Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	34869589	12894	12600	0.0173	NA	NA	NA	1.29087349277809e-11	34859068	34869589
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34876833	34884849	5	5	-0.8563	1.29087349277809e-11	34859068	34869589	1.07638851323593e-21	34884849	34886493
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34886493	72537426	14995	14683	0.0013	1.07638851323593e-21	34884849	34886493	1.28938647347885e-149	72537426	72539143
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72574479	13	12	1.8932	1.28938647347885e-149	72537426	72539143	2.55217357347258e-153	72571158	72574479
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72579311	72589682	2	0	NA	2.55217357347258e-153	72571158	72574479	NA	NA	NA
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72596993	110023268	11702	11455	0.0096	NA	NA	NA	4.30563327383321e-09	110015739	110023268
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110041712	4	4	-0.7855	4.30563327383321e-09	110015739	110023268	3.80903508752013e-09	110041712	110058441
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	147306304	4556	4469	3e-04	3.80903508752013e-09	110041712	110058441	1.69246571131358e-25	146294654	147315217
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147308557	147510532	35	34	0.4731	1.69246571131358e-25	146294654	147315217	6.26892118412912e-23	147490608	148081769
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147644831	150839754	1262	1244	0.0332	6.26892118412912e-23	147490608	148081769	3.19434717979529e-148	150839754	150839754
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150851439	7	6	-2.6373	3.19434717979529e-148	150839754	150839754	3.31764670310807e-127	150851439	150851439
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151938534	451	442	-0.0173	3.31764670310807e-127	150851439	150851439	1.74758254550681e-08	151931017	151939880
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151939880	151956812	9	8	0.5383	1.74758254550681e-08	151931017	151939880	9.92081000388823e-07	151956473	151968128
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151962651	161099582	3925	3846	0.0368	9.92081000388823e-07	151956473	151968128	3.14942073517222e-10	161099582	161099582
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161104752	161104791	2	2	-1.1831	3.14942073517222e-10	161099582	161099582	4.24083315912874e-18	161104791	161104791
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161108722	167483267	2484	2440	-0.0208	4.24083315912874e-18	161104791	161104791	2.56705500912090e-18	167477428	167483267
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	0.5663	2.5670550091209e-18	167477428	167483267	8.49849499803487e-08	167507882	167525669
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	200613454	11352	11149	0.0217	8.49849499803487e-08	167507882	167525669	1.93678196314873e-15	200596027	200629099
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200616638	200804838	38	38	-0.3227	1.93678196314873e-15	200596027	200629099	4.26418309968784e-20	200698665	200813827
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200806319	247186514	17404	17061	-0.0071	4.26418309968784e-20	200698665	200813827	NA	NA	NA
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	14619077	4413	4329	-0.0337	NA	NA	NA	1.32335561306259e-14	14585733	14635804
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	14624598	14662601	6	6	-0.5605	1.32335561306259e-14	14585733	14635804	3.29853324859106e-06	14648144	14671447
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	14667539	17082016	670	659	-0.0453	3.29853324859106e-06	14648144	14671447	7.9240918126818e-11	17074335	17087488
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	17087488	17102047	4	4	-0.8688	7.9240918126818e-11	17074335	17087488	3.48536830151173e-10	17102047	17105804
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	17105804	34543992	6429	6285	0.0082	3.48536830151173e-10	17102047	17105804	4.25679264710623e-50	34542224	34551222
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	17	0.9303	4.25679264710623e-50	34542224	34551222	4.05034609164287e-54	34583814	34589997
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	34591681	1	0	NA	4.05034609164287e-54	34583814	34589997	NA	NA	NA
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34595734	35553983	380	371	-0.0282	NA	NA	NA	3.30316894995415e-06	35552710	35553983
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35556102	35562007	2	2	-0.9603	3.30316894995415e-06	35552710	35553983	4.14435095184891e-06	35562007	35564203
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35564203	41091579	2492	2446	0.0076	4.14435095184891e-06	35562007	35564203	4.8267622262192e-11	41087172	41091579
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	41092989	41101640	5	5	-0.8028	4.8267622262192e-11	41087172	41091579	2.52787510138009e-11	41101640	41105253
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	41105253	52600588	4312	4222	0.0097	2.52787510138009e-11	41101640	41105253	1.95929697727023e-08	52580357	52600588
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	1.95929697727023e-08	52580357	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	0.7748	NA	NA	NA	9.3550916873949e-25	52635695	52639605
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	88910647	11488	11252	0.0088	9.3550916873949e-25	52635695	52639605	2.4164112274661e-26	88898748	88916734
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	88914081	88941248	14	14	-0.5565	2.4164112274661e-26	88898748	88916734	0.0897981780205761	88916734	88941248
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	88944977	88946718	2	2	-1.0589	0.0897981780205761	88916734	88941248	0.0516990223181106	88946718	88971719
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	88948348	88980771	18	18	-1.5716	0.0516990223181106	88946718	88971719	2.45911888802728e-06	88975782	88995175
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	88983003	89208480	31	31	-1.1279	2.45911888802728e-06	88975782	88995175	9.86458893279495e-40	89093646	89222214
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89210958	91155301	75	73	-0.3125	9.86458893279495e-40	89093646	89222214	7.74589643031219e-23	89890854	94892766
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	91158269	167878095	21338	20900	-0.0136	7.74589643031219e-23	89890854	94892766	1.85044321546911e-17	167873350	167878095
