Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	924194	44	42	0.0274	NA	NA	NA	3.54116199490418e-05	896990	947337
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	926279	991862	21	19	0.4289	3.54116199490418e-05	896990	947337	7.96990877450521e-14	962722	998149
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	993566	72537426	27829	26680	0.0087	7.96990877450521e-14	962722	998149	0	72537426	72537426
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	2.9021	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	150839754	17560	16807	0.0019	0	72579311	72579311	1.64947939013254e-171	150839754	150839754
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150851439	7	6	-2.4758	1.64947939013254e-171	150839754	150839754	2.9420038074197e-75	150851439	150851439
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	150852858	1	0	NA	2.9420038074197e-75	150851439	150851439	NA	NA	NA
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150857070	151026228	77	74	-0.0053	NA	NA	NA	2.25896361856078e-16	151026228	151028700
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.8077	2.25896361856078e-16	151026228	151028700	1.08238079837383e-11	151033188	151038091
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	172591602	8772	8415	-4e-04	1.08238079837383e-11	151033188	151038091	8.50512382242759e-49	172591602	172591602
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	172592995	172624259	12	12	-0.9328	8.50512382242759e-49	172591602	172591602	3.86447940858886e-48	172624259	172624259
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	172625658	194978218	7193	6854	0.006	3.86447940858886e-48	172624259	172624259	3.11701697667031e-19	194977713	194978218
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195048208	7	7	-0.7792	3.11701697667031e-19	194977713	194978218	2.26686280712987e-18	195048208	195062793
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195062793	200598243	2160	2076	0.0029	2.26686280712987e-18	195048208	195062793	1.31037542321467e-12	200587846	200613454
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200600795	200665389	23	23	-0.3589	1.31037542321467e-12	200587846	200613454	5.24575210537302e-13	200649025	200676505
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200667381	200667381	1	0	NA	5.24575210537302e-13	200649025	200676505	NA	NA	NA
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200668993	246769018	17298	16617	0.0016	NA	NA	NA	7.23199032485297e-93	246769018	246794552
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246794552	246862029	27	25	-0.898	7.23199032485297e-93	246769018	246794552	1.40193021307268e-49	246860551	246863179
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246863179	247186514	98	93	-0.0217	1.40193021307268e-49	246860551	246863179	NA	NA	NA
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	8042298	2396	2282	0.0166	NA	NA	NA	2.56038645208431e-15	8038670	8042298
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	8045619	8053654	4	4	-0.8864	2.56038645208431e-15	8038670	8042298	2.41445135078005e-13	8053654	8053654
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	8058417	33076512	8476	8133	0.0024	2.41445135078005e-13	8053654	8053654	2.65192620159691e-138	33076512	33076512
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	-3.9506	2.65192620159691e-138	33076512	33076512	2.21118421210839e-169	33080437	33080437
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	34543992	644	620	-0.0062	2.21118421210839e-169	33080437	33080437	4.15375280011572e-79	34543992	34552935
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	18	0.9344	4.15375280011572e-79	34543992	34552935	5.39467925291554e-70	34582272	34589997
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	35821494	484	465	0.0021	5.39467925291554e-70	34582272	34589997	9.62662684485504e-14	35821494	35821494
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	-1.1811	9.62662684485504e-14	35821494	35821494	1.98513231092305e-12	35844884	35844884
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	52600588	6706	6428	-0.0017	1.98513231092305e-12	35844884	35844884	1.72717917670870e-11	52588009	52600588
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	1.7271791767087e-11	52588009	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	0.8016	NA	NA	NA	5.3112289490118e-11	52635695	52639605
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	76393140	8057	7722	0.0047	5.3112289490118e-11	52635695	52639605	3.21845472312060e-19	76393140	76393140
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	76401064	76441763	5	5	-0.9255	3.2184547231206e-19	76393140	76393140	2.77359720993564e-19	76441763	76441763
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	76450708	87149187	3094	2965	0.0057	2.77359720993564e-19	76441763	76441763	6.19083846208776e-13	86964156	87335913
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	87245647	88015932	20	20	0.3914	6.19083846208776e-13	86964156	87335913	5.92140124109985e-13	87926461	88080817
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	88038874	143359312	14073	13532	0.005	5.92140124109985e-13	87926461	88080817	4.64150496547968e-14	143359312	143360660
