Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	13110044	4524	4294	0.0219	NA	NA	NA	3.15823581677403e-11	13104898	13110044
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	13647633	13656272	4	3	-1.0213	3.15823581677403e-11	13104898	13110044	3.0692268655996e-10	13649201	13658321
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	13658321	16236840	1058	1002	0.0064	3.0692268655996e-10	13649201	13658321	1.04195207335431e-13	16230368	16239639
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16239639	16262797	8	8	0.7317	1.04195207335431e-13	16230368	16239639	3.39710010173840e-15	16260159	16265269
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16265269	72537426	22300	21318	0.0073	3.3971001017384e-15	16260159	16265269	2.11089478721057e-60	72537426	72540240
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72539143	1	0	NA	2.11089478721057e-60	72537426	72540240	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72540240	72579311	13	6	1.6415	NA	NA	NA	9.76109046357975e-64	72571158	72579311
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	150819879	17556	16779	-9e-04	9.76109046357975e-64	72571158	72579311	3.65620792088935e-25	150819879	150819879
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150839754	4	4	-1.2758	3.65620792088935e-25	150819879	150819879	6.85296451779922e-05	150839754	150843192
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150851439	7	6	-3.5142	6.85296451779922e-05	150839754	150843192	6.9173173614272e-283	150851439	150851439
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2632	0.0132	6.9173173614272e-283	150851439	150851439	4.27609982110039e-71	157133150	157133150
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	3.034	4.27609982110039e-71	157133150	157133150	1.95700172340383e-73	157136342	157136342
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	247186514	32910	31454	-0.0014	1.95700172340383e-73	157136342	157136342	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	37800512	12907	12320	0.0018	NA	NA	NA	3.94136596259488e-27	37792669	37812045
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37803744	37855837	24	24	-0.5366	3.94136596259488e-27	37792669	37812045	1.96407145928346e-26	37848754	37859985
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	52600588	5801	5543	-0.0017	1.96407145928346e-26	37848754	37859985	5.08225445876764e-09	52588009	52600588
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	5.08225445876764e-09	52588009	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	0.7781	NA	NA	NA	8.98954544172164e-10	52635695	52639605
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	66357387	4557	4339	0.0017	8.98954544172164e-10	52635695	52639605	9.00580970640027e-16	66357387	66357387
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	1.3813	9.00580970640027e-16	66357387	66357387	1.65295284214070e-14	66360747	66360747
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	212890878	43839	41891	-0.0014	1.6529528421407e-14	66360747	66360747	1.39874228976231e-20	212890878	212890878
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212892884	212898875	4	4	-1.1535	1.39874228976231e-20	212890878	212890878	1.74844591971025e-21	212898875	212898875
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212900857	227949124	5141	4870	-0.0046	1.74844591971025e-21	212898875	212898875	9.53684176245532e-14	227946001	227952131
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	227950459	227981126	12	12	0.5303	9.53684176245532e-14	227946001	227952131	1.23521300141602e-11	227976902	227996401
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	227986221	242689978	5535	5275	0.0088	1.23521300141602e-11	227976902	227996401	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	199329592	65632	62611	-3e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	4883170	1611	1534	0.0212	NA	NA	NA	9.13486183220864e-13	4883170	4885689
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	4885689	4895991	4	3	-1.1415	9.13486183220864e-13	4883170	4885689	4.7513268843376e-15	4892606	4895991
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	4900352	187330240	52303	49902	-0.0024	4.7513268843376e-15	4892606	4895991	4.9653406456728e-10	187329037	187330240
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187338465	4	4	0.8178	4.9653406456728e-10	187329037	187330240	7.17793796182805e-11	187338465	187346058
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187346058	191133836	1238	1187	-0.0126	7.17793796182805e-11	187338465	187346058	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	191153613	191153613	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	776194	223	212	-0.0198	NA	NA	NA	1.83452887188272e-06	727098	812169
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	812169	829954	5	5	-0.6853	1.83452887188272e-06	727098	812169	1.67636377275516e-09	819038	870657
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	12840501	3745	3557	0.0095	1.67636377275516e-09	819038	870657	2.58052493616777e-21	12840501	12857302
