Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	1640562	211	194	0.0102	NA	NA	NA	4.38631487877689e-08	1637771	1640562
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	1652866	1669998	3	3	-0.7802	4.38631487877689e-08	1637771	1640562	4.65492440609385e-10	1669998	1673810
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	1673810	34869589	12680	11998	0.005	4.65492440609385e-10	1669998	1673810	1.28261625142577e-21	34869589	34869589
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34876833	34884849	5	5	-0.8696	1.28261625142577e-21	34869589	34869589	3.08476016619071e-22	34884849	34884849
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34886493	72537426	14995	14215	-0.0024	3.08476016619071e-22	34884849	34884849	2.77646289748011e-85	72537426	72537426
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	7	-1.4206	2.77646289748011e-85	72537426	72537426	7.61094507657716e-90	72579311	72579311
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	79364942	2277	2163	-0.0036	7.61094507657716e-90	72579311	72579311	4.21352789120468e-09	79364942	79364942
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	79369664	79373212	2	2	-0.862	4.21352789120468e-09	79364942	79364942	7.40388420133491e-09	79373212	79373212
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	79380417	103932025	7839	7402	-0.0014	7.40388420133491e-09	79373212	79373212	3.82463472606823e-23	103932025	103932025
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103956767	104012520	3	3	-1.1129	3.82463472606823e-23	103932025	103932025	1.87949872724214e-23	104012520	104012520
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	104108153	109373255	1285	1224	-0.002	1.87949872724214e-23	104012520	104012520	6.12258135761745e-15	109373255	109373255
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109374790	109376249	2	2	-1.0899	6.12258135761745e-15	109373255	109373255	1.67724501174939e-13	109376249	109376249
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109379566	113021083	1494	1420	-0.0061	1.67724501174939e-13	109376249	109376249	1.07155749836643e-10	113021083	113021083
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	113023629	113025181	2	2	-0.9756	1.07155749836643e-10	113021083	113021083	3.00643699508689e-11	113025181	113025181
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	113029072	113029072	1	0	NA	3.00643699508689e-11	113025181	113025181	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	113031469	113841017	271	257	0.0214	NA	NA	NA	1.55634056491911e-10	113838795	113841017
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	113847479	113848985	2	2	-0.9457	1.55634056491911e-10	113838795	113841017	6.53678241551572e-11	113848985	113848985
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	113850483	147306304	3085	2921	-0.0019	6.53678241551572e-11	113848985	113848985	7.77374228006258e-37	146297175	147329819
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147308557	147644831	36	34	-0.4213	7.77374228006258e-37	146297175	147329819	5.40330363294154e-39	147471665	148081741
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147847659	150819879	1257	1190	-0.0052	5.40330363294154e-39	147471665	148081741	9.26191152647532e-79	150819879	150819879
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	10	1.0513	9.26191152647532e-79	150819879	150819879	6.36959418877155e-70	150851439	150851439
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	194978218	16059	15228	-0.0039	6.36959418877155e-70	150851439	150851439	1.14389137006227e-31	194977713	194978218
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195065867	9	9	-0.7572	1.14389137006227e-31	194977713	194978218	7.51640124269069e-32	195065867	195091758
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	200602881	2160	2052	0.0013	7.51640124269069e-32	195065867	195091758	1.80531449526492e-13	200594055	200618814
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200609726	200673525	26	21	-0.3273	1.80531449526492e-13	200594055	200618814	9.90820869755582e-13	200654700	200683992
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200676505	247186514	17419	16508	-0.0042	9.90820869755582e-13	200654700	200683992	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	37810001	12909	12223	-0.0032	NA	NA	NA	1.26935884755341e-12	37789939	37815049
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37812045	37855837	22	21	0.3172	1.26935884755341e-12	37789939	37815049	1.45407983100482e-12	37852371	37863712
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	66357387	10363	9828	0.0018	1.45407983100482e-12	37852371	37863712	2.41763156108184e-21	66357387	66357387
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	1.3178	2.41763156108184e-21	66357387	66357387	3.28733935601814e-21	66360747	66360747
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	146571330	21778	20647	-4e-04	3.28733935601814e-21	66360747	66360747	2.73654898385958e-43	146571330	146571330
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	1.3177	2.73654898385958e-43	146571330	146571330	1.40962589566519e-44	146592775	146592775
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	212890878	22057	20913	-0.0023	1.40962589566519e-44	146592775	146592775	1.50569534500989e-25	212890878	212890878
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212892884	212898875	4	4	-1.0089	1.50569534500989e-25	212890878	212890878	7.48348678510337e-24	212898875	212898875
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212900857	242689978	10688	10159	7e-04	7.48348678510337e-24	212898875	212898875	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10261	-0.0074	NA	NA	NA	6.009212511193e-188	32074432	32074432
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	-3.8242	6.009212511193e-188	32074432	32074432	9.48260106660664e-186	32080848	32080848
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	84964575	18516	17495	-6e-04	9.48260106660664e-186	32080848	32080848	5.11217200765922e-54	84964575	84964575
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	84969962	84996380	9	9	-0.9783	5.11217200765922e-54	84964575	84964575	2.93317282526650e-45	84996380	84996380
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	85000587	85204973	75	73	0.0099	2.9331728252665e-45	84996380	84996380	2.85243103828692e-109	85204973	85204973
