Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	9242021	3009	2801	-0.009	NA	NA	NA	3.04760873736795e-43	9237111	9246530
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	9244452	9325536	39	37	0.4781	3.04760873736795e-43	9237111	9246530	1.80346326888191e-40	9322177	9328245
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	9326760	16713074	2734	2516	0.0186	1.80346326888191e-40	9322177	9328245	9.612876769951e-08	16660353	16713074
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16799711	16926444	11	9	-0.3965	9.612876769951e-08	16660353	16713074	3.82279932564551e-15	16926444	17086698
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16961001	24391166	3041	2803	0.0049	3.82279932564551e-15	16926444	17086698	7.60835676976247e-13	24389046	24391166
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	24394076	24395691	2	2	-0.8507	7.60835676976247e-13	24389046	24391166	5.52789452695765e-18	24395691	24397212
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	24397212	34869589	4058	3749	0.0316	5.52789452695765e-18	24395691	24397212	2.04082522856860e-20	34859068	34869589
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34876833	34883375	4	3	-0.8432	2.0408252285686e-20	34859068	34869589	3.25289917924657e-22	34883375	34884849
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34884849	72525842	14990	13833	0.0029	3.25289917924657e-22	34883375	34884849	2.67190742390910e-23	72524413	72533804
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72528790	72536231	5	5	-0.5952	2.6719074239091e-23	72524413	72533804	1.54595081660983e-35	72536231	72536231
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72537426	72537426	1	0	NA	1.54595081660983e-35	72536231	72536231	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	11	1.8058	NA	NA	NA	2.74751692004026e-218	72579311	72579311
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	97633142	8191	7590	-0.0021	2.74751692004026e-218	72579311	72579311	2.03509893728054e-08	97633142	97633142
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	97635367	97644885	2	2	-0.8651	2.03509893728054e-08	97633142	97633142	7.09513765767806e-13	97644885	97647706
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	97647706	150823073	9364	8674	0.0134	7.09513765767806e-13	97644885	97647706	1.38716777998319e-48	150823073	150823073
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150851439	10	9	0.9785	1.38716777998319e-48	150823073	150823073	5.42105162924733e-47	150851439	150851439
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	161104752	4386	4030	0.028	5.42105162924733e-47	150851439	150851439	3.40558736958433e-09	161099582	161104752
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161104791	161108722	2	2	-0.7425	3.40558736958433e-09	161099582	161104752	1.51524018520089e-39	161108722	161110682
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161110682	194978218	11671	10785	0.0099	1.51524018520089e-39	161108722	161110682	1.47240543865434e-37	194977713	195048208
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195009358	1	0	NA	1.47240543865434e-37	194977713	195048208	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195011344	195095156	10	9	-0.5466	NA	NA	NA	5.71362404111575e-17	195048208	195097118
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195097118	200613454	2161	1991	0.0294	5.71362404111575e-17	195048208	195097118	3.01633657208557e-14	200596027	200618814
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200616638	200672373	22	21	-0.3154	3.01633657208557e-14	200596027	200618814	6.07058313896921e-14	200668993	200689399
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200673525	203761526	1357	1258	0.0199	6.07058313896921e-14	200668993	200689399	3.90685955282641e-07	203755007	203769129
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	203764048	203779775	9	8	-0.3731	3.90685955282641e-07	203755007	203769129	5.70336302905513e-07	203774063	203782573
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	203781229	211070042	2685	2494	0.0209	5.70336302905513e-07	203774063	203782573	1.47701140232062e-17	211070042	211070042
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	211072658	211079988	3	3	-0.977	1.47701140232062e-17	211070042	211070042	1.52540452250730e-15	211079988	211079988
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	211082419	243702540	11966	11048	-0.018	1.5254045225073e-15	211079988	211079988	4.36859331231296e-17	243700961	243702540
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	243703653	243703653	1	0	NA	4.36859331231296e-17	243700961	243702540	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	243704923	243715818	7	6	-0.7275	NA	NA	NA	1.02809154064288e-16	243715818	243717078
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	243717078	246674083	1250	1151	-0.0163	1.02809154064288e-16	243715818	243717078	9.6209608080849e-08	246643175	246691241
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246676851	246713340	10	10	0.3663	9.6209608080849e-08	246643175	246691241	0.00133656673694672	246696388	246713340
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246738832	246769018	7	7	-0.0961	0.00133656673694672	246696388	246713340	7.49322136929314e-07	246755298	246805521
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246794552	246875016	30	30	-0.6976	7.49322136929314e-07	246755298	246805521	7.90944785744812e-48	246863179	246878405
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246878405	247186514	95	87	-0.0069	7.90944785744812e-48	246863179	246878405	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	33076512	10876	10043	-0.0125	NA	NA	NA	2.43809531101041e-56	33076512	33076512
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	-2.2417	2.43809531101041e-56	33076512	33076512	3.39697197642779e-62	33080437	33080437
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	66357387	12416	11436	0.0111	3.39697197642779e-62	33080437	33080437	6.47141849317671e-22	66357387	66357387
