Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	16704522	5781	5536	0.0026	NA	NA	NA	2.09315280471148e-09	16660353	16814050
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16713074	17094326	17	17	-0.3008	2.09315280471148e-09	16660353	16814050	9.63370262424529e-10	16926444	17112697
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17094475	23306525	2594	2476	-7e-04	9.63370262424529e-10	16926444	17112697	4.77776408144001e-10	23306525	23306525
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	23308216	23309366	2	2	-0.8853	4.77776408144001e-10	23306525	23306525	6.64709020881533e-10	23309366	23309366
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	23310942	58739273	14121	13560	0.0039	6.64709020881533e-10	23309366	23309366	8.55104442205511e-16	58739273	58739273
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	58741191	58746505	3	3	-0.8999	8.55104442205511e-16	58739273	58739273	6.44696433320937e-17	58746505	58746505
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	58751182	72525842	5370	5144	4e-04	6.44696433320937e-17	58746505	58746505	4.06163631195662e-12	72524413	72533856
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72528790	72537426	6	6	-0.5434	4.06163631195662e-12	72524413	72533856	3.36928650132415e-127	72537426	72537426
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	11	3.0966	3.36928650132415e-127	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	79364942	2277	2190	0.0046	0	72579311	72579311	4.51041412566276e-09	79364942	79364942
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	79369664	79373212	2	2	-0.7979	4.51041412566276e-09	79364942	79364942	2.23892045103313e-09	79373212	79373212
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	79380417	84484082	1209	1171	6e-04	2.23892045103313e-09	79373212	79373212	3.94822016426412e-19	84484082	84484082
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	84485205	84487429	2	2	-1.1277	3.94822016426412e-19	84484082	84484082	2.73800850355316e-17	84487429	84487429
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	84488775	108535814	7639	7323	0.0026	2.73800850355316e-17	84487429	84487429	2.16282124899664e-143	108535814	108535814
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108537259	108538662	2	2	-3.2675	2.16282124899664e-143	108535814	108535814	4.02982157103282e-129	108538662	108538662
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108541074	150819879	6425	6170	0.0012	4.02982157103282e-129	108538662	108538662	4.68500727127372e-246	150819879	150819879
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	11	1.8852	4.68500727127372e-246	150819879	150819879	7.09773569700894e-144	150851439	150851439
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	76	-0.0146	7.09773569700894e-144	150851439	150851439	4.01099731220204e-13	151024118	151026228
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.7151	4.01099731220204e-13	151024118	151026228	7.29691169193096e-14	151036435	151038091
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	200598243	18144	17430	1e-04	7.29691169193096e-14	151036435	151038091	9.54548931575341e-16	200592050	200613454
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200600795	200665389	23	23	-0.3169	9.5454893157534e-16	200592050	200613454	2.26405770602929e-15	200649025	200672373
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200667381	247186514	17424	16694	-0.0041	2.26405770602929e-15	200649025	200672373	NA	NA	NA
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	11057	-0.0085	NA	NA	NA	5.11199202012628e-145	34543992	34543992
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	18	1.0518	5.11199202012628e-145	34543992	34543992	9.46975752784795e-147	34589997	34589997
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	52600588	7192	6903	-0.0033	9.46975752784795e-147	34589997	34589997	2.50725468501761e-18	52600588	52600588
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	2.50725468501761e-18	52600588	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	0.8	NA	NA	NA	1.25071668626846e-18	52635695	52639605
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	66357387	4557	4394	0.0017	1.25071668626846e-18	52635695	52639605	0	66357387	66357387
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	-4.914	0	66357387	66357387	0	66360747	66360747
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	208677101	42382	40661	-0.002	0	66360747	66360747	7.52520649357917e-12	208677101	208677101
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	208678998	208680717	2	2	-0.9428	7.52520649357917e-12	208677101	208677101	8.93250310695246e-12	208680717	208680717
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	208682461	242689978	12147	11636	-0.0031	8.93250310695246e-12	208680717	208680717	NA	NA	NA
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10343	-0.008	NA	NA	NA	7.02281256501133e-16	32074432	32074432
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.0632	7.02281256501133e-16	32074432	32074432	2.22568565426896e-14	32080848	32080848
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	53001678	7864	7555	0.003	2.22568565426896e-14	32080848	32080848	3.41137631195654e-08	52997045	53001678
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53003136	53011885	5	5	0.5177	3.41137631195654e-08	52997045	53001678	6.3425545974433e-09	53011885	53014254
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53014254	162252328	34496	33115	-0.0024	6.3425545974433e-09	53011885	53014254	9.15689563595658e-23	162252328	162252328
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	162255354	162259312	3	3	-1.0394	9.15689563595658e-23	162252328	162252328	4.58008785460711e-23	162259312	162259312
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	162261860	164005577	325	314	0.0138	4.58008785460711e-23	162259312	162259312	1.46092443567774e-37	164005577	164005577
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	4	-1.1386	1.46092443567774e-37	164005577	164005577	3.19626563592293e-37	164027724	164027724
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	194354505	10150	9753	0.0027	3.19626563592293e-37	164027724	164027724	8.14663959729482e-22	194353315	194354505
