Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	1637771	210	197	0.0132	NA	NA	NA	3.09010924817033e-09	1603613	1637771
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	1640562	1654026	3	3	-0.947	3.09010924817033e-09	1603613	1637771	4.20095354465509e-08	1654026	1669998
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	1669998	16838573	5575	5387	0	4.20095354465509e-08	1654026	1669998	2.50751879590517e-21	16814050	16888048
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16888048	17127039	19	18	-0.6144	2.50751879590517e-21	16814050	16888048	7.87706012763825e-21	17121583	17155989
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17148592	17148592	1	0	NA	7.87706012763825e-21	17121583	17155989	NA	NA	NA
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17154037	72537426	22086	21366	-0.0035	NA	NA	NA	3.38270500899243e-175	72537426	72537426
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72574479	13	13	2.044	3.38270500899243e-175	72537426	72537426	4.55018342377573e-176	72574479	72574479
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72579311	72579311	1	0	NA	4.55018342377573e-176	72574479	72574479	NA	NA	NA
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	143623909	15603	15053	-0.0037	NA	NA	NA	1.60816201202124e-09	142730208	143631346
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143631328	143659690	16	14	0.4733	1.60816201202124e-09	142730208	143631346	2.73932530335873e-10	143653780	143706304
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143697723	150819879	1937	1870	-0.0035	2.73932530335873e-10	143653780	143706304	1.32124952057736e-56	150819879	150823073
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	11	1.247	1.32124952057736e-56	150819879	150823073	5.9163855765863e-54	150848509	150851439
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	194978218	16059	15542	-0.0051	5.9163855765863e-54	150848509	150851439	3.11357503897918e-20	194977713	194978218
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195048208	7	7	-0.9767	3.11357503897918e-20	194977713	194978218	1.80930028547596e-21	195048208	195062793
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195062793	200602881	2162	2092	0.0012	1.80930028547596e-21	195048208	195062793	3.73573254600518e-08	200585836	200629099
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200609726	200667381	22	22	-0.3482	3.73573254600518e-08	200585836	200629099	3.36103661493099e-08	200642828	200679934
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200668993	211067168	4053	3913	0.0103	3.36103661493099e-08	200642828	200679934	2.14962974882699e-09	211065770	211067168
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	211070042	211079988	4	4	-0.8821	2.14962974882699e-09	211065770	211067168	2.19914385486319e-09	211079988	211082419
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	211082419	242699020	11528	11153	-0.0089	2.19914385486319e-09	211079988	211082419	1.97328489471441e-81	242693936	242706489
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	242704328	242921986	86	83	0.5385	1.97328489471441e-81	242693936	242706489	2.87190821233473e-84	242917110	242925624
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	242923175	247186514	1752	1699	-0.0206	2.87190821233473e-84	242917110	242925624	NA	NA	NA
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	11119	-0.006	NA	NA	NA	3.29412964760534e-61	34543992	34543992
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	18	1.0236	3.29412964760534e-61	34543992	34543992	4.17618463276825e-58	34589997	34589997
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	37813211	1371	1320	0.0075	4.17618463276825e-58	34589997	34589997	4.17363725806583e-08	37797909	37823343
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37815049	37855837	20	19	0.3847	4.17363725806583e-08	37797909	37823343	1.38536520408727e-08	37847519	37868682
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	66357387	10363	10025	-0.0017	1.38536520408727e-08	37847519	37868682	3.43530815651435e-10	66357387	66357387
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	1.2869	3.43530815651435e-10	66357387	66357387	3.36553694883731e-10	66360747	66360747
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	89054185	6991	6716	7e-04	3.36553694883731e-10	66360747	66360747	1.25919412638555e-22	89038425	89210958
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89057273	89730278	49	45	-0.3975	1.25919412638555e-22	89038425	89210958	4.040715845058e-10	89706973	89745998
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89742890	89902365	20	20	-0.8329	4.040715845058e-10	89706973	89745998	6.62880622707507e-44	89890854	91057122
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	91057122	146571330	14718	14195	-0.0013	6.62880622707507e-44	89890854	91057122	1.76448484928758e-17	146571330	146571330
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	1.1871	1.76448484928758e-17	146571330	146571330	1.71471006298488e-17	146592775	146592775
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	242689978	32749	31655	-0.0033	1.71471006298488e-17	146592775	146592775	NA	NA	NA
