Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	16713074	5782	5491	-0.0111	NA	NA	NA	3.06099787910555e-19	16704522	16799711
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16799711	16926444	11	11	-0.6211	3.06099787910555e-19	16704522	16799711	1.1061553411004e-20	16921319	16961001
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16961001	69017343	20783	19798	7e-04	1.1061553411004e-20	16921319	16961001	4.53482297071876e-15	69006102	69028854
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	69022656	69053731	6	6	-0.7235	4.53482297071876e-15	69006102	69028854	7.3414176608684e-16	69041993	69061997
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	69061997	72537426	1312	1255	0.0016	7.3414176608684e-16	69041993	69061997	1.33589864709640e-222	72537426	72537426
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72539143	1	0	NA	1.3358986470964e-222	72537426	72537426	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72540240	72579311	13	9	2.1872	NA	NA	NA	2.11939588954983e-226	72579311	72579311
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	109373255	11406	10857	0.0188	2.11939588954983e-226	72579311	72579311	6.15695015829598e-117	109373255	109373255
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109374790	109376249	2	2	-3.2903	6.15695015829598e-117	109373255	109373255	2.13153334236775e-110	109376249	109376249
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109379566	150819879	6148	5843	1e-04	2.13153334236775e-110	109376249	109376249	1.52407596302295e-59	150819879	150823073
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150852858	12	12	0.9928	1.52407596302295e-59	150819879	150823073	3.779880733481e-58	150851439	150852858
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150857070	151938534	450	430	-0.0202	3.779880733481e-58	150851439	150852858	7.22905253014423e-12	151933142	151939880
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151939880	151956812	9	9	0.4937	7.22905253014423e-12	151933142	151939880	1.76892842302977e-10	151956778	151962672
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151962651	157133150	2301	2194	0.012	1.76892842302977e-10	151956778	151962672	1.90936435970464e-60	157133150	157133150
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	2.4137	1.90936435970464e-60	157133150	157133150	1.12424849688781e-61	157136342	157136342
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	161099582	1622	1548	0.0121	1.12424849688781e-61	157136342	157136342	1.80383598191614e-11	161099582	161099582
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161104752	161104791	2	2	-1.0427	1.80383598191614e-11	161099582	161099582	1.03289743537108e-17	161104791	161104791
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161108722	179014530	7072	6741	0.0057	1.03289743537108e-17	161104791	161104791	2.84485613567202e-16	179012671	179014530
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	179017844	179021834	3	3	-0.7855	2.84485613567202e-16	179012671	179014530	8.85289552569329e-10	179021834	179023488
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	179023488	185979586	2626	2488	0.0067	8.85289552569329e-10	179021834	179023488	5.50021653621189e-07	185973975	185979586
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	-0.8212	5.50021653621189e-07	185973975	185979586	2.13415181127488e-07	185988138	186000612
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	195009358	1970	1895	0.0302	2.13415181127488e-07	185988138	186000612	1.56526440940466e-18	194978218	195011344
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195011344	195048208	6	6	-0.7358	1.56526440940466e-18	194978218	195011344	5.23631347671801e-16	195046932	195062793
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195062793	200609726	2163	2059	0.0295	5.23631347671801e-16	195046932	195062793	7.35887787696271e-12	200596027	200620756
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200612164	200672373	24	22	-0.3177	7.35887787696271e-12	200596027	200620756	1.79727665427873e-10	200654700	200683992
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200673525	247186514	17420	16691	-0.0042	1.79727665427873e-10	200654700	200683992	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	10944	-0.0109	NA	NA	NA	1.83402429116408e-62	34542224	34551222
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	16	0.8696	1.83402429116408e-62	34542224	34551222	5.74333156313216e-62	34583814	34591681
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	52600588	7192	6830	0.0071	5.74333156313216e-62	34583814	34591681	1.18117645459848e-11	52588009	52600588
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	1.18117645459848e-11	52588009	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	0.7704	NA	NA	NA	1.06949970308767e-12	52635695	52639605
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	58097482	1727	1635	0.0122	1.06949970308767e-12	52635695	52639605	1.11365154664369e-30	58097482	58097482
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	58099732	58108035	6	6	-0.9395	1.11365154664369e-30	58097482	58097482	5.37499449193955e-34	58108035	58108035
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	58109885	58109885	1	0	NA	5.37499449193955e-34	58108035	58108035	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	58112555	66357387	2823	2683	0.0327	NA	NA	NA	2.14239350300807e-18	66357387	66357387
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	1.2801	2.14239350300807e-18	66357387	66357387	1.07849428347323e-16	66360747	66360747
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	88910647	6929	6573	-2e-04	1.07849428347323e-16	66360747	66360747	2.31232439966598e-284	88910647	88914081
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	88914081	89024933	51	49	-1.0567	2.31232439966598e-284	88910647	88914081	9.8606704884288e-08	89015715	89040625
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89028988	89093646	13	13	-1.7284	9.8606704884288e-08	89015715	89040625	3.37292030054506e-10	89054185	89093646