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	1.2046	6.47141849317671e-22	66357387	66357387	6.01883503879908e-27	66360747	66360747
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	88910647	6929	6400	-0.0101	6.01883503879908e-27	66360747	66360747	2.07223176793012e-52	88910647	88916734
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	88914081	88946718	16	15	-0.7977	2.07223176793012e-52	88910647	88916734	0.0138869961464588	88920710	88972855
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	88948348	89093646	48	45	-1.1111	0.0138869961464588	88920710	88972855	4.18350836051981e-08	89043940	89208480
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89208480	89315203	18	17	-0.6349	4.18350836051981e-08	89043940	89208480	4.88866458495040e-06	89275085	89391042
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89319930	91155301	58	55	-0.3463	4.8886645849504e-06	89275085	89391042	4.35824212882265e-40	91133575	91179406
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	91158269	98957228	1180	1089	0.0068	4.35824212882265e-40	91133575	91179406	2.66616155808893e-10	98950658	98966934
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	98966934	98981189	7	7	0.5029	2.66616155808893e-10	98950658	98966934	6.25706953182568e-11	98980920	99000972
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	98993051	142039625	12037	11136	-0.0299	6.25706953182568e-11	98980920	99000972	5.4363638724993e-13	142039625	142039625
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	142041792	142043930	2	2	-1.1107	5.4363638724993e-13	142039625	142039625	2.51106253235258e-16	142043930	142043930
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	142051022	146571330	1483	1380	0.016	2.51106253235258e-16	142043930	142043930	3.86217155385218e-32	146571330	146571330
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	3	1.2971	3.86217155385218e-32	146571330	146571330	6.11881506479029e-30	146592775	146592775
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	179767214	11204	10315	0.0058	6.11881506479029e-30	146592775	146592775	4.47584171434683e-11	179764646	179767214
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179777850	179778919	3	3	-0.5487	4.47584171434683e-11	179764646	179767214	2.38957922464116e-05	179778919	179791155
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791128	202952517	7120	6532	0.016	2.38957922464116e-05	179778919	179791155	9.36680880020221e-58	202951146	202954912
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	202954912	202993875	19	15	-0.7729	9.36680880020221e-58	202951146	202954912	2.54698943493669e-54	202992692	202993875
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	202996204	212890878	3711	3434	4e-04	2.54698943493669e-54	202992692	202993875	2.51426190412888e-11	212889077	212892884
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212892884	212898875	4	4	-0.6102	2.51426190412888e-11	212889077	212892884	2.91498536101094e-23	212896080	212900857
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212900857	242501239	10621	9833	-0.0037	2.91498536101094e-23	212896080	212900857	9.06251169613478e-146	242495169	242514593
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242505261	242505261	1	0	NA	9.06251169613478e-146	242495169	242514593	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242506262	242689978	66	60	-0.6471	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	116137442	37232	34365	-0.0081	NA	NA	NA	1.56437789874176e-47	116137442	116137442
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	116140997	116143347	3	3	-0.9807	1.56437789874176e-47	116137442	116137442	1.42987368311189e-16	116143347	116143347
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	116146946	116146946	1	0	NA	1.42987368311189e-16	116143347	116143347	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	116155373	194358882	26411	24421	7e-04	NA	NA	NA	1.51041147333161e-111	194358882	194358882
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194360242	194360242	1	0	NA	1.51041147333161e-111	194358882	194358882	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194362272	194366950	4	4	-2.1558	NA	NA	NA	3.95734775172397e-109	194366950	194366950
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196942158	1019	942	-1e-04	3.95734775172397e-109	194366950	194366950	1.24387436410178e-07	196929826	196942158
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196943380	196950095	4	4	0.5742	1.24387436410178e-07	196929826	196942158	2.57759472911688e-05	196950095	196957322
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196952514	199329592	957	886	0.052	2.57759472911688e-05	196950095	196957322	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9792028	3391	3142	-0.0157	NA	NA	NA	2.11218159397829e-08	9775301	9792028
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9800777	9832823	5	4	0.6207	2.11218159397829e-08	9775301	9792028	5.85744149633143e-10	9832823	9853710
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9842644	9842644	1	0	NA	5.85744149633143e-10	9832823	9853710	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	34445002	6167	5688	-0.0343	NA	NA	NA	2.18361420635319e-08	34433787	34445002
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	-0.5277	2.18361420635319e-08	34433787	34445002	1.82272669893275e-31	34491115	34506297
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	63346612	7653	7087	0.0025	1.82272669893275e-31	34491115	34506297	1.03322134395981e-33	63346612	63346612
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	63357811	63358506	2	2	-1.1179	1.03322134395981e-33	63346612	63346612	5.74112796749984e-14	63358506	63358506
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	63360367	68905670	1208	1125	-0.0108	5.74112796749984e-14	63358506	63358506	1.41054185242188e-42	68901210	69069651
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	0.7189	1.41054185242188e-42	68901210	69069651	3.57053561857615e-44	69163312	69165814