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12853151	12873052	4	4	1.1608	2.58052493616777e-21	12840501	12857302	5.32232816312856e-22	12857302	12873052
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	21480789	2375	2264	-0.0011	5.32232816312856e-22	12857302	12873052	5.78142672307996e-20	21480789	21480789
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21485944	21487474	2	2	-1.5618	5.78142672307996e-20	21480789	21480789	2.72769501804655e-19	21487474	21487474
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21488938	137831933	32734	31257	-0.0025	2.72769501804655e-19	21487474	21487474	2.37510030798822e-13	137830334	137831933
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	137833920	137843309	5	5	-0.8319	2.37510030798822e-13	137830334	137831933	2.7118088198432e-13	137843309	137844931
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	137844931	178040439	13643	13036	0.0036	2.7118088198432e-13	137843309	137844931	3.70381140580317e-09	178040439	178040439
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178044111	178045608	2	2	-1.1067	3.70381140580317e-09	178040439	178040439	7.62724015852186e-10	178045608	178045608
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178047480	180644810	1028	983	0.0264	7.62724015852186e-10	178045608	178045608	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	39	-0.0423	NA	NA	NA	3.11385803833014e-16	198124	202063
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	240119	16	14	0.5156	3.11385803833014e-16	198124	202063	0.000239161855128547	228968	246974
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	241674	268978	15	14	0.2366	0.000239161855128547	228968	246974	0.000206035079813069	258187	307231
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	271851	29980445	10521	10034	0.0021	0.000206035079813069	258187	307231	4.66440985716947e-09	29972382	29986370
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29981912	30005338	9	9	-0.5026	4.66440985716947e-09	29972382	29986370	1.09368313352401e-08	29998009	30021908
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30010234	31385778	581	551	0.0234	1.09368313352401e-08	29998009	30021908	1.06965892417476e-08	31383925	31385778
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31395330	5	5	-0.6757	1.06965892417476e-08	31383925	31385778	1.14558481231655e-08	31395330	31418006
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31418006	32548736	489	463	0.0087	1.14558481231655e-08	31395330	31418006	3.41707579539648e-218	32548736	32558677
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32600962	10	10	-2.7051	3.41707579539648e-218	32548736	32558677	4.04598916278764e-40	32597877	32600962
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	32711957	35	35	-0.0667	4.04598916278764e-40	32597877	32600962	0.000146730181276484	32700719	32720656
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32713363	32728487	9	8	0.6429	0.000146730181276484	32700719	32720656	7.83388246993151e-13	32720656	32731072
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	103841482	21469	20502	4e-04	7.83388246993151e-13	32720656	32731072	1.16099657757889e-12	103827105	103841482
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	3	1.0422	1.16099657757889e-12	103827105	103841482	6.20104339794604e-13	103868154	103868154
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	165643653	21106	20132	-0.0068	6.20104339794604e-13	103868154	103868154	1.44829133824844e-220	165643653	165643653
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165649379	3	3	-4.2093	1.44829133824844e-220	165643653	165643653	9.92244221768422e-185	165649379	165649379
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165650610	170753106	1805	1723	5e-04	9.92244221768422e-185	165649379	165649379	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	244720	40	39	0.0706	NA	NA	NA	5.04519910510022e-17	244720	246786
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	246786	254342	5	4	-1.2225	5.04519910510022e-17	244720	246786	3.13038918180929e-22	251565	254342
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	256802	16135701	5343	5122	0.0086	3.13038918180929e-22	251565	254342	3.52120284815654e-12	16135701	16135701
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	1.3096	3.52120284815654e-12	16135701	16135701	8.67487077434949e-13	16140018	16140018
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	100161629	25670	24501	3e-04	8.67487077434949e-13	16140018	16140018	1.93155932727858e-08	100158582	100162851
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100162851	100174991	6	6	0.6258	1.93155932727858e-08	100158582	100162851	1.57017601176893e-08	100170227	100178968
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100178968	133433384	15029	14341	-0.0064	1.57017601176893e-08	100170227	100178968	0	133433384	133433384
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	-4.2757	0	133433384	133433384	0	133448277	133448277