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89208480	89261600	10	10	-0.6375	3.37292030054506e-10	89054185	89093646	2.97799089432449e-07	89256487	89289123
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89263354	89263354	1	0	NA	2.97799089432449e-07	89256487	89289123	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89266418	91155301	65	62	-0.2796	NA	NA	NA	2.05965698866105e-46	91057122	94784165
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	91158269	180117780	26024	24800	-3e-04	2.05965698866105e-46	91057122	94784165	2.42400523945432e-42	180117780	180117780
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	180121271	180129680	6	4	-0.9403	2.42400523945432e-42	180117780	180117780	4.84265796026828e-19	180129680	180129680
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	180131608	212890878	10740	10229	0.0209	4.84265796026828e-19	180129680	180129680	2.41656230487323e-14	212890878	212890878
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212892884	212898875	4	4	-0.8184	2.41656230487323e-14	212890878	212890878	2.18607223441836e-24	212898875	212900857
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212900857	242689978	10688	10193	-0.009	2.18607223441836e-24	212898875	212900857	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	66996521	24074	22927	-0.0043	NA	NA	NA	1.97913807042996e-35	66994191	66996521
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	66999815	67006755	3	2	0.9096	1.97913807042996e-35	66994191	66996521	2.93007134755721e-09	67006755	67006755
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	67010986	78249428	3674	3475	-0.0225	2.93007134755721e-09	67006755	67006755	0.00229861871581286	78165073	78260953
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	78251454	78264444	7	7	0.2204	0.00229861871581286	78165073	78260953	1.89338567797122e-05	78252796	78470550
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	78267329	127335817	13477	12840	0.0194	1.89338567797122e-05	78252796	78470550	8.28100147837207e-09	127331471	127347507
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	127337742	127351071	6	6	-0.5242	8.28100147837207e-09	127331471	127347507	7.43144638417109e-09	127339242	127355988
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	127352985	133189686	2468	2351	-0.0054	7.43144638417109e-09	127339242	127355988	1.06748582510901e-10	133189686	133189686
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.0366	1.06748582510901e-10	133189686	133189686	1.60787119446122e-10	133194685	133194685
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	163992903	9777	9328	0.009	1.60787119446122e-10	133194685	133194685	1.70845529018396e-14	163992903	163992903
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164005577	3	3	0.9851	1.70845529018396e-14	163992903	163992903	1.22751559562689e-09	164005577	164005577
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	4	-1.1747	1.22751559562689e-09	164005577	164005577	1.01285569842390e-29	164027724	164027724
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	18	0.8528	1.0128556984239e-29	164027724	164027724	1.47915341790684e-66	164105613	164112873
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	194364470	10134	9655	0.0117	1.47915341790684e-66	164105613	164112873	1.33773825497050e-183	194364470	194364470
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194365648	194366950	2	2	-4.1586	1.3377382549705e-183	194364470	194364470	2.25923958746592e-187	194366950	194366950
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196822133	996	949	-0.0109	2.25923958746592e-187	194366950	194366950	2.77115495423601e-15	196806091	196911010
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196970927	36	32	-0.3173	2.77115495423601e-15	196806091	196911010	7.28822974691965e-17	196961238	196980755
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196972067	199329592	948	894	0.0341	7.28822974691965e-17	196961238	196980755	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	58159	9	9	-0.4117	NA	NA	NA	3.87470603163827e-06	58159	78043
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	61552	9815760	3384	3223	-0.0138	3.87470603163827e-06	58159	78043	1.10069430397889e-139	9815760	9815760
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9821327	1	0	NA	1.10069430397889e-139	9815760	9815760	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9827233	9842644	3	3	-3.1664	NA	NA	NA	7.23112109992789e-165	9842644	9842644
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	34445002	6167	5902	-0.0226	7.23112109992789e-165	9842644	9842644	0	34445002	34445002
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	-4.1488	0	34445002	34445002	0	34491115	34491115
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	68905670	8863	8429	0.0096	0	34491115	34491115	2.95981363280549e-45	68901210	69069651
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	13	0.8217	2.95981363280549e-45	68901210	69069651	2.99327509887545e-44	69163312	69643272
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	88752705	6585	6269	0.0164	2.99327509887545e-44	69163312	69643272	3.89555353629947e-12	88752705	88752705
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88754121	88756721	2	2	-1.0769	3.89555353629947e-12	88752705	88752705	2.06152729937951e-12	88756721	88756721
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88757953	122500822	10657	10122	0.0134	2.06152729937951e-12	88756721	88756721	4.04396199895762e-11	122499680	122500822
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	122502339	122507557	3	3	-0.832	4.04396199895762e-11	122499680	122500822	1.00007791286175e-27	122507557	122511771
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	122511771	190710812	19357	18419	-0.001	1.00007791286175e-27	122507557	122511771	5.87092703458296e-88	190708316	190725579
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190717801	190921041	65	62	-0.511	5.87092703458296e-88	190708316	190725579	3.26517971966596e-20	190913517	190927969