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	69643272	1	0	NA	3.57053561857615e-44	69163312	69165814	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69656183	173224400	31192	28842	-7e-04	NA	NA	NA	1.59020086815294e-101	173224400	173224400
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-2.8689	1.59020086815294e-101	173224400	173224400	2.00012803792156e-108	173228860	173228860
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173660684	193	177	-0.0047	2.00012803792156e-108	173228860	173228860	1.13333309174585e-46	173660684	173660684
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	1.8701	1.13333309174585e-46	173660684	173660684	2.27045891810623e-44	173666072	173666072
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	187330240	4081	3742	-0.018	2.27045891810623e-44	173666072	173666072	1.17908936893548e-39	187330240	187330240
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	1.77	1.17908936893548e-39	187330240	187330240	7.1962205006484e-40	187333619	187333619
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1155	-0.0964	7.1962205006484e-40	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	54625577	14497	13348	-0.028	NA	NA	NA	1.13249669797307e-36	54617997	54634239
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	54627186	54653868	11	11	0.3041	1.13249669797307e-36	54617997	54634239	5.76699296290066e-06	54642295	54666090
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	54655801	55582377	408	371	0.0158	5.76699296290066e-06	54642295	54666090	2.38277987670648e-06	55578882	55582377
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	55584546	55591133	5	4	0.4996	2.38277987670648e-06	55578882	55582377	3.17913697082492e-06	55591133	55594311
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	55592605	140203440	25159	23210	0.0141	3.17913697082492e-06	55591133	55594311	1.44230175592668e-08	140198797	140203440
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140204823	140216524	7	7	-0.4559	1.44230175592668e-08	140198797	140203440	1.94720130245257e-08	140216524	140224323
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	155405839	5396	4971	-0.0026	1.94720130245257e-08	140216524	140224323	3.17342588930331e-09	155404062	155405839
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155411053	155421443	5	5	0.5566	3.17342588930331e-09	155404062	155405839	7.50208180724995e-09	155421443	155427637
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155427589	180342860	8158	7567	-0.0076	7.50208180724995e-09	155421443	155427637	9.74397820527702e-122	180342860	180342860
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180362342	9	5	-2.0333	9.74397820527702e-122	180342860	180342860	1.79271276463554e-80	180362342	180362342
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180364670	180644810	111	102	0.0222	1.79271276463554e-80	180362342	180362342	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	234115	53	50	0.0462	NA	NA	NA	2.83332145038952e-10	228968	249566
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	236535	334423	53	51	-0.2301	2.83332145038952e-10	228968	249566	1.06781191197159e-46	311748	348891
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	335212	165643653	54203	49996	7e-04	1.06781191197159e-46	311748	348891	2.18343231269191e-52	165643653	165643653
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	-1.4475	2.18343231269191e-52	165643653	165643653	1.7331925446836e-41	165650610	165650610
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1672	-0.0456	1.7331925446836e-41	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	16135701	5388	4992	-0.0094	NA	NA	NA	6.3960555531744e-48	16135701	16135701
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-2.0511	6.3960555531744e-48	16135701	16135701	3.31603248407116e-50	16140018	16140018
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	38270942	8214	7579	-0.0085	3.31603248407116e-50	16140018	16140018	9.58149270599472e-08	38238549	38285237
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38274436	38340009	36	36	0.1875	9.58149270599472e-08	38238549	38285237	2.97999239870115e-12	38330907	38381921
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38341239	64523575	5922	5463	-0.0259	2.97999239870115e-12	38330907	38381921	1.14452667557984e-10	64515225	64523575
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64532019	64532949	2	2	-0.8095	1.14452667557984e-10	64515225	64523575	4.55699608167233e-15	64532949	64534167
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64534167	103863630	12979	11914	-0.0019	4.55699608167233e-15	64532949	64534167	2.89034669458045e-14	103863630	103863630
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	103868277	103868375	2	2	-0.8636	2.89034669458045e-14	103863630	103863630	2.02883480602578e-08	103868375	103870016
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	103870016	109967918	2722	2503	0.0154	2.02883480602578e-08	103868375	103870016	8.6161106766133e-11	109967918	109967918
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109970524	109974402	2	2	-0.9737	8.6161106766133e-11	109967918	109967918	2.14499634262256e-10	109974402	109974402
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109976628	141410894	14534	13399	-0.0018	2.14499634262256e-10	109974402	109974402	4.08496231230709e-11	141406414	141417702
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141413352	1	0	NA	4.08496231230709e-11	141406414	141417702	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141414719	141438504	12	12	0.4078	NA	NA	NA	6.91593047809557e-09	141432778	141446728
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	142031323	256	238	0.0144	6.91593047809557e-09	141432778	141446728	1.20457600970352e-12	142002912	142046351
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142033620	142194531	50	49	0.2589	1.20457600970352e-12	142002912	142046351	2.02648996221584e-21	142187073	142217406
