Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	12762774	4514	4333	-0.2903	NA	NA	NA	4.03811008712145e-61	12762774	12762774
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12769521	12831942	5	4	-1.9592	4.03811008712145e-61	12762774	12762774	3.35018864442156e-54	12831942	12831942
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12835156	17094475	1280	1224	-0.3287	3.35018864442156e-54	12831942	12831942	4.70468951774731e-09	17094326	17094475
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17102601	17112697	4	4	0.3442	4.70468951774731e-09	17094326	17094475	9.02254876509765e-09	17112697	17114337
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17114337	19067643	795	755	-0.3198	9.02254876509765e-09	17112697	17114337	3.47805368365867e-07	19032575	19078995
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	19068841	19106587	36	33	-0.1059	3.47805368365867e-07	19032575	19078995	5.41793453276317e-08	19098575	19119413
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	19107357	30608434	4606	4399	-0.3192	5.41793453276317e-08	19098575	19119413	3.03098165553275e-28	30511860	30705615
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	30617062	31257138	173	166	-0.1408	3.03098165553275e-28	30511860	30705615	1.43687834706880e-31	31255447	31257138
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	31259122	31284977	16	15	-0.7548	1.4368783470688e-31	31255447	31257138	5.75255539244105e-44	31284977	31288985
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	31288985	33107731	770	734	-0.1269	5.75255539244105e-44	31284977	31288985	1.61680929561188e-113	33091093	33128792
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	33110218	33110218	1	0	NA	1.61680929561188e-113	33091093	33128792	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	33112949	37687560	1786	1715	0.0502	NA	NA	NA	1.20192705428634e-46	37687560	37687560
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	37692387	37696203	3	3	-1.4713	1.20192705428634e-46	37687560	37687560	2.70727042434805e-46	37696203	37696203
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	37697870	42327265	1871	1789	0.0592	2.70727042434805e-46	37696203	37696203	0	42303967	42350354
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	42347235	44969460	1113	1065	-0.3551	0	42303967	42350354	0	44961633	44977505
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	44973058	61884298	6658	6388	0.0439	0	44961633	44977505	9.526595058777e-09	61881731	61884298
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	61887342	61890388	3	3	-0.6178	9.526595058777e-09	61881731	61884298	1.83181374243425e-08	61890388	61892291
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	61892291	62607071	336	322	0.049	1.83181374243425e-08	61890388	61892291	1.09646209983714e-114	62588626	62628577
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	62615943	63374452	259	238	0.4041	1.09646209983714e-114	62588626	62628577	2.80945420899767e-225	63357819	63384916
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	63380546	72537426	3665	3513	0.0403	2.80945420899767e-225	63357819	63384916	0	72537426	72537426
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	1.863	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	141559466	15594	14919	0.0469	0	72579311	72579311	0	121024339	142723311
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	142719230	149225719	1250	1188	0.3835	0	121024339	142723311	4.02159053223954e-52	149214619	149238456
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	149226849	149510949	141	135	0.642	4.02159053223954e-52	149214619	149238456	6.77548252982544e-49	149494658	149523018
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	149513087	150823073	572	545	0.3767	6.77548252982544e-49	149494658	149523018	2.56419518524953e-78	150823073	150836484
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150851439	10	9	-0.8354	2.56419518524953e-78	150823073	150836484	8.2663905400493e-43	150847304	150851439
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	75	0.3302	8.2663905400493e-43	150847304	150851439	7.93945290949547e-96	151026228	151026228
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	-2.0845	7.93945290949547e-96	151026228	151026228	2.65860757385558e-131	151036435	151036435
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	153757499	1253	1198	0.3936	2.65860757385558e-131	151036435	151036435	2.72623311593188e-97	153745093	153770743
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	153760427	154294041	227	220	0.7087	2.72623311593188e-97	153745093	153770743	2.45286737732161e-09	154257679	154318372
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	154294875	154471439	84	82	0.9024	2.45286737732161e-09	154257679	154318372	3.89855171150639e-08	154446633	154488480
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	154473257	154573971	51	49	0.6508	3.89855171150639e-08	154446633	154488480	4.76800725617421e-17	154552855	154594192
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	154576093	157133150	1064	1006	0.3965	4.76800725617421e-17	154552855	154594192	1.01426959214675e-96	157133150	157133150
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	3.2674	1.01426959214675e-96	157133150	157133150	1.24720969583335e-100	157136342	157136342
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	161099582	1622	1543	0.3653	1.24720969583335e-100	157136342	157136342	3.49850609241844e-07	161099067	161099582
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161104752	161104791	2	2	-0.4344	3.49850609241844e-07	161099067	161099582	2.31428132469855e-09	161104791	161104791
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161108722	167483267	2484	2357	0.3727	2.31428132469855e-09	161104791	161104791	1.48373604909089e-13	167481271	167497116
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167506259	6	6	0.932	1.48373604909089e-13	167481271	167497116	7.99790049794784e-12	167497116	167507882
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167507882	177016348	3745	3599	0.3778	7.99790049794784e-12	167497116	167507882	3.14184412784044e-61	177008143	177022766
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	177017665	177308643	116	114	0.0919	3.14184412784044e-61	177008143	177022766	2.7496235372418e-54	177304113	177312695
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	177309944	177595302	129	124	0.4062	2.7496235372418e-54	177304113	177312695	9.14867181655435e-06	177593746	177595302
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	177596757	177599597	3	3	-0.0633	9.14867181655435e-06	177593746	177595302	2.34681158544449e-07	177599597	177604352
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	177601540	177601540	1	0	NA	2.34681158544449e-07	177599597	177604352	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	177604352	177651166	22	22	0.4043	NA	NA	NA	3.09687064611424e-13	177651166	177651166
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	177661937	177662982	2	2	-0.4816	3.09687064611424e-13	177651166	177651166	8.44438509926068e-10	177662982	177665329
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	177665329	200609726	7334	7013	0.398	8.44438509926068e-10	177662982	177665329	4.59443261312833e-13	200596027	200623556
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200612164	200668993	22	22	0.0936	4.59443261312833e-13	200596027	200623556	2.99308220054171e-11	200654700	200689399
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200670407	212540122	4485	4301	0.3836	2.99308220054171e-11	200654700	200689399	7.11429974226653e-40	212534153	212546544
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	212543362	212641216	51	48	0.0197	7.11429974226653e-40	212534153	212546544	1.91276552879238e-20	212635107	212644511
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	212642996	212733786	45	45	0.3886	1.91276552879238e-20	212635107	212644511	6.20202459492306e-16	212728512	212744770
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	212735366	212927906	83	82	0.6863	6.20202459492306e-16	212728512	212744770	1.202507217618e-50	212910895	212941273
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	212930241	215906033	1177	1130	0.377	1.202507217618e-50	212910895	212941273	9.48742499882682e-22	215899768	215907856
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	215907856	215949691	20	20	-0.0203	9.48742499882682e-22	215899768	215907856	2.82329928590504e-20	215941709	215953658
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	215950141	241012909	9144	8784	0.3767	2.82329928590504e-20	215941709	215953658	2.16205749687376e-12	240984241	241091628
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	241014635	241433682	45	43	0.1654	2.16205749687376e-12	240984241	241091628	1.05190016969680e-10	241415541	241462960
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	241440101	247186514	2372	2274	0.3694	1.0519001696968e-10	241415541	241462960	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	29008141	9143	8751	0.5462	NA	NA	NA	0	28996139	29019905
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	29011942	35821494	2881	2741	0.266	0	28996139	29019905	1.96144314974881e-12	35821494	35821494
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	-0.7086	1.96144314974881e-12	35821494	35821494	1.77547450649639e-13	35844884	35844884