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190924564	191153613	45	40	-0.1031	3.26517971966596e-20	190913517	190927969	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	61638068	16799	16020	-0.0118	NA	NA	NA	1.52445567131234e-25	61633571	61638068
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	61639502	61643767	3	3	-0.8429	1.52445567131234e-25	61633571	61638068	4.62983040905367e-12	61643767	61643767
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	61646220	66210221	1516	1445	0.0365	4.62983040905367e-12	61643767	61643767	6.32185767148157e-08	66205378	66210221
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	66212257	66220693	6	6	0.5457	6.32185767148157e-08	66205378	66210221	3.00856076447717e-09	66220693	66224134
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	66222704	68864742	725	691	0.0143	3.00856076447717e-09	66220693	66224134	6.61372605170468e-09	68862665	68864742
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	68885350	70405656	4	4	0.6533	6.61372605170468e-09	68862665	68864742	3.81042277963622e-13	70405656	70693444
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	70693444	161749783	28604	27237	0.0137	3.81042277963622e-13	70405656	70693444	2.06995170716795e-40	161722215	161761305
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	161761305	161977052	45	42	-0.4107	2.06995170716795e-40	161722215	161761305	2.88268779893788e-34	161971639	162000827
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	161981116	180194323	5943	5655	-0.0135	2.88268779893788e-34	161971639	162000827	5.47063601604887e-13	180192214	180194323
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180342860	180362342	10	9	-0.549	5.47063601604887e-13	180192214	180194323	1.44447707506205e-11	180362342	180365950
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180364670	180644810	111	106	-0.0068	1.44447707506205e-11	180362342	180365950	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	29966336	10589	10130	6e-04	NA	NA	NA	2.78136766091841e-16	29962849	29966336
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29972382	29995247	8	8	0.6204	2.78136766091841e-16	29962849	29966336	1.69034608854510e-13	29995247	30000990
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29998009	31387708	586	564	0.0228	1.6903460885451e-13	29995247	30000990	2.58095358392451e-12	31387708	31387708
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31389372	31390982	2	2	-1.1249	2.58095358392451e-12	31387708	31387708	2.79243159668380e-15	31390982	31390982
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31393624	32558677	492	473	0.0399	2.7924315966838e-15	31390982	31390982	3.37612997351199e-203	32558677	32558677
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32588005	4	4	-2.9864	3.37612997351199e-203	32558677	32558677	1.57725170764357e-190	32588005	32588005
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32590568	32590568	1	0	NA	1.57725170764357e-190	32588005	32588005	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32593151	72919733	12845	12265	0.0066	NA	NA	NA	8.09897453078186e-125	72919733	72919733
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72920894	72924440	3	3	-2.7955	8.09897453078186e-125	72919733	72919733	1.33182151400842e-127	72924440	72924440
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72931542	165643653	29779	28430	0.0089	1.33182151400842e-127	72924440	72924440	7.09965690554927e-100	165643653	165643653
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	2.1584	7.09965690554927e-100	165643653	165643653	1.67236849878703e-91	165650610	165650610
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1715	-0.0541	1.67236849878703e-91	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	16135701	5388	5113	0.0044	NA	NA	NA	4.04780286604795e-12	16135701	16135701
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	1.096	4.04780286604795e-12	16135701	16135701	2.03472516324466e-12	16140018	16140018
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	38269153	8213	7843	-0.0015	2.03472516324466e-12	16140018	16140018	6.6472101446816e-11	38247267	38281765
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38270942	38270942	1	0	NA	6.6472101446816e-11	38247267	38281765	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38274436	38335964	34	33	0.2529	NA	NA	NA	2.57150415958612e-11	38329228	38372692
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38337912	64523575	5924	5645	-0.0163	2.57150415958612e-11	38329228	38372692	2.55521677671230e-12	64523575	64523575
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64532019	64532949	2	2	-1.1529	2.5552167767123e-12	64523575	64523575	3.15452655389398e-13	64532949	64532949
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64534167	71889139	2222	2116	-0.024	3.15452655389398e-13	64532949	64532949	5.24583548936893e-22	71889139	71889139
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71894353	71894353	1	0	NA	5.24583548936893e-22	71889139	71889139	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71911940	71912065	2	2	-1.4689	NA	NA	NA	7.79662673624125e-23	71912065	71912065
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71914572	109217320	13172	12582	0.0115	7.79662673624125e-23	71912065	71912065	1.19417625057319e-08	109216032	109217320
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109230336	109233214	3	3	-0.7525	1.19417625057319e-08	109216032	109217320	1.00084879157368e-13	109233214	109236813
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109236813	133433384	11131	10576	0.0055	1.00084879157368e-13	109233214	109236813	2.47587579693465e-14	133426996	133437464
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133455682	10	10	0.5405	2.47587579693465e-14	133426996	133437464	3.08472397300319e-15	133448277	133456873
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133456873	141410894	3698	3507	0.0051	3.08472397300319e-15	133448277	133456873	8.09067247205663e-11	141406414	141414719
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	13	0.4037	8.09067247205663e-11	141406414	141414719	7.58555809960901e-08	141432778	141452085
