Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72533804	27890	26700	-0.0017	NA	NA	NA	3.56250966018856e-254	72533804	72534975
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72533856	72537426	4	4	-3.3727	3.56250966018856e-254	72533804	72534975	1.57442596364525e-20	72536231	72537426
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72574479	13	11	2.674	1.57442596364525e-20	72536231	72537426	0	72574479	72574479
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72579311	72579311	1	0	NA	0	72574479	72574479	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	91834314	6011	5757	-7e-04	NA	NA	NA	5.99955947731836e-10	91832851	91834314
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	91838743	91840471	2	2	-0.8947	5.99955947731836e-10	91832851	91834314	7.84606986465581e-10	91840471	91845096
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	91842900	91842900	1	0	NA	7.84606986465581e-10	91840471	91845096	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	91845096	108533257	5114	4915	-0.0031	NA	NA	NA	2.27237098992486e-07	108531247	108533257
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108535814	108538662	3	3	0.6332	2.27237098992486e-07	108531247	108533257	2.15294277046974e-06	108538662	108541074
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108541074	110014625	570	543	-0.0136	2.15294277046974e-06	108538662	108541074	8.02616266913503e-16	110014625	110014625
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110015739	110033018	3	0	NA	8.02616266913503e-16	110014625	110014625	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110034542	110039388	2	2	-1.2389	NA	NA	NA	2.23845958554808e-18	110039388	110039388
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	150818222	5849	5618	0.0051	2.23845958554808e-18	110039388	110039388	6.00237115081235e-11	150816180	150823073
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150819879	150839754	5	5	-0.6096	6.00237115081235e-11	150816180	150823073	0.000417264279072311	150839754	150844444
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150851439	7	6	-2.6048	0.000417264279072311	150839754	150844444	5.18055334666646e-72	150851439	150851439
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	150852858	1	0	NA	5.18055334666646e-72	150851439	150851439	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150857070	151026228	77	73	0.0175	NA	NA	NA	0	151026228	151026228
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	-5.0566	0	151026228	151026228	0	151036435	151036435
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2577	-0.001	0	151036435	151036435	2.07654794127292e-49	157133150	157133150
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-2.1	2.07654794127292e-49	157133150	157133150	8.6596469538069e-55	157136342	157136342
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	196570662	13877	13284	-0.0042	8.6596469538069e-55	157136342	157136342	4.08064485356184e-12	196570662	196570662
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	196572806	196576204	3	2	-1.0141	4.08064485356184e-12	196570662	196570662	8.96868920209453e-11	196576204	196578227
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	196578227	200594055	1581	1517	-3e-04	8.96868920209453e-11	196576204	196578227	1.08828056692048e-19	200582647	200612164
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200596027	200787319	40	39	-0.3133	1.08828056692048e-19	200582647	200612164	2.52211031700406e-22	200678532	200803726
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200797743	243702540	16009	15309	-7e-04	2.52211031700406e-22	200678532	200803726	2.46403843967118e-36	243702540	243702540
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	243703653	243714007	7	6	-1.0087	2.46403843967118e-36	243702540	243702540	3.26433248638285e-33	243714007	243714007
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	243715818	243715818	1	0	NA	3.26433248638285e-33	243714007	243714007	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	243717078	247186514	1392	1347	-0.0184	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	3708749	1388	1316	0.0399	NA	NA	NA	1.16389135238244e-14	3707057	3708749
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	3713664	3714236	3	3	-0.8566	1.16389135238244e-14	3707057	3708749	1.40911922555577e-12	3714236	3718746
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	3718746	28632815	7586	7287	0.0044	1.40911922555577e-12	3714236	3718746	5.37975454205681e-09	28632815	28632815
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	28634722	28636751	2	2	-0.896	5.37975454205681e-09	28632815	28632815	9.63653424437262e-09	28636751	28636751
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	28639293	34543992	2543	2442	-0.008	9.63653424437262e-09	28636751	28636751	1.58205768814182e-73	34543992	34543992
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34582272	16	13	0.9775	1.58205768814182e-73	34543992	34543992	1.87801279084148e-78	34582272	34582272
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34583814	66357387	11756	11254	-0.0037	1.87801279084148e-78	34582272	34582272	4.9599023055596e-20	66357387	66357387
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	1.2774	4.9599023055596e-20	66357387	66357387	5.24859503563041e-19	66360747	66360747
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	141259503	19933	19064	0.004	5.24859503563041e-19	66360747	66360747	5.88969563324742e-16	141257044	141259503
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	141260745	141268008	5	5	-0.7372	5.88969563324742e-16	141257044	141259503	4.82109961602257e-16	141268008	141269772
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	141269772	142237530	449	424	-0.003	4.82109961602257e-16	141268008	141269772	6.64721909265083e-14	142236211	142237530
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	142240564	142243681	3	3	-0.8844	6.64721909265083e-14	142236211	142237530	1.18773596380405e-16	142243681	142243681