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	143360660	143363850	3	3	1.0417	4.64150496547968e-14	143359312	143360660	3.3150625618841e-15	143362092	143363850
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	143365718	146571330	1085	1041	-0.0053	3.3150625618841e-15	143362092	143363850	0	146571330	146571330
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-4.4872	0	146571330	146571330	0	146592775	146592775
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	209169252	20807	19949	-8e-04	0	146592775	146592775	4.1304449653708e-15	209169252	209171076
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	209171076	209180835	4	4	0.919	4.1304449653708e-15	209169252	209171076	2.54091899799396e-14	209177222	209183430
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	209183430	242689978	11938	11451	0.0061	2.54091899799396e-14	209177222	209183430	NA	NA	NA
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	163992903	53488	51186	0.003	NA	NA	NA	4.8699322608187e-98	163987457	163992903
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164107951	28	25	0.9239	4.8699322608187e-98	163987457	163992903	2.44048857171845e-98	164105613	164112873
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	192546280	9548	9174	0.0052	2.44048857171845e-98	164105613	164112873	1.01066549276116e-13	192546280	192546280
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192548135	192550989	3	3	-1.0062	1.01066549276116e-13	192546280	192546280	1.41431013072257e-13	192550989	192550989
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192552734	196822133	1581	1522	0.0017	1.41431013072257e-13	192550989	192550989	7.025807101154e-22	196810503	196904349
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196929826	21	21	-0.4811	7.025807101154e-22	196810503	196904349	1.56153734388133e-17	196928503	196943380
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196940125	199329592	963	919	-0.0034	1.56153734388133e-17	196928503	196943380	NA	NA	NA
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3268	0.0276	NA	NA	NA	5.09013965256989e-288	9815760	9815760
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.1952	5.09013965256989e-288	9815760	9815760	0	9842644	9842644
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	191133836	51763	49590	6e-04	0	9842644	9842644	NA	NA	NA
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	191153613	191153613	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	117408114	32594	31294	0.0037	NA	NA	NA	1.49550584138207e-187	117408114	117408114
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	117417457	117420898	2	2	-4.4699	1.49550584138207e-187	117408114	117408114	4.82607804839371e-187	117420898	117420898
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	117423638	180194323	21049	20184	0.007	4.82607804839371e-187	117420898	117420898	3.67537060272767e-18	180192214	180194323
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180342860	180362342	10	8	-0.7056	3.67537060272767e-18	180192214	180194323	6.72186907302375e-17	180362342	180364670
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180364670	180644810	111	107	0.0258	6.72186907302375e-17	180362342	180364670	NA	NA	NA
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	26811016	9366	8989	0.0022	NA	NA	NA	4.18221634155321e-16	26811016	26811016
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26849722	26861184	4	4	-0.9486	4.18221634155321e-16	26811016	26811016	8.3114141624136e-17	26861184	26861184
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26863540	29939288	1215	1171	0.0116	8.3114141624136e-17	26861184	26861184	3.15821488479258e-12	29935438	29980445
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29941766	29941766	1	0	NA	3.15821488479258e-12	29935438	29980445	NA	NA	NA
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29950805	30005338	15	14	-0.4324	NA	NA	NA	8.72569551994851e-11	29986370	30026699
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30010234	30010234	1	0	NA	8.72569551994851e-11	29986370	30026699	NA	NA	NA
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30021908	31389372	582	552	0.0018	NA	NA	NA	4.44588122476382e-11	31387708	31389372
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31390982	31418006	4	4	0.8142	4.44588122476382e-11	31387708	31389372	1.38025129168793e-11	31418006	31425113
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	32558677	489	472	0.0235	1.38025129168793e-11	31418006	31425113	8.34668371528043e-53	32558677	32564884
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32595402	7	7	1.3129	8.34668371528043e-53	32558677	32564884	4.91786526824234e-56	32590568	32595402
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	65767409	10706	10308	0.0035	4.91786526824234e-56	32590568	32595402	9.96190667146095e-104	65767409	65767409
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65769146	65771532	2	2	-3.3142	9.96190667146095e-104	65767409	65767409	7.01608623730329e-106	65771532	65771532
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65778663	70469990	1169	1112	0.0107	7.01608623730329e-106	65771532	65771532	1.98513317772164e-15	70469990	70469990
