Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	2160429	415	396	-0.0065	NA	NA	NA	2.53896975184153e-08	2127724	2192552
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	2162483	2265120	41	39	-0.2367	2.53896975184153e-08	2127724	2192552	7.3568458721898e-09	2240503	2298088
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	2269096	2269096	1	0	NA	7.3568458721898e-09	2240503	2298088	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	2271500	12769521	4058	3907	-0.011	NA	NA	NA	7.87035087705373e-13	12762774	12790795
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12789063	12835156	5	5	-0.7605	7.87035087705373e-13	12762774	12790795	1.82191347800791e-13	12793354	12835156
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12839991	16704522	1261	1212	-3e-04	1.82191347800791e-13	12793354	12835156	7.34835775311062e-11	16659021	16836160
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16713074	17148592	27	26	-0.3022	7.34835775311062e-11	16659021	16836160	2.50178489738535e-09	17102601	17167719
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17154037	31463370	5689	5476	-0.0171	2.50178489738535e-09	17102601	17167719	4.5291491309691e-06	31456271	31463370
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	31465080	31469268	3	3	-0.7032	4.5291491309691e-06	31456271	31463370	6.28429508405971e-08	31469268	31470379
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	31470379	34734522	1375	1328	-0.0055	6.28429508405971e-08	31469268	31470379	3.12030831354529e-09	34726946	34734522
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34739490	34758017	3	3	-0.7565	3.12030831354529e-09	34726946	34734522	2.53954588600412e-06	34758017	34768731
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34761645	34869589	16	15	-0.0701	2.53954588600412e-06	34758017	34768731	1.79973017210637e-14	34859068	34869589
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34876833	34884849	5	5	-0.847	1.79973017210637e-14	34859068	34869589	2.54878379810349e-17	34884849	34886493
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34886493	72537426	14995	14483	-0.0082	2.54878379810349e-17	34884849	34886493	6.99512381724753e-202	72537426	72539143
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72574479	13	10	1.9776	6.99512381724753e-202	72537426	72539143	4.52288311695335e-204	72571158	72574479
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72579311	72579311	1	0	NA	4.52288311695335e-204	72571158	72574479	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	150819879	17556	16887	-0.0038	NA	NA	NA	6.9595832866695e-230	150819879	150819879
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	11	2.0003	6.9595832866695e-230	150819879	150819879	1.27489081348745e-173	150851439	150851439
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	76	0.0303	1.27489081348745e-173	150851439	150851439	4.52461158964278e-16	151024118	151028700
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.8808	4.52461158964278e-16	151024118	151028700	9.46211259408027e-16	151033188	151036435
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2582	-0.019	9.46211259408027e-16	151033188	151036435	1.72666779688083e-38	157133150	157133150
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	1.9476	1.72666779688083e-38	157133150	157133150	3.88669236822562e-40	157136342	157136342
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	161099582	1622	1574	-0.0172	3.88669236822562e-40	157136342	157136342	3.14968166622672e-22	161099582	161099582
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161104752	161104791	2	2	-1.4856	3.14968166622672e-22	161099582	161099582	2.96224488174029e-24	161104791	161104791
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161108722	167479184	2482	2406	0.0044	2.96224488174029e-24	161104791	161104791	4.24139924525754e-10	167473499	167483267
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167481271	167507898	10	9	-0.4563	4.24139924525754e-10	167473499	167483267	3.34328595605062e-09	167506259	167525669
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	200594055	11345	10901	-0.004	3.34328595605062e-09	167506259	167525669	1.13487612541476e-23	200585836	200609726
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200596027	200803726	44	42	-0.3327	1.13487612541476e-23	200585836	200609726	2.96792766147428e-23	200698665	200808717
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200804838	210699009	3870	3728	7e-04	2.96792766147428e-23	200698665	200808717	2.41649674579989e-07	210695650	210700827
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	210700827	210707589	4	4	-0.6175	2.41649674579989e-07	210695650	210700827	3.89141704036213e-08	210704151	210709895
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	210709895	219251721	3019	2895	0.0016	3.89141704036213e-08	210704151	210709895	3.66530828956184e-07	219215704	219296386
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	219258381	219359007	15	15	-0.3003	3.66530828956184e-07	219215704	219296386	7.90087739150741e-06	219341590	219383812
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	219361149	219361149	1	0	NA	7.90087739150741e-06	219341590	219383812	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	219362783	247186514	10496	10097	-0.0093	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	52600588	18732	17994	-0.0046	NA	NA	NA	1.86178044756882e-161	52600588	52600588
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	1.86178044756882e-161	52600588	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	-2.7825	NA	NA	NA	9.21050526720767e-175	52635695	52635695
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	66357387	4557	4383	-0.0081	9.21050526720767e-175	52635695	52635695	3.98858177318558e-18	66357387	66357387
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	1.272	3.98858177318558e-18	66357387	66357387	1.32274070775127e-16	66360747	66360747
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	184501938	34430	33148	-0.0087	1.32274070775127e-16	66360747	66360747	3.53001137861803e-11	184499425	184501938
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	184505519	184510172	3	3	-0.8792	3.53001137861803e-11	184499425	184501938	4.60636099203501e-11	184510172	184517600