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142196011	142196011	1	0	NA	2.02648996221584e-21	142187073	142217406	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142198376	158821263	6572	6058	-0.0276	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	2234351	737	688	-0.0927	NA	NA	NA	1.87056069020750e-18	2234351	2234351
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2242849	2251011	4	4	-1.0526	1.8705606902075e-18	2234351	2234351	1.12577618752868e-27	2251011	2251011
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2257255	25120552	7418	6849	-0.0416	1.12577618752868e-27	2251011	2251011	2.50265528591213e-25	25120552	25120552
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	2.50265528591213e-25	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	1.1637	NA	NA	NA	1.32261144368768e-15	25125700	25125700
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	32797545	3031	2790	-0.0179	1.32261144368768e-15	25125700	25125700	4.00640322617656e-10	32797545	32797545
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32800775	32800775	1	0	NA	4.00640322617656e-10	32797545	32797545	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32805686	32808049	2	2	0.9396	NA	NA	NA	1.64581024664908e-17	32808049	32808049
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32812909	51191560	4116	3777	-0.0111	1.64581024664908e-17	32808049	32808049	4.40014636525921e-18	51189068	51196227
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51193977	51193977	1	0	NA	4.40014636525921e-18	51189068	51196227	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51196227	51200291	3	3	-0.7085	NA	NA	NA	2.41922082310781e-27	51198463	51204788
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51202490	51202490	1	0	NA	2.41922082310781e-27	51198463	51204788	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51204788	144968840	28796	26534	-0.0068	NA	NA	NA	8.9083357989107e-27	144968042	144968840
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144970607	144970777	2	2	0.8769	8.9083357989107e-27	144968042	144968840	4.77380726115282e-08	144970777	144970777
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144972090	146253929	450	419	0.0092	4.77380726115282e-08	144970777	144970777	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	146264846	146264846	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	116124007	28542	26264	-0.0128	NA	NA	NA	4.28609270198171e-28	116124007	116124007
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-1.125	4.28609270198171e-28	116124007	116124007	3.55911353005057e-18	116130333	116130333
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	122794657	2146	1990	-0.0483	3.55911353005057e-18	116130333	116130333	1.83010226116711e-23	122784809	122797092
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	122795834	122839006	22	20	0.2646	1.83010226116711e-23	122784809	122797092	1.63238114636475e-06	122832223	122862706
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	122840734	129499038	2927	2661	0.0204	1.63238114636475e-06	122832223	122862706	1.45393807435151e-08	129495684	129499038
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	129500901	129500901	1	0	NA	1.45393807435151e-08	129495684	129499038	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	129504664	129506210	2	2	-0.8565	NA	NA	NA	3.60224055515836e-07	129506210	129512406
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	129508476	129510647	2	0	NA	3.60224055515836e-07	129506210	129512406	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	129512406	140145632	4299	3969	5e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	140145683	140145683	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	13553503	4682	4332	-0.01	NA	NA	NA	1.58115016030659e-14	13551930	13553503
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13555034	13556315	2	2	-0.8856	1.58115016030659e-14	13551930	13553503	1.18828652672956e-08	13556315	13556315
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13557998	13557998	1	0	NA	1.18828652672956e-08	13556315	13556315	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13559717	27038538	5044	4649	-0.0207	NA	NA	NA	5.27125120513315e-20	27038538	27038538
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	1.2702	5.27125120513315e-20	27038538	27038538	1.01067870115805e-18	27041812	27041812
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	37328178	3451	3185	-0.021	1.01067870115805e-18	27041812	27041812	1.87293369354136e-10	37319033	37349933
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	37332771	37428354	16	14	0.3359	1.87293369354136e-10	37319033	37349933	2.24709983968345e-09	37349933	37449758
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	37434180	53683740	3104	2875	-0.0166	2.24709983968345e-09	37349933	37449758	2.18679324148486e-10	53679935	53683740
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53686515	53687880	2	2	0.7441	2.18679324148486e-10	53679935	53683740	1.90727157690773e-11	53687880	53689554
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53689554	70949263	5371	4979	-0.0073	1.90727157690773e-11	53687880	53689554	1.01520335871438e-10	70947915	70949263
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70952973	70960187	4	3	-0.8028	1.01520335871438e-10	70947915	70949263	3.86941901127003e-16	70960187	70960187
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70964344	112707562	14991	13891	0.0079	3.86941901127003e-16	70960187	70960187	1.13738434526044e-21	112676344	112718154
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	112708461	112840909	74	69	0.2008	1.13738434526044e-21	112676344	112718154	1.90453355180694e-20	112822710	112857901
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	112843701	127566573	5347	4960	-0.0273	1.90453355180694e-20	112822710	112857901	1.24298448284083e-08	127556450	127568592
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127568592	127592138	12	11	-0.4051	1.24298448284083e-08	127556450	127568592	2.61094687193956e-06	127584239	127612803
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127598425	134739406	2494	2292	-0.0808	2.61094687193956e-06	127584239	127612803	2.37309870303542e-14	134739406	134739406