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	167882675	167888640	2	2	-1.0979	1.85044321546911e-17	167873350	167878095	1.79906288144248e-08	167888640	167899155
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	167899155	180117780	4684	4591	0.0148	1.79906288144248e-08	167888640	167899155	7.60623355718984e-31	180117780	180117780
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	180121271	180129680	6	6	-1.182	7.60623355718984e-31	180117780	180117780	1.33996955002432e-31	180129680	180129680
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	180131608	198301821	5312	5216	0.0236	1.33996955002432e-31	180129680	180129680	2.09182477511982e-09	198300141	198301821
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	198307946	198313546	4	4	-0.7998	2.09182477511982e-09	198300141	198301821	3.80523319280690e-13	198313546	198318249
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	198316089	242689978	16116	15766	-0.0013	3.8052331928069e-13	198313546	198318249	NA	NA	NA
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	574416	195	191	-0.0163	NA	NA	NA	3.10406021035469e-06	556781	599376
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	580586	643285	17	17	-0.3524	3.10406021035469e-06	556781	599376	7.95491214820923e-11	608449	666100
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	646735	32074432	10584	10364	-0.0099	7.95491214820923e-11	608449	666100	1.31064113518801e-171	32074432	32074432
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	-4.7814	1.31064113518801e-171	32074432	32074432	7.83973207920679e-175	32080848	32080848
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	37953375	1883	1846	0.0118	7.83973207920679e-175	32080848	32080848	2.96362308831495e-14	37951628	37953375
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37954819	37961110	6	6	-0.7926	2.96362308831495e-14	37951628	37953375	1.67902138936238e-26	37961110	37963014
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37963014	133189686	31022	30394	-0.0017	1.67902138936238e-26	37961110	37963014	2.37664126126469e-26	133187633	133189686
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.0337	2.37664126126469e-26	133187633	133189686	1.20598512295466e-07	133194685	133197276
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	133755498	213	209	-0.0083	1.20598512295466e-07	133194685	133197276	1.07546885280746e-08	133750649	133755498
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133757249	133762892	4	4	-0.7921	1.07546885280746e-08	133750649	133755498	2.58757290212327e-08	133762892	133766114
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133766114	163992903	9560	9376	0.0027	2.58757290212327e-08	133762892	133766114	3.67373365316257e-07	163989367	163992903
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164005577	3	3	0.86	3.67373365316257e-07	163989367	163992903	5.318057204178e-13	164005577	164005577
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	4	-1.4578	5.318057204178e-13	164005577	164005577	2.99576094527926e-47	164027724	164027724
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164112873	21	21	0.8701	2.99576094527926e-47	164027724	164027724	5.95631209371804e-56	164107951	164115417
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164115417	190844369	8912	8691	0.0057	5.95631209371804e-56	164107951	164115417	1.43150772724888e-08	190841946	190844369
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	190847899	190850562	3	3	-0.9188	1.43150772724888e-08	190841946	190844369	1.18228483879394e-09	190850562	190854164
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	190854164	192546280	632	623	-0.011	1.18228483879394e-09	190850562	190854164	1.82371417963269e-106	192546280	192546280
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192548135	192552734	4	4	-2.6978	1.82371417963269e-106	192546280	192546280	8.34661695828141e-94	192552734	192552734
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192554451	194354505	578	560	-0.0272	8.34661695828141e-94	192552734	192552734	6.02128474055257e-09	194351567	194358882
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194365648	5	5	0.6933	6.02128474055257e-09	194351567	194358882	8.51616302041974e-09	194364470	194368145
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194366950	196822133	997	975	-0.009	8.51616302041974e-09	194364470	194368145	8.82940855528358e-73	196820428	196835413
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196929826	21	21	-0.9835	8.82940855528358e-73	196820428	196835413	0.0109655006886731	196924340	196946355
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196940125	196958467	9	8	-0.5664	0.0109655006886731	196924340	196946355	1.04395295882520e-09	196946355	196964180
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196961238	199329592	954	930	0.0524	1.0439529588252e-09	196946355	196964180	NA	NA	NA
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	68905670	18433	18090	-0.0109	NA	NA	NA	1.00081028098024e-34	68901210	69069651
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	0.8306	1.00081028098024e-34	68901210	69069651	8.37620693054199e-34	69163312	69643272
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	88752705	6585	6466	0.0126	8.37620693054199e-34	69163312	69643272	4.858730818664e-09	88749866	88752705
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88754121	88756721	2	2	-1.1339	4.858730818664e-09	88749866	88752705	5.67573411243092e-12	88756721	88756721
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88757953	122500822	10657	10437	0.0012	5.67573411243092e-12	88756721	88756721	2.39762680737050e-11	122499680	122500822
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	122502339	122505457	2	2	-1.1322	2.3976268073705e-11	122499680	122500822	8.64979769416871e-09	122505457	122505457
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	122507557	173224400	13947	13710	-9e-04	8.64979769416871e-09	122505457	122505457	2.08530611772126e-155	173224400	173224400
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-4.5652	2.08530611772126e-155	173224400	173224400	2.67959987636935e-155	173228860	173228860
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173659100	192	188	0.0075	2.67959987636935e-155	173228860	173228860	1.58628979755048e-50	173659100	173659100
