Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	24391166	8834	8527	0.0087	NA	NA	NA	5.51987803658204e-14	24391166	24391166
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	24394076	24395691	2	2	-1.038	5.51987803658204e-14	24391166	24391166	1.11852245156172e-15	24395691	24395691
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	24397212	43131392	7354	7094	0.0047	1.11852245156172e-15	24395691	24395691	2.48855808008434e-12	43131392	43131392
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	43132077	43139091	2	2	-0.925	2.48855808008434e-12	43131392	43131392	5.96593937211654e-12	43139091	43139091
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	43142878	72537426	11702	11253	-0.0014	5.96593937211654e-12	43139091	43139091	0	72537426	72537426
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	12	2.106	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	109987341	11688	11288	-0.0026	0	72579311	72579311	7.40781747831442e-29	109987341	109987341
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109988743	109989998	2	2	1.3859	7.40781747831442e-29	109987341	109987341	5.18503940622908e-20	109989998	109989998
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109994195	110023268	13	11	0.0981	5.18503940622908e-20	109989998	109989998	6.54380445009485e-13	110023268	110023268
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110041712	4	3	-0.7273	6.54380445009485e-13	110023268	110023268	1.16283638945404e-11	110041712	110058441
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	111177741	481	460	0.0138	1.16283638945404e-11	110041712	110058441	1.04004746034229e-15	111177741	111177741
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	111180807	111188857	3	2	-1.0324	1.04004746034229e-15	111177741	111177741	4.25795831602016e-16	111188857	111188857
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	111190763	147329819	4078	3914	3e-04	4.25795831602016e-16	111188857	111188857	1.18808275631315e-09	147308557	147357754
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147346371	147441409	17	17	0.2785	1.18808275631315e-09	147308557	147357754	1.5700679918066e-10	147427208	147460661
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147446204	150818222	1269	1207	-0.0019	1.5700679918066e-10	147427208	147460661	2.39680605681334e-10	150816180	150818222
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150819879	150839754	5	5	-0.5099	2.39680605681334e-10	150816180	150818222	7.4823342803449e-30	150839754	150839754
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150846148	4	3	-3.0519	7.4823342803449e-30	150839754	150839754	9.49368174612586e-207	150846148	150846148
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150847304	150848509	2	0	NA	9.49368174612586e-207	150846148	150846148	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150851439	247186514	35674	34415	-0.0036	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	13623794	4232	4089	-0.0011	NA	NA	NA	2.24402561436815e-12	13623794	13623794
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	13627327	13634154	2	2	-0.9115	2.24402561436815e-12	13623794	13623794	7.83001872010062e-12	13634154	13634154
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	13644265	34543992	7288	7048	-0.006	7.83001872010062e-12	13634154	13634154	7.82172699438035e-108	34543992	34551222
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	18	0.8854	7.82172699438035e-108	34543992	34551222	6.51329926019076e-102	34583814	34589997
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	35821494	484	461	-0.0117	6.51329926019076e-102	34583814	34589997	3.08902730357426e-28	35821494	35821494
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	-1.4107	3.08902730357426e-28	35821494	35821494	1.29996495707718e-29	35844884	35844884
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	35851593	1	0	NA	1.29996495707718e-29	35844884	35844884	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35853977	37800512	880	850	-0.0129	NA	NA	NA	1.71115307255997e-49	37797909	37812045
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37803744	37855837	24	24	-0.5475	1.71115307255997e-49	37797909	37812045	1.68747777498634e-55	37848754	37858379
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	52600588	5801	5585	0.0056	1.68747777498634e-55	37848754	37858379	4.43707050362462e-13	52588009	52600588
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	4.43707050362462e-13	52588009	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	0.6712	NA	NA	NA	4.87256678824098e-13	52635695	52639605
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	79182762	8857	8533	-8e-04	4.87256678824098e-13	52635695	52639605	2.33980266221334e-12	79180906	79184112
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	79184112	79196200	5	5	0.5854	2.33980266221334e-12	79180906	79184112	3.51787746015801e-14	79193832	79196200
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	79198028	82054900	919	886	-0.0106	3.51787746015801e-14	79193832	79196200	9.32698212405797e-52	82052281	82058168
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	82058168	82164538	16	16	0.6186	9.32698212405797e-52	82052281	82058168	9.19447675805108e-45	82159133	82171872
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	82171872	112749123	6807	6578	0.004	9.19447675805108e-45	82159133	82171872	5.9621832532991e-08	112749123	112749123
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	112750646	112752277	2	2	0.7603	5.9621832532991e-08	112749123	112749123	4.53009190513139e-08	112752277	112752277
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	112761950	117187800	1367	1315	-0.0075	4.53009190513139e-08	112752277	112752277	3.51601861890389e-88	117182908	117199984
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	117199984	117560944	47	45	0.5225	3.51601861890389e-88	117182908	117199984	1.88602742066344e-94	117546748	117571669
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	117571669	227949124	35523	34225	-0.001	1.88602742066344e-94	117546748	117571669	3.80301949195978e-51	227949124	227949124
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	227950459	227964962	7	7	0.9793	3.80301949195978e-51	227949124	227949124	2.77589930571647e-47	227964962	227964962
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	227967126	242689978	5540	5343	0.005	2.77589930571647e-47	227964962	227964962	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10426	0	NA	NA	NA	5.36983357052554e-259	32074432	32074432
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	-4.1121	5.36983357052554e-259	32074432	32074432	1.47753121139440e-253	32080848	32080848
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	37953375	1883	1808	-0.0031	1.4775312113944e-253	32080848	32080848	2.06494993213044e-33	37953375	37953375
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37954819	37961110	6	4	-1.0694	2.06494993213044e-33	37953375	37953375	3.64286636517275e-35	37961110	37961110