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	184517600	242689978	20098	19338	-0.0082	4.60636099203501e-11	184510172	184517600	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	194354505	63646	61296	-0.0029	NA	NA	NA	0	194354505	194354505
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194358882	1	0	NA	0	194354505	194354505	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194360242	194366950	5	5	-3.5981	NA	NA	NA	0	194366950	194366950
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196820428	995	956	-0.0239	0	194366950	194366950	1.16918216172413e-17	196809098	196911010
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196822133	196822133	1	0	NA	1.16918216172413e-17	196809098	196911010	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196929826	21	19	0.4051	NA	NA	NA	9.11169468884946e-14	196925203	196945209
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196940125	199329592	963	915	-0.0174	9.11169468884946e-14	196925203	196945209	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3262	0.0156	NA	NA	NA	0	9815760	9815760
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.6704	0	9815760	9815760	0	9842644	9842644
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	34445002	6167	5967	0.0011	0	9842644	9842644	4.40056008684446e-15	34439897	34445002
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	-0.6709	4.40056008684446e-15	34439897	34445002	1.36714123006155e-13	34491115	34506297
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	94068864	17323	16716	-0.0092	1.36714123006155e-13	34491115	34506297	0	94068864	94068864
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94070673	94073863	2	0	NA	0	94068864	94068864	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94076749	94078581	2	2	-5.6103	NA	NA	NA	0	94078581	94078581
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94084961	173224400	22743	21895	-0.0173	0	94078581	94078581	2.36507433740035e-08	173223225	173224400
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	0.8964	2.36507433740035e-08	173223225	173224400	1.38189688573192e-08	173228860	173228860
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173660684	193	184	-0.0228	1.38189688573192e-08	173228860	173228860	3.85302302977874e-72	173660684	173660684
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	2.6327	3.85302302977874e-72	173660684	173660684	5.92294300315289e-73	173666072	173666072
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	175860235	743	717	-0.0087	5.92294300315289e-73	173666072	173666072	4.72610046371348e-07	175857109	175860235
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175862084	175863396	2	2	0.8328	4.72610046371348e-07	175857109	175860235	1.30034332217856e-07	175863396	175866055
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175866055	187330240	3336	3214	-0.0174	1.30034332217856e-07	175863396	175866055	4.7809905226536e-09	187329037	187330240
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187338465	4	4	0.6348	4.7809905226536e-09	187329037	187330240	1.53143404718123e-09	187338465	187346058
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187346058	191153613	1239	1191	-0.0016	1.53143404718123e-09	187338465	187346058	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	12857302	3975	3837	0.0136	NA	NA	NA	0	12857302	12857302
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	-5.5211	0	12857302	12857302	0	12873052	12873052
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	36217605	6205	5965	0.0162	0	12873052	12873052	2.18951730929877e-12	36217605	36217605
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	36220056	36226270	2	2	1.0982	2.18951730929877e-12	36217605	36217605	1.91145357733542e-12	36226270	36226270
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	36227691	68864742	8865	8579	-0.0043	1.91145357733542e-12	36226270	36226270	1.77771050036519e-26	68864742	68864742
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	68885350	70693444	5	5	-1.0073	1.77771050036519e-26	68864742	68864742	1.35918466631383e-26	70693444	70693444
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	70752359	112546984	12274	11800	-0.0065	1.35918466631383e-26	70693444	70693444	9.20537653842264e-25	112546984	112546984
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	112548319	112556405	6	5	-0.973	9.20537653842264e-25	112546984	112546984	2.10338724071722e-27	112556405	112556405
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	112558360	130579586	4840	4655	-0.0032	2.10338724071722e-27	112556405	112556405	1.44325616013884e-23	130563251	130590484
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	130583605	130695464	49	48	-0.2954	1.44325616013884e-23	130563251	130590484	1.52907883465166e-22	130689450	130713947
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	130701727	171178433	14280	13791	0.0045	1.52907883465166e-22	130689450	130713947	8.35906195745432e-08	171152947	171206554
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	171182122	171245246	25	25	-0.2477	8.35906195745432e-08	171152947	171206554	7.95873473154777e-07	171225192	171264529
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	171246244	180342860	3118	3003	-0.0043	7.95873473154777e-07	171225192	171264529	4.56659686273216e-14	180194323	180342860
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180362342	9	8	-0.6089	4.56659686273216e-14	180194323	180342860	4.18908309509199e-20	180362342	180364670
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180364670	180417929	20	20	0.0851	4.18908309509199e-20	180362342	180364670	0.000875784144255866	180406030	180458805
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180420190	180528707	39	36	-0.1417	0.000875784144255866	180406030	180458805	1.03327068802614e-05	180508005	180550683
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180532685	180644810	52	48	0.0933	1.03327068802614e-05	180508005	180550683	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	39	0.055	NA	NA	NA	1.58290839797136e-12	191387	204881
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	240119	16	14	-0.4136	1.58290839797136e-12	191387	204881	9.88768381405977e-47	237952	241674
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	241674	329100	47	47	0.4871	9.88768381405977e-47	237952	241674	6.88090716289921e-63	326323	332608