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	0.7213	8.14663959729482e-22	194353315	194354505	2.86703609338053e-23	194366950	194366950
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196822133	996	963	-0.017	2.86703609338053e-23	194366950	194366950	7.8173782973176e-126	196822133	196905767
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196961238	31	30	-0.831	7.8173782973176e-126	196822133	196905767	2.20253904513849e-109	196952514	196961238
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196964180	198823667	734	708	0.0055	2.20253904513849e-109	196952514	196961238	1.71877319284417e-08	198819935	198823667
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198871596	198873921	2	2	-0.8431	1.71877319284417e-08	198819935	198823667	1.79302570131462e-08	198873921	198878828
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198878828	199329592	217	202	0.0132	1.79302570131462e-08	198873921	198878828	NA	NA	NA
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3283	-0.0051	NA	NA	NA	0	9815760	9815760
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.568	0	9815760	9815760	0	9842644	9842644
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	63346612	13826	13295	-0.0041	0	9842644	9842644	0	63346612	63346612
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	63357811	63358506	2	2	-4.9821	0	63346612	63346612	1.37913393458199e-285	63358506	63358506
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	63360367	64376590	126	120	-0.0312	1.37913393458199e-285	63358506	63358506	1.48617266647657e-295	64376590	64376590
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64381871	64390333	2	2	-5.0924	1.48617266647657e-295	64376590	64376590	0	64390333	64390333
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64398986	68905670	1080	1036	4e-04	0	64390333	64390333	4.45169916992984e-55	68905670	68905670
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	0.75	4.45169916992984e-55	68905670	68905670	1.72545288441711e-56	69165814	69165814
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	187330240	35471	34054	0.0015	1.72545288441711e-56	69165814	69165814	1.06123066001959e-57	187330240	187330240
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	2.0026	1.06123066001959e-57	187330240	187330240	7.38951349699037e-57	187333619	187333619
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	190710812	1131	1092	-0.0097	7.38951349699037e-57	187333619	187333619	6.56530002920419e-26	190692881	190735382
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190717801	190924564	66	64	-0.2559	6.56530002920419e-26	190692881	190735382	2.08278825941255e-17	190913517	190936155
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190927969	191035341	35	33	0.0292	2.08278825941255e-17	190913517	190936155	0.0164774272580965	191008702	191117375
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	191037553	191153613	9	9	-0.1824	0.0164774272580965	191008702	191117375	NA	NA	NA
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	180644810	53766	51568	-0.0031	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	240119	56	55	0.0166	NA	NA	NA	4.56021803535371e-15	230588	246974
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	241674	332608	49	49	-0.2499	4.56021803535371e-15	230588	246974	1.58828315502119e-21	326323	342633
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	334423	29950805	10482	10052	-0.0024	1.58828315502119e-21	326323	342633	1.63096543753023e-18	29939288	29972382
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30010234	15	15	0.4134	1.63096543753023e-18	29939288	29972382	1.03593538297204e-13	29998009	30026699
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30021908	31385778	580	561	-0.0034	1.03593538297204e-13	29998009	30026699	1.61568044157881e-08	31383925	31390982
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31395330	5	5	0.5645	1.61568044157881e-08	31383925	31390982	3.22842743837389e-10	31389372	31418006
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31418006	32558677	490	470	-0.0064	3.22842743837389e-10	31389372	31418006	2.57479119694564e-67	32558677	32588005
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32633691	17	16	0.9458	2.57479119694564e-67	32558677	32588005	5.47307461810955e-07	32609525	32634977
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32703109	24	23	0.0634	5.47307461810955e-07	32609525	32634977	0.000464106052553232	32685188	32711957
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32707427	32728487	12	12	0.4936	0.000464106052553232	32685188	32711957	3.31130648193762e-20	32723722	32732764
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	54035000	8259	7929	0	3.31130648193762e-20	32723722	32732764	1.13950832467672e-11	54033505	54035000
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	0.7583	1.13950832467672e-11	54033505	54035000	1.26726206357019e-11	54042734	54045472
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	103841482	13207	12678	0	1.26726206357019e-11	54042734	54045472	0	103841482	103841482
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-3.9393	0	103841482	103841482	0	103868154	103868154
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	165643653	21106	20294	6e-04	0	103868154	103868154	6.70008092243952e-26	165643653	165643653
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	3	1.1064	6.70008092243952e-26	165643653	165643653	2.0801343378758e-24	165650610	165650610
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	166414597	296	288	-0.0167	2.0801343378758e-24	165650610	165650610	1.18975704723030e-21	166414597	166414597
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	166418511	166422386	3	3	-1.0616	1.1897570472303e-21	166414597	166414597	6.37262958898872e-22	166422386	166422386
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	166425475	170753106	1505	1441	-0.0133	6.37262958898872e-22	166422386	166422386	NA	NA	NA
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	1038517	260	248	-0.0083	NA	NA	NA	7.17842567799904e-09	1038517	1038517
