Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	12762774	4514	4386	0.0159	NA	NA	NA	3.15465394113776e-08	12760663	12789063
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12769521	12835156	6	5	-0.5984	3.15465394113776e-08	12760663	12789063	2.30772653698877e-08	12790795	12839991
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12839991	37687560	9466	9227	0.0146	2.30772653698877e-08	12790795	12839991	5.4338262358889e-10	37684878	37687560
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	37692387	37696203	3	3	-0.8442	5.4338262358889e-10	37684878	37687560	4.69789307711192e-10	37696203	37697870
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	37697870	72537426	13905	13552	7e-04	4.69789307711192e-10	37696203	37697870	4.73743599872109e-293	72537426	72537426
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	2.1134	4.73743599872109e-293	72537426	72537426	9.045977478423e-315	72579311	72579311
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	110014625	11701	11411	1e-04	9.045977478423e-315	72579311	72579311	4.13717583714706e-10	110011494	110023268
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110015739	110041712	6	6	-0.5772	4.13717583714706e-10	110011494	110023268	6.3854882445834e-10	110034542	110060587
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	116029725	2221	2171	0.0027	6.3854882445834e-10	110034542	110060587	2.28199609486950e-265	116029725	116029725
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116031670	116033402	2	2	-5.0464	2.2819960948695e-265	116029725	116029725	2.79306406862663e-267	116033402	116033402
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116035435	150839754	3630	3528	-0.0021	2.79306406862663e-267	116033402	116033402	1.69666361412161e-110	150839754	150839754
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150843192	2	0	NA	1.69666361412161e-110	150839754	150839754	NA	NA	NA
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150844444	150846148	2	2	-3.2511	NA	NA	NA	1.26675544379272e-116	150846148	150846148
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150847304	150848509	2	0	NA	1.26675544379272e-116	150846148	150846148	NA	NA	NA
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150851439	151026228	79	78	-0.0087	NA	NA	NA	0	151026228	151026228
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	-4.5788	0	151026228	151026228	0	151036435	151036435
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2612	0.0132	0	151036435	151036435	8.50286871691388e-102	157133150	157133150
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	3.2744	8.50286871691388e-102	157133150	157133150	1.39386149156865e-115	157136342	157136342
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	161099067	1621	1578	-0.0123	1.39386149156865e-115	157136342	157136342	2.32907567659648e-19	161099067	161099067
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161099582	161099582	1	0	NA	2.32907567659648e-19	161099067	161099067	NA	NA	NA
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161104752	161104791	2	2	-1.3745	NA	NA	NA	1.44325716969556e-21	161104791	161104791
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161108722	167483267	2484	2437	-0.0059	1.44325716969556e-21	161104791	161104791	4.37954982100462e-09	167477428	167493768
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167520743	9	9	0.42	4.37954982100462e-09	167477428	167493768	2.0918511308257e-08	167507898	167529221
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167523140	177595302	3987	3889	-0.0101	2.0918511308257e-08	167507898	167529221	1.40063834253051e-10	177593746	177595302
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	177596757	177599597	3	3	-0.84	1.40063834253051e-10	177593746	177595302	9.86994360157113e-11	177599597	177601540
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	177601540	200594055	7354	7169	4e-04	9.86994360157113e-11	177599597	177601540	5.9173383984516e-16	200580745	200616638
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200596027	200701140	39	39	-0.2822	5.9173383984516e-16	200580745	200616638	4.96683452560933e-15	200676505	200806319
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200787319	247186514	17410	17006	-0.0037	4.96683452560933e-15	200676505	200806319	NA	NA	NA
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	66357387	23294	22730	-0.0025	NA	NA	NA	5.49371344851676e-21	66357387	66357387
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	1.4282	5.49371344851676e-21	66357387	66357387	8.01650919869792e-21	66360747	66360747
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	106244482	10614	10372	0.0034	8.01650919869792e-21	66360747	66360747	1.39229014663238e-24	106244482	106244482
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106247167	106250718	2	2	-1.541	1.39229014663238e-24	106244482	106244482	2.87585658057151e-23	106250718	106250718
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106253229	112750646	1430	1397	-0.0048	2.87585658057151e-23	106250718	106250718	4.82581811953905e-08	112749123	112750646
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	112752277	112764889	4	4	0.6452	4.82581811953905e-08	112749123	112750646	1.78762175709894e-08	112764889	112768403
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	112768403	146571330	9728	9481	-0.0024	1.78762175709894e-08	112764889	112768403	3.54253548339628e-39	146571330	146571330
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	1.3463	3.54253548339628e-39	146571330	146571330	5.97596412229964e-40	146592775	146592775
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	203889616	18725	18306	-0.0045	5.97596412229964e-40	146592775	146592775	3.16997980076362e-17	203889616	203889616
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	203892886	203898334	4	3	-1.0428	3.16997980076362e-17	203889616	203889616	4.95447791392675e-18	203898334	203898334
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	203900226	212890878	3328	3245	-0.0028	4.95447791392675e-18	203898334	203898334	1.32251356048292e-20	212890878	212890878