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	331014	29980445	10489	10120	-0.0108	6.88090716289921e-63	326323	332608	4.78082409638378e-18	29973024	29985620
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29981912	30005338	9	9	-0.6285	4.78082409638378e-18	29973024	29985620	8.67128340607468e-15	29998009	30010234
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30010234	31385778	581	561	-0.0216	8.67128340607468e-15	29998009	30010234	1.86292078478663e-12	31383925	31385778
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31393624	4	4	-0.8454	1.86292078478663e-12	31383925	31385778	8.5237184247826e-09	31393624	31393624
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31395330	31457884	14	14	-0.0648	8.5237184247826e-09	31393624	31393624	1.8467618883423e-18	31457884	31467551
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31467551	31558079	28	27	-0.9674	1.8467618883423e-18	31457884	31467551	9.08210151281874e-110	31555715	31558079
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31559059	32590568	454	434	-0.0126	9.08210151281874e-110	31555715	31558079	8.30879955498724e-35	32564884	32653710
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32593151	32762061	61	58	-0.5165	8.30879955498724e-35	32564884	32653710	1.58968708412708e-28	32720656	32766023
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32766023	33687559	406	391	-0.0459	1.58968708412708e-28	32720656	32766023	0.00657715330975566	33656700	33687559
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	33690281	33696513	4	4	-0.4385	0.00657715330975566	33656700	33687559	6.78343700256154e-05	33696513	33706463
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	33699370	36515424	1221	1173	-0.0253	6.78343700256154e-05	33696513	33706463	2.64143705005777e-07	36514036	36515424
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	36518498	36520159	2	2	0.8487	2.64143705005777e-07	36514036	36515424	2.72098224474994e-07	36520159	36521308
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	36521308	54035000	6613	6386	-7e-04	2.72098224474994e-07	36520159	36521308	7.8792028266545e-40	54035000	54035000
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	1.5651	7.8792028266545e-40	54035000	54035000	4.68038855234989e-41	54042734	54042734
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	65767409	2398	2320	0.0097	4.68038855234989e-41	54042734	54042734	5.05510948261433e-09	65767409	65767409
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65769146	65771532	2	2	-0.9034	5.05510948261433e-09	65767409	65767409	1.36208075358652e-08	65771532	65771532
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65778663	74647491	2888	2787	0.0174	1.36208075358652e-08	65771532	65771532	2.61816826897598e-96	74647491	74647491
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74650995	74653360	2	2	-3.063	2.61816826897598e-96	74647491	74647491	3.79482957854365e-98	74653360	74653360
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74655219	103841482	7917	7621	0.0055	3.79482957854365e-98	74653360	74653360	0	103841482	103841482
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-4.3939	0	103841482	103841482	0	103868154	103868154
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	165643653	21106	20317	-0.0156	0	103868154	103868154	8.5989920235197e-132	165643653	165643653
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	2.4685	8.5989920235197e-132	165643653	165643653	7.02802104046348e-114	165650610	165650610
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	166610861	375	362	0.0046	7.02802104046348e-114	165650610	165650610	4.94605174785254e-11	166601648	166612100
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	166612100	166630700	12	12	-0.4428	4.94605174785254e-11	166601648	166612100	2.34997170701981e-10	166627630	166638824
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	166632407	170753106	1417	1355	-0.0148	2.34997170701981e-10	166627630	166638824	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	3566196	1250	1203	0.0346	NA	NA	NA	4.13755092479246e-09	3559041	3573608
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	3568133	3568133	1	0	NA	4.13755092479246e-09	3559041	3573608	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	3571461	3582201	6	6	-0.5245	NA	NA	NA	6.23117613240635e-08	3578428	3588903
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	3583854	64523575	18305	17639	-0.0014	6.23117613240635e-08	3578428	3588903	3.84235031738574e-12	64523575	64523575
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64532019	64532949	2	2	-1.1023	3.84235031738574e-12	64523575	64523575	3.05786097784697e-12	64532949	64532949
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64534167	109967918	15703	15153	0.0066	3.05786097784697e-12	64532949	64532949	2.00171789346547e-09	109967918	109967918
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109970524	109974402	2	2	-0.9757	2.00171789346547e-09	109967918	109967918	1.14420541978907e-09	109974402	109974402
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109976628	118611324	3996	3851	-0.0067	1.14420541978907e-09	109974402	109974402	3.11843446100263e-304	118611324	118611324
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	-4.3366	3.11843446100263e-304	118611324	118611324	1.19377023054072e-290	118620875	118620875
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	141690753	10665	10233	0.0018	1.19377023054072e-290	118620875	118620875	1.43336603826882e-48	141690753	141698634
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	9	1.0317	1.43336603826882e-48	141690753	141698634	2.78021981790084e-31	141712786	141714168
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	141890215	69	67	0.061	2.78021981790084e-31	141712786	141714168	8.74806564004351e-14	141882706	141892876
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141892876	141904745	4	4	-0.8668	8.74806564004351e-14	141882706	141892876	4.61789719095942e-13	141902417	141908206
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141908206	142526341	250	240	0.041	4.61789719095942e-13	141902417	141908206	2.27586749361407e-119	142526341	142535936