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37963014	47460892	3531	3386	0.0049	3.64286636517275e-35	37961110	37961110	0	47460892	47460892
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	-4.9087	0	47460892	47460892	0	47466921	47466921
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	164005577	37271	35965	-3e-04	0	47466921	47466921	2.51543838518439e-135	164005577	164009321
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	4	-2.101	2.51543838518439e-135	164005577	164009321	2.37306655619958e-133	164019640	164027724
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	191219222	9142	8801	0.001	2.37306655619958e-133	164019640	164027724	1.65013674193344e-07	191217656	191219222
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191221758	191222891	2	2	0.7329	1.65013674193344e-07	191217656	191219222	2.99198786463370e-07	191222891	191224191
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191224191	194360242	1008	973	-0.009	2.9919878646337e-07	191222891	191224191	0	194360242	194360242
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194362272	194366950	4	4	-3.4814	0	194360242	194360242	0	194366950	194366950
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196822133	996	960	-0.0079	0	194366950	194366950	1.78633184088022e-29	196810503	196905767
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196958467	30	29	-0.3867	1.78633184088022e-29	196810503	196905767	7.65846291405817e-28	196952514	196964180
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196961238	199329592	954	917	-0.0016	7.65846291405817e-28	196952514	196964180	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	173660684	49835	48103	-0.0023	NA	NA	NA	4.06167878230437e-90	173660684	173660684
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	2.4315	4.06167878230437e-90	173660684	173660684	2.14172348989870e-89	173666072	173666072
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	191153613	5324	5137	-4e-04	2.1417234898987e-89	173666072	173666072	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	2083971	645	628	0.0016	NA	NA	NA	1.81739609117573e-41	2083971	2083971
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	2089748	2089748	1	0	NA	1.81739609117573e-41	2083971	2083971	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	2093610	2117301	8	8	-0.9301	NA	NA	NA	1.74927736105508e-54	2117301	2117301
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	2119242	12857302	3321	3217	-0.0028	1.74927736105508e-54	2117301	2117301	0	12857302	12857302
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	-4.5273	0	12857302	12857302	4.33967500681117e-319	12873052	12873052
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	180346557	49671	47885	-9e-04	4.33967500681117e-319	12873052	12873052	0	180346557	180346557
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180348365	180358977	6	6	-5.2696	0	180346557	180346557	0	180358977	180358977
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180632269	111	105	0.0282	0	180358977	180358977	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180644810	180644810	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	39	0.0224	NA	NA	NA	3.68243040533043e-25	200350	202063
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	236535	14	13	0.6093	3.68243040533043e-25	200350	202063	3.03088676143423e-05	227473	240119
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	237952	268978	17	16	0.3187	3.03088676143423e-05	227473	240119	1.14783583920878e-17	262928	278304
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	271851	29950805	10516	10148	-0.003	1.14783583920878e-17	262928	278304	2.87104758315793e-17	29941766	29972382
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30010234	15	13	0.4213	2.87104758315793e-17	29941766	29972382	1.96691696065671e-08	30005338	30010234
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30021908	30030032	4	4	-0.3738	1.96691696065671e-08	30005338	30010234	0.00140598985693475	30025480	30046181
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30031367	31382291	574	549	0.0081	0.00140598985693475	30025480	30046181	1.80381244031513e-05	31381060	31382291
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31383925	31385778	2	2	-0.6538	1.80381244031513e-05	31381060	31382291	7.48418346807924e-06	31385778	31387708
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31418006	6	6	0.6326	7.48418346807924e-06	31385778	31387708	3.90391360956556e-16	31393624	31425113
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	32564884	491	480	-0.0017	3.90391360956556e-16	31393624	31425113	1.36107917109211e-45	32564884	32593151
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32567462	32567462	1	0	NA	1.36107917109211e-45	32564884	32593151	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32588005	32600962	6	5	-1.2356	NA	NA	NA	0.299465855922357	32595402	32629848
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	32633691	8	8	-0.4524	0.299465855922357	32595402	32629848	0.378977851142729	32609525	32667180
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32713363	28	28	-0.1396	0.378977851142729	32609525	32667180	7.5653882772007e-14	32713363	32720656
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	8	-1.2735	7.5653882772007e-14	32713363	32720656	4.8047989125272e-08	32723366	32728487
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	32745693	9	9	-0.086	4.8047989125272e-08	32723366	32728487	0.000158935170073214	32742767	32758904
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32756637	32762061	4	4	-0.6941	0.000158935170073214	32742767	32758904	5.18408975286938e-14	32762061	32766023
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32766023	54035000	8246	7967	0.0019	5.18408975286938e-14	32762061	32766023	1.13813566917429e-311	54035000	54035000
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-3.7024	1.13813566917429e-311	54035000	54035000	0	54042734	54042734
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	79018959	6432	6223	-0.0025	0	54042734	54042734	8.42846943618692e-81	79018959	79018959
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-0.8908	8.42846943618692e-81	79018959	79018959	3.49630766925577e-78	79091850	79091850
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	102039635	6272	6067	-0.0037	3.49630766925577e-78	79091850	79091850	6.96655127795008e-09	102036719	102039635
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102041299	102044331	3	3	-0.6457	6.96655127795008e-09	102036719	102039635	8.92137964511573e-09	102044331	102046884
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102046884	103841482	487	472	0.0168	8.92137964511573e-09	102044331	102046884	0	103841482	103841482
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-3.9338	0	103841482	103841482	0	103868154	103868154