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	142245223	242689978	34141	32701	-8e-04	1.18773596380405e-16	142243681	142243681	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	85579282	29578	28314	0.0016	NA	NA	NA	1.15044507957198e-30	85577194	85579282
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	85581215	85605281	14	14	0.6077	1.15044507957198e-30	85577194	85579282	8.77552889446281e-34	85605281	85606831
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	85606831	99891210	2591	2487	0.0057	8.77552889446281e-34	85605281	85606831	0	99891210	99891210
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-5.5879	0	99891210	99891210	0	99897201	99897201
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	133189686	11524	11019	-0.0012	0	99897201	99897201	9.20907231480299e-14	133189686	133189686
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.0674	9.20907231480299e-14	133189686	133189686	1.4586121919894e-13	133194685	133194685
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	164005577	9780	9363	8e-04	1.4586121919894e-13	133194685	133194685	4.35146036980007e-26	164005577	164012645
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	0.9268	4.35146036980007e-26	164005577	164012645	3.75181774644500e-27	164019640	164027724
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	190844369	8933	8544	-0.0036	3.751817746445e-27	164019640	164027724	5.13535432976348e-23	190844369	190844369
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	190847899	190850562	3	3	-1.1096	5.13535432976348e-23	190844369	190844369	1.3153726137753e-21	190850562	190850562
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	190854164	192546280	632	607	0.0038	1.3153726137753e-21	190850562	190850562	2.13579692461049e-17	192546280	192546280
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192548135	192552734	4	4	-0.8634	2.13579692461049e-17	192546280	192546280	5.74859149527342e-17	192552734	192552734
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192554451	193133137	114	112	-0.0118	5.74859149527342e-17	192552734	192552734	1.05036391780366e-19	193133137	193133137
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	193140532	193147523	3	3	-1.0892	1.05036391780366e-19	193133137	193133137	4.64065202364043e-23	193147523	193147523
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	193152152	194354505	461	447	-0.0175	4.64065202364043e-23	193147523	193147523	4.41086149229908e-80	194354505	194358882
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194365648	5	5	1.5612	4.41086149229908e-80	194354505	194358882	3.39710693640245e-69	194364470	194365648
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194366950	194366950	1	0	NA	3.39710693640245e-69	194364470	194365648	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	199329592	1980	1898	-0.0108	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	34020	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	35882	9815760	3392	3242	0.0183	NA	NA	NA	0	9815760	9815760
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.6254	0	9815760	9815760	0	9842644	9842644
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	34445002	6167	5906	-0.0012	0	9842644	9842644	1.9259145164774e-18	34439897	34445002
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	-0.6824	1.9259145164774e-18	34439897	34445002	1.21026995454718e-16	34491115	34506297
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	64376590	7781	7440	-0.0084	1.21026995454718e-16	34491115	34506297	0	64376590	64376590
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64381871	64390333	2	2	-5.1111	0	64376590	64376590	0	64390333	64390333
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64398986	70207908	1213	1177	-0.0048	0	64390333	64390333	1.11979202272266e-15	70207908	70207908
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70216172	70294312	3	3	-0.9263	1.11979202272266e-15	70207908	70207908	8.36765341629727e-16	70294312	70294312
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70336467	107275274	12583	12048	-0.0102	8.36765341629727e-16	70294312	70294312	0	107275274	107275274
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107276428	107281410	4	4	-4.9705	0	107275274	107275274	0	107281410	107281410
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107283257	119334954	3589	3457	-0.0072	0	107281410	107281410	7.9596820812831e-196	119334954	119334954
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119345371	119348829	3	3	-3.1973	7.9596820812831e-196	119334954	119334954	1.49228097061876e-178	119348829	119348829
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119350354	122499680	942	901	-0.0145	1.49228097061876e-178	119348829	119348829	1.10712203776155e-15	122497864	122499680
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	122500822	122507557	4	4	-0.7955	1.10712203776155e-15	122497864	122499680	4.57592723217865e-17	122507557	122511771
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	122511771	138307863	3268	3132	-0.0012	4.57592723217865e-17	122507557	122511771	1.28998333692404e-13	138307863	138307863
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	138312147	138319409	2	2	-1.0083	1.28998333692404e-13	138307863	138307863	4.112953847206e-12	138319409	138319409
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	138324335	191153613	16197	15486	-0.0026	4.112953847206e-12	138319409	138319409	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	737829	222	214	0.0204	NA	NA	NA	3.79174112930265e-08	729262	737829
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	776194	829954	6	6	-0.483	3.79174112930265e-08	729262	737829	3.65509483882167e-24	829954	873365
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	59316268	15918	15248	0.0022	3.65509483882167e-24	829954	873365	5.81380692247551e-26	59314941	59318791
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59318791	59325340	4	4	-0.7802	5.81380692247551e-26	59314941	59318791	2.05290417131339e-14	59321944	59327219