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	134740920	134743423	2	2	-1.2031	2.37309870303542e-14	134739406	134739406	7.151963148798e-12	134743423	134743423
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	134746574	135285645	209	192	-0.0453	7.151963148798e-12	134743423	134743423	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1647	-0.0072	NA	NA	NA	3.51666379587448e-207	4923300	4923300
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-2.7222	3.51666379587448e-207	4923300	4923300	9.16446374185911e-155	4932214	4932214
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	5741031	361	328	-0.0057	9.1644637418591e-155	4932214	4932214	1.13683552716843e-17	5733442	5745329
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	14	-0.5271	1.13683552716843e-17	5733442	5745329	4.57395265274627e-32	5762182	5769776
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	66463477	19429	17976	6e-04	4.57395265274627e-32	5762182	5769776	3.60473344660127e-32	66463477	66463477
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	1.0939	3.60473344660127e-32	66463477	66463477	1.89468469915652e-13	66469412	66469412
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	83525209	6063	5582	0.007	1.89468469915652e-13	66469412	66469412	1.50755822912265e-10	83522972	83525209
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	83526700	83526700	1	0	NA	1.50755822912265e-10	83522972	83525209	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	83529177	83531681	3	3	-0.7843	NA	NA	NA	3.02972327625492e-11	83531681	83531681
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	83534566	85107091	690	636	-0.0112	3.02972327625492e-11	83531681	83531681	8.82725862879241e-62	85107091	85107091
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	85109527	85146433	19	17	-0.7711	8.8272586287924e-62	85107091	85107091	2.33739484415977e-57	85146433	85151011
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	85149153	85149153	1	0	NA	2.33739484415977e-57	85146433	85151011	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	85151011	106733851	6621	6112	-0.0042	NA	NA	NA	3.62183286501652e-193	106733851	106733851
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106744337	106747920	4	4	-2.8875	3.62183286501652e-193	106733851	106733851	5.98530025568813e-195	106747920	106747920
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106754784	134443483	10317	9500	-0.0153	5.98530025568813e-195	106747920	106747920	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	134450318	134450318	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	7894681	3249	3003	0.0519	NA	NA	NA	1.33773188977987e-14	7859373	7928083
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7896259	8003026	40	38	0.2767	1.33773188977987e-14	7859373	7928083	3.83918341224779e-18	7975671	8020582
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	8005058	98517420	29267	27015	0.0507	3.83918341224779e-18	7975671	8020582	6.59650607067886e-19	98515290	98517420
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	98519108	98532494	6	6	-0.6912	6.59650607067886e-19	98515290	98517420	5.72723571083102e-51	98532494	98535730
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	98535730	132289090	12599	11664	0.0456	5.72723571083102e-51	98532494	98535730	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	33030946	5595	5184	-0.0102	NA	NA	NA	3.70140052691894e-53	33030946	33030946
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33033905	33042557	3	3	-1.7355	3.70140052691894e-53	33030946	33030946	6.01919783091437e-55	33042557	33042557
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33046417	45633164	4967	4588	-0.0025	6.01919783091437e-55	33042557	33042557	2.68186984616119e-29	45633164	45633164
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	45636180	45636180	1	0	NA	2.68186984616119e-29	45633164	45633164	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	45637710	45637778	2	2	1.2124	NA	NA	NA	2.45898463731335e-35	45637778	45637778
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	45640031	114123340	21076	19419	-0.0228	2.45898463731335e-35	45637778	45637778	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18544772	6	6	0.111	NA	NA	NA	1.31801046997889e-09	18508651	18798641
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	19494416	54	50	-0.6505	1.31801046997889e-09	18508651	18798641	6.74649649969382e-129	19492531	19497023
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	21706846	1078	994	0.0413	6.74649649969382e-129	19492531	19497023	5.24659187962538e-70	21698018	21717022
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21710990	22052799	176	163	0.3262	5.24659187962538e-70	21698018	21717022	1.86357702513902e-95	22047168	22059557
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22054604	73071404	18106	16727	0.0136	1.86357702513902e-95	22047168	22059557	2.79456383915717e-25	73061942	73071404
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73072457	1	0	NA	2.79456383915717e-25	73061942	73071404	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73075500	73092112	6	6	0.8576	NA	NA	NA	9.76268135131419e-32	73092112	73092112
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	105343802	12146	11229	-0.0064	9.76268135131419e-32	73092112	73092112	3.13647746329480e-29	105330913	105348737
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105347685	105373966	10	10	-0.3535	3.1364774632948e-29	105330913	105348737	0.00348159867970738	105360891	105384766
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105376130	105398979	11	11	-0.0516	0.00348159867970738	105360891	105384766	1.44723876702149e-20	105398979	105401413
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105401413	105414975	7	7	-1.7256	1.44723876702149e-20	105398979	105401413	1.19132397092929e-07	105413366	105432521