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	134629897	10480	10114	-0.0014	0	103868154	103868154	2.18175666142259e-18	134629897	134629897
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134631701	134631701	1	0	NA	2.18175666142259e-18	134629897	134629897	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134633117	134635779	3	3	-0.9166	NA	NA	NA	1.14295489194413e-18	134635779	134635779
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134639397	165643653	10622	10246	-0.0026	1.14295489194413e-18	134635779	134635779	3.54329918993972e-37	165643653	165643653
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.1038	3.54329918993972e-37	165643653	165643653	1.12446331461094e-32	165650610	165650610
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1738	-0.0041	1.12446331461094e-32	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	38280664	13608	13111	0	NA	NA	NA	2.54671227624097e-10	38257171	38286537
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38281765	38335964	30	29	0.2243	2.54671227624097e-10	38257171	38286537	1.93813236519456e-10	38327469	38360187
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38337912	100164752	17424	16845	-0.0039	1.93813236519456e-10	38327469	38360187	1.77914161183110e-09	100162851	100164752
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100166257	100174991	4	4	0.5834	1.7791416118311e-09	100162851	100164752	5.71702730590065e-10	100174991	100178968
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100178968	109217320	3895	3756	-7e-04	5.71702730590065e-10	100174991	100178968	1.17167191645238e-14	109216032	109217320
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109230336	109240210	5	5	-0.6291	1.17167191645238e-14	109216032	109217320	1.4780363138926e-13	109240210	109244233
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109244233	109967918	301	287	-0.0071	1.4780363138926e-13	109240210	109244233	2.66061092466954e-17	109967918	109967918
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109970524	109974402	2	2	-1.1043	2.66061092466954e-17	109967918	109967918	1.11332382199797e-18	109974402	109974402
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109976628	118611324	3996	3857	-0.0016	1.11332382199797e-18	109974402	109974402	0	118611324	118611324
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	-4.7653	0	118611324	118611324	0	118620875	118620875
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	133433384	6827	6583	-0.003	0	118620875	118620875	1.77570913124011e-32	133433384	133433384
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.7473	1.77570913124011e-32	133433384	133433384	2.43872988188553e-32	133448277	133448277
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141409512	3699	3575	-3e-04	2.43872988188553e-32	133448277	133448277	9.18793967785183e-62	141409512	141409512
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141410894	141435643	13	13	0.8081	9.18793967785183e-62	141409512	141409512	1.11699363884072e-59	141435643	141435643
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141438504	156483966	5823	5598	-0.0052	1.11699363884072e-59	141435643	141435643	2.23185752566352e-09	156477783	156490484
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156485711	156495904	6	6	0.466	2.23185752566352e-09	156477783	156490484	9.60786963555811e-09	156490484	156498994
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156497496	158821263	1051	1023	-0.0052	9.60786963555811e-09	156490484	156498994	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	579405	118	114	0.0025	NA	NA	NA	1.64533296575615e-137	579405	579405
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	581533	581533	1	0	NA	1.64533296575615e-137	579405	579405	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	3.0981	NA	NA	NA	5.77119413115217e-138	588865	588865
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	11943616	3875	3749	-0.0074	5.77119413115217e-138	588865	588865	4.66006825402871e-12	11943616	12284724
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	12284724	12511855	3	3	-0.7777	4.66006825402871e-12	11943616	12284724	2.44130250670415e-12	12448374	12511855
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	12600375	26934767	4931	4756	-0.0055	2.44130250670415e-12	12448374	12511855	1.34662682318629e-13	26934767	26934767
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	26935578	26936405	2	2	-0.9927	1.34662682318629e-13	26934767	26934767	3.60111868045956e-15	26936405	26936405
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	26937497	39350798	4142	3998	-0.0074	3.60111868045956e-15	26936405	26936405	0	39350798	39350798
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	59	0.8968	0	39350798	39350798	0	39505256	39505256
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40892587	441	430	-0.0245	0	39505256	39505256	2.97721376203511e-247	40892587	40892587
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-4.1361	2.97721376203511e-247	40892587	40892587	1.25614678490323e-231	40897469	40897469
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	51191560	1736	1666	-0.0054	1.25614678490323e-231	40897469	40897469	2.81561727155277e-15	51191560	51191560
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51193977	51193977	1	0	NA	2.81561727155277e-15	51191560	51191560	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51196227	51200291	3	3	-0.8857	NA	NA	NA	3.20355790902687e-18	51200291	51200291
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51202490	51202490	1	0	NA	3.20355790902687e-18	51200291	51200291	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51204788	87255865	10503	10122	-0.0084	NA	NA	NA	6.55241750655569e-23	87255865	87255865
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87258019	87262662	3	3	-0.9889	6.55241750655569e-23	87255865	87255865	1.66558029013859e-21	87262662	87262662
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87265435	146264846	18743	18076	-9e-04	1.66558029013859e-21	87262662	87262662	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15141574	5182	5004	-0.0055	NA	NA	NA	4.81235492035727e-49	15141574	15141574
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15143629	15153076	6	6	-1.0196	4.81235492035727e-49	15141574	15141574	4.41750310006177e-38	15153076	15153076
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15154403	15802255	270	260	-0.0093	4.41750310006177e-38	15153076	15153076	6.84141467724396e-120	15802255	15802255
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	-3.0951	6.84141467724396e-120	15802255	15802255	9.83468361692592e-136	15807123	15807123
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	140145683	32484	31295	-0.0014	9.83468361692592e-136	15807123	15807123	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	31284926	11292	10904	-0.0086	NA	NA	NA	2.14051925875828e-10	31284756	31284926