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59327219	68786286	2865	2758	-0.0178	2.05290417131339e-14	59321944	59327219	1.02316706663047e-09	68785515	68786286
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	68791405	68792873	2	2	-0.9085	1.02316706663047e-09	68785515	68786286	2.55365963275277e-10	68792873	68792873
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	68796062	83403591	4650	4445	-0.005	2.55365963275277e-10	68792873	68792873	3.82027838005709e-71	83400543	83406974
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	83406974	83470082	30	30	0.5935	3.82027838005709e-71	83400543	83406974	1.27268211628000e-70	83468882	83471971
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	83471971	133336776	13610	12990	-0.0026	1.27268211628e-70	83468882	83471971	3.00235916930747e-07	133324602	133336776
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	133339708	133345370	5	4	-0.4218	3.00235916930747e-07	133324602	133336776	0.00119268015529997	133345370	133356672
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	133349364	140201609	2767	2649	0.0031	0.00119268015529997	133345370	133356672	2.11145955146684e-09	140198797	140201609
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140203440	140216524	8	7	0.5046	2.11145955146684e-09	140198797	140201609	3.81266298167806e-10	140216524	140221835
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	180342860	13559	12979	0.0034	3.81266298167806e-10	140216524	140221835	4.97768347907303e-60	180342860	180342860
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180346557	2	2	-2.2121	4.97768347907303e-60	180342860	180342860	1.15246603485625e-11	180346557	180346557
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180348365	180358977	6	5	-5.5707	1.15246603485625e-11	180346557	180346557	0	180358977	180358977
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180362342	1	0	NA	0	180358977	180358977	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180364670	180644810	111	103	-0.017	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	198124	39	36	-0.009	NA	NA	NA	2.62935119749298e-11	176670	211079
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	200350	326323	62	60	0.2611	2.62935119749298e-11	176670	211079	3.44811431491028e-24	314877	335212
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	29941766	10485	10022	0.0029	3.44811431491028e-24	314877	335212	1.39580958972211e-20	29937319	29981912
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29950805	30033946	22	22	0.3979	1.39580958972211e-20	29937319	29981912	6.2136362307097e-18	30004636	30040917
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30040901	32548736	1068	1029	0	6.2136362307097e-18	30004636	30040917	5.55206154251524e-61	32548736	32609525
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32653710	21	20	-0.9163	5.55206154251524e-61	32548736	32609525	0.00727353611021933	32590568	32657601
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32654861	32713363	25	24	-0.0874	0.00727353611021933	32590568	32657601	1.61670516012813e-07	32709263	32716255
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	7	-1.105	1.61670516012813e-07	32709263	32716255	5.97068476766909e-53	32728285	32728487
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	103841482	21469	20575	0	5.97068476766909e-53	32728285	32728487	1.41602447318358e-26	103841482	103841482
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	1.0434	1.41602447318358e-26	103841482	103841482	6.31887982916805e-28	103868154	103868154
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	139643729	12380	11832	-0.008	6.31887982916805e-28	103868154	103868154	2.39182949259196e-27	139643729	139643729
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139645417	139648318	3	3	-1.2096	2.39182949259196e-27	139643729	139643729	9.69875083815707e-27	139648318	139648318
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139651247	151799135	4014	3842	-0.0027	9.69875083815707e-27	139648318	139648318	8.0702222108787e-10	151790398	151810134
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	151800956	151822731	12	12	-0.3761	8.0702222108787e-10	151790398	151810134	2.63969210540422e-10	151810134	151829060
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	151824665	165643653	4697	4485	0.0052	2.63969210540422e-10	151810134	151829060	1.15859464973648e-292	165643653	165643653
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165649379	3	3	-3.9792	1.15859464973648e-292	165643653	165643653	4.30093469282912e-278	165649379	165649379
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165650610	165650610	1	0	NA	4.30093469282912e-278	165649379	165649379	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1732	0.0319	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	56012100	18910	18073	0.0039	NA	NA	NA	3.39374354741204e-39	56008443	56013532
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	56013532	56056178	20	19	0.5904	3.39374354741204e-39	56008443	56013532	6.43056741046967e-42	56052335	56058849
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	56058849	118611324	20335	19504	-0.0102	6.43056741046967e-42	56052335	56058849	1.64452760205060e-12	118611324	118611324
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	2	1.0249	1.6445276020506e-12	118611324	118611324	1.2650156167338e-12	118620875	118620875
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	141413352	10536	10063	-0.0012	1.2650156167338e-12	118620875	118620875	3.76015273883007e-10	141409512	141425306
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141414719	141435643	11	11	0.3944	3.76015273883007e-10	141409512	141425306	3.99298114739706e-10	141426846	141442231
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141438504	141438504	1	0	NA	3.99298114739706e-10	141426846	141442231	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	147702365	2639	2506	-0.0088	NA	NA	NA	4.90067540067326e-13	147702365	147707161