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	85206766	85254012	26	25	-0.9813	2.85243103828692e-109	85204973	85204973	2.53078292533399e-162	85254012	85254012
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	85257967	114656759	7123	6755	0.0043	2.53078292533399e-162	85254012	85254012	1.05466728949075e-18	114656759	114656759
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	114658236	114662219	3	3	-0.9761	1.05466728949075e-18	114656759	114656759	2.5488475572216e-17	114662219	114662219
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	114666302	133189686	7159	6779	-0.0065	2.5488475572216e-17	114662219	114662219	4.96766336864472e-10	133189686	133189686
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	0.9091	4.96766336864472e-10	133189686	133189686	6.53737242662077e-10	133194685	133194685
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	163992903	9777	9263	-3e-04	6.53737242662077e-10	133194685	133194685	3.33326645589404e-96	163992903	164001657
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164027724	8	8	1.3676	3.33326645589404e-96	163992903	164001657	0.0199934592161368	164001657	164036648
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	20	0.8878	0.0199934592161368	164001657	164036648	1.25277633187185e-99	164107951	164107951
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	194354505	10130	9559	0.0044	1.25277633187185e-99	164107951	164107951	0	194354505	194354505
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194358882	1	0	NA	0	194354505	194354505	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194360242	194366950	5	5	-3.9242	NA	NA	NA	0	194366950	194366950
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	199329592	1980	1866	-0.0035	0	194366950	194366950	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3213	0.0089	NA	NA	NA	0	9815760	9815760
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-3.7758	0	9815760	9815760	0	9842644	9842644
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	34445002	6167	5836	-0.0085	0	9842644	9842644	3.81065863095786e-12	34439897	34445002
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	5	-0.6245	3.81065863095786e-12	34439897	34445002	1.49450513879844e-11	34491115	34506297
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	119334954	25175	23829	-0.0045	1.49450513879844e-11	34491115	34506297	2.40920515911789e-11	119334954	119334954
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119345371	119346804	2	2	-0.9766	2.40920515911789e-11	119334954	119334954	9.58642055564424e-12	119346804	119346804
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119348829	119348829	1	0	NA	9.58642055564424e-12	119346804	119346804	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119350354	173659100	15086	14255	-0.0041	NA	NA	NA	2.4122514179019e-44	173659100	173659100
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173660684	173660684	1	0	NA	2.4122514179019e-44	173659100	173659100	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-1.8485	NA	NA	NA	7.02192935402766e-47	173666072	173666072
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	175857109	742	697	-0.0067	7.02192935402766e-47	173666072	173666072	2.30651604208830e-10	175857109	175857109
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175860235	175863396	3	3	0.7142	2.3065160420883e-10	175857109	175857109	9.21638179075914e-11	175863396	175866055
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175866055	176903791	256	241	-0.0079	9.21638179075914e-11	175863396	175866055	8.07105176127598e-20	176903791	176903791
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	176908147	176908147	1	0	NA	8.07105176127598e-20	176903791	176903791	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	176911203	176915658	3	3	-0.9785	NA	NA	NA	3.84481915028831e-17	176915658	176915658
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	176917193	191153613	4319	4085	0.0014	3.84481915028831e-17	176915658	176915658	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	730853	221	209	0.0023	NA	NA	NA	3.62620504272483e-05	724557	730853
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	737829	829954	7	7	0.4286	3.62620504272483e-05	724557	730853	4.25830415903738e-49	829954	829954
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	873365	2	2	-0.9497	4.25830415903738e-49	829954	829954	5.30541597253188e-11	873365	873365
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	905462	59521690	15973	15151	-0.0014	5.30541597253188e-11	873365	873365	2.99935825357711e-10	59521690	59521690
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59525396	59531344	3	2	-0.9191	2.99935825357711e-10	59521690	59521690	3.30739058768801e-10	59531344	59531344
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59535295	140201609	23873	22631	-0.003	3.30739058768801e-10	59531344	59531344	7.30756057337662e-12	140198797	140201609
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140203440	140219465	9	8	0.4879	7.30756057337662e-12	140198797	140201609	1.86923025687828e-11	140219465	140224323
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140221835	150181399	3766	3579	-0.0065	1.86923025687828e-11	140219465	140224323	1.50210529795765e-26	150181399	150181399
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150185190	150202601	7	7	-0.8008	1.50210529795765e-26	150181399	150181399	2.88032324038690e-27	150202601	150202601
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	179012917	9267	8793	0.0011	2.8803232403869e-27	150202601	150202601	2.87570249763534e-14	179012917	179012917
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	179018160	179019069	2	2	1.098	2.87570249763534e-14	179012917	179012917	4.97764469680159e-15	179019069	179019069
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	179023414	179429409	212	202	0.0062	4.97764469680159e-15	179019069	179019069	2.67005968226903e-09	179426090	179429409
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	179430821	179431937	2	2	0.8797	2.67005968226903e-09	179426090	179429409	2.37283896618525e-07	179431937	179433578
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	179433578	180644810	422	395	0.0281	2.37283896618525e-07	179431937	179433578	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	191387	38	37	-0.0316	NA	NA	NA	1.44351177361380e-19	186875	198124
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	198124	236535	16	14	0.5363	1.4435117736138e-19	186875	198124	0.0140546144457577	219639	262928