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	142007171	249	235	0.0319	7.58555809960901e-08	141432778	141452085	2.68745147642128e-08	141978682	142031323
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142009000	142152205	45	43	0.2485	2.68745147642128e-08	141978682	142031323	8.15721628516098e-15	142136345	142176074
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142156165	147702365	2345	2232	-0.0166	8.15721628516098e-15	142136345	142176074	8.19235497144444e-14	147702365	147702365
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	1.1645	8.19235497144444e-14	147702365	147702365	3.96034088748689e-13	147707161	147707161
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4041	-0.0286	3.96034088748689e-13	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	579405	118	111	-0.0668	NA	NA	NA	2.25076899527637e-05	576338	579405
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	581533	588865	3	3	-0.8126	2.25076899527637e-05	576338	579405	2.73235284061535e-11	588865	591112
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	25022606	8008	7632	-0.0311	2.73235284061535e-11	588865	591112	1.42887637460701e-18	25022606	25022606
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	1.0905	1.42887637460701e-18	25022606	25022606	6.61887715477683e-19	25039370	25039370
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	40892587	5442	5172	-0.01	6.61887715477683e-19	25039370	25039370	1.99467395508557e-164	40892587	40892587
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-3.9238	1.99467395508557e-164	40892587	40892587	2.21828409937519e-163	40897469	40897469
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	107520947	19159	18227	0.0082	2.21828409937519e-163	40897469	40897469	3.29207186921933e-13	107520947	107520947
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	107522226	107526215	2	2	1.159	3.29207186921933e-13	107520947	107520947	1.61305968017213e-13	107526215	107526215
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	107529035	131919337	7290	6957	0.0017	1.61305968017213e-13	107526215	107526215	1.67890654829686e-13	131919337	131919337
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	131921399	131923149	2	2	1.1587	1.67890654829686e-13	131919337	131919337	1.42613137965171e-14	131923149	131923149
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	131926292	145330767	4236	4045	-0.0344	1.42613137965171e-14	131923149	131923149	2.22441690124558e-14	145328970	145330767
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	145333207	145334573	2	2	-0.9447	2.22441690124558e-14	145328970	145330767	5.58296165958748e-09	145334573	145336073
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	145336073	146264846	299	284	0.0138	5.58296165958748e-09	145334573	145336073	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	23343915	8000	7620	0.0049	NA	NA	NA	1.66536907867517e-153	23343915	23343915
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	-3.0996	1.66536907867517e-153	23343915	23343915	4.41104893889787e-177	23365926	23365926
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	25230590	383	357	-0.037	4.41104893889787e-177	23365926	23365926	9.2168387608835e-58	25230590	25230590
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	25241843	25241843	1	0	NA	9.2168387608835e-58	25230590	25230590	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	25249013	25336912	13	12	-0.9248	NA	NA	NA	3.11154370858754e-51	25336912	25336912
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	25344922	140145683	29544	28145	-0.0077	3.11154370858754e-51	25336912	25336912	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	13553503	4682	4459	-0.0126	NA	NA	NA	2.93082420299278e-10	13553503	13553503
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13555034	13556315	2	2	-1.037	2.93082420299278e-10	13553503	13553503	3.31446553391228e-11	13556315	13556315
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13557998	27038538	5045	4792	-0.0085	3.31446553391228e-11	13556315	13556315	9.534331838601e-46	27038538	27038538
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-2.0664	9.534331838601e-46	27038538	27038538	6.74595187894706e-41	27041812	27041812
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	27043861	1	0	NA	6.74595187894706e-41	27041812	27041812	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27045226	31284926	1560	1505	-0.0077	NA	NA	NA	4.03516420051094e-07	31284756	31284926
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31287101	31291525	3	3	0.6908	4.03516420051094e-07	31284756	31284926	5.54014759766445e-07	31291525	31293140
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31293140	68005599	9070	8608	-0.0106	5.54014759766445e-07	31291525	31293140	3.27260815637953e-160	68003920	68018232
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	68009183	68009183	1	0	NA	3.27260815637953e-160	68003920	68018232	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	68009346	68135446	50	48	-0.8219	NA	NA	NA	9.22306700149668e-153	68127495	68135446
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	68137546	68137546	1	0	NA	9.22306700149668e-153	68127495	68135446	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	68140907	69429088	539	519	0.0011	NA	NA	NA	1.55208655564579e-07	69396045	69461035
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	69432192	69513347	35	34	0.211	1.55208655564579e-07	69396045	69461035	1.06045123287808e-72	69487900	69541847
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	69515241	135285645	23817	22673	-0.0089	1.06045123287808e-72	69487900	69541847	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1672	-0.0066	NA	NA	NA	0	4923300	4923300
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-4.7085	0	4923300	4923300	0	4932214	4932214
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	5742476	362	343	0.0223	0	4932214	4932214	2.23020214850759e-19	5741031	5745329