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147710037	4	4	0.7453	4.90067540067326e-13	147702365	147707161	5.15764208067298e-11	147707161	147711471
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147711471	158191657	4022	3834	0.0126	5.15764208067298e-11	147707161	147711471	5.88763920198955e-12	158191657	158191657
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158193795	158195947	2	2	-1.0616	5.88763920198955e-12	158191657	158191657	1.08710314565389e-15	158195947	158195947
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158197662	158821263	212	206	0.049	1.08710314565389e-15	158195947	158195947	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	2234351	737	704	0.0415	NA	NA	NA	1.94584075384049e-14	2231804	2234351
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2242849	2251011	4	4	-0.8093	1.94584075384049e-14	2231804	2234351	1.1746725737615e-17	2251011	2257255
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2257255	6926661	1650	1569	0.0147	1.1746725737615e-17	2251011	2257255	1.52653652479205e-09	6907624	7226901
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7156900	7790934	9	9	0.424	1.52653652479205e-09	6907624	7226901	6.0163082239931e-09	7709141	8139999
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7824059	25017905	5728	5473	0.0065	6.0163082239931e-09	7709141	8139999	1.31149818034244e-15	25017905	25017905
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25022606	25022606	1	0	NA	1.31149818034244e-15	25017905	25017905	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	0.9478	NA	NA	NA	2.53646952926427e-20	25039370	25039370
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	25120552	27	27	-0.0537	2.53646952926427e-20	25039370	25039370	2.16356167856260e-32	25120552	25120552
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	2.1635616785626e-32	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	1.6534	NA	NA	NA	1.99067855310919e-34	25125700	25125700
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	67999009	12133	11595	-0.0082	1.99067855310919e-34	25125700	25125700	5.39634239702283e-11	67997437	68004667
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	68000972	68011798	8	6	-0.5628	5.39634239702283e-11	67997437	68004667	8.94484687740632e-13	68004667	68013487
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	68013487	68550022	232	221	-0.0278	8.94484687740632e-13	68004667	68013487	1.18822050436241e-29	68550022	68552223
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	68552223	68561574	6	6	-0.8369	1.18822050436241e-29	68550022	68552223	8.56446589137784e-26	68559451	68565118
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	68565118	146264846	24025	22969	-1e-04	8.56446589137784e-26	68559451	68565118	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	140145683	37944	36326	-0.0024	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	53683740	16302	15619	-0.0016	NA	NA	NA	0	53683740	53683740
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53686515	53687880	2	2	-5.1354	0	53683740	53683740	0	53687880	53687880
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53689554	70949263	5371	5125	-0.0123	0	53687880	53687880	9.44769829250968e-10	70945853	70949263
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70952973	70960187	4	3	-0.7447	9.44769829250968e-10	70945853	70949263	3.44511267359162e-09	70960187	70964344
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70964344	124328915	19250	18425	7e-04	3.44511267359162e-09	70960187	70964344	2.54461916511068e-13	124328915	124328915
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124337128	124340356	3	3	0.8857	2.54461916511068e-13	124328915	124328915	2.12879830163190e-11	124340356	124340356
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124368725	135285645	3876	3720	0.025	2.1287983016319e-11	124340356	124340356	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	20799632	8146	7795	0.0069	NA	NA	NA	4.17173591570623e-11	20797855	20799632
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	20801973	20806094	3	3	-0.8201	4.17173591570623e-11	20797855	20799632	2.75049014793130e-11	20806094	20809631
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	20809631	66463477	13433	12824	-0.0018	2.7504901479313e-11	20806094	20809631	1.39483971769758e-63	66463477	66463477
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	-2.3159	1.39483971769758e-63	66463477	66463477	6.9921006660727e-63	66469412	66469412
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	89842734	8235	7859	-2e-04	6.9921006660727e-63	66469412	66469412	1.63255578043815e-13	89842734	89842734
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	89849869	89860500	2	2	-1.0951	1.63255578043815e-13	89842734	89842734	1.28279866389022e-16	89860500	89860500
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	89865412	134450318	15483	14804	0.007	1.28279866389022e-16	89860500	89860500	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	11116883	4329	4148	0.0071	NA	NA	NA	1.34070868932853e-159	11116883	11123452
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	7	-1.9507	1.34070868932853e-159	11116883	11123452	3.21314723260639e-42	11126558	11140421
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	11395862	70	70	-0.0471	3.21314723260639e-42	11126558	11140421	8.77381182864067e-11	11393473	11395862
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11435643	6	5	0.6081	8.77381182864067e-11	11393473	11395862	2.44808719756313e-11	11435643	11440927
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	31196787	6751	6450	-0.0024	2.44808719756313e-11	11435643	11440927	2.58660412678673e-40	31188761	31200356
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31200356	31298659	35	35	0.4251	2.58660412678673e-40	31188761	31200356	5.96538480426148e-40	31296973	31301891