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173660684	173660684	1	0	NA	1.58628979755048e-50	173659100	173659100	NA	NA	NA
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	2.6289	NA	NA	NA	2.53128982243905e-50	173666072	173666072
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	191153613	5324	5209	-0.0332	2.53128982243905e-50	173666072	173666072	NA	NA	NA
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	12857302	3975	3877	-0.0365	NA	NA	NA	3.38634826685776e-180	12857302	12857302
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	-5.0212	3.38634826685776e-180	12857302	12857302	3.16971853933948e-187	12873052	12873052
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	155411053	41507	40693	0.0018	3.16971853933948e-187	12873052	12873052	8.09771292265627e-31	155404062	155416484
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155416484	155421443	4	4	0.783	8.09771292265627e-31	155404062	155416484	4.27487447064248e-08	155420791	155427589
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155427589	180632269	8277	8109	-0.0075	4.27487447064248e-08	155420791	155427589	NA	NA	NA
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180644810	180644810	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	210326	43	42	0.0403	NA	NA	NA	3.72778003971514e-20	202063	218316
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	211079	327962	59	58	-0.379	3.72778003971514e-20	202063	218316	5.13155630817842e-31	320854	334423
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	329100	29966336	10487	10286	0.0013	5.13155630817842e-31	320854	334423	2.11262080612086e-11	29950805	29966336
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29972382	29995247	8	8	0.6339	2.11262080612086e-11	29950805	29966336	9.43663640472745e-09	29995247	30000990
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29998009	32558677	1080	1054	0.0618	9.43663640472745e-09	29995247	30000990	4.53813643595176e-44	32558677	32558677
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32595402	7	7	1.409	4.53813643595176e-44	32558677	32558677	1.09093643974103e-12	32593151	32600962
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	32713363	38	38	0.2153	1.09093643974103e-12	32593151	32600962	0.00415442940500021	32689775	32728285
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32739800	14	14	0.6812	0.00415442940500021	32689775	32728285	6.17551786727744e-20	32732764	32745036
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32742767	40403214	3286	3201	0.0255	6.17551786727744e-20	32732764	32745036	2.29394164883350e-08	40399614	40403214
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	40407371	40408936	2	2	1.0426	2.2939416488335e-08	40399614	40403214	2.72615664978432e-07	40408936	40411727
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	40411727	54035000	4965	4882	0.0036	2.72615664978432e-07	40408936	40411727	4.63178190585423e-20	54035000	54035000
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	1.3768	4.63178190585423e-20	54035000	54035000	3.34045588038551e-22	54042734	54042734
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	67055837	2770	2711	-0.0165	3.34045588038551e-22	54042734	54042734	3.48242863458251e-06	67024438	67078860
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67060622	67109079	8	8	-0.4809	3.48242863458251e-06	67024438	67078860	3.97089390949662e-07	67093216	67119543
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67111812	79018959	3654	3587	0.0144	3.97089390949662e-07	67093216	67119543	5.76159143774757e-36	79015901	79018959
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-0.8833	5.76159143774757e-36	79015901	79018959	1.92247018297262e-36	79091850	79095415
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	103841482	6762	6641	-0.0032	1.92247018297262e-36	79091850	79095415	1.88483395614127e-12	103827105	103841482
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103860573	3	3	1.0857	1.88483395614127e-12	103827105	103841482	9.15195523990398e-13	103860573	103868154
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103868154	122289187	5893	5786	0.008	9.15195523990398e-13	103860573	103868154	3.05029298637162e-07	122281226	122289187
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	122293593	122315252	4	4	-0.7073	3.05029298637162e-07	122281226	122289187	2.31456124579396e-06	122315252	122326220
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	122321176	125007156	974	954	-0.035	2.31456124579396e-06	122315252	122326220	9.15250004603425e-06	125003237	125007156
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	125009977	125011593	3	3	0.7055	9.15250004603425e-06	125003237	125007156	2.92830037735366e-35	125011593	125018643
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	125016866	165643653	14233	13942	0.0012	2.92830037735366e-35	125011593	125018643	1.00091085466607e-36	165643653	165643653
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.5951	1.00091085466607e-36	165643653	165643653	2.12201810426943e-35	165650610	165650610
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1761	-0.0462	2.12201810426943e-35	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	100166257	31063	30443	-0.0062	NA	NA	NA	3.72610904911554e-182	100166257	100166257
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100170227	100174991	3	3	-4.114	3.72610904911554e-182	100166257	100166257	7.27234418550867e-182	100174991	100174991
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100178968	141410894	18737	18380	0.0066	7.27234418550867e-182	100174991	100174991	1.11117864288493e-12	141406414	141413352
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	14	-0.5122	1.11117864288493e-12	141406414	141413352	8.82115349835591e-12	141438504	141446728
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	142007171	248	243	0.0191	8.82115349835591e-12	141438504	141446728	1.25079293552377e-12	141989750	142027745
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142009000	142194531	57	57	0.3158	1.25079293552377e-12	141989750	142027745	2.97081286858179e-22	142176074	142210399
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142196011	158821263	6573	6444	-0.0294	2.97081286858179e-22	142176074	142210399	NA	NA	NA
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	2234351	737	721	-0.0715	NA	NA	NA	1.07501985588004e-12	2231804	2234351