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5744034	5765438	14	14	-0.57	2.23020214850759e-19	5741031	5745329	1.15682361187816e-22	5762182	5766615
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	49663240	14564	13887	-0.002	1.15682361187816e-22	5762182	5766615	3.05318356441927e-10	49650232	49671267
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49666382	49710027	10	10	-0.463	3.05318356441927e-10	49650232	49671267	1.00104393027355e-09	49699428	49725462
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49721954	55118214	178	169	-0.0659	1.00104393027355e-09	49699428	49725462	4.08908151521203e-72	55114405	55124730
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	39	-0.7084	4.08908151521203e-72	55114405	55124730	3.25011125691466e-104	55207305	55217189
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	113976883	20690	19727	0.0086	3.25011125691466e-104	55207305	55217189	1.14475805804994e-10	113970622	113976883
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	113979934	114016954	7	7	-0.4956	1.14475805804994e-10	113970622	113976883	5.00023211013061e-21	114016954	114030071
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	114022843	134450318	7663	7300	-0.0243	5.00023211013061e-21	114016954	114030071	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	11116883	4329	4116	0.009	NA	NA	NA	7.38423820523994e-107	11116883	11125311
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11130871	6	6	-1.9201	7.38423820523994e-107	11116883	11125311	7.97081549177018e-119	11126558	11130871
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	130694393	40180	38293	0.014	7.97081549177018e-119	11126558	11130871	1.83495590430901e-50	130694393	130694393
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	1.2043	1.83495590430901e-50	130694393	130694393	3.52624284284571e-13	130701040	130701040
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	610	0.0048	3.52624284284571e-13	130701040	130701040	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	34578806	6015	5722	-0.0047	NA	NA	NA	3.14082023658585e-07	34566316	34581791
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	34580008	34613316	17	17	0.2876	3.14082023658585e-07	34566316	34581791	1.90335210734126e-15	34610187	34626236
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	34614409	45631823	4532	4303	-0.046	1.90335210734126e-15	34610187	34626236	7.22325213472442e-60	45631823	45631823
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	45633164	45636180	2	0	NA	7.22325213472442e-60	45631823	45631823	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	45637710	45637778	2	2	2.3289	NA	NA	NA	2.45452481244339e-64	45637778	45637778
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	45640031	49964838	1651	1567	-0.0438	2.45452481244339e-64	45637778	45637778	2.48129926061911e-39	49964838	49964838
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-1.9044	2.48129926061911e-39	49964838	49964838	4.32156915691542e-33	49971732	49971732
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56650373	1804	1719	-0.0814	4.32156915691542e-33	49971732	49971732	1.48264790124883e-36	56646284	56650373
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56681665	14	12	0.7005	1.48264790124883e-36	56646284	56650373	4.7761665411635e-56	56681665	56685341
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56685341	114123340	17605	16769	-0.0277	4.7761665411635e-56	56681665	56685341	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18798641	7	7	0.0347	NA	NA	NA	9.99086868327708e-10	18537177	18864561
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18864561	19494416	53	49	0.6725	9.99086868327708e-10	18537177	18864561	4.04908600217247e-105	19492531	19497023
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	21431585	947	897	0.0259	4.04908600217247e-105	19492531	19497023	9.20822911958289e-74	21418192	21448635
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21432670	22048569	304	288	0.2766	9.2082291195829e-74	21418192	21448635	4.02879548123625e-104	22040315	22059557
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22049850	40680589	6338	6044	0.0099	4.02879548123625e-104	22040315	22059557	7.68209230012978e-18	40676611	40687108
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40687108	40722360	6	6	-0.7485	7.68209230012978e-18	40676611	40687108	2.29012389812967e-18	40712006	40726930
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40726930	73071404	11765	11193	0.0168	2.29012389812967e-18	40712006	40726930	2.41725550885796e-09	73060301	73075500
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73092112	7	7	0.532	2.41725550885796e-09	73060301	73075500	7.33798864685066e-13	73091980	73104540
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	105323841	12139	11558	-0.0099	7.33798864685066e-13	73091980	73104540	3.88794420043361e-26	105314254	105334736
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105328908	105389020	24	23	-0.4874	3.88794420043361e-26	105314254	105334736	0.0175318261085970	105369008	105389020
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105391340	105398979	4	4	-0.103	0.017531826108597	105369008	105389020	1.14004315848683e-09	105398979	105401413
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105401413	105416396	8	8	-2.8743	1.14004315848683e-09	105398979	105401413	8.38104259869969e-10	105413708	105416396
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105425440	105607572	43	39	-1.2636	8.38104259869969e-10	105413708	105416396	0.00705668229273693	105520895	105623070
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105609466	105794161	34	32	-0.8802	0.00705668229273693	105520895	105623070	6.76601704485909e-10	105787390	105799261
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105795807	105900253	33	32	-0.4211	6.76601704485909e-10	105787390	105799261	2.41915867808556e-14	105881677	105908702
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105901394	106358491	173	164	-0.0214	2.41915867808556e-14	105881677	105908702	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18837737	15	15	0.0364	NA	NA	NA	5.77407464333883e-05	18824622	18857376