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31287101	31291525	3	3	0.6901	2.14051925875828e-10	31284756	31284926	4.50157926351611e-10	31291525	31293140
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31293140	53683740	5007	4837	-0.0015	4.50157926351611e-10	31291525	31293140	4.59406453356337e-83	53683740	53683740
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53686515	53687880	2	2	-2.43	4.59406453356337e-83	53683740	53683740	2.96833059778334e-89	53687880	53687880
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53689554	70941924	5368	5187	-0.003	2.96833059778334e-89	53687880	53687880	1.39258604301358e-13	70938362	70945853
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70945853	70960187	7	5	-0.599	1.39258604301358e-13	70938362	70945853	1.22219821420579e-12	70955025	70964344
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70964344	100676022	10678	10300	0.0011	1.22219821420579e-12	70955025	70964344	5.12016303200962e-16	100672415	100676022
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100678817	100686787	4	4	-0.7499	5.12016303200962e-16	100672415	100676022	2.1100768165034e-15	100686787	100686787
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100693036	135285645	12447	11974	6e-04	2.1100768165034e-15	100686787	100686787	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1709	0.0123	NA	NA	NA	1.84134737215748e-11	4920907	4923300
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-0.5769	1.84134737215748e-11	4920907	4923300	1.96204148485148e-12	4932214	4934594
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	5741031	361	350	-0.0199	1.96204148485148e-12	4932214	4934594	1.00738186502394e-10	5732077	5745329
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	14	0.2959	1.00738186502394e-10	5732077	5745329	2.47122602905427e-08	5760117	5777496
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	55118214	14752	14217	9e-04	2.47122602905427e-08	5760117	5777496	6.1496385742112e-186	55118214	55123719
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	39	-0.7996	6.1496385742112e-186	55118214	55123719	1.08346023606312e-183	55207305	55209626
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	66463477	4638	4478	0.0054	1.08346023606312e-183	55207305	55209626	1.06575365153858e-20	66463477	66463477
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	1.2046	1.06575365153858e-20	66463477	66463477	1.60712422348045e-21	66469412	66469412
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	106733851	13398	12933	0.0012	1.60712422348045e-21	66469412	66469412	8.20452088445086e-14	106732431	106733851
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106744337	106747920	4	4	-0.6873	8.20452088445086e-14	106732431	106733851	9.09483037767068e-14	106747920	106754784
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106754784	134450318	10318	9933	0.0031	9.09483037767068e-14	106747920	106754784	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3612	0.0047	NA	NA	NA	0	9523923	9523923
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9554149	5	5	-5.342	0	9523923	9523923	1.14023246807404e-70	9554149	9554149
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	9610054	11	11	-1.1278	1.14023246807404e-70	9554149	9554149	2.43089705651881e-93	9610054	9610054
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	10462211	326	309	-0.0243	2.43089705651881e-93	9610054	9610054	2.02359660776265e-19	10459455	10465787
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10464018	10485848	10	10	-0.5419	2.02359660776265e-19	10459455	10465787	1.44769800998638e-21	10482217	10491341
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10491341	31132762	7061	6805	0.0028	1.44769800998638e-21	10482217	10491341	3.72688964062365e-51	31132716	31171313
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31169263	31237505	17	17	-0.6365	3.72688964062365e-51	31132716	31171313	5.64381892571329e-44	31231952	31242528
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31242528	33184017	750	729	-0.0254	5.64381892571329e-44	31231952	31242528	3.12788028020483e-15	33184017	33184017
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33193255	33198331	2	2	-1.0443	3.12788028020483e-15	33184017	33184017	5.66644112321101e-16	33198331	33198331
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33201796	52100657	5837	5621	0.0012	5.66644112321101e-16	33198331	33198331	5.41813726341592e-35	52100657	52103427
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	52103427	52115805	7	7	-0.8186	5.41813726341592e-35	52100657	52103427	1.53078076545760e-31	52114017	52115805
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	52120198	55618235	1467	1417	0.0023	1.5307807654576e-31	52114017	52115805	1.20464378475002e-39	55618235	55618235
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	55622537	55663909	8	8	-0.8531	1.20464378475002e-39	55618235	55618235	1.34602744460209e-43	55663909	55663909
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	55667388	125558844	23561	22787	-1e-04	1.34602744460209e-43	55663909	55663909	3.42955409593808e-09	125558844	125558844
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	125565039	125570308	2	2	-0.8135	3.42955409593808e-09	125558844	125558844	5.75436076271734e-09	125570308	125576897
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	125576897	130694393	1709	1657	-0.0062	5.75436076271734e-09	125570308	125576897	2.30843694584340e-12	130694393	130694393
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	0.9353	2.3084369458434e-12	130694393	130694393	1.65813426792014e-11	130701040	130701040
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	619	-0.0112	1.65813426792014e-11	130701040	130701040	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	22314217	1348	1291	-0.015	NA	NA	NA	1.70431276160394e-107	22314217	22314217
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	22317487	22381531	17	17	-0.9293	1.70431276160394e-107	22314217	22314217	7.57699913502325e-109	22381531	22381531
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	22383458	33030946	4230	4088	-0.0021	7.57699913502325e-109	22381531	22381531	7.03872249302129e-17	33030946	33030946
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33033905	33042557	3	3	-0.8835	7.03872249302129e-17	33030946	33030946	1.10926940969648e-17	33042557	33042557
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33046417	49964838	6621	6369	-0.005	1.10926940969648e-17	33042557	33042557	1.52589134729629e-112	49964838	49964838
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-2.6767	1.52589134729629e-112	49964838	49964838	1.76115473851255e-110	49971732	49971732
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	50819012	360	350	0.0193	1.76115473851255e-110	49971732	49971732	2.74477805315732e-07	50817754	50819012
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	50820905	50822114	2	2	-0.6842	2.74477805315732e-07	50817754	50819012	2.03793773134097e-07	50822114	50826116
