Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	2193598	428	400	0.001	NA	NA	NA	5.0039274329066e-12	2176630	2210121
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	2195514	2269096	29	26	-0.3158	5.0039274329066e-12	2176630	2210121	3.43489384044544e-14	2251892	2278136
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	2271500	34869589	12437	11635	0.0032	3.43489384044544e-14	2251892	2278136	0	34869589	34869589
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34876833	34881595	3	3	-6.226	0	34869589	34869589	0	34881595	34881595
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34883375	72537426	14997	14142	-0.006	0	34881595	34881595	0	72537426	72537426
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	11	3.0821	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	86171390	4220	3956	0.0014	0	72579311	72579311	8.82660094073674e-19	86171390	86171390
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	86173546	86175273	2	2	-1.2195	8.82660094073674e-19	86171390	86171390	2.13948336611632e-19	86175273	86175273
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	86179068	103929627	5895	5528	-0.0032	2.13948336611632e-19	86175273	86175273	3.7587231203088e-17	103929627	103929627
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103932025	103932025	1	0	NA	3.7587231203088e-17	103929627	103929627	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103956767	104012520	3	3	-0.9383	NA	NA	NA	4.26607943451431e-17	104012520	104012520
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	104108153	109373255	1285	1213	-0.0025	4.26607943451431e-17	104012520	104012520	3.80323943188057e-14	109373255	109373255
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109374790	109376249	2	2	-1.0469	3.80323943188057e-14	109373255	109373255	1.11107148262604e-12	109376249	109376249
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109379566	110033018	296	274	-0.0209	1.11107148262604e-12	109376249	109376249	4.82173647226651e-09	110033018	110033018
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110034542	110039388	2	2	-0.8918	4.82173647226651e-09	110033018	110033018	7.78830086182459e-10	110039388	110039388
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	120333077	3816	3566	0.001	7.78830086182459e-10	110039388	110039388	3.95107471175996e-10	120326821	120358263
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	120338395	120854952	15	13	-0.3548	3.95107471175996e-10	120326821	120358263	2.31701581587203e-09	120415520	120865864
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	120857377	143659690	82	77	-0.0266	2.31701581587203e-09	120415520	120865864	2.91698444134406e-33	143656552	143702972
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143697723	143793256	49	47	-0.3935	2.91698444134406e-33	143656552	143702972	3.30444913334526e-18	143791143	143800457
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143799153	143799153	1	0	NA	3.30444913334526e-18	143791143	143800457	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143800457	143830859	20	19	-0.001	NA	NA	NA	6.65214243753136e-07	143827741	143830859
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143832442	143994475	8	7	-0.363	6.65214243753136e-07	143827741	143830859	2.36822336996552e-06	143994475	144105332
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144003068	144003068	1	0	NA	2.36822336996552e-06	143994475	144105332	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144093719	146297175	563	508	-0.002	NA	NA	NA	2.64215039197666e-40	146294654	147311437
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147203277	147847659	39	37	-0.4209	2.64215039197666e-40	146294654	147311437	1.00019153696947e-40	147490608	148081769
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	148081741	150823073	1257	1177	-0.0105	1.00019153696947e-40	147490608	148081769	1.12748221561093e-08	150819879	150823073
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150839754	3	3	-0.6657	1.12748221561093e-08	150819879	150823073	1.04216966469139e-41	150839754	150839754
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150846148	4	4	-3.9115	1.04216966469139e-41	150839754	150839754	9.7649814619196e-149	150846148	150846148
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150847304	150847304	1	0	NA	9.7649814619196e-149	150846148	150846148	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150848509	151026228	80	74	-0.0465	NA	NA	NA	1.33366118446916e-200	151026228	151026228
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	-5.1139	1.33366118446916e-200	151026228	151026228	0	151036435	151036435
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2520	0.0026	0	151036435	151036435	1.40822440565836e-139	157133150	157133150
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	3.3833	1.40822440565836e-139	157133150	157133150	1.22546818239736e-151	157136342	157136342
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167483267	4108	3848	-0.0084	1.22546818239736e-151	157136342	157136342	2.55348249056835e-11	167479184	167483267
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	7	0.4993	2.55348249056835e-11	167479184	167483267	5.62424047220425e-12	167507898	167523140
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	173060997	2177	2039	-0.0155	5.62424047220425e-12	167507898	167523140	1.48286277098031e-09	173059045	173060997
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	173063537	173067337	3	3	-0.7211	1.48286277098031e-09	173059045	173060997	1.46810951536638e-09	173067337	173068576
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	173068576	192715640	6522	6106	-0.0073	1.46810951536638e-09	173067337	173068576	5.0985391735708e-07	192712721	192715640
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192718231	192723635	3	3	0.6113	5.0985391735708e-07	192712721	192715640	5.91071317991088e-08	192719540	192727583
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192727583	195009358	476	439	0.0122	5.91071317991088e-08	192719540	192727583	8.26144988301253e-29	195009358	195011344
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195011344	195065867	8	8	-0.6848	8.26144988301253e-29	195009358	195011344	4.12386935177708e-23	195062793	195091758
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	200594055	2156	2022	-2e-04	4.12386935177708e-23	195062793	195091758	2.76977981738419e-23	200587846	200602881
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200596027	200672373	29	29	-0.3637	2.76977981738419e-23	200587846	200602881	7.48923034133915e-23	200665389	200679934
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200673525	229968132	10769	10151	-0.0048	7.48923034133915e-23	200665389	200679934	2.43643436915022e-22	229958542	229980078