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1047636	1047707	2	2	0.8948	7.17842567799904e-09	1038517	1038517	1.95278853261329e-09	1047707	1047707
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1049599	10461972	3204	3080	0.0037	1.95278853261329e-09	1047707	1047707	6.7593331575671e-70	10461972	10461972
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	10469126	10489209	11	11	-1.005	6.7593331575671e-70	10461972	10461972	1.61227019898457e-78	10489209	10489209
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	10492591	20236099	3283	3150	-0.0034	1.61227019898457e-78	10489209	10489209	1.75521955977414e-16	20236099	20236099
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	20238450	20243406	3	3	-0.8945	1.75521955977414e-16	20236099	20236099	6.73515846215884e-16	20243406	20243406
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	20245704	71894353	15024	14434	-0.0045	6.73515846215884e-16	20243406	20243406	2.99581246882727e-115	71894353	71894353
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71911940	71912065	2	2	-2.8771	2.99581246882727e-115	71894353	71894353	5.42139466882242e-120	71912065	71912065
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71914572	92522688	6370	6087	0.0062	5.42139466882242e-120	71912065	71912065	3.50382775966786e-09	92522688	92522688
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	92530156	92562146	2	2	-0.8175	3.50382775966786e-09	92522688	92522688	1.20470504833873e-08	92562146	92562146
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	92563715	109966116	7105	6830	0.0076	1.20470504833873e-08	92562146	92562146	1.46192215505962e-10	109961911	109966116
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109967918	109974402	3	3	-0.7326	1.46192215505962e-10	109961911	109966116	3.59995721551325e-11	109974402	109976628
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109976628	118611324	3996	3796	-0.0025	3.59995721551325e-11	109974402	109976628	0	118611324	118611324
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	-4.8846	0	118611324	118611324	0	118620875	118620875
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	141410894	10535	10106	0.0014	0	118620875	118620875	1.05911578426470e-08	141405145	141419692
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	12	0.3321	1.0591157842647e-08	141405145	141419692	3.71944754787094e-07	141431668	141446728
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	141690753	117	112	-0.0051	3.71944754787094e-07	141431668	141446728	4.26853462642763e-276	141690753	141690753
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141711513	8	8	-3.581	4.26853462642763e-276	141690753	141690753	0	141711513	141711513
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141712786	141712786	1	0	NA	0	141711513	141711513	NA	NA	NA
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141714168	147702365	2513	2416	-4e-04	NA	NA	NA	3.30449951487035e-14	147702365	147702365
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147708382	3	3	0.8669	3.30449951487035e-14	147702365	147702365	2.98194738264456e-14	147708382	147708382
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147710037	158821263	4237	4063	-0.0093	2.98194738264456e-14	147708382	147708382	NA	NA	NA
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	113	-0.003	NA	NA	NA	5.65411528137947e-66	581533	581533
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	2.2389	5.65411528137947e-66	581533	581533	2.30279179668060e-66	588865	588865
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	25631081	8284	7931	-0.0075	2.3027917966806e-66	588865	588865	4.0906966744179e-10	25631081	25631081
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25642917	25643641	2	2	0.8943	4.0906966744179e-10	25631081	25631081	4.74309389929614e-11	25643641	25643641
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25649804	40892587	5167	4935	-0.0022	4.74309389929614e-11	25643641	25643641	8.6838364447599e-22	40892587	40892587
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	1.2402	8.6838364447599e-22	40892587	40892587	1.07384626935658e-21	40897469	40897469
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	115701209	21295	20408	-2e-04	1.07384626935658e-21	40897469	40897469	1.38445560066190e-09	115701209	115701209
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115705898	115711730	2	2	-0.8455	1.3844556006619e-09	115701209	115701209	6.323800191125e-09	115711730	115711730
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115718942	146264846	9693	9276	-0.0085	6.323800191125e-09	115711730	115711730	NA	NA	NA
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	23343915	8000	7642	-0.0036	NA	NA	NA	3.33276784168249e-288	23343915	23343915
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	-3.6716	3.33276784168249e-288	23343915	23343915	8.13615187171475e-287	23365926	23365926
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	23377660	1	0	NA	8.13615187171475e-287	23365926	23365926	NA	NA	NA
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23395558	47002187	4736	4529	0.0044	NA	NA	NA	3.91409496711530e-10	43626920	67859114
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	66245109	70217543	20	20	-0.2707	3.9140949671153e-10	43626920	67859114	1.57354671057508e-11	70207320	70229901
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70221479	70926188	312	293	-0.0027	1.57354671057508e-11	70207320	70229901	7.50245144574772e-38	70926188	70926188
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-1.7344	7.50245144574772e-38	70926188	70926188	4.70380707981609e-40	70930528	70930528
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	140145683	24870	23859	-0.003	4.70380707981609e-40	70930528	70930528	NA	NA	NA
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9299	-0.0074	NA	NA	NA	3.40340250589075e-26	27038538	27038538
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	1.3479	3.40340250589075e-26	27038538	27038538	1.76347844500845e-24	27041812	27041812
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	31284926	1561	1498	3e-04	1.76347844500845e-24	27041812	27041812	2.5942738348161e-10	31284756	31284926