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	70471504	70474901	2	2	1.2942	1.98513317772164e-15	70469990	70469990	4.71310004756964e-15	70474901	70474901
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	70478723	72919733	964	920	-7e-04	4.71310004756964e-15	70474901	70474901	2.60345798934775e-13	72919733	72919733
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72920894	72924440	3	3	-1.0001	2.60345798934775e-13	72919733	72919733	2.1659444509077e-13	72924440	72924440
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72931542	139643729	21053	20129	-9e-04	2.1659444509077e-13	72924440	72924440	3.62102438971722e-21	139643729	139643729
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139645417	139648318	3	3	-1.2426	3.62102438971722e-21	139643729	139643729	4.63628136066618e-21	139648318	139648318
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139651247	165643653	8723	8346	0.0022	4.63628136066618e-21	139648318	139648318	2.95898523581765e-36	165643653	165643653
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.4067	2.95898523581765e-36	165643653	165643653	1.17350977602138e-32	165650610	165650610
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	168321288	998	952	0.0036	1.17350977602138e-32	165650610	165650610	3.48077613158878e-10	168313497	168321288
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	168324002	168327844	2	2	1.1268	3.48077613158878e-10	168313497	168321288	3.30169536291398e-10	168327844	168331501
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	168331501	170753106	804	775	0.0186	3.30169536291398e-10	168327844	168331501	NA	NA	NA
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	3598570	1264	1206	0.0267	NA	NA	NA	6.90067883249897e-159	3594334	3603515
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	3601653	3964343	164	161	0.5498	6.90067883249897e-159	3594334	3603515	4.58210377968596e-217	3961002	3968710
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	3966915	16135701	3960	3790	-0.0028	4.58210377968596e-217	3961002	3968710	1.08032632995889e-172	16135701	16135701
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-4.3378	1.08032632995889e-172	16135701	16135701	3.89807707198649e-176	16140018	16140018
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	64523575	14172	13641	0.0016	3.89807707198649e-176	16140018	16140018	2.44803482230187e-12	64523575	64523575
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64532019	64532949	2	2	-1.1809	2.44803482230187e-12	64523575	64523575	5.76781407112594e-12	64532949	64532949
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64534167	118611324	19701	18919	2e-04	5.76781407112594e-12	64532949	64532949	1.47117704530244e-14	118611324	118611324
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	1.0573	1.47117704530244e-14	118611324	118611324	2.31090682044577e-14	118620875	118620875
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	141409512	10534	10079	0.0027	2.31090682044577e-14	118620875	118620875	4.86442005306182e-15	141405145	141417702
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141410894	141443577	17	17	-0.4508	4.86442005306182e-15	141405145	141417702	2.50031774132451e-10	141435643	141452085
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141446728	141698634	115	109	-0.0024	2.50031774132451e-10	141435643	141452085	1.61859640035144e-43	141698634	141698634
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141700432	141714168	9	8	1.2641	1.61859640035144e-43	141698634	141698634	1.14062379067591e-59	141714168	141714168
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	142152205	167	162	-0.0267	1.14062379067591e-59	141714168	141714168	7.50007336395809e-06	142140540	142152205
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142156165	142166710	4	4	-0.5841	7.50007336395809e-06	142140540	142152205	0.0364741292095386	142166710	142166710
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142167901	142167908	2	2	-2.0498	0.0364741292095386	142166710	142166710	2.05595964257837e-31	142167908	142167908
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142176074	143503317	486	466	0.0035	2.05595964257837e-31	142167908	142167908	5.8743306196013e-13	143503317	143503317
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143582864	143584350	3	3	-1.0346	5.8743306196013e-13	143503317	143503317	8.89859159755791e-14	143584350	143584350
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143705425	158821263	6090	5816	0.0074	8.89859159755791e-14	143584350	143584350	NA	NA	NA
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	2234351	737	707	0.0303	NA	NA	NA	1.65676664211564e-14	2234351	2234351
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2242849	2251011	4	4	-0.9374	1.65676664211564e-14	2234351	2234351	5.36878627682421e-15	2251011	2251011
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2257255	18899949	5446	5199	9e-04	5.36878627682421e-15	2251011	2251011	4.52942363469112e-23	18899949	18899949
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	18901549	18908287	4	4	-1.1552	4.52942363469112e-23	18899949	18899949	4.94117126241795e-24	18908287	18908287