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	229970869	230061017	44	42	-0.3	2.43643436915022e-22	229958542	229980078	5.36734030628463e-20	230044742	230069173
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	230063133	247186514	6607	6210	-0.0224	5.36734030628463e-20	230044742	230069173	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	27373949	8414	7883	-0.0012	NA	NA	NA	1.5062972937856e-08	27373949	27373949
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	27375549	27379368	2	2	-0.8511	1.5062972937856e-08	27373949	27373949	2.27517904580784e-08	27379368	27379368
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	27381947	33617141	2716	2552	-0.008	2.27517904580784e-08	27379368	27379368	0	33617141	33617141
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33619260	33621111	2	2	-5.8636	0	33617141	33617141	0	33621111	33621111
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33622478	34543992	388	362	-0.0196	0	33621111	33621111	3.49067914173724e-139	34543992	34543992
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	18	0.9734	3.49067914173724e-139	34543992	34543992	2.28107244444148e-112	34589997	34589997
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	37800512	1367	1280	-0.0136	2.28107244444148e-112	34589997	34589997	3.30823440160248e-35	37797909	37812045
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37803744	37854350	23	22	-0.5228	3.30823440160248e-35	37797909	37812045	2.13849636368916e-38	37847519	37855837
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37855837	52600588	5802	5460	-0.0045	2.13849636368916e-38	37847519	37855837	1.02324199545506e-11	52588009	52600588
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	1.02324199545506e-11	52588009	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	0.6755	NA	NA	NA	2.95607295421999e-11	52635695	52639605
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	87149187	11156	10481	-0.0012	2.95607295421999e-11	52635695	52639605	7.42594455416167e-20	86964156	87245647
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	87245647	88038874	21	21	0.3861	7.42594455416167e-20	86964156	87245647	1.97134360681721e-19	88015932	88080817
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	88078497	146571330	15160	14238	-5e-04	1.97134360681721e-19	88015932	88080817	0	146571330	146571330
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-4.9342	0	146571330	146571330	0	146592775	146592775
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	154601442	2203	2070	-0.0079	0	146592775	146592775	0	154601442	154601442
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154605621	154606943	2	2	-5.2708	0	154601442	154601442	0	154606943	154606943
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154608095	241950780	30332	28542	-0.0043	0	154606943	154606943	6.01816535774435e-10	241950780	241950780
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	241952791	241954489	2	2	-0.9148	6.01816535774435e-10	241950780	241950780	1.10630263984285e-07	241954489	241957006
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	241957006	242689978	210	201	-0.0041	1.10630263984285e-07	241954489	241957006	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	75803353	26883	25293	-0.005	NA	NA	NA	1.65881763860759e-11	75798154	75853052
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75845446	75875904	11	11	0.4131	1.65881763860759e-11	75798154	75853052	3.2865816309308e-12	75870144	76006248
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76000715	89747986	3848	3628	0.0091	3.2865816309308e-12	75870144	76006248	6.51818925324066e-12	89747986	89747986
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89754033	89757490	2	2	-0.9246	6.51818925324066e-12	89747986	89747986	2.82738357262540e-10	89757490	89757490
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89768924	163992903	22744	21350	-1e-04	2.8273835726254e-10	89757490	89757490	0	163992903	164001657
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	163997228	1	0	NA	0	163992903	164001657	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164001657	164107951	27	23	-4.3396	NA	NA	NA	4.78043542621862e-37	164105613	164107951
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	164193105	22	21	0.0515	4.78043542621862e-37	164105613	164107951	2.22627721195856e-06	164189606	164193105
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164199919	164203532	2	2	0.8188	2.22627721195856e-06	164189606	164193105	1.82171393936964e-08	164203532	164203532
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164208172	176559755	4085	3850	0.0022	1.82171393936964e-08	164203532	164203532	5.71067501695401e-14	176559755	176559755
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	176563796	176566161	2	2	-1.034	5.71067501695401e-14	176559755	176559755	2.95322282104991e-13	176566161	176566161
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	176568986	193785530	5822	5472	-0.0012	2.95322282104991e-13	176566161	176566161	1.40114845962974e-26	193785530	193785530
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	193787655	193794411	4	4	-1.024	1.40114845962974e-26	193785530	193785530	9.4158596736083e-20	193794411	193794411
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	193797190	194354505	193	178	-0.0138	9.4158596736083e-20	193794411	193794411	0	194354505	194354505
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194358882	1	0	NA	0	194354505	194354505	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194360242	194366950	5	5	-4.3618	NA	NA	NA	0	194366950	194366950
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	194368145	1	0	NA	0	194366950	194366950	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194371608	198002627	1441	1347	-0.0135	NA	NA	NA	5.06938715403729e-13	197993509	198002627
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198003896	198035494	13	13	-0.4431	5.06938715403729e-13	197993509	198002627	1.83702566327705e-11	198035494	198041362
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198036999	199329592	525	487	-0.0277	1.83702566327705e-11	198035494	198041362	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	119798	30	30	0.0792	NA	NA	NA	8.87087143063042e-06	108016	147296
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	132913	250553	41	39	-0.175	8.87087143063042e-06	108016	147296	1.14322128814728e-07	214804	303462
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	252702	9815760	3322	3140	0.0195	1.14322128814728e-07	214804	303462	3.60037072490679e-12	9800777	9815760
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	0.7699	3.60037072490679e-12	9800777	9815760	1.02926226431547e-15	9842644	9842644