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	52600588	6706	6419	0.2772	1.77547450649639e-13	35844884	35844884	6.13165893287037e-10	52588009	52600588
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	6.13165893287037e-10	52588009	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	0.8803	NA	NA	NA	4.98139993005043e-10	52635695	52639605
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	66038336	4484	4300	0.276	4.98139993005043e-10	52635695	52639605	6.61004047696034e-25	66038336	66038336
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66041319	66049853	3	3	-0.8051	6.61004047696034e-25	66038336	66038336	1.08685565793830e-26	66049853	66049853
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66055464	66357387	70	68	0.2457	1.0868556579383e-26	66049853	66049853	5.23056866598088e-35	66357387	66357387
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	1.709	5.23056866598088e-35	66357387	66357387	1.29192301884409e-28	66360747	66360747
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	78511728	4138	3952	0.2765	1.29192301884409e-28	66360747	66360747	2.70956168328488e-89	78504707	78519674
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	78514175	79076058	128	119	0.6075	2.70956168328488e-89	78504707	78519674	2.05562187315139e-91	79048628	79088557
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	79079594	85007845	1548	1490	0.2653	2.05562187315139e-91	79048628	79088557	1.30025134963085e-205	84999167	85030438
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	85016337	86189651	486	467	0.5677	1.30025134963085e-205	84999167	85030438	1.41778135409618e-159	86180763	86196569
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	86191854	91168837	771	730	0.2627	1.41778135409618e-159	86180763	86196569	3.49689802426748e-253	91143626	94892766
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	91173586	105427487	3314	3167	0.0291	3.49689802426748e-253	91143626	94892766	8.8270292441507e-144	105421967	105437320
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	105430432	106083103	175	172	0.3646	8.8270292441507e-144	105421967	105437320	6.60424426216616e-05	106045532	106106533
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106085077	106163760	37	35	0.2075	6.60424426216616e-05	106045532	106106533	0.00266494194601004	106134788	106179390
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106167160	106244482	17	17	0.3957	0.00266494194601004	106134788	106179390	1.01071769071657e-46	106244482	106244482
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106247167	106250718	2	2	-1.2538	1.01071769071657e-46	106244482	106244482	1.58691851898804e-40	106250718	106250718
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106253229	106662029	54	51	0.3411	1.58691851898804e-40	106250718	106250718	1.88402482308939e-35	106651890	106675345
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106665190	112745189	1373	1309	0.0237	1.88402482308939e-35	106651890	106675345	4.5487760690357e-15	112742471	112750646
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	112747508	112764889	7	7	0.587	4.5487760690357e-15	112742471	112750646	6.68299606769085e-16	112752277	112768403
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	112768403	141378786	7941	7632	0.022	6.68299606769085e-16	112752277	112768403	2.96581478080839e-22	141340074	141400276
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	141380040	141658099	132	128	-0.1341	2.96581478080839e-22	141340074	141400276	7.52211610345397e-08	141652149	141662419
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	141660608	141688878	13	13	-0.4228	7.52211610345397e-08	141652149	141662419	8.72172600874466e-05	141679625	141711540
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	141691411	141896390	89	88	-0.182	8.72172600874466e-05	141679625	141711540	7.0620142518869e-29	141879524	141916405
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	141898524	146571330	1553	1484	0.0259	7.0620142518869e-29	141879524	141916405	4.83942752044006e-45	146571330	146571330
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	1.2009	4.83942752044006e-45	146571330	146571330	1.23018171224748e-43	146592775	146592775
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	203889616	18725	17953	0.0052	1.23018171224748e-43	146592775	146592775	2.99081805222565e-38	203889616	203889616
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	203892886	203898334	4	4	-0.8529	2.99081805222565e-38	203889616	203889616	2.86148989733634e-22	203898334	203898334
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	203900226	212890878	3328	3177	-0.0116	2.86148989733634e-22	203898334	203898334	2.07904505494981e-12	212889077	212890878
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212892884	212898875	4	4	-0.6462	2.07904505494981e-12	212889077	212890878	1.24824078539313e-10	212898875	212900857
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212900857	241651521	10339	9876	-0.0106	1.24824078539313e-10	212898875	212900857	8.164663802659e-05	241645942	241651521
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	241653599	241653599	1	0	NA	8.164663802659e-05	241645942	241651521	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	241655460	241658426	3	3	-0.5232	NA	NA	NA	2.51353593266608e-05	241658426	241662868
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	241660613	242689978	345	333	0.0159	2.51353593266608e-05	241658426	241662868	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	6290643	2154	2058	0.0249	NA	NA	NA	3.47383439899379e-08	6279161	6290643
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	6294232	6297993	2	2	0.7669	3.47383439899379e-08	6279161	6290643	9.70056847043139e-25	6297993	6309877
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	6309877	75479859	24720	23658	0.039	9.70056847043139e-25	6297993	6309877	8.40513647003046e-27	75464737	75787094
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75783255	76034950	24	23	-0.268	8.40513647003046e-27	75464737	75787094	1.56665007094509e-16	76013273	76045769
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76039417	122094500	12186	11691	0.0414	1.56665007094509e-16	76013273	76045769	0	122090535	122097590
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	122097008	123910067	712	688	-0.3852	0	122090535	122097590	0	123908290	123915357
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	123914753	129425840	2368	2278	0.0467	0	123908290	123915357	1.37430029605188e-281	129419728	129432012
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	129427633	130414719	466	451	0.3813	1.37430029605188e-281	129419728	129432012	2.63600811258995e-295	130409171	130420291
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	130416758	139524412	3196	3047	0.0525	2.63600811258995e-295	130409171	130420291	5.58092288689777e-15	139519588	139528332
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	139526502	139552150	15	15	0.4333	5.58092288689777e-15	139519588	139528332	4.83892915009368e-15	139549508	139557968
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	139554238	151297559	3599	3461	0.0588	4.83892915009368e-15	139549508	139557968	3.03832507994137e-34	151285062	151307868
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	151299683	151574817	47	46	0.3797	3.03832507994137e-34	151285062	151307868	1.61396986499723e-35	151554551	151584709
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	151578107	164005577	4002	3846	0.0584	1.61396986499723e-35	151554551	151584709	1.40518388041421e-17	164005577	164012645
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	0.7484	1.40518388041421e-17	164005577	164012645	5.78877330750956e-17	164019640	164027724
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	170188570	1506	1433	0.069	5.78877330750956e-17	164019640	164027724	0	170174570	170210574
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	170201812	171515762	612	588	0.4187	0	170174570	170210574	0	171510626	171525524
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	171521511	176559755	2011	1907	0.0648	0	171510626	171525524	5.03584579887593e-07	176559299	176559755
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	176563796	176566161	2	2	-0.6405	5.03584579887593e-07	176559299	176559755	2.67613221336035e-08	176566161	176568986
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	176568986	187552857	3597	3448	0.0693	2.67613221336035e-08	176566161	176568986	6.91786458864028e-08	187551645	187552857
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	187555151	187556304	2	2	-0.682	6.91786458864028e-08	187551645	187552857	3.3555919775016e-08	187556304	187557704
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	187557704	191219222	1412	1354	0.0618	3.3555919775016e-08	187556304	187557704	3.53501806834506e-20	191219222	191219222
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191221758	191222891	2	2	-1.0968	3.53501806834506e-20	191219222	191219222	2.43509995871283e-19	191222891	191222891
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191224191	194354505	1006	965	0.0589	2.43509995871283e-19	191222891	191222891	7.2305600123344e-11	194353315	194358882
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	0.5586	7.2305600123344e-11	194353315	194358882	2.19299793679918e-09	194365648	194371608