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105416396	105416396	1	0	NA	1.19132397092929e-07	105413366	105432521	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105425440	105794161	77	72	-0.7755	NA	NA	NA	6.3870719739544e-10	105769543	105801812
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105795807	105946993	46	44	-0.3047	6.3870719739544e-10	105769543	105801812	0.00056284788124351	105901394	105964382
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105948347	106015449	20	16	-0.676	0.00056284788124351	105901394	105964382	1.67322122816258e-25	106013552	106017453
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106017453	106358491	140	130	-0.0484	1.67322122816258e-25	106013552	106017453	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	19465359	98	88	0.0813	NA	NA	NA	0.0168981567134686	19350466	19806497
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19537035	19845942	12	10	0.3051	0.0168981567134686	19350466	19806497	2.05127873882754e-12	19845942	19845942
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19874677	19882711	3	3	1.0379	2.05127873882754e-12	19845942	19845942	1.32660233379597e-07	19882711	19910696
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19910696	20088256	43	41	0.2125	1.32660233379597e-07	19882711	19910696	9.22163557307788e-57	20011950	20347935
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	41638388	7354	6752	-0.0153	9.22163557307788e-57	20011950	20347935	4.24528182930601e-62	41637456	41676221
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41676219	41723580	11	10	-0.7096	4.24528182930601e-62	41637456	41676221	4.90995468510947e-30	41720966	41776053
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41776053	75114211	14363	13248	0.0193	4.90995468510947e-30	41720966	41776053	5.81502359057187e-11	75114211	75114211
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75115806	75115806	1	0	NA	5.81502359057187e-11	75114211	75114211	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	1.0253	NA	NA	NA	3.54933423503000e-12	75119713	75119713
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	75121466	1	0	NA	3.54933423503e-12	75119713	75119713	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75124365	82332155	2621	2426	0.0097	NA	NA	NA	8.26119873366038e-08	82330854	82332155
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82333698	82334704	2	2	-0.8113	8.26119873366038e-08	82330854	82332155	2.00583426926223e-11	82334704	82335935
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82335935	98232932	5897	5464	-0.0146	2.00583426926223e-11	82334704	82335935	2.93086009575586e-20	98232932	98232932
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98239454	3	3	1.0917	2.93086009575586e-20	98232932	98232932	1.23667171494071e-21	98239454	98239454
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	100298352	911	837	-0.0111	1.23667171494071e-21	98239454	98239454	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	28511295	9614	8867	0.001	NA	NA	NA	1.55214029613615e-12	28507317	28511295
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	28512937	28529948	5	5	-0.5376	1.55214029613615e-12	28507317	28511295	1.51989705871759e-11	28529948	28539481
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	28536745	34333833	1091	1000	0.0293	1.51989705871759e-11	28529948	28539481	6.24584208456984e-09	34240270	34402206
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34339543	34602318	49	47	0.233	6.24584208456984e-09	34240270	34402206	9.30085497461945e-28	34559808	34641825
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34617260	75093957	9764	9009	-0.0047	9.30085497461945e-28	34559808	34641825	3.90675590371321e-75	75093957	75093957
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75097331	1	0	NA	3.90675590371321e-75	75093957	75093957	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75099083	75100865	2	2	2.5675	NA	NA	NA	1.32140978273512e-79	75100865	75100865
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	550	-0.0661	1.32140978273512e-79	75100865	75100865	6.73067376541526e-64	76925748	76925748
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76929598	1	0	NA	6.73067376541526e-64	76925748	76925748	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76931247	76940218	7	6	1.2998	NA	NA	NA	3.07070295254326e-55	76940218	76940218
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4166	-0.0091	3.07070295254326e-55	76940218	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	36673853	13871	12758	0.0126	NA	NA	NA	3.50829195994057e-09	36672710	36678537
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36675987	1	0	NA	3.50829195994057e-09	36672710	36678537	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36678537	36683509	4	3	-0.6905	NA	NA	NA	2.53239855902443e-09	36680557	36684619
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	41519702	2012	1853	0.038	2.53239855902443e-09	36680557	36684619	5.84764957057789e-57	41518222	41519702
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41566540	21	20	-0.6454	5.84764957057789e-57	41518222	41519702	7.22642649540743e-50	41566540	41568539
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	52440878	3526	3255	0.022	7.22642649540743e-50	41566540	41568539	6.56691734034786e-53	52440878	52440878
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52445183	52447064	3	3	-1.7488	6.56691734034786e-53	52440878	52440878	3.53351671259308e-52	52447064	52447064
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52454171	78653545	10196	9395	0.0183	3.53351671259308e-52	52447064	52447064	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	4316	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	108760	76116026	22963	21172	-0.0178	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	3591120	1536	1423	0.0118	NA	NA	NA	1.37714854651131e-08	3588389	3591120
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3592564	3593646	2	2	-0.9442	1.37714854651131e-08	3588389	3591120	1.26846199394831e-09	3593646	3593646
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3596968	9130495	2522	2313	0.0268	1.26846199394831e-09	3593646	3593646	6.46895394189066e-07	9129085	9130495