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	38982815	7518	7030	-0.0052	1.02926226431547e-15	9842644	9842644	4.64595662821058e-17	38962689	38994708
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	38984714	39093896	50	47	-0.2412	4.64595662821058e-17	38962689	38994708	2.89821118188593e-16	39076379	39108089
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	39096081	48407484	3160	2979	-0.0139	2.89821118188593e-16	39076379	39108089	1.50157240549626e-08	48407484	48407484
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	48414690	48415927	2	2	-0.8177	1.50157240549626e-08	48407484	48407484	1.89330716701011e-08	48415927	48418976
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	48418976	63346612	3096	2911	-0.0089	1.89330716701011e-08	48415927	48418976	3.18448033266586e-16	63346612	63346612
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	63357811	63358506	2	2	-1.1138	3.18448033266586e-16	63346612	63346612	7.10562475658376e-16	63358506	63358506
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	63360367	173224400	32415	30519	-0.0059	7.10562475658376e-16	63358506	63358506	6.59932672771166e-317	173224400	173224400
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-4.818	6.59932672771166e-317	173224400	173224400	0	173228860	173228860
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	175860235	938	879	-0.0069	0	173228860	173228860	2.08534890132689e-16	175860235	175860235
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175862084	175863396	2	2	1.0546	2.08534890132689e-16	175860235	175860235	2.36590531133793e-14	175863396	175863396
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175866055	187330240	3336	3138	-0.0068	2.36590531133793e-14	175863396	175863396	4.29796532483232e-227	187330240	187330240
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-4.1429	4.29796532483232e-227	187330240	187330240	2.50404677633076e-229	187333619	187333619
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1152	-0.0112	2.50404677633076e-229	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	155411053	45484	42847	0.0011	NA	NA	NA	2.42704885239414e-12	155405839	155411053
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155416484	155421443	4	4	0.7126	2.42704885239414e-12	155405839	155411053	2.17504378196976e-12	155421443	155427589
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155427589	174076796	6000	5654	0.0014	2.17504378196976e-12	155421443	155427589	1.59762175725510e-10	174067709	174086025
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	174078177	174125438	17	17	-0.3184	1.5976217572551e-10	174067709	174086025	6.51710795410356e-10	174112421	174155626
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	174131366	178278701	1326	1236	0.0028	6.51710795410356e-10	174112421	174155626	7.10402561564221e-07	178277302	178278701
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178281947	178283377	2	2	-0.7776	7.10402561564221e-07	178277302	178278701	2.64896418848294e-07	178283377	178286894
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178286894	180444863	850	805	0.0163	2.64896418848294e-07	178283377	178286894	2.50924685483788e-08	180441070	180444863
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180447292	180451252	2	2	-0.829	2.50924685483788e-08	180441070	180444863	1.24315683805552e-05	180451252	180459673
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180451904	180458805	2	0	NA	1.24315683805552e-05	180451252	180459673	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180459673	180644810	79	76	-0.0017	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	99130	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	109360	200350	39	35	0.0248	NA	NA	NA	1.93647448697462e-42	198124	200350
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	236535	14	13	0.8926	1.93647448697462e-42	198124	200350	7.55121028349914e-09	232366	241674
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	237952	326323	47	45	0.4899	7.55121028349914e-09	232366	241674	1.28926859177476e-66	322557	327962
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	17482872	6025	5689	0.0187	1.28926859177476e-66	322557	327962	4.37186642285263e-09	17482872	17482872
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	17486309	17488010	2	2	-0.8279	4.37186642285263e-09	17482872	17482872	1.24101433618783e-08	17488010	17488010
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	17490237	26811016	3238	3033	-0.0017	1.24101433618783e-08	17488010	17488010	1.87210302777752e-17	26801068	26811016
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26849722	26865624	6	6	-0.6707	1.87210302777752e-17	26801068	26811016	1.62405474744855e-18	26865624	26868404
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26868404	29941766	1214	1139	0.0121	1.62405474744855e-18	26865624	26868404	3.98632892178312e-14	29937319	29980445
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29950805	30005338	15	14	-0.3839	3.98632892178312e-14	29937319	29980445	8.28345480922883e-11	29992946	30025480
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30010234	31385778	581	546	0.0175	8.28345480922883e-11	29992946	30025480	3.05333129073057e-06	31377756	31389372
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31418006	6	6	0.4826	3.05333129073057e-06	31377756	31389372	1.41258435186524e-05	31393624	31429184
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	31977091	239	228	0.0402	1.41258435186524e-05	31393624	31429184	1.63341075051220e-07	31974220	31977091
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31979641	31982948	3	3	-0.6694	1.6334107505122e-07	31974220	31977091	7.74432929351904e-08	31982948	31988177
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31988177	32590568	252	233	0.0217	7.74432929351904e-08	31982948	31988177	3.87450528571594e-30	32590568	32595402
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32593151	32600962	4	4	-1.3138	3.87450528571594e-30	32590568	32595402	4.84396847309345e-41	32595402	32600962
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	49539700	6653	6236	0.0165	4.84396847309345e-41	32595402	32600962	1.37353926352787e-09	49535439	49544651
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	49542272	49556217	7	7	0.5121	1.37353926352787e-09	49535439	49544651	6.50834280060098e-12	49553252	49559737
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	49559737	54035000	1643	1552	0.0123	6.50834280060098e-12	49553252	49559737	0	54035000	54035000
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-4.3632	0	54035000	54035000	0	54042734	54042734
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	65767409	2398	2250	0.0145	0	54042734	54042734	7.14169517935444e-11	65767409	65767409