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	198407689	1612	1548	0.0739	2.19299793679918e-09	194365648	194371608	1.26756609359998e-19	198388401	198420349
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198410995	198586332	64	62	0.2918	1.26756609359998e-19	198388401	198420349	5.53778398301962e-15	198573723	198620583
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198589643	199329592	304	289	0.0728	5.53778398301962e-15	198573723	198620583	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	61552	10	10	0.0981	NA	NA	NA	1.49348705473649e-106	61552	71148
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	65688	68905670	18423	17653	-0.3789	1.49348705473649e-106	61552	71148	2.69205303731607e-101	68901210	68905670
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	0.2594	2.69205303731607e-101	68901210	68905670	7.08633434206526e-35	69165814	69643272
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	70190682	118	110	-0.4001	7.08633434206526e-35	69165814	69643272	3.98629812174528e-42	70190682	70190682
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70207908	70216707	3	3	-2.0012	3.98629812174528e-42	70190682	70190682	6.13546968779554e-52	70216707	70216707
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70294312	119334954	16177	15470	-0.3867	6.13546968779554e-52	70216707	70216707	2.14098019844657e-38	119334954	119345371
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119345371	119348829	3	3	-1.7805	2.14098019844657e-38	119334954	119345371	1.26368398226256e-22	119346804	119348829
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119350354	119514714	82	78	-0.4185	1.26368398226256e-22	119346804	119348829	2.71386658377373e-12	119505364	119550771
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119520357	119700930	28	27	-0.106	2.71386658377373e-12	119505364	119550771	4.15121280971307e-14	119676881	119732017
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119720703	171232666	14391	13795	-0.3914	4.15121280971307e-14	119676881	119732017	2.62871816868481e-10	171232666	171232666
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	171236259	171236270	2	2	-1.2954	2.62871816868481e-10	171232666	171232666	1.54577590988616e-10	171236270	171236270
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	171242113	186875633	4458	4274	-0.3906	1.54577590988616e-10	171236270	171236270	2.01244604817918e-08	186875633	186875633
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186876783	186882219	3	2	-1.205	2.01244604817918e-08	186875633	186875633	1.39198110243017e-07	186882219	186883431
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186883431	187330240	206	190	-0.3784	1.39198110243017e-07	186882219	186883431	2.80169979716616e-19	187330240	187330240
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	0.922	2.80169979716616e-19	187330240	187330240	4.50934461032101e-23	187333619	187333619
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1187	-0.403	4.50934461032101e-23	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	12857302	3975	3797	0.0168	NA	NA	NA	2.45947138719787e-74	12857302	12857302
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	-2.3723	2.45947138719787e-74	12857302	12857302	3.92648588626467e-90	12873052	12873052
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	46150784	9150	8762	0.0454	3.92648588626467e-90	12873052	12873052	0	45930997	49644792
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	49595677	99730324	14781	14155	-0.2081	0	45930997	49644792	0	99664445	99795712
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	99736771	127434789	7410	7080	0.0131	0	99664445	99795712	4.201370725605e-22	127434789	127434789
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	127436376	127438118	2	2	-1.1948	4.201370725605e-22	127434789	127434789	2.74900084325365e-20	127438118	127438118
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	127439603	140201609	4759	4560	0.0238	2.74900084325365e-20	127438118	127438118	1.76443748440559e-09	140195260	140201609
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140203440	140216524	8	8	0.4465	1.76443748440559e-09	140195260	140201609	6.10210956525796e-13	140216524	140221835
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	178040439	12649	12117	0.0153	6.10210956525796e-13	140216524	140221835	5.37295852433092e-12	178040439	178040439
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178044111	178045608	2	2	-0.8195	5.37295852433092e-12	178040439	178040439	7.75849175472038e-09	178045608	178045608
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178047480	178047480	1	0	NA	7.75849175472038e-09	178045608	178045608	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178053491	180644810	1027	979	0.0492	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	109360	2	2	0.283	NA	NA	NA	2.02202727313832e-05	109360	111259
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	111259	198124	37	35	-0.4224	2.02202727313832e-05	109360	111259	5.16802815373289e-25	198124	200350
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	200350	236535	15	14	0.2319	5.16802815373289e-25	198124	200350	1.73989015261341e-05	227473	248239
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	237952	326323	47	45	-0.057	1.73989015261341e-05	227473	248239	1.99881107027686e-29	320854	332608
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	11573826	4034	3857	-0.3836	1.99881107027686e-29	320854	332608	0	11556005	11582344
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	11576399	31381060	7044	6742	-0.0573	0	11556005	11582344	0.000516033374645617	31198190	31385778
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31382291	31390982	6	5	-0.2172	0.000516033374645617	31198190	31385778	0.000729234477630352	31383925	31390982
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31393624	31418006	3	3	0.5989	0.000729234477630352	31383925	31390982	1.42400940381772e-07	31418006	31425113
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	32558677	489	465	-0.0037	1.42400940381772e-07	31418006	31425113	4.72633935089626e-51	32558677	32567462
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32597877	8	8	-1.0199	4.72633935089626e-51	32558677	32567462	1.20345414935998e-08	32588005	32600962
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32600962	32713363	37	37	-0.1818	1.20345414935998e-08	32588005	32600962	0.00179098335891594	32703109	32745036
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32762061	21	19	-0.6175	0.00179098335891594	32703109	32745036	1.45227674224830e-190	32734957	32766023
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32766023	54035000	8246	7884	-0.0922	1.4522767422483e-190	32734957	32766023	2.19056656633533e-205	54035000	54035000
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-2.0227	2.19056656633533e-205	54035000	54035000	7.07484599166795e-90	54042734	54042734
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	57065925	1161	1095	-0.0469	7.07484599166795e-90	54042734	54042734	7.29353831413173e-20	57058517	57067287
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	57067287	57092558	13	13	-0.4978	7.29353831413173e-20	57058517	57067287	1.21074299675418e-18	57087455	57098838
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	57097294	66453686	1458	1406	-0.0623	1.21074299675418e-18	57087455	57098838	7.10439295678587e-09	66453686	66453686
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	66456250	66460548	2	2	-0.8354	7.10439295678587e-09	66453686	66453686	6.62158275974942e-09	66460548	66461980
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	66461980	74647491	2654	2535	-0.0483	6.62158275974942e-09	66460548	66461980	1.87644594315183e-09	74647491	74647491
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74650995	74653360	2	2	0.7614	1.87644594315183e-09	74647491	74647491	5.42715431068341e-09	74653360	74655219
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74655219	79018959	1142	1095	-0.0479	5.42715431068341e-09	74653360	74655219	3.37292204353027e-71	79018959	79018959
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	12	-0.9636	3.37292204353027e-71	79018959	79018959	1.04316473723769e-74	79091850	79091850
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	103841482	6762	6488	-0.0548	1.04316473723769e-74	79091850	79091850	1.00274648715109e-80	103841482	103841482
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-1.69	1.00274648715109e-80	103841482	103841482	2.82531430847384e-82	103868154	103868154
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	139643729	12380	11863	-0.0548	2.82531430847384e-82	103868154	103868154	1.70437393840239e-14	139643729	139643729
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139645417	139648318	3	3	-0.8639	1.70437393840239e-14	139643729	139643729	8.1699451912172e-14	139648318	139648318
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139651247	165643653	8723	8320	-0.0577	8.1699451912172e-14	139648318	139648318	3.05312140138271e-39	165643653	165643653
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.1005	3.05312140138271e-39	165643653	165643653	2.7731619286209e-36	165650610	165650610
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1721	-0.073	2.7731619286209e-36	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	34061941	12106	11625	0.0448	NA	NA	NA	3.73616874630664e-63	34052885	34068140
