Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	17102601	5800	5532	0.0081	NA	NA	NA	4.94381748832272e-08	17094326	17112697
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17104345	17127039	7	7	0.4227	4.94381748832272e-08	17094326	17112697	2.66462887580426e-08	17112697	17154037
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17148592	72537426	22087	21076	0.0011	2.66462887580426e-08	17112697	17154037	1.52741829379643e-268	72537426	72537426
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72574479	13	10	1.9104	1.52741829379643e-268	72537426	72537426	3.70816606173581e-277	72574479	72574479
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72579311	72579311	1	0	NA	3.70816606173581e-277	72574479	72574479	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	150819879	17556	16793	-0.0012	NA	NA	NA	1.37714032577467e-248	150819879	150823073
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	11	1.7289	1.37714032577467e-248	150819879	150823073	1.97601421675652e-75	150848509	150851439
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	78	0.0388	1.97601421675652e-75	150848509	150851439	8.6503782197618e-11	151024118	151026228
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.7786	8.6503782197618e-11	151024118	151026228	4.88961750752072e-17	151036435	151036435
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	173060997	8974	8590	-3e-04	4.88961750752072e-17	151036435	151036435	2.44318842556616e-18	173060997	173060997
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	173063537	173067337	3	3	-0.9318	2.44318842556616e-18	173060997	173060997	3.32080123331936e-19	173067337	173067337
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	173068576	200602881	9169	8763	-3e-04	3.32080123331936e-19	173067337	173067337	1.83208962128254e-20	200596027	200616638
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200609726	200668993	23	22	-0.356	1.83208962128254e-20	200596027	200616638	4.05602716332711e-21	200659076	200672373
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200670407	211067168	4052	3876	0.01	4.05602716332711e-21	200659076	200672373	2.68523124414029e-24	211067168	211067168
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	211070042	211079988	4	4	-0.904	2.68523124414029e-24	211067168	211067168	1.04757251329354e-22	211079988	211079988
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	211082419	227875096	5882	5609	-0.0029	1.04757251329354e-22	211079988	211079988	1.03020420216158e-07	227871579	227875096
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227879152	227882805	4	4	-0.5414	1.03020420216158e-07	227871579	227875096	3.28973615882687e-08	227882805	227889619
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227889619	243702540	6080	5812	-0.0093	3.28973615882687e-08	227882805	227889619	4.25037441970626e-33	243702540	243703653
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	243703653	243714007	7	7	-0.7957	4.25037441970626e-33	243702540	243703653	3.75894216579044e-30	243711918	243714007
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	243715818	246558492	1213	1164	-0.0152	3.75894216579044e-30	243711918	243714007	4.03922716755694e-08	246556424	246558492
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246560663	246561864	2	2	-0.7832	4.03922716755694e-08	246556424	246558492	1.40713951089034e-08	246561864	246573165
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246573165	247149830	164	156	-0.0126	1.40713951089034e-08	246561864	246573165	7.82143214939381e-07	247132377	247165926
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	247152072	247186514	14	14	-0.2845	7.82143214939381e-07	247132377	247165926	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	11011	0.0029	NA	NA	NA	0	34543992	34543992
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34551222	1	0	NA	0	34543992	34543992	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34552935	34580533	14	13	-2.9836	NA	NA	NA	6.91353065444295e-06	34574224	34580533
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34582272	34589997	3	2	-1.0858	6.91353065444295e-06	34574224	34580533	4.30142786999092e-17	34589997	34589997
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	37812045	1370	1324	-0.0053	4.30142786999092e-17	34589997	34589997	3.36745082322924e-41	37810001	37823343
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37813211	37813211	1	0	NA	3.36745082322924e-41	37810001	37823343	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37815049	37854350	19	19	-0.562	NA	NA	NA	7.03380232370216e-41	37843380	37855837
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37855837	41091579	1485	1411	-0.0102	7.03380232370216e-41	37843380	37855837	1.34861196928836e-19	41087172	41091579
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	41092989	41101640	5	5	-0.7386	1.34861196928836e-19	41087172	41091579	3.37330546044607e-19	41101640	41101640