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	162173511	53129	51328	-0.002	NA	NA	NA	1.96474876836554e-33	162170223	162173511
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	162177754	162177754	1	0	NA	1.96474876836554e-33	162170223	162173511	NA	NA	NA
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	162179400	162202225	12	11	-0.9782	NA	NA	NA	1.27088292683995e-33	162202225	162205828
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	162205828	164005577	349	331	0.016	1.27088292683995e-33	162202225	162205828	7.57116639633302e-34	164005577	164009321
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	-1.495	7.57116639633302e-34	164005577	164009321	2.12465296847434e-35	164023502	164027724
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	194354505	10150	9822	6e-04	2.12465296847434e-35	164023502	164027724	4.65055592425707e-20	194354505	194354505
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	1.0354	4.65055592425707e-20	194354505	194354505	8.28088960060733e-21	194366950	194366950
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196835413	997	963	-0.0019	8.28088960060733e-21	194366950	194366950	1.44385938140380e-10	196809098	196911010
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196904349	196904349	1	0	NA	1.4438593814038e-10	196809098	196911010	NA	NA	NA
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196905767	196928503	17	16	-0.4604	NA	NA	NA	1.07066970819043e-09	196925203	196942158
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196929805	199329592	965	929	-0.0033	1.07066970819043e-09	196925203	196942158	NA	NA	NA
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	187330240	53918	52098	-0.0085	NA	NA	NA	5.33271595466005e-14	187330240	187330240
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-1.5236	5.33271595466005e-14	187330240	187330240	1.84086512046304e-13	187333619	187333619
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1199	-0.0077	1.84086512046304e-13	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	97057534	27470	26554	-0.004	NA	NA	NA	2.6268966388388e-25	97055188	97057534
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	97060205	97060205	1	0	NA	2.6268966388388e-25	97055188	97057534	NA	NA	NA
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	97074064	97119376	7	7	-1.062	NA	NA	NA	8.7270632084292e-25	97119376	97119376
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	97126918	98116606	148	142	-0.0075	8.7270632084292e-25	97119376	97119376	5.88356673061176e-14	98116606	98116606
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	98118881	98118881	1	0	NA	5.88356673061176e-14	98116606	98116606	NA	NA	NA
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	98121332	98126117	3	3	-1.1504	NA	NA	NA	4.21893732220759e-12	98126117	98127741
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	98127741	180342860	26016	25146	-0.0035	4.21893732220759e-12	98126117	98127741	3.49673087874704e-07	180182580	180342860
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180362342	9	9	-0.527	3.49673087874704e-07	180182580	180342860	1.66145480294035e-09	180362342	180365950
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180364670	180644810	111	107	0.0445	1.66145480294035e-09	180362342	180365950	NA	NA	NA
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	191387	38	37	-0.011	NA	NA	NA	1.11957834072156e-21	186875	198124
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	198124	236535	16	16	0.5838	1.11957834072156e-21	186875	198124	8.17944628165094e-06	230588	249566
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	237952	323898	46	46	0.2651	8.17944628165094e-06	230588	249566	2.03238371574350e-10	307231	345376
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	326323	29941766	10486	10139	-0.0078	2.0323837157435e-10	307231	345376	2.57115090997107e-12	29935438	29981912
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29950805	29950805	1	0	NA	2.57115090997107e-12	29935438	29981912	NA	NA	NA
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30033946	21	21	0.4293	NA	NA	NA	2.17678771431026e-12	30005338	30049982
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30040901	32548736	1068	1039	-0.0173	2.17678771431026e-12	30005338	30049982	9.38743057453775e-94	32548736	32600962
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32672983	28	24	-1.3591	9.38743057453775e-94	32548736	32600962	4.03367771344486e-05	32628420	32673823
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32673823	32711957	17	17	-0.0951	4.03367771344486e-05	32628420	32673823	2.2181020796289e-09	32709263	32711957
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32713363	32728487	9	7	-1.6166	2.2181020796289e-09	32709263	32711957	2.75649557499780e-58	32728487	32728487
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	54035000	8259	7999	-1e-04	2.7564955749978e-58	32728487	32728487	7.43520232647998e-25	54035000	54035000
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	1.6213	7.43520232647998e-25	54035000	54035000	1.10869304516323e-23	54042734	54042734
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	74647491	5288	5117	-0.005	1.10869304516323e-23	54042734	54042734	2.46276509085293e-08	74644381	74647491