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2242849	2251011	4	4	-1.0778	1.07501985588004e-12	2231804	2234351	4.57414144101698e-15	2251011	2251011
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2257255	25022606	7388	7242	-0.0376	4.57414144101698e-15	2251011	2251011	7.24275793528898e-15	25022606	25022606
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	1.1558	7.24275793528898e-15	25022606	25022606	2.58052761507459e-14	25039370	25039370
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	25120552	27	26	-0.0892	2.58052761507459e-14	25039370	25039370	5.66609716241915e-51	25120552	25120552
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	5.66609716241915e-51	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	2.7933	NA	NA	NA	1.38557245499678e-59	25125700	25125700
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	39350798	4912	4790	-0.0159	1.38557245499678e-59	25125700	25125700	0	39350798	39352361
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	59	-4.0344	0	39350798	39352361	0	39504332	39505256
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40892587	441	439	0.012	0	39504332	39505256	4.03923407039857e-13	40892587	40892587
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	1.4243	4.03923407039857e-13	40892587	40892587	1.99080406730862e-13	40897469	40897469
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	51191560	1736	1717	-0.0032	1.99080406730862e-13	40897469	40897469	2.71663996428276e-272	51191560	51191560
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51193977	51200291	4	4	-4.527	2.71663996428276e-272	51191560	51191560	3.03003155281387e-301	51200291	51200291
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51202490	51202490	1	0	NA	3.03003155281387e-301	51200291	51200291	NA	NA	NA
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51204788	131919337	24710	24193	5e-04	NA	NA	NA	3.88226332372941e-09	131916458	131919337
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	131921399	131926292	3	3	0.9543	3.88226332372941e-09	131916458	131919337	1.48457974092873e-24	131926292	131929136
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	131929136	146264846	4536	4458	-0.0263	1.48457974092873e-24	131926292	131929136	NA	NA	NA
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5360	-0.0089	NA	NA	NA	1.28726845806863e-19	15802255	15802255
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	1.5451	1.28726845806863e-19	15802255	15802255	8.79395970766051e-18	15807123	15807123
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	21144918	1952	1920	-0.0124	8.79395970766051e-18	15807123	15807123	5.53420556196666e-11	21140819	21144918
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	21146097	21152777	3	3	0.7666	5.53420556196666e-11	21140819	21144918	1.19699192603321e-23	21152777	21154498
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	21154498	39130211	5315	5200	0.0038	1.19699192603321e-23	21152777	21154498	5.81009648180581e-30	39130211	43445839
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	39146895	39146895	1	0	NA	5.81009648180581e-30	39130211	43445839	NA	NA	NA
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43445839	43599449	3	3	-1.6976	NA	NA	NA	2.64803578404630e-25	43530076	43599449
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43626920	70926188	338	326	-0.0029	2.6480357840463e-25	43530076	43599449	6.81800412435401e-30	70926188	70926188
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	2.0399	6.81800412435401e-30	70926188	70926188	3.40018539143189e-31	70930528	70930528
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	75177268	1792	1744	-0.0362	3.40018539143189e-31	70930528	70930528	1.04834646206828e-06	75172123	75177268
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	75208977	75213550	2	2	-1.0244	1.04834646206828e-06	75172123	75177268	2.13044048049923e-12	75213550	75221525
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	75221525	107246785	10300	10092	-0.0265	2.13044048049923e-12	75213550	75221525	7.4406570757063e-12	107216929	107246785
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	107248937	107257058	5	5	-0.4254	7.4406570757063e-12	107216929	107246785	4.49340939000055e-17	107257058	107275498
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	107259163	116124007	3369	3304	7e-04	4.49340939000055e-17	107257058	107275498	8.46723502020848e-16	116122595	116124007
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-1.1623	8.46723502020848e-16	116122595	116124007	3.52326465703645e-37	116130333	116130333
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	140145683	9400	9217	0.0042	3.52326465703645e-37	116130333	116130333	NA	NA	NA
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9535	-0.0127	NA	NA	NA	1.63604876095264e-11	27038538	27038538
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	1.2798	1.63604876095264e-11	27038538	27038538	1.30376911947071e-10	27041812	27041812
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	31284926	1561	1533	-0.0156	1.30376911947071e-10	27041812	27041812	2.17589092547169e-311	31284926	31284926
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31287101	31291525	3	3	-5.6202	2.17589092547169e-311	31284926	31284926	2.12628176301264e-316	31291525	31291525
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31293140	56115736	5736	5618	-0.0251	2.12628176301264e-316	31291525	31291525	1.74141765484844e-22	56114489	56115736
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	56118633	56138767	10	10	0.8039	1.74141765484844e-22	56114489	56115736	1.54601070939887e-23	56138767	56140996
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	56140996	70949263	4634	4533	8e-04	1.54601070939887e-23	56138767	56140996	1.15392085072594e-08	70947915	70949263
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70952973	70960187	4	4	-0.7855	1.15392085072594e-08	70947915	70949263	6.0787429716601e-14	70960187	70964344
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70964344	77917893	2913	2853	0.0195	6.0787429716601e-14	70960187	70964344	1.02611126456837e-77	77917893	77917893
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-3.3991	1.02611126456837e-77	77917893	77917893	3.13584561352711e-79	77928669	77928669
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	126209938	16983	16649	-0.0018	3.13584561352711e-79	77928669	77928669	1.19111254806961e-19	126203478	126217500