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65769146	65771532	2	2	-0.887	7.14169517935444e-11	65767409	65767409	3.08026019788971e-11	65771532	65771532
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65778663	72919733	2135	1992	0.0254	3.08026019788971e-11	65771532	65771532	7.22386155727045e-83	72919733	72919733
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72920894	72924440	3	2	-2.5599	7.22386155727045e-83	72919733	72919733	8.16536949655114e-60	72924440	72924440
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72931542	74647491	750	708	-0.006	8.16536949655114e-60	72924440	72924440	4.08970268274199e-08	74644381	74647491
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74650995	74653360	2	2	0.8282	4.08970268274199e-08	74644381	74647491	1.55878024779805e-07	74653360	74655219
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74655219	79018959	1142	1075	0.0156	1.55878024779805e-07	74653360	74655219	1.85547353973049e-49	79018959	79018959
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	12	-0.8159	1.85547353973049e-49	79018959	79018959	6.46367348178875e-59	79091850	79091850
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	83051086	1040	974	0.0067	6.46367348178875e-59	79091850	79091850	1.28649629962974e-10	83043114	83051086
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	83054210	83094464	7	7	0.4711	1.28649629962974e-10	83043114	83051086	9.50665692051673e-09	83094464	83101965
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	83098344	102039635	5225	4962	0.013	9.50665692051673e-09	83094464	83101965	3.94467268472149e-15	102039635	102041299
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102041299	102044331	3	3	-0.8954	3.94467268472149e-15	102039635	102041299	6.33294308524972e-16	102042870	102044331
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102046884	134629897	10971	10310	0.0114	6.33294308524972e-16	102042870	102044331	1.50930971925891e-17	134629897	134629897
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134631701	134631701	1	0	NA	1.50930971925891e-17	134629897	134629897	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134633117	134635779	3	3	-0.9381	NA	NA	NA	5.66565072478623e-17	134635779	134635779
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134639397	165643653	10622	9987	0.0109	5.66565072478623e-17	134635779	134635779	2.17914890060322e-131	165643653	165643653
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	2.2547	2.17914890060322e-131	165643653	165643653	1.12141223144101e-118	165650610	165650610
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1703	0.0134	1.12141223144101e-118	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	26398483	8918	8385	0.0061	NA	NA	NA	3.31599634409335e-23	26398483	26398483
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26400538	26400538	1	0	NA	3.31599634409335e-23	26398483	26398483	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26403038	26404540	2	2	1.3653	NA	NA	NA	1.05334442519921e-22	26404540	26404540
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26406021	141410894	40882	38405	0.0033	1.05334442519921e-22	26404540	26404540	1.30967094172981e-15	141408013	141414719
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	14	-0.428	1.30967094172981e-15	141408013	141414719	1.88417025612373e-14	141435643	141443577
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	142152205	293	279	0.0137	1.88417025612373e-14	141435643	141443577	6.84580712351869e-07	142136345	142152205
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142156165	142176074	7	7	0.4404	6.84580712351869e-07	142136345	142152205	4.67572500064275e-08	142176074	142187097
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142187073	143503317	485	455	0.0099	4.67572500064275e-08	142176074	142187097	8.51679004696828e-17	143503317	143503317
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143582864	143584350	3	3	-0.9269	8.51679004696828e-17	143503317	143503317	4.54656490186110e-15	143584350	143584350
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143705425	158804557	6087	5755	0.0052	4.5465649018611e-15	143584350	143584350	7.52619368530134e-07	158792914	158811268
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158811268	158821263	3	3	-0.6381	7.52619368530134e-07	158792914	158811268	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	116	0.0015	NA	NA	NA	5.27752501420522e-08	578009	581533
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-0.8491	5.27752501420522e-08	578009	581533	3.54271981553289e-08	588865	588865
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	25119007	8037	7557	-0.0052	3.54271981553289e-08	588865	588865	6.78190272835549e-34	25119007	25119007
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25120552	25123025	2	0	NA	6.78190272835549e-34	25119007	25119007	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	1.6625	NA	NA	NA	1.23325212063216e-32	25125700	25125700
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	28359363	1397	1321	-0.0073	1.23325212063216e-32	25125700	25125700	3.16358110609878e-16	28359363	28359363
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	28360586	28365703	3	3	-0.9767	3.16358110609878e-16	28359363	28359363	1.51767264209422e-19	28365703	28365703
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	28367785	39350798	3512	3314	-0.012	1.51767264209422e-19	28365703	28365703	0	39350798	39350798
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	58	0.9046	0	39350798	39350798	1.23796860492214e-292	39505256	39505256
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	51191560	2179	2061	-0.0106	1.23796860492214e-292	39505256	39505256	9.29175293276015e-17	51189068	51191560
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51193977	51200291	4	4	-0.845	9.29175293276015e-17	51189068	51191560	7.08119793197616e-18	51200291	51200291
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51202490	51202490	1	0	NA	7.08119793197616e-18	51200291	51200291	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51204788	146264846	29249	27483	-0.0018	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5148	-0.003	NA	NA	NA	8.42683556834545e-35	15802255	15802255
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	1.6346	8.42683556834545e-35	15802255	15802255	4.30445461662766e-35	15807123	15807123
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	23338535	2539	2394	-0.0049	4.30445461662766e-35	15807123	15807123	6.91813290000425e-15	23338535	23338535
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23343915	23365926	4	4	0.7589	6.91813290000425e-15	23338535	23338535	1.29098127387490e-13	23365926	23395558