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31287101	31291525	3	3	0.724	2.5942738348161e-10	31284756	31284926	4.31201142859227e-11	31291525	31293140
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31293140	43434589	2581	2459	-0.0077	4.31201142859227e-11	31291525	31293140	1.37912799039463e-06	43430681	43434589
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	43436980	43437056	2	2	-0.7078	1.37912799039463e-06	43430681	43434589	3.83742354649259e-06	43437056	43443788
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	43443788	77917893	10714	10244	-0.0052	3.83742354649259e-06	43437056	43443788	6.3720253453162e-16	77917893	77917893
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	1.0881	6.3720253453162e-16	77917893	77917893	7.13188516679967e-16	77928669	77928669
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	135285645	20214	19392	-0.0059	7.13188516679967e-16	77928669	77928669	NA	NA	NA
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	64979515	20930	20041	0.0016	NA	NA	NA	6.81192501489047e-10	64979515	64979515
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	64982122	64982226	2	2	-0.891	6.81192501489047e-10	64979515	64979515	2.67288199727491e-10	64982226	64982226
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	64989812	81165726	5884	5651	0.0011	2.67288199727491e-10	64982226	64982226	2.85322590477062e-14	81156648	81165726
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81171544	81208351	6	6	-0.6008	2.85322590477062e-14	81156648	81165726	9.75222048593119e-15	81208351	81224183
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81217667	81217667	1	0	NA	9.75222048593119e-15	81208351	81224183	NA	NA	NA
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81224183	85565280	1708	1630	0.0013	NA	NA	NA	1.23260171486014e-14	85565280	85565280
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	85567562	85576174	3	3	-0.8452	1.23260171486014e-14	85565280	85565280	1.22155238954105e-14	85576174	85576174
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	85580062	134450318	16770	16117	-0.002	1.22155238954105e-14	85576174	85576174	NA	NA	NA
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	2109441	920	884	0.0232	NA	NA	NA	9.84018297520618e-35	2109441	2109441
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2115933	2127537	7	7	-0.8194	9.84018297520618e-35	2109441	2109441	9.8494128138571e-32	2127537	2127537
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2128807	7841847	2304	2212	-8e-04	9.8494128138571e-32	2127537	2127537	2.00369077361672e-14	7814165	7865499
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7843117	8003026	58	56	0.1985	2.00369077361672e-14	7814165	7865499	3.29432080329619e-13	7975671	8026718
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	8005058	9523923	453	424	0.0037	3.29432080329619e-13	7975671	8026718	0	9523923	9523923
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9554149	5	5	-4.3787	0	9523923	9523923	4.60868990567457e-42	9554149	9554149
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	9610054	11	8	-1.1366	4.60868990567457e-42	9554149	9554149	5.58061855142225e-68	9610054	9610054
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	11116883	571	542	-0.0037	5.58061855142225e-68	9610054	9610054	1.12619988568416e-66	11116883	11116883
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	6	1.265	1.12619988568416e-66	11116883	11116883	2.59836109472872e-69	11140421	11140421
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	31084265	6816	6532	0.0012	2.59836109472872e-69	11140421	11140421	1.75623621288140e-33	31079618	31098259
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31098259	31248212	24	23	-0.4507	1.7562362128814e-33	31079618	31098259	1.86355058023580e-31	31246624	31249495
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31249495	33184017	746	715	0.0078	1.8635505802358e-31	31246624	31249495	2.88866321933195e-16	33184017	33184017
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33193255	33198331	2	2	-1.1012	2.88866321933195e-16	33184017	33184017	3.15427207051741e-16	33198331	33198331
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33201796	130694393	32591	31267	0.0012	3.15427207051741e-16	33198331	33198331	3.60409573337891e-26	130694393	130694393
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	1.3855	3.60409573337891e-26	130694393	130694393	1.22584667497567e-19	130701040	130701040
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	618	0.0052	1.22584667497567e-19	130701040	130701040	NA	NA	NA
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	56650373	14025	13479	-5e-04	NA	NA	NA	6.06138021997759e-76	56650373	56650373
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56685341	15	15	0.8751	6.06138021997759e-76	56650373	56650373	1.89583305293236e-82	56685341	56685341
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	114123340	17604	16888	-4e-04	1.89583305293236e-82	56685341	56685341	NA	NA	NA
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18544772	6	4	0.1419	NA	NA	NA	5.6433111635187e-09	18537177	18544772
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	19403640	16	14	-0.6651	5.6433111635187e-09	18537177	18544772	0.00119356661808232	19301034	19407199
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19407199	19422841	10	9	-0.9546	0.00119356661808232	19301034	19407199	2.13156128883056e-06	19418899	19436149
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19433191	19490630	26	26	-0.7082	2.13156128883056e-06	19418899	19436149	9.5784769690835e-98	19490630	19490630
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19492531	69086125	17570	16862	0.0054	9.5784769690835e-98	19490630	19490630	2.64574564062598e-19	69086125	69086125
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69092211	3	3	0.9545	2.64574564062598e-19	69086125	69086125	3.74598904302446e-18	69092211	69092211
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69093444	73061942	1788	1720	-0.0039	3.74598904302446e-18	69092211	69092211	3.79004593185763e-37	73061942	73061942
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73092112	8	7	-0.8983	3.79004593185763e-37	73061942	73061942	3.32837857627811e-37	73092112	73092112