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	18910176	146264846	38375	36778	0.0028	4.94117126241795e-24	18908287	18908287	NA	NA	NA
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	70926188	13072	12520	-3e-04	NA	NA	NA	1.07782202888748e-41	70926188	70926188
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	2.1006	1.07782202888748e-41	70926188	70926188	5.22317124345538e-40	70930528	70930528
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	123448269	17903	17201	-0.0013	5.22317124345538e-40	70930528	70930528	3.56158273854826e-14	123448269	123449399
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	123449399	123453227	3	3	1.0397	3.56158273854826e-14	123448269	123449399	7.67556406384196e-13	123451454	123455396
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	123455396	134932980	4985	4755	0.0081	7.67556406384196e-13	123451454	123455396	1.11231392887397e-13	134932959	134932980
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	134938349	134946471	4	4	-0.9121	1.11231392887397e-13	134932959	134932980	1.54627953071440e-13	134946471	134950600
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	134950600	137352394	870	840	0.0288	1.5462795307144e-13	134946471	134950600	6.87665853348957e-14	137352394	137352394
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.3715	6.87665853348957e-14	137352394	137352394	9.85279452439025e-14	137356880	137356880
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1061	0.0159	9.85279452439025e-14	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	8100859	3024	2894	0.0015	NA	NA	NA	3.36618890646557e-12	8099179	8100859
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	8102498	8106159	3	3	-0.9488	3.36618890646557e-12	8099179	8100859	9.20892282539806e-12	8106159	8106159
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	8108341	70949263	18648	17914	-0.0044	9.20892282539806e-12	8106159	8106159	9.81356210212118e-11	70947915	70949263
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70952973	70960187	4	4	-0.7883	9.81356210212118e-11	70947915	70949263	9.0510165933056e-11	70960187	70964344
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70964344	135285645	23129	22173	0.0062	9.0510165933056e-11	70960187	70964344	NA	NA	NA
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	7762277	3016	2905	0.0113	NA	NA	NA	1.87558041718776e-24	7762277	7762277
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7771593	7783344	7	6	-1.0065	1.87558041718776e-24	7762277	7762277	5.35347510219341e-28	7783344	7783344
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7783492	134450318	42281	40533	0.008	5.35347510219341e-28	7783344	7783344	NA	NA	NA
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	11395862	4406	4226	0.0052	NA	NA	NA	4.25482526881195e-20	11393473	11395862
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11435643	6	6	-0.8881	4.25482526881195e-20	11393473	11395862	2.20480766992781e-22	11435643	11435643
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	19361660	2758	2640	-0.0021	2.20480766992781e-22	11435643	11435643	6.41442151561397e-66	19358397	19363584
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	19363584	19469446	54	50	0.5237	6.41442151561397e-66	19358397	19363584	4.80593665427467e-63	19468110	19481947
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	19471947	19476466	2	0	NA	4.80593665427467e-63	19468110	19481947	NA	NA	NA
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	19479825	80131015	19865	19062	-5e-04	NA	NA	NA	9.49945410159386e-14	80131015	80131015
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80132658	80134890	2	2	1.2517	9.49945410159386e-14	80131015	80131015	3.30417187023262e-14	80134890	80134890
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80136355	99460566	5888	5659	5e-04	3.30417187023262e-14	80134890	80134890	5.41915891717326e-13	99460566	99460566
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	99462740	99468590	3	3	-0.9791	5.41915891717326e-13	99460566	99460566	1.06330567083498e-12	99468590	99468590
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	99470406	130694393	11531	11051	0.0062	1.06330567083498e-12	99468590	99468590	2.70811331513657e-13	130694393	130694393
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	1.2387	2.70811331513657e-13	130694393	130694393	2.86180531274599e-13	130701040	130701040
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	615	0.0089	2.86180531274599e-13	130701040	130701040	NA	NA	NA
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	49964838	12219	11745	-0.0012	NA	NA	NA	2.37050220959590e-15	49964838	49964838
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	1.3389	2.3705022095959e-15	49964838	49964838	6.75913386244119e-15	49971732	49971732
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56650373	1804	1721	0.0115	6.75913386244119e-15	49971732	49971732	1.16989001070892e-47	56646284	56650373
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56657371	1	0	NA	1.16989001070892e-47	56646284	56650373	NA	NA	NA
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56658479	56685341	14	13	0.9329	NA	NA	NA	8.80178860074264e-53	56685341	56686863