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	151044155	7721	7400	0.0041	0	133448277	133448277	2.65414344115816e-20	151044155	151044155
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151045748	151056280	5	5	-1.0484	2.65414344115816e-20	151044155	151044155	1.08471021233625e-20	151056280	151056280
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151059107	158821263	2866	2728	0.0026	1.08471021233625e-20	151056280	151056280	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	25022606	8129	7784	-0.0038	NA	NA	NA	1.13106997300925e-126	25022606	25022606
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	-3.2867	1.13106997300925e-126	25022606	25022606	3.01888162655770e-129	25039370	25039370
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	146253929	36433	34808	3e-04	3.0188816265577e-129	25039370	25039370	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	146264846	146264846	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	22477358	7837	7465	-0.0064	NA	NA	NA	5.208325101729e-116	22477358	22477358
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	-3.8244	5.208325101729e-116	22477358	22477358	2.89970050751307e-121	22492603	22492603
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	23338535	160	154	8e-04	2.89970050751307e-121	22492603	22492603	2.30650070137587e-11	23331804	23338535
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23343915	23365926	4	4	0.8323	2.30650070137587e-11	23331804	23338535	6.9969597850093e-11	23365926	23377660
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	70926188	5069	4830	0.0037	6.9969597850093e-11	23365926	23377660	6.14975789783609e-10	70923005	70926188
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.1262	6.14975789783609e-10	70923005	70926188	1.93984213274249e-09	70930528	70930528
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	100348045	9919	9474	-0.0052	1.93984213274249e-09	70930528	70930528	1.91676628282449e-171	100348045	100348045
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	-4.6591	1.91676628282449e-171	100348045	100348045	3.03719795039119e-182	100350814	100350814
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	116124007	5547	5291	-9e-04	3.03719795039119e-182	100350814	100350814	1.5352793530485e-09	116124007	116124007
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-1.1005	1.5352793530485e-09	116124007	116124007	2.74668628383757e-08	116130333	116132839
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	137352394	8295	7905	0.006	2.74668628383757e-08	116130333	116132839	2.92321902150722e-16	137352394	137352394
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.5267	2.92321902150722e-16	137352394	137352394	2.8227427168383e-14	137356880	137356880
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1047	0.0101	2.8227427168383e-14	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	46393097	14462	13797	-0.0035	NA	NA	NA	1.80966075752323e-58	45489823	46407311
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46394835	47938346	116	110	0.3636	1.80966075752323e-58	45489823	46407311	2.55892657363809e-54	47159404	47954413
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47943524	135285645	30230	28912	0.0028	2.55892657363809e-54	47159404	47954413	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5738494	2137	2036	0.0087	NA	NA	NA	3.17069963322232e-29	5734978	5738494
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5741031	5741031	1	0	NA	3.17069963322232e-29	5734978	5738494	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5763749	14	14	-0.7828	NA	NA	NA	6.95709016612531e-33	5763749	5765438
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5765438	55118214	14753	14093	0.0011	6.95709016612531e-33	5763749	5765438	1.05658293916550e-81	55114405	55124730
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55217189	40	39	-0.7347	1.0565829391655e-81	55114405	55124730	1.42601392940365e-80	55207305	55219985
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	66463477	4637	4445	0.0157	1.42601392940365e-80	55207305	55219985	1.48866668878425e-12	66463477	66463477
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	1.3454	1.48866668878425e-12	66463477	66463477	8.20209830069219e-12	66469412	66469412
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	70132648	1266	1205	0.0232	8.20209830069219e-12	66469412	66469412	1.04311918064445e-10	70132648	70132648
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	70134644	70136255	2	2	-1.2394	1.04311918064445e-10	70132648	70132648	7.43656433108941e-12	70136255	70136255
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	70138721	121382162	17491	16681	6e-04	7.43656433108941e-12	70136255	70136255	1.9810438123953e-12	121382162	121384051
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	121384051	121394498	3	3	-1.0351	1.9810438123953e-12	121382162	121384051	1.33888644880402e-12	121385659	121394498
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	121395888	134450318	4958	4727	0.0059	1.33888644880402e-12	121385659	121394498	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	10470425	4088	3928	0.0036	NA	NA	NA	2.91832308754617e-87	10470425	10470425
