Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	16838573	5788	5416	0.0222	NA	NA	NA	5.3376276166275e-16	16814050	16926444
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16888048	17148592	20	19	-0.4213	5.3376276166275e-16	16814050	16926444	6.8745138430685e-15	17107476	17158730
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17154037	24389046	3025	2813	0.01	6.8745138430685e-15	17107476	17158730	6.20781823120234e-11	24389046	24389046
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	24391166	24391166	1	0	NA	6.20781823120234e-11	24389046	24389046	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	24394076	24395691	2	2	-1.1284	NA	NA	NA	4.83929947812479e-12	24395691	24395691
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	24397212	72537426	19058	17819	0.0039	4.83929947812479e-12	24395691	24395691	4.44229631872090e-96	72537426	72537426
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72541443	3	0	NA	4.4422963187209e-96	72537426	72537426	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72543019	72574479	10	4	-2.1911	NA	NA	NA	3.88069530761646e-102	72574479	72574479
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72579311	72579311	1	0	NA	3.88069530761646e-102	72574479	72574479	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	76730138	1210	1121	0.0018	NA	NA	NA	1.04381525296884e-13	76730138	76730138
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	76731333	76732469	2	2	-1.1514	1.04381525296884e-13	76730138	76730138	7.91982065572285e-14	76732469	76732469
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	76733667	85745222	2832	2644	0.0074	7.91982065572285e-14	76732469	76732469	2.34355205487176e-09	85736538	85756293
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	85753561	85778723	14	13	-0.3704	2.34355205487176e-09	85736538	85756293	4.80690924822969e-09	85772922	85785843
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	85781420	103929627	6059	5663	-0.0017	4.80690924822969e-09	85772922	85785843	1.03200648017813e-21	103929627	103929627
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103932025	103932025	1	0	NA	1.03200648017813e-21	103929627	103929627	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103956767	104012520	3	3	-1.1675	NA	NA	NA	2.73957572814887e-21	104012520	104012520
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	104108153	110023268	1582	1488	-0.0055	2.73957572814887e-21	104012520	104012520	1.48775745575120e-12	110023268	110023268
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110039388	3	3	-0.9053	1.4877574557512e-12	110023268	110023268	3.39005322371929e-12	110039388	110039388
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	110041712	1	0	NA	3.39005322371929e-12	110039388	110039388	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	144322074	4109	3858	-0.001	NA	NA	NA	1.18953746033929e-214	144322074	144322074
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144337287	144544352	60	53	-0.8864	1.18953746033929e-214	144322074	144322074	1.54751197662857e-183	144544352	144544352
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144970789	147346399	395	376	-0.025	1.54751197662857e-183	144544352	144544352	9.03922068724522e-09	147306304	147381641
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147352661	147497268	25	23	0.2574	9.03922068724522e-09	147306304	147381641	2.36462322044687e-08	147467273	148081769
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147508217	150819879	1260	1185	-0.0034	2.36462322044687e-08	147467273	148081769	1.48767456308816e-235	150819879	150819879
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	11	1.9589	1.48767456308816e-235	150819879	150819879	2.12008029620231e-173	150851439	150851439
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	75	0.0041	2.12008029620231e-173	150851439	150851439	1.9955897533335e-14	151026228	151026228
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.7955	1.9955897533335e-14	151026228	151026228	1.68273289541937e-11	151036435	151038091
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	161099582	4303	3978	0.0048	1.68273289541937e-11	151036435	151038091	1.50766215880660e-21	161099582	161099582
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161104752	161104791	2	2	-1.508	1.5076621588066e-21	161099582	161099582	1.54368459882229e-23	161104791	161104791
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161108722	173060997	4669	4354	-0.0097	1.54368459882229e-23	161104791	161104791	0	173060997	173060997
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	173063537	173067337	3	3	-5.2488	0	173060997	173060997	0	173067337	173067337
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	173068576	195009358	7001	6540	-0.0011	0	173067337	173067337	5.01796705706659e-35	194978218	195015837
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195011344	195115164	17	15	-0.6524	5.01796705706659e-35	194978218	195015837	5.79856316324008e-33	195104207	195119691
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195119691	200613454	2154	2014	0.0059	5.79856316324008e-33	195104207	195119691	6.72936683385039e-19	200598243	200613454
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200616638	200672373	22	19	-0.4364	6.72936683385039e-19	200598243	200613454	6.27775694836937e-18	200672373	200679934
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200673525	231749868	11443	10721	-1e-04	6.27775694836937e-18	200672373	200679934	1.17337326748917e-18	231749868	231749868
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	231756594	231775293	4	4	-0.9692	1.17337326748917e-18	231749868	231749868	1.16131274868060e-18	231775293	231775293
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	231780827	231780827	1	0	NA	1.1613127486806e-18	231775293	231775293	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	231787259	246794552	5848	5488	-0.0141	NA	NA	NA	3.84906591761512e-117	246794552	246794552
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246805521	246862029	26	25	-0.9589	3.84906591761512e-117	246794552	246794552	2.93863161737932e-26	246860551	246863179
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246863179	246931601	20	19	-0.0502	2.93863161737932e-26	246860551	246863179	4.13315060624510e-10	246928454	246931601