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	105597555	12215	11722	-0.0051	3.32837857627811e-37	73092112	73092112	0	105597555	105597555
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	-2.5358	0	105597555	105597555	9.83763119388533e-52	105632168	105632168
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105787390	21	20	-0.0291	9.83763119388533e-52	105632168	105632168	1.87313115158633e-06	105776293	105787390
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105788623	105799261	7	7	-0.4018	1.87313115158633e-06	105776293	105787390	5.81204947715432e-06	105799261	105804040
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105800545	105856972	22	20	0.0316	5.81204947715432e-06	105799261	105804040	8.68470796520217e-15	105850033	105856972
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105872360	105875924	3	3	-0.9421	8.68470796520217e-15	105850033	105856972	9.4963205255428e-14	105875924	105875924
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881677	106358491	178	172	0.028	9.4963205255428e-14	105875924	105875924	NA	NA	NA
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	19845942	110	108	0.3117	NA	NA	NA	5.55137479041647e-10	19844217	19845942
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19874677	19882711	3	3	1.0427	5.55137479041647e-10	19844217	19845942	4.27922155006909e-09	19882711	19882711
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19910696	20088256	43	41	0.328	4.27922155006909e-09	19882711	19882711	1.89854424214370e-32	20060061	20316992
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	32456500	3671	3510	-0.0152	1.8985442421437e-32	20060061	20316992	2.81561160860122e-96	32454294	32514939
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32514939	32594200	25	25	-0.7673	2.81561160860122e-96	32454294	32514939	3.33512443296752e-103	32583146	32594200
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32661846	32661846	1	0	NA	3.33512443296752e-103	32583146	32594200	NA	NA	NA
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32664506	75115806	18032	17306	0.0033	NA	NA	NA	1.28051082598231e-16	75115806	75115806
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	1.118	1.28051082598231e-16	75115806	75115806	1.08725354943765e-16	75119713	75119713
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	98232932	8521	8169	-3e-04	1.08725354943765e-16	75119713	75119713	6.03945747403711e-23	98232932	98232932
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98239454	3	3	1.0644	6.03945747403711e-23	98232932	98232932	9.92116401743063e-24	98239454	98239454
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	100278665	908	870	-0.0158	9.92116401743063e-24	98239454	98239454	3.08520637495544e-06	100217283	100282819
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	100282819	100298352	3	3	0.5519	3.08520637495544e-06	100217283	100282819	NA	NA	NA
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	14876356	5468	5242	-0.0037	NA	NA	NA	6.90566000134259e-16	14683004	14956177
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14956177	15029941	14	14	-0.4368	6.90566000134259e-16	14683004	14956177	6.34692616469699e-18	15028108	15037844
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15034210	28523145	4134	3964	0.0039	6.34692616469699e-18	15028108	15037844	2.48043975240153e-09	28512937	28523145
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	28525086	28525086	1	0	NA	2.48043975240153e-09	28512937	28523145	NA	NA	NA
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	28529942	28529948	2	2	0.8512	NA	NA	NA	3.55451942210697e-08	28529948	28529948
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	28536745	33348511	975	937	0.035	3.55451942210697e-08	28529948	28529948	8.60948921574135e-30	33293241	33370459
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33370459	33559207	24	24	-0.4102	8.60948921574135e-30	33293241	33370459	9.66451795818427e-27	33538171	33842125
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33647856	33830585	2	0	NA	9.66451795818427e-27	33538171	33842125	NA	NA	NA
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33841331	54352394	3076	2975	-0.0055	NA	NA	NA	2.76842176671433e-22	54348362	54363713
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54353978	54379839	10	9	-0.6138	2.76842176671433e-22	54348362	54363713	7.39222526782914e-05	54376805	54390060
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	54402057	4	4	0.4969	7.39222526782914e-05	54376805	54390060	5.59256856536418e-07	54399890	54405667
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54405667	57203733	1199	1151	-0.0023	5.59256856536418e-07	54399890	54405667	5.2472558063273e-28	57203733	57203733
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	1.4338	5.2472558063273e-28	57203733	57203733	3.06934573927980e-28	57206772	57206772
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	74097511	5312	5079	0.0037	3.0693457392798e-28	57206772	57206772	1.16537079482950e-06	74085073	74103442
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	74099704	74122039	11	11	-0.2958	1.1653707948295e-06	74085073	74103442	6.3353540674256e-07	74117457	74134999
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	74124510	75093957	289	279	0.0063	6.3353540674256e-07	74117457	74134999	3.91433673221092e-62	75093957	75093957
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	-2.0656	3.91433673221092e-62	75093957	75093957	2.74778492013340e-56	75100865	75100865
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	586	-0.0079	2.7477849201334e-56	75100865	75100865	1.04511767027670e-293	76925748	76925748
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	2.3848	1.0451176702767e-293	76925748	76925748	6.13380556962223e-302	76940218	76940218
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4318	-0.0098	6.13380556962223e-302	76940218	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	400	0.0117	NA	NA	NA	3.45499573710051e-26	1028979	1028979
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.4157	3.45499573710051e-26	1028979	1028979	1.42391501284770e-25	1030766	1030766