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	41105253	52600588	4312	4111	-0.0033	3.37330546044607e-19	41101640	41101640	5.53057997056363e-14	52588009	52600588
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	5.53057997056363e-14	52588009	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	0.702	NA	NA	NA	7.4693039345731e-16	52635695	52635695
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	57251850	1554	1473	-0.0024	7.4693039345731e-16	52635695	52635695	2.85295327967339e-32	57251850	57251850
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	57263450	57300299	5	5	0.892	2.85295327967339e-32	57251850	57251850	1.28655484962712e-28	57300299	57300299
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	57307517	66357387	2998	2855	-0.0106	1.28655484962712e-28	57300299	57300299	3.18314085725576e-18	66357387	66357387
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	1.1331	3.18314085725576e-18	66357387	66357387	1.69224286443501e-18	66360747	66360747
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	146571330	21778	20770	0.0037	1.69224286443501e-18	66360747	66360747	9.815388499834e-56	146571330	146571330
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	1.3688	9.815388499834e-56	146571330	146571330	1.20652169627475e-58	146592775	146592775
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	184501938	12648	12075	-0.0049	1.20652169627475e-58	146592775	146592775	9.36147069106425e-14	184501938	184501938
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	184505519	184510172	3	3	-0.7892	9.36147069106425e-14	184501938	184501938	4.16712800487097e-13	184510172	184510172
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	184517600	242689978	20098	19194	-5e-04	4.16712800487097e-13	184510172	184510172	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	89475107	30641	29247	1e-04	NA	NA	NA	3.63167154208493e-57	89475107	89475107
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89477163	89500935	13	11	-0.8283	3.63167154208493e-57	89475107	89475107	1.44742597337738e-60	89500935	89500935
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89502757	95871768	390	372	0.0093	1.44742597337738e-60	89500935	89500935	9.88623665804457e-16	95871768	95871768
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	95884710	95892055	2	2	-0.981	9.88623665804457e-16	95871768	95871768	4.23803722801871e-14	95892055	95892055
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	95897757	95897757	1	0	NA	4.23803722801871e-14	95892055	95892055	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	95904526	103935428	2513	2392	9e-04	NA	NA	NA	2.19963321954475e-08	103932888	103935428
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	103937153	103943728	2	2	0.7668	2.19963321954475e-08	103932888	103935428	4.43688054671741e-08	103943728	103946458
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	103946458	163992903	19926	19017	-0.0018	4.43688054671741e-08	103943728	103946458	2.90706578405826e-127	163992903	163997228
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164107951	28	26	0.8051	2.90706578405826e-127	163992903	163997228	1.93409802693045e-126	164105613	164107951
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	192546280	9548	9138	0.0014	1.93409802693045e-126	164105613	164107951	4.79156094810932e-15	192546280	192546280
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192548135	192552734	4	4	-0.7186	4.79156094810932e-15	192546280	192546280	2.91323439098847e-14	192552734	192554451
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192554451	194354505	578	554	-0.0143	2.91323439098847e-14	192552734	192554451	1.41586589215387e-22	194354505	194354505
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194358882	1	0	NA	1.41586589215387e-22	194354505	194354505	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194360242	194366950	5	5	0.7748	NA	NA	NA	6.48627124306699e-22	194366950	194366950
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196822133	996	940	-0.0052	6.48627124306699e-22	194366950	194366950	3.20066520356953e-35	196810503	196904349
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196961238	31	29	-0.4226	3.20066520356953e-35	196810503	196904349	1.31262272000135e-31	196952514	196968244
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196964180	196964180	1	0	NA	1.31262272000135e-31	196952514	196968244	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196966631	199329592	952	910	-0.0045	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3242	0.0195	NA	NA	NA	1.71861416637489e-250	9815760	9815760
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-3.0407	1.71861416637489e-250	9815760	9815760	9.80057184666465e-283	9842644	9842644
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	34445002	6167	5892	-0.0052	9.80057184666465e-283	9842644	9842644	0	34445002	34445002