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126212089	126224309	7	7	0.5923	1.19111254806961e-19	126203478	126217500	1.91282650762358e-09	126217500	126229001
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126227557	135285645	3224	3178	-0.0688	1.91282650762358e-09	126217500	126229001	NA	NA	NA
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5741031	2138	2096	0.0033	NA	NA	NA	1.61060340221578e-16	5734978	5741031
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	15	-0.6158	1.61060340221578e-16	5734978	5741031	5.54194874644488e-21	5765438	5769776
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	12452016	2811	2743	0.0151	5.54194874644488e-21	5765438	5769776	1.06368778008202e-06	12447862	12452016
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	12454409	12458753	4	4	-0.6915	1.06368778008202e-06	12447862	12452016	2.90625024938391e-07	12458753	12461269
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	12459903	58383355	13222	12977	-0.0121	2.90625024938391e-07	12458753	12461269	7.80095981530342e-07	58382032	58383355
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	58389208	58390670	2	2	-0.9437	7.80095981530342e-07	58382032	58383355	6.3365801200885e-06	58390670	58404501
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	58404501	66463477	3390	3322	0.0501	6.3365801200885e-06	58390670	58404501	7.13891596204259e-11	66463477	66463477
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	1.3723	7.13891596204259e-11	66463477	66463477	5.56838583824072e-51	66469412	66469412
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	134450318	23720	23238	-0.0028	5.56838583824072e-51	66469412	66469412	NA	NA	NA
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	2109441	920	895	0.039	NA	NA	NA	1.95311985279533e-15	2106791	2109441
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2115933	2127537	7	7	-0.7768	1.95311985279533e-15	2106791	2109441	5.91776689339572e-17	2127537	2128807
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2128807	11104085	3397	3339	0.0173	5.91776689339572e-17	2127537	2128807	7.17557240058383e-17	11093358	11109483
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11104973	11140421	12	12	0.4801	7.17557240058383e-17	11093358	11109483	4.33511822876143e-08	11126558	11151185
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	11395862	70	69	0.0332	4.33511822876143e-08	11126558	11151185	1.05730880108341e-18	11393473	11395862
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11435643	6	5	-0.914	1.05730880108341e-18	11393473	11395862	6.91805970649759e-43	11435643	11440927
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	130694393	40103	39287	0.0072	6.91805970649759e-43	11435643	11440927	1.70575916622994e-41	130694393	130694393
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	1.2936	1.70575916622994e-41	130694393	130694393	2.74587851458436e-10	130701040	130701040
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	633	-0.0041	2.74587851458436e-10	130701040	130701040	NA	NA	NA
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	56650373	14025	13726	-0.0027	NA	NA	NA	3.60875192661348e-44	56646284	56650373
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56686863	16	16	0.8889	3.60875192661348e-44	56646284	56650373	6.46149331984125e-50	56686863	56688605
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56688605	71375082	3622	3550	-0.0157	6.46149331984125e-50	56686863	56688605	3.89807093876522e-157	71375082	71375082
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-4.528	3.89807093876522e-157	71375082	71375082	8.72355282189728e-149	71377671	71377671
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	100690991	9415	9226	-0.0133	8.72355282189728e-149	71377671	71377671	1.66737396893335e-22	100690991	100690991
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	1.7668	1.66737396893335e-22	100690991	100690991	1.55755585244445e-22	100693892	100693892
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	100695073	1	0	NA	1.55755585244445e-22	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100696985	114123340	4561	4464	-0.0466	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19497023	61	59	-0.2717	NA	NA	NA	1.57772209913624e-19	19471494	19548246
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19535787	21598382	1023	996	0.0428	1.57772209913624e-19	19471494	19548246	6.33121823139647e-60	21579483	21617995
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21603576	22048569	227	224	0.3403	6.33121823139647e-60	21579483	21617995	4.21485025720419e-85	22041571	22057437
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22049850	105314254	30253	29669	0.0088	4.21485025720419e-85	22041571	22057437	8.39872730270069e-19	105074110	105330913
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105322191	105369044	18	17	-0.4206	8.39872730270069e-19	105074110	105330913	0.0168673329535871	105338667	105384766
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105373966	105401413	13	13	-0.094	0.0168673329535871	105338667	105384766	2.60292887570209e-112	105401413	105401413
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105403001	105416396	7	7	-2.9774	2.60292887570209e-112	105401413	105401413	8.65013052610873e-56	105416396	105416396
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105425440	105597555	40	39	-0.8808	8.65013052610873e-56	105416396	105416396	1.94712204541644e-51	105597555	105597555
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	11	-3.454	1.94712204541644e-51	105597555	105597555	1.91263089093513e-82	105632168	105632168
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105850033	48	46	-0.4717	1.91263089093513e-82	105632168	105632168	2.93856920013958e-07	105846004	105850033
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105875924	5	5	-1.2832	2.93856920013958e-07	105846004	105850033	1.76084482784873e-05	105875924	105881893
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881677	105902383	7	7	-0.4613	1.76084482784873e-05	105875924	105881893	0.0118302829600467	105898108	105998412
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105904455	106358491	171	167	-0.0419	0.0118302829600467	105898108	105998412	NA	NA	NA
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.056	NA	NA	NA	4.15680037380561e-10	18452491	18692865