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74650995	74655219	3	3	0.9819	2.46276509085293e-08	74644381	74647491	9.99117096350542e-09	74655219	74662644
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74662644	139643729	20300	19613	-0.0065	9.99117096350542e-09	74655219	74662644	7.21944625984334e-13	139641158	139643729
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139645417	139648318	3	3	-1.1882	7.21944625984334e-13	139641158	139643729	8.92891810515741e-13	139648318	139651247
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139651247	165643653	8723	8438	-0.0041	8.92891810515741e-13	139648318	139651247	2.00534395066906e-46	165643653	165643653
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.9136	2.00534395066906e-46	165643653	165643653	1.17479112174033e-44	165650610	165650610
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1752	-0.0024	1.17479112174033e-44	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	3412335	1178	1140	0.0091	NA	NA	NA	6.9304690279888e-07	3407926	3421619
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	3413603	3431904	9	9	-0.4854	6.9304690279888e-07	3407926	3421619	1.03530034532661e-06	3424119	3442940
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	3435568	16135701	4201	4069	0.0056	1.03530034532661e-06	3424119	3442940	1.26587241636255e-118	16135701	16135701
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-4.1932	1.26587241636255e-118	16135701	16135701	2.42276447723589e-112	16140018	16140018
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	75188956	17097	16545	-0.0024	2.42276447723589e-112	16140018	16140018	4.5022258973749e-07	75185783	75196119
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	75192598	75207560	7	7	0.5906	4.5022258973749e-07	75185783	75196119	1.92126608244901e-07	75203575	75212042
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	75210882	112218341	13837	13400	-0.0108	1.92126608244901e-07	75203575	75212042	2.35295862670268e-29	112215891	112218341
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	112221312	112265575	21	20	0.6697	2.35295862670268e-29	112215891	112218341	1.58962051382258e-27	112265575	112266957
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	112266957	118611324	2913	2816	-0.0047	1.58962051382258e-27	112265575	112266957	5.81106315117486e-172	118611324	118611324
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	-4.3158	5.81106315117486e-172	118611324	118611324	2.80259832576947e-180	118620875	118620875
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	125831554	3170	3075	-0.0052	2.80259832576947e-180	118620875	118620875	3.90908844080668e-147	125831554	125831554
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-3.8937	3.90908844080668e-147	125831554	125831554	5.8272130832618e-147	125837524	125837524
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133433384	3654	3514	-0.0047	5.8272130832618e-147	125837524	125837524	3.40474152675027e-15	133432281	133433384
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.7755	3.40474152675027e-15	133432281	133433384	1.29650910350869e-14	133448277	133453811
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141690753	3830	3707	0.0017	1.29650910350869e-14	133448277	133453811	0	141690753	141698634
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	-3.6746	0	141690753	141698634	0	141712786	141714168
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	143500499	658	633	-0.0126	0	141712786	141714168	2.22875411469395e-09	143497023	143500499
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143503317	143584350	4	4	-0.8251	2.22875411469395e-09	143497023	143500499	2.78396956049031e-07	143584350	143706194
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143705425	147702365	1850	1801	-0.0146	2.78396956049031e-07	143584350	143706194	2.55236875941801e-07	147697712	147702365
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147710037	4	3	-0.953	2.55236875941801e-07	147697712	147702365	1.50517925743076e-08	147710037	147711471
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147711471	155630221	2868	2772	0.0074	1.50517925743076e-08	147710037	147711471	2.68079543241664e-14	155630221	155630221
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	155632974	155632974	1	0	NA	2.68079543241664e-14	155630221	155630221	NA	NA	NA
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	155635254	155637620	3	3	-1.2207	NA	NA	NA	1.91769785516135e-13	155637620	155639337
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	155639337	158821263	1364	1317	0.0152	1.91769785516135e-13	155637620	155639337	NA	NA	NA
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	119	0.0196	NA	NA	NA	6.46831976246058e-57	581533	581533
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	3.1324	6.46831976246058e-57	581533	581533	3.05005628207580e-63	588865	588865
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	146264846	44445	42978	-0.0084	3.0500562820758e-63	588865	588865	NA	NA	NA
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	23343915	8000	7739	-0.0077	NA	NA	NA	3.32834974891217e-178	23343915	23343915