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31299898	100624427	22237	21280	-0.0078	5.96538480426148e-40	31296973	31301891	9.1185503530757e-10	100620923	100624427
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	100626837	100629832	3	3	-0.7633	9.1185503530757e-10	100620923	100624427	9.15076580325114e-10	100629832	100631726
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	100631726	111125512	4034	3839	-0.0048	9.15076580325114e-10	100629832	100631726	7.60572117018956e-11	111125512	111125512
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	111126852	111128107	2	2	-0.9808	7.60572117018956e-11	111125512	111125512	2.10686837935844e-10	111128107	111128107
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	111129902	130292213	6932	6632	-0.0023	2.10686837935844e-10	111128107	111128107	2.58898394341057e-76	130292213	130303832
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130296301	130296301	1	0	NA	2.58898394341057e-76	130292213	130303832	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130299307	130381290	21	20	-0.8224	NA	NA	NA	1.82518322795283e-44	130368305	130391735
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130391735	130694393	87	84	0.0739	1.82518322795283e-44	130368305	130391735	3.58351897091028e-09	130694393	130694393
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	1.0884	3.58351897091028e-09	130694393	130694393	2.27302889914914e-12	130701040	130701040
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	612	-0.0035	2.27302889914914e-12	130701040	130701040	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	114123340	31644	30254	0.0019	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19301034	14	14	-0.308	NA	NA	NA	3.43433842339357e-09	19271102	19325098
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19323579	19494416	46	44	-0.7472	3.43433842339357e-09	19271102	19325098	2.49534427007681e-138	19492531	19497023
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	21445390	953	912	-0.0078	2.49534427007681e-138	19492531	19497023	1.81632406088307e-40	21418192	21474576
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21446445	22040315	292	285	-0.1885	1.81632406088307e-40	21418192	21474576	1.48692712215197e-57	22010711	22056148
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22041571	69086125	16323	15634	-0.0069	1.48692712215197e-57	22010711	22056148	1.71151060572326e-13	69086125	69086125
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69092211	3	3	0.8601	1.71151060572326e-13	69086125	69086125	1.60281737596372e-12	69092211	69092211
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69093444	80647457	5299	5077	-0.0018	1.60281737596372e-12	69092211	69092211	4.82739120614945e-09	80644954	80648549
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	80648549	80649876	3	3	-0.7406	4.82739120614945e-09	80644954	80648549	7.26948666963936e-09	80649745	80659243
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	80659243	105597555	8709	8325	0.0055	7.26948666963936e-09	80649745	80659243	0	105597555	105607572
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	-2.5133	0	105597555	105607572	2.16112515906897e-15	105623070	105632168
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105787390	21	20	0.0843	2.16112515906897e-15	105623070	105632168	1.02117474703758e-15	105783533	105788623
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105788623	105798116	6	6	-0.8744	1.02117474703758e-15	105783533	105788623	1.25370216485722e-17	105795807	105799261
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105799261	106218059	152	144	0.0713	1.25370216485722e-17	105795807	105799261	1.32264642065345e-22	106214372	106218059
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106219784	106253648	16	15	0.7367	1.32264642065345e-22	106214372	106218059	4.53009794341231e-18	106253648	106256498
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106255190	106358491	36	34	0.0815	4.53009794341231e-18	106253648	106256498	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18692865	6	6	0.0911	NA	NA	NA	9.51899045175224e-14	18692865	18749895
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18741716	19806497	97	93	0.7888	9.51899045175224e-14	18692865	18749895	1.73961031301107e-07	19421704	19927262
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19819961	20088256	53	52	1.0139	1.73961031301107e-07	19421704	19927262	0	20088256	20088256
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	52134186	11658	11138	-0.0046	0	20088256	20088256	8.45734965214326e-10	52134186	52134186
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	52135358	52140648	2	2	-0.9383	8.45734965214326e-10	52134186	52134186	8.79561318456017e-10	52140648	52140648
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	52143100	75114211	10068	9652	-0.0046	8.79561318456017e-10	52140648	52140648	7.6893608159385e-12	75114211	75114211
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75115806	75115806	1	0	NA	7.6893608159385e-12	75114211	75114211	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	1.0166	NA	NA	NA	1.41005339323723e-11	75119713	75119713
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	83774352	3085	2949	0.008	1.41005339323723e-11	75119713	75119713	1.90271662574970e-07	83771670	83774352
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	83776657	83777850	2	2	-0.81	1.9027166257497e-07	83771670	83774352	2.46589473736125e-07	83777850	83784233
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	83784233	98232932	5434	5193	0.0039	2.46589473736125e-07	83777850	83784233	2.55795098515596e-22	98232932	98232932
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98239454	3	3	1.1332	2.55795098515596e-22	98232932	98232932	1.30502903426532e-21	98239454	98239454
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	100298352	911	882	0.006	1.30502903426532e-21	98239454	98239454	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	32558526	10589	10180	-0.008	NA	NA	NA	5.35647465583596e-42	32547617	32558526