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212892884	212898875	4	4	-0.9634	1.32251356048292e-20	212890878	212890878	2.99313354614111e-18	212898875	212898875
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212900857	242689978	10688	10435	-0.0011	2.99313354614111e-18	212898875	212898875	NA	NA	NA
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	191219222	62638	61141	-0.0026	NA	NA	NA	1.43686790337564e-44	191219222	191219222
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191221758	191222891	2	2	-2.0762	1.43686790337564e-44	191219222	191219222	1.36836354790608e-43	191222891	191222891
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191224191	194354505	1006	983	-0.0161	1.36836354790608e-43	191222891	191222891	2.1528039248127e-23	194354505	194354505
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	0.8283	2.1528039248127e-23	194354505	194354505	2.00898019156742e-20	194366950	194368145
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	198038358	1457	1418	-0.006	2.00898019156742e-20	194366950	194368145	3.38596676476104e-08	198036999	198038358
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198041362	198049128	5	4	0.6499	3.38596676476104e-08	198036999	198038358	5.24023987790574e-08	198049128	198052526
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198052526	199329592	518	510	0.0074	5.24023987790574e-08	198049128	198052526	NA	NA	NA
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	682752	214	210	-0.0113	NA	NA	NA	7.86311009681145e-11	682752	682752
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	685953	685953	1	0	NA	7.86311009681145e-11	682752	682752	NA	NA	NA
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	689619	691065	2	2	1.1061	NA	NA	NA	1.83810167265057e-12	691065	691065
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	693668	34445002	9347	9128	-2e-04	1.83810167265057e-12	691065	691065	5.6444916244296e-09	34433787	34445002
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	-0.5477	5.6444916244296e-09	34433787	34445002	3.64416870710746e-09	34491115	34509895
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	48407484	4555	4474	-0.0067	3.64416870710746e-09	34491115	34509895	3.76510665635872e-09	48407484	48407484
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	48414690	48415927	2	2	-0.943	3.76510665635872e-09	48407484	48407484	6.617400754061e-09	48415927	48418976
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	48418976	64376590	3224	3143	-0.0061	6.617400754061e-09	48415927	48418976	1.08042596138798e-34	64376590	64376590
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64381871	64390333	2	2	-1.8209	1.08042596138798e-34	64376590	64376590	2.42989679651602e-33	64390333	64390333
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64398986	68905670	1080	1044	-0.0072	2.42989679651602e-33	64390333	64390333	3.96600666413572e-40	68901210	69069651
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	0.7422	3.96600666413572e-40	68901210	69069651	6.53447915483785e-38	69163312	69643272
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	70150576	117	113	-0.0069	6.53447915483785e-38	69163312	69643272	1.12075818169915e-12	70150576	70150576
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70190682	70216707	4	3	-0.877	1.12075818169915e-12	70150576	70150576	3.99371189435096e-12	70216707	70294312
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70294312	119334954	16177	15787	-0.0035	3.99371189435096e-12	70216707	70294312	1.19753146071197e-15	119334954	119345371
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119345371	119348829	3	3	-0.9888	1.19753146071197e-15	119334954	119345371	1.11540098879225e-15	119346804	119348829
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119350354	173224400	14892	14530	-0.0071	1.11540098879225e-15	119346804	119348829	5.49148324219305e-10	173224400	173224400
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	0.9658	5.49148324219305e-10	173224400	173224400	1.23410122575794e-10	173228860	173228860
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173660684	193	189	-0.0032	1.23410122575794e-10	173228860	173228860	2.20361007291703e-73	173660684	173660684
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	2.5044	2.20361007291703e-73	173660684	173660684	2.47371309797427e-71	173666072	173666072
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	187330240	4081	3981	0	2.47371309797427e-71	173666072	173666072	1.37818193001521e-12	187330240	187330240
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187335827	3	3	0.8767	1.37818193001521e-12	187330240	187330240	1.67327542219044e-12	187335827	187338465
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187338465	191153613	1240	1203	-0.0117	1.67327542219044e-12	187335827	187338465	NA	NA	NA
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	127434789	35318	34471	-0.0061	NA	NA	NA	6.82799440346053e-191	127434789	127434789
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	127436376	127438118	2	2	-4.1567	6.82799440346053e-191	127434789	127434789	7.86084502342586e-178	127438118	127438118
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	127439603	178040439	17416	17033	0	7.86084502342586e-178	127438118	127438118	1.51093320664442e-10	178040439	178040439
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178044111	178045608	2	2	-1.0499	1.51093320664442e-10	178040439	178040439	7.05127671319618e-11	178045608	178045608
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178047480	180644810	1028	1005	0.0206	7.05127671319618e-11	178045608	178045608	NA	NA	NA
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	191387	38	37	-0.0133	NA	NA	NA	2.7343691954785e-13	176670	202063
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	198124	268978	33	32	0.3854	2.7343691954785e-13	176670	202063	1.80246582356309e-25	262928	276159
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	271851	17482872	6055	5904	0.0026	1.80246582356309e-25	262928	276159	1.06090846622331e-247	17482872	17482872
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	17486309	17488010	2	2	-4.703	1.06090846622331e-247	17482872	17482872	2.25416661151001e-228	17488010	17488010