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	-3.4313	0	34445002	34445002	0	34491115	34491115
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	39380124	1522	1452	-0.0106	0	34491115	34491115	2.67003001840894e-37	39380124	39380124
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	39382435	39387900	4	4	-1.1234	2.67003001840894e-37	39380124	39380124	1.56833370980246e-36	39387900	39387900
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	39391819	68905670	7337	6996	-0.0074	1.56833370980246e-36	39387900	39387900	2.38267327536794e-47	68905670	68905670
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	0.6707	2.38267327536794e-47	68905670	68905670	9.18098112212072e-49	69165814	69165814
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	119334954	16298	15522	-0.0058	9.18098112212072e-49	69165814	69165814	3.09106599150511e-19	119334954	119345371
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119345371	119348829	3	3	-0.9353	3.09106599150511e-19	119334954	119345371	6.7782707489889e-19	119346804	119348829
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119350354	122499680	942	906	-0.0246	6.7782707489889e-19	119346804	119348829	9.35237384997801e-14	122499680	122499680
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	122500822	122505457	3	3	-0.7994	9.35237384997801e-14	122499680	122499680	1.0918924194544e-13	122505457	122511771
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	122507557	122507557	1	0	NA	1.0918924194544e-13	122505457	122511771	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	122511771	173224400	13946	13271	-0.0055	NA	NA	NA	1.14358648013407e-16	173224400	173224400
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	1.062	1.14358648013407e-16	173224400	173224400	1.33824143072001e-19	173228860	173228860
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173416233	81	78	0.0075	1.33824143072001e-19	173228860	173228860	5.27060706628249e-07	173409336	173416233
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173416260	173424336	4	3	0.5329	5.27060706628249e-07	173409336	173416233	1.71001575257681e-07	173424336	173428065
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173428065	173660684	108	104	0.0044	1.71001575257681e-07	173424336	173428065	1.3928050614629e-96	173660684	173660684
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	2.3341	1.3928050614629e-96	173660684	173660684	2.51235296153313e-84	173666072	173666072
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	191153613	5324	5054	-0.0018	2.51235296153313e-84	173666072	173666072	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	727098	219	209	0.0254	NA	NA	NA	6.4171960832241e-05	718523	730853
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	729262	829954	9	9	0.329	6.4171960832241e-05	718523	730853	5.64188079647567e-41	829954	829954
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	873365	2	2	-0.9173	5.64188079647567e-41	829954	829954	7.3169192283105e-13	873365	873365
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	905462	12857302	3745	3585	0.0107	7.3169192283105e-13	873365	873365	7.07667466445135e-135	12857302	12857302
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	-2.9314	7.07667466445135e-135	12857302	12857302	2.49200960873331e-135	12873052	12873052
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	59316268	12169	11656	-0.0042	2.49200960873331e-135	12873052	12873052	1.22087952808210e-11	59313784	59320265
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59318791	59325340	4	4	-0.6296	1.2208795280821e-11	59313784	59320265	8.40185663489679e-09	59320265	59327219
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59327219	59521690	53	51	0.0096	8.40185663489679e-09	59320265	59327219	5.47600915480573e-99	59521690	59521690
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59525396	59531344	3	3	-2.4984	5.47600915480573e-99	59521690	59521690	1.3763386421638e-142	59531344	59531344
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59535295	78485582	5634	5397	-0.01	1.3763386421638e-142	59531344	59531344	5.43025086630043e-09	78474450	78495585
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	78486743	78531091	20	19	-0.2667	5.43025086630043e-09	78474450	78495585	2.20392257276646e-09	78521408	78543926
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	78532750	140201609	18219	17375	-0.0028	2.20392257276646e-09	78521408	78543926	2.35556704023906e-10	140198797	140203440
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140203440	140216524	8	8	0.4226	2.35556704023906e-10	140198797	140203440	1.73782748493471e-10	140216524	140224323
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	140219465	1	0	NA	1.73782748493471e-10	140216524	140224323	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140221835	140533456	136	132	-0.0092	NA	NA	NA	1.57457405944715e-14	140533456	140533456