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	237952	268978	17	17	0.2994	0.0140546144457577	219639	262928	4.97095962821533e-13	259527	279694
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	271851	32548736	11605	10991	-0.0016	4.97095962821533e-13	259527	279694	2.08661554099565e-132	32548736	32590568
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32600962	10	8	-1.6756	2.08661554099565e-132	32548736	32590568	0.385327332255964	32563252	32628420
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	32633691	8	7	-0.7077	0.385327332255964	32563252	32628420	3.4018117696077e-20	32609525	32633691
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	79018959	14730	13991	-4e-04	3.4018117696077e-20	32609525	32633691	1.61361696314288e-60	79018959	79018959
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-0.8821	1.61361696314288e-60	79018959	79018959	7.68555629628201e-65	79091850	79091850
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	102039635	6272	5951	-9e-04	7.68555629628201e-65	79091850	79091850	3.99168360825485e-15	102039635	102039635
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102041299	102044331	3	3	-0.9013	3.99168360825485e-15	102039635	102039635	8.96613674214993e-15	102044331	102044331
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102046884	103841482	487	454	0.0141	8.96613674214993e-15	102044331	102044331	6.61389726206593e-19	103841482	103841482
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	0.9129	6.61389726206593e-19	103841482	103841482	5.71722869538069e-22	103868154	103868154
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	110498221	2256	2123	-0.0042	5.71722869538069e-22	103868154	103868154	5.2321714780216e-27	110498221	110498221
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	110503513	110520229	7	6	-0.8323	5.2321714780216e-27	110498221	110498221	2.08774472142534e-25	110520229	110521603
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	110521603	165643653	18843	17849	-0.0044	2.08774472142534e-25	110520229	110521603	9.14138992470504e-24	165643653	165643653
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	3	1.1293	9.14138992470504e-24	165643653	165643653	7.62859832194795e-22	165650610	165650610
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1722	-0.0049	7.62859832194795e-22	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	3575931	1254	1178	0.0072	NA	NA	NA	1.44767368490420e-15	3575931	3575931
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	3578428	3583854	4	4	-0.8474	1.4476736849042e-15	3575931	3575931	1.41217904918946e-17	3583854	3588903
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	3588903	38248761	12337	11706	-0.0016	1.41217904918946e-17	3583854	3588903	5.02779104162846e-11	38224748	38277728
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38251281	38378554	54	50	-0.1939	5.02779104162846e-11	38224748	38277728	2.05775938999439e-10	38330907	38403343
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38380333	118611324	25616	24248	-0.003	2.05775938999439e-10	38330907	38403343	1.41170312187572e-274	118611324	118611324
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	-3.8386	1.41170312187572e-274	118611324	118611324	3.42472343306810e-273	118620875	118620875
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	133433384	6827	6423	-0.0042	3.4247234330681e-273	118620875	118620875	0	133433384	133433384
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	-3.7531	0	133433384	133433384	0	133448277	133448277
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141410894	3700	3508	0.0021	0	133448277	133448277	0	141410894	141417702
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	13	-3.7482	0	141410894	141417702	1.31006699492819e-158	141438504	141440184
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141690753	116	110	0.0078	1.31006699492819e-158	141438504	141440184	0	141690753	141690753
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141709835	7	7	-4.2074	0	141690753	141690753	2.06303446888519e-272	141709835	141709835
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141711513	141711513	1	0	NA	2.06303446888519e-272	141709835	141709835	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141712786	142166710	173	160	-0.0605	NA	NA	NA	4.95246954955961e-21	142166710	142166710
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142167901	142167908	2	2	-2.2872	4.95246954955961e-21	142166710	142166710	9.35219059570096e-59	142167908	142167908
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142176074	158821263	6579	6229	-0.0027	9.35219059570096e-59	142167908	142167908	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	117	0.0045	NA	NA	NA	4.75327292563953e-59	581533	581533
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	2.5143	4.75327292563953e-59	581533	581533	1.47906918382389e-82	588865	588865
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	6651407	2175	2064	5e-04	1.47906918382389e-82	588865	588865	1.71535893955809e-66	6651407	6651407
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	6653191	6675709	12	12	-0.9243	1.71535893955809e-66	6651407	6651407	5.86583554273529e-62	6675709	6675709
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	6677318	16480904	3017	2859	-0.0038	5.86583554273529e-62	6675709	6675709	5.29769959159983e-69	16480904	16480904
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	16490177	16569810	13	12	-0.9734	5.29769959159983e-69	16480904	16480904	2.09774307711029e-70	16569810	16569810
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	16580941	25022606	2791	2636	-0.0025	2.09774307711029e-70	16569810	16569810	5.86826735245738e-17	25022606	25022606
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	0.9622	5.86826735245738e-17	25022606	25022606	1.01405127352132e-17	25039370	25039370
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	39350798	4942	4670	-0.0036	1.01405127352132e-17	25039370	25039370	9.87820264238856e-277	39350798	39350798
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	55	0.8798	9.87820264238856e-277	39350798	39350798	2.00396909991799e-251	39505256	39505256
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	51191560	2179	2076	-0.0104	2.00396909991799e-251	39505256	39505256	2.85117430566490e-17	51191560	51191560