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10474825	10485848	6	6	-1.9782	2.91832308754617e-87	10470425	10470425	1.13384114011907e-75	10485848	10485848
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10491341	11116883	235	223	-0.0184	1.13384114011907e-75	10485848	10485848	8.29986326808224e-61	11116883	11116883
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	7	1.546	8.29986326808224e-61	11116883	11116883	7.39511767823866e-66	11140421	11140421
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	85544169	24281	23157	-9e-04	7.39511767823866e-66	11140421	11140421	2.47977460270267e-12	85544169	85544169
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	85544596	85550905	2	2	-1.2899	2.47977460270267e-12	85544169	85544169	1.46234552474618e-12	85550905	85550905
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	85551586	85551586	1	0	NA	1.46234552474618e-12	85550905	85550905	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	85553109	130694393	15895	15178	0.0032	NA	NA	NA	4.64164653864047e-16	130694393	130694393
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	1.4555	4.64164653864047e-16	130694393	130694393	3.64041921165771e-16	130701040	130701040
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	621	-0.0031	3.64041921165771e-16	130701040	130701040	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	22183575	1308	1249	-0.0086	NA	NA	NA	3.48885127923726e-14	22179714	22183575
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	22185079	22193363	5	5	-0.8923	3.48885127923726e-14	22179714	22183575	5.12107719136525e-15	22193363	22195538
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	22195538	49964838	10906	10396	-0.0068	5.12107719136525e-15	22193363	22195538	5.48645224088307e-55	49964838	49964838
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-2.6396	5.48645224088307e-55	49964838	49964838	5.62792202272177e-56	49971732	49971732
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56650373	1804	1725	0.0109	5.62792202272177e-56	49971732	49971732	1.8149948823407e-46	56646284	56657371
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56686863	16	16	0.8693	1.8149948823407e-46	56646284	56657371	1.21056433531090e-49	56686863	56688605
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56688605	100690991	13039	12465	-0.0016	1.2105643353109e-49	56686863	56688605	2.86796646892549e-140	100690991	100690991
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-4.1187	2.86796646892549e-140	100690991	100690991	1.98984569354147e-135	100693892	100693892
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4361	-0.0034	1.98984569354147e-135	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18544772	6	6	0.0426	NA	NA	NA	2.13998683814267e-09	18544772	18864561
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	19494416	54	50	-0.814	2.13998683814267e-09	18544772	18864561	9.75132800483572e-137	19490630	19497023
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	69084841	17567	16790	0.0013	9.75132800483572e-137	19490630	19497023	1.22288195860608e-10	69083716	69084841
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69086125	69086125	1	0	NA	1.22288195860608e-10	69083716	69084841	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69092211	3	3	0.9605	NA	NA	NA	1.35354290085641e-10	69092211	69093444
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69093444	73071404	1789	1702	0.0082	1.35354290085641e-10	69092211	69093444	1.44850487639611e-24	73061942	73071404
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73072457	1	0	NA	1.44850487639611e-24	73061942	73071404	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73075500	73092112	6	6	1.0203	NA	NA	NA	3.11831236766615e-22	73092112	73092112
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	105607572	12218	11670	0.0072	3.11831236766615e-22	73092112	73092112	4.58691088616898e-12	105602602	105609466
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105609466	105632168	9	8	0.6625	4.58691088616898e-12	105602602	105609466	2.00755080752505e-12	105632168	105673157
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105856972	50	49	-0.0975	2.00755080752505e-12	105632168	105673157	6.85676535960562e-05	105848335	105872360
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105872360	105881677	4	4	0.5637	6.85676535960562e-05	105848335	105872360	0.000108336347961539	105875924	105901394
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881893	105897061	2	0	NA	0.000108336347961539	105875924	105901394	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105898108	105945006	14	13	-0.0124	NA	NA	NA	9.34050987295276e-10	105923686	105948347
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105946993	106002179	19	19	-0.5943	9.34050987295276e-10	105923686	105948347	9.21341930206846e-14	105996176	106017453