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246933929	246940630	5	5	-1.0901	4.1331506062451e-10	246928454	246931601	5.07956567945156e-30	246940630	246940630
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246941904	247186514	73	70	-0.0098	5.07956567945156e-30	246940630	246940630	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	52600588	18732	17496	-0.0024	NA	NA	NA	0	52600588	52600588
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	4	-5.1282	0	52600588	52600588	0	52635695	52635695
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	66357387	4557	4240	-0.006	0	52635695	52635695	8.5333246910435e-21	66357387	66357387
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	1.3796	8.5333246910435e-21	66357387	66357387	1.35047856028879e-19	66360747	66360747
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	242689978	54531	50936	-0.0022	1.35047856028879e-19	66360747	66360747	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	29579582	9989	9334	-0.0024	NA	NA	NA	5.76608283125547e-12	29579582	29579582
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	29581512	29583050	2	0	NA	5.76608283125547e-12	29579582	29579582	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	29586593	29594534	2	2	-1.0796	NA	NA	NA	1.24280917919214e-11	29594534	29594534
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	29595898	47460892	6225	5803	0.0015	1.24280917919214e-11	29594534	29594534	3.36623190779612e-266	47460892	47460892
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	-5.0299	3.36623190779612e-266	47460892	47460892	7.00887449947787e-242	47466921	47466921
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	58767266	4869	4529	0.0118	7.00887449947787e-242	47466921	47466921	8.40511685106854e-09	58765745	58767266
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	58773503	58775000	3	2	-0.9824	8.40511685106854e-09	58765745	58767266	3.09906398966967e-10	58775000	58775000
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	58783419	99891210	11091	10367	-0.0036	3.09906398966967e-10	58775000	58775000	6.88514342130869e-246	99891210	99891210
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-4.6417	6.88514342130869e-246	99891210	99891210	1.61186497718541e-244	99897201	99897201
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	116136208	5046	4729	-6e-04	1.61186497718541e-244	99897201	99897201	7.12860729769843e-15	116133980	116136208
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	116137442	116137442	1	0	NA	7.12860729769843e-15	116133980	116136208	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	116140997	116146946	4	4	-0.8265	NA	NA	NA	1.46692324292473e-13	116146946	116155373
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	116155373	133189686	6473	6050	-0.005	1.46692324292473e-13	116146946	116155373	8.17904704661608e-12	133189686	133189686
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.0829	8.17904704661608e-12	133189686	133189686	6.20115907730375e-12	133194685	133194685
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	145508936	4332	4085	-0.0077	6.20115907730375e-12	133194685	133194685	2.12634464358262e-08	145506618	145508936
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	145516371	145523655	2	2	0.9156	2.12634464358262e-08	145506618	145508936	5.18886163925344e-09	145523655	145523655
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	145534234	164005577	5446	5088	-0.003	5.18886163925344e-09	145523655	145523655	5.8957149453991e-34	164005577	164005577
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	1.0985	5.8957149453991e-34	164005577	164005577	3.21322772469813e-32	164027724	164027724
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	194354505	10150	9464	-0.0044	3.21322772469813e-32	164027724	164027724	5.38080776167481e-51	194354505	194358882
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	4	1.5426	5.38080776167481e-51	194354505	194358882	2.32350773904078e-46	194365648	194366950
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196820428	995	924	-0.0107	2.32350773904078e-46	194365648	194366950	5.74791862532994e-26	196807153	196904349
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196822133	196822133	1	0	NA	5.74791862532994e-26	196807153	196904349	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196957322	29	28	-0.4509	NA	NA	NA	3.1541841611944e-25	196950095	196964180
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196958467	199329592	955	892	-0.0064	3.1541841611944e-25	196950095	196964180	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	34445002	9564	8952	0.006	NA	NA	NA	0	34445002	34445002
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	-5.3944	0	34445002	34445002	0	34491115	34491115
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	70150576	8994	8398	-0.0086	0	34491115	34491115	1.26272688803793e-20	70150576	70150576
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70190682	70216707	4	4	-0.9863	1.26272688803793e-20	70150576	70150576	3.51923728043331e-21	70216707	70216707
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70294312	88752705	6464	6011	-0.0062	3.51923728043331e-21	70216707	70216707	1.27034224237570e-15	88752705	88752705
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88754121	88756721	2	2	-1.203	1.2703422423757e-15	88752705	88752705	6.56977285773459e-16	88756721	88756721
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88757953	152248437	18416	17193	-0.0049	6.56977285773459e-16	88756721	88756721	1.78743367718784e-17	152248437	152248437
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	152249965	152252263	2	2	-1.2576	1.78743367718784e-17	152248437	152248437	5.25625342405539e-17	152252263	152252263
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	152252336	173224400	6188	5796	-0.0072	5.25625342405539e-17	152252263	152252263	1.89424511148852e-258	173224400	173224400
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-4.7914	1.89424511148852e-258	173224400	173224400	2.84299582104948e-257	173228860	173228860
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	191153613	5519	5152	-0.0042	2.84299582104948e-257	173228860	173228860	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	12857302	3975	3719	0.0036	NA	NA	NA	5.32566786062188e-253	12857302	12857302