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	50826116	56650373	1442	1394	-6e-04	2.03793773134097e-07	50822114	50826116	2.82084418810907e-77	56650373	56657371
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56686863	16	15	0.7909	2.82084418810907e-77	56650373	56657371	2.95980714226196e-74	56681665	56686863
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56688605	62495746	1363	1314	-0.0153	2.95980714226196e-74	56681665	56686863	1.06875907188522e-05	62456486	62507943
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	62499779	62523095	5	5	0.3819	1.06875907188522e-05	62456486	62507943	7.1629587429705e-05	62507943	62534030
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	62527115	63118944	91	88	0.0146	7.1629587429705e-05	62507943	62534030	9.21155062171168e-15	63118944	63118944
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	63123793	63130828	2	2	-0.9582	9.21155062171168e-15	63118944	63118944	2.46235627319244e-14	63130828	63130828
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	63140078	66410194	795	769	5e-04	2.46235627319244e-14	63130828	63130828	4.59447785804933e-10	66408719	66410194
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	66412366	66415125	2	2	-0.807	4.59447785804933e-10	66408719	66410194	7.62670982896053e-10	66415125	66415125
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	66416280	72641136	1803	1741	0.0012	7.62670982896053e-10	66415125	66415125	1.54081767990047e-19	72641136	72642997
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	72642997	72649306	3	3	-0.9204	1.54081767990047e-19	72641136	72642997	1.97803856945962e-20	72646182	72649306
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	72651761	89659397	4188	4045	-0.002	1.97803856945962e-20	72646182	72649306	1.80148152718866e-197	89659397	89659397
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	-3.4463	1.80148152718866e-197	89659397	89659397	2.84159073363659e-177	89662326	89662326
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	100690991	4785	4627	-0.0114	2.84159073363659e-177	89662326	89662326	2.36233719286891e-09	100690991	100690991
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	0.802	2.36233719286891e-09	100690991	100690991	5.92537385812412e-09	100693892	100693892
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	113788788	4410	4254	-0.003	5.92537385812412e-09	100693892	100693892	7.73808468820973e-11	113788788	113788788
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113791151	113792974	2	2	-0.8842	7.73808468820973e-11	113788788	113788788	5.13410395924727e-08	113792974	113794669
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113794669	114118270	149	143	0.0292	5.13410395924727e-08	113792974	113794669	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	114123340	114123340	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18544772	6	6	-0.1362	NA	NA	NA	2.31689652230125e-09	18537177	18864561
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	19494416	54	50	-0.7232	2.31689652230125e-09	18537177	18864561	1.24975909552384e-175	19490630	19494416
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	21511829	984	953	-0.0069	1.24975909552384e-175	19490630	19494416	1.07961711271869e-80	21503195	21526238
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21511994	22051630	269	261	0.2273	1.07961711271869e-80	21503195	21526238	6.5322623483523e-101	22042671	22061243
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22052799	40676611	6335	6094	-0.0029	6.5322623483523e-101	22042671	22061243	5.78319296284957e-20	40670538	40676611
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40722360	7	7	-0.6222	5.78319296284957e-20	40670538	40676611	3.1421078538599e-20	40722360	40726930
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40726930	64771215	8086	7782	-0.0029	3.1421078538599e-20	40722360	40726930	3.46143938384195e-16	64771215	64771215
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	64773298	64773298	1	0	NA	3.46143938384195e-16	64771215	64771215	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	64779054	64782414	2	2	-1.0431	NA	NA	NA	1.71651987969042e-15	64782414	64782414
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	64788025	69086125	1884	1816	0.01	1.71651987969042e-15	64782414	64782414	5.62946745942953e-17	69086125	69086125
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69092211	3	3	0.9113	5.62946745942953e-17	69086125	69086125	4.10008489502773e-17	69092211	69092211
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69093444	72595934	1553	1491	-0.0043	4.10008489502773e-17	69092211	69092211	8.87820419594999e-18	72595934	72595934
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	72597009	72600731	3	3	-0.9359	8.87820419594999e-18	72595934	72595934	1.16647057020458e-18	72600731	72600731
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	72602517	79174722	3154	3040	5e-04	1.16647057020458e-18	72600731	72600731	3.20864180621994e-07	79171460	79174722
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79176037	79183154	4	4	-0.5144	3.20864180621994e-07	79171460	79174722	2.72795392607e-07	79183154	79185548
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	102266887	8014	7741	9e-04	2.72795392607e-07	79183154	79185548	2.55833314082489e-12	102266887	102266887
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	102267929	102272955	3	3	-0.7591	2.55833314082489e-12	102266887	102266887	1.60728571342395e-09	102272955	102275823
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	102275823	106358491	1523	1472	0.0016	1.60728571342395e-09	102272955	102275823	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18874259	26	26	0.198	NA	NA	NA	7.34781278451861e-08	18851513	19123327
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18876677	20088256	130	130	0.4588	7.34781278451861e-08	18851513	19123327	6.13621322730655e-204	20065525	20308014
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	74669752	21555	20796	-0.0025	6.13621322730655e-204	20065525	20308014	3.68262971784121e-08	74665386	74669752
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-0.5534	3.68262971784121e-08	74665386	74669752	2.12544486304393e-08	74680439	74696127
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	75115806	170	166	-0.0175	2.12544486304393e-08	74680439	74696127	8.61825859384528e-23	75115806	75115806
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	-1.443	8.61825859384528e-23	75115806	75115806	6.69923232234644e-31	75119713	75119713
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	98232932	8521	8198	0.0024	6.69923232234644e-31	75119713	75119713	1.15360986311025e-19	98232932	98232932
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98239454	3	3	0.9467	1.15360986311025e-19	98232932	98232932	3.21341941420659e-20	98239454	98239454
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	99632987	637	614	0.0055	3.21341941420659e-20	98239454	98239454	2.50075598311705e-16	99632987	99632987