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18842565	20022359	133	129	0.3289	5.77407464333883e-05	18824622	18857376	1.32032245082466e-40	20010559	20045859
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20029653	20618219	133	130	-0.032	1.32032245082466e-40	20010559	20045859	2.70573446788259e-07	20616253	20618219
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20619211	20624211	3	3	0.6116	2.70573446788259e-07	20616253	20618219	1.27510506763535e-44	20624211	20627802
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20626298	47331325	9510	9016	-0.0055	1.27510506763535e-44	20624211	20627802	1.53825111551451e-45	47329708	47331325
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	47333933	47335145	2	2	-0.7628	1.53825111551451e-45	47329708	47331325	1.66937515529370e-21	47335145	47336225
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	47336225	98232932	20612	19629	0.0022	1.6693751552937e-21	47335145	47336225	1.15565556232962e-26	98232932	98232932
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98239454	3	3	1.3412	1.15565556232962e-26	98232932	98232932	3.95531813248848e-31	98239454	98239454
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	100217181	906	876	-0.0311	3.95531813248848e-31	98239454	98239454	3.84238901338547e-05	100208843	100282819
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	100217283	100298352	5	5	-0.4775	3.84238901338547e-05	100208843	100282819	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	54379839	13706	13069	-0.0062	NA	NA	NA	1.85170924602672e-11	54379834	54399890
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	54402057	4	4	0.5921	1.85170924602672e-11	54379834	54399890	2.06410967866096e-06	54399890	54408446
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54405667	57201427	1198	1148	0.0092	2.06410967866096e-06	54399890	54408446	1.07023518625498e-10	57201427	57201427
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57203733	57203733	1	0	NA	1.07023518625498e-10	57201427	57201427	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	1.0565	NA	NA	NA	1.02614388444064e-14	57206772	57206772
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	75093957	5612	5354	-0.002	1.02614388444064e-14	57206772	57206772	4.89622687224394e-28	75093957	75093957
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	-1.6375	4.89622687224394e-28	75093957	75093957	3.37409723104518e-25	75100865	75100865
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76923844	609	576	-0.0575	3.37409723104518e-25	75100865	75100865	2.30344605023557e-50	76923844	76929598
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76925748	76925748	1	0	NA	2.30344605023557e-50	76923844	76929598	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	1.0778	NA	NA	NA	3.35110362835556e-44	76938723	76940218
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4290	-0.0222	3.35110362835556e-44	76938723	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	38282993	14649	13955	0.0023	NA	NA	NA	1.84520234989374e-15	38282993	38282993
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	38284409	38287021	3	3	-1.033	1.84520234989374e-15	38282993	38282993	1.89516433310783e-15	38287021	38287021
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	38288310	40874079	1032	981	0.0164	1.89516433310783e-15	38287021	38287021	3.02092506036794e-08	40866844	40874079
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41007660	41007660	1	0	NA	3.02092506036794e-08	40866844	40874079	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41011530	41031191	5	5	-0.584	NA	NA	NA	1.02844252087182e-07	41031191	41066163
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41062669	41521544	199	189	0.0125	1.02844252087182e-07	41031191	41066163	1.27958490244748e-36	41519702	41521544
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41522429	41566540	20	20	-0.6436	1.27958490244748e-36	41519702	41521544	0.0121340564624741	41552048	41611916
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41706870	44	43	-0.8321	0.0121340564624741	41552048	41611916	1.3993816530836e-151	41704093	42142363
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41708551	41710400	2	0	NA	1.3993816530836e-151	41704093	42142363	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	78653545	13679	12979	0.0092	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	21902	-0.0098	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	3591120	1536	1454	0.0223	NA	NA	NA	4.81239504715095e-10	3591120	3591120
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3592564	3593646	2	2	-1.1044	4.81239504715095e-10	3591120	3591120	2.00460298810524e-16	3593646	3593646
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3596968	35007799	9214	8718	0.0079	2.00460298810524e-16	3593646	3593646	3.188115379961e-36	35006331	35010769
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	35010769	35040746	13	12	-0.803	3.188115379961e-36	35006331	35010769	2.42998741417925e-37	35037173	35047301
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	35047301	59246409	10201	9722	-0.0015	2.42998741417925e-37	35037173	35047301	1.06576181389301e-21	59244965	59246409
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59249279	59251831	3	3	-0.7741	1.06576181389301e-21	59244965	59246409	1.28406549258951e-07	59251831	59253728
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59253728	63788698	2090	2000	-0.015	1.28406549258951e-07	59251831	59253728	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1516966	589	555	-0.0157	NA	NA	NA	6.8423950937793e-82	1516966	1518825
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1518825	1531162	6	6	-1.8207	6.8423950937793e-82	1516966	1518825	1.35278795974850e-102	1528899	1531162
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	52080395	17246	16385	-0.014	1.3527879597485e-102	1528899	1531162	3.99523539360743e-10	52078884	52080395
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52081719	52090393	5	5	-0.6571	3.99523539360743e-10	52078884	52080395	1.60992798241411e-10	52090393	52092989