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140535820	140538666	2	2	0.9929	1.57457405944715e-14	140533456	140533456	1.15424581304527e-13	140538666	140538666
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140541178	180342860	13420	12821	0.0067	1.15424581304527e-13	140538666	140538666	7.77504725838747e-16	180194323	180342860
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	7	-0.5587	7.77504725838747e-16	180194323	180342860	1.29250625437983e-16	180358977	180362342
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180632269	111	103	0.0298	1.29250625437983e-16	180358977	180362342	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180644810	180644810	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	36	0.0134	NA	NA	NA	1.10558764147895e-16	198124	200350
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	237952	15	15	0.5265	1.10558764147895e-16	198124	200350	8.1683367741873e-06	232366	251128
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	240119	326323	46	44	0.7608	8.1683367741873e-06	232366	251128	1.51306076782810e-201	326323	326323
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	29950805	10486	10009	-0.0074	1.5130607678281e-201	326323	326323	1.7506974411392e-12	29937319	29962849
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30000990	12	12	0.3683	1.7506974411392e-12	29937319	29962849	4.7175853073887e-10	29998009	30021908
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30004636	32558677	1078	1034	0.0019	4.7175853073887e-10	29998009	30021908	3.73517573110465e-68	32558677	32563252
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32600962	9	8	1.1587	3.73517573110465e-68	32558677	32563252	5.81892661310832e-79	32597877	32600962
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	54035000	8303	7917	0.0056	5.81892661310832e-79	32597877	32600962	6.03531243096065e-151	54035000	54035000
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-2.5866	6.03531243096065e-151	54035000	54035000	9.82661527829503e-149	54042734	54042734
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	74920179	5348	5103	-0.0039	9.82661527829503e-149	54042734	54042734	3.96096235107674e-88	74920179	74923561
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74923561	74975054	16	16	-0.8694	3.96096235107674e-88	74920179	74923561	3.42361664078949e-89	74974633	74975054
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74977938	77490500	786	741	-0.0036	3.42361664078949e-89	74974633	74975054	7.25101451953563e-06	77479480	77490500
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77499382	77509983	3	3	0.5113	7.25101451953563e-06	77479480	77490500	8.09410998900717e-07	77509983	77517630
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77517630	79018959	279	270	-0.0018	8.09410998900717e-07	77509983	77517630	3.36925744009135e-84	79018959	79018959
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-0.8802	3.36925744009135e-84	79018959	79018959	5.07365356540991e-80	79091850	79091850
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	81334248	728	686	-0.0054	5.07365356540991e-80	79091850	79091850	8.64630477560023e-22	81334248	81334248
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	81341711	81348170	3	3	-0.9525	8.64630477560023e-22	81334248	81334248	1.16517193473657e-20	81348170	81348170
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	81350502	95520975	3707	3551	-0.0043	1.16517193473657e-20	81348170	81348170	1.8877263592135e-68	95520975	95520975
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	95530717	95616346	13	12	-0.8594	1.8877263592135e-68	95520975	95520975	3.96472824780548e-67	95616346	95616346
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	95626993	134629897	12795	12216	-0.0032	3.96472824780548e-67	95616346	95616346	6.38350317909071e-13	134627341	134629897
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134631701	134631701	1	0	NA	6.38350317909071e-13	134627341	134629897	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134633117	134635779	3	3	-0.772	NA	NA	NA	7.20298492988499e-13	134635779	134639397
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134639397	162502077	9659	9210	-0.0072	7.20298492988499e-13	134635779	134639397	6.77640664070967e-14	162502077	162502077
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	162504290	162505819	2	2	-0.9785	6.77640664070967e-14	162502077	162502077	3.32965393675266e-13	162505819	162505819
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	162508430	165643653	961	907	-0.0102	3.32965393675266e-13	162505819	162505819	6.36380807063902e-256	165643653	165643653
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165649379	3	3	-3.6181	6.36380807063902e-256	165643653	165643653	1.10546706378437e-264	165649379	165649379
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165650610	170753106	1805	1712	0.0106	1.10546706378437e-264	165649379	165649379	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	2318672	753	713	0.0291	NA	NA	NA	4.20450102788849e-07	2316417	2318672