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	-4.3372	3.32834974891217e-178	23343915	23343915	1.15633780036955e-181	23365926	23365926
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	137352394	28836	27843	-0.0022	1.15633780036955e-181	23365926	23365926	7.22480123157928e-138	137352394	137352394
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	-4.629	7.22480123157928e-138	137352394	137352394	4.94188124138995e-153	137356880	137356880
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1069	0.0141	4.94188124138995e-153	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9439	-0.0082	NA	NA	NA	9.47759262392002e-134	27038538	27038538
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-4.5778	9.47759262392002e-134	27038538	27038538	2.60665882663667e-133	27041812	27041812
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	56115736	7300	7023	-0.0021	2.60665882663667e-133	27041812	27041812	1.57373865088082e-10	56107694	56120991
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	56118633	56140996	11	11	0.5629	1.57373865088082e-10	56107694	56120991	2.61413838898261e-11	56137463	56143873
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	56142414	68018403	3327	3229	-0.0081	2.61413838898261e-11	56137463	56143873	1.83729200360707e-33	68018403	68018403
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	68020303	68043643	8	8	-1.1412	1.83729200360707e-33	68018403	68018403	3.34948892111987e-33	68043643	68043643
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	68046521	135285645	24431	23600	-0.0019	3.34948892111987e-33	68043643	68043643	NA	NA	NA
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	134450318	45304	43812	-5e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9516067	3741	3610	-1e-04	NA	NA	NA	6.91116987223085e-11	9423653	9528590
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9523923	9607363	16	16	-0.4726	6.91116987223085e-11	9423653	9528590	8.13053848009378e-11	9599999	9630105
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9610054	11116883	572	550	-0.0084	8.13053848009378e-11	9599999	9630105	9.72994630353078e-203	11116883	11116883
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11128557	5	5	-3.7285	9.72994630353078e-203	11116883	11116883	1.13840952188965e-220	11128557	11128557
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11130871	11130871	1	0	NA	1.13840952188965e-220	11128557	11128557	NA	NA	NA
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	132289090	40826	39507	-0.0085	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	22929668	1546	1503	-0.0093	NA	NA	NA	1.23646986501904e-07	22923791	22929668
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	22931465	22934704	2	2	-1.138	1.23646986501904e-07	22923791	22929668	1.0008088707482e-07	22934704	22940370
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	22940370	33030946	4047	3904	-0.0087	1.0008088707482e-07	22934704	22940370	4.41260672236801e-07	33028007	33030946
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33033905	33042557	3	3	-0.8941	4.41260672236801e-07	33028007	33030946	4.01025973163515e-07	33042557	33046417
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33046417	36969571	1441	1397	0.0082	4.01025973163515e-07	33042557	33046417	4.43584859524741e-07	36964477	36969571
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36976441	36982877	2	2	1.1102	4.43584859524741e-07	36964477	36969571	2.49453484535960e-08	36982877	36982877
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36989091	37950801	296	290	-0.0098	2.4945348453596e-08	36982877	36982877	4.47787180946178e-130	37950801	37950801
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37953582	37953582	1	0	NA	4.47787180946178e-130	37950801	37950801	NA	NA	NA
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-4.3764	NA	NA	NA	1.29305891244104e-124	37957844	37957844
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4703	-0.0097	1.29305891244104e-124	37957844	37957844	7.47693631511111e-30	49964838	49964838
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-2.1656	7.47693631511111e-30	49964838	49964838	3.36275140498791e-30	49971732	49971732
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56650373	1804	1748	-0.001	3.36275140498791e-30	49971732	49971732	7.90151357620922e-27	56646284	56658479
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56681665	14	14	0.7765	7.90151357620922e-27	56646284	56658479	2.25693950537361e-26	56679017	56685341
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56685341	100690991	13041	12616	-0.0045	2.25693950537361e-26	56679017	56685341	5.13653667408732e-20	100690991	100690991
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	1.8021	5.13653667408732e-20	100690991	100690991	7.69434693583924e-21	100693892	100693892
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4420	0.0082	7.69434693583924e-21	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19535787	62	60	-0.7066	NA	NA	NA	5.1233958824607e-96	19494416	19538610
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19538610	69086125	17566	16974	-0.0027	5.1233958824607e-96	19494416	19538610	1.36420468245849e-06	69084841	69086125