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106216726	89	86	-0.0369	9.21341930206846e-14	105996176	106017453	2.46092829069137e-17	106212061	106218059
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106218059	106253648	17	17	0.6038	2.46092829069137e-17	106212061	106218059	1.13200780936660e-15	106252126	106256498
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106255190	106358491	36	36	0.0353	1.1320078093666e-15	106252126	106256498	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18450562	4	4	-0.1008	NA	NA	NA	4.72302963700667e-06	18427151	18452491
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18452491	19174556	44	43	0.4591	4.72302963700667e-06	18427151	18452491	6.37524680864996e-06	19172531	19176037
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19176037	19186696	3	3	1.1465	6.37524680864996e-06	19172531	19176037	1.50004540096688e-06	19186696	19188571
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19188571	19537035	48	47	0.3876	1.50004540096688e-06	19186696	19188571	1.74833308992638e-12	19465359	19537035
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	19835471	8	8	0.9928	1.74833308992638e-12	19465359	19537035	3.86065853011107e-05	19835471	19844217
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19839695	19882711	6	5	1.5431	3.86065853011107e-05	19835471	19844217	5.85678607328996e-05	19874677	19932166
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19910696	20088256	43	38	0.9233	5.85678607328996e-05	19874677	19932166	2.66642864608723e-125	20079935	20308014
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	98232932	30252	28870	0.0014	2.66642864608723e-125	20079935	20308014	1.62125778259754e-23	98232932	98232932
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98239454	3	3	1.4444	1.62125778259754e-23	98232932	98232932	1.74477571932727e-24	98239454	98239454
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	100298352	911	873	-0.007	1.74477571932727e-24	98239454	98239454	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	14876356	5468	5224	0.0137	NA	NA	NA	3.2953209242474e-09	14672496	14958374
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14956177	15037844	16	16	-0.4038	3.2953209242474e-09	14672496	14958374	4.08256665080926e-10	15028108	15045430
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15039224	15039224	1	0	NA	4.08256665080926e-10	15028108	15045430	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15040558	32379126	5088	4846	0.0199	NA	NA	NA	1.55990587540208e-24	31842335	32527388
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33559207	45	44	0.4131	1.55990587540208e-24	31842335	32527388	2.56684318294968e-26	33525500	33846647
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33647856	68710277	7682	7305	0.01	2.56684318294968e-26	33525500	33846647	2.19334703262715e-11	68693014	68712507
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68712507	68751390	8	8	-0.6194	2.19334703262715e-11	68693014	68712507	3.93159681610272e-12	68747578	68842364
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68753209	68753209	1	0	NA	3.93159681610272e-12	68747578	68842364	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	72941901	1455	1394	0.0026	NA	NA	NA	3.63337026494018e-09	72918129	72941901
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72951581	72964783	5	5	-0.6844	3.63337026494018e-09	72918129	72941901	1.88032576973932e-08	72964783	73025340
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73022578	75093957	754	720	0.0041	1.88032576973932e-08	72964783	73025340	1.05540455597179e-68	75093957	75093957
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	-3.0326	1.05540455597179e-68	75093957	75093957	4.27905738850896e-69	75100865	75100865
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	590	-0.0117	4.27905738850896e-69	75100865	75100865	3.62172714285211e-153	76925748	76925748
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	2.2883	3.62172714285211e-153	76925748	76925748	1.32436555454790e-149	76940218	76940218
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4316	0.0069	1.3243655545479e-149	76940218	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	36673853	13871	13188	0.0135	NA	NA	NA	3.3878711214902e-96	36673853	36673853
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36680557	3	3	-2.9227	3.3878711214902e-96	36673853	36673853	2.28358116347715e-96	36680557	36680557
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36682031	36683509	2	0	NA	2.28358116347715e-96	36680557	36680557	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	40869151	1807	1710	0.0237	NA	NA	NA	3.2079987512007e-07	40866844	40869151
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	40874079	41017338	5	4	-0.6951	3.2079987512007e-07	40866844	40869151	8.28448305779621e-07	41017338	41031191
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41026062	41519702	200	199	0.0323	8.28448305779621e-07	41017338	41031191	1.59955876296430e-42	41518222	41519702