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	34063053	34063053	1	0	NA	3.73616874630664e-63	34052885	34068140	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	34064506	34339714	104	102	0.3395	NA	NA	NA	9.43308707069165e-69	34329582	34353214
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	34345446	71894353	9576	9186	0.0304	9.43308707069165e-69	34329582	34353214	1.75685678111012e-14	71894353	71894353
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71911940	71912065	2	2	-0.9976	1.75685678111012e-14	71894353	71894353	1.82916704336924e-15	71912065	71912065
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71914572	100164752	9273	8908	0.0501	1.82916704336924e-15	71912065	71912065	2.89729455166719e-16	100162851	100164752
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100166257	100174991	4	4	0.7085	2.89729455166719e-16	100162851	100164752	1.00847759408252e-13	100174991	100178968
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100178968	109757592	4120	3930	0.0504	1.00847759408252e-13	100174991	100178968	2.30135423992047e-13	109734773	109769756
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109760168	109872252	45	44	-0.1415	2.30135423992047e-13	109734773	109769756	1.73530575148633e-05	109862660	109877005
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109875379	109892649	8	8	-0.4294	1.73530575148633e-05	109862660	109877005	0.000346178372648786	109886471	109906005
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109894107	110004696	43	41	-0.1725	0.000346178372648786	109886471	109906005	3.2283735091993e-11	109993119	110030816
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	110005948	110005948	1	0	NA	3.2283735091993e-11	109993119	110030816	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	110007471	111727311	820	793	0.0179	NA	NA	NA	7.99293615025768e-58	111727311	111729122
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	111729122	111746764	11	11	-0.7933	7.99293615025768e-58	111727311	111729122	3.87963473539113e-56	111745499	111746764
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	111751162	118611324	3151	3005	0.0419	3.87963473539113e-56	111745499	111746764	4.62938370414203e-65	118611324	118611324
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	-1.6762	4.62938370414203e-65	118611324	118611324	5.86924700300908e-61	118620875	118620875
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	133433384	6827	6532	0.039	5.86924700300908e-61	118620875	118620875	6.51934922478925e-250	133433384	133436265
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	-2.0953	6.51934922478925e-250	133433384	133436265	2.25567904935689e-254	133447868	133448277
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141690753	3830	3680	0.0413	2.25567904935689e-254	133447868	133448277	1.62796185665282e-59	141690753	141690753
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141711513	8	8	1.0635	1.62796185665282e-59	141690753	141690753	3.60677327484569e-50	141711513	141711513
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141712786	142152205	169	163	0.0635	3.60677327484569e-50	141711513	141711513	1.01248974695133e-06	142136345	142152205
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142156165	142187073	8	8	0.4323	1.01248974695133e-06	142136345	142152205	3.23690802685790e-11	142187073	142188727
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142187097	142526341	148	141	0.0191	3.2369080268579e-11	142187073	142188727	1.11971644945667e-129	142526341	142535936
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142535936	142602080	33	33	-0.8013	1.11971644945667e-129	142526341	142535936	6.72574252721876e-151	142602080	142602080
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142605735	158821263	6396	6119	0.0335	6.72574252721876e-151	142602080	142602080	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	25022606	8129	7777	0.021	NA	NA	NA	4.65761028877911e-90	25022606	25022606
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	-2.0819	4.65761028877911e-90	25022606	25022606	2.33225067395148e-41	25039370	25039370
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	25120552	27	27	-0.0208	2.33225067395148e-41	25039370	25039370	1.12028767402571e-14	25120552	25120552
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	1.12028767402571e-14	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	-1.0121	NA	NA	NA	1.31897045585881e-12	25125700	25125700
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	25628537	241	231	0.0103	1.31897045585881e-12	25125700	25125700	6.98012510687218e-221	25620654	25631081
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25630954	30651493	1936	1857	-0.3888	6.98012510687218e-221	25620654	25631081	1.43661922333989e-127	30646909	30654090
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	30654090	30895517	98	93	0.0687	1.43661922333989e-127	30646909	30654090	7.9469619972359e-52	30880889	30922602
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	30903548	31376559	149	145	0.4195	7.9469619972359e-52	30880889	30922602	1.16460972385979e-147	31365985	31403058
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	31390232	40892587	2988	2865	0.0404	1.16460972385979e-147	31365985	31403058	2.25092489270524e-67	40892587	40892587
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-2.0884	2.25092489270524e-67	40892587	40892587	8.00192580138333e-70	40897469	40897469
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	101249031	16862	16133	0.0428	8.00192580138333e-70	40897469	40897469	0	101245220	101255162
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	101253602	102721297	511	494	0.3935	0	101245220	101255162	0	102715326	102727750
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	102723669	115701209	3922	3759	0.0548	0	102715326	102727750	2.45410230760171e-12	115701209	115701209
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115705898	115711730	2	2	-0.8886	2.45410230760171e-12	115701209	115701209	6.46706352336207e-13	115711730	115711730
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115718942	122475698	2135	2044	0.048	6.46706352336207e-13	115711730	115711730	2.16684409309836e-12	122475698	122475698
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	122481289	122486046	2	2	0.9662	2.16684409309836e-12	122475698	122475698	1.51250206354291e-24	122486046	122486046
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	122490361	144968042	7102	6788	0.0453	1.51250206354291e-24	122486046	122486046	2.11845758682938e-26	144968042	144968042
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144968840	144968840	1	0	NA	2.11845758682938e-26	144968042	144968042	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144970607	144970777	2	2	1.2207	NA	NA	NA	2.58297888933455e-15	144970777	144970777
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144972090	145327758	148	143	0.1599	2.58297888933455e-15	144970777	144970777	6.02119472843506e-09	145322549	145327758
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	145328970	145330767	2	0	NA	6.02119472843506e-09	145322549	145327758	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	145333207	145334573	2	2	-0.6552	NA	NA	NA	3.09466362332798e-06	145334573	145336073
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	145336073	146264846	299	289	0.1596	3.09466362332798e-06	145334573	145336073	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	6585206	2424	2319	-0.3945	NA	NA	NA	1.60636898062865e-38	6578755	6592743
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	6588697	6749321	67	64	-0.0945	1.60636898062865e-38	6578755	6592743	1.78046184953055e-32	6735231	6764206
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	6751638	129499038	31148	29831	-0.3844	1.78046184953055e-32	6735231	6764206	3.31239539547522e-16	129495684	129499038
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	129500901	129506210	3	3	-0.9835	3.31239539547522e-16	129495684	129499038	1.94311500212908e-12	129506210	129508476
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	129508476	140145683	4302	4141	-0.2711	1.94311500212908e-12	129506210	129508476	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	53683740	16302	15630	0.037	NA	NA	NA	1.00922118252329e-11	53683740	53683740
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53686515	53687880	2	2	0.9683	1.00922118252329e-11	53683740	53683740	2.27979657111839e-12	53687880	53687880
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53689554	70949263	5371	5138	0.0495	2.27979657111839e-12	53687880	53687880	9.90775819029415e-12	70949263	70949263
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70952973	70960187	4	3	-0.6821	9.90775819029415e-12	70949263	70949263	3.14505501867873e-11	70960187	70964344
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70964344	77917870	2912	2803	0.0636	3.14505501867873e-11	70960187	70964344	1.36339309963794e-18	77917870	77917870
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77917893	77928738	4	4	0.8893	1.36339309963794e-18	77917870	77917870	1.98014989464162e-19	77928738	77928738
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	111980024	11759	11284	0.0463	1.98014989464162e-19	77928738	77928738	5.14211177984304e-296	111974745	111983408
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	111983408	112563865	245	233	-0.3809	5.14211177984304e-296	111974745	111983408	3.52504134788269e-274	112561063	112567106