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69092211	3	3	0.8685	1.36420468245849e-06	69084841	69086125	4.311459569402e-07	69092211	69093444
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69093444	73061942	1788	1720	-0.0077	4.311459569402e-07	69092211	69093444	4.40606206309942e-106	73061942	73061942
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73092112	8	8	2.0083	4.40606206309942e-106	73061942	73061942	1.42833556080636e-104	73092112	73092112
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	100468315	10176	9819	0.0022	1.42833556080636e-104	73092112	73092112	7.81504525900831e-07	100453183	100487738
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	100471849	100532918	41	40	-0.2387	7.81504525900831e-07	100453183	100487738	3.91038552500454e-07	100519286	100553238
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	100534009	105597555	1998	1934	0.0032	3.91038552500454e-07	100519286	100553238	8.05372174761722e-15	105594189	105606424
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	0.6242	8.05372174761722e-15	105594189	105606424	8.9512258689044e-11	105625010	105681007
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105787390	21	21	0.051	8.9512258689044e-11	105625010	105681007	1.08979031663237e-18	105787390	105787390
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105788623	105794161	4	4	-0.9929	1.08979031663237e-18	105787390	105787390	6.34882054571748e-09	105794161	105798116
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105795807	105850033	23	21	-0.0537	6.34882054571748e-09	105794161	105798116	8.19580196413681e-14	105848335	105856591
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105881893	7	7	-1.085	8.19580196413681e-14	105848335	105856591	3.71227227121348e-16	105881677	105897061
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	105948347	17	17	0.0191	3.71227227121348e-16	105881677	105897061	1.32701460769672e-21	105946993	105948347
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105951399	105989160	13	10	-0.944	1.32701460769672e-21	105946993	105948347	4.35414329626038e-22	105989160	105994646
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105994646	106216726	93	88	-0.0246	4.35414329626038e-22	105989160	105994646	0.000183787365031449	106185891	106219784
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106218059	106253648	17	17	0.2954	0.000183787365031449	106185891	106219784	7.21277149822308e-05	106251081	106285879
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106255190	106358491	36	33	-0.0686	7.21277149822308e-05	106251081	106285879	NA	NA	NA
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18824622	11	11	0.2053	NA	NA	NA	0.000538170733914854	18749895	18824622
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18826924	18848213	8	8	-0.2268	0.000538170733914854	18749895	18824622	0.000406325791954486	18848213	18876677
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18851513	19910696	95	94	0.2734	0.000406325791954486	18848213	18876677	1.1746047947612e-22	19537035	19952173
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19927040	32517839	3715	3591	-0.0149	1.1746047947612e-22	19537035	19952173	8.05482090529223e-22	32454294	32525865
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32520164	32664506	25	24	0.5375	8.05482090529223e-22	32454294	32525865	1.93313516131731e-21	32581730	32669751
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32667508	74669752	17857	17301	-0.0014	1.93313516131731e-21	32581730	32669751	5.53767871496081e-316	74669752	74669752
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-4.9794	5.53767871496081e-316	74669752	74669752	2.44189855050489e-240	74680439	74680439
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	75115806	170	162	-0.0151	2.44189855050489e-240	74680439	74680439	3.55106752291950e-23	75115806	75115806
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	-2.2538	3.5510675229195e-23	75115806	75115806	6.26387978582848e-32	75119713	75119713
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	100298352	9435	9125	0.0044	6.26387978582848e-32	75119713	75119713	NA	NA	NA
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	2600740	1013	976	0.0139	NA	NA	NA	8.93872832277124e-12	2593067	2600740
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2638581	2639798	3	3	1.0816	8.93872832277124e-12	2593067	2600740	4.74378727658768e-11	2639798	2649851
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2649851	32379126	9557	9278	-0.0101	4.74378727658768e-11	2639798	2649851	5.44824057259621e-34	31845232	32518665
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33647856	46	44	0.4808	5.44824057259621e-34	31845232	32518665	5.87515197865176e-33	33528385	33842125
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33830585	57203733	4290	4148	0.0034	5.87515197865176e-33	33528385	33842125	3.79021108791751e-54	57203733	57203733
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	-2.8392	3.79021108791751e-54	57203733	57203733	2.90543861423541e-52	57206772	57206772