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.0435	2.50075598311705e-16	99632987	99632987	8.39001590136367e-17	99635701	99635701
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100217283	268	261	0.0123	8.39001590136367e-17	99635701	99635701	4.42447681913414e-43	100217283	100217283
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	100278665	100298352	4	4	1.1977	4.42447681913414e-43	100217283	100217283	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	21258019	7255	6996	-0.0043	NA	NA	NA	5.10246283700797e-07	21239284	21382540
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	21382540	21501073	10	9	-0.3506	5.10246283700797e-07	21239284	21382540	6.22782058192092e-08	21493483	21512310
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	21504151	22338034	283	269	0.0026	6.22782058192092e-08	21493483	21512310	3.58678497216976e-09	22315373	22338034
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22541389	22609825	10	10	-0.3563	3.58678497216976e-09	22315373	22338034	2.23738286159048e-08	22609825	22647089
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22617217	22617217	1	0	NA	2.23738286159048e-08	22609825	22647089	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22625780	31841022	3008	2920	-0.0055	NA	NA	NA	1.32285667826628e-59	31837203	31854794
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	31842335	33559207	51	49	0.3983	1.32285667826628e-59	31837203	31854794	3.77148911710936e-27	33533440	33842125
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33647856	34317157	89	84	-0.0126	3.77148911710936e-27	33533440	33842125	2.70635477698813e-32	34302966	34329518
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34325501	34602318	52	52	0.3968	2.70635477698813e-32	34302966	34329518	4.72648153422727e-61	34588639	34619028
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34617260	54352394	2937	2832	-0.0036	4.72648153422727e-61	34588639	34619028	5.24402346949984e-27	54348362	54363713
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54353978	54379839	10	10	-0.6147	5.24402346949984e-27	54348362	54363713	5.39061176147686e-27	54366535	54390060
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	75093957	6817	6583	-0.0018	5.39061176147686e-27	54366535	54390060	3.70279190718637e-34	75093957	75093957
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.2491	3.70279190718637e-34	75093957	75093957	3.05613476490674e-35	75100865	75100865
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76923844	609	591	-0.0087	3.05613476490674e-35	75100865	75100865	4.35401531806843e-249	76923844	76923844
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76925748	76925748	1	0	NA	4.35401531806843e-249	76923844	76923844	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	2.0505	NA	NA	NA	7.7811785557609e-229	76940218	76940218
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4386	0.0022	7.7811785557609e-229	76940218	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1904451	854	814	6e-04	NA	NA	NA	8.05275216871616e-19	1904451	1904451
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906319	1906391	3	3	0.9924	8.05275216871616e-19	1904451	1904451	2.53657505966393e-20	1906391	1906391
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	36673853	13014	12523	8e-04	2.53657505966393e-20	1906391	1906391	0	36673853	36673853
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	3.2458	0	36673853	36673853	0	36684619	36684619
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41519702	2011	1932	0.0111	0	36684619	36684619	7.82722971446622e-64	41518222	41519702
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41521544	1	0	NA	7.82722971446622e-64	41518222	41519702	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41522429	41566540	20	20	-0.6699	NA	NA	NA	2.69183445524846e-10	41562786	41573295
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41702238	42	42	-0.3274	2.69183445524846e-10	41562786	41573295	1.35215634545566e-31	41648545	41708551
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41704093	57544500	5661	5453	2e-04	1.35215634545566e-31	41648545	41708551	1.76444036978543e-10	57544500	57544500
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	57548711	57550827	2	2	-0.8776	1.76444036978543e-10	57544500	57544500	1.66527601071424e-10	57550827	57550827
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	57552085	72774988	5652	5460	-0.0016	1.66527601071424e-10	57550827	57550827	2.22900554730005e-16	72774988	72774988
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	72776416	72780121	3	3	-0.8857	2.22900554730005e-16	72774988	72774988	4.17987827754526e-15	72780121	72780121
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	72785841	78653545	2365	2272	0.0146	4.17987827754526e-15	72780121	72780121	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	49454374	15144	14623	-0.0065	NA	NA	NA	4.30086212720225e-16	49454374	49454374
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	49460662	49464433	2	2	-1.0533	4.30086212720225e-16	49454374	49454374	4.8421672535204e-16	49464433	49464433
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	49468722	53092949	1053	1007	-0.0056	4.8421672535204e-16	49464433	49464433	1.91862866827018e-16	53092949	53092949
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	1.0541	1.91862866827018e-16	53092949	53092949	1.69639806614141e-16	53099601	53099601
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6519	-5e-04	1.69639806614141e-16	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	466	0.0121	NA	NA	NA	3.49647922766217e-47	1398325	1398325
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	2.1219	3.49647922766217e-47	1398325	1398325	2.80706286183795e-60	1400840	1400840
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	44213393	13840	13353	-0.0051	2.80706286183795e-60	1400840	1400840	1.50741860324971e-29	44213393	44213393
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	44215416	44227421	4	4	-1.0652	1.50741860324971e-29	44213393	44213393	1.32014677074332e-31	44227421	44227421
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	44228073	55769042	5017	4822	-4e-04	1.32014677074332e-31	44227421	44227421	3.79811549000233e-71	55769042	55769042
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55770195	55772729	2	2	-2.2843	3.79811549000233e-71	55769042	55769042	1.41088073961395e-61	55772729	55772729
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55776055	59491509	1730	1674	-0.0139	1.41088073961395e-61	55772729	55772729	2.47024473695493e-10	59491509	59491509
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59492650	59497049	2	2	-0.9217	2.47024473695493e-10	59491509	59491509	2.66099299044570e-12	59497049	59497049