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	89659397	8253	7910	0.0047	8.80178860074264e-53	56685341	56686863	2.99915123158678e-84	89659397	89659397
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	-2.9769	2.99915123158678e-84	89659397	89659397	1.24784466651129e-82	89662326	89662326
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	100690991	4785	4589	0.0012	1.24784466651129e-82	89662326	89662326	3.52543710100647e-11	100690991	100690991
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	1.1221	3.52543710100647e-11	100690991	100690991	1.67657053931698e-10	100693892	100695073
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4380	0.0059	1.67657053931698e-10	100693892	100695073	NA	NA	NA
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18544772	6	6	-0.3092	NA	NA	NA	0.000238597378538237	18527871	19287128
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	19494416	54	49	-0.762	0.000238597378538237	18527871	19287128	2.99245461408874e-130	19492531	19497023
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	40676611	7588	7308	-0.0046	2.99245461408874e-130	19492531	19497023	0	40676611	40676611
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40726930	8	8	-3.3421	0	40676611	40676611	0	40726930	40726930
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40741934	69086125	9972	9521	-9e-04	0	40726930	40726930	1.07464456615986e-17	69086125	69086125
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69092211	3	3	1.1393	1.07464456615986e-17	69086125	69086125	2.85914700724494e-16	69092211	69092211
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69093444	105681007	14025	13454	0.0068	2.85914700724494e-16	69092211	69092211	5.30028608698345e-41	105625010	105741049
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105703388	105917286	63	61	0.4017	5.30028608698345e-41	105625010	105741049	0.00755922556338684	105872360	105919618
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105919618	105946993	6	6	-0.0701	0.00755922556338684	105872360	105919618	5.22787667859586e-07	105946993	105951399
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105948347	106002179	18	18	-0.6781	5.22787667859586e-07	105946993	105951399	5.85855468070299e-32	105998412	106013552
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106358491	142	138	0.0418	5.85855468070299e-32	105998412	106013552	NA	NA	NA
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18362555	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18427151	18452491	4	4	0.1168	NA	NA	NA	0.00113434169096183	18432558	18692865
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	18837737	10	9	-0.2672	0.00113434169096183	18432558	18692865	5.83020158635764e-12	18837737	18837737
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18842565	18848213	4	4	-0.8146	5.83020158635764e-12	18837737	18837737	3.37524747862716e-17	18848213	18848213
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18851513	19109124	12	12	-0.2811	3.37524747862716e-17	18848213	18848213	0.00289635639929898	18886649	19150242
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19117783	98424064	30458	29162	0	0.00289635639929898	18886649	19150242	1.08821339181171e-29	98424064	98424064
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98425409	98441467	7	7	-0.9807	1.08821339181171e-29	98424064	98424064	3.11148855338568e-27	98441467	98441467
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98447755	100298352	826	777	0.0109	3.11148855338568e-27	98441467	98441467	NA	NA	NA
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	29828435	9798	9427	0.0059	NA	NA	NA	3.86999225602331e-10	29828435	29828435
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	29831817	29831884	2	2	-1.1152	3.86999225602331e-10	29828435	29828435	2.68944971909394e-11	29831884	29831884
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	29836930	57203733	5109	4903	0.0075	2.68944971909394e-11	29831884	29831884	3.15333119977723e-11	57203733	57203733
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	1.1267	3.15333119977723e-11	57203733	57203733	1.54452115934241e-11	57206772	57208375
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	75093957	5612	5387	0.0044	1.54452115934241e-11	57206772	57208375	2.68442377171818e-77	75093957	75093957
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	2.3222	2.68442377171818e-77	75093957	75093957	7.10522871231371e-71	75100865	75100865
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76922411	608	586	-0.0093	7.10522871231371e-71	75100865	75100865	1.34944305879851e-30	76922411	76929598
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76923844	76940218	10	9	0.8922	1.34944305879851e-30	76922411	76929598	3.43218037807486e-29	76937156	76942679
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4341	0.0089	3.43218037807486e-29	76937156	76942679	NA	NA	NA
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	36673853	13871	13262	0.0059	NA	NA	NA	9.14067612070522e-17	36673853	36673853
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	4	-0.982	9.14067612070522e-17	36673853	36673853	3.82519811043397e-17	36683509	36683509
