40	66463477	66463477	1.99331067341478e-44	66469412	66469412
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	107284914	13645	13164	-1e-04	1.99331067341478e-44	66469412	66469412	1.08722923667837e-228	107284914	107284914
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107289887	107292148	2	2	-5.5182	1.08722923667837e-228	107284914	107284914	1.04234980205476e-227	107292148	107292148
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107293658	134450318	10073	9712	0.0057	1.04234980205476e-227	107292148	107292148	NA	NA	NA
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3605	0.0108	NA	NA	NA	0	9523923	9523923
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9554149	5	5	-5.5557	0	9523923	9523923	1.83653138097954e-17	9554149	9555181
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	9607363	10	9	-1.7261	1.83653138097954e-17	9554149	9555181	2.49347660632073e-85	9599999	9607363
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9610054	11112600	571	546	-0.017	2.49347660632073e-85	9599999	9607363	2.28122174553822e-43	11112600	11112600
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11116883	11140421	8	8	1.1575	2.28122174553822e-43	11112600	11112600	1.63764515569616e-30	11140421	11140421
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	11395862	70	68	-0.0292	1.63764515569616e-30	11140421	11140421	3.57831016728392e-16	11393473	11395862
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11435643	6	6	-0.9515	3.57831016728392e-16	11393473	11395862	2.93762498763522e-20	11435643	11435643
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	31079618	6738	6498	-0.0051	2.93762498763522e-20	11435643	11435643	7.61710972010935e-24	31074520	31098259
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31081498	31237505	22	21	-0.5538	7.61710972010935e-24	31074520	31098259	5.01286975312653e-23	31225941	31245432
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31242528	41303729	2491	2414	-0.0208	5.01286975312653e-23	31225941	31245432	7.77371355863278e-07	41293470	41303729
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	41307749	41312478	3	3	-0.8033	7.77371355863278e-07	41293470	41303729	1.57460127899281e-06	41312478	41315922
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	41315922	52644641	4281	4143	0.0017	1.57460127899281e-06	41312478	41315922	1.81055914074985e-07	52642972	52644641
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	52645412	52646415	2	2	1.0514	1.81055914074985e-07	52642972	52644641	3.12899206262587e-07	52646415	52646415
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	52647464	132289090	27212	26306	-6e-04	3.12899206262587e-07	52646415	52646415	NA	NA	NA
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	49964838	12219	11794	-0.0049	NA	NA	NA	8.13303333818072e-23	49964838	49964838
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	1.7487	8.13303333818072e-23	49964838	49964838	9.93455815640265e-23	49971732	49971732
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	51296396	587	577	0.0095	9.93455815640265e-23	49971732	49971732	8.76040610489575e-07	51294959	51296396
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	51298094	51300398	3	3	-0.7808	8.76040610489575e-07	51294959	51296396	1.73696379603227e-06	51300398	51301682
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	51301682	56650373	1214	1167	0.0079	1.73696379603227e-06	51300398	51301682	6.39567009701944e-43	56646284	56650373
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56681665	14	14	0.9238	6.39567009701944e-43	56646284	56650373	9.27941818043307e-47	56681665	56681665
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56685341	114123340	17605	16981	-0.0019	9.27941818043307e-47	56681665	56681665	NA	NA	NA
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	21551504	1063	1030	-0.0107	NA	NA	NA	7.00377682354269e-41	21526238	21573262
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21552515	22022060	234	227	-0.2631	7.00377682354269e-41	21526238	21573262	7.64420265095559e-58	22006974	22044438
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22025617	69086125	16331	15812	-0.0029	7.64420265095559e-58	22006974	22044438	5.04850824785963e-15	69084841	69092211
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69097052	6	6	0.8224	5.04850824785963e-15	69084841	69092211	3.20149203423702e-13	69092211	69098569
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69098569	79174722	4707	4547	0.0054	3.20149203423702e-13	69092211	69098569	9.74447696532878e-155	79174722	79174722
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79176037	79183154	4	4	-3.3394	9.74447696532878e-155	79174722	79174722	1.18103414397782e-168	79183154	79183154