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	2320938	2328218	3	3	-0.5553	4.20450102788849e-07	2316417	2318672	1.33528034648515e-06	2328218	2353119
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	2353119	8790893	2404	2282	-0.0019	1.33528034648515e-06	2328218	2353119	1.36879842823272e-17	8790893	8790893
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	8793843	8793843	1	0	NA	1.36879842823272e-17	8790893	8790893	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	8804002	8829893	4	4	-0.7686	NA	NA	NA	6.80937047475329e-17	8829893	8838768
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	8838768	38270942	10439	9951	-0.0014	6.80937047475329e-17	8829893	8838768	1.85821533604783e-11	38251281	38286537
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38274436	38360187	42	41	0.1982	1.85821533604783e-11	38251281	38286537	7.84036416356823e-13	38333171	38389189
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38372692	45444609	2525	2408	-0.0081	7.84036416356823e-13	38333171	38389189	1.96942302146616e-09	45444609	45444609
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	45449329	45453517	2	2	-0.8063	1.96942302146616e-09	45444609	45444609	6.75271931550554e-09	45453517	45488118
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	45462921	45462921	1	0	NA	6.75271931550554e-09	45453517	45488118	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	45488118	46673973	231	220	-0.0108	NA	NA	NA	8.91550919379309e-07	46667284	46673973
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	46680534	46684717	2	2	0.687	8.91550919379309e-07	46667284	46673973	4.97101464252106e-08	46684717	46690431
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	46690431	75188956	6080	5788	-0.0058	4.97101464252106e-08	46684717	46690431	1.05137639845103e-08	75185783	75188956
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	75192598	75207560	7	7	0.4274	1.05137639845103e-08	75185783	75188956	1.85793282544941e-09	75207560	75212042
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	75210882	100164752	8568	8185	-0.0062	1.85793282544941e-09	75207560	75212042	5.99836597594997e-10	100162851	100164752
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100166257	100174991	4	4	0.5811	5.99836597594997e-10	100162851	100164752	1.46121142762213e-09	100174991	100178968
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100178968	109967918	4201	3993	-0.0131	1.46121142762213e-09	100174991	100178968	1.10495631814579e-14	109967918	109967918
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109970524	109974402	2	2	-1.0439	1.10495631814579e-14	109967918	109967918	9.02922224423645e-16	109974402	109974402
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109976628	125831554	7169	6857	-0.0014	9.02922224423645e-16	109974402	109974402	2.58080674431541e-11	125831554	125831554
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	0.7255	2.58080674431541e-11	125831554	125831554	1.62332404984892e-11	125837524	125839386
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133432281	3653	3467	-4e-04	1.62332404984892e-11	125837524	125839386	0	133432281	133436265
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133433384	133433384	1	0	NA	0	133432281	133436265	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	-2.7823	NA	NA	NA	0	133447868	133448277
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141410894	3700	3529	-0.0036	0	133447868	133448277	0	141410894	141410894
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	14	-3.025	0	141410894	141410894	0	141440184	141440184
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141690753	116	113	0.0069	0	141440184	141440184	4.09352977614971e-100	141690753	141690753
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141711513	8	8	1.0963	4.09352977614971e-100	141690753	141690753	1.79755633068959e-51	141711513	141711513
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141712786	142149857	168	161	0.0774	1.79755633068959e-51	141711513	141711513	2.63392295781792e-08	142133796	142156165
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142152205	142188727	11	11	0.4377	2.63392295781792e-08	142133796	142156165	1.36189059861946e-13	142187097	142196011
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142192030	142192030	1	0	NA	1.36189059861946e-13	142187097	142196011	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142194531	158191657	6360	6057	0.0081	NA	NA	NA	2.04197058900054e-08	158189154	158191657
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158193795	158195947	2	2	-0.7724	2.04197058900054e-08	158189154	158191657	3.24754011359248e-08	158195947	158197662
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158197662	158783642	206	196	0.0362	3.24754011359248e-08	158195947	158197662	0.000249931971172054	158765920	158792914