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	23377660	1	0	NA	1.2909812738749e-13	23365926	23395558	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23395558	70926188	5068	4732	0.0028	NA	NA	NA	2.84253401285988e-205	70926188	70926188
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-4.0565	2.84253401285988e-205	70926188	70926188	2.41573015484039e-212	70930528	70930528
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	116124007	15468	14519	-0.0067	2.41573015484039e-212	70930528	70930528	7.57214143154668e-13	116124007	116124007
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-1.0321	7.57214143154668e-13	116124007	116124007	3.33500043327675e-13	116130333	116130333
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	116132839	1	0	NA	3.33500043327675e-13	116130333	116130333	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116137111	128592580	4665	4378	-0.0028	NA	NA	NA	5.49107803069977e-12	128549539	128619999
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	128594878	128725281	54	50	-0.2007	5.49107803069977e-12	128549539	128619999	1.75695538025173e-10	128699327	128762094
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	128726695	137347945	3574	3351	0.0104	1.75695538025173e-10	128699327	128762094	3.61522226972455e-19	137347945	137347945
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137352394	137352394	1	0	NA	3.61522226972455e-19	137347945	137347945	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.4117	NA	NA	NA	6.20761695496883e-17	137356880	137356880
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1037	-0.0089	6.20761695496883e-17	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	114100979	36987	34791	-0.007	NA	NA	NA	2.21710232323472e-51	114100979	114100979
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114103547	114106460	2	2	-2.0448	2.21710232323472e-51	114100979	114100979	1.54694926207953e-49	114106460	114106460
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114108041	135284109	7818	7343	0.0033	1.54694926207953e-49	114106460	114106460	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	135285645	135285645	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	92655841	30499	28637	5e-04	NA	NA	NA	9.482871055571e-12	92650420	92655841
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	92662312	92669239	3	3	-0.8195	9.482871055571e-12	92650420	92655841	1.91624668513588e-12	92669239	92669239
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	92685617	134450318	14802	13937	-0.0028	1.91624668513588e-12	92669239	92669239	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	736988	296	284	0.0301	NA	NA	NA	2.43482882667426e-07	734832	736988
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	738240	743223	4	4	-0.5435	2.43482882667426e-07	734832	736988	3.02300378011894e-07	743223	747365
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	745410	7897538	2951	2768	0.018	3.02300378011894e-07	743223	747365	2.02712429398227e-11	7875061	7905005
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7899058	7973198	29	27	0.2869	2.02712429398227e-11	7875061	7905005	2.42975386669227e-12	7962973	7985677
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7975671	9456107	460	432	0.0127	2.42975386669227e-12	7962973	7985677	2.96078234156031e-08	9412552	9528590
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9516067	9626623	19	17	-0.2697	2.96078234156031e-08	9412552	9528590	4.69544064399805e-09	9607363	9631798
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626736	11104973	566	528	0.0149	4.69544064399805e-09	9607363	9631798	2.65320342966066e-70	11104973	11104973
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11109483	11140421	11	11	1.0095	2.65320342966066e-70	11104973	11104973	1.22999173324033e-69	11140421	11140421
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	130943064	40273	37879	0.0124	1.22999173324033e-69	11140421	11140421	4.10126663470564e-15	130943064	130943064
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.13	4.10126663470564e-15	130943064	130943064	9.65187563373038e-13	130946248	130946248
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	517	0.0112	9.65187563373038e-13	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	114123340	31644	29765	-0.0064	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18544772	6	5	-0.2383	NA	NA	NA	5.22812560309689e-06	18508651	18864561
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	19490630	52	45	-0.7314	5.22812560309689e-06	18508651	18864561	7.46576274523117e-142	19489920	19490630
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19492531	20601371	543	503	-0.0151	7.46576274523117e-142	19489920	19490630	2.26227903314134e-06	20576934	20605595
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	20602821	20637904	20	19	0.1894	2.26227903314134e-06	20576934	20605595	0.00051435922699737	20631862	20701044
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	20639242	34674458	5129	4810	-0.0053	0.00051435922699737	20631862	20701044	1.87504672329045e-17	34674458	34674458
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	-0.9758	1.87504672329045e-17	34674458	34674458	1.10594347394554e-17	34683810	34683810
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	69086125	11875	11164	-0.0055	1.10594347394554e-17	34683810	34683810	1.13689066747979e-20	69086125	69086125
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69092211	3	3	1.0405	1.13689066747979e-20	69086125	69086125	4.82172976847861e-21	69092211	69092211
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69093444	73071404	1789	1666	-0.0064	4.82172976847861e-21	69092211	69092211	2.43340365955845e-44	73071404	73075500
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73092112	7	7	0.9858	2.43340365955845e-44	73071404	73075500	2.10488188388831e-39	73091980	73092112
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	79174722	2914	2723	-0.0043	2.10488188388831e-39	73091980	73092112	2.70423815158855e-159	79174722	79174722
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79176037	79180204	3	3	-3.1069	2.70423815158855e-159	79174722	79174722	5.35979387901074e-183	79180204	79180204
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79183154	79183154	1	0	NA	5.35979387901074e-183	79180204	79180204	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	85351640	1634	1524	-0.003	NA	NA	NA	6.30938783403078e-37	85351640	85351640
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	85356918	85381909	7	7	-0.8689	6.30938783403078e-37	85351640	85351640	5.82667012684807e-31	85381909	85381909