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142535936	142602080	33	32	-0.9546	2.27586749361407e-119	142526341	142535936	4.82518372011244e-144	142600731	142602080
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142605735	158821263	6396	6135	0.0027	4.82518372011244e-144	142600731	142602080	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	5574577	2010	1940	0.0183	NA	NA	NA	2.71413389703797e-07	5568458	5574577
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	5585615	5591702	2	2	-0.8558	2.71413389703797e-07	5568458	5574577	1.14867411484994e-07	5591702	5596343
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	5596343	9533226	872	842	-0.0233	1.14867411484994e-07	5591702	5596343	9.73680151523654e-10	9531510	9533226
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	9535456	9538031	3	3	-0.7894	9.73680151523654e-10	9531510	9533226	3.12486572385310e-09	9538031	9539424
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	9539424	103038148	28206	27155	0.0026	3.1248657238531e-09	9538031	9539424	1.17177630854959e-12	103038148	103038148
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	103039630	103041843	2	2	-1.1177	1.17177630854959e-12	103038148	103038148	1.13913423007736e-12	103041843	103041843
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	103043502	131916458	8931	8586	-7e-04	1.13913423007736e-12	103041843	103041843	3.48057029439183e-10	131916458	131916458
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	131919337	131919337	1	0	NA	3.48057029439183e-10	131916458	131916458	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	131921399	131923149	2	2	1.0073	NA	NA	NA	3.28817029567778e-09	131923149	131923149
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	131926292	145330767	4236	4078	0.0031	3.28817029567778e-09	131923149	131923149	2.35470216753428e-10	145330767	145330767
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	145333207	145334573	2	2	-1.0579	2.35470216753428e-10	145330767	145330767	6.50856975114741e-10	145334573	145334573
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	145336073	146264846	299	288	0.0358	6.50856975114741e-10	145334573	145334573	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	23338535	7999	7704	0.0091	NA	NA	NA	4.68875485837788e-09	23331804	23338535
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23343915	23365926	4	4	0.6767	4.68875485837788e-09	23331804	23338535	1.66255475864995e-10	23365926	23377660
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	27140808	789	760	0.0016	1.66255475864995e-10	23365926	23377660	3.4163140039872e-09	27139501	27142473
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	27142473	27145309	3	3	0.737	3.4163140039872e-09	27139501	27142473	7.31571208730337e-08	27143670	27146885
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	27146885	70926188	4277	4096	0.0034	7.31571208730337e-08	27143670	27146885	9.9959071479221e-11	70926188	70926188
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.042	9.9959071479221e-11	70926188	70926188	2.64902251748979e-11	70930528	70930528
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	78310181	2727	2637	0.0038	2.64902251748979e-11	70930528	70930528	1.74975052253073e-13	78310181	78310181
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	78312326	78313694	2	2	-1.1269	1.74975052253073e-13	78310181	78310181	1.7646389600902e-13	78313694	78313694
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	78316035	78959163	276	269	0.028	1.7646389600902e-13	78313694	78313694	8.34393854522988e-08	78955488	78959163
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	78961754	78966636	3	3	0.7481	8.34393854522988e-08	78955488	78959163	7.93540906145511e-09	78966636	78970032
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	78970032	137352394	20757	19977	-0.0071	7.9354090614551e-09	78966636	78970032	4.93611287306045e-17	137352394	137352394
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.2997	4.93611287306045e-17	137352394	137352394	3.18688661022445e-14	137356880	137356880
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1069	-0.002	3.18688661022445e-14	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9400	0.0062	NA	NA	NA	2.50224647004295e-50	27038538	27038538
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-2.1824	2.50224647004295e-50	27038538	27038538	2.06395129771339e-49	27041812	27041812
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	67970293	10616	10244	3e-04	2.06395129771339e-49	27041812	27041812	5.44635865406479e-184	67970293	67974175
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	67972803	68087163	48	48	-0.8546	5.44635865406479e-184	67970293	67974175	1.70862624611069e-181	68085596	68087163
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	68091316	95908082	9950	9570	-6e-04	1.70862624611069e-181	68085596	68087163	7.95488344988287e-07	95905781	95908082
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	95909257	95909288	2	2	0.8473	7.95488344988287e-07	95905781	95908082	1.89742728481085e-06	95909288	95915326
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	95915326	135285645	14461	13957	0.0069	1.89742728481085e-06	95909288	95915326	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	7762277	3016	2899	0.0025	NA	NA	NA	9.42375435185823e-41	7762277	7762277
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7771593	7783492	8	8	-1.0295	9.42375435185823e-41	7762277	7762277	2.338104280958e-46	7783492	7783492
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7797993	55118214	13881	13332	0.0163	2.338104280958e-46	7783492	7783492	2.76891169097208e-108	55114405	55127355
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	39	-0.7062	2.76891169097208e-108	55114405	55127355	3.18248489646053e-100	55205278	55219985
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	55217189	1	0	NA	3.18248489646053e-100	55205278	55219985	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	66463477	4637	4476	0.01	NA	NA	NA	4.76318772565985e-11	66463477	66463477
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	1.076	4.76318772565985e-11	66463477	66463477	1.72038756635469e-11	66469412	66469412
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	107026190	13532	13003	0.0074	1.72038756635469e-11	66469412	66469412	1.05207221088998e-10	106996136	107040352