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51193977	51200291	4	4	-0.8746	2.8511743056649e-17	51191560	51191560	2.64344498483673e-19	51200291	51200291
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51202490	51202490	1	0	NA	2.64344498483673e-19	51200291	51200291	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51204788	131916458	24709	23403	-0.0048	NA	NA	NA	1.24406969545227e-14	131916458	131916458
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	131919337	131921399	2	2	1.074	1.24406969545227e-14	131916458	131916458	3.205877991016e-12	131921399	131921399
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	131923149	146264846	4538	4293	0.004	3.205877991016e-12	131921399	131921399	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	2135333	760	716	-0.0039	NA	NA	NA	4.8848428045639e-09	2133384	2135333
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	2138129	2139868	2	2	-0.8887	4.8848428045639e-09	2133384	2135333	6.66361304402059e-10	2139868	2139868
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	2143843	23338535	7237	6849	-0.0032	6.66361304402059e-10	2139868	2139868	2.03482585496235e-20	23338535	23338535
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23343915	23365926	4	4	0.8813	2.03482585496235e-20	23338535	23338535	3.94826308153264e-18	23365926	23365926
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	70926188	5069	4777	0.0018	3.94826308153264e-18	23365926	23365926	8.89640332084801e-159	70926188	70926188
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-3.6181	8.89640332084801e-159	70926188	70926188	1.31945119027535e-169	70930528	70930528
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	70935055	1	0	NA	1.31945119027535e-169	70930528	70930528	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70939069	87659812	5571	5287	-0.0091	NA	NA	NA	6.23283730694497e-16	87659812	87659812
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	87662292	87665732	3	3	-0.9295	6.23283730694497e-16	87659812	87659812	4.36835192481166e-15	87665732	87665732
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	87668290	116118907	9891	9392	-0.0034	4.36835192481166e-15	87665732	87665732	9.29019364524606e-15	116118907	116122595
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116122595	116130333	4	4	-0.7975	9.29019364524606e-15	116118907	116122595	2.04579913791589e-14	116126105	116132839
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	137352394	8295	7837	-8e-04	2.04579913791589e-14	116126105	116132839	3.42250747331026e-08	137352394	137352394
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	0.8626	3.42250747331026e-08	137352394	137352394	6.82028317792228e-07	137356880	137359947
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1038	0.0012	6.82028317792228e-07	137356880	137359947	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9202	-0.0081	NA	NA	NA	3.15698166601382e-22	27038538	27038538
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	1.3325	3.15698166601382e-22	27038538	27038538	3.41071656293076e-22	27041812	27041812
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	31284926	1561	1482	-0.0129	3.41071656293076e-22	27041812	27041812	7.8104648772059e-11	31284926	31284926
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31287101	31291525	3	3	0.7627	7.8104648772059e-11	31284926	31284926	3.10311002244828e-10	31291525	31293140
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31293140	94063000	18305	17293	-0.0053	3.10311002244828e-10	31291525	31293140	1.35483699704054e-279	94059385	94065060
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	94065060	94444636	147	141	0.5603	1.35483699704054e-279	94059385	94065060	4.11138646614525e-266	94442409	94447540
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	94447540	114100979	7240	6846	0.0016	4.11138646614525e-266	94442409	94447540	1.27282476364306e-67	114100979	114100979
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114103547	114106460	2	2	-2.3498	1.27282476364306e-67	114100979	114100979	8.86170576399452e-65	114106460	114106460
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114108041	114108041	1	0	NA	8.86170576399452e-65	114106460	114106460	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114109303	135285645	7818	7406	-0.0045	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	66463477	21582	20449	0.002	NA	NA	NA	6.85488456889886e-75	66463477	66463477
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	-2.4728	6.85488456889886e-75	66463477	66463477	2.57953779503313e-75	66469412	66469412
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	106733851	13398	12652	-0.0022	2.57953779503313e-75	66469412	66469412	0	106733851	106733851
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106744337	106747920	4	4	-4.6558	0	106733851	106733851	0	106747920	106747920
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106754784	134450318	10318	9755	-0.0027	0	106747920	106747920	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	736988	296	281	0.0134	NA	NA	NA	0	736988	736988
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	738240	743223	4	4	-4.4211	0	736988	736988	0	743223	743223
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	745410	7897538	2951	2791	-0.0065	0	743223	743223	7.28251087000754e-13	7876756	7915879
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7899058	7981679	34	32	0.2654	7.28251087000754e-13	7876756	7915879	3.40970436024679e-15	7973198	8005058
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7985677	9516067	456	430	-0.009	3.40970436024679e-15	7973198	8005058	1.82581681621676e-09	9423653	9523923
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9523923	9607363	16	15	-0.3161	1.82581681621676e-09	9423653	9523923	7.38691106960386e-08	9604633	9630105
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9610054	10464018	328	306	-0.0223	7.38691106960386e-08	9604633	9630105	3.06112213212568e-17	10459455	10464018
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10465787	10485848	9	9	-0.5783	3.06112213212568e-17	10459455	10464018	4.42711968867068e-18	10485848	10491341
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10491341	98517420	28462	26955	-0.0034	4.42711968867068e-18	10485848	10491341	7.58529943400821e-26	98517420	98517420
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	98519108	98532494	6	6	-0.8388	7.58529943400821e-26	98517420	98517420	6.19918070599153e-25	98532494	98532494