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	9131737	9131737	1	0	NA	6.46895394189066e-07	9129085	9130495	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	9134840	9142861	4	3	-0.6509	NA	NA	NA	2.33311016952568e-07	9142861	9145735
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	9144715	9144715	1	0	NA	2.33311016952568e-07	9142861	9145735	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	9145735	20841320	5256	4831	0.0292	NA	NA	NA	3.7382213941378e-13	20823632	20857921
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20847760	20890025	14	13	-0.4013	3.7382213941378e-13	20823632	20857921	9.62744330791878e-25	20878378	20901410
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20897098	41532062	3812	3536	-0.0322	9.62744330791878e-25	20878378	20901410	4.97926972055948e-22	41532062	41532062
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	41533405	41538649	2	2	-1.37	4.97926972055948e-22	41532062	41532062	1.04318795497929e-22	41538649	41538649
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	41542955	56825794	6724	6184	0.0254	1.04318795497929e-22	41538649	41538649	1.45312848400744e-20	56822197	56825794
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56828073	56840346	7	6	-0.7427	1.45312848400744e-20	56822197	56825794	1.97020902868310e-17	56840346	56844304
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	56842447	1	0	NA	1.9702090286831e-17	56840346	56844304	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56844304	63788698	3177	2953	-0.0164	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	532	-0.0031	NA	NA	NA	2.02746881676672e-25	1499421	1515948
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	9	0.6905	2.02746881676672e-25	1499421	1515948	4.23248843166746e-30	1525300	1544485
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	18073029	5941	5464	-0.0195	4.23248843166746e-30	1525300	1544485	2.63744814970232e-26	18064835	18073029
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	18074598	18083569	5	5	0.4171	2.63744814970232e-26	18064835	18073029	6.80623773990995e-23	18083569	18093829
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	18085109	62419534	15037	13844	-0.0042	6.80623773990995e-23	18083569	18093829	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	10136303	16	15	-0.1578	NA	NA	NA	4.55511798534202e-10	10115958	10136303
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	10144881	10152384	3	3	-0.7103	4.55511798534202e-10	10115958	10136303	1.25430558163063e-09	10152384	10154777
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	10154777	46922972	13422	12334	-0.0123	1.25430558163063e-09	10152384	10154777	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	21040740	2250	2084	0.0082	NA	NA	NA	5.28453915846484e-41	21028612	21056805
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21043421	21376186	151	139	-0.2347	5.28453915846484e-41	21028612	21056805	5.18590285187938e-18	21357082	21391308
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21378222	21576859	123	115	-0.4817	5.18590285187938e-18	21357082	21391308	5.71782334273583e-153	21571489	21579649
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21579649	49571068	14033	12965	0.0098	5.71782334273583e-153	21571489	21579649	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.04	NA	NA	NA	1.71466152966640e-12	94062	98390
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	-1.6224	1.7146615296664e-12	94062	98390	3.78202762144823e-18	103089	104732
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	124528	16	14	-0.0887	3.78202762144823e-18	103089	104732	0.00346623649596312	122211	127779
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	4	-0.7403	0.00346623649596312	122211	127779	1.57885464040155e-09	129544	132721
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	132689	1	0	NA	1.57885464040155e-09	129544	132721	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132721	1427392	752	690	-0.0071	NA	NA	NA	5.63710713125549e-14	1427338	1431240
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-0.8912	5.63710713125549e-14	1427338	1431240	4.86661009314852e-15	1432891	1432953
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	1894973	349	320	0.0168	4.86661009314852e-15	1432891	1432953	5.35165747486944e-08	1892736	1894973
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1895343	1898078	2	2	-0.8991	5.35165747486944e-08	1892736	1894973	5.98988539206463e-09	1898078	1901223
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1901223	2303192	259	232	0.0296	5.98988539206463e-09	1898078	1901223	2.9813581469415e-21	2303192	2303192
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303218	2304398	3	3	-1.1403	2.9813581469415e-21	2303192	2303192	8.85291515024546e-19	2304398	2304398
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2708291	389	350	-0.0056	8.85291515024546e-19	2304398	2304398	0	2708291	2711273
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	8452395	1791	1669	0.7995	0	2708291	2711273	2.11028821804753e-09	8446489	8456422
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8456422	8466917	7	7	0.2734	2.11028821804753e-09	8446489	8456422	1.66839674428649e-36	8465433	8481280
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8473482	8475091	2	0	NA	1.66839674428649e-36	8465433	8481280	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8477126	55775967	17025	15699	0.8375	NA	NA	NA	6.85095290191351e-38	55775967	55775967
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	55782983	55783009	2	2	-0.3765	6.85095290191351e-38	55775967	55775967	2.89002730021740e-11	55783009	55783009
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	55793888	56800429	167	154	0.8442	2.8900273002174e-11	55783009	55783009	2.71692117323552e-11	56792140	56809272
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	56802632	56848661	19	18	0.4003	2.71692117323552e-11	56792140	56809272	8.40918611898853e-09	56836621	56878004