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	112565699	133734059	7584	7269	0.0389	3.52504134788269e-274	112561063	112567106	7.55611576670464e-11	133734059	133734059
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	133740643	133742185	2	2	-0.8763	7.55611576670464e-11	133734059	133734059	1.22256787331083e-08	133742185	133760059
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	133760059	135058235	562	543	0.1095	1.22256787331083e-08	133742185	133760059	4.91998564300504e-09	135024324	135085997
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	135059558	135285645	61	60	-0.0798	4.91998564300504e-09	135024324	135085997	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	941812	286	269	-0.1812	NA	NA	NA	0.000770795992614414	887340	949995
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	943067	969305	13	12	-0.441	0.000770795992614414	887340	949995	0.00708085870528809	957217	1043855
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	970729	2113447	483	462	-0.2139	0.00708085870528809	957217	1043855	3.23416033290221e-05	2098022	2120511
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	2113999	2137186	21	21	0.0171	3.23416033290221e-05	2098022	2120511	8.09753327163647e-31	2134029	2141724
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	2138247	13321370	4470	4253	-0.372	8.09753327163647e-31	2134029	2141724	0	13312434	13331243
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	13323118	18906505	2100	2012	-0.1091	0	13312434	13331243	1.13441599838284e-33	18906505	18906505
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18908541	18917191	5	4	0.9631	1.13441599838284e-33	18906505	18906505	3.45972655248318e-32	18917191	18917191
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18929375	55123719	9528	9130	-0.1086	3.45972655248318e-32	18917191	18917191	0	55123719	55123719
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55124730	55209626	38	36	-2.9729	0	55123719	55123719	0	55209626	55209626
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	66463477	4638	4453	-0.0656	0	55209626	55209626	2.99367217822008e-52	66463477	66463477
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	0.9749	2.99367217822008e-52	66463477	66463477	1.82946754099009e-17	66469412	66469412
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	66663058	85	84	-0.0337	1.82946754099009e-17	66469412	66469412	2.89539102426019e-31	66663058	66663058
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66665139	66673172	4	4	-1.0024	2.89539102426019e-31	66663058	66663058	8.8389658811732e-22	66673172	66673172
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66675101	73262111	2398	2288	-0.0547	8.8389658811732e-22	66673172	66673172	9.57626446541246e-284	73252016	73269889
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	73264367	74656638	578	559	0.2606	9.57626446541246e-284	73252016	73269889	1.35343142255216e-179	74634911	74671518
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	74658145	106733851	10333	9889	0.049	1.35343142255216e-179	74634911	74671518	1.69560125977499e-79	106733851	106733851
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106744337	106747920	4	4	-1.5702	1.69560125977499e-79	106733851	106733851	7.11960489509266e-78	106747920	106747920
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106754784	116304167	3213	3085	0.04	7.11960489509266e-78	106747920	106747920	0	116299299	116310316
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	116306589	125320942	3746	3601	0.3807	0	116299299	116310316	6.77627817017326e-05	125317396	125324390
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	125322089	125329703	4	4	-0.0973	6.77627817017326e-05	125317396	125324390	7.18689409845375e-18	125327689	125333023
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	125330890	128523122	1027	983	0.4	7.18689409845375e-18	125327689	125333023	0	128515608	128555669
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	128539399	134450318	2328	2215	0.0272	0	128515608	128555669	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9421132	3735	3589	0.0567	NA	NA	NA	9.37539142229719e-22	9410002	9431548
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9423653	9626623	24	24	-0.3211	9.3753914222972e-22	9410002	9431548	3.38427254130527e-21	9604633	9628897
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626736	10466791	328	315	0.0312	3.38427254130527e-21	9604633	9628897	5.88572109061027e-10	10464018	10474825
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10470425	10485848	7	7	-0.4006	5.88572109061027e-10	10464018	10474825	6.5225718046653e-10	10482217	10493984
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10491341	11116883	235	223	0.0503	6.5225718046653e-10	10482217	10493984	5.41526543900042e-53	11116883	11116883
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11128557	5	5	-1.1862	5.41526543900042e-53	11116883	11116883	2.05908336118142e-57	11128557	11128557
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11130871	11130871	1	0	NA	2.05908336118142e-57	11128557	11128557	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	29590790	6420	6153	0.0501	NA	NA	NA	0	29587866	29598317
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	29594434	31872587	689	656	-0.3943	0	29587866	29598317	0	31864207	31890222
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31879835	33178741	477	452	0.0547	0	31864207	31890222	9.05462566895444e-09	33170663	33178741
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33184017	33184017	1	0	NA	9.05462566895444e-09	33170663	33178741	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33193255	33198331	2	2	-0.7521	NA	NA	NA	1.43626254756066e-07	33198331	33201796
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33201796	36820402	263	247	0.0227	1.43626254756066e-07	33198331	33201796	5.67288156461214e-06	36818882	36827131
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	36827131	36858944	3	3	-0.5499	5.67288156461214e-06	36818882	36827131	3.39463734819352e-08	36856906	36874609
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	36874609	46363167	3009	2879	0.0548	3.39463734819352e-08	36856906	36874609	2.62394120565656e-126	46359770	46366909
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46364873	46653225	145	139	0.4008	2.62394120565656e-126	46359770	46366909	9.15994952531791e-94	46645477	46659252
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46654733	51096793	1952	1861	0.0712	9.1599495253179e-94	46645477	46659252	8.83358804002951e-28	51092605	51100974
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	51098092	51141498	22	21	0.5239	8.83358804002951e-28	51092605	51100974	3.96801483305994e-33	51137071	51142499
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	51142499	98316278	15161	14555	0.0555	3.96801483305994e-33	51137071	51142499	9.9888161535378e-17	98314473	98316278
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	98318378	98320165	3	3	-0.6701	9.9888161535378e-17	98314473	98316278	1.63487427392003e-155	98320165	98320165
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	98327582	121916736	9031	8641	0.0825	1.63487427392003e-155	98320165	98320165	0	121912507	121921332
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	121918030	123333979	586	557	0.5307	0	121912507	121921332	0	123325460	123337871
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	123335831	130943064	2510	2375	0.1335	0	123325460	123337871	6.42251400124398e-37	130943064	130943064
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.8117	6.42251400124398e-37	130943064	130943064	4.29235051201874e-29	130946248	130946248
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	522	0.1916	4.29235051201874e-29	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	34566316	6008	5760	0.0333	NA	NA	NA	3.78804058705487e-15	34553849	34576891
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	34568451	34606866	21	21	0.3521	3.78804058705487e-15	34553849	34576891	6.50146144813844e-14	34590688	34613316
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	34608376	100690991	21051	20166	0.0492	6.50146144813844e-14	34590688	34613316	5.3054997972171e-36	100690991	100690991
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	1.5973	5.3054997972171e-36	100690991	100690991	3.80852892906554e-33	100693892	100693892
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	113373747	4318	4133	0.0401	3.80852892906554e-33	100693892	100693892	2.22953916911178e-147	113366788	113495704
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113474906	114123340	244	228	-0.2788	2.22953916911178e-147	113366788	113495704	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	56	-0.7646	NA	NA	NA	7.23801543619399e-215	19492531	19494416
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	34674458	5690	5460	-0.0186	7.23801543619399e-215	19492531	19494416	8.50567760148872e-16	34674458	34674458
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	-0.8687	8.50567760148872e-16	34674458	34674458	9.11903828910392e-16	34683810	34683810
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	65221481	10195	9724	-0.0292	9.11903828910392e-16	34683810	34683810	7.73698876695785e-54	65215522	65235058
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	65222870	65572983	89	84	0.2606	7.73698876695785e-54	65215522	65235058	6.62841572019458e-45	65556577	65605534