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107028237	107028237	1	0	NA	1.05207221088998e-10	106996136	107040352	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107029717	107053494	14	13	-0.2199	NA	NA	NA	5.65125881777387e-09	107045982	107087423
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107055246	134450318	10173	9795	0.0091	5.65125881777387e-09	107045982	107087423	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	1354018	570	551	0.0013	NA	NA	NA	5.54773908873279e-15	1311017	1371823
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	1356599	1406771	27	26	-0.234	5.54773908873279e-15	1311017	1371823	4.75670310270134e-07	1389934	1425834
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	1408434	11116883	3732	3599	0.0021	4.75670310270134e-07	1389934	1425834	1.66144632960218e-100	11116883	11121204
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11130871	6	6	-1.7919	1.66144632960218e-100	11116883	11121204	3.13667605285004e-104	11128557	11130871
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	11140421	1	0	NA	3.13667605285004e-104	11128557	11130871	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	99460566	28645	27579	0.0096	NA	NA	NA	5.31203465547061e-14	99460566	99460566
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	99462740	99468590	3	3	-0.9503	5.31203465547061e-14	99460566	99460566	1.46285112182578e-13	99468590	99468590
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	99470406	130694393	11531	11129	0.0056	1.46285112182578e-13	99468590	99468590	5.28407494696147e-09	130694393	130694393
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	0.972	5.28407494696147e-09	130694393	130694393	1.44621485079784e-08	130701040	130701040
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	621	0.0198	1.44621485079784e-08	130701040	130701040	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	56650373	14025	13498	-0.0091	NA	NA	NA	1.46303845584402e-54	56646284	56657371
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56681665	14	13	0.8865	1.46303845584402e-54	56646284	56657371	1.21712410415504e-55	56680346	56681665
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56685341	61816597	1261	1212	-0.0023	1.21712410415504e-55	56680346	56681665	2.28835582503650e-17	61816597	61816597
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	61819506	61827792	3	3	-1.0403	2.2883558250365e-17	61816597	61816597	8.2382812496456e-18	61827792	61827792
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	61833849	100690991	11777	11351	0.0068	8.2382812496456e-18	61827792	61827792	6.61580838375715e-274	100690991	100690991
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-4.9225	6.61580838375715e-274	100690991	100690991	8.21992317420824e-264	100693892	100693892
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4403	-0.0064	8.21992317420824e-264	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18864561	8	7	-0.0215	NA	NA	NA	1.32809573247546e-11	18544772	19273289
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19271102	19494416	52	49	-0.7451	1.32809573247546e-11	18544772	19273289	5.53917389208634e-149	19492531	19494416
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	21628776	1036	1002	0.0139	5.53917389208634e-149	19492531	19494416	3.19699544419417e-60	21608294	21639280
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21631597	22051630	217	212	0.2605	3.19699544419417e-60	21608294	21639280	2.04497561806009e-70	22041571	22064175
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22052799	34674458	4437	4279	0.0105	2.04497561806009e-70	22041571	22064175	1.52645683023709e-14	34674458	34674458
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	-0.9389	1.52645683023709e-14	34674458	34674458	2.1928395544168e-13	34683810	34683810
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	34685308	1	0	NA	2.1928395544168e-13	34683810	34683810	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34689453	69086125	11874	11420	0.0059	NA	NA	NA	3.48164675630424e-18	69086125	69086125
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69092211	3	3	1.0995	3.48164675630424e-18	69086125	69086125	2.96952886891304e-23	69092211	69092211
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69093444	69324704	123	120	-0.0055	2.96952886891304e-23	69092211	69092211	2.14326518787012e-06	69315167	69346011
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69326925	69388338	22	22	0.2346	2.14326518787012e-06	69315167	69346011	4.17138688810814e-06	69355704	69418554
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69392354	73075500	1646	1573	2e-04	4.17138688810814e-06	69355704	69418554	7.00806750319631e-24	73075500	73075500
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73082262	73092112	5	5	0.9408	7.00806750319631e-24	73075500	73075500	1.89293820676164e-22	73092112	73092112
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	101704652	10671	10283	0.0048	1.89293820676164e-22	73092112	73092112	2.33920401979638e-11	101704652	101704652
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	101707771	101707860	2	2	-1.0639	2.33920401979638e-11	101704652	101704652	6.05002466182195e-10	101707860	101714112
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	101713121	101713121	1	0	NA	6.05002466182195e-10	101707860	101714112	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	101714112	105597555	1541	1491	0.0086	NA	NA	NA	1.38832667421248e-13	105592583	105602602
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	0.5189	1.38832667421248e-13	105592583	105602602	2.89472581621983e-09	105630089	105707746
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105856591	49	48	0.0048	2.89472581621983e-09	105630089	105707746	2.29205496748169e-25	105850033	105856591
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856972	105881893	6	6	-1.1651	2.29205496748169e-25	105850033	105856591	2.27878415554466e-41	105881893	105881893
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	105923686	14	14	-0.0331	2.27878415554466e-41	105881893	105881893	2.0582146377552e-16	105923686	105946993
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105945006	106019719	24	22	0.6819	2.0582146377552e-16	105923686	105946993	2.24334583596989e-30	106015449	106021453