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32809658	32809658	1	0	NA	5.35647465583596e-42	32547617	32558526	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33278944	33559207	28	27	0.5195	NA	NA	NA	6.40427925856503e-41	33559207	33841331
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33647856	54352394	3078	2960	0.0094	6.40427925856503e-41	33559207	33841331	3.26953656006733e-13	54343465	54365385
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54353978	54379839	10	10	-0.4764	3.26953656006733e-13	54343465	54365385	1.90580045988469e-05	54368717	54390060
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	54408446	6	6	0.4297	1.90580045988469e-05	54368717	54390060	9.46955976888442e-06	54400475	54424734
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54410800	57203733	1197	1143	0.0017	9.46955976888442e-06	54400475	54424734	2.20558899808843e-16	57203733	57203733
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	1.2196	2.20558899808843e-16	57203733	57203733	8.69649291253663e-18	57206772	57206772
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	75093957	5612	5361	-0.0083	8.69649291253663e-18	57206772	57206772	2.75783759535683e-72	75093957	75097331
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-2.0124	2.75783759535683e-72	75093957	75097331	3.04942211105697e-67	75099083	75100865
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	585	-0.0025	3.04942211105697e-67	75099083	75100865	1.02186758294298e-78	76925748	76925748
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	1.2947	1.02186758294298e-78	76925748	76925748	2.13279585809341e-66	76940218	76940218
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4334	0.0082	2.13279585809341e-66	76940218	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	31457889	12037	11485	-0.0037	NA	NA	NA	3.87234635863999e-60	31457889	31457889
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31503774	19	18	0.7657	3.87234635863999e-60	31457889	31457889	1.11029507550031e-55	31503774	31503774
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	36673853	1815	1743	-0.0082	1.11029507550031e-55	31503774	31503774	1.0419291490793e-58	36673853	36673853
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36678537	2	0	NA	1.0419291490793e-58	36673853	36673853	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36680557	36683509	3	3	-1.9531	NA	NA	NA	5.29907549089142e-55	36683509	36683509
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	38035466	655	628	0.0122	5.29907549089142e-55	36683509	36683509	2.32445723066511e-08	38033951	38035466
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	38038556	38040017	2	2	-0.9413	2.32445723066511e-08	38033951	38035466	1.11716984005374e-09	38040017	38041771
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	38041771	40874079	1151	1101	-0.0211	1.11716984005374e-09	38040017	38041771	2.23577947755372e-11	40874079	40874079
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41007660	41011530	2	2	-1.0143	2.23577947755372e-11	40874079	40874079	3.98884397271481e-08	41011530	41015177
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41015177	41519702	202	192	0.0123	3.98884397271481e-08	41011530	41015177	3.41285812166866e-34	41518222	41519702
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41566540	21	20	-0.6634	3.41285812166866e-34	41518222	41519702	4.41442980880091e-50	41566540	41568539
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	55313150	4841	4613	-0.0016	4.41442980880091e-50	41566540	41568539	2.76664568765828e-09	55290467	55322991
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	55316033	55358482	17	17	-0.2251	2.76664568765828e-09	55290467	55322991	0.000472731442925315	55347441	55483782
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	55362705	70743361	5578	5335	-0.0065	0.000472731442925315	55347441	55483782	1.18225695336659e-11	70743361	70743361
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	70746418	70747755	2	2	-1.0414	1.18225695336659e-11	70743361	70743361	9.20889337221539e-10	70747755	70749113
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	70749113	78653545	3287	3150	-0.0049	9.20889337221539e-10	70747755	70749113	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	17512646	5298	5075	-0.0022	NA	NA	NA	2.16817624561018e-14	17512646	17512646
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	17513277	17514596	2	2	-1.0876	2.16817624561018e-14	17512646	17512646	1.60148588168175e-14	17514596	17514596
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	17515586	76116026	17664	16897	0.0072	1.60148588168175e-14	17514596	17514596	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	19692626	9026	8623	-0.0247	NA	NA	NA	2.94193196889506e-251	19692626	19692626
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19694025	19694025	1	0	NA	2.94193196889506e-251	19692626	19692626	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19699024	19700620	3	3	-4.0086	NA	NA	NA	1.60136406029729e-134	19700620	19700620
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19702214	19710429	6	6	-0.2704	1.60136406029729e-134	19700620	19700620	0.0319705097389915	19706330	19810464
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19711596	20399700	180	167	-0.0247	0.0319705097389915	19706330	19810464	0.00264546651836656	20368015	20420327
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20420327	20426875	4	4	-0.3856	0.00264546651836656	20368015	20420327	0.00321615624694742	20425020	20436482
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20429162	20493401	11	10	-0.868	0.00321615624694742	20425020	20436482	2.3840412206935e-42	20474417	20493401
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20507235	46046859	5922	5671	-0.0103	2.3840412206935e-42	20474417	20493401	4.35548308951532e-12	46032427	46046859