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	98535730	130694393	11953	11331	0.0014	6.19918070599153e-25	98532494	98532494	5.55222412367377e-12	130694393	130694393
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	1.0262	5.55222412367377e-12	130694393	130694393	1.21689435741003e-10	130701040	130701040
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	130830689	51	48	-0.0034	1.21689435741003e-10	130701040	130701040	0.000308288370001522	130821689	130837742
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130832307	130850075	8	8	-0.3388	0.000308288370001522	130821689	130837742	2.74390370961734e-05	130841123	130862312
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130851705	132289090	585	551	9e-04	2.74390370961734e-05	130841123	130862312	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	36969571	7039	6681	-0.0054	NA	NA	NA	5.57017969476159e-273	36969571	36969571
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36976441	36982877	2	2	-4.6936	5.57017969476159e-273	36969571	36969571	8.09685984276979e-291	36982877	36982877
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36989091	56650373	6984	6597	-0.0026	8.09685984276979e-291	36982877	36982877	2.14645566031699e-52	56650373	56657371
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56681665	14	14	0.7556	2.14645566031699e-52	56650373	56657371	1.9855517828217e-53	56680346	56681665
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56685341	68142120	2695	2548	0.0029	1.9855517828217e-53	56680346	56681665	1.46336830377696e-59	68142120	68142120
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68144264	68163523	10	9	-0.985	1.46336830377696e-59	68142120	68142120	5.58525696132595e-57	68163523	68163523
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68167758	97327189	8737	8292	0	5.58525696132595e-57	68163523	68163523	1.33301459619818e-08	97327189	97327189
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	97329413	97330568	2	2	-0.8388	1.33301459619818e-08	97327189	97327189	1.92812257800783e-08	97330568	97331794
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	97331794	100690991	1597	1506	-0.0071	1.92812257800783e-08	97330568	97331794	6.626245316727e-41	100690991	100690991
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	1.784	6.626245316727e-41	100690991	100690991	6.28788117934033e-40	100693892	100693892
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4304	-0.0039	6.28788117934033e-40	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18544772	6	5	0.0018	NA	NA	NA	7.68560699806368e-12	18544772	18798641
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	19494416	54	52	-0.7175	7.68560699806368e-12	18544772	18798641	1.62438067863948e-170	19492531	19497023
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	73061942	19359	18327	-0.0034	1.62438067863948e-170	19492531	19497023	2.22206164689359e-38	73061942	73061942
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73092112	8	7	0.9265	2.22206164689359e-38	73061942	73061942	7.2527636293597e-37	73092112	73092112
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	91679319	6803	6416	-0.0017	7.2527636293597e-37	73092112	73092112	6.93043602109672e-10	91678213	91679319
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	91681100	91683443	2	2	-0.9217	6.93043602109672e-10	91678213	91679319	3.87537418226150e-09	91683443	91683443
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	91684949	105787390	5443	5153	0.0013	3.8753741822615e-09	91683443	91683443	1.62728051160373e-27	105787390	105787390
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105788623	105798116	6	6	-0.9039	1.62728051160373e-27	105787390	105787390	6.12425977218949e-18	105798116	105799261
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105799261	105948347	45	43	-0.0214	6.12425977218949e-18	105798116	105799261	3.22539359624106e-18	105946993	105951399
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105951399	105989160	13	11	-0.7547	3.22539359624106e-18	105946993	105951399	9.85053406484636e-20	105985458	105994646
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105994646	106216726	93	87	0.003	9.85053406484636e-20	105985458	105994646	6.78143973972828e-22	106214372	106218059
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106218059	106253648	17	17	0.6213	6.78143973972828e-22	106214372	106218059	6.89523633166243e-21	106252126	106256498
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106255190	106355517	35	32	0.0225	6.89523633166243e-21	106252126	106256498	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106358491	106358491	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	19835471	107	107	-0.0322	NA	NA	NA	1.39491402687826e-09	19822150	19839695
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19839695	19882711	6	6	0.614	1.39491402687826e-09	19822150	19839695	1.23600346312927e-06	19874677	19910696
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19910696	19985258	16	15	0.0573	1.23600346312927e-06	19874677	19910696	0.00106735537496240	19968127	19985258
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19986234	19992790	5	5	0.4009	0.0010673553749624	19968127	19985258	1.85877074735881e-05	19992790	20003276
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19996210	21982746	344	321	-0.0332	1.85877074735881e-05	19992790	20003276	3.500259086193e-41	21982746	21996787
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	21996787	22038880	3	3	-1.8348	3.500259086193e-41	21982746	21996787	3.97519077908536e-54	22021181	22038880
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	22138119	32456500	3346	3169	-0.0116	3.97519077908536e-54	22021181	22038880	1.967312339419e-89	32454294	32514939
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32514939	32594200	25	25	-0.8107	1.967312339419e-89	32454294	32514939	5.05735366111582e-28	32594200	32594200
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32661846	32661846	1	0	NA	5.05735366111582e-28	32594200	32594200	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32664506	32714483	18	18	0.0558	NA	NA	NA	7.67901875403955e-21	32714483	32721469
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32721469	32762005	8	8	-0.896	7.67901875403955e-21	32714483	32721469	7.39375711316097e-39	32755468	32762005