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59500575	63788698	1970	1900	-0.0082	2.6609929904457e-12	59497049	59497049	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	560	-0.0031	NA	NA	NA	4.77683282118273e-35	1506379	1506379
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	9	0.7565	4.77683282118273e-35	1506379	1506379	2.47451353726171e-37	1532433	1532433
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	20254	-0.0017	2.47451353726171e-37	1532433	1532433	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	14489502	122	119	-0.0367	NA	NA	NA	0.000116948675561874	14486161	14489502
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	14491488	14498344	2	2	-0.7992	0.000116948675561874	14486161	14489502	1.31680952805157e-08	14498344	14498344
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	14501081	46922972	13317	12841	-0.003	1.31680952805157e-08	14498344	14498344	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	16521073	405	390	-0.0191	NA	NA	NA	2.63775816882368e-14	16521073	16521073
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16523019	16524408	2	2	-0.9847	2.63775816882368e-14	16521073	16521073	7.44939792403005e-13	16524408	16524408
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16525922	22667608	2575	2498	0.0027	7.44939792403005e-13	16524408	16524408	2.00235366176579e-102	22667608	22677959
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	22	0.836	2.00235366176579e-102	22667608	22677959	2.02453120947435e-106	22721042	22725305
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	37621766	7737	7466	0.0083	2.02453120947435e-106	22721042	22725305	1.88874016986044e-80	37621766	37621766
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37624278	37626069	2	2	-2.4042	1.88874016986044e-80	37621766	37621766	2.83292471666777e-07	37626069	37626069
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37633961	37685496	21	21	-0.0231	2.83292471666777e-07	37626069	37626069	9.57049276929709e-23	37685496	37689058
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37689058	37715385	16	16	-0.8519	9.57049276929709e-23	37685496	37689058	1.41984451524665e-84	37715370	37715385
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37718669	41219395	1823	1752	0.0011	1.41984451524665e-84	37715370	37715385	3.84714138494779e-12	41213175	41246992
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41220567	41220567	1	0	NA	3.84714138494779e-12	41213175	41246992	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41226643	41276170	10	9	0.4383	NA	NA	NA	2.78599965733179e-21	41276170	41276170
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41279485	41279485	1	0	NA	2.78599965733179e-21	41276170	41276170	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41286119	41295673	5	5	-0.8878	NA	NA	NA	8.35936341288275e-27	41295673	41295673
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41310667	48448446	3434	3294	0.0114	8.35936341288275e-27	41295673	41295673	4.8089668039048e-10	48446915	48448446
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48451678	48452959	2	2	-0.874	4.8089668039048e-10	48446915	48448446	1.32150411328735e-09	48452959	48452959
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48455492	49571068	500	480	0.0104	1.32150411328735e-09	48452959	48452959	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	4926	5	5	-0.1096	NA	NA	NA	5.1245296963528e-09	4926	95819
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	94062	94062	1	0	NA	5.1245296963528e-09	4926	95819	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	-1.4343	NA	NA	NA	5.90544131327152e-86	104486	104732
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	845758	554	537	-0.0012	5.90544131327152e-86	104486	104732	3.21935699146941e-09	841738	849437
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	848806	859493	10	9	0.4099	3.21935699146941e-09	841738	849437	8.63451951346125e-10	856619	861050
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	860688	2674962	1193	1149	-0.0279	8.63451951346125e-10	856619	861050	8.42049341458905e-10	2669410	2693493
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2676476	2708291	23	22	-0.312	8.42049341458905e-10	2669410	2693493	1.89136191951415e-117	2708291	2708291
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	8449254	1789	1734	0.8454	1.89136191951415e-117	2708291	2708291	5.83341307652124e-15	8440931	8458058
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8450789	8466917	9	9	0.3975	5.83341307652124e-15	8440931	8458058	1.97878342444753e-11	8461739	8477126
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8473482	8473482	1	0	NA	1.97878342444753e-11	8461739	8477126	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8475091	13679455	2276	2187	0.9016	NA	NA	NA	1.33873479457888e-09	13677276	13681110
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	13681110	13686085	3	3	0.0985	1.33873479457888e-09	13677276	13681110	4.51450666499822e-19	13683888	13688061
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	13688061	76998610	18861	18209	0.898	4.51450666499822e-19	13683888	13688061	1.55853151895741e-122	76998610	76998610
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	-2.4476	1.55853151895741e-122	76998610	76998610	1.54347625442492e-126	77010018	77010018
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	140175103	17912	17249	0.9019	1.54347625442492e-126	77010018	77010018	2.64838161971794e-150	140145377	140176737
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	140176737	140385224	86	79	1.4837	2.64838161971794e-150	140145377	140176737	8.86142671416858e-138	140383353	140443615
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	140387534	140387534	1	0	NA	8.86142671416858e-138	140383353	140443615	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	140443615	154038318	4061	3911	0.8826	NA	NA	NA	3.06124039510069e-57	154038318	154038318
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154078819	11	10	1.9685	3.06124039510069e-57	154038318	154038318	1.52903509922851e-54	154078819	154078819
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154582414	122	119	0.8716	1.52903509922851e-54	154078819	154078819	0	154578922	154582414
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	195	0.0115	0	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	118	-4.109	NA	NA	NA	1.10060794322613e-28	3219200	3773948
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3733715	1	0	NA	1.10060794322613e-28	3219200	3773948	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-1.2097	NA	NA	NA	2.87656469866803e-11	5422507	6696721
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	167	-3.567	2.87656469866803e-11	5422507	6696721	1.04928029036478e-06	7016002	7228333
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7653082	159	148	-2.7053	1.04928029036478e-06	7016002	7228333	5.71768039522356e-06	7608619	7668037
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7723783	44	44	-3.9825	5.71768039522356e-06	7608619	7668037	0.00159061186479408	7712882	7723783