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	18835660	9	9	-0.7441	4.15680037380561e-10	18452491	18692865	0.00253504651411207	18835660	18842565
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18837737	18837737	1	0	NA	0.00253504651411207	18835660	18842565	NA	NA	NA
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18842565	18846835	3	3	-1.4695	NA	NA	NA	1.06529848220903e-08	18846835	18846835
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18848213	18848213	1	0	NA	1.06529848220903e-08	18846835	18846835	NA	NA	NA
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18851513	19537035	80	79	-0.4449	NA	NA	NA	0.00882044929737163	19379346	19800789
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	19835471	8	8	-0.107	0.00882044929737163	19379346	19800789	2.1063743824536e-15	19835471	19839695
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19839695	19882711	6	6	0.7362	2.1063743824536e-15	19835471	19839695	4.06350475345206e-38	19879448	19927040
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19910696	41638388	7397	7216	-0.0152	4.06350475345206e-38	19879448	19927040	2.55379305219514e-41	41635466	41638388
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41676219	41723580	11	11	0.6194	2.55379305219514e-41	41635466	41638388	2.88801354928356e-27	41723580	41803782
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41776053	100298352	23801	23304	0.0069	2.88801354928356e-27	41723580	41803782	NA	NA	NA
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	31862577	10572	10369	0.0106	NA	NA	NA	2.01320115966443e-35	31842335	32513457
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32379126	34059589	56	55	-0.4388	2.01320115966443e-35	31842335	32513457	2.99378934583698e-35	34054713	34063575
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34061029	72941901	9136	8961	-0.0043	2.99378934583698e-35	34054713	34063575	3.44072070270707e-18	72917554	72955519
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72951581	73038136	10	10	0.5432	3.44072070270707e-18	72917554	72955519	1.23418665459991e-08	73025340	73044781
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73040905	75093957	749	740	0.0193	1.23418665459991e-08	73025340	73044781	1.68919433470788e-33	75093957	75093957
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	-2.2281	1.68919433470788e-33	75093957	75093957	1.11309937315429e-34	75100865	75100865
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	595	-0.0873	1.11309937315429e-34	75100865	75100865	4.25706577251046e-55	76925748	76929598
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	1.2815	4.25706577251046e-55	76925748	76929598	3.54268350290702e-42	76938723	76940218
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4415	-0.0071	3.54268350290702e-42	76938723	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	19438939	7621	7495	0.0112	NA	NA	NA	1.46534640770567e-19	19435553	19446176
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	19442291	19478144	11	11	-0.7257	1.46534640770567e-19	19435553	19446176	1.49726521198358e-18	19473422	19486276
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	19486276	24195451	1337	1312	0.0079	1.49726521198358e-18	19473422	19486276	6.49599885715398e-13	24194191	24195451
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	24198397	24201924	5	5	-0.8992	6.49599885715398e-13	24194191	24195451	5.2120708349216e-14	24201924	24204545
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	24204545	31468896	3067	3003	0.0167	5.2120708349216e-14	24201924	24204545	1.71135861119337e-09	31451114	31474518
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31470227	31893451	18	17	0.4299	1.71135861119337e-09	31451114	31474518	3.08741002684412e-08	31503774	31906515
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31895551	36673853	1812	1779	0.0377	3.08741002684412e-08	31503774	31906515	1.37579994334024e-132	36673853	36673853
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	5	2.8534	1.37579994334024e-132	36673853	36673853	1.38863133275359e-132	36684619	36684619
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41519702	2011	1966	0.0475	1.38863133275359e-132	36684619	36684619	1.16876845559158e-37	41518222	41521544
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41564408	20	20	-0.7013	1.16876845559158e-37	41518222	41521544	5.57438848883988e-05	41552048	41577520
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41566540	41706870	45	45	-0.3759	5.57438848883988e-05	41552048	41577520	3.74819390034414e-23	41697532	42147225
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41708551	78653545	13681	13388	0.023	3.74819390034414e-23	41697532	42147225	NA	NA	NA
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	26125229	7788	7619	-0.0112	NA	NA	NA	3.43493554168775e-07	26123929	26125229
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	26126445	26128419	3	3	-0.7539	3.43493554168775e-07	26123929	26125229	9.57925656963937e-10	26128419	26132557
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	26129268	37896062	3440	3372	-0.0341	9.57925656963937e-10	26128419	26132557	1.58973273381336e-09	37889472	37896062
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	37897353	37901321	3	3	0.7088	1.58973273381336e-09	37889472	37896062	1.91263214507057e-09	37901321	37905029
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	37903429	76116026	11730	11504	-0.012	1.91263214507057e-09	37901321	37905029	NA	NA	NA
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	39098208	12090	11848	0.0199	NA	NA	NA	1.74918333514923e-57	39098208	39098208
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	39103462	39108156	2	2	-1.2915	1.74918333514923e-57	39098208	39098208	2.94120374210966e-11	39108156	39108156
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	39109391	56823430	7781	7614	0.0373	2.94120374210966e-11	39108156	39108156	4.64252782285333e-17	56822197	56823430
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	8	-0.7727	4.64252782285333e-17	56822197	56823430	7.05969151070096e-15	56840346	56842447
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	58213220	588	582	-0.0154	7.05969151070096e-15	56840346	56842447	3.38359924765446e-09	58204170	58219286
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58214720	58241773	12	12	0.4808	3.38359924765446e-09	58204170	58219286	2.00852408706145e-08	58237461	58259101