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	17490237	26811016	3238	3150	-0.0081	2.25416661151001e-228	17488010	17488010	1.43283393792989e-07	26797255	26811016
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26849722	26861184	4	4	-0.6341	1.43283393792989e-07	26797255	26811016	3.29525111098629e-09	26861184	26863540
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26863540	29950805	1217	1184	0.0073	3.29525111098629e-09	26861184	26863540	3.27124065080168e-14	29939288	29962849
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	29995247	10	10	0.5084	3.27124065080168e-14	29939288	29962849	2.50579529492277e-09	29992946	30004636
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29998009	31390982	588	574	0.0239	2.50579529492277e-09	29992946	30004636	1.03693120513822e-07	31389372	31390982
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31393624	31418006	3	3	0.8277	1.03693120513822e-07	31389372	31390982	1.25225889223340e-09	31418006	31425113
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	32564884	491	481	0.0095	1.2522588922334e-09	31418006	31425113	1.40654492128617e-33	32548736	32654861
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32567462	32590568	3	0	NA	1.40654492128617e-33	32548736	32654861	NA	NA	NA
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32593151	32760574	60	58	-0.4917	NA	NA	NA	9.92407864065582e-68	32709263	32762061
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32762061	54035000	8247	8046	0.0024	9.92407864065582e-68	32709263	32762061	3.83338432933642e-233	54035000	54035000
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-3.881	3.83338432933642e-233	54035000	54035000	4.69590472938127e-259	54042734	54042734
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	74644381	5287	5160	-0.0044	4.69590472938127e-259	54042734	54042734	1.922807527896e-08	74641901	74644381
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74647491	74647491	1	0	NA	1.922807527896e-08	74641901	74644381	NA	NA	NA
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74650995	74653360	2	2	0.8821	NA	NA	NA	3.04225726405921e-07	74653360	74655219
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74655219	79018959	1142	1114	-0.0023	3.04225726405921e-07	74653360	74655219	5.44430894613929e-58	79018959	79018959
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-0.9624	5.44430894613929e-58	79018959	79018959	1.24291382537974e-64	79091850	79091850
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	103841482	6762	6616	-6e-04	1.24291382537974e-64	79091850	79091850	0	103841482	103841482
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-4.0652	0	103841482	103841482	0	103868154	103868154
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	139643729	12380	12100	-0.0051	0	103868154	103868154	7.30688210722043e-12	139643729	139643729
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139645417	139645417	1	0	NA	7.30688210722043e-12	139643729	139643729	NA	NA	NA
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139646582	139648318	2	2	-1.0638	NA	NA	NA	6.07723476787922e-11	139648318	139648318
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139651247	165643653	8723	8516	-0.0058	6.07723476787922e-11	139648318	139648318	3.32638726724912e-33	165643653	165643653
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.2709	3.32638726724912e-33	165643653	165643653	1.31916687921112e-31	165650610	165650610
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1773	-0.0056	1.31916687921112e-31	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	71894353	21787	21281	-0.0018	NA	NA	NA	1.20223339433343e-39	71894353	71894353
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71911940	71912065	2	2	-1.9683	1.20223339433343e-39	71894353	71894353	8.8214008886875e-41	71912065	71912065
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71914572	100164752	9273	9061	0.0013	8.8214008886875e-41	71912065	71912065	1.80425718195095e-12	100162851	100164752
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100166257	100174991	4	4	0.7864	1.80425718195095e-12	100162851	100164752	2.5189547754308e-12	100174991	100178968
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100178968	111727311	5037	4925	-1e-04	2.5189547754308e-12	100174991	100178968	5.96216781212245e-55	111727311	111727311
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	111729122	111746764	11	11	-0.9825	5.96216781212245e-55	111727311	111727311	1.37584520248470e-54	111746764	111746764
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	111751162	118611324	3151	3067	-0.0098	1.3758452024847e-54	111746764	111746764	6.555161714954e-286	118611324	118611324
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	-4.2492	6.555161714954e-286	118611324	118611324	1.37473801962888e-277	118620875	118620875
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	133433384	6827	6651	-0.0046	1.37473801962888e-277	118620875	118620875	0	133433384	133436265
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	-3.5936	0	133433384	133436265	0	133447868	133448277
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141410894	3700	3623	0.0046	0	133447868	133448277	7.80440464908501e-08	141405145	141417702
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141435643	12	12	0.3714	7.80440464908501e-08	141405145	141417702	4.10396329686953e-09	141431668	141443577
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141438504	141438504	1	0	NA	4.10396329686953e-09	141431668	141443577	NA	NA	NA
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	141690753	117	113	-0.0034	NA	NA	NA	2.93264153576925e-61	141690753	141698634
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	1.0623	2.93264153576925e-61	141690753	141698634	1.83165950236891e-44	141712786	141714168
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	141720303	1	0	NA	1.83165950236891e-44	141712786	141714168	NA	NA	NA
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720324	142152205	166	161	-0.0231	NA	NA	NA	8.74516440431969e-05	142129738	142152205