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	41519702	2012	1929	0.007	3.82519811043397e-17	36683509	36683509	2.92596681621501e-51	41518222	41519702
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41566540	21	20	-0.7528	2.92596681621501e-51	41518222	41519702	1.28239490861485e-07	41555295	41573295
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41648545	38	37	-0.414	1.28239490861485e-07	41555295	41573295	6.87609010948303e-29	41644148	41700762
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41652861	47638959	2400	2303	0.0062	6.87609010948303e-29	41644148	41700762	2.30205500898779e-33	47626286	47651362
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47651362	47874537	30	28	0.5262	2.30205500898779e-33	47626286	47651362	4.02591515151357e-33	47869349	47884799
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47881039	60986238	4461	4275	0.0024	4.02591515151357e-33	47869349	47884799	1.71274335815773e-20	60986238	60986238
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	60988534	60989697	2	2	1.551	1.71274335815773e-20	60986238	60986238	2.08310431370733e-19	60989697	60989697
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	60991800	78653545	6794	6540	0.0119	2.08310431370733e-19	60989697	60989697	NA	NA	NA
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22044	1e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	210395	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	216768	1398325	491	472	0.0119	NA	NA	NA	6.26115738577727e-14	1398325	1398325
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.3223	6.26115738577727e-14	1398325	1398325	5.71682741898256e-14	1400840	1400840
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	63787171	22564	21602	1e-04	5.71682741898256e-14	1400840	1400840	NA	NA	NA
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	63788698	63788698	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	563	0.009	NA	NA	NA	8.2892650664605e-27	1499421	1506379
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	0.8255	8.2892650664605e-27	1499421	1506379	1.10698311642698e-29	1532433	1544485
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	20106	0.0045	1.10698311642698e-29	1532433	1544485	NA	NA	NA
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12904	0.003	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	22667608	2982	2853	0.0161	NA	NA	NA	0	22667608	22679305
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22720195	20	20	-2.429	0	22667608	22679305	0	22715919	22720195
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22721042	32110063	5044	4834	0.0064	0	22715919	22720195	1.3257910122539e-09	32110063	32110063
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	32110939	32112051	2	2	-1.0611	1.3257910122539e-09	32110063	32110063	1.66250412247594e-10	32112051	32112051
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	32114341	35472378	1503	1441	0.0123	1.66250412247594e-10	32112051	32112051	1.33408303572884e-18	35472378	35472378
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-1.4135	1.33408303572884e-18	35472378	35472378	2.82111510570586e-16	35476942	35476942
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6684	0.0173	2.82111510570586e-16	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	-0.0776	NA	NA	NA	2.35807032765723e-10	94062	95819
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	-1.4396	2.35807032765723e-10	94062	95819	2.09796934776144e-56	104486	104732
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	2708291	1780	1707	-0.0114	2.09796934776144e-56	104486	104732	0	2708291	2711273
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	55640899	18791	17993	0.943	0	2708291	2711273	4.76894675611898e-16	55640899	55640899
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	55642060	55643277	2	2	2.4002	4.76894675611898e-16	55640899	55640899	2.43781714257547e-11	55643277	55643277
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	55650356	104114422	9993	9538	0.9365	2.43781714257547e-11	55643277	55643277	4.29272636846886e-14	104114422	104114422
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	104115936	104117277	2	2	-0.6858	4.29272636846886e-14	104114422	104114422	3.05545447260730e-19	104117277	104117277
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	104119118	154038318	16213	15498	0.9424	3.0554544726073e-19	104117277	104117277	1.08106085492658e-29	154037006	154038318
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154078819	11	10	1.9691	1.08106085492658e-29	154037006	154038318	1.59881052778592e-28	154078819	154079002
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154582414	122	120	0.9385	1.59881052778592e-28	154078819	154079002	6.35035248851064e-214	154578922	154582414
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	191	-0.0076	6.35035248851064e-214	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3219200	122	119	-3.7319	NA	NA	NA	7.98239092098348e-20	2973379	3223585
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3223585	5593746	18	18	-1.1281	7.98239092098348e-20	2973379	3223585	8.18322931920117e-10	5422507	6711090