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	99457537	6693	6473	0.0071	1.18103414397782e-168	79183154	79183154	7.38029990661308e-16	99453703	99461923
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	99461923	99487712	16	16	0.5302	7.38029990661308e-16	99453703	99461923	1.04187306779587e-11	99486409	99494382
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	99489222	105856591	2649	2556	0.0106	1.04187306779587e-11	99486409	99494382	2.13312991509052e-06	105846004	105872360
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856972	105881893	6	6	-0.6268	2.13312991509052e-06	105846004	105872360	1.00730961099409e-06	105875924	105900253
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	106358491	176	173	-0.013	1.00730961099409e-06	105875924	105900253	NA	NA	NA
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18692865	6	6	0.0643	NA	NA	NA	5.58865762350228e-07	18692865	18818949
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18741716	20088256	150	143	0.705	5.58865762350228e-07	18692865	18818949	4.78538810805713e-252	20065525	20308014
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	75115806	21729	20980	1e-04	4.78538810805713e-252	20065525	20308014	8.77827909074158e-105	75115806	75115806
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	-3.8359	8.77827909074158e-105	75115806	75115806	3.62108906405658e-102	75119713	75119713
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	98234519	8522	8211	0.0031	3.62108906405658e-102	75119713	75119713	3.04347085249994e-124	98234519	98234519
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98237721	98239454	2	2	-4.2274	3.04347085249994e-124	98234519	98234519	4.82788011045295e-117	98239454	98239454
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	100298352	911	880	0.0073	4.82788011045295e-117	98239454	98239454	NA	NA	NA
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	2593067	1012	972	0.0244	NA	NA	NA	2.01226238828451e-10	2589724	2593067
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2600740	2639798	4	4	1.0593	2.01226238828451e-10	2589724	2593067	3.84111164449636e-15	2639798	2649851
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2649851	28512937	8599	8299	-0.0011	3.84111164449636e-15	2639798	2649851	6.7162411685351e-08	28511295	28512937
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	28523145	28529948	4	4	0.7799	6.7162411685351e-08	28511295	28512937	1.33579482519842e-06	28529942	28539481
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	28536745	31854794	952	901	0.0138	1.33579482519842e-06	28529942	28539481	1.86628876167893e-13	31818508	32515876
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	31862577	33842125	51	47	-0.306	1.86628876167893e-13	31818508	32515876	1.13098890905416e-14	33536526	34061926
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33846647	54348362	3073	2958	0.0013	1.13098890905416e-14	33536526	34061926	1.05330023446324e-09	54339225	54363713
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54352394	54379839	11	11	-0.5191	1.05330023446324e-09	54339225	54363713	1.78810676252433e-08	54365385	54402057
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	57203733	1203	1157	0.0044	1.78810676252433e-08	54365385	54402057	3.32482796447532e-07	57203733	57203733
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	1.1282	3.32482796447532e-07	57203733	57203733	9.03291582744989e-09	57206772	57206772
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	74088894	5308	5126	0.0021	9.03291582744989e-09	57206772	57206772	3.48323332112562e-07	74073008	74105458
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	74091505	74139612	22	20	-0.3232	3.48323332112562e-07	74073008	74105458	8.05597443819562e-08	74124510	74153116
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	74141966	75093957	282	274	-3e-04	8.05597443819562e-08	74124510	74153116	2.04659092599509e-36	75093957	75093957
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.6992	2.04659092599509e-36	75093957	75093957	1.54362075692119e-37	75100865	75100865
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76923844	609	584	-0.0053	1.54362075692119e-37	75100865	75100865	8.61816532928472e-173	76923844	76923844
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76925748	76925748	1	0	NA	8.61816532928472e-173	76923844	76923844	NA	NA	NA
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	2.2364	NA	NA	NA	3.26100769333961e-121	76940218	76940218
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4336	0.0105	3.26100769333961e-121	76940218	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	397	0.02	NA	NA	NA	5.90690532539004e-16	1028979	1028979