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158790943	158821263	6	6	-0.3084	0.000249931971172054	158765920	158792914	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	117	0.0201	NA	NA	NA	3.58425938638489e-15	581533	581533
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-0.9884	3.58425938638489e-15	581533	581533	1.53831984887716e-13	588865	588865
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	7156900	2271	2174	9e-04	1.53831984887716e-13	588865	588865	3.97400801443349e-14	6909487	7260442
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7226901	8139999	11	11	-0.4308	3.97400801443349e-14	6909487	7260442	9.55290784320808e-14	7790934	8145219
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8143301	25022606	5726	5462	0.002	9.55290784320808e-14	7790934	8145219	6.88565838829758e-18	25022606	25022606
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25047250	4	4	0.8158	6.88565838829758e-18	25022606	25022606	7.16937065692324e-20	25047250	25047250
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25057567	87255865	17687	16840	-0.0095	7.16937065692324e-20	25047250	25047250	3.32187708088753e-14	87255865	87255865
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87258019	87262662	3	3	-0.8217	3.32187708088753e-14	87255865	87255865	1.73018668664575e-14	87262662	87262662
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87265435	146243521	18737	17908	0.0016	1.73018668664575e-14	87262662	87262662	2.01091887473490e-11	146236135	146243521
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	146245580	146264846	6	6	-0.41	2.0109188747349e-11	146236135	146243521	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	140145683	37944	36164	6e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	70949263	21675	20685	-0.0056	NA	NA	NA	3.68172684930768e-23	70949263	70949263
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70952973	70960187	4	4	-0.8932	3.68172684930768e-23	70949263	70949263	1.30590807884881e-23	70960187	70960187
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70964344	77917893	2913	2782	-0.002	1.30590807884881e-23	70960187	70960187	1.86552186577258e-87	77917893	77917893
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-2.4037	1.86552186577258e-87	77917893	77917893	2.81369593114563e-81	77928669	77928669
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	82866553	1495	1438	0.011	2.81369593114563e-81	77928669	77928669	3.58074976867241e-24	82863076	82866553
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	82869426	82869426	1	0	NA	3.58074976867241e-24	82863076	82866553	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	82871659	82881204	5	5	-0.8292	NA	NA	NA	3.38607811860803e-25	82881204	82881204
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	82884042	116637025	11930	11414	-0.0018	3.38607811860803e-25	82881204	82881204	1.39581608921959e-07	116633700	116637025
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	116638723	116638723	1	0	NA	1.39581608921959e-07	116633700	116637025	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	116640080	116652075	6	6	-0.43	NA	NA	NA	2.36191223107335e-08	116652075	116658493
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	116654997	135110218	6727	6396	0.0174	2.36191223107335e-08	116652075	116658493	1.23915308674088e-49	135105125	135117546
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	135117546	135229796	40	37	0.4439	1.23915308674088e-49	135105125	135117546	8.73550239177948e-13	135227463	135252519
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	135252519	135285645	9	8	-0.0513	8.73550239177948e-13	135227463	135252519	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1690	0.02	NA	NA	NA	1.24331125598662e-10	4920907	4926583
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-0.5321	1.24331125598662e-10	4920907	4926583	5.64038872126307e-08	4931000	4937118
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	5742476	362	347	-0.0259	5.64038872126307e-08	4931000	4937118	3.85970678081461e-47	5741031	5742476
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5744034	5765438	14	14	-0.7687	3.85970678081461e-47	5741031	5742476	1.12193992185357e-58	5765438	5765438
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	55123719	14753	14065	0.0048	1.12193992185357e-58	5765438	5765438	0	55123719	55123719
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55124730	55209626	38	36	-3.7835	0	55123719	55123719	0	55207305	55209626
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	66463477	4638	4409	0.004	0	55207305	55209626	2.60684562391186e-10	66463477	66463477
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	0.844	2.60684562391186e-10	66463477	66463477	6.81717195652398e-10	66469412	66469412