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6953343	118	115	-3.2547	8.18322931920117e-10	5422507	6711090	3.78356359590140e-05	6907614	7029972
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6954864	7653082	216	210	-2.4818	3.7835635959014e-05	6907614	7029972	1.71862211835633e-07	7625006	7663037
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7709619	35	34	-3.9405	1.71862211835633e-07	7625006	7663037	2.6746902813235e-07	7701303	7726921
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	8016395	90	86	-2.5034	2.6746902813235e-07	7701303	7726921	3.77535630185474e-11	7964586	8048263
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8036254	8245608	56	54	-3.931	3.77535630185474e-11	7964586	8048263	4.89072076004329e-05	8195174	8348968
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8251785	8956787	199	195	-3.1157	4.89072076004329e-05	8195174	8348968	1.20465441312384e-07	8928870	8963617
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8958121	9119912	24	24	-4.5624	1.20465441312384e-07	8928870	8963617	0.00136098758383942	9087629	10025706
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9126602	10515697	88	82	-3.3796	0.00136098758383942	9087629	10025706	2.99084253951891e-16	10511255	10535786
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	11673476	17	17	-0.5771	2.99084253951891e-16	10511255	10535786	1.00802309126732e-20	11660512	11698871
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	12537944	12	12	-3.6978	1.00802309126732e-20	11660512	11698871	3.0818175979613e-06	12533900	12550566
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12541506	12682301	55	51	-1.7416	3.0818175979613e-06	12533900	12550566	1.06175202330173e-06	12646477	12696242
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12772155	14	14	-3.6429	1.06175202330173e-06	12646477	12696242	2.31583548542359e-09	12741404	12792780
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12776542	12776542	1	0	NA	2.31583548542359e-09	12741404	12792780	NA	NA	NA
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12786515	12919413	36	35	-2.116	NA	NA	NA	0.000952582903733526	12901857	12924438
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12921790	12926941	5	5	-3.4871	0.000952582903733526	12901857	12924438	3.68615780113644e-06	12924438	12940175
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12928074	13050965	48	44	-1.3286	3.68615780113644e-06	12924438	12940175	6.29666622151384e-10	13040293	13050965
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13052633	13062151	7	7	-3.5751	6.29666622151384e-10	13040293	13050965	3.8404646125404e-12	13062151	13066543
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13066543	13129843	25	25	-1.3899	3.8404646125404e-12	13062151	13066543	2.35160505844033e-21	13128515	13137597
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	14342834	408	398	-3.6373	2.35160505844033e-21	13128515	13137597	4.39398750770916e-22	14323815	14370346
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14700040	145	137	-2.4754	4.39398750770916e-22	14323815	14370346	5.71034582663617e-07	14581797	14721033
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14701706	15137457	89	87	-3.4489	5.71034582663617e-07	14581797	14721033	0.000222729878383077	15112995	15137457
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15139441	15139441	1	0	NA	0.000222729878383077	15112995	15137457	NA	NA	NA
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15140278	15149506	7	7	-1.4315	NA	NA	NA	0.379715468226914	15141311	15161075
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15152354	15165820	10	10	-2.1987	0.379715468226914	15141311	15161075	0.0105815305253302	15155598	15298885
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15169415	15915466	287	275	-3.2632	0.0105815305253302	15155598	15298885	0.00253164904948029	15564959	16078189
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16387273	162	153	-2.7495	0.00253164904948029	15564959	16078189	4.11096490721268e-12	16330184	16413874
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	16656177	38	35	-4.4422	4.11096490721268e-12	16330184	16413874	7.35008971076875e-05	16607621	16723892
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16659030	21036411	632	600	-3.4435	7.35008971076875e-05	16607621	16723892	3.52709164961088e-05	21018574	21036411
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21036503	21054519	7	7	-1.1744	3.52709164961088e-05	21018574	21036411	7.66359706720106e-05	21054519	21061132
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	22181855	273	262	-3.3673	7.66359706720106e-05	21054519	21061132	3.99828114451168e-08	22166564	22182080
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22182080	22261337	24	24	-4.8987	3.99828114451168e-08	22166564	22182080	5.41984809361373e-06	22252446	22395796
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22263267	22930737	66	60	-3.5386	5.41984809361373e-06	22252446	22395796	1.7694866808401e-25	22923722	26871442
MSK_252152917556_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	82	-1.28	1.7694866808401e-25	22923722	26871442	NA	NA	NA