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106021453	106358491	138	133	0.0089	2.24334583596989e-30	106015449	106021453	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	19537035	99	95	0.1548	NA	NA	NA	1.31715451991993e-48	19537035	19537035
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	19910696	15	14	-0.644	1.31715451991993e-48	19537035	19537035	0.00127671675043682	19845942	19968127
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19927040	20088256	42	41	-0.3651	0.00127671675043682	19845942	19968127	5.58678903920327e-28	20045859	20321772
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	53879197	12370	11894	0.0039	5.58678903920327e-28	20045859	20321772	2.92774017372173e-07	53876187	53879197
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	53881556	53881556	1	0	NA	2.92774017372173e-07	53876187	53879197	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	53884978	53888947	2	2	0.885	NA	NA	NA	2.77718365285613e-07	53888947	53894752
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	53894752	100298352	18793	18072	-0.002	2.77718365285613e-07	53888947	53894752	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	33348511	10594	10224	0.0181	NA	NA	NA	1.96862322484890e-13	32545350	33445329
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33370459	34059589	34	32	-0.2749	1.9686232248489e-13	32545350	33445329	6.47275583446871e-14	33842125	34068830
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34061029	68693086	7671	7388	0.0175	6.47275583446871e-14	33842125	34068830	2.99404463965551e-14	68687301	68712507
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68753209	10	10	-0.5107	2.99404463965551e-14	68687301	68712507	2.00327397042441e-14	68747578	68842364
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	72918129	1453	1395	0.0234	2.00327397042441e-14	68747578	68842364	2.21352504593174e-11	72915477	72941901
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72929786	72964783	7	7	-0.5448	2.21352504593174e-11	72915477	72941901	7.77500463752098e-10	72956298	73025340
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73022578	75093957	754	730	0.0121	7.77500463752098e-10	72956298	73025340	2.96693824822970e-81	75093957	75093957
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	2.4029	2.9669382482297e-81	75093957	75093957	1.43415740707506e-91	75100865	75100865
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	576	0.0411	1.43415740707506e-91	75100865	75100865	1.39439737829952e-135	76925748	76929598
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	7	2.0543	1.39439737829952e-135	76925748	76929598	8.0269077542419e-134	76937156	76940218
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4347	0.0076	8.0269077542419e-134	76937156	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1904451	854	818	0.0241	NA	NA	NA	1.73425477494485e-14	1904451	1904451
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906319	1906391	3	3	1.0519	1.73425477494485e-14	1904451	1904451	1.77916011094134e-15	1906391	1906391
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	25367590	8659	8335	0.0182	1.77916011094134e-15	1906391	1906391	6.43780667673376e-19	25367590	25367590
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	25371853	25377349	3	3	-1.1201	6.43780667673376e-19	25367590	25367590	3.09598776463911e-19	25377349	25377349
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	25378651	31457889	2518	2426	-0.0062	3.09598776463911e-19	25377349	25377349	6.20821970960462e-11	31436580	31470227
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31499568	18	18	-0.2818	6.20821970960462e-11	31436580	31470227	6.3467397823629e-07	31489333	31898606
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31503774	40869151	3628	3489	0.0092	6.3467397823629e-07	31489333	31898606	3.66602851143671e-09	40847517	40869151
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	40874079	41031191	7	7	-0.5223	3.66602851143671e-09	40847517	40869151	4.36609568300421e-11	41031191	41066163
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41062669	41519702	198	191	0.0581	4.36609568300421e-11	41031191	41066163	5.40900013681074e-186	41519702	41519702
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41710400	67	64	-0.8597	5.40900013681074e-186	41519702	41519702	2.27244533895081e-242	41710400	41710400
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	72840124	11343	10919	0.0107	2.27244533895081e-242	41710400	41710400	8.00746621507225e-11	72827808	72859590
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	72842733	72885023	18	18	-0.3468	8.00746621507225e-11	72827808	72859590	2.82906348319221e-09	72872016	72890711
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	72886200	78653545	2318	2235	-0.0036	2.82906348319221e-09	72872016	72890711	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	65357415	19766	19008	0.0129	NA	NA	NA	2.72275868594742e-19	65357415	65357415
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	65359770	65367911	4	4	-0.9493	2.72275868594742e-19	65357415	65357415	9.30051445179362e-18	65367911	65367911
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	65369843	65369843	1	0	NA	9.30051445179362e-18	65367911	65367911	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	65371927	76116026	3193	3086	0.0142	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	473	0.0193	NA	NA	NA	3.04866446376960e-58	1398325	1398325
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	2.5913	3.0486644637696e-58	1398325	1398325	3.60859291186575e-55	1400840	1400840
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	1797537	185	174	0.0374	3.60859291186575e-55	1400840	1400840	1.27784716129723e-09	1797537	1797537
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1798246	1799778	2	2	1.1051	1.27784716129723e-09	1797537	1797537	3.44923655546598e-10	1799778	1799778
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1801091	11448975	4491	4278	0.009	3.44923655546598e-10	1799778	1799778	3.1155521972718e-12	11448975	11448975
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.2047	3.1155521972718e-12	11448975	11448975	2.41770568556231e-13	11452390	11452390