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142156165	142187097	9	9	0.3495	8.74516440431969e-05	142129738	142152205	4.37619376437299e-07	142187097	142196011
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142188727	142526341	147	146	-0.0226	4.37619376437299e-07	142187097	142196011	1.65374565582901e-113	142526341	142535936
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142535936	142602080	33	33	-0.9107	1.65374565582901e-113	142526341	142535936	2.03085718423012e-130	142600731	142602080
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142605735	158821263	6396	6250	-0.0055	2.03085718423012e-130	142600731	142602080	NA	NA	NA
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	7697025	2397	2356	-0.0118	NA	NA	NA	1.16452297362852e-08	7327293	7729311
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7709141	7824059	4	4	-0.673	1.16452297362852e-08	7327293	7729311	1.19642528904725e-08	7729311	8137794
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	25022606	5728	5598	-0.001	1.19642528904725e-08	7729311	8137794	1.80020533875286e-243	25022606	25030003
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	-4.0181	1.80020533875286e-243	25022606	25030003	3.45703374668910e-260	25034970	25039370
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	40892587	5442	5320	-0.0025	3.4570337466891e-260	25034970	25039370	2.72821837371520e-196	40892587	40892587
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-4.2218	2.7282183737152e-196	40892587	40892587	1.00281310982274e-190	40897469	40897469
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	146264846	30990	30251	-0.0035	1.00281310982274e-190	40897469	40897469	NA	NA	NA
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	28036840	9115	8925	-0.0075	NA	NA	NA	0	28036840	28036840
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	28039058	28040562	2	2	-5.7144	0	28036840	28036840	0	28040562	28040562
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	28041684	28445376	192	185	-0.0098	0	28040562	28040562	3.71522990544916e-13	28444040	28450438
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	28448080	28465880	9	9	0.5264	3.71522990544916e-13	28444040	28450438	1.18122458483492e-11	28462545	28468760
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	28467033	70926188	3754	3643	0.0072	1.18122458483492e-11	28462545	28468760	7.68608273780685e-43	70926188	70926188
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	2.0791	7.68608273780685e-43	70926188	70926188	2.66090247782979e-42	70930528	70930528
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	73133242	948	918	-0.0045	2.66090247782979e-42	70930528	70930528	6.28514561835817e-12	73131331	73133242
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	73135012	73139210	3	3	-0.9204	6.28514561835817e-12	73131331	73133242	1.24553074673199e-12	73139210	73139210
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	73140836	116116077	14514	14192	-0.0052	1.24553074673199e-12	73139210	73139210	1.72401061805647e-09	116111715	116116077
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116118907	116132839	6	6	-0.572	1.72401061805647e-09	116111715	116116077	1.09384136803825e-08	116132839	116141258
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116137111	116137111	1	0	NA	1.09384136803825e-08	116132839	116141258	NA	NA	NA
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116138267	140145683	9398	9154	0.0012	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	70949263	21675	21189	-0.0052	NA	NA	NA	9.65261364140073e-10	70945853	70949263
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70952973	70960187	4	3	-0.8169	9.65261364140073e-10	70945853	70949263	1.52718706756744e-09	70960187	70964344
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70964344	77917893	2913	2832	0.0012	1.52718706756744e-09	70960187	70964344	1.95832723945807e-07	77917870	77917893
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	0.7282	1.95832723945807e-07	77917870	77917893	2.44833285908367e-07	77928738	77936034
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	114100979	12392	12103	1e-04	2.44833285908367e-07	77928738	77936034	1.69662275556197e-16	114100979	114100979
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114103547	114106460	2	2	-1.3012	1.69662275556197e-16	114100979	114100979	6.4062861660812e-16	114106460	114106460
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114108041	135285645	7819	7626	-0.0058	6.4062861660812e-16	114106460	114106460	NA	NA	NA
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5741031	2138	2089	0.0068	NA	NA	NA	8.69710514496007e-35	5738494	5741031
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	15	-0.7258	8.69710514496007e-35	5738494	5741031	1.3219986656145e-40	5765438	5766615
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	18896166	5219	5072	-8e-04	1.3219986656145e-40	5765438	5766615	7.80034718200738e-31	18896166	18896166
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18906505	18917191	6	6	0.999	7.80034718200738e-31	18896166	18896166	1.30495193596916e-30	18917191	18917191
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18929375	55123719	9528	9310	-0.0018	1.30495193596916e-30	18917191	18917191	0	55123719	55123719
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55124730	55209626	38	38	-4.4038	0	55123719	55123719	0	55209626	55209626
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	66463477	4638	4540	0.0091	0	55209626	55209626	1.07142714793577e-17	66463477	66463477
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	1.3355	1.07142714793577e-17	66463477	66463477	5.56636234039067e-19	66469412	66469412
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	66663058	85	83	0.0182	5.56636234039067e-19	66469412	66469412	1.20055348155311e-12	66659030	66663058
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66665139	66673172	4	4	-0.7441	1.20055348155311e-12	66659030	66663058	1.31648170860823e-10	66673172	66675101
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66675101	134450318	23631	23037	-0.0043	1.31648170860823e-10	66673172	66675101	NA	NA	NA
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	7859302	3237	3148	-8e-04	NA	NA	NA	1.27755608344477e-10	7820543	7875061