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41521544	1	0	NA	1.5995587629643e-42	41518222	41519702	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41522429	41576147	26	26	-0.7086	NA	NA	NA	3.31489345724151e-06	41562786	41585817
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41577520	41648545	32	32	-0.3921	3.31489345724151e-06	41562786	41585817	7.68815139326827e-19	41644979	41704093
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41652861	78653545	13687	13064	0.0124	7.68815139326827e-19	41644979	41704093	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	53092949	16199	15438	-0.0037	NA	NA	NA	2.73883107127330e-13	53092949	53092949
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-1.3137	2.7388310712733e-13	53092949	53092949	2.52906345142896e-13	53099601	53099601
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6455	4e-04	2.52906345142896e-13	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	210395	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	216768	3000518	1263	1196	0.0194	NA	NA	NA	3.47727572361362e-07	2998694	3000518
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3002994	3003952	2	2	-1.0895	3.47727572361362e-07	2998694	3000518	4.30515353793578e-08	3003952	3005394
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3005394	56825794	18608	17784	0.0206	4.30515353793578e-08	3003952	3005394	4.37764053747634e-20	56823430	56828073
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56828073	56840346	7	7	-0.8865	4.37764053747634e-20	56823430	56828073	2.6881663700416e-18	56837593	56842447
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	63788698	3178	3046	0.0019	2.6881663700416e-18	56837593	56842447	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	560	0.0096	NA	NA	NA	7.44243183401626e-17	1499421	1506379
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1516966	3	3	-1.2867	7.44243183401626e-17	1499421	1506379	0.00664597547175856	1516966	1523000
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1518825	1531162	6	6	-3.6341	0.00664597547175856	1516966	1523000	9.11865799084857e-305	1528899	1531162
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	20010	0.0044	9.11865799084857e-305	1528899	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	10167413	22	22	-0.2459	NA	NA	NA	3.03677204113032e-05	10165953	10167413
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13342486	13435755	2	2	-1.4197	3.03677204113032e-05	10165953	10167413	8.40512369939728e-15	13435755	13435755
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13562263	46922972	13417	12825	-0.0018	8.40512369939728e-15	13435755	13435755	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	22667608	2982	2826	0.0123	NA	NA	NA	2.26818108513374e-67	22644243	22679305
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	22	0.9769	2.26818108513374e-67	22644243	22679305	3.43101704984845e-70	22720195	22735036
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	49571068	13552	12903	0.0169	3.43101704984845e-70	22720195	22735036	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	1427392	787	744	0.0199	NA	NA	NA	1.29533468534202e-05	1424788	1431411
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1434970	5	5	-0.5824	1.29533468534202e-05	1424788	1431411	9.2978857684389e-06	1432891	1437694
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1435082	2302065	608	584	0.0128	9.2978857684389e-06	1432891	1437694	1.54590659441769e-06	2300485	2302065
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	0.7186	1.54590659441769e-06	2300485	2302065	2.480750359843e-07	2304398	2307282
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2708291	389	366	-0.0089	2.480750359843e-07	2304398	2307282	0	2708291	2711273
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	154038318	45001	42837	0.9823	0	2708291	2711273	4.13016841667309e-36	154038318	154038318
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154079002	12	10	2.144	4.13016841667309e-36	154038318	154038318	1.56382306144803e-24	154079002	154085354
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154085354	154442377	89	87	0.9779	1.56382306144803e-24	154079002	154085354	3.56129813690307e-147	154442377	154442377
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	4	-3.5346	3.56129813690307e-147	154442377	154442377	4.10839890097893e-148	154450309	154450309
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	27	1.0213	4.10839890097893e-148	154450309	154450309	1.91455198503986e-98	154578922	154586690
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	191	-0.0224	1.91455198503986e-98	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	114	-4.7643	NA	NA	NA	4.56748148775707e-38	3223585	3773948
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	3772482	1	0	NA	4.56748148775707e-38	3223585	3773948	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3773948	5593746	15	14	-1.3085	NA	NA	NA	5.42552130244585e-17	5422507	6652845
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	169	-4.2174	5.42552130244585e-17	5422507	6652845	1.73947170121145e-06	7013903	7224954