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	59491509	15913	15307	0.0117	2.41770568556231e-13	11452390	11452390	7.30038069680241e-10	59491509	59491509
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59492650	59497049	2	2	-0.9676	7.30038069680241e-10	59491509	59491509	1.04862725020848e-08	59497049	59500575
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59500575	63788698	1970	1902	-0.0075	1.04862725020848e-08	59497049	59500575	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	559	0.0178	NA	NA	NA	8.03871679918639e-125	1506379	1506379
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	1.6174	8.0387167991864e-125	1506379	1506379	2.85136216261434e-125	1532433	1532433
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	5025550	1449	1396	-0.0066	2.85136216261434e-125	1532433	1532433	5.82837195721082e-15	4931218	5025550
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	5029608	5030776	2	2	-0.4467	5.82837195721082e-15	4931218	5025550	0.000349864331206119	5030776	5077551
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	5034958	52080395	15794	15271	0.0118	0.000349864331206119	5030776	5077551	8.60841808407212e-15	52078884	52080395
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52081719	52090393	5	5	-0.76	8.60841808407212e-15	52078884	52080395	4.99376867518386e-13	52090393	52092989
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52092989	62419534	3733	3607	0.0101	4.99376867518386e-13	52090393	52092989	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12976	0.0108	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	21571489	2520	2436	0.0142	NA	NA	NA	1.81947834804239e-08	21570227	21571489
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21574577	21576859	3	3	0.8336	1.81947834804239e-08	21570227	21571489	2.62634310244397e-09	21576859	21579649
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21579649	22667608	459	443	0.019	2.62634310244397e-09	21576859	21579649	6.32997824399015e-176	22667608	22677959
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	22	1.3737	6.32997824399015e-176	22667608	22677959	1.5797455319129e-204	22721042	22725305
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	35472378	6547	6314	0.0208	1.5797455319129e-204	22721042	22725305	2.52657508005828e-100	35472378	35472378
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.1151	2.52657508005828e-100	35472378	35472378	3.25679101230933e-96	35476942	35476942
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	36865292	786	758	0.0012	3.25679101230933e-96	35476942	35476942	4.75853392784758e-07	36859160	36866617
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	36866617	36876540	6	6	-0.5005	4.75853392784758e-07	36859160	36866617	5.27517704320001e-17	36871366	36891479
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	36877753	49571068	6211	5971	0.0105	5.27517704320001e-17	36871366	36891479	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	266212	127	122	0.0193	NA	NA	NA	8.49081548590286e-06	264886	266212
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	267060	267079	2	2	0.9012	8.49081548590286e-06	264886	266212	3.77208506038043e-11	267079	268402
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	268402	2708291	1664	1600	-0.0269	3.77208506038043e-11	267079	268402	0	2708291	2711273
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	8437023	1782	1725	0.9033	0	2708291	2711273	9.30785743933244e-11	8417817	8449254
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8439398	8466917	16	16	0.442	9.30785743933244e-11	8417817	8449254	3.47774366250754e-12	8456422	8481902
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8473482	8477126	3	0	NA	3.47774366250754e-12	8456422	8481902	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8481280	154038318	43200	41580	0.9153	NA	NA	NA	1.17382043920855e-53	154038318	154038318
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154078819	11	11	2.0742	1.17382043920855e-53	154038318	154038318	5.30264025564934e-41	154078819	154078819
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154582414	122	116	0.9105	5.30264025564934e-41	154078819	154078819	1.15817386958035e-246	154578922	154582414
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	188	0.0817	1.15817386958035e-246	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	118	-4.0284	NA	NA	NA	1.96444418901385e-16	3034907	3733715
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	4431527	11	11	-0.8418	1.96444418901385e-16	3034907	3733715	0.000788731694270045	4272867	4597974
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4597974	5672441	7	7	-1.9602	0.000788731694270045	4272867	4597974	0.0688862747421648	5672441	6866246
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6652845	6955902	119	109	-3.5845	0.0688862747421648	5672441	6866246	6.30307760759819e-06	6909375	7017919
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6956705	7653082	214	200	-2.6452	6.30307760759819e-06	6909375	7017919	2.53104343191667e-07	7630477	7664085
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7709619	35	32	-4.3114	2.53104343191667e-07	7630477	7664085	1.18479063470997e-07	7698960	7723783
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	8016395	90	85	-2.6895	1.18479063470997e-07	7698960	7723783	1.04360642832346e-11	7992095	8059682
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8036254	8036254	1	0	NA	1.04360642832346e-11	7992095	8059682	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8043008	8280065	60	50	-4.3349	NA	NA	NA	5.10716661495009e-08	8251785	8293425
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8289709	8289709	1	0	NA	5.10716661495009e-08	8251785	8293425	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8292347	8324291	12	12	-2.0922	NA	NA	NA	0.000111176945168221	8304781	8347344
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8324328	8949553	178	166	-3.5911	0.000111176945168221	8304781	8347344	0.0124541725027294	8888511	8949553
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8953090	8956787	3	3	-1.3938	0.0124541725027294	8888511	8949553	0.000211430816559395	8956787	8960527
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8958121	10513747	111	100	-4.1458	0.000211430816559395	8956787	8960527	1.57998900116344e-35	10512616	10515697