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	85390548	85390548	1	0	NA	5.82667012684807e-31	85381909	85381909	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	85398952	105597555	7655	7217	0.0034	NA	NA	NA	4.96284848595497e-15	105595302	105597555
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105625010	10	8	0.5783	4.96284848595497e-15	105595302	105597555	2.97232610763994e-11	105625010	105632168
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105630089	106358491	233	219	-0.0048	2.97232610763994e-11	105625010	105632168	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	19537035	99	95	-0.0456	NA	NA	NA	3.84025094200762e-21	19465359	19800789
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	19845942	11	11	0.4995	3.84025094200762e-21	19465359	19800789	9.5883021428971e-18	19845942	19845942
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19874677	19910696	4	4	-0.6387	9.5883021428971e-18	19845942	19845942	1.00100967180773e-22	19910696	19910696
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19927040	20088256	42	39	0.4206	1.00100967180773e-22	19910696	19910696	7.33746352105133e-43	20065525	20310916
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	75115806	21729	20418	-0.0054	7.33746352105133e-43	20065525	20310916	6.49276602940072e-108	75115806	75115806
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	-2.9696	6.49276602940072e-108	75115806	75115806	1.06216953448172e-113	75119713	75119713
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	98232932	8521	8020	6e-04	1.06216953448172e-113	75119713	75119713	1.59336388378799e-12	98232932	98232932
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98237721	2	2	1.011	1.59336388378799e-12	98232932	98232932	5.59404430907757e-13	98237721	98237721
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98239454	98239454	1	0	NA	5.59404430907757e-13	98237721	98237721	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	100298352	911	866	-0.0036	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	2587173	1010	958	0.0123	NA	NA	NA	5.52948959248461e-06	2576804	2593067
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2589724	2639798	6	6	0.4821	5.52948959248461e-06	2576804	2593067	8.20399508033928e-08	2638581	2660804
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2649851	32379126	9557	8958	-0.003	8.20399508033928e-08	2638581	2660804	6.30173117663532e-112	31862577	32515876
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33559207	45	42	0.6659	6.30173117663532e-112	31862577	32515876	2.16899432473804e-107	33536526	33647856
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33647856	54352394	3078	2903	0.0032	2.16899432473804e-107	33536526	33647856	2.84671065488062e-12	54343465	54363713
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54353978	54379839	10	10	-0.462	2.84671065488062e-12	54343465	54363713	1.79970306901264e-11	54365385	54399890
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	57203733	1203	1129	0.0109	1.79970306901264e-11	54365385	54399890	1.23920283306167e-12	57203733	57203733
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	1.1027	1.23920283306167e-12	57203733	57203733	5.3385993674072e-16	57206772	57206772
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	57208375	1	0	NA	5.3385993674072e-16	57206772	57206772	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57211203	67357217	2791	2636	0.0029	NA	NA	NA	1.23459503734879e-07	67353956	67357217
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	67360714	67362275	2	2	-0.7696	1.23459503734879e-07	67353956	67357217	2.20160484410080e-06	67362275	67364387
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	67364387	74095899	2517	2377	-0.0137	2.2016048441008e-06	67362275	67364387	6.9621728350519e-07	74083479	74116017
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	74097511	74097511	1	0	NA	6.9621728350519e-07	74083479	74116017	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	74099704	74134999	16	16	-0.2921	NA	NA	NA	3.0920248433074e-10	74117457	74148860
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	74137609	75093957	284	272	9e-04	3.0920248433074e-10	74117457	74148860	1.85236713222224e-60	75093957	75093957
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	-1.8779	1.85236713222224e-60	75093957	75093957	6.00249255266502e-44	75100865	75100865
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	576	-0.007	6.00249255266502e-44	75100865	75100865	1.40796097801561e-92	76925748	76925748
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	1.3695	1.40796097801561e-92	76925748	76925748	1.64927803266879e-90	76940218	76940218
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	83858867	2690	2524	0.0084	1.64927803266879e-90	76940218	76940218	5.43175730589242e-10	83858867	83858867
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	83860254	83861596	2	2	-0.9152	5.43175730589242e-10	83858867	83858867	8.00727752443293e-08	83861596	83864368
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	83864368	88690571	1821	1705	-0.0032	8.00727752443293e-08	83861596	83864368	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1903358	853	804	-0.0074	NA	NA	NA	5.73569804067163e-12	1903358	1903358
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1904451	1904451	1	0	NA	5.73569804067163e-12	1903358	1903358	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906319	1906391	3	3	0.8643	NA	NA	NA	1.67248768063884e-12	1906391	1906391
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	36673853	13014	12223	-0.0016	1.67248768063884e-12	1906391	1906391	1.74723441168272e-153	36673853	36673853
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	5	2.2844	1.74723441168272e-153	36673853	36673853	2.79964167681564e-141	36684619	36684619
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41519702	2011	1879	0.0029	2.79964167681564e-141	36684619	36684619	5.92280349721605e-222	41518222	41519702
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41521544	1	0	NA	5.92280349721605e-222	41518222	41519702	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41522429	41648545	58	53	-0.886	NA	NA	NA	1.22739527769216e-241	41648545	41648545
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41652861	62868652	7757	7281	-0.0089	1.22739527769216e-241	41648545	41648545	7.30125062734602e-15	62867799	62868652
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	62869966	62874348	5	4	-0.815	7.30125062734602e-15	62867799	62868652	5.90051341018463e-14	62874348	62876193
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	62875265	62875265	1	0	NA	5.90051341018463e-14	62874348	62876193	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	62876193	78653545	5924	5556	-0.0042	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76113758	22963	21644	-0.0046	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	76116026	76116026	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	456	-0.0092	NA	NA	NA	2.43663946079359e-16	1398325	1398325