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7495687	128	119	-3.3593	1.73947170121145e-06	7013903	7224954	6.86429963742186e-07	7379019	7603458
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7723783	75	69	-4.4696	6.86429963742186e-07	7379019	7603458	5.12005620904446e-07	7714929	7723783
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7745143	9	8	-2.4028	5.12005620904446e-07	7714929	7723783	0.0086633159070796	7740117	7789562
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7749796	7865557	40	37	-3.683	0.0086633159070796	7740117	7789562	0.00745596790879978	7835361	7895945
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7866716	7914104	9	9	-2.4113	0.00745596790879978	7835361	7895945	3.56473218834839e-06	7911990	7930528
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	8370019	111	106	-4.31	3.56473218834839e-06	7911990	7930528	9.03657699143978e-05	8327467	8378918
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8378918	8463583	14	12	-2.8714	9.03657699143978e-05	8327467	8378918	8.42405310368593e-05	8458018	8518479
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8474062	10513747	264	255	-4.3059	8.42405310368593e-05	8458018	8518479	4.21991695588178e-38	10512616	10535786
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	11673476	18	18	-0.9764	4.21991695588178e-38	10512616	10535786	5.06813766818393e-08	10655750	12514978
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	12682301	67	64	-3.2015	5.06813766818393e-08	10655750	12514978	0.00384187966269218	12615455	12682301
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12733867	9	8	-5.1351	0.00384187966269218	12615455	12682301	3.9310807679034e-05	12721434	12741404
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12741404	12804329	10	9	-4.1228	3.9310807679034e-05	12721434	12741404	2.3097208290164e-05	12792780	12804329
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12809152	12833424	4	4	-5.1296	2.3097208290164e-05	12792780	12804329	0.00794521018653202	12833424	12861657
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	12905395	25	24	-3.4458	0.00794521018653202	12833424	12861657	0.0159725433807028	12882767	12921790
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12909643	12926941	8	8	-4.7417	0.0159725433807028	12882767	12921790	0.00607988797471534	12924438	12973132
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12928074	12928074	1	0	NA	0.00607988797471534	12924438	12973132	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12939004	13119344	76	75	-2.9473	NA	NA	NA	0.223490620976522	12959689	13119344
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13121152	13128515	2	2	-0.5519	0.223490620976522	12959689	13119344	3.72595732477999e-06	13128515	13133803
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13129843	1	0	NA	3.72595732477999e-06	13128515	13133803	NA	NA	NA
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	14524829	506	493	-4.3074	NA	NA	NA	7.24259102411559e-08	14489801	14597771
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14526446	14700040	47	46	-3.3261	7.24259102411559e-08	14489801	14597771	0.000160145879593489	14557473	14765141
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14701706	15920478	395	374	-4.2176	0.000160145879593489	14557473	14765141	5.74035944765264e-06	15798021	15967120
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15928904	16042966	48	44	-3.2215	5.74035944765264e-06	15798021	15967120	8.59735537389333e-10	16017681	16075680
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16043782	21443476	920	880	-4.3522	8.59735537389333e-10	16017681	16075680	1.66662406181345e-05	21433459	21443476
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21444509	21459388	4	4	-1.5822	1.66662406181345e-05	21433459	21443476	1.59868853603598e-05	21459388	21490803
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21473338	22139807	127	120	-4.2985	1.59868853603598e-05	21459388	21490803	7.72034641011671e-05	22043133	22139807
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-2.6043	7.72034641011671e-05	22043133	22139807	3.04499178209242e-08	22177335	22178964
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22192409	5	5	-4.0711	3.04499178209242e-08	22177335	22178964	4.68943781581629e-06	22192409	22202315
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22200078	22252795	21	18	-5.34	4.68943781581629e-06	22192409	22202315	2.53551032166490e-05	22249988	22393417
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22261337	22930737	67	62	-4.2683	2.5355103216649e-05	22249988	22393417	2.84557559504361e-63	22926726	23283689
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	31	-1.2495	2.84557559504361e-63	22926726	23283689	1.20573816880706e-05	26943701	26995399
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	18	-2.9709	1.20573816880706e-05	26943701	26995399	6.77975858832028e-05	27000085	27068911
MSK_252152917536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	29	-0.9405	6.77975858832028e-05	27000085	27068911	NA	NA	NA