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52092989	55492102	892	847	-0.0175	1.60992798241411e-10	52090393	52092989	5.5279775631777e-06	55489536	55492102
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	55493808	55501367	2	2	0.7534	5.5279775631777e-06	55489536	55492102	8.47410115376378e-16	55501367	55503979
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	55503979	62419534	2839	2708	-0.0332	8.47410115376378e-16	55501367	55503979	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	38499544	9406	8969	-0.0027	NA	NA	NA	4.7362613914796e-06	38498208	38499544
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	38501105	38502491	2	2	0.7977	4.7362613914796e-06	38498208	38499544	3.91523979631851e-13	38502491	38504109
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	38504109	46922972	4033	3841	-0.0196	3.91523979631851e-13	38502491	38504109	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	21424450	2423	2321	-0.0019	NA	NA	NA	1.69409026401619e-48	21415608	21433764
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21425952	21575829	99	92	-0.3542	1.69409026401619e-48	21415608	21433764	1.26100096643420e-55	21564629	21588229
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21576859	45448310	12185	11601	-0.0013	1.2610009664342e-55	21564629	21588229	1.30920771521635e-12	45446440	45448310
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	45451935	45456936	4	4	-0.6024	1.30920771521635e-12	45446440	45448310	6.24597050785784e-05	45456936	45461388
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	45458963	49571068	1845	1741	-0.0386	6.24597050785784e-05	45456936	45461388	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	1431411	789	752	-0.2552	NA	NA	NA	2.52262433601728e-07	1431240	1431411
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-1.3445	2.52262433601728e-07	1431240	1431411	7.82000536994262e-07	1432953	1435082
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	1434970	1	0	NA	7.82000536994262e-07	1432953	1435082	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1435082	2708291	1001	957	-0.273	NA	NA	NA	0	2708113	2711273
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	13679455	4075	3892	0.5539	0	2708113	2711273	8.05010740236812e-25	13677276	13681110
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	13681110	13686085	3	3	-0.391	8.05010740236812e-25	13677276	13681110	4.39914445034287e-24	13683888	13688061
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	13688061	77390104	18882	17950	0.5759	4.39914445034287e-24	13683888	13688061	6.32529953548062e-25	77390104	77390104
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77408943	77410052	2	2	-0.6689	6.32529953548062e-25	77390104	77390104	7.14322101274198e-30	77410052	77410052
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77412083	154038318	22039	20942	0.5699	7.14322101274198e-30	77410052	77410052	4.32918615223868e-53	154038318	154038318
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154078819	11	11	1.6739	4.32918615223868e-53	154038318	154038318	1.50370168067399e-40	154078819	154078819
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154442377	90	84	0.595	1.50370168067399e-40	154078819	154078819	1.40096738032866e-132	154442377	154442377
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	4	-2.2988	1.40096738032866e-132	154442377	154442377	4.1072201897734e-121	154450309	154450309
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	28	0.5622	4.1072201897734e-121	154450309	154450309	4.28442496895594e-60	154578922	154586690
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	190	-0.279	4.28442496895594e-60	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3780462	128	123	-3.2293	NA	NA	NA	1.09015823536085e-12	3772482	3780462
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4174561	4174561	1	0	NA	1.09015823536085e-12	3772482	3780462	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	5593746	11	10	-0.8383	NA	NA	NA	9.03525429545304e-06	5593746	6720552
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6953343	118	111	-3.0094	9.03525429545304e-06	5593746	6720552	2.71981706967959e-05	6900119	7020318
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6954864	7485594	183	174	-2.2704	2.71981706967959e-05	6900119	7020318	4.37163025994906e-05	7344413	7619927
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7491280	7709619	68	65	-3.1385	4.37163025994906e-05	7344413	7619927	2.78733273897348e-07	7698960	7713973
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7782532	27	25	-1.646	2.78733273897348e-07	7698960	7713973	0.000100093035647948	7745143	7799614
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7859390	29	28	-2.6235	0.000100093035647948	7745143	7799614	6.22155325898417e-05	7848999	7870400
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7860364	7914104	11	10	-1.4663	6.22155325898417e-05	7848999	7870400	3.95842394803222e-14	7914104	7914104
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	7930528	5	5	-4.1579	3.95842394803222e-14	7914104	7914104	1.97926888456763e-15	7930528	7930528
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7936024	8005148	16	13	-1.7934	1.97926888456763e-15	7930528	7930528	4.34989108900828e-13	8005148	8016395
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8010446	8178487	37	33	-3.699	4.34989108900828e-13	8005148	8016395	5.66232563352633e-06	8167434	8178487
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8179883	8195174	6	6	-1.9442	5.66232563352633e-06	8167434	8178487	9.50631786181633e-06	8195174	8204414
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8199414	8289709	21	18	-3.8005	9.50631786181633e-06	8195174	8204414	4.44016855103436e-15	8277707	8289709
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8292347	8324291	12	11	-1.4617	4.44016855103436e-15	8277707	8289709	0.000916236796037456	8324291	8437780
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8324328	8823361	148	138	-2.8427	0.000916236796037456	8324291	8437780	0.0415351079299637	8548774	8953090