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32772265	98232932	26529	25141	-0.0033	7.39375711316097e-39	32755468	32762005	3.04824358632401e-16	98232932	98232932
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98239454	3	3	0.9543	3.04824358632401e-16	98232932	98232932	5.40633689171334e-17	98239454	98239454
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	99632987	637	601	-0.003	5.40633689171334e-17	98239454	98239454	3.69513852544237e-27	99632987	99632987
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.472	3.69513852544237e-27	99632987	99632987	2.04640357057374e-22	99635701	99635701
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	256	0.0153	2.04640357057374e-22	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	12277572	4665	4442	0.0065	NA	NA	NA	1.08743753704962e-09	12275406	12277572
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	12278826	12280486	2	2	-0.9679	1.08743753704962e-09	12275406	12277572	1.09292276306164e-10	12280486	12280486
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	12282105	32379126	5906	5578	0.0014	1.09292276306164e-10	12280486	12280486	1.00479100354122e-49	31854794	32513457
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33559207	45	43	0.444	1.00479100354122e-49	31854794	32513457	1.5692364510619e-49	33533440	33841331
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33647856	54352394	3078	2911	0.0014	1.5692364510619e-49	33533440	33841331	3.22864964585533e-17	54348362	54366535
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54353978	54390060	11	11	-0.5206	3.22864964585533e-17	54348362	54366535	7.37806754517268e-06	54379834	54390060
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54399890	54408446	5	5	0.5402	7.37806754517268e-06	54379834	54390060	2.30643936283416e-08	54402057	54424734
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54410800	75093957	6811	6407	0.0058	2.30643936283416e-08	54402057	54424734	2.59908367432857e-25	75093957	75093957
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	-1.4312	2.59908367432857e-25	75093957	75093957	7.27016436602571e-23	75100865	75100865
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76923844	609	582	-0.0021	7.27016436602571e-23	75100865	75100865	1.13170520271473e-220	76923844	76923844
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76925748	76925748	1	0	NA	1.13170520271473e-220	76923844	76923844	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	2.1689	NA	NA	NA	3.11626488737336e-211	76940218	76940218
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4261	-6e-04	3.11626488737336e-211	76940218	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	36673853	13871	13071	0.0046	NA	NA	NA	8.82550655111914e-194	36673853	36673853
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	5	2.5551	8.82550655111914e-194	36673853	36673853	1.05016121566776e-190	36684619	36684619
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	78653545	15757	14872	0.0035	1.05016121566776e-190	36684619	36684619	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	65357415	19766	18703	-0.0041	NA	NA	NA	8.34050378262801e-21	65356061	65357415
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	65359770	65369843	5	5	-0.8209	8.34050378262801e-21	65356061	65357415	1.94241467571956e-20	65369843	65369843
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	65371927	65371927	1	0	NA	1.94241467571956e-20	65369843	65369843	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	65373462	76116026	3192	3038	0.0013	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	210395	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	216768	1398325	491	460	0.0275	NA	NA	NA	6.61020699881252e-24	1398325	1398325
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.5051	6.61020699881252e-24	1398325	1398325	1.62827955544535e-22	1400840	1400840
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	11448975	4678	4430	0.0067	1.62827955544535e-22	1400840	1400840	1.80282644240443e-13	11448975	11448975
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.1763	1.80282644240443e-13	11448975	11448975	5.9083959230246e-15	11452390	11452390
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	19694025	3853	3649	0.0023	5.9083959230246e-15	11452390	11452390	2.79339063763093e-274	19694025	19694025
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19699024	19700620	3	3	-4.0334	2.79339063763093e-274	19694025	19694025	1.10979923451075e-218	19700620	19700620
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19702214	20399700	186	176	-0.0124	1.10979923451075e-218	19700620	19700620	4.0949599281813e-44	20386500	20399700
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20420327	20493401	15	13	-0.8631	4.0949599281813e-44	20386500	20399700	1.90158269251141e-58	20493401	20493401
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20507235	40540618	3462	3300	-0.0016	1.90158269251141e-58	20493401	20493401	7.49281907439906e-239	40540618	40540618
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40543992	40553315	3	3	-3.6	7.49281907439906e-239	40540618	40540618	3.54259844285955e-231	40553315	40553315
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40556205	40556205	1	0	NA	3.54259844285955e-231	40553315	40553315	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40557697	55769042	6658	6285	0.0057	NA	NA	NA	3.58140031730223e-09	55761892	55787676
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55770195	55803449	13	12	-0.3673	3.58140031730223e-09	55761892	55787676	2.19976544121629e-08	55778849	55824192
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55819553	55819553	1	0	NA	2.19976544121629e-08	55778849	55824192	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55820551	58419952	1196	1149	-0.0066	NA	NA	NA	1.41662082890365e-41	58419952	58419952
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58422039	58438969	10	9	-0.8974	1.41662082890365e-41	58419952	58419952	9.81078930918014e-41	58438969	58438969
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58444441	63788698	2484	2339	-0.0019	9.81078930918014e-41	58438969	58438969	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	551	-0.0035	NA	NA	NA	6.30801588160218e-125	1506379	1506379
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	9	1.5579	6.30801588160218e-125	1506379	1506379	1.43652288487315e-128	1532433	1532433