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58244012	58244012	1	0	NA	2.00852408706145e-08	58237461	58259101	NA	NA	NA
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58247367	63788698	2577	2530	-0.0077	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1511632	587	579	8e-04	NA	NA	NA	6.21405976999912e-211	1511632	1511632
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1515948	1525300	6	6	-3.3864	6.21405976999912e-211	1511632	1511632	3.68874762921642e-242	1525300	1525300
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1528899	56432617	18493	18121	-0.0068	3.68874762921642e-242	1525300	1525300	4.69026106521949e-24	56429111	56432617
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	56435112	56438162	3	2	-1.2047	4.69026106521949e-24	56429111	56432617	1.7946355503856e-21	56438162	56440931
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	56440931	62419534	2490	2451	-0.0256	1.7946355503856e-21	56438162	56440931	NA	NA	NA
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	43645627	11898	11631	-0.0117	NA	NA	NA	2.03515586966310e-29	43645627	43648176
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	43648176	43660918	8	7	1.0694	2.0351558696631e-29	43645627	43648176	3.64511593783398e-23	43659103	43660918
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	43661998	46922972	1535	1502	0.018	3.64511593783398e-23	43659103	43660918	NA	NA	NA
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	22667608	2982	2925	0.0069	NA	NA	NA	1.37678304373138e-56	22644243	22679305
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22720195	20	20	0.9882	1.37678304373138e-56	22644243	22679305	6.4895985502366e-66	22715919	22720195
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22721042	35472378	6549	6410	0.0043	6.4895985502366e-66	22715919	22720195	2.09792681049073e-63	35472378	35472378
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.0377	2.09792681049073e-63	35472378	35472378	6.8677695670643e-56	35476942	35476942
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6853	0.0219	6.8677695670643e-56	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	1427392	787	774	-0.031	NA	NA	NA	5.92029957504037e-08	1425580	1431240
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-0.8534	5.92029957504037e-08	1425580	1431240	1.40865149284572e-08	1432891	1434970
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2673365	977	958	-0.0031	1.40865149284572e-08	1432891	1434970	0.00096478320246873	2655932	2696434
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2674375	2708291	25	24	-0.24	0.00096478320246873	2655932	2696434	1.61229398304296e-95	2708291	2708291
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	32178208	11256	11039	0.9664	1.61229398304296e-95	2708291	2708291	5.95917153269491e-19	32177102	32178208
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	32181030	32189664	5	5	-0.0158	5.95917153269491e-19	32177102	32178208	1.55788491685684e-22	32189664	32191796
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	32191796	154038318	33740	33049	0.948	1.55788491685684e-22	32189664	32191796	7.4896595522347e-36	154037006	154038318
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154078819	11	11	2.0541	7.4896595522347e-36	154037006	154038318	3.9759605716353e-27	154078819	154079002
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154582414	122	119	0.9731	3.9759605716353e-27	154078819	154079002	4.5520455012828e-215	154578922	154586690
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	195	-0.0139	4.5520455012828e-215	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	124	-3.968	NA	NA	NA	1.18318414754756e-25	3219200	3733715
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-1.0371	1.18318414754756e-25	3219200	3733715	1.90529196465584e-41	5593746	5593746
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6749115	16	16	-4.7003	1.90529196465584e-41	5593746	5593746	0.00361728071973775	6739500	6801155
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6756250	7045224	153	148	-3.3441	0.00361728071973775	6739500	6801155	0.0742632260551761	6953343	7048724
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7047579	7057026	7	7	-4.896	0.0742632260551761	6953343	7048724	0.00297019698454231	7054924	7190466
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7070931	7495687	127	125	-2.663	0.00297019698454231	7054924	7190466	0.221820278278150	7280349	7632577
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7653082	31	29	-3.4549	0.22182027827815	7280349	7632577	0.0641183097728583	7584183	7668917
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7709619	35	34	-4.3961	0.0641183097728583	7584183	7668917	5.25876562617809e-07	7700496	7731490
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	8005148	88	87	-3.0052	5.25876562617809e-07	7700496	7731490	2.66552680167732e-08	7964586	8036254
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8010446	8178487	37	35	-4.4439	2.66552680167732e-08	7964586	8036254	0.000151314727750100	8155089	8182880
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8179883	8201959	8	8	-3.0446	0.0001513147277501	8155089	8182880	7.30262531850874e-07	8195174	8204414
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8204414	8245608	13	12	-4.4687	7.30262531850874e-07	8195174	8204414	0.00277499865900073	8221620	8254853
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8251785	8289709	6	6	-3.5974	0.00277499865900073	8221620	8254853	2.49912204714227e-09	8289709	8292347
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8292347	8313045	10	10	-1.9734	2.49912204714227e-09	8289709	8292347	0.000129373290133587	8308608	8340407
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8316416	8687580	101	99	-3.503	0.000129373290133587	8308608	8340407	0.000107154545808641	8630377	8690572
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8689019	8722568	17	17	-4.6988	0.000107154545808641	8630377	8690572	5.20409341237807e-06	8717366	8745585
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8724320	8835526	37	35	-3.5122	5.20409341237807e-06	8717366	8745585	0.00169017533308825	8786453	8869690
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8836109	8949553	25	25	-4.356	0.00169017533308825	8786453	8869690	7.07325928566596e-09	8943871	8949553