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	-5.045	5.32566786062188e-253	12857302	12857302	1.27018846703006e-281	12873052	12873052
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	155405839	41506	38821	-0.0047	1.27018846703006e-281	12873052	12873052	2.68998183362346e-09	155404062	155405839
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155411053	155421443	5	5	0.606	2.68998183362346e-09	155404062	155405839	6.9201339541798e-09	155421443	155427589
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155427589	178040439	7248	6759	0.0011	6.9201339541798e-09	155421443	155427589	8.76940463912832e-11	178040439	178040439
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178044111	178045608	2	2	-1.046	8.76940463912832e-11	178040439	178040439	2.69010034608035e-10	178045608	178045608
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178047480	178047480	1	0	NA	2.69010034608035e-10	178045608	178045608	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178053491	180644810	1027	957	0.0233	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	38	-0.0301	NA	NA	NA	3.71464421450874e-11	186875	210326
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	268978	31	30	0.3782	3.71464421450874e-11	186875	210326	1.76491433006470e-22	259527	276159
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	271851	26717221	9268	8699	-0.0011	1.7649143300647e-22	259527	276159	6.01104526070341e-10	26717221	26717221
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26719980	26723296	2	2	-0.9946	6.01104526070341e-10	26717221	26717221	1.34554065628471e-09	26723296	26723296
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26727076	29937319	1243	1161	-0.0074	1.34554065628471e-09	26723296	26723296	1.02331105732044e-07	29922876	29973024
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29939288	30010234	18	18	-0.3081	1.02331105732044e-07	29922876	29973024	1.09716276642239e-07	29992946	30033946
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30021908	31385778	580	546	0.0136	1.09716276642239e-07	29992946	30033946	1.04352134676551e-10	31382291	31387708
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31418006	6	6	-0.6261	1.04352134676551e-10	31382291	31387708	5.78659547249991e-09	31395330	31425144
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	31889575	199	190	0.0026	5.78659547249991e-09	31395330	31425144	2.55763797657377e-25	31887126	31889575
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31893557	31902818	6	6	-1.0462	2.55763797657377e-25	31887126	31889575	1.24165350733288e-34	31902818	31902818
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31905636	32558677	284	270	0.0251	1.24165350733288e-34	31902818	31902818	2.77024981932445e-66	32558677	32558677
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32588005	4	0	NA	2.77024981932445e-66	32558677	32558677	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32590568	32600962	5	5	-1.6726	NA	NA	NA	6.28418457424526e-61	32600962	32600962
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	35862502	1390	1296	-0.0015	6.28418457424526e-61	32600962	32600962	1.37680144396456e-12	35862270	35864636
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35864636	35873335	6	6	-0.6998	1.37680144396456e-12	35862270	35864636	9.60774775009588e-16	35872078	35875112
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35875112	54035000	6907	6471	0.003	9.60774775009588e-16	35872078	35875112	1.23156080914642e-309	54035000	54035000
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-4.333	1.23156080914642e-309	54035000	54035000	2.00609280680742e-309	54042734	54042734
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	66453686	2632	2471	-0.0075	2.00609280680742e-309	54042734	54042734	2.76489022518644e-09	66453686	66453686
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	66456250	66460548	2	2	-0.9406	2.76489022518644e-09	66453686	66453686	4.37754105487638e-09	66460548	66460548
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	66461980	77490500	3516	3292	-0.004	4.37754105487638e-09	66460548	66460548	5.6283990148104e-223	77490500	77490500
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77499382	77509983	3	3	-3.6853	5.6283990148104e-223	77490500	77490500	1.15642341655042e-227	77509983	77509983
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77517630	102039635	6564	6147	-0.003	1.15642341655042e-227	77509983	77509983	0	102039635	102039635
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102041299	102044331	3	3	-4.4492	0	102039635	102039635	1.24203162708031e-319	102044331	102044331
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102046884	103841482	487	463	0.0208	1.24203162708031e-319	102044331	102044331	9.16079347429673e-09	103827105	103841482
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	3	0.7773	9.16079347429673e-09	103827105	103841482	2.85705208041489e-09	103868154	103873584
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	165643653	21106	19659	-0.0071	2.85705208041489e-09	103868154	103873584	5.15002858310178e-50	165643653	165643653
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.5133	5.15002858310178e-50	165643653	165643653	2.66295168077052e-41	165650610	165650610
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1680	-0.0052	2.66295168077052e-41	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	244720	40	34	0.089	NA	NA	NA	5.06776610768268e-25	244720	244720
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	246786	254342	5	5	-1.0444	5.06776610768268e-25	244720	244720	1.38856424816564e-27	254342	254342
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	256802	256802	1	0	NA	1.38856424816564e-27	254342	254342	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	258293	109967918	35221	32829	-0.0019	NA	NA	NA	1.66969733148223e-09	109967918	109967918
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109970524	109974402	2	2	-1.0026	1.66969733148223e-09	109967918	109967918	1.15228370541065e-10	109974402	109974402
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109976628	120089714	4603	4287	-0.0032	1.15228370541065e-10	109974402	109974402	4.59929959001436e-19	120087494	120089714
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	120092153	120098907	5	4	-0.9372	4.59929959001436e-19	120087494	120089714	7.01468047513828e-17	120098907	120101979