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7859373	8013470	58	56	0.2055	1.27755608344477e-10	7820543	7875061	1.74001429069871e-14	8006268	8036400
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	8015452	10464018	790	768	-0.0222	1.74001429069871e-14	8006268	8036400	7.99164981294654e-15	10462211	10464018
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10465787	10485848	9	9	-0.5857	7.99164981294654e-15	10462211	10464018	2.86985046198155e-12	10485848	10493984
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10491341	11116883	235	227	-0.0184	2.86985046198155e-12	10485848	10493984	5.16675737488593e-113	11116883	11116883
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11126558	4	4	-3.1656	5.16675737488593e-113	11116883	11116883	0.0696799358141688	11123452	11126558
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11128557	11140421	3	2	-1.074	0.0696799358141688	11123452	11126558	1.46452204894281e-11	11140421	11140421
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	33178741	7585	7401	-0.0049	1.46452204894281e-11	11140421	11140421	2.18239294950435e-09	33178741	33178741
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33184017	33184017	1	0	NA	2.18239294950435e-09	33178741	33178741	NA	NA	NA
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33193255	33198331	2	2	-0.9744	NA	NA	NA	1.15224352353841e-09	33198331	33201796
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33201796	51088812	5368	5240	0.0033	1.15224352353841e-09	33198331	33201796	7.93636138521826e-40	51084654	51091147
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	51091147	51141498	26	26	0.5421	7.93636138521826e-40	51084654	51091147	2.43088579448604e-40	51137071	51147032
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	51142499	114613974	21186	20708	4e-04	2.43088579448604e-40	51137071	51147032	4.35984062933244e-11	114611101	114613974
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	114617816	114628521	4	4	-0.7441	4.35984062933244e-11	114611101	114613974	7.82522971631385e-11	114628521	114630162
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	114630162	132289090	6653	6478	0.0082	7.82522971631385e-11	114628521	114630162	NA	NA	NA
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	31428172	4884	4780	-0.0059	NA	NA	NA	5.72633930633505e-12	31428172	31428172
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	31431833	31436314	2	2	-1.115	5.72633930633505e-12	31428172	31428172	4.51569180386925e-14	31436314	31436314
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	31441218	34578806	1129	1106	-0.007	4.51569180386925e-14	31436314	31436314	8.83654733791977e-10	34572045	34584473
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	34580008	34613316	17	17	0.3144	8.83654733791977e-10	34572045	34584473	4.1102468255233e-09	34601014	34621870
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	34614409	49475817	5963	5816	-0.0051	4.1102468255233e-09	34601014	34621870	3.44376653060065e-08	49473507	49475817
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49477467	49478569	2	2	-0.8899	3.44376653060065e-08	49473507	49475817	5.08372068625823e-08	49478569	49483447
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49479966	49479966	1	0	NA	5.08372068625823e-08	49478569	49483447	NA	NA	NA
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49483447	49964838	221	215	-0.0136	NA	NA	NA	1.59493974624236e-45	49964838	49964838
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-2.0844	1.59493974624236e-45	49964838	49964838	5.43491150633626e-48	49971732	49971732
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	100690991	14859	14520	-6e-04	5.43491150633626e-48	49971732	49971732	9.6919621174523e-34	100690991	100690991
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	1.7527	9.6919621174523e-34	100690991	100690991	2.46283431587865e-31	100693892	100693892
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	113788788	4410	4298	-0.0095	2.46283431587865e-31	100693892	100693892	3.94830602955471e-09	113787620	113788788
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113791151	113794669	3	3	0.7848	3.94830602955471e-09	113787620	113788788	1.65185769366688e-07	113794669	113797828
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113797828	114123340	149	145	0.0124	1.65185769366688e-07	113794669	113797828	NA	NA	NA
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18544772	6	5	-1.082	NA	NA	NA	0.027491293350637	18508651	19287128
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	19494416	54	54	-0.6843	0.027491293350637	18508651	19287128	5.37022988675216e-146	19492531	19497023
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	34674458	5690	5546	0.0031	5.37022988675216e-146	19492531	19497023	7.7841241717612e-12	34674458	34674458
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	-0.8432	7.7841241717612e-12	34674458	34674458	3.8918615297593e-10	34683810	34685308
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	105597555	25889	25256	9e-04	3.8918615297593e-10	34683810	34685308	0	105597555	105597555
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	-2.4382	0	105597555	105597555	5.82511703935319e-148	105632168	105632168
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	106358491	231	226	-0.0114	5.82511703935319e-148	105632168	105632168	NA	NA	NA
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18692865	6	6	0.1464	NA	NA	NA	2.79418909804888e-15	18692865	18692865
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18741716	18882292	22	21	0.7886	2.79418909804888e-15	18692865	18692865	0.00413044001771654	18863056	19215372
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18884436	19537035	71	69	0.9942	0.00413044001771654	18863056	19215372	2.06584383533451e-11	19415360	19833542
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	20088256	57	55	0.6674	2.06584383533451e-11	19415360	19833542	9.8752128355159e-127	20065525	20308014
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	87401449	26225	25643	-7e-04	9.8752128355159e-127	20065525	20308014	1.4339405008751e-14	87401449	87401449