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	41564408	15489	14867	0.0091	1.4239150128477e-25	1030766	1030766	1.73853300407852e-37	41555295	41568539
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41566540	42151941	52	49	-0.3338	1.73853300407852e-37	41555295	41568539	4.32251608286657e-37	42147225	42158650
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42153189	78653545	13674	13116	0.0076	4.32251608286657e-37	42147225	42158650	NA	NA	NA
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	4316	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	108760	630865	224	213	-0.0055	NA	NA	NA	1.52803763571714e-09	630865	630865
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	633499	634943	2	2	-0.9016	1.52803763571714e-09	630865	630865	6.61015841638844e-11	634943	634943
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	636235	64085502	19191	18428	-0.0039	6.61015841638844e-11	634943	634943	2.48613865631555e-13	64085502	64085502
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	64091630	64099958	2	2	-0.9897	2.48613865631555e-13	64085502	64085502	6.25720110485903e-13	64099958	64099958
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	64105567	76116026	3544	3406	-0.0119	6.25720110485903e-13	64099958	64099958	NA	NA	NA
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	210395	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	216768	1398325	491	459	0.0065	NA	NA	NA	2.01152677727746e-09	1395246	1398325
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	0.932	2.01152677727746e-09	1395246	1398325	2.49423652747358e-09	1400840	1400840
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	11445761	4677	4479	0.0132	2.49423652747358e-09	1400840	1400840	6.13815402301247e-17	11445761	11445761
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11448975	11448975	1	0	NA	6.13815402301247e-17	11445761	11445761	NA	NA	NA
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.2344	NA	NA	NA	3.84306375662404e-18	11452390	11452390
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	20399700	4042	3888	0.0064	3.84306375662404e-18	11452390	11452390	2.72581259357525e-51	20386500	20420327
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20420327	20493401	15	15	-0.7414	2.72581259357525e-51	20386500	20420327	1.00956775137347e-43	20474417	20507235
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20507235	21632138	325	315	-0.0182	1.00956775137347e-43	20474417	20507235	2.86081431261394e-07	21625633	21633408
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	21633408	21649003	4	4	0.5478	2.86081431261394e-07	21625633	21633408	2.05978150579500e-07	21635158	21653170
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	21651184	40540618	3133	3007	-0.0052	2.059781505795e-07	21635158	21653170	6.10456960758276e-10	40539029	40540618
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40543992	40553315	3	3	-0.7381	6.10456960758276e-10	40539029	40540618	1.20562529830961e-10	40553315	40556205
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40556205	55769042	6659	6353	0.0157	1.20562529830961e-10	40553315	40556205	3.60146689196327e-09	55769042	55769042
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55770195	55772729	2	2	-0.8448	3.60146689196327e-09	55769042	55769042	1.62806611755196e-09	55772729	55772729
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55776055	56825794	517	496	0.0022	1.62806611755196e-09	55772729	55772729	6.20114555485905e-37	56825794	56825794
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56828073	56840346	7	7	-0.8821	6.20114555485905e-37	56825794	56825794	1.93315748685424e-39	56840346	56840346
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	58208527	586	568	-0.0152	1.93315748685424e-39	56840346	56840346	4.7247605274129e-16	58203159	58212113
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58212113	58254174	19	19	-0.3542	4.7247605274129e-16	58203159	58212113	3.31979884875294e-15	58252109	58262497
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58259101	63788698	2573	2477	0.0051	3.31979884875294e-15	58252109	58262497	NA	NA	NA
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1511632	587	555	-0.0154	NA	NA	NA	6.60797322830515e-185	1511632	1511632
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1515948	1525300	6	5	-2.4409	6.60797322830515e-185	1511632	1511632	2.90672157578575e-05	1525300	1525300
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1528899	1531162	2	2	-0.8787	2.90672157578575e-05	1525300	1525300	1.78103354598491e-09	1531162	1532433
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	3825971	961	905	0.0051	1.78103354598491e-09	1531162	1532433	2.07787152953849e-26	3825971	3825971
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	3827436	3831372	6	6	-0.8385	2.07787152953849e-26	3825971	3825971	9.39785439531024e-28	3831372	3833484
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	3833484	56896329	17754	17077	-0.0043	9.39785439531024e-28	3831372	3833484	4.47409246064117e-09	56896329	56896329
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	56898026	56899350	2	2	-0.8556	4.47409246064117e-09	56896329	56896329	2.9005577387083e-08	56899350	56899350
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	56901438	62419534	2261	2170	-0.0095	2.9005577387083e-08	56899350	56899350	NA	NA	NA
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	22052334	2906	2804	0.0029	NA	NA	NA	3.34769982523029e-12	22052334	22052334
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	22054904	22056956	2	2	-0.9577	3.34769982523029e-12	22052334	22052334	1.20018305173792e-14	22056956	22056956
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	22059300	22573420	155	148	0.0018	1.20018305173792e-14	22056956	22056956	4.7585694203906e-19	22573420	22573420
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	22577751	22585040	3	3	-0.9037	4.7585694203906e-19	22573420	22573420	7.2378428407163e-16	22585040	22585040
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	22589739	46922972	10375	9955	-0.0073	7.2378428407163e-16	22585040	22585040	NA	NA	NA
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	21571489	2520	2402	0.0017	NA	NA	NA	9.67476430630316e-09	21568861	21571489