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	120101979	131424513	5219	4844	-0.0016	7.01468047513828e-17	120098907	120101979	3.05832689534529e-16	131424513	131424513
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	131426580	131429932	3	3	-1.0622	3.05832689534529e-16	131424513	131424513	1.41966881965004e-17	131429932	131429932
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	131431668	141406414	4701	4427	-0.0024	1.41966881965004e-17	131429932	131429932	9.97882983619804e-10	141398471	141419692
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141408013	141440184	17	16	-0.3495	9.97882983619804e-10	141398471	141419692	2.81374714927374e-07	141429405	141449014
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141690753	116	109	-0.0038	2.81374714927374e-07	141429405	141449014	6.84156922210172e-74	141690753	141690753
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	1.2239	6.84156922210172e-74	141690753	141690753	1.80603536989456e-77	141714168	141714168
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	143503317	659	615	0.0177	1.80603536989456e-77	141714168	141714168	6.9469335818072e-19	143503317	143503317
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143582864	143584350	3	3	-1.0823	6.9469335818072e-19	143503317	143503317	3.09446753916311e-19	143584350	143584350
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143705425	146350117	1173	1091	-0.0041	3.09446753916311e-19	143584350	143584350	1.81378446659016e-11	146350117	146350117
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	146351946	146353730	2	2	-1.0309	1.81378446659016e-11	146350117	146350117	2.75120540993814e-09	146353730	146353730
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	146356235	158821263	4915	4581	-0.0038	2.75120540993814e-09	146353730	146353730	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	107	0.0087	NA	NA	NA	1.98355149602724e-32	581533	581533
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	2.1267	1.98355149602724e-32	581533	581533	8.7916851446486e-42	588865	588865
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	2137441	591	545	0.0273	8.7916851446486e-42	588865	588865	1.22002657928969e-12	2137441	2137441
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2139449	2145922	3	3	-0.9234	1.22002657928969e-12	2137441	2137441	1.80638812305398e-12	2145922	2145922
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2150932	25119007	7443	6998	-0.0035	1.80638812305398e-12	2145922	2145922	3.8870472422961e-42	25119007	25119007
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25120552	25120552	1	0	NA	3.8870472422961e-42	25119007	25119007	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25125700	3	3	1.6569	NA	NA	NA	1.39710038742197e-45	25125700	25125700
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	39350798	4912	4589	-0.0063	1.39710038742197e-45	25125700	25125700	8.79437384004973e-281	39350798	39350798
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	55	0.9566	8.79437384004973e-281	39350798	39350798	3.6562833813012e-280	39505256	39505256
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	81614517	11210	10476	-0.0086	3.6562833813012e-280	39505256	39505256	4.19162881162072e-15	81611611	81614517
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	81616010	81628983	8	8	0.5915	4.19162881162072e-15	81611611	81614517	3.76405871631718e-14	81628983	81632971
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	81631734	146264846	20215	18943	-0.0013	3.76405871631718e-14	81628983	81632971	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	22477358	7837	7305	-0.007	NA	NA	NA	3.17919010755923e-22	22477358	22477358
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	1.3968	3.17919010755923e-22	22477358	22477358	3.69452844507605e-17	22492603	22492603
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	23343915	161	154	0.0076	3.69452844507605e-17	22492603	22492603	3.34109572419021e-08	23338535	23343915
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	0.797	3.34109572419021e-08	23338535	23343915	1.16716025947933e-09	23365926	23377660
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	70926188	5069	4707	0.0012	1.16716025947933e-09	23365926	23377660	1.27345328645633e-163	70926188	70926188
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-3.8922	1.27345328645633e-163	70926188	70926188	1.12269503820341e-160	70930528	70930528
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	116124007	15468	14424	-0.009	1.12269503820341e-160	70930528	70930528	2.63888368380453e-11	116124007	116124007
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-1.0728	2.63888368380453e-11	116124007	116124007	6.98450460505994e-10	116130333	116132839
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	140145683	9400	8758	0.0062	6.98450460505994e-10	116130333	116132839	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	13553503	4682	4378	-0.0034	NA	NA	NA	8.9386289058863e-07	13551930	13553503
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13555034	13556315	2	2	-0.8549	8.9386289058863e-07	13551930	13553503	9.86261646395324e-07	13556315	13557998
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13557998	53683740	11618	10863	-0.0107	9.86261646395324e-07	13556315	13557998	4.10847440637323e-09	53678550	53686515
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53686515	53691276	4	4	0.6748	4.10847440637323e-09	53678550	53686515	2.93127528622989e-08	53689554	53695083
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53695083	135285645	28502	26663	-7e-04	2.93127528622989e-08	53689554	53695083	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	66463477	21582	20099	0.0038	NA	NA	NA	2.15360543552123e-67	66463477	66463477
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	-2.5926	2.15360543552123e-67	66463477	66463477	1.50005686511776e-64	66469412	66469412
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	81530809	5315	4962	0.0044	1.50005686511776e-64	66469412	66469412	2.36825376429658e-08	81524127	81530809
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81536990	81540765	3	3	-0.7825	2.36825376429658e-08	81524127	81530809	2.34583219567922e-09	81540765	81544262
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81544262	92337729	3514	3272	-0.0098	2.34583219567922e-09	81540765	81544262	1.36204789791355e-10	92336413	92337729