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	87403637	87409513	3	3	-0.9961	1.4339405008751e-14	87401449	87401449	1.8902448085701e-14	87409513	87409513
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	87412138	98232932	4024	3914	-1e-04	1.8902448085701e-14	87409513	87409513	5.05463033762304e-19	98232932	98232932
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98239454	3	3	1.1373	5.05463033762304e-19	98232932	98232932	6.86877566742699e-18	98239454	98239454
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	100298352	911	884	-0.0132	6.86877566742699e-18	98239454	98239454	NA	NA	NA
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	14876356	5468	5353	0.0051	NA	NA	NA	1.52588916437840e-07	14669740	14956177
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14956177	15029941	14	14	-0.3454	1.5258891643784e-07	14669740	14956177	2.89017212489664e-08	15028108	15042407
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15034210	28512937	4133	4044	0.014	2.89017212489664e-08	15028108	15042407	9.04415679591147e-11	28511295	28512937
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	28523145	28529948	4	4	0.7758	9.04415679591147e-11	28511295	28512937	2.3444052425977e-10	28529948	28536745
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	28536745	32379126	954	927	0.0296	2.3444052425977e-10	28529948	28536745	1.15766500473660e-32	31845232	32515876
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33559207	45	43	0.4363	1.1576650047366e-32	31845232	32515876	8.37483368964595e-42	33536526	33830585
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33647856	54352394	3078	3000	-0.0016	8.37483368964595e-42	33536526	33830585	5.54661165631939e-21	54348362	54363713
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54353978	54379839	10	10	-0.6498	5.54661165631939e-21	54348362	54363713	2.21396927914734e-17	54366535	54390060
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	57203733	1203	1174	0.0037	2.21396927914734e-17	54366535	54390060	6.85045391282396e-58	57203733	57203733
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	-2.5915	6.85045391282396e-58	57203733	57203733	1.99100166334215e-69	57206772	57206772
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	68534408	3375	3301	0.0091	1.99100166334215e-69	57206772	57206772	1.98372005037468e-15	68531989	68649801
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68606309	68838384	24	24	-0.3523	1.98372005037468e-15	68531989	68649801	2.11740862093954e-15	68744086	68850394
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68842364	72918129	1452	1412	0.0029	2.11740862093954e-15	68744086	68850394	1.76906045202826e-06	72915477	72929786
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72929786	72951581	3	3	-0.6526	1.76906045202826e-06	72915477	72929786	3.02204298349903e-06	72941901	72955519
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72955519	75093957	758	740	6e-04	3.02204298349903e-06	72941901	72955519	1.60301279090034e-16	75093957	75093957
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	-1.2853	1.60301279090034e-16	75093957	75093957	8.27558521734424e-17	75100865	75100865
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	592	-0.0075	8.27558521734424e-17	75100865	75100865	1.11161043398832e-50	76925748	76929598
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	7	1.1782	1.11161043398832e-50	76925748	76929598	1.07311955173240e-42	76938723	76940218
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4402	-0.0031	1.0731195517324e-42	76938723	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	407	0.0469	NA	NA	NA	2.75320243990544e-15	1028979	1028979
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.259	2.75320243990544e-15	1028979	1028979	3.80267099269952e-14	1030766	1030766
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	19438939	7202	7013	0.0167	3.80267099269952e-14	1030766	1030766	8.61231097179987e-40	19435553	19438939
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	19442291	19478144	11	11	-0.859	8.61231097179987e-40	19435553	19438939	1.82603617536576e-40	19478144	19486276
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	19486276	41519702	8256	8032	0.0102	1.82603617536576e-40	19478144	19486276	5.49443807577555e-49	41518222	41519702
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41566540	21	21	-0.6816	5.49443807577555e-49	41518222	41519702	3.62469555381622e-06	41553226	41574775
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41647135	37	35	-0.366	3.62469555381622e-06	41553226	41574775	6.6592010638295e-24	41636402	41700762
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41648545	78653545	13688	13345	0.0087	6.6592010638295e-24	41636402	41700762	NA	NA	NA
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22439	-0.0048	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	474	0.0242	NA	NA	NA	5.61690813588829e-09	1398325	1398325
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.0336	5.61690813588829e-09	1398325	1398325	6.45707205494686e-08	1400840	1400840
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	11448975	4678	4554	0.0241	6.45707205494686e-08	1400840	1400840	8.3478825625583e-07	11445761	11448975
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	0.9645	8.3478825625583e-07	11445761	11448975	8.77872458586188e-08	11452390	11453579
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	40540618	7519	7329	0.0105	8.77872458586188e-08	11452390	11453579	9.8363446384114e-118	40540618	40540618
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40543992	40553315	3	3	-2.9075	9.8363446384114e-118	40540618	40540618	1.12584193300810e-120	40553315	40553315
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40556205	52151943	4972	4820	0.0194	1.1258419330081e-120	40553315	40553315	1.06074295117452e-21	52151943	52151943
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	52152984	52155364	3	3	-1.2338	1.06074295117452e-21	52151943	52151943	1.77873078612326e-20	52155364	52155364
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	52158334	63788698	5388	5250	0.0148	1.77873078612326e-20	52155364	52155364	NA	NA	NA