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21574577	21575829	2	2	0.8946	9.67476430630316e-09	21568861	21571489	4.534906104673e-09	21575829	21576859
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21576859	23952059	1075	1037	0.0038	4.534906104673e-09	21575829	21576859	4.25074098646333e-191	23951922	23958327
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	23958187	24178764	77	74	-0.7003	4.25074098646333e-191	23951922	23958327	4.42327135113427e-231	24174269	24178764
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	24197743	24197743	1	0	NA	4.42327135113427e-231	24174269	24178764	NA	NA	NA
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	24197852	27492663	1937	1864	-0.0068	NA	NA	NA	4.84421617830424e-09	27476750	27510154
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	27494698	27545523	33	31	0.203	4.84421617830424e-09	27476750	27510154	4.81246610428099e-07	27528169	27569890
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	27547887	32110063	2401	2302	0.0073	4.81246610428099e-07	27528169	27569890	7.45354512135028e-13	32110063	32110063
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	32110939	32112051	2	2	-1.0111	7.45354512135028e-13	32110063	32110063	2.49773299269832e-12	32112051	32112051
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	32114341	37685496	2716	2609	0.0066	2.49773299269832e-12	32112051	32112051	7.13146223199331e-76	37685496	37685496
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37689058	37715385	16	16	-0.8723	7.13146223199331e-76	37685496	37685496	5.4023144728546e-83	37715385	37715385
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37718669	41219395	1823	1730	0.0131	5.4023144728546e-83	37715385	37715385	9.94706611416101e-11	41201012	41237593
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41220567	41279485	12	10	0.4238	9.94706611416101e-11	41201012	41237593	5.39010007542151e-10	41254513	41289552
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41286119	49571068	3941	3764	-0.001	5.39010007542151e-10	41254513	41289552	NA	NA	NA
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	266212	127	118	-0.0103	NA	NA	NA	3.04751441931326e-09	266212	266212
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	267060	267079	2	2	0.9047	3.04751441931326e-09	266212	266212	8.98495813669217e-09	267079	268402
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	268402	1431411	660	634	0.0184	8.98495813669217e-09	267079	268402	1.42409428835970e-10	1431411	1431411
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-0.951	1.4240942883597e-10	1431411	1431411	7.25037864725766e-10	1432953	1432953
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2510846	821	784	-0.0146	7.25037864725766e-10	1432953	1432953	3.61214441183731e-09	2510846	2510846
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2512844	2512881	2	2	0.8925	3.61214441183731e-09	2510846	2510846	2.26629264728429e-09	2512881	2512881
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2514651	2672401	152	148	0.0054	2.26629264728429e-09	2512881	2512881	5.87359070736005e-06	2666344	2695630
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672477	2708291	27	27	-0.2152	5.87359070736005e-06	2666344	2695630	2.71395904668332e-124	2708291	2711273
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	6145632	1106	1060	0.8924	2.71395904668332e-124	2708291	2711273	2.70233121640198e-10	6141888	6145632
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	6146726	6146726	1	0	NA	2.70233121640198e-10	6141888	6145632	NA	NA	NA
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	6148661	6150055	2	2	0.0522	NA	NA	NA	3.48660823000963e-07	6150055	6152223
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	6152223	8452395	682	653	0.9263	3.48660823000963e-07	6150055	6152223	1.65085048352226e-08	8450789	8452395
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8456422	8458058	2	2	-0.0213	1.65085048352226e-08	8450789	8452395	2.89322862947269e-09	8458058	8459880
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8459880	13679455	2282	2175	0.9382	2.89322862947269e-09	8458058	8459880	5.81390795217918e-12	13679455	13679455
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	13681110	13686085	3	2	-0.1462	5.81390795217918e-12	13679455	13679455	9.22024206243815e-13	13686085	13686085
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	13688061	32880615	7575	7280	0.9621	9.22024206243815e-13	13686085	13686085	0	32879184	32886159
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	32882506	34549545	467	448	1.5017	0	32879184	32886159	0	34543792	34551281
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	34551281	139871174	28678	27489	0.9513	0	34543792	34551281	3.3250721610677e-25	139869703	139879676
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	139874067	139904307	14	14	1.5554	3.3250721610677e-25	139869703	139879676	2.10108839168828e-23	139900308	139981316
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	139981316	154038318	4189	4018	0.9313	2.10108839168828e-23	139900308	139981316	6.81584432306689e-42	154038318	154038318
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154078819	11	10	1.9101	6.81584432306689e-42	154038318	154038318	1.61413971143945e-53	154078819	154078819
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154442377	90	89	0.9292	1.61413971143945e-53	154078819	154078819	8.4032965833995e-269	154442377	154442377
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	4	-2.6381	8.4032965833995e-269	154442377	154442377	2.91542431609384e-285	154450309	154450309
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	27	0.9828	2.91542431609384e-285	154450309	154450309	2.11989671087388e-154	154582414	154582414
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	191	-7e-04	2.11989671087388e-154	154582414	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3034907	121	114	-4.0904	NA	NA	NA	1.59929572008967e-27	2969891	3219200
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3219200	5672441	20	18	-1.1058	1.59929572008967e-27	2969891	3219200	9.47496910788515e-11	5531459	6715636