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	56855445	76998610	3926	3624	0.7995	8.40918611898853e-09	56836621	56878004	1.35627772172669e-29	76998610	76998610
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	-1.3425	1.35627772172669e-29	76998610	76998610	1.53227197156648e-35	77010018	77010018
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	152229432	21324	19720	0.8238	1.53227197156648e-35	77010018	77010018	2.81444508764308e-44	152161517	152291233
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152230490	152871621	290	275	0.6198	2.81444508764308e-44	152161517	152291233	2.23801130470461e-05	152785084	152908115
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152872693	152872693	1	0	NA	2.23801130470461e-05	152785084	152908115	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152874486	153059368	88	83	0.8182	NA	NA	NA	3.64025151861452e-06	153033530	153232909
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153062482	153062482	1	0	NA	3.64025151861452e-06	153033530	153232909	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153067477	153566897	141	129	0.6009	NA	NA	NA	2.03978760071978e-14	153477623	153593884
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153575170	154038318	215	200	0.8576	2.03978760071978e-14	153477623	153593884	7.08419390846138e-27	154037006	154038318
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154078819	11	10	1.7906	7.08419390846138e-27	154037006	154038318	4.81011651119455e-31	154078819	154079002
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154582414	122	120	0.8406	4.81011651119455e-31	154078819	154079002	8.68695946386945e-232	154578922	154582414
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	190	0.0072	8.68695946386945e-232	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	117	-2.2134	NA	NA	NA	1.85619795544174e-15	3219200	3733715
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	4948824	13	13	-0.3207	1.85619795544174e-15	3219200	3733715	1.07813573394394e-10	4948824	5672441
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5422507	6953343	121	115	-2.2075	1.07813573394394e-10	4948824	5672441	5.28959269892937e-10	6927923	6995785
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6954864	7653082	216	203	-1.4475	5.28959269892937e-10	6927923	6995785	3.35917791821283e-06	7648873	7653082
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7663037	6	6	-3.5474	3.35917791821283e-06	7648873	7653082	2.58349120009037e-05	7663037	7668037
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7664085	7700496	22	20	-2.1331	2.58349120009037e-05	7663037	7668037	2.46948023854041e-05	7693377	7701303
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7701303	7709619	7	7	-3.5447	2.46948023854041e-05	7693377	7701303	5.04321619145741e-08	7708716	7713973
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7992221	84	80	-1.6242	5.04321619145741e-08	7708716	7713973	2.36266227230762e-12	7942730	7997485
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7996758	8174858	39	38	-2.7626	2.36266227230762e-12	7942730	7997485	6.86281536362786e-08	8167434	8179883
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8176058	8201959	10	9	-1.3684	6.86281536362786e-08	8167434	8179883	0.0126731206502645	8185182	8229100
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8204414	8289709	19	18	-2.53	0.0126731206502645	8185182	8229100	6.59049107084943e-05	8229100	8316416
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8292347	8697715	118	110	-1.5795	6.59049107084943e-05	8229100	8316416	2.92243392581982e-07	8663007	8761847
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8698878	10501368	180	165	-2.2252	2.92243392581982e-07	8663007	8761847	3.01350983109696e-09	10472399	10511255
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10503821	11673476	24	24	-0.8622	3.01350983109696e-09	10472399	10511255	1.12463905968308e-09	10655750	11673476
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	11698871	1	0	NA	1.12463905968308e-09	10655750	11673476	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12536761	10	10	-2.6698	NA	NA	NA	5.26717241770227e-06	12536761	12550566
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12537944	13129843	192	179	-1.2145	5.26717241770227e-06	12536761	12550566	2.88100464307379e-29	13104920	13150942
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	14122129	377	355	-2.1616	2.88100464307379e-29	13104920	13150942	2.75794408315336e-06	14009234	14426934
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	15320389	373	346	-1.7693	2.75794408315336e-06	14009234	14426934	6.21446486647706e-05	15293299	15330645
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15321153	15355928	20	20	-2.8533	6.21446486647706e-05	15293299	15330645	0.000131592264864209	15343136	15380259
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15358372	16318293	327	307	-1.8468	0.000131592264864209	15343136	15380259	0.00185775769669998	16071977	16894271
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16321288	22192409	964	891	-2.1109	0.00185775769669998	16071977	16894271	1.28674484056849e-07	22169951	22203194
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22200078	22371003	27	27	-3.2381	1.28674484056849e-07	22169951	22203194	8.66515427635983e-06	22263267	22776089
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22373608	22373608	1	0	NA	8.66515427635983e-06	22263267	22776089	NA	NA	NA
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22379285	22930737	60	57	-2.1413	NA	NA	NA	2.01159727804338e-11	22915679	23283689
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	33	-0.8098	2.01159727804338e-11	22915679	23283689	4.99565778803884e-14	26945893	26952278
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	26980386	5	5	-2.7718	4.99565778803884e-14	26945893	26952278	9.0922794080951e-06	26957814	26990807
MSK_252152917567_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26984336	57440809	48	44	-0.8478	9.0922794080951e-06	26957814	26990807	NA	NA	NA