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8953090	8956787	3	3	-1.6665	7.07325928566596e-09	8943871	8949553	7.51252249286483e-05	8956787	8960527
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8958121	10513747	111	108	-4.1663	7.51252249286483e-05	8956787	8960527	2.16486161681587e-39	10512616	10515697
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	11673476	18	16	-0.8946	2.16486161681587e-39	10512616	10515697	7.13005967955328e-19	11660512	11673476
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	12541506	13	13	-4.243	7.13005967955328e-19	11660512	11673476	2.37822949276824e-05	12536761	12557151
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	53	-2.3147	2.37822949276824e-05	12536761	12557151	5.96702299274842e-07	12638022	12700767
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	23	-4.0121	5.96702299274842e-07	12638022	12700767	5.3813029435043e-07	12804329	12852769
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	12887023	18	18	-2.4173	5.3813029435043e-07	12804329	12852769	0.0136642161139043	12859309	12898852
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12888523	12926941	15	15	-3.4328	0.0136642161139043	12859309	12898852	6.62713468051898e-06	12925401	12963078
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12928074	13048283	47	47	-1.8078	6.62713468051898e-06	12925401	12963078	3.26877130472751e-07	13034069	13048283
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13050965	13066849	10	10	-3.9898	3.26877130472751e-07	13034069	13048283	4.65290083549787e-10	13066849	13078432
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13076862	13129843	23	23	-1.7937	4.65290083549787e-10	13066849	13078432	1.16750258124835e-22	13121152	13137597
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	14342834	408	394	-3.9697	1.16750258124835e-22	13121152	13137597	1.43208979998954e-10	14331599	14349668
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14376942	16	15	-2.14	1.43208979998954e-10	14331599	14349668	1.89845525358631e-19	14376942	14376942
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14377844	14404284	13	13	-4.7768	1.89845525358631e-19	14376942	14376942	1.89755108191713e-05	14390028	14415559
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14404979	14503185	64	63	-3.2987	1.89755108191713e-05	14390028	14415559	0.0776189597502752	14445814	14503185
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14503927	14508021	3	3	-4.994	0.0776189597502752	14445814	14503185	2.03790972085017e-08	14508021	14524829
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	2.03790972085017e-08	14508021	14524829	NA	NA	NA
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	23	-1.5266	NA	NA	NA	8.84431991659353e-12	14572190	14581797
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14598838	6	6	-4.6415	8.84431991659353e-12	14572190	14581797	4.33786450989583e-05	14597771	14605090
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14601309	14700040	17	17	-2.288	4.33786450989583e-05	14597771	14605090	1.82644766288076e-06	14694578	14709446
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14701706	15139441	90	88	-3.9941	1.82644766288076e-06	14694578	14709446	7.74831093211318e-07	15067468	15161075
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15140278	15299931	91	90	-2.9802	7.74831093211318e-07	15067468	15161075	3.49236196187858e-10	15279629	15311814
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15301380	15433122	87	85	-4.1147	3.49236196187858e-10	15279629	15311814	3.78075635332321e-10	15431247	15433122
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15434486	15447091	6	6	-1.4204	3.78075635332321e-10	15431247	15433122	7.80122703588273e-10	15447091	15450495
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15448670	15523178	31	31	-4.1894	7.80122703588273e-10	15447091	15450495	0.00228511429287012	15499052	15550511
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15587741	35	34	-2.9728	0.00228511429287012	15499052	15550511	0.00143769195410786	15548828	15655003
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15590299	15915466	54	53	-4.073	0.00143769195410786	15548828	15655003	7.52779406784314e-07	15838612	15974702
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16177411	104	101	-2.9232	7.52779406784314e-07	15838612	15974702	0.000169260472492880	16075680	16191571
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16178192	16387273	58	58	-3.6579	0.00016926047249288	16075680	16191571	0.000190046934504147	16279279	16557904
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	17057424	99	96	-4.322	0.000190046934504147	16279279	16557904	1.36087902102198e-06	16777203	17129499
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17062567	17062567	1	0	NA	1.36087902102198e-06	16777203	17129499	NA	NA	NA
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17067188	17351702	51	49	-3.4293	NA	NA	NA	1.41200107556069e-07	17322448	17368306
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17360817	17470781	20	18	-4.91	1.41200107556069e-07	17322448	17368306	9.23080725360034e-06	17464620	17513494
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17473674	17782139	54	52	-3.4947	9.23080725360034e-06	17464620	17513494	0.0276725599824186	17690401	17802714
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17785103	17815797	14	14	-2.4191	0.0276725599824186	17690401	17802714	5.0668506796621e-05	17799408	17832657
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17817586	21018574	424	409	-3.9013	5.0668506796621e-05	17799408	17832657	4.57131785780025e-08	20996944	21026715
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21025470	21054519	14	14	-2.0509	4.57131785780025e-08	20996944	21026715	3.55026482333383e-07	21043581	21066948
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	22216169	285	273	-3.7419	3.55026482333383e-07	21043581	21066948	4.26776341588849e-05	22192409	22232997
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22232997	22268552	14	14	-5.1465	4.26776341588849e-05	22192409	22232997	0.000704605482678041	22261337	22407622
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22308420	22930737	64	61	-3.9785	0.000704605482678041	22261337	22407622	2.24736079731289e-41	22924754	26870361
MSK_252152917524_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	83	-1.2455	2.24736079731289e-41	22924754	26870361	NA	NA	NA