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8824539	8956787	33	31	-3.2198	0.0415351079299637	8548774	8953090	0.0177712354532926	8856239	8965553
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8958121	9102367	22	22	-4.2437	0.0177712354532926	8856239	8965553	6.11290642981557e-05	9087629	9153682
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9118845	10513747	89	84	-3.1406	6.11290642981557e-05	9087629	9153682	2.79621251543704e-14	10511255	10537808
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	12502304	21	19	-1.0466	2.79621251543704e-14	10511255	10537808	1.98061603845290e-10	11698871	12502304
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12511461	12541506	10	10	-3.8342	1.9806160384529e-10	11698871	12502304	5.84474008229507e-12	12541506	12545716
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	49	-1.4553	5.84474008229507e-12	12541506	12545716	4.25475708902995e-09	12661168	12700767
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12776542	15	14	-3.3813	4.25475708902995e-09	12661168	12700767	8.36687915047806e-08	12741404	12804329
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12786515	13129843	121	116	-1.6941	8.36687915047806e-08	12741404	12804329	4.85010575081771e-34	13112411	13146483
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13823928	246	238	-3.1365	4.85010575081771e-34	13112411	13146483	0.000924270122436404	13777254	13851627
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13828384	13863657	8	8	-1.5581	0.000924270122436404	13777254	13851627	2.60616138078927e-06	13854447	13870622
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13866668	14352278	157	150	-3.3833	2.60616138078927e-06	13854447	13870622	1.48482234474184e-18	14331599	14374313
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14353244	14700040	142	140	-2.2613	1.48482234474184e-18	14331599	14374313	0.025522928275209	14585542	14700040
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14701706	14705129	4	3	-4.433	0.025522928275209	14585542	14700040	0.00624607526564194	14702545	14712496
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14705886	14836085	32	30	-2.9326	0.00624607526564194	14702545	14712496	0.000703921651122019	14793118	14849277
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14841337	14883615	7	7	-4.1519	0.000703921651122019	14793118	14849277	0.0194417283913369	14875973	14916784
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14894476	14937488	9	9	-2.5426	0.0194417283913369	14875973	14916784	0.159229850763332	14899294	15005207
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14941202	15018205	10	10	-1.7231	0.159229850763332	14899294	15005207	1.11310611412600e-05	15014767	15039182
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15022037	15095427	14	14	-3.6061	1.113106114126e-05	15014767	15039182	0.000122262937019409	15067468	15122414
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15099698	15282186	93	89	-2.3467	0.000122262937019409	15067468	15122414	3.29576095703094e-10	15266772	15303557
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15283393	15283393	1	0	NA	3.29576095703094e-10	15266772	15303557	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15284717	15433122	98	94	-3.3307	NA	NA	NA	2.27020832846890e-06	15429742	15433122
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15434486	15447091	6	5	-0.9273	2.2702083284689e-06	15429742	15433122	1.06841326264889e-08	15447091	15450495
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15448670	15473709	19	19	-3.5127	1.06841326264889e-08	15447091	15450495	0.00467071961585107	15467288	15537260
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15475310	15583573	45	44	-2.3652	0.00467071961585107	15467288	15537260	0.00302522480723249	15551462	15583573
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15585797	15617621	7	7	-4.1468	0.00302522480723249	15551462	15583573	7.93694211139993e-05	15590299	15642822
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15621613	15873423	44	40	-3.0606	7.93694211139993e-05	15590299	15642822	0.000367975654661896	15848986	15873423
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15892492	15915466	5	4	-4.2448	0.000367975654661896	15848986	15873423	0.0279547997399598	15915466	15955821
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16387273	162	156	-2.3682	0.0279547997399598	15915466	15955821	2.17331925039228e-15	16354465	16413874
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	16659030	39	38	-4.0388	2.17331925039228e-15	16354465	16413874	1.67767132707511e-05	16626771	16707690
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16660742	21018574	624	588	-3.0586	1.67767132707511e-05	16626771	16707690	0.0376359192614521	20363399	21025500
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21025470	21036411	7	7	-2.0199	0.0376359192614521	20363399	21025500	0.0120675523422071	21026715	21041164
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21036503	21054519	7	7	-1.1686	0.0120675523422071	21026715	21041164	0.000624922120970985	21054519	21074401
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	22192409	275	262	-2.9922	0.000624922120970985	21054519	21074401	2.02547837576353e-07	22169951	22202315
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22200078	22263267	23	22	-4.4113	2.02547837576353e-07	22169951	22202315	3.88081170609919e-07	22252795	22387293
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22268552	22268552	1	0	NA	3.88081170609919e-07	22252795	22387293	NA	NA	NA
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22308420	22876519	45	42	-2.9221	NA	NA	NA	0.0194361070792634	22407622	22908342
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22877495	22930737	19	19	-3.8877	0.0194361070792634	22407622	22908342	2.41332785032499e-26	22924754	25737663
MSK_252152917555_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	82	-1.0113	2.41332785032499e-26	22924754	25737663	NA	NA	NA