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6652845	7259689	228	217	-3.4356	9.47496910788515e-11	5531459	6715636	2.18616008457054e-07	7247504	7264547
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7261174	7304209	23	22	-1.67	2.18616008457054e-07	7247504	7264547	0.00195557609669304	7287810	7340782
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7305143	7495687	51	49	-2.9032	0.00195557609669304	7287810	7340782	0.00175407748992463	7379019	7626352
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7708716	65	63	-3.8989	0.00175407748992463	7379019	7626352	0.106106810907821	7572591	7719658
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7709619	7709619	1	0	NA	0.106106810907821	7572591	7719658	NA	NA	NA
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7723783	9	8	-3.321	NA	NA	NA	0.00555796157845759	7713973	7729757
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7782532	18	16	-1.8238	0.00555796157845759	7713973	7729757	2.11425266156873e-05	7776265	7821554
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	8005148	61	59	-3.2393	2.11425266156873e-05	7776265	7821554	3.61418488836882e-07	7936024	8048263
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8010446	8289709	64	55	-4.2333	3.61418488836882e-07	7936024	8048263	6.84206046961967e-09	8245608	8304781
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8292347	8463583	40	39	-3.174	6.84206046961967e-09	8245608	8304781	1.60317525462678e-09	8446542	8474062
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8474062	8538835	18	18	-4.6381	1.60317525462678e-09	8446542	8474062	8.43825489258372e-05	8533866	8555993
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8539855	8824539	103	99	-3.4634	8.43825489258372e-05	8533866	8555993	0.000466349298039292	8725366	8968640
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8826900	10513747	143	129	-4.0843	0.000466349298039292	8725366	8968640	9.7565450723747e-32	10512616	10515697
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	11673476	18	17	-0.7941	9.7565450723747e-32	10512616	10515697	0.000212101444319897	10646662	12541506
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	12682301	67	66	-2.3399	0.000212101444319897	10646662	12541506	2.41916613678411e-06	12649357	12696242
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12776542	15	13	-4.4148	2.41916613678411e-06	12649357	12696242	2.06266806097738e-08	12741404	12804329
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12786515	13007725	70	67	-2.4675	2.06266806097738e-08	12741404	12804329	3.05488652207189e-06	12982236	13007725
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13008662	13048283	18	17	-1.0964	3.05488652207189e-06	12982236	13007725	8.39110725955933e-44	13048283	13048283
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13050965	13058512	5	4	-3.9127	8.39110725955933e-44	13048283	13048283	9.65590346614615e-06	13058512	13061201
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13059372	13129843	28	28	-1.819	9.65590346614615e-06	13058512	13061201	2.48208112890631e-26	13121152	13136828
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	14342834	408	380	-3.9467	2.48208112890631e-26	13121152	13136828	7.86704086437727e-13	14331599	14343139
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14380301	19	18	-2.0981	7.86704086437727e-13	14331599	14343139	2.41138813486788e-09	14379418	14384653
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14381372	14449913	38	38	-3.9528	2.41138813486788e-09	14379418	14384653	0.00176648009876907	14426934	14479475
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14451317	14524829	41	37	-2.928	0.00176648009876907	14426934	14479475	5.82039405270459e-06	14502379	14524829
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14526446	14545228	9	8	-0.7693	5.82039405270459e-06	14502379	14524829	0.00160182860669142	14545228	14563486
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14546195	14546195	1	0	NA	0.00160182860669142	14545228	14563486	NA	NA	NA
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14547168	14700040	37	37	-2.615	NA	NA	NA	1.40068978249482e-07	14689490	14705886
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14701706	14883615	43	39	-4.1737	1.40068978249482e-07	14689490	14705886	0.00933844288026149	14754064	15154705
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14894476	15658114	310	296	-3.4001	0.00933844288026149	14754064	15154705	0.00565138749360885	15523178	15719904
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15661862	15915466	41	40	-4.1844	0.00565138749360885	15523178	15719904	9.03648578640831e-07	15873423	15969469
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16387273	162	152	-3.0174	9.03648578640831e-07	15873423	15969469	2.41717941200526e-12	16256821	16481450
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	17482749	173	165	-3.9858	2.41717941200526e-12	16256821	16481450	1.93461055258484e-07	17440719	17482749
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17487972	17557953	13	13	-2.2656	1.93461055258484e-07	17440719	17482749	1.91741752865264e-05	17557953	17623295
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17566412	21036411	484	455	-3.8846	1.91741752865264e-05	17557953	17623295	2.03054136620771e-06	21025500	21036411
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21036503	21054519	7	7	-1.4929	2.03054136620771e-06	21025500	21036411	1.08458747347207e-08	21054519	21060047
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	21054605	1	0	NA	1.08458747347207e-08	21054519	21060047	NA	NA	NA
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21057446	22139807	260	242	-3.9766	NA	NA	NA	3.19111821966968e-07	22051284	22139807
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.9981	3.19111821966968e-07	22051284	22139807	6.62430820861881e-12	22177335	22179794
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22930737	93	82	-4.2164	6.62430820861881e-12	22177335	22179794	1.21459186009309e-75	22926726	25737663
MSK_252152918124_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	78	-1.2288	1.21459186009309e-75	22926726	25737663	NA	NA	NA