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	75093957	5612	5435	-0.0054	2.90543861423541e-52	57206772	57206772	3.91612230344479e-56	75093957	75093957
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	-2.9402	3.91612230344479e-56	75093957	75093957	2.00936283859764e-55	75100865	75100865
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	586	-0.001	2.00936283859764e-55	75100865	75100865	5.10332949633531e-53	76925748	76925748
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	1.4477	5.10332949633531e-53	76925748	76925748	3.2357500332603e-55	76940218	76940218
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4372	0.003	3.2357500332603e-55	76940218	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	36673853	13871	13410	-0.0013	NA	NA	NA	2.6937370978072e-93	36673853	36673853
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	4	2.7193	2.6937370978072e-93	36673853	36673853	1.15149778371868e-94	36684619	36684619
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	36686013	1	0	NA	1.15149778371868e-94	36684619	36684619	NA	NA	NA
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36687917	40866844	1804	1738	-3e-04	NA	NA	NA	4.69898305260342e-07	40845024	40866844
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	40869151	41017338	6	6	-0.6215	4.69898305260342e-07	40845024	40866844	6.7858608720208e-09	41017338	41031191
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41026062	41519702	200	195	0.0356	6.7858608720208e-09	41017338	41031191	3.9101394294775e-36	41518222	41521544
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41566540	21	21	-0.6823	3.9101394294775e-36	41518222	41521544	8.13459110351577e-10	41562786	41570512
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41702238	42	41	-0.2663	8.13459110351577e-10	41562786	41570512	2.43014823172634e-08	41636402	42165272
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41704093	78653545	13683	13196	-0.0055	2.43014823172634e-08	41636402	42165272	NA	NA	NA
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	4316	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	108760	45826325	13917	13474	-0.0048	NA	NA	NA	7.31943861204508e-08	45824468	45826325
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	45828510	45831789	3	3	-0.9401	7.31943861204508e-08	45824468	45826325	4.68278861151749e-08	45831789	45834106
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	45834106	76116026	9043	8754	0.0055	4.68278861151749e-08	45831789	45834106	NA	NA	NA
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	63788698	23059	22276	-0.0149	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	560	0.0078	NA	NA	NA	1.02492481769663e-140	1506379	1516966
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	8	-2.6503	1.02492481769663e-140	1506379	1516966	1.27144373399074e-183	1521410	1531162
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	20285	0.0015	1.27144373399074e-183	1521410	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12998	-0.0013	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22667608	2983	2892	-0.0067	NA	NA	NA	3.02010625758705e-102	22667608	22682428
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22701123	8	8	-2.0648	3.02010625758705e-102	22667608	22682428	0.000106462657092119	22686690	22701205
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22701205	22720195	12	11	-3.8564	0.000106462657092119	22686690	22701205	0	22720195	22720195
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22721042	49571068	13554	13068	0.0059	0	22720195	22720195	NA	NA	NA
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	-0.0621	NA	NA	NA	1.28389184717615e-05	4893	98390
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	-1.1927	1.28389184717615e-05	4893	98390	1.04548157605283e-39	104486	104732
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	851066	557	542	0.028	1.04548157605283e-39	104486	104732	2.39047094867315e-07	848806	851066
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	851251	856655	5	5	0.653	2.39047094867315e-07	848806	851066	2.11880408211000e-08	856655	860688
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	859452	859452	1	0	NA	2.11880408211e-08	856655	860688	NA	NA	NA
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	859493	1169438	102	102	0.0181	NA	NA	NA	2.13760634120529e-17	1167948	1174117
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1172111	1328543	28	26	0.4719	2.13760634120529e-17	1167948	1174117	5.51531421502338e-21	1322183	1331221
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1331177	2708291	1087	1041	-0.0202	5.51531421502338e-21	1322183	1331221	0	2708291	2711273
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	39523285	13663	13176	0.9367	0	2708291	2711273	3.64877629103461e-23	39509866	39530512
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	39525112	39564957	18	18	1.3724	3.64877629103461e-23	39509866	39530512	1.05077335006596e-08	39558440	39583549
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	39567394	150306410	29848	28810	0.9319	1.05077335006596e-08	39558440	39583549	7.06824483105645e-08	150306410	150306410