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	19846	-0.0027	1.43652288487315e-128	1532433	1532433	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12756	-0.0019	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	16521073	405	383	-0.0011	NA	NA	NA	1.03549433017118e-12	16521073	16521073
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16523019	16524408	2	2	-1.0759	1.03549433017118e-12	16521073	16521073	1.95250080364746e-12	16524408	16524408
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16525922	22667608	2575	2441	-0.0021	1.95250080364746e-12	16524408	16524408	9.13817961096545e-76	22667608	22679305
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	20	0.8276	9.13817961096545e-76	22667608	22679305	6.8128929002112e-80	22720195	22725305
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	35472378	6547	6180	0.0057	6.8128929002112e-80	22720195	22725305	4.79329583213805e-42	35472378	35472378
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	1.8919	4.79329583213805e-42	35472378	35472378	7.25244302348318e-38	35476942	35476942
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	35478503	1	0	NA	7.25244302348318e-38	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35479767	48705025	6626	6229	0.0081	NA	NA	NA	2.85118233662773e-14	48705025	48705025
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48706108	48708883	3	3	0.9658	2.85118233662773e-14	48705025	48705025	4.98504245341457e-14	48708883	48708883
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48711031	49571068	373	350	-0.0145	4.98504245341457e-14	48708883	48708883	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	104732	13	11	-0.202	NA	NA	NA	0.0211811662277761	3237	115195
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	266212	114	108	0.0201	0.0211811662277761	3237	115195	1.42945558960605e-12	264886	266212
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	267060	267079	2	2	1.0086	1.42945558960605e-12	264886	266212	5.27327803363999e-10	267079	267079
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	268402	698519	338	319	0.0246	5.27327803363999e-10	267079	267079	2.13288287329934e-57	697799	704996
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	701079	747837	33	33	-0.6876	2.13288287329934e-57	697799	704996	2.24553513198583e-26	742385	748909
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	748909	845758	67	65	0.0499	2.24553513198583e-26	742385	748909	2.56871119134042e-09	843648	849437
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	848806	856655	8	8	0.5297	2.56871119134042e-09	843648	849437	2.30317568980994e-11	853836	860688
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	859452	859452	1	0	NA	2.30317568980994e-11	853836	860688	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	859493	1397449	184	173	0.0343	NA	NA	NA	7.16663023758581e-37	1397449	1397449
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1401362	1402317	2	2	1.7737	7.16663023758581e-37	1397449	1397449	1.52147156668744e-31	1402317	1402317
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1403541	2672401	1004	958	0.0039	1.52147156668744e-31	1402317	1402317	2.93603523220193e-08	2667268	2695951
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672477	2708291	27	24	-0.2697	2.93603523220193e-08	2667268	2695951	3.2442765600283e-106	2708291	2711273
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	8432497	1781	1678	0.8543	3.2442765600283e-106	2708291	2711273	5.11184544722278e-15	8417817	8446489
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8437023	8466917	17	17	0.4241	5.11184544722278e-15	8417817	8446489	6.58161005737161e-17	8458058	8481280
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8473482	8473482	1	0	NA	6.58161005737161e-17	8458058	8481280	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8475091	103129950	26647	25136	0.9002	NA	NA	NA	1.37510141006853e-31	103129734	103145335
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	103145335	103191693	20	19	1.5079	1.37510141006853e-31	103129734	103145335	2.9129913437282e-31	103189107	103224094
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	103224094	154038318	16535	15674	0.8977	2.9129913437282e-31	103189107	103224094	4.14732896684297e-47	154038318	154038318
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154078819	11	11	1.8779	4.14732896684297e-47	154038318	154038318	2.15542919501582e-43	154078819	154078819
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154442377	90	85	0.8714	2.15542919501582e-43	154078819	154078819	1.52197438058383e-240	154442377	154442377
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	4	-3.0623	1.52197438058383e-240	154442377	154442377	4.54547722660625e-273	154450309	154450309
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	28	0.8652	4.54547722660625e-273	154450309	154450309	1.00801703579030e-128	154582414	154582414
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	191	-0.0201	1.0080170357903e-128	154582414	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	118	-3.8928	NA	NA	NA	4.93006854918951e-22	3034907	3772482
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3733715	1	0	NA	4.93006854918951e-22	3034907	3772482	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-1.0253	NA	NA	NA	2.24498624136849e-13	5531459	6688691
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6953343	118	108	-3.6961	2.24498624136849e-13	5531459	6688691	1.30786743256814e-07	6926956	6998513
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6954864	7495687	185	174	-2.6746	1.30786743256814e-07	6926956	6998513	1.12069182049986e-08	7418921	7605311
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7709619	66	64	-3.9962	1.12069182049986e-08	7418921	7605311	2.76583483327468e-06	7686527	7733351
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	8005148	88	83	-2.8394	2.76583483327468e-06	7686527	7733351	4.01993347483074e-11	7951683	8048263
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8010446	8289709	64	61	-4.2343	4.01993347483074e-11	7951683	8048263	4.53582039810924e-12	8277707	8289709
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8292347	8313045	10	9	-1.543	4.53582039810924e-12	8277707	8289709	5.9588553085754e-07	8308608	8324328
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8316416	8414160	21	18	-3.4188	5.9588553085754e-07	8308608	8324328	0.0134501770261362	8347344	8414160