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	65577598	105597555	15605	14912	-0.0212	6.62841572019458e-45	65556577	65605534	2.89296765893025e-202	105597555	105597555
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	11	-1.66	2.89296765893025e-202	105597555	105597555	2.1358060826533e-119	105632168	105632168
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	106358491	231	217	-0.072	2.1358060826533e-119	105632168	105632168	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.0232	NA	NA	NA	3.43080976075248e-19	18452491	18452491
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	19806497	98	94	0.9298	3.43080976075248e-19	18452491	18452491	2.71523886645351e-17	19465359	19839695
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19819961	20088256	53	52	0.591	2.71523886645351e-17	19465359	19839695	1.05939607637561e-112	20065525	20308014
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	87401449	26225	25073	0.0348	1.05939607637561e-112	20065525	20308014	1.76130537604048e-12	87396328	87401449
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	87403637	87409513	3	3	-0.6878	1.76130537604048e-12	87396328	87401449	1.54454998197625e-10	87409513	87412138
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	87412138	98232932	4024	3867	0.033	1.54454998197625e-10	87409513	87412138	1.79001468735987e-22	98232932	98232932
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98239454	3	3	1.071	1.79001468735987e-22	98232932	98232932	1.60291886212755e-24	98239454	98239454
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	99632987	637	604	0.0115	1.60291886212755e-24	98239454	98239454	1.67230614388766e-43	99632987	99632987
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.7314	1.67230614388766e-43	99632987	99632987	3.60144905261783e-33	99635701	99635701
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	260	0.0326	3.60144905261783e-33	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	2046835	803	764	-0.1857	NA	NA	NA	5.42610130918983e-11	2036990	2048299
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2048299	2076337	19	19	0.1784	5.42610130918983e-11	2036990	2048299	8.58398650206487e-63	2074203	2078640
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2076810	14956177	4647	4434	-0.3548	8.58398650206487e-63	2074203	2078640	6.98958511415133e-56	14666341	14958374
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14956252	15037844	15	15	-0.6405	6.98958511415133e-56	14666341	14958374	1.50396457687523e-06	15029941	15051621
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15039224	18516136	768	739	-0.3534	1.50396457687523e-06	15029941	15051621	0	18072714	18539669
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	18539669	20403990	650	621	0.3758	0	18072714	18539669	1.16430885493186e-06	20396651	20433094
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	20405572	20436991	6	6	0.8268	1.16430885493186e-06	20396651	20433094	1.389236139323e-06	20428322	20440778
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	20438853	24624577	1438	1373	0.3785	1.389236139323e-06	20428322	20440778	0	24606208	24637352
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	24629092	28512937	1269	1212	0.056	0	24606208	24637352	7.37892578644275e-12	28511295	28512937
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	28523145	28529948	4	4	0.7296	7.37892578644275e-12	28511295	28512937	2.66045648132025e-10	28529948	28536745
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	28536745	32379126	954	912	0.1117	2.66045648132025e-10	28529948	28536745	1.82827967734409e-24	31843922	32518665
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33559207	45	44	0.422	1.82827967734409e-24	31843922	32518665	4.73356800174612e-47	33533440	33647856
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33647856	34995910	193	189	-0.0603	4.73356800174612e-47	33533440	33647856	7.54824174873156e-104	34976429	45070502
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	35003634	54366535	2891	2760	-0.3767	7.54824174873156e-104	34976429	45070502	5.71892259005897e-14	54366535	54366535
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54368717	54368717	1	0	NA	5.71892259005897e-14	54366535	54366535	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54376805	54379839	3	3	-1.2838	NA	NA	NA	5.45092651237841e-08	54379839	54379839
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	54408446	6	6	0.1175	5.45092651237841e-08	54379839	54379839	7.62169585773814e-07	54399890	54428808
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54410800	54410800	1	0	NA	7.62169585773814e-07	54399890	54428808	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54424734	55441361	392	367	-0.3543	NA	NA	NA	1.23953129782884e-07	55432067	55448680
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	55442100	55474002	36	36	-0.1458	1.23953129782884e-07	55432067	55448680	2.39339103372234e-32	55460671	55493882
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	55475005	68534408	4145	3977	-0.3464	2.39339103372234e-32	55460671	55493882	2.98334673721858e-31	68530970	68649801
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68606309	68753209	23	23	-0.66	2.98334673721858e-31	68530970	68649801	6.37964718486499e-16	68745887	68844016
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	69398720	254	241	-0.2683	6.37964718486499e-16	68745887	68844016	5.39452032765741e-40	69385317	69409493
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	69401319	69758635	162	155	1e-04	5.39452032765741e-40	69385317	69409493	1.04914151141996e-130	69753919	69763173
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	69761372	75093957	1798	1711	-0.3705	1.04914151141996e-130	69753919	69763173	1.0472961936376e-11	75092501	75093957
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-1.157	1.0472961936376e-11	75092501	75093957	1.01286168272766e-10	75100865	75100865
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	578	-0.4016	1.01286168272766e-10	75100865	75100865	1.34197948471634e-18	76923844	76925748
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76942679	9	9	0.173	1.34197948471634e-18	76923844	76925748	1.03230299980362e-98	76938723	76948299
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76944661	88690571	4512	4284	-0.3209	1.03230299980362e-98	76938723	76948299	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	399	-0.2903	NA	NA	NA	3.57682484620908e-10	1028979	1028979
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	0.7203	3.57682484620908e-10	1028979	1028979	5.82545990394511e-10	1030766	1030766
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	1898326	429	417	-0.2554	5.82545990394511e-10	1030766	1030766	3.33284197825908e-07	1893749	1906352
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1899328	1899328	1	0	NA	3.33284197825908e-07	1893749	1906352	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1899977	1910544	11	11	0.1101	NA	NA	NA	1.29367851848846e-09	1906319	1913393
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1911059	6297323	1810	1728	-0.3181	1.29367851848846e-09	1906319	1913393	2.67711750821071e-05	6270340	6302032
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	6298859	6325711	12	12	-0.0456	2.67711750821071e-05	6270340	6302032	2.48396399899244e-05	6319456	6351883
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	6329594	8691344	1090	1031	-0.3003	2.48396399899244e-05	6319456	6351883	0.000236380061841565	8688521	8691344
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	8693548	8694678	2	2	0.3471	0.000236380061841565	8688521	8691344	5.14905053622845e-31	8694678	8696357
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	8696357	19438939	3847	3680	-0.3577	5.14905053622845e-31	8694678	8696357	2.84291414590059e-66	19438939	19446176
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	19442291	19478144	11	11	-1.4147	2.84291414590059e-66	19438939	19446176	3.56421187590193e-74	19473422	19478144
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	19486276	26517169	2313	2193	-0.3412	3.56421187590193e-74	19473422	19478144	4.34394077638443e-70	26515853	26546197
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	26518665	26652668	65	58	-0.8179	4.34394077638443e-70	26515853	26546197	2.24419531326133e-71	26635923	26654893
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	26654893	40869151	5673	5416	-0.3303	2.24419531326133e-71	26635923	26654893	3.85765211110886e-35	40866844	40874079
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	40874079	41011530	3	3	-0.9447	3.85765211110886e-35	40866844	40874079	2.33826188713413e-06	41007660	41015177
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41015177	41519702	202	190	-0.3209	2.33826188713413e-06	41007660	41015177	4.62132955394903e-54	41518222	41521544
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41566540	21	20	-1.042	4.62132955394903e-54	41518222	41521544	3.86767212705345e-15	41561017	41570512
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41644148	35	33	-0.5955	3.86767212705345e-15	41561017	41570512	0.0181132241316597	41624013	41644148
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41644979	41647135	2	2	-1.0184	0.0181132241316597	41624013	41644148	2.60575345245487e-05	41647135	41648545