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.5908	5.90690532539004e-16	1028979	1028979	1.72698446791218e-16	1030766	1030766
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	32828797	12002	11565	0.004	1.72698446791218e-16	1030766	1030766	3.12549243709935e-189	32828797	32828797
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	-5.2598	3.12549243709935e-189	32828797	32828797	1.63797620586822e-184	32832642	32832642
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	32833765	1	0	NA	1.63797620586822e-184	32832642	32832642	NA	NA	NA
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32836527	41544224	3474	3347	0.0119	NA	NA	NA	2.80469907772338e-18	41521544	41553226
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41546807	42153189	63	59	-0.3005	2.80469907772338e-18	41521544	41553226	7.52007636372065e-18	42142363	42173482
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42155643	78653545	13673	13162	0.0061	7.52007636372065e-18	42142363	42173482	NA	NA	NA
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22213	-9e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	472	0.0342	NA	NA	NA	2.11898694919180e-08	1395246	1398325
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.2353	2.1189869491918e-08	1395246	1398325	3.84668307074162e-08	1400840	1400840
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	1405308	1	0	NA	3.84668307074162e-08	1400840	1400840	NA	NA	NA
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1409386	20399700	8721	8415	0.0019	NA	NA	NA	4.61597559120178e-44	20386500	20422223
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20420327	20507235	16	16	-0.9825	4.61597559120178e-44	20386500	20422223	9.34303875797837e-49	20474417	20510787
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20510787	56823430	10641	10253	-0.0017	9.34303875797837e-49	20474417	20510787	6.81416366335734e-12	56819531	56823430
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	7	-0.7486	6.81416366335734e-12	56819531	56823430	1.43396952976107e-10	56840346	56844304
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	59414645	1173	1143	-0.0286	1.43396952976107e-10	56840346	56844304	2.07890802078262e-09	59410642	59414898
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59414898	59440262	12	11	0.5149	2.07890802078262e-09	59410642	59414898	1.16257050461773e-08	59434159	59443697
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440274	63788698	1993	1912	-0.0042	1.16257050461773e-08	59434159	59443697	NA	NA	NA
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1511632	587	560	0.0101	NA	NA	NA	1.30139115642294e-205	1511632	1515948
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1515948	1531162	8	8	-3.1471	1.30139115642294e-205	1511632	1515948	6.4703568988087e-272	1528899	1531162
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	52080395	17246	16660	0.0054	6.4703568988087e-272	1528899	1531162	1.46252763375775e-09	52078884	52081719
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52081719	52090393	5	5	-0.7711	1.46252763375775e-09	52078884	52081719	3.65822967115003e-09	52089160	52094361
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52092989	62419534	3733	3579	0.0168	3.65822967115003e-09	52089160	52094361	NA	NA	NA
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12968	0.0032	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	49571068	16557	15975	0.0133	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	2708291	1793	1730	-0.0019	NA	NA	NA	0	2708113	2711273
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	8450789	1790	1733	0.9192	0	2708113	2711273	4.83623661319451e-09	8446489	8456422
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8452395	8473482	9	9	0.286	4.83623661319451e-09	8446489	8456422	5.85596671222882e-13	8465433	8481280
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8475091	88039167	23447	22638	0.9569	5.85596671222882e-13	8465433	8481280	2.60467226066884e-16	88035247	88039167
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	88045012	88062186	7	7	0.0622	2.60467226066884e-16	88035247	88039167	8.42131833123867e-16	88062186	88065425
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	88065425	154038318	19748	19082	0.9581	8.42131833123867e-16	88062186	88065425	2.85433495146956e-25	154037006	154038318
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154079002	12	11	1.8535	2.85433495146956e-25	154037006	154038318	1.20767359683895e-20	154079002	154085354
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154085354	154442377	89	86	0.915	1.20767359683895e-20	154079002	154085354	4.10567370428128e-150	154442377	154442377