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	12452734	20	20	-0.8968	1.57998900116344e-35	10512616	10515697	1.79761527153478e-07	11673476	12518008
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12541506	11	10	-3.359	1.79761527153478e-07	11673476	12518008	0.00109933674706559	12532441	12557151
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	52	-1.7279	0.00109933674706559	12532441	12557151	7.43047722335683e-07	12651786	12721434
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	22	-3.472	7.43047722335683e-07	12651786	12721434	1.71495855067088e-08	12786515	12855363
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	13129843	113	109	-1.7762	1.71495855067088e-08	12786515	12855363	6.05049333173786e-09	13114969	13133803
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13153117	12	12	-3.8549	6.05049333173786e-09	13114969	13133803	0.072612590678417	13138841	13155705
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13153920	13159901	4	4	-2.8268	0.072612590678417	13138841	13155705	0.0068589893223132	13155705	13164641
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13161955	13176983	10	9	-1.6828	0.0068589893223132	13155705	13164641	8.35939391163601e-08	13176983	13215006
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13202163	14342834	382	347	-4.0105	8.35939391163601e-08	13176983	13215006	8.13316547427136e-11	14331599	14349668
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14377844	17	17	-2.0048	8.13316547427136e-11	14331599	14349668	1.80195849952189e-13	14375855	14377844
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14379418	14407293	14	13	-4.2427	1.80195849952189e-13	14375855	14377844	0.000816434455895868	14404979	14434038
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14409145	14508021	65	61	-2.897	0.000816434455895868	14404979	14434038	1.62013972251845e-05	14498784	14508021
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	1.62013972251845e-05	14498784	14508021	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14547168	12	10	-1.0753	NA	NA	NA	1.65575724622196e-13	14547168	14547168
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14549297	14554415	4	4	-3.726	1.65575724622196e-13	14547168	14547168	6.61120553072059e-16	14554415	14554415
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14555872	14579298	9	9	-1.1376	6.61120553072059e-16	14554415	14554415	0.000241103242964911	14579298	14644293
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15299931	204	193	-3.0937	0.000241103242964911	14579298	14644293	3.13955543301242e-07	15255162	15327001
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15301380	15467288	106	100	-3.9928	3.13955543301242e-07	15255162	15327001	2.36679801879838e-07	15434486	15541293
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15468160	16387273	269	249	-3.0721	2.36679801879838e-07	15434486	15541293	0.0029867841401567	16357759	16387273
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	16413874	3	3	-6.2205	0.0029867841401567	16357759	16387273	0.000543769942061287	16404836	16426834
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16417108	16647090	33	32	-4.3422	0.000543769942061287	16404836	16426834	0.0791101299546595	16492450	16647090
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16654558	16656177	2	2	-5.7571	0.0791101299546595	16492450	16647090	0.0180465348942715	16656177	17201569
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16659030	17232116	92	88	-3.5255	0.0180465348942715	16656177	17201569	0.00222181421115130	16929465	17280842
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17238655	17496151	46	41	-4.4268	0.0022218142111513	16929465	17280842	1.04391613964470e-16	17487972	17496151
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17503455	17548302	9	9	-1.7325	1.0439161396447e-16	17487972	17496151	1.37558677839030e-05	17548302	17598928
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17557953	21036411	485	446	-3.8971	1.3755867783903e-05	17548302	17598928	2.81447224084212e-07	21028489	21036411
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21036503	21054519	7	7	-1.1061	2.81447224084212e-07	21028489	21036411	4.91848508670011e-08	21054519	21059229
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	21224074	61	58	-3.9146	4.91848508670011e-08	21054519	21059229	5.0640778187143e-05	21159172	21269254
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21236497	21348482	37	36	-2.8113	5.0640778187143e-05	21159172	21269254	0.000450641615345063	21335456	21435511
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21349725	22139807	163	143	-3.7812	0.000450641615345063	21335456	21435511	1.68238736045398e-05	22041876	22157319
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	8	-1.5263	1.68238736045398e-05	22041876	22157319	7.52016001374804e-07	22176501	22177335
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22181855	3	3	-3.5605	7.52016001374804e-07	22176501	22177335	0.000583103032090261	22181855	22200078
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22182080	22263267	25	22	-5.0598	0.000583103032090261	22181855	22200078	0.000176957330053523	22252795	22767553
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22268552	22268552	1	0	NA	0.000176957330053523	22252795	22767553	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22308420	22930737	64	53	-3.8547	NA	NA	NA	8.93583388171772e-42	22924754	23283689
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	27019256	50	47	-1.0851	8.93583388171772e-42	22924754	23283689	1.89180813404434e-12	27011035	27019256
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27032300	3	3	-4.3353	1.89180813404434e-12	27011035	27019256	1.16270509608504e-49	27032300	27032300
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27039222	27039222	1	0	NA	1.16270509608504e-49	27032300	27032300	NA	NA	NA
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	27137064	16	14	-0.4692	NA	NA	NA	1.53806481531409e-09	27137064	27163598
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27163598	27176933	5	4	-2.6918	1.53806481531409e-09	27137064	27163598	1.85483970943379e-12	27172283	27176933
MSK_252152917554_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27188740	57440809	11	11	-0.2243	1.85483970943379e-12	27172283	27176933	NA	NA	NA