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41648545	45430889	1492	1418	-0.3212	2.60575345245487e-05	41647135	41648545	0	45417120	45437004
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	45436512	52438207	1996	1920	0.012	0	45417120	45437004	7.74705399274461e-60	52438207	52440878
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52440878	52447064	4	4	-0.8443	7.74705399274461e-60	52438207	52440878	3.24294145413532e-25	52447064	52447064
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52454171	72398013	7679	7350	0.1322	3.24294145413532e-25	52447064	52447064	1.42054991681394e-14	72396137	72398013
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	72399562	72401138	2	2	-0.5937	1.42054991681394e-14	72396137	72398013	2.89458209385882e-06	72401138	72402560
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	72402560	78617761	2504	2395	0.1646	2.89458209385882e-06	72401138	72402560	1.04454211246531e-05	78591544	78635423
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	78618887	78653545	11	11	0.4329	1.04454211246531e-05	78591544	78635423	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	1351660	471	449	-0.28	NA	NA	NA	2.34821921626678e-255	1341924	1361150
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	1353260	13705800	4332	4136	0.0127	2.34821921626678e-255	1341924	1361150	4.67988678812447e-20	13701684	13707780
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	13707780	13766264	24	23	-0.3376	4.67988678812447e-20	13701684	13707780	2.59880184954285e-11	13755012	13783873
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	13767842	15069276	165	156	-0.0239	2.59880184954285e-11	13755012	13783873	4.64337829323622e-85	14960896	16787891
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	16780963	18281950	603	585	-0.3634	4.64337829323622e-85	14960896	16787891	0	18281950	18281950
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	18291426	19159968	239	231	0.3898	0	18281950	18281950	0	19157520	19159968
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	19164200	76116026	17130	16443	-0.3654	0	19157520	19159968	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	210395	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	216768	333922	47	46	-0.3064	NA	NA	NA	1.3511186156438e-05	292072	410015
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	333950	1398325	444	426	-0.1398	1.3511186156438e-05	292072	410015	3.24695702061205e-09	1395246	1398325
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	0.8715	3.24695702061205e-09	1395246	1398325	2.43862326053657e-10	1400840	1400840
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	3591120	1042	1011	-0.213	2.43862326053657e-10	1400840	1400840	4.07148911367226e-06	3588389	3591120
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3592564	3593646	2	2	-1.0573	4.07148911367226e-06	3588389	3591120	5.67503113379279e-14	3593646	3599322
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3596968	3596968	1	0	NA	5.67503113379279e-14	3593646	3599322	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3599322	7799344	1953	1859	-0.2581	NA	NA	NA	1.03699677329924e-11	7749380	7807366
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	7800846	7863531	32	28	-0.0445	1.03699677329924e-11	7749380	7807366	8.94429219012799e-20	7859722	7882356
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	7864932	12529373	2075	1989	-0.2883	8.94429219012799e-20	7859722	7882356	0	12521681	12539025
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	12534733	40543992	7095	6808	0.0672	0	12521681	12539025	2.80709696656163e-95	40543992	40543992
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40548081	40553315	2	2	-2.7287	2.80709696656163e-95	40543992	40543992	5.12131615355082e-101	40553315	40553315
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40556205	52150371	4971	4748	0.0804	5.12131615355082e-101	40553315	40553315	2.81809297678715e-21	52150371	52150371
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	52151943	52155364	4	4	-0.8431	2.81809297678715e-21	52150371	52150371	2.91432415189902e-20	52155364	52155364
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	52158334	58208527	2796	2683	0.0781	2.91432415189902e-20	52155364	52155364	6.12673104968734e-22	58201323	58213220
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58212113	58241773	14	13	-0.2736	6.12673104968734e-22	58201323	58213220	1.87265705939567e-08	58232649	58252109
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58244012	61437534	1454	1384	0.0759	1.87265705939567e-08	58232649	58252109	8.57842643821158e-163	61426952	61450661
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	61442378	62599701	542	521	0.3473	8.57842643821158e-163	61426952	61450661	3.37283793305299e-74	62591639	62607472
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	62601750	62865673	143	132	0.0181	3.37283793305299e-74	62591639	62607472	1.90079600223701e-70	62863112	62871385
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	62868337	63788698	439	417	-0.3166	1.90079600223701e-70	62863112	62871385	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1516966	589	555	0.063	NA	NA	NA	2.02318621597404e-96	1516966	1518825
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1518825	1531162	6	6	-1.7074	2.02318621597404e-96	1516966	1518825	4.88075733104942e-120	1528899	1531162
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	30149109	8821	8449	0.0095	4.88075733104942e-120	1528899	1531162	1.20540756500846e-24	30143885	30152320
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	30152320	30159580	4	3	-0.5363	1.20540756500846e-24	30143885	30152320	1.51844333545375e-20	30159580	30162278
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	30160985	45782758	6188	5934	0.0503	1.51844333545375e-20	30159580	30162278	7.47499011932425e-165	45774222	45790032
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	45784308	46892124	287	274	0.3559	7.47499011932425e-165	45774222	45790032	2.04645424168366e-140	46882338	46905098
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	46894988	46894988	1	0	NA	2.04645424168366e-140	46882338	46905098	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	46897499	51608352	1810	1732	0.0654	NA	NA	NA	5.21233261921114e-179	51598659	51617432
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	51611473	52390406	240	230	0.4204	5.21233261921114e-179	51598659	51617432	2.47055796567832e-188	52382226	52401430
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52397083	56432617	1140	1092	0.05	2.47055796567832e-188	52382226	52401430	5.5228406133129e-09	56429111	56432617
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	56435112	56438162	3	3	-0.6125	5.5228406133129e-09	56429111	56432617	1.29428809210268e-31	56438162	56440931
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	56440931	61567835	2108	1991	0.0603	1.29428809210268e-31	56438162	56440931	4.45150632606376e-55	61562911	61583049
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	61569427	61783925	87	82	0.4067	4.45150632606376e-55	61562911	61583049	1.4365410510642e-24	61765801	61799614
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	61785766	62419534	295	279	0.127	1.4365410510642e-24	61765801	61799614	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12857	-0.0398	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	20609709	2053	1972	-0.3003	NA	NA	NA	3.7297005432323e-14	20602819	20610922
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	20610922	20643128	16	15	0.1449	3.7297005432323e-14	20602819	20610922	5.9971876280031e-24	20643128	20645755
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	20645755	21571489	452	435	-0.3678	5.9971876280031e-24	20643128	20645755	9.93004521954487e-16	21571489	21571489
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21574577	21576859	3	3	0.5578	9.93004521954487e-16	21571489	21571489	2.10526130827093e-10	21576859	21579649
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21579649	22667608	459	441	-0.2886	2.10526130827093e-10	21576859	21579649	8.80113200115949e-57	22667608	22677959
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	22	0.4496	8.80113200115949e-57	22667608	22677959	1.79710097140168e-67	22721042	22725305
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	24080015	632	607	-0.3349	1.79710097140168e-67	22721042	22725305	5.6830776450383e-05	24027002	24090622
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	24082742	24136917	23	22	-0.1171	5.6830776450383e-05	24027002	24090622	4.04561925431071e-07	24129729	24172450
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	24146258	28599591	2559	2440	-0.3526	4.04561925431071e-07	24129729	24172450	4.5397094542902e-12	28596616	28611261
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	28604329	28624893	10	10	0.1154	4.5397094542902e-12	28596616	28611261	1.27241105131974e-24	28613000	28630731
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	28627112	28627112	1	0	NA	1.27241105131974e-24	28613000	28630731	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	28628752	39303406	5368	5122	-0.3231	NA	NA	NA	5.47359818573249e-33	39282698	39308468
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	39304360	39495860	88	81	-0.0872	5.47359818573249e-33	39282698	39308468	8.75594906186478e-20	39485709	39513588