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1511632	587	573	0.0011	NA	NA	NA	1.58731602986852e-134	1511632	1515948
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1515948	1531162	8	7	-2.2136	1.58731602986852e-134	1511632	1515948	2.53554194250768e-168	1528899	1531162
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	20495	-4e-04	2.53554194250768e-168	1528899	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13130	-0.0026	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	16521073	406	397	0.0146	NA	NA	NA	3.04772368085253e-12	16521073	16521073
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16523019	16524408	2	2	-1.1532	3.04772368085253e-12	16521073	16521073	1.43319662007119e-11	16524408	16524408
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16525922	21571489	2113	2065	0.0092	1.43319662007119e-11	16524408	16524408	1.49433054917650e-07	21570227	21571489
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21574577	21576859	3	3	0.7841	1.4943305491765e-07	21570227	21571489	5.64343120606573e-08	21576859	21579649
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21579649	22667608	459	451	0.0065	5.64343120606573e-08	21576859	21579649	1.75255899117652e-64	22667608	22679305
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	21	0.8632	1.75255899117652e-64	22667608	22679305	5.36822597786984e-68	22720195	22725305
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	49571068	13552	13204	0.0153	5.36822597786984e-68	22720195	22725305	NA	NA	NA
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	124528	29	29	0.0658	NA	NA	NA	5.94461618409202e-31	124528	124528
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	5	1.0099	5.94461618409202e-31	124528	124528	9.18255564368053e-19	130528	132689
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	849437	535	518	0.0459	9.18255564368053e-19	130528	132689	6.28384741032955e-07	843648	851066
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	851066	856655	6	6	0.5879	6.28384741032955e-07	843648	851066	5.65281240810524e-08	856619	860688
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	859452	859452	1	0	NA	5.65281240810524e-08	856619	860688	NA	NA	NA
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	859493	2671030	1189	1160	0.0232	NA	NA	NA	1.46920878030749e-07	2666368	2692498
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672401	2708291	28	27	-0.241	1.46920878030749e-07	2666368	2692498	7.00775339169694e-103	2708291	2711273
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	8450789	1790	1752	0.8732	7.00775339169694e-103	2708291	2711273	7.01743330830029e-09	8446489	8458058
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8452395	8465433	7	7	0.273	7.01743330830029e-09	8446489	8458058	6.53180890004535e-11	8459880	8475091
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8466917	110641084	29528	28825	0.9182	6.53180890004535e-11	8459880	8475091	5.35389489428181e-18	110633964	110641084
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	110646582	110718377	11	11	1.5679	5.35389489428181e-18	110633964	110641084	3.77246586666034e-18	110718377	110726401
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	110726401	154038318	13665	13318	0.9116	3.77246586666034e-18	110718377	110726401	9.33640914774038e-45	154038318	154038318
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154078819	11	11	1.9352	9.33640914774038e-45	154038318	154038318	2.59900134475292e-43	154078819	154078819
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154441943	89	86	0.9212	2.59900134475292e-43	154078819	154078819	1.35862554295660e-141	154441943	154441943
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154442377	154442377	1	0	NA	1.3586255429566e-141	154441943	154441943	NA	NA	NA
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	4	-2.2506	NA	NA	NA	5.16854390803961e-131	154450309	154450309
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	26	0.8968	5.16854390803961e-131	154450309	154450309	4.37171610696564e-97	154582414	154582414
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	196	-0.0109	4.37171610696564e-97	154582414	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	117	-3.5634	NA	NA	NA	4.75915835541328e-19	3034907	3772482
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3733715	1	0	NA	4.75915835541328e-19	3034907	3772482	NA	NA	NA
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-1.0289	NA	NA	NA	3.03187540009642e-13	5531459	6692482
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6953343	118	114	-3.4816	3.03187540009642e-13	5531459	6692482	4.7582820154309e-07	6922654	7006750
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6954864	7495687	185	182	-2.5791	4.7582820154309e-07	6922654	7006750	6.36050354809628e-07	7372772	7614571
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7709619	66	64	-3.6486	6.36050354809628e-07	7372772	7614571	0.000719573077324846	7666216	7784314
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	8010446	89	86	-2.8171	0.000719573077324846	7666216	7784314	4.11875956025734e-06	7926989	8073018
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8016395	8289709	63	56	-3.7864	4.11875956025734e-06	7926989	8073018	0.000142990097384695	8229100	8304781
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8292347	8347344	22	22	-2.722	0.000142990097384695	8229100	8304781	3.75028632503803e-06	8327467	8378918
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8348968	8538835	36	32	-3.8533	3.75028632503803e-06	8327467	8378918	3.60966392572177e-07	8524390	8546737
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8539855	8681965	50	50	-2.8495	3.60966392572177e-07	8524390	8546737	7.70717060540281e-06	8652693	8692156
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8683710	8725431	23	23	-3.8256	7.70717060540281e-06	8652693	8692156	0.0002995505209171	8714581	8744081
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8730690	8783087	19	19	-2.8477	0.0002995505209171	8714581	8744081	0.00339938908853607	8761847	8882995