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	92339747	92349031	5	4	0.7002	1.36204789791355e-10	92336413	92337729	8.32909273005964e-10	92349031	92351040
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	92351040	134443483	14882	13933	-4e-04	8.32909273005964e-10	92349031	92351040	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	134450318	134450318	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	33854	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	59822	7894681	3248	3034	0.0054	NA	NA	NA	2.56088756986126e-09	7859302	7926710
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7896259	8013470	46	43	0.2247	2.56088756986126e-09	7859302	7926710	1.06375786432068e-12	7993107	8032127
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	8015452	9523923	447	411	-0.0131	1.06375786432068e-12	7993107	8032127	2.12128752873952e-11	9432943	9554149
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9604633	14	14	0.3727	2.12128752873952e-11	9432943	9554149	2.81131956809104e-11	9578398	9626736
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9607363	11116883	573	543	-0.0145	2.81131956809104e-11	9578398	9626736	1.23842149652443e-51	11116883	11116883
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	7	1.1243	1.23842149652443e-51	11116883	11116883	8.47641238896367e-48	11140421	11140421
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	33178741	7585	7107	-0.0065	8.47641238896367e-48	11140421	11140421	7.64729229701065e-10	33178741	33178741
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33184017	33184017	1	0	NA	7.64729229701065e-10	33178741	33178741	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33193255	33198331	2	2	-0.9915	NA	NA	NA	1.38189309338428e-09	33198331	33217627
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33201796	33210537	2	0	NA	1.38189309338428e-09	33198331	33217627	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33217627	63346598	9692	9096	0.002	NA	NA	NA	5.75391512058911e-16	63346598	63346598
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	63347718	63349229	2	2	-1.2625	5.75391512058911e-16	63346598	63346598	1.44819591622322e-15	63349229	63349229
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	63350624	132289090	23541	22011	-0.0015	1.44819591622322e-15	63349229	63349229	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	6845	-0.0083	NA	NA	NA	2.31439363079256e-12	37953582	37953582
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	1.1021	2.31439363079256e-12	37953582	37953582	1.50409737660486e-13	37957844	37957844
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4564	-0.0112	1.50409737660486e-13	37957844	37957844	4.41410452977381e-13	49964838	49964838
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	1.0835	4.41410452977381e-13	49964838	49964838	7.24661222522447e-13	49971732	49971732
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56650373	1804	1698	0.0068	7.24661222522447e-13	49971732	49971732	2.07436466838330e-50	56650373	56650373
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56681665	14	13	0.8324	2.0743646683833e-50	56650373	56650373	1.64445665364597e-48	56681665	56681665
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56685341	114118270	17604	16520	-0.0032	1.64445665364597e-48	56681665	56681665	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	114123340	114123340	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	34674458	5750	5407	0.0043	NA	NA	NA	9.6947219192241e-12	34666996	34674458
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	-0.8871	9.6947219192241e-12	34666996	34674458	1.00208942574813e-12	34683810	34685308
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	40676611	1895	1786	-0.0068	1.00208942574813e-12	34683810	34685308	1.14271136126220e-16	40670538	40676611
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40722360	7	7	-0.6648	1.1427113612622e-16	40670538	40676611	1.11499059828622e-15	40722360	40726930
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40726930	64771215	8086	7540	-0.0035	1.11499059828622e-15	40722360	40726930	9.55635505209202e-10	64771215	64771215
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	64773298	64773298	1	0	NA	9.55635505209202e-10	64771215	64771215	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	64779054	64782414	2	2	-0.9906	NA	NA	NA	1.42150959759839e-09	64782414	64782414
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	64788025	69086125	1884	1769	4e-04	1.42150959759839e-09	64782414	64782414	5.29302814398273e-11	69084841	69086125
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69092211	3	3	0.8657	5.29302814398273e-11	69084841	69086125	4.16892482568629e-10	69092211	69093444
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69093444	105597555	14011	13103	0.0027	4.16892482568629e-10	69092211	69093444	0	105597555	105597555
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105602602	1	0	NA	0	105597555	105597555	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105606424	105630089	10	10	-3.1998	NA	NA	NA	4.87861134342913e-60	105630089	105630089
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105632168	105632168	1	0	NA	4.87861134342913e-60	105630089	105630089	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105921895	67	62	-0.0379	NA	NA	NA	2.71347595220530e-06	105916075	105923686
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105923159	105948347	5	5	0.6371	2.7134759522053e-06	105916075	105923686	1.17943533385759e-05	105923686	105948347
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105951399	105985458	12	9	0.1364	1.17943533385759e-05	105923686	105948347	3.65305269994630e-12	105985458	105985458
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105989160	106002179	5	5	0.6758	3.6530526999463e-12	105985458	105985458	8.6497337438564e-08	106002179	106015449
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106358491	142	132	0.0097	8.6497337438564e-08	106002179	106015449	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	19427350	96	90	-0.0693	NA	NA	NA	1.82554864631915e-12	19405220	19839695
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19430207	20308014	61	58	-0.3641	1.82554864631915e-12	19405220	19839695	9.66768547693891e-38	20042683	20330200