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	39499660	49020056	4640	4436	-0.3092	8.75594906186478e-20	39485709	39513588	1.90583646580907e-15	49005116	49034336
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	49021121	49133784	45	44	-0.0416	1.90583646580907e-15	49005116	49034336	0.000111887411346106	49079146	49149534
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	49133893	49217323	38	37	-0.2763	0.000111887411346106	49079146	49149534	3.13521963326480e-05	49190311	49239445
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	49229574	49294074	32	30	-0.0512	3.1352196332648e-05	49190311	49239445	0.000254866198176794	49281181	49341944
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	49295088	49571068	116	113	-0.246	0.000254866198176794	49281181	49341944	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	2708291	1793	1721	0.0143	NA	NA	NA	0	2708113	2711273
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	8440931	1784	1701	0.7704	0	2708113	2711273	3.18784098339749e-10	8420787	8450789
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8442417	8473482	15	14	0.363	3.18784098339749e-10	8420787	8450789	4.87348365023341e-21	8459880	8481280
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8475091	56824123	17201	16486	0.8142	4.87348365023341e-21	8459880	8481280	1.47205695476922e-23	56806966	56833867
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	56826937	56848661	13	13	0.3416	1.47205695476922e-23	56806966	56833867	6.92215993377739e-09	56840603	56859422
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	56855445	83435959	5064	4843	0.7908	6.92215993377739e-09	56840603	56859422	5.57620491553791e-11	83385860	83450799
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	83448866	83531876	36	34	0.4839	5.57620491553791e-11	83385860	83450799	2.44873830676395e-12	83524692	83559662
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	83532150	110641084	7212	6898	0.7904	2.44873830676395e-12	83524692	83559662	8.29466599670207e-14	110629617	110641084
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	110646582	110646582	1	0	NA	8.29466599670207e-14	110629617	110641084	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	110651151	110718377	10	10	1.3856	NA	NA	NA	7.11178284604186e-15	110718377	110726401
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	110726401	146086841	10757	10308	0.7837	7.11178284604186e-15	110718377	110726401	4.88856305722977e-09	146085066	146086841
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	146087729	146087729	1	0	NA	4.88856305722977e-09	146085066	146086841	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	146095685	146095707	2	2	-0.2813	NA	NA	NA	2.02905016637157e-06	146095707	146098710
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	146098710	154038318	2905	2784	0.7323	2.02905016637157e-06	146095707	146098710	1.24755045789923e-29	154038318	154038318
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154078819	11	9	1.7473	1.24755045789923e-29	154038318	154038318	1.71650325181193e-24	154078819	154079002
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154442377	90	85	0.787	1.71650325181193e-24	154078819	154079002	4.57971572150772e-42	154442377	154442377
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	4	-1.1101	4.57971572150772e-42	154442377	154442377	1.04467851400232e-38	154450309	154450309
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	27	0.8159	1.04467851400232e-38	154450309	154450309	2.03981148398969e-96	154582414	154582414
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	192	-0.0372	2.03981148398969e-96	154582414	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	121	-2.1833	NA	NA	NA	8.16686904985521e-13	3034907	3772482
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-0.6584	8.16686904985521e-13	3034907	3772482	9.4299153161159e-10	5531459	6711090
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	5672441	1	0	NA	9.4299153161159e-10	5531459	6711090	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6652845	6953343	117	112	-2.1328	NA	NA	NA	1.90682624959437e-08	6926956	7005620
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6954864	7653082	216	203	-1.4929	1.90682624959437e-08	6926956	7005620	1.33183819888919e-09	7456245	7712882
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	10513747	491	471	-1.9762	1.33183819888919e-09	7456245	7712882	7.20732194012428e-09	10501368	10595079
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10515697	1	0	NA	7.20732194012428e-09	10501368	10595079	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	12502304	20	20	-0.7307	NA	NA	NA	6.31202112917042e-14	11698871	12502304
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12511461	12536761	8	8	-2.9841	6.31202112917042e-14	11698871	12502304	7.79816089776002e-10	12536761	12542979
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12537944	12715696	61	59	-1.1694	7.79816089776002e-10	12536761	12542979	2.12739005521718e-08	12696242	12730281
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12721434	12776542	10	9	-2.8768	2.12739005521718e-08	12696242	12730281	6.42366202885259e-08	12745259	12796639
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12786515	13129843	121	118	-1.2093	6.42366202885259e-08	12745259	12796639	1.21465348191038e-25	13111594	13147329
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13596448	202	198	-2.1865	1.21465348191038e-25	13111594	13147329	0.000114389782242209	13562157	13606316
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13597813	13705594	16	15	-1.2285	0.000114389782242209	13562157	13606316	0.00857368188202582	13691261	13717328
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716000	13751402	7	7	-2.0816	0.00857368188202582	13691261	13717328	0.00151246926504999	13718946	13760710
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13759681	13775083	8	7	-3.0658	0.00151246926504999	13718946	13760710	7.47166837025251e-08	13772047	13775083
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13776202	13823928	13	11	-2.0232	7.47166837025251e-08	13772047	13775083	2.43936733882252e-05	13816133	13851627
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13828384	13863616	7	7	-1.0279	2.43936733882252e-05	13816133	13851627	0.000118448095750794	13854447	13870622
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13863657	13863657	1	0	NA	0.000118448095750794	13854447	13870622	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13866668	14122129	123	117	-2.3786	NA	NA	NA	0.00103418384272420	14088529	14260254
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14335755	27	27	-1.7193	0.0010341838427242	14088529	14260254	9.04943999769917e-07	14330251	14335755
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14338189	14340202	3	3	-3.8737	9.04943999769917e-07	14330251	14335755	3.22891772762138e-06	14340202	14343139
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14342834	14434912	49	49	-1.5878	3.22891772762138e-06	14340202	14343139	6.20506843333631e-06	14425003	14434912
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14436374	14444446	6	6	-3.1922	6.20506843333631e-06	14425003	14434912	2.14854896300273e-09	14444446	14448198
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14445814	14508021	42	41	-1.6376	2.14854896300273e-09	14444446	14448198	0.00225055205663865	14489801	14546195
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14579298	26	26	-1.0653	0.00225055205663865	14489801	14546195	3.07593830648276e-05	14559651	14685149
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15313932	214	208	-1.8616	3.07593830648276e-05	14559651	14685149	0.000225671745315106	15276098	15342258
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15315201	15399621	53	51	-2.4145	0.000225671745315106	15276098	15342258	2.41797678685422e-06	15381088	15426319
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15400529	16387273	312	303	-1.7598	2.41797678685422e-06	15381088	15426319	3.78589195558980e-08	16357759	16413874
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	16492450	15	15	-3.0609	3.7858919555898e-08	16357759	16413874	0.00133214861978809	16430865	16535392
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16517319	16635994	20	20	-2.2415	0.00133214861978809	16430865	16535392	9.42747022896581e-07	16631496	16647090
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16647090	16659030	4	4	-3.6639	9.4274702289658e-07	16631496	16647090	0.00588784399100747	16656177	16680383
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16660742	22181855	911	875	-2.0023	0.00588784399100747	16656177	16680383	0.341607451803425	21787090	22209119
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22182080	22182080	1	0	NA	0.341607451803425	21787090	22209119	NA	NA	NA
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22192409	22214320	10	10	-2.5853	NA	NA	NA	0.000524477850758868	22205568	22236421
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22216169	22249988	10	10	-3.9184	0.000524477850758868	22205568	22236421	6.3755831848403e-06	22244581	22268552
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22252446	22930737	69	66	-2.3718	6.3755831848403e-06	22244581	22268552	7.44986627600634e-24	22921089	26872527
MSK_252152917545_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	84	-0.801	7.44986627600634e-24	22921089	26872527	NA	NA	NA