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7733351	4	4	-1.4927	0.00159061186479408	7712882	7723783	0.0645672705488705	7731490	7758635
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7734410	7782532	14	12	-2.2932	0.0645672705488705	7731490	7758635	5.04696426024464e-05	7776265	7821580
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	10515697	430	410	-3.6943	5.04696426024464e-05	7776265	7821580	1.49162932591523e-25	10513747	10515697
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10645500	12	11	-0.3113	1.49162932591523e-25	10513747	10515697	0.00813133131715007	10645500	11660512
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	11698871	6	6	-1.9285	0.00813133131715007	10645500	11660512	0.000230189794343654	11249952	11698871
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12541506	12	12	-4.0147	0.000230189794343654	11249952	11698871	4.70573081015766e-05	12541506	12563030
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12542979	1	0	NA	4.70573081015766e-05	12541506	12563030	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12545716	12682301	53	48	-2.1365	NA	NA	NA	1.84397338743620e-06	12651786	12687167
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12733867	9	9	-4.6139	1.8439733874362e-06	12651786	12687167	0.0122896378146563	12721434	12776542
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12741404	12804329	10	8	-3.297	0.0122896378146563	12721434	12776542	0.00343974417469204	12756268	12909643
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12809152	13128515	116	114	-2.0969	0.00343974417469204	12756268	12909643	1.68155603784773e-06	13111594	13133803
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13151875	12	12	-3.8096	1.68155603784773e-06	13111594	13133803	0.00236230075930543	13148290	13161955
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13153117	13173328	13	12	-2.3874	0.00236230075930543	13148290	13161955	6.92338842293874e-08	13165652	13202163
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13175367	13566041	166	159	-4.006	6.92338842293874e-08	13165652	13202163	0.000193115795966909	13530614	13584982
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13566905	13705594	28	25	-3.1509	0.000193115795966909	13530614	13584982	1.25996200168849e-07	13663517	13717328
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716000	13823928	28	26	-4.2984	1.25996200168849e-07	13663517	13717328	7.70290874926537e-09	13816133	13851627
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13828384	13863657	8	8	-2.3875	7.70290874926537e-09	13816133	13851627	7.64233919568493e-08	13854447	13869106
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13866668	14122129	123	119	-4.3414	7.64233919568493e-08	13854447	13869106	6.52877199033668e-08	14122036	14122129
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14169526	4	3	-1.2823	6.52877199033668e-08	14122036	14122129	5.56042410405032e-20	14169526	14169526
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14203911	14310145	11	11	-4.4595	5.56042410405032e-20	14169526	14169526	0.000618265859269806	14244120	14322984
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14312365	14335755	12	11	-3.54	0.000618265859269806	14244120	14322984	7.39497610014233e-05	14331599	14338189
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14338189	14342834	4	4	-4.9596	7.39497610014233e-05	14331599	14338189	0.00655447183136107	14342834	14368151
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14508021	96	93	-3.1293	0.00655447183136107	14342834	14368151	7.64324367965126e-15	14502379	14528771
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	7.64324367965126e-15	14502379	14528771	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	24	-1.3139	NA	NA	NA	5.3317513261421e-11	14572190	14581797
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14598838	6	6	-4.0795	5.3317513261421e-11	14572190	14581797	2.90322620205757e-09	14597771	14598838
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14601309	14644293	4	4	-0.6303	2.90322620205757e-09	14597771	14598838	2.61236311908912e-05	14644293	14685149
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	14681738	1	0	NA	2.61236311908912e-05	14644293	14685149	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14684159	14707011	18	18	-2.9606	NA	NA	NA	0.00220767727546611	14700040	14739919
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14708015	14994704	53	52	-4.0969	0.00220767727546611	14700040	14739919	1.87017354628552e-05	14958284	14994704
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15005207	15018205	3	3	-0.917	1.87017354628552e-05	14958284	14994704	1.11393131521388e-15	15018205	15018205
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15022037	15095427	14	13	-4.3376	1.11393131521388e-15	15018205	15018205	0.00102994163873442	15067468	15095427
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15099698	15109845	4	4	-3.0205	0.00102994163873442	15067468	15095427	1.55160612174038e-16	15109845	15109845
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15112995	15139441	10	10	-4.7741	1.55160612174038e-16	15109845	15109845	0.000248214393430607	15139441	15157004
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15140278	15283393	80	73	-3.0382	0.000248214393430607	15139441	15157004	2.03499144345796e-09	15257187	15293299
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15284717	15284717	1	0	NA	2.03499144345796e-09	15257187	15293299	NA	NA	NA
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15286805	15402860	75	72	-4.2211	NA	NA	NA	1.99620323221124e-09	15388044	15425463
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15405339	16387273	310	296	-3.2575	1.99620323221124e-09	15388044	15425463	6.89212672436616e-08	16304538	16453776
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	16679419	49	47	-4.3336	6.89212672436616e-08	16304538	16453776	1.04106834811914e-05	16677667	16680383
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16680383	16688132	3	3	-1.3277	1.04106834811914e-05	16677667	16680383	0.00383292795734629	16685944	16707690
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16689244	22157319	887	842	-3.8369	0.00383292795734629	16685944	16707690	0.00263034239007573	22017259	22171771
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22158616	22192409	13	12	-2.5484	0.00263034239007573	22017259	22171771	1.64749268811709e-19	22182080	22192409
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22200078	22268552	24	23	-5.0693	1.64749268811709e-19	22182080	22192409	1.61126976184376e-06	22249988	22388804
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22308420	22930737	64	59	-4.1692	1.61126976184376e-06	22249988	22388804	3.18886065961658e-65	22930737	26870361
MSK_252152916886_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	80	-1.1611	3.18886065961658e-65	22930737	26870361	NA	NA	NA