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	4	-3.0336	4.10567370428128e-150	154442377	154442377	1.22276277852969e-194	154450309	154450309
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	27	0.9233	1.22276277852969e-194	154450309	154450309	5.00721244836031e-63	154578922	154586690
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	195	0.0204	5.00721244836031e-63	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4174561	129	120	-4.3236	NA	NA	NA	2.16039396829766e-18	3777766	4272867
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	5593746	11	11	-1.1395	2.16039396829766e-18	3777766	4272867	2.39617006652292e-09	5422507	6692482
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7051884	173	166	-3.9092	2.39617006652292e-09	5422507	6692482	3.50353692752358e-08	7016814	7196517
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7495687	130	125	-2.8608	3.50353692752358e-08	7016814	7196517	2.47086962682411e-05	7367173	7614571
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7723783	75	73	-3.9167	2.47086962682411e-05	7367173	7614571	5.25740279789172e-08	7714929	7729757
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7782532	18	16	-1.8948	5.25740279789172e-08	7714929	7729757	3.86963161387678e-11	7776265	7788596
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7905286	37	36	-3.8396	3.86963161387678e-11	7776265	7788596	2.36680602064068e-06	7895945	7905286
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7905553	7914104	3	3	-0.8751	2.36680602064068e-06	7895945	7905286	4.34072240615823e-10	7914104	7918899
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	7992095	16	16	-4.1323	4.34072240615823e-10	7914104	7918899	0.00160117381792011	7970340	8005148
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7992221	8036254	8	8	-2.6538	0.00160117381792011	7970340	8005148	1.10560536687429e-06	8005148	8057124
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8043008	8289709	61	56	-4.3769	1.10560536687429e-06	8005148	8057124	6.30310287544321e-13	8277707	8289709
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8292347	8313045	10	10	-2.3378	6.30310287544321e-13	8277707	8289709	1.22378382975410e-05	8313045	8335081
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8316416	10515697	295	281	-4.0677	1.2237838297541e-05	8313045	8335081	1.09857284311617e-23	10513747	10537808
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	11673476	17	13	-0.8867	1.09857284311617e-23	10513747	10537808	1.16399737724492e-05	10622062	12532441
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	11698871	1	0	NA	1.16399737724492e-05	10622062	12532441	NA	NA	NA
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12999095	148	144	-3.2506	NA	NA	NA	0.000448717734242823	12922667	13031576
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13001517	13129843	54	53	-2.1562	0.000448717734242823	12922667	13031576	9.26071416472454e-55	13114969	13136828
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	14342834	408	387	-4.2942	9.26071416472454e-55	13114969	13136828	7.95016089688814e-18	14323815	14377844
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14508021	96	92	-3.3067	7.95016089688814e-18	14323815	14377844	1.13121374985950e-09	14500820	14530134
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	1.1312137498595e-09	14500820	14530134	NA	NA	NA
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	23	-1.4526	NA	NA	NA	0.00191372089783214	14555872	14605090
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14700040	23	23	-2.901	0.00191372089783214	14555872	14605090	0.0098362738026913	14605090	14841337
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14701706	15915466	394	379	-3.9149	0.0098362738026913	14605090	14841337	9.89948827714377e-08	15716500	15986595
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16195788	117	113	-3.0902	9.89948827714377e-08	15716500	15986595	1.48122817291228e-15	16177411	16221882
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16198927	17767311	266	255	-4.2402	1.48122817291228e-15	16177411	16221882	0.000348002657048641	17583495	17814505
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17772524	17893954	42	41	-3.3389	0.000348002657048641	17583495	17814505	4.19023260496575e-07	17828001	17995508
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17901399	22930737	777	739	-4.3008	4.19023260496575e-07	17828001	17995508	2.32737320764643e-134	22924754	26870361
MSK_252152916609_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	81	-1.2841	2.32737320764643e-134	22924754	26870361	NA	NA	NA