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8786453	10515697	155	140	-3.7899	0.00339938908853607	8761847	8882995	6.29560962153679e-34	10513747	10535786
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	11673476	17	16	-0.5285	6.29560962153679e-34	10513747	10535786	1.53746446312677e-07	11249952	12518008
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	12978637	141	137	-2.5522	1.53746446312677e-07	11249952	12518008	8.04815383084302e-05	12925401	12982236
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12980114	13040293	26	26	-1.2615	8.04815383084302e-05	12925401	12982236	0.00031930595240279	13031576	13078432
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13041812	13128515	35	33	-2.417	0.00031930595240279	13031576	13078432	0.00112186980115696	13090512	13137597
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13153117	13	13	-3.8858	0.00112186980115696	13090512	13137597	0.018639508066355	13146483	13173328
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13153920	13261173	32	29	-2.7799	0.018639508066355	13146483	13173328	1.09058017080188e-06	13230706	13281871
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13262997	13649497	164	155	-3.7141	1.09058017080188e-06	13230706	13281871	0.000186263857911596	13591921	13649497
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13663517	13705594	10	5	-2.1152	0.000186263857911596	13591921	13649497	1.73515456364151e-08	13705594	13716000
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716000	13823928	28	28	-3.9773	1.73515456364151e-08	13705594	13716000	1.62444467422351e-09	13820955	13828384
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13828384	13863657	8	8	-2.2177	1.62444467422351e-09	13820955	13828384	8.56356974964748e-06	13863616	13870089
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13866668	14353244	158	152	-3.901	8.56356974964748e-06	13863616	13870089	2.71371283182623e-12	14342834	14353244
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14354682	14376942	12	12	-1.8888	2.71371283182623e-12	14342834	14353244	2.90854908201479e-15	14376942	14376942
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14377844	14390028	11	11	-4.3264	2.90854908201479e-15	14376942	14376942	4.90661354734688e-06	14388689	14409145
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14391767	14434038	19	18	-2.5669	4.90661354734688e-06	14388689	14409145	5.03849846239244e-05	14416385	14434038
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14434065	14449913	11	11	-4.0301	5.03849846239244e-05	14416385	14434038	1.08401295784540e-05	14449913	14459118
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14451317	14508021	39	37	-2.6777	1.0840129578454e-05	14449913	14459118	1.04911023764582e-10	14502379	14526446
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	1.04911023764582e-10	14502379	14526446	NA	NA	NA
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	24	-1.1855	NA	NA	NA	3.69539129284982e-13	14572190	14579298
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14598838	6	6	-3.8311	3.69539129284982e-13	14572190	14579298	2.98816882924454e-09	14598838	14598838
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14601309	14644293	4	4	-0.7115	2.98816882924454e-09	14598838	14598838	1.56533152760716e-11	14644293	14644293
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	14694578	8	8	-2.8283	1.56533152760716e-11	14644293	14644293	0.216035288276904	14691724	15124246
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14695441	15139441	95	91	-3.6474	0.216035288276904	14691724	15124246	1.43393866099793e-05	15089058	15179500
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15140278	15284717	81	77	-2.7723	1.43393866099793e-05	15089058	15179500	0.0110539539724861	15255162	15284717
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15286805	15291532	5	5	-4.6216	0.0110539539724861	15255162	15284717	1.18895874361799e-08	15291532	15291532
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15293299	15311814	13	12	-3.0814	1.18895874361799e-08	15291532	15291532	4.45281214881726e-23	15311814	15312994
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15312994	15339564	18	17	-4.7724	4.45281214881726e-23	15311814	15312994	0.000634805512209837	15335578	15362520
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15340715	15408015	43	41	-3.7582	0.000634805512209837	15335578	15362520	0.0204831708895373	15383973	15546378
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15409110	15682936	106	101	-3.0743	0.0204831708895373	15383973	15546378	0.00374422724672501	15549637	15750379
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15687088	15915466	38	37	-3.9406	0.00374422724672501	15549637	15750379	1.13117693009541e-08	15873423	15951430
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16177411	104	99	-2.5974	1.13117693009541e-08	15873423	15951430	0.000204732194148193	16088722	16198927
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16178192	16387273	58	57	-3.4003	0.000204732194148193	16088722	16198927	3.10131603463730e-07	16321288	16417108
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	16656177	38	37	-4.4865	3.1013160346373e-07	16321288	16417108	9.51085843137474e-06	16626771	16719600
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16659030	22139807	900	862	-3.5698	9.51085843137474e-06	16626771	16719600	4.15690801184876e-06	22049641	22139807
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.676	4.15690801184876e-06	22049641	22139807	1.89665459424552e-40	22177335	22177335
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22268552	29	29	-4.6309	1.89665459424552e-40	22177335	22177335	2.71782060200966e-05	22252446	22768795
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22308420	22877495	46	42	-3.6187	2.71782060200966e-05	22252446	22768795	0.105466125837687	22767553	22915679
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22878671	22930737	18	15	-4.4268	0.105466125837687	22767553	22915679	2.74424044780942e-19	22926726	26870361
MSK_252152916776_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	81	-1.23	2.74424044780942e-19	22926726	26870361	NA	NA	NA