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	150308132	150310638	2	2	2.1961	7.06824483105645e-08	150306410	150306410	5.241313450613e-08	150310638	150310638
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	150312073	154038318	1470	1436	0.8942	5.241313450613e-08	150310638	150310638	8.31028554740523e-21	154037006	154038318
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154078819	11	10	1.82	8.31028554740523e-21	154037006	154038318	2.90928993498881e-19	154078819	154079002
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154441943	89	83	0.9046	2.90928993498881e-19	154078819	154079002	1.42812386275422e-111	154441943	154441943
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154442377	154442377	1	0	NA	1.42812386275422e-111	154441943	154441943	NA	NA	NA
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	3	-2.8822	NA	NA	NA	1.44650440953457e-86	154450309	154450309
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	27	0.8234	1.44650440953457e-86	154450309	154450309	2.31420626348184e-52	154570196	154586690
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	192	0.011	2.31420626348184e-52	154570196	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	117	-4.0942	NA	NA	NA	4.28473790594136e-30	3219200	3772482
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3733715	1	0	NA	4.28473790594136e-30	3219200	3772482	NA	NA	NA
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-1.202	NA	NA	NA	1.75677944642913e-16	5531459	6688691
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7057026	176	167	-3.8892	1.75677944642913e-16	5531459	6688691	9.28912705408097e-08	7034323	7200061
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7070931	7304209	76	74	-2.7832	9.28912705408097e-08	7034323	7200061	1.15785654713922e-10	7254722	7342985
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7305143	10513747	573	550	-3.7818	1.15785654713922e-10	7254722	7342985	1.02628798379293e-22	10512616	10515697
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	12	-0.6194	1.02628798379293e-22	10512616	10515697	1.56222893340404e-06	10622062	11698871
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	13129843	208	200	-2.9423	1.56222893340404e-06	10622062	11698871	0.00801834093235543	13058512	13136828
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13158272	15	14	-4.3765	0.00801834093235543	13058512	13136828	0.00422814028262878	13150942	13213249
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13159901	13254711	26	26	-3.1865	0.00422814028262878	13150942	13213249	1.77146375172435e-05	13208776	13286708
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13256555	13596448	161	157	-4.1521	1.77146375172435e-05	13208776	13286708	0.000275665659820604	13562157	13633041
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13597813	13705594	16	15	-3.1131	0.000275665659820604	13562157	13633041	1.91309135615099e-07	13692518	13717328
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716000	13823928	28	27	-4.3838	1.91309135615099e-07	13692518	13717328	2.45699136501311e-14	13816133	13823928
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13828384	13863657	8	7	-2.1011	2.45699136501311e-14	13816133	13823928	4.57040463041553e-07	13863657	13870622
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13866668	14353244	158	154	-4.1465	4.57040463041553e-07	13863657	13870622	3.36792004037718e-10	14328579	14404284
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14354682	14700040	141	137	-3.2078	3.36792004037718e-10	14328579	14404284	2.13270724300746e-06	14546195	14731122
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14701706	15208612	130	126	-4.0297	2.13270724300746e-06	14546195	14731122	3.39865687539629e-05	15205160	15208612
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15209166	15222741	4	4	-1.51	3.39865687539629e-05	15205160	15208612	2.72688309284608e-06	15222741	15227049
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15223545	15523178	171	165	-4.1009	2.72688309284608e-06	15222741	15227049	1.76884359948795e-07	15519963	15524675
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15531144	5	5	-1.5657	1.76884359948795e-07	15519963	15524675	9.40730935736261e-06	15528826	15538983
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15532597	15915466	84	84	-4.1145	9.4073093573626e-06	15528826	15538983	9.48309134987815e-05	15765251	15982684
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16177411	104	101	-3.3642	9.48309134987815e-05	15765251	15982684	1.50767704176057e-07	16102267	16247995
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16178192	22157319	997	956	-4.0244	1.50767704176057e-07	16102267	16247995	2.27611737499519e-05	22049641	22165808
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22158616	22177335	8	8	-2.1256	2.27611737499519e-05	22049641	22165808	4.77357664635481e-07	22176501	22181855
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	25737663	95	87	-4.1765	4.77357664635481e-07	22176501	22181855	8.1844533735446e-59	23283689	26872527
MSK_252152916757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	57440809	84	76	-1.3873	8.1844533735446e-59	23283689	26872527	NA	NA	NA