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	46054503	46063357	5	5	-0.6699	4.35548308951532e-12	46032427	46046859	3.35611644379461e-11	46063357	46086240
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	46086240	58196296	5302	5064	-0.0232	3.35611644379461e-11	46063357	46086240	2.62274048492433e-08	58177409	58201323
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58197961	58197961	1	0	NA	2.62274048492433e-08	58177409	58201323	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58198955	58244012	21	20	-0.3042	NA	NA	NA	8.0999157913353e-09	58237461	58264130
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58247367	58247367	1	0	NA	8.0999157913353e-09	58237461	58264130	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58249435	63788698	2576	2468	-0.0169	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1511632	587	561	0.0061	NA	NA	NA	3.55413256491701e-215	1511632	1511632
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1515948	1532433	9	8	-2.4257	3.55413256491701e-215	1511632	1511632	1.57831111742427e-270	1532433	1532433
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	20046	0.0046	1.57831111742427e-270	1532433	1532433	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12859	0.0029	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	16518586	403	388	-0.019	NA	NA	NA	1.34751146707745e-07	16513294	16519953
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16519953	16524408	4	4	-0.6518	1.34751146707745e-07	16513294	16519953	1.06247263097539e-08	16523019	16525922
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16525922	28604329	5812	5532	0.0071	1.06247263097539e-08	16523019	16525922	5.58041098094509e-06	28592220	28613000
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	28606054	28627112	10	10	0.3581	5.58041098094509e-06	28592220	28613000	3.37362146950533e-07	28617053	28635288
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	28628752	49571068	10327	9858	0.0013	3.37362146950533e-07	28617053	28635288	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	1870412	1121	1074	-0.013	NA	NA	NA	2.37427953938773e-12	1870412	1870855
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1870855	1873302	3	3	-0.8941	2.37427953938773e-12	1870412	1870855	8.4280548429731e-11	1872109	1873761
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1873761	2672401	642	615	-0.0147	8.4280548429731e-11	1872109	1873761	3.63660071155483e-08	2667268	2695951
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672477	2708291	27	26	-0.2828	3.63660071155483e-08	2667268	2695951	1.26176954287006e-100	2708291	2711273
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	8449254	1789	1711	0.8422	1.26176954287006e-100	2708291	2711273	1.05039648225699e-14	8445177	8456422
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8450789	8466917	9	9	0.245	1.05039648225699e-14	8445177	8456422	3.07555100289327e-29	8461739	8477126
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8473482	8473482	1	0	NA	3.07555100289327e-29	8461739	8477126	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8475091	76998610	21140	20142	0.8822	NA	NA	NA	1.31852057888433e-29	76998610	76998610
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	1.9913	1.31852057888433e-29	76998610	76998610	3.05524527352702e-12	77010018	77010018
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154038318	22060	21113	0.8826	3.05524527352702e-12	77010018	77010018	1.01587087507899e-37	154038318	154044828
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154078819	11	10	1.8979	1.01587087507899e-37	154038318	154044828	3.44156924306898e-26	154078401	154078819
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154582414	122	118	0.8246	3.44156924306898e-26	154078401	154078819	2.90795608610589e-193	154570196	154582414
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	194	0.0033	2.90795608610589e-193	154570196	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	114	-4.114	NA	NA	NA	3.4719378849232e-23	3034907	3772482
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3733715	1	0	NA	3.4719378849232e-23	3034907	3772482	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	15	-1.1159	NA	NA	NA	3.45408828911157e-08	5422507	6711090
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7259689	229	220	-3.3407	3.45408828911157e-08	5422507	6711090	1.04025555692856e-06	7244216	7271632
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7261174	7304209	23	22	-1.6209	1.04025555692856e-06	7244216	7271632	0.00621686197744934	7284775	7342985
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7305143	7495687	51	49	-2.9284	0.00621686197744934	7284775	7342985	0.00324975262467514	7375948	7630477
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7709619	66	62	-3.9249	0.00324975262467514	7375948	7630477	1.74002561026460e-07	7694197	7714929
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7782532	27	23	-2.1452	1.7400256102646e-07	7694197	7714929	0.00302685509025067	7740903	7833760
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	8010446	62	60	-3.2549	0.00302685509025067	7740903	7833760	4.30900180911909e-05	7919636	8061681
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8016395	8289709	63	61	-4.1877	4.30900180911909e-05	7919636	8061681	1.08566972150855e-12	8277707	8289709
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8292347	8313045	10	10	-1.9551	1.08566972150855e-12	8277707	8289709	8.42814677176311e-06	8313045	8333193
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8316416	8949553	180	174	-3.6793	8.42814677176311e-06	8313045	8333193	0.0121280304781889	8890417	8949553
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8953090	8956787	3	3	-1.5555	0.0121280304781889	8890417	8949553	2.26467551210112e-06	8956787	8959151
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8958121	10515697	112	104	-4.2867	2.26467551210112e-06	8956787	8959151	2.09408471482392e-55	10515697	10535786