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20310916	56509504	13459	12496	-0.0056	9.66768547693891e-38	20042683	20330200	5.8679209013247e-25	56509504	56509504
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	56510751	56516385	4	4	-1.1167	5.8679209013247e-25	56509504	56509504	1.17737111679673e-24	56516385	56516385
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	56518657	74669752	8091	7569	0.0047	1.17737111679673e-24	56516385	56516385	7.75009157958452e-294	74669752	74669752
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-3.8173	7.75009157958452e-294	74669752	74669752	6.01959353569338e-292	74680439	74680439
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	75114211	169	157	0.0066	6.01959353569338e-292	74680439	74680439	1.71482251665303e-134	75114211	75114211
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75115806	75115806	1	0	NA	1.71482251665303e-134	75114211	75114211	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	-3.5115	NA	NA	NA	1.02732896771135e-125	75119713	75119713
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	75121466	1	0	NA	1.02732896771135e-125	75119713	75119713	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75124365	100298352	9434	8850	-0.0036	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	32379126	10573	9870	0.0079	NA	NA	NA	2.28006984468863e-32	31854794	32521360
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33538171	44	40	0.4314	2.28006984468863e-32	31854794	32521360	7.75180294836452e-36	33519338	33647856
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33559207	68693086	7682	7172	0.0045	7.75180294836452e-36	33519338	33647856	3.20185143404314e-17	68693014	68710277
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68753209	10	10	-0.5911	3.20185143404314e-17	68693014	68710277	2.63417722501954e-17	68751390	68842364
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	73805719	1783	1664	-0.0031	2.63417722501954e-17	68751390	68842364	4.76585456418657e-12	73803521	73805719
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73809039	73812685	3	3	-0.9016	4.76585456418657e-12	73803521	73805719	2.60063508432076e-12	73812685	73812685
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73815706	73815706	1	0	NA	2.60063508432076e-12	73812685	73812685	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73818855	74097511	127	124	0.0022	NA	NA	NA	1.66607812994709e-08	74088894	74109031
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	74099704	74139612	18	17	-0.3417	1.66607812994709e-08	74088894	74109031	3.92085832740796e-10	74127552	74148860
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	74141966	76923844	894	829	-0.013	3.92085832740796e-10	74127552	74148860	1.06533520234782e-62	76923844	76929598
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76925748	76925748	1	0	NA	1.06533520234782e-62	76923844	76929598	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	1.1532	NA	NA	NA	1.67987360824058e-45	76938723	76940218
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4209	0.0047	1.67987360824058e-45	76938723	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	48858	2	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	50119	1028979	415	392	0.0272	NA	NA	NA	4.36819536705597e-08	1028979	1028979
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	0.9527	4.36819536705597e-08	1028979	1028979	9.72837236460659e-08	1030766	1030766
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	31468896	11622	10850	0.0089	9.7283723646066e-08	1030766	1030766	1.07945746378387e-07	31447686	31474518
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31470227	31893451	18	17	0.332	1.07945746378387e-07	31447686	31474518	1.31935310752271e-07	31499568	31913901
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31895551	41519702	3829	3562	0.0107	1.31935310752271e-07	31499568	31913901	9.340058324012e-54	41518222	41519702
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41564408	20	19	-0.7734	9.340058324012e-54	41518222	41519702	3.73834954171751e-07	41555295	41572001
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41566540	41647135	38	36	-0.4336	3.73834954171751e-07	41555295	41572001	5.6371887813904e-34	41644148	41697532
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41648545	78653545	13688	12747	0.0084	5.6371887813904e-34	41644148	41697532	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	40226609	11794	10991	-0.0062	NA	NA	NA	2.65015094975472e-15	40226609	40226609
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	40230827	40235901	3	3	-1.0014	2.65015094975472e-15	40226609	40226609	1.77460779975191e-15	40235901	40235901
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	40244566	65356061	7968	7406	-0.0029	1.77460779975191e-15	40235901	40235901	2.67780631154877e-16	65353326	65356061
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	65357415	65357415	1	0	NA	2.67780631154877e-16	65353326	65356061	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	65359770	65367911	4	4	-0.8892	NA	NA	NA	5.38083521818906e-16	65367911	65369843
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	65369843	76116026	3194	2992	0.0026	5.38083521818906e-16	65367911	65369843	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1899612	727	682	0.0241	NA	NA	NA	3.18902807520597e-07	1898132	1899612
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1901483	1903590	2	2	-0.9552	3.18902807520597e-07	1898132	1899612	2.38558714671032e-06	1903590	1907897
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1907897	3591120	807	753	-0.0017	2.38558714671032e-06	1903590	1907897	4.80159800886354e-11	3591120	3591120
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3592564	3593646	2	2	-1.2453	4.80159800886354e-11	3591120	3591120	5.03107045655313e-13	3593646	3593646
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3596968	40352568	11071	10327	0.0084	5.03107045655313e-13	3593646	3593646	3.60600326290391e-11	40352568	40352568
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40354034	40356341	2	2	-1.1577	3.60600326290391e-11	40352568	40352568	2.02411533966053e-11	40356341	40356341
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40359145	59491509	8476	7866	0.0099	2.02411533966053e-11	40356341	40356341	2.70329949017871e-08	59488537	59491509