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.3115	2.43663946079359e-16	1398325	1398325	3.6857198337496e-17	1400840	1400840
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	1899612	233	217	-0.0213	3.6857198337496e-17	1400840	1400840	8.53904408270687e-08	1898132	1899612
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1901483	1903590	2	2	-0.9259	8.53904408270687e-08	1898132	1899612	1.79941349175326e-08	1903590	1907897
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1907897	56823430	19144	17974	-0.0074	1.79941349175326e-08	1903590	1907897	2.54853392084295e-27	56822197	56823430
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	8	-0.805	2.54853392084295e-27	56822197	56823430	5.86473447897056e-28	56840346	56842447
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	58208527	586	544	-0.0292	5.86473447897056e-28	56840346	56842447	1.18626177785422e-10	58201323	58213220
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58212113	58239871	13	12	-0.4272	1.18626177785422e-10	58201323	58213220	3.25376235542831e-09	58234974	58247367
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58241773	59414645	574	539	-0.01	3.25376235542831e-09	58234974	58247367	2.91767920484546e-08	59406523	59414645
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59414898	59440262	12	11	0.4029	2.91767920484546e-08	59406523	59414645	3.63774982525806e-07	59440262	59441741
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440274	59491509	21	20	0.0696	3.63774982525806e-07	59440262	59441741	1.96501586953552e-18	59488537	59491509
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59492650	59497049	2	2	-0.8932	1.96501586953552e-18	59488537	59491509	1.38101891680907e-08	59497049	59500575
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59500575	63788698	1970	1844	-0.0102	1.38101891680907e-08	59497049	59500575	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1511632	587	552	0.005	NA	NA	NA	9.18493217067486e-192	1511632	1515948
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1515948	1531162	8	7	-2.4456	9.18493217067486e-192	1511632	1515948	3.49348265881116e-256	1528899	1531162
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	51906833	17177	16118	-0.0022	3.49348265881116e-256	1528899	1531162	5.11168898235287e-14	51906833	51906833
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	51910029	51916264	3	3	0.8907	5.11168898235287e-14	51906833	51906833	7.50790612373793e-20	51916264	51916264
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	51917762	52080395	66	61	0.0131	7.50790612373793e-20	51916264	51916264	7.13496365207883e-17	52080395	52080395
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52081719	52086193	2	2	-0.9587	7.13496365207883e-17	52080395	52080395	0.119919940441256	52086193	52087787
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52087787	52090393	3	3	-0.8015	0.119919940441256	52086193	52087787	8.87231205800926e-11	52090393	52092989
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52092989	62419534	3733	3495	0.0097	8.87231205800926e-11	52090393	52092989	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12639	-0.0052	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	16521073	406	380	-0.0216	NA	NA	NA	3.94582789208698e-12	16521073	16521073
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16523019	16524408	2	2	-1.0948	3.94582789208698e-12	16521073	16521073	1.57306005135438e-12	16524408	16524408
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16525922	22667608	2575	2424	0.0068	1.57306005135438e-12	16524408	16524408	2.29858906820737e-69	22667608	22677959
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	20	0.8194	2.29858906820737e-69	22667608	22677959	4.18985677105716e-73	22720195	22725305
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	32110063	5042	4726	0.0065	4.18985677105716e-73	22720195	22725305	6.0064689078962e-10	32110063	32110063
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	32110939	32112051	2	2	-0.9621	6.0064689078962e-10	32110063	32110063	1.06838447565653e-09	32112051	32112051
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	32114341	49571068	8508	7984	0.0122	1.06838447565653e-09	32112051	32112051	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.1035	NA	NA	NA	3.47478518721759e-16	94062	94062
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	-1.4628	3.47478518721759e-16	94062	94062	1.59288089285376e-69	104486	104732
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	849437	556	519	-0.0062	1.59288089285376e-69	104486	104732	5.96173418457595e-17	848806	849437
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	851066	856655	6	5	0.8382	5.96173418457595e-17	848806	849437	8.10571303282005e-18	856655	856655
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	859452	859452	1	0	NA	8.10571303282005e-18	856655	856655	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	859493	2426938	964	897	-0.0445	NA	NA	NA	4.98703701327828e-15	2426938	2426938
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2428167	2428307	2	2	1.2385	4.98703701327828e-15	2426938	2426938	2.7904190849623e-18	2428307	2428307
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2430156	2672401	224	210	-0.0063	2.7904190849623e-18	2428307	2428307	1.16051124810312e-07	2667362	2692498
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672477	2708291	27	27	-0.2514	1.16051124810312e-07	2667362	2692498	2.09084627940081e-127	2708291	2711273
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	8432497	1781	1677	0.8847	2.09084627940081e-127	2708291	2711273	5.40532011284222e-16	8411159	8449254
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8437023	8466917	17	17	0.5215	5.40532011284222e-16	8411159	8449254	1.44199486879850e-13	8452395	8481280
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8473482	8473482	1	0	NA	1.4419948687985e-13	8452395	8481280	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8475091	16143829	3283	3091	0.936	NA	NA	NA	5.57810739397081e-10	16141841	16143829
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	16152777	16157558	2	2	-0.0997	5.57810739397081e-10	16141841	16143829	1.52360693564660e-10	16157558	16157558
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	16167006	37105142	7704	7248	0.943	1.5236069356466e-10	16157558	16157558	1.15340081363054e-171	37100844	37109878
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	37107088	37419023	141	131	1.454	1.15340081363054e-171	37100844	37109878	7.87067844302887e-162	37416476	37422234