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	11673476	17	16	-0.6034	2.09408471482392e-55	10515697	10535786	1.13002026664627e-05	11249952	12533900
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	12682301	67	66	-2.6017	1.13002026664627e-05	11249952	12533900	0.0168453704518815	12583843	12725675
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	21	-3.7984	0.0168453704518815	12583843	12725675	1.53041550513992e-05	12804329	12869489
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	13129843	113	106	-2.247	1.53041550513992e-05	12804329	12869489	1.02708459314360e-05	13086552	13148290
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13254711	41	41	-3.4491	1.0270845931436e-05	13086552	13148290	1.32380988828820e-05	13166582	13300861
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13256555	13603478	163	155	-4.2196	1.3238098882882e-05	13166582	13300861	3.07760708387733e-08	13587025	13633041
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13606316	13705594	14	12	-2.8015	3.07760708387733e-08	13587025	13633041	1.47207240382477e-08	13700962	13729067
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716000	14122129	159	153	-4.2621	1.47207240382477e-08	13700962	13729067	4.27368871226572e-08	14118164	14122129
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14143748	3	3	-1.4726	4.27368871226572e-08	14118164	14122129	8.35394191797377e-12	14143748	14143748
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14169526	14342834	28	28	-4.448	8.35394191797377e-12	14143748	14143748	0.000189881096030640	14331599	14343139
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14358464	7	7	-3.2414	0.00018988109603064	14331599	14343139	4.0961132898421e-08	14356069	14358464
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14359748	14376942	9	9	-1.9277	4.0961132898421e-08	14356069	14358464	5.65040002695892e-05	14376942	14383746
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14377844	14449913	41	41	-3.6851	5.65040002695892e-05	14376942	14383746	0.00287003899120757	14425003	14480242
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14451317	14508894	40	38	-2.7433	0.00287003899120757	14425003	14480242	1.0527760724492e-07	14502379	14526446
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	22	-1.2008	1.0527760724492e-07	14502379	14526446	2.01477833645148e-21	14579298	14579298
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14598838	6	6	-4.6029	2.01477833645148e-21	14579298	14579298	4.53166283943622e-38	14598838	14598838
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14601309	14644293	4	4	-0.4084	4.53166283943622e-38	14598838	14598838	4.55157858421422e-09	14644293	14681738
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	14994704	72	68	-3.9379	4.55157858421422e-09	14644293	14681738	4.33689837342934e-05	14969835	14994704
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15005207	15018205	3	3	-0.8832	4.33689837342934e-05	14969835	14994704	5.31237121054585e-06	15018205	15025974
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15022037	15139441	28	26	-3.949	5.31237121054585e-06	15018205	15025974	2.82481412148718e-06	15126227	15146521
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15140278	15165820	17	16	-2.0897	2.82481412148718e-06	15126227	15146521	2.01417980158772e-05	15159692	15165820
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15169415	15175926	5	5	-4.8518	2.01417980158772e-05	15159692	15165820	0.000712840136637274	15175378	15179500
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15176870	15201695	12	12	-3.3018	0.000712840136637274	15175378	15179500	0.000934927714176198	15180502	15201695
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15203221	15208612	6	6	-4.5796	0.000934927714176198	15180502	15201695	0.00128530009915479	15208612	15240367
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15209166	15284717	41	40	-2.8246	0.00128530009915479	15208612	15240367	1.84130713240938e-05	15270384	15315201
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15286805	15915466	223	217	-3.7892	1.84130713240938e-05	15270384	15315201	8.75744183982871e-12	15848986	15958396
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16067790	58	54	-2.4653	8.75744183982871e-12	15848986	15958396	0.00817891596730727	16019249	16079877
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16068838	16102267	20	20	-3.7188	0.00817891596730727	16019249	16079877	2.39794711757059e-06	16096672	16102267
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16103913	16103913	1	0	NA	2.39794711757059e-06	16096672	16102267	NA	NA	NA
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16107406	16139806	7	5	-0.8906	NA	NA	NA	2.21382210267949e-05	16139806	16156464
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16143653	16387273	76	74	-3.4522	2.21382210267949e-05	16139806	16156464	0.000381416888322476	16224597	16673519
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	21036411	670	640	-4.0615	0.000381416888322476	16224597	16673519	9.62909691109527e-09	21028489	21036503
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21036503	21054519	7	7	-1.3919	9.62909691109527e-09	21028489	21036503	1.67198792531748e-10	21048365	21057446
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	22139807	261	244	-4.0079	1.67198792531748e-10	21048365	21057446	6.71229231965444e-06	22043133	22157319
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22178964	10	9	-2.2711	6.71229231965444e-06	22043133	22157319	2.42243402352747e-23	22178964	22179794
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22179794	22780866	47	46	-4.6823	2.42243402352747e-23	22178964	22179794	3.82962579092815e-05	22395796	22848638
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22782417	25737663	47	45	-3.9644	3.82962579092815e-05	22395796	22848638	1.08059341119723e-44	22930737	26873861
MSK_252152916779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	57440809	84	79	-1.1562	1.08059341119723e-44	22930737	26873861	NA	NA	NA