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8427047	8463583	9	6	-2.1867	0.0134501770261362	8347344	8414160	3.00728334623439e-07	8463583	8463583
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8474062	8543430	22	22	-4.238	3.00728334623439e-07	8463583	8463583	4.52077892441657e-10	8538835	8547778
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8544417	8697715	56	54	-2.9278	4.52077892441657e-10	8538835	8547778	1.98261016115654e-09	8690572	8740566
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8698878	10513747	186	172	-3.9843	1.98261016115654e-09	8690572	8740566	5.19608322393102e-32	10512616	10515697
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	11698871	19	18	-0.7449	5.19608322393102e-32	10512616	10515697	2.76365790723088e-20	11673476	11698871
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12536761	10	9	-4.6259	2.76365790723088e-20	11673476	11698871	0.000135721563478714	12533900	12559410
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12537944	12978637	130	122	-2.5446	0.000135721563478714	12533900	12559410	0.0021941754461286	12845704	13019119
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12980114	13129843	62	60	-1.7609	0.0021941754461286	12845704	13019119	5.97505079063007e-12	13112411	13146483
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13262997	45	44	-3.3392	5.97505079063007e-12	13112411	13146483	0.0137069372273046	13151875	13379797
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13264329	13649497	163	149	-3.895	0.0137069372273046	13151875	13379797	2.52984819296686e-05	13591921	13663517
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13663517	13705594	10	8	-2.3766	2.52984819296686e-05	13591921	13663517	4.50249666918442e-18	13701755	13716000
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716000	13823928	28	26	-4.2964	4.50249666918442e-18	13701755	13716000	8.91936183444922e-21	13816133	13823928
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13828384	13863657	8	7	-2.1025	8.91936183444922e-21	13816133	13823928	1.30116765133604e-06	13863616	13870089
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13866668	14352278	157	150	-4.1254	1.30116765133604e-06	13863616	13870089	3.36951683833701e-05	14260254	14379418
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14353244	14449913	54	51	-3.3478	3.36951683833701e-05	14260254	14379418	0.133175446647479	14361297	14498784
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14451317	14508021	39	38	-2.8798	0.133175446647479	14361297	14498784	2.20799279002658e-09	14502379	14536962
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	2.20799279002658e-09	14502379	14536962	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	22	-1.2006	NA	NA	NA	3.53599438611992e-12	14572190	14579298
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14598838	6	6	-4.5551	3.53599438611992e-12	14572190	14579298	2.6055107850779e-28	14598838	14598838
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14601309	14644293	4	4	-0.5751	2.6055107850779e-28	14598838	14598838	1.094568927592e-12	14644293	14681738
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	14700040	13	13	-2.7437	1.094568927592e-12	14644293	14681738	3.40653774276489e-08	14700040	14703568
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14701706	14727064	15	15	-4.0762	3.40653774276489e-08	14700040	14703568	0.00116142962985063	14712496	14727064
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14729413	14729413	1	0	NA	0.00116142962985063	14712496	14727064	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14731122	14744771	6	5	-2.8696	NA	NA	NA	1.86481563255980e-09	14744771	14744771
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14747796	14883615	21	19	-4.3974	1.8648156325598e-09	14744771	14744771	2.11093603886992e-19	14883615	14883615
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14894476	14909937	4	4	-1.9476	2.11093603886992e-19	14883615	14883615	9.38784296262912e-18	14909937	14909937
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14913412	14937488	5	5	-4.7687	9.38784296262912e-18	14909937	14909937	1.55693917643627e-06	14937488	14952770
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14941202	15072515	20	19	-3.4	1.55693917643627e-06	14937488	14952770	2.41187014085205e-07	15062957	15072515
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15078313	15095427	4	4	-4.9227	2.41187014085205e-07	15062957	15072515	0.0846041259206432	15095427	15199550
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15099698	15284717	95	89	-3.0454	0.0846041259206432	15095427	15199550	2.12864083913084e-07	15251900	15304956
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15286805	15432050	96	90	-4.0748	2.12864083913084e-07	15251900	15304956	2.10670228245447e-06	15427777	15432050
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15433122	15446156	6	6	-1.8018	2.10670228245447e-06	15427777	15432050	2.24613806565961e-25	15446156	15446156
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15447091	15469100	16	15	-4.6516	2.24613806565961e-25	15446156	15446156	0.000331025108184226	15468160	15519963
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15470132	15639408	60	57	-3.1606	0.000331025108184226	15468160	15519963	0.00122288426294686	15548828	15675166
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15642822	15915466	45	44	-4.0673	0.00122288426294686	15548828	15675166	3.8864692381923e-06	15873423	15977755
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16173830	101	94	-2.874	3.8864692381923e-06	15873423	15977755	8.02123585343646e-11	16100397	16203872
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16175250	16175250	1	0	NA	8.02123585343646e-11	16100397	16203872	NA	NA	NA
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16176562	22181855	1010	949	-3.7793	NA	NA	NA	3.14568903518855e-07	22158616	22192409
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22182080	22268552	26	23	-5.1953	3.14568903518855e-07	22158616	22192409	2.15493771023672e-05	22252795	22407622
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22308420	22930737	64	59	-4.0472	2.15493771023672e-05	22252795	22407622	3.75305123207011e-38	22924754	26870361
MSK_252152916777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	80	-1.2689	3.75305123207011e-38	22924754	26870361	NA	NA	NA