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	37420183	154582414	32205	30223	0.9244	7.87067844302887e-162	37416476	37422234	0	154578922	154582414
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	190	0.0096	0	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	2775895	28	27	-4.5835	NA	NA	NA	7.09724780671286e-06	2769294	2775895
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2777308	2784560	7	6	-2.341	7.09724780671286e-06	2769294	2775895	1.66827641129559e-06	2784560	2792940
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2787638	3223585	88	84	-4.2583	1.66827641129559e-06	2784560	2792940	1.83704350823863e-50	3223585	3223585
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3733715	1	0	NA	1.83704350823863e-50	3223585	3223585	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	4431527	10	10	-0.1135	NA	NA	NA	7.68136018235052e-05	4421500	4846477
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4597974	5593746	6	6	-1.6278	7.68136018235052e-05	4421500	4846477	0.00832888257317694	5531459	6765103
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6953343	118	108	-3.8184	0.00832888257317694	5531459	6765103	0.000623183835570649	6900119	7016002
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6954864	7266323	115	107	-2.9656	0.000623183835570649	6900119	7016002	0.000176837646261042	7242656	7277048
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7267235	7304209	19	17	-1.3177	0.000176837646261042	7242656	7277048	0.00126992923851960	7294545	7340782
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7305143	7495687	51	48	-2.8148	0.0012699292385196	7294545	7340782	0.00641243933704867	7386947	7655293
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7723783	75	71	-3.7881	0.00641243933704867	7386947	7655293	0.0181671581301533	7698960	7723783
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7733351	4	4	-1.3732	0.0181671581301533	7698960	7723783	0.072838762922321	7729757	7756907
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7734410	7782532	14	12	-2.2116	0.072838762922321	7729757	7756907	0.0335708486134648	7776265	7911990
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	8016395	63	60	-3.3245	0.0335708486134648	7776265	7911990	6.75214623371797e-08	7942730	8057124
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8036254	8289709	62	53	-4.4898	6.75214623371797e-08	7942730	8057124	1.68786382398350e-06	8230756	8335081
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8292347	8820252	159	150	-3.5796	1.6878638239835e-06	8230756	8335081	3.32155844436466e-06	8714581	8921205
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8823361	8823361	1	0	NA	3.32155844436466e-06	8714581	8921205	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8824539	10515697	145	132	-4.2614	NA	NA	NA	3.16132826971802e-37	10513747	10537808
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	11698871	18	17	-0.8062	3.16132826971802e-37	10513747	10537808	4.47090759086832e-21	11660512	11698871
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12452734	1	0	NA	4.47090759086832e-21	11660512	11698871	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12541506	11	10	-4.5843	NA	NA	NA	1.13753697954492e-06	12541506	12554612
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	13129843	190	177	-2.2655	1.13753697954492e-06	12541506	12554612	6.71880985649358e-05	13100625	13137597
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13155705	14	14	-3.9825	6.71880985649358e-05	13100625	13137597	0.0346222138022202	13147329	13202163
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13158272	13158272	1	0	NA	0.0346222138022202	13147329	13202163	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13159901	13254711	26	24	-2.9411	NA	NA	NA	8.32508078267127e-09	13236901	13281871
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13256555	14352278	370	347	-4.2597	8.32508078267127e-09	13236901	13281871	3.68739902195264e-17	14323815	14376942
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14353244	14508021	93	85	-3.1488	3.68739902195264e-17	14323815	14376942	3.88764235680314e-07	14500052	14536962
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	3.88764235680314e-07	14500052	14536962	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	22	-1.444	NA	NA	NA	2.95458434365378e-06	14566592	14581797
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14597771	5	5	-4.4802	2.95458434365378e-06	14566592	14581797	1.23804537519429e-11	14597771	14597771
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14598838	14598838	1	0	NA	1.23804537519429e-11	14597771	14597771	NA	NA	NA
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14601309	14644293	4	4	-0.6264	NA	NA	NA	4.95064788755637e-07	14644293	14681738
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	14707011	19	17	-3.0542	4.95064788755637e-07	14644293	14681738	0.000319954975065472	14701706	14731122
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14708015	14958284	50	46	-4.2774	0.000319954975065472	14701706	14731122	5.91959932667528e-05	14899294	15103953
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14969835	15299931	125	119	-3.2677	5.91959932667528e-05	14899294	15103953	1.86417462231956e-11	15280555	15304956
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15301380	15388044	56	50	-4.671	1.86417462231956e-11	15280555	15304956	1.43078802630353e-06	15379192	15417398
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15389388	15915466	157	146	-3.642	1.43078802630353e-06	15379192	15417398	3.73684078737921e-08	15810752	15958396
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16067790	58	55	-2.4313	3.73684078737921e-08	15810752	15958396	0.000131877945435392	16018437	16096672
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16068838	16371504	101	92	-3.4175	0.000131877945435392	16018437	16096672	0.0632829606019348	16165328	16377188
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16377188	16387273	3	3	-1.4578	0.0632829606019348	16165328	16377188	0.00683039139194104	16380639	16430865
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	22139807	938	871	-4.0071	0.00683039139194104	16380639	16430865	2.95790518850802e-05	22041876	22157319
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-2.0614	2.95790518850802e-05	22041876	22157319	1.52159503391320e-10	22177335	22182080
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22924754	91	80	-4.4577	1.5215950339132e-10	22177335	22182080	9.26149505488657e-70	22923722	23283689
MSK_252152916804_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22926726	57440809	88	78	-1.2471	9.26149505488657e-70	22923722	23283689	NA	NA	NA