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59492650	59497049	2	2	-0.9956	2.70329949017871e-08	59488537	59491509	4.33400628820996e-08	59497049	59500575
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59500575	60161479	236	214	-0.012	4.33400628820996e-08	59497049	59500575	1.37355450902621e-06	60152697	60161479
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	60163188	60165382	2	2	-0.9024	1.37355450902621e-06	60152697	60161479	1.01173462517126e-06	60165382	60170718
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	60170718	63788698	1732	1621	0.0063	1.01173462517126e-06	60165382	60170718	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1499421	585	541	0.0155	NA	NA	NA	3.27247137375329e-08	1499034	1499421
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1506379	1516966	4	3	-0.7665	3.27247137375329e-08	1499034	1499421	0.000407561560975783	1516966	1518825
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1518825	1528899	5	4	-2.4504	0.000407561560975783	1516966	1518825	6.48135090259874e-121	1528899	1528899
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1531162	1531162	1	0	NA	6.48135090259874e-121	1528899	1528899	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	52080395	17246	16064	0.0026	NA	NA	NA	0	52080395	52080395
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52081719	52090393	5	5	-5.1336	0	52080395	52080395	0	52090393	52090393
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52092989	62419534	3733	3480	0.0065	0	52090393	52090393	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12560	-0.0031	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	48446915	16053	15023	0.0148	NA	NA	NA	2.53839581026298e-08	48445579	48446915
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48448446	48448446	1	0	NA	2.53839581026298e-08	48445579	48446915	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48451678	48452959	2	2	-1.0001	NA	NA	NA	3.50449322389099e-07	48452959	48455492
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48455492	49571068	500	462	0.0177	3.50449322389099e-07	48452959	48455492	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.1129	NA	NA	NA	2.39021668146494e-17	94062	94062
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	6	-1.476	2.39021668146494e-17	94062	94062	1.19474191662122e-52	104732	104732
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	742385	483	450	9e-04	1.19474191662122e-52	104732	104732	7.45003799168206e-08	739660	742385
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	742470	747220	3	3	-0.8078	7.45003799168206e-08	739660	742385	3.03434365806826e-11	747220	747837
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	747837	845758	68	62	0.0208	3.03434365806826e-11	747220	747837	1.67551808874642e-06	841512	851251
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	848806	859493	10	10	0.4082	1.67551808874642e-06	841512	851251	8.83659165991555e-06	853836	863831
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	860688	1427392	210	195	0.0339	8.83659165991555e-06	853836	863831	1.20203798918382e-08	1427338	1431240
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	3	-0.792	1.20203798918382e-08	1427338	1431240	2.55338440208399e-06	1431411	1434970
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	1894973	349	333	-0.022	2.55338440208399e-06	1431411	1434970	8.90831765701816e-08	1891190	1894973
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1895343	1898078	2	2	-1.0507	8.90831765701816e-08	1891190	1894973	5.13940397520834e-09	1898078	1901223
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1901223	2291993	247	236	1e-04	5.13940397520834e-09	1898078	1901223	9.16621619931772e-07	2285992	2297347
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2293573	2304398	15	15	0.3518	9.16621619931772e-07	2285992	2297347	1.98001059773669e-07	2300485	2310113
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2672401	362	326	0.0037	1.98001059773669e-07	2300485	2310113	1.89197340281140e-07	2666368	2692523
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672477	2708291	27	25	-0.2697	1.8919734028114e-07	2666368	2692523	1.30786569573382e-143	2708291	2708291
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	24507490	8398	7832	0.9519	1.30786569573382e-143	2708291	2708291	2.41155016556883e-20	24505442	24507490
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	24508743	24510064	2	2	-0.0991	2.41155016556883e-20	24505442	24507490	1.11297020421021e-08	24510064	24511712
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	24511712	154044828	36602	34233	0.9491	1.11297020421021e-08	24510064	24511712	1.6779108440636e-46	154044828	154044828
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154046681	154079002	11	9	2.1072	1.6779108440636e-46	154044828	154044828	9.55261562909079e-45	154079002	154079002
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154085354	154582414	121	117	0.9143	9.55261562909079e-45	154079002	154079002	4.22563466530463e-263	154578922	154582414
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	190	0.0013	4.22563466530463e-263	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	114	-4.2946	NA	NA	NA	1.99367023478009e-31	3219200	3733715
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	5593746	17	16	-1.1995	1.99367023478009e-31	3219200	3733715	1.24076951645477e-13	5422507	6688691
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7051884	173	164	-3.7902	1.24076951645477e-13	5422507	6688691	0.000146272256213280	7017919	7161694
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7219774	35	31	-2.6191	0.00014627225621328	7017919	7161694	0.0189746654013347	7177061	7248437
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7221322	7221322	1	0	NA	0.0189746654013347	7177061	7248437	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7224954	7262785	22	21	-3.7871	NA	NA	NA	0.000311265692410999	7250951	7278425
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7264547	7304209	21	21	-1.949	0.000311265692410999	7250951	7278425	4.94297308967925e-06	7292494	7331655
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7305143	8016395	207	189	-3.5825	4.94297308967925e-06	7292494	7331655	6.47665430632077e-06	7866716	8058483
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8036254	8036254	1	0	NA	6.47665430632077e-06	7866716	8058483	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8043008	8245608	55	48	-4.6234	NA	NA	NA	4.11634596033436e-05	8214803	8343165
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8251785	8956787	199	177	-3.7843	4.11634596033436e-05	8214803	8343165	8.10360343829252e-06	8783087	9128508
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8958121	10513747	111	99	-4.5134	8.10360343829252e-06	8783087	9128508	3.06579314484949e-29	10512616	10537808
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	11673476	18	17	-1.1114	3.06579314484949e-29	10512616	10537808	1.08572348002868e-13	11249952	11673476
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	11698871	1	0	NA	1.08572348002868e-13	11249952	11673476	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12536761	10	10	-5.0485	NA	NA	NA	9.5973493727415e-05	12532441	12556034
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12537944	12960717	120	111	-2.9218	9.5973493727415e-05	12532441	12556034	1.99780180474817e-05	12875039	12970269
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12963078	13050965	40	38	-1.7381	1.99780180474817e-05	12875039	12970269	0.000154086169808214	13034069	13077621
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13052633	13054694	2	0	NA	0.000154086169808214	13034069	13077621	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13055925	13104920	20	19	-3.1294	NA	NA	NA	0.0152743888044039	13078432	13109337
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13106723	13129843	10	9	-1.4996	0.0152743888044039	13078432	13109337	1.07264616397893e-06	13129843	13140274
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13261173	44	42	-3.891	1.07264616397893e-06	13129843	13140274	0.0788096352154512	13146483	13392751
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13262997	14358464	371	335	-4.3679	0.0788096352154512	13146483	13392751	2.98719172743165e-10	14320016	14409145
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14359748	14508894	90	85	-3.5089	2.98719172743165e-10	14320016	14409145	1.65505390726035e-12	14502379	14524829
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	24	-1.2946	1.65505390726035e-12	14502379	14524829	1.62816104059720e-22	14572190	14579298
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14598838	6	6	-5.0665	1.6281610405972e-22	14572190	14579298	1.09932399278831e-08	14598838	14601309
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14601309	14695441	13	13	-2.3191	1.09932399278831e-08	14598838	14601309	3.79745446912049e-08	14692847	14702545
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14696387	15139441	94	85	-4.293	3.79745446912049e-08	14692847	14702545	2.17849418482733e-08	15118268	15143138
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15140278	15165820	17	17	-2.498	2.17849418482733e-08	15118268	15143138	2.32749521954376e-05	15157004	15175378
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15169415	15206674	21	20	-4.0986	2.32749521954376e-05	15157004	15175378	0.000112717388036021	15203221	15223545
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15207522	15251900	19	16	-2.4984	0.000112717388036021	15203221	15223545	1.80660206640112e-07	15241527	15260075
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15252823	15433122	121	111	-4.1206	1.80660206640112e-07	15241527	15260075	2.10645544490199e-07	15431247	15433122
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15434486	15447091	6	6	-1.714	2.10645544490199e-07	15431247	15433122	1.87602422058874e-14	15447091	15448670
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15448670	15521958	30	30	-4.2453	1.87602422058874e-14	15447091	15448670	0.0103158379576047	15501930	15573648
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15523178	15630463	44	40	-3.3191	0.0103158379576047	15501930	15573648	0.000246683333728278	15551462	15658114
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15639408	15915466	46	42	-4.3638	0.000246683333728278	15551462	15658114	5.100951414751e-09	15898644	15955821
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	15920478	1	0	NA	5.100951414751e-09	15898644	15955821	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15928904	16085263	67	61	-2.9904	NA	NA	NA	0.000557053154200385	16068838	16088722
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16087502	16103913	11	11	-4.6253	0.000557053154200385	16068838	16088722	8.95429044651917e-06	16100397	16118971
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16107406	16180512	28	26	-2.8526	8.95429044651917e-06	16100397	16118971	6.231169247764e-07	16172539	16201830
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16182565	21036411	725	666	-4.1069	6.231169247764e-07	16172539	16201830	1.00389968933559e-07	21028489	21036411
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21036503	21054519	7	6	-1.3979	1.00389968933559e-07	21028489	21036411	6.64067123134041e-09	21054519	21059229
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	21054605	1	0	NA	6.64067123134041e-09	21054519	21059229	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21057446	21172258	55	52	-4.2475	NA	NA	NA	0.00649585539416838	21109328	21352545
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21182945	21182945	1	0	NA	0.00649585539416838	21109328	21352545	NA	NA	NA
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21186021	21534077	86	74	-3.6433	NA	NA	NA	6.30679309097704e-05	21383975	21687813
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21559551	22139807	118	106	-4.3592	6.30679309097704e-05	21383975	21687813	4.72337258961816e-07	22049641	22157319
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-2.4972	4.72337258961816e-07	22049641	22157319	2.69746924334496e-09	22177335	22181855
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22930737	93	82	-4.5507	2.69746924334496e-09	22177335	22181855	2.60666575094425e-75	22926726	25737663
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	27019256	50	48	-1.3324	2.60666575094425e-75	22926726	25737663	5.3341713036624e-08	27007874	27019256
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27039222	4	4	-4.4249	5.3341713036624e-08	27007874	27019256	1.36347491613562e-69	27039222	27039222
MSK_252152916884_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	27	-0.4351	1.36347491613562e-69	27039222	27039222	NA	NA	NA