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	134450318	23720	22601	0.0064	6.81717195652398e-10	66469412	66469412	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	98316278	32479	31025	-0.0041	NA	NA	NA	7.56474561042573e-12	98314473	98316278
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	98318378	98320165	3	3	-0.7598	7.56474561042573e-12	98314473	98316278	2.44422830020302e-12	98320165	98320165
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	98327582	130943064	12127	11605	0	2.44422830020302e-12	98320165	98320165	1.80413685109394e-10	130943064	130943064
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	0.8617	1.80413685109394e-10	130943064	130943064	4.61906207470122e-09	130946248	130947790
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	520	0.0252	4.61906207470122e-09	130946248	130947790	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	36969571	7039	6723	-0.0042	NA	NA	NA	6.89456546002522e-14	36969571	36969571
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36976441	36982877	2	2	0.9882	6.89456546002522e-14	36969571	36969571	5.67323241013178e-17	36982877	36982877
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36989091	36989091	1	0	NA	5.67323241013178e-17	36982877	36982877	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36993048	37953582	296	281	0.0054	NA	NA	NA	3.70141424129479e-49	37953582	37953582
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-2.2657	3.70141424129479e-49	37953582	37953582	5.20114790606072e-76	37957844	37957844
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4665	-0.0068	5.20114790606072e-76	37957844	37957844	4.82140631784745e-32	49964838	49964838
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-1.4498	4.82140631784745e-32	49964838	49964838	6.23455573145082e-32	49971732	49971732
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56650373	1804	1721	0.0036	6.23455573145082e-32	49971732	49971732	4.57243151014374e-26	56646284	56658479
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56666220	7	7	0.7107	4.57243151014374e-26	56646284	56658479	0.220589910585714	56658479	56675588
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56672324	56685341	8	8	0.8952	0.220589910585714	56658479	56675588	2.23147013681716e-48	56685341	56685341
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	100690991	13040	12423	0.002	2.23147013681716e-48	56685341	56685341	4.97144643723628e-10	100690991	100690991
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	0.8397	4.97144643723628e-10	100690991	100690991	2.98716574295585e-10	100693892	100693892
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	113788788	4410	4205	0.0104	2.98716574295585e-10	100693892	100693892	1.28191776882022e-08	113787620	113788788
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113791151	113794669	3	3	0.6344	1.28191776882022e-08	113787620	113788788	3.60178507854579e-06	113794669	113799756
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113797828	114010129	92	89	0.07	3.60178507854579e-06	113794669	113799756	4.82709484307175e-08	113979141	114031632
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	114011532	114011532	1	0	NA	4.82709484307175e-08	113979141	114031632	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	114013971	114123340	56	55	-0.1186	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18544772	6	5	-0.2169	NA	NA	NA	9.20342145274884e-07	18527871	18864561
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	19494416	54	52	-0.7179	9.20342145274884e-07	18527871	18864561	4.15269650839797e-162	19492531	19497023
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	21528132	991	957	-0.015	4.15269650839797e-162	19492531	19497023	7.27205108610281e-46	21505880	21538431
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21529816	21951294	204	195	0.1857	7.27205108610281e-46	21505880	21538431	1.45365373044975e-09	21950230	21951294
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21954022	21957214	3	3	0.7566	1.45365373044975e-09	21950230	21951294	7.0097844166327e-06	21957214	21958644
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21958644	22034704	44	41	0.2504	7.0097844166327e-06	21957214	21958644	1.01502850354211e-21	22025617	22044438
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22035729	40676611	6346	6090	-0.0029	1.01502850354211e-21	22025617	22044438	2.50221045102569e-09	40663660	40680589
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40726930	8	8	0.4038	2.50221045102569e-09	40663660	40680589	1.67507756121798e-09	40722360	40746865
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40741934	69086125	9972	9494	-0.0031	1.67507756121798e-09	40722360	40746865	4.27857547131977e-217	69086125	69086125
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69092211	3	3	-3.0663	4.27857547131977e-217	69086125	69086125	3.65283654425447e-197	69092211	69092211
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69093444	73061942	1788	1718	-0.003	3.65283654425447e-197	69092211	69092211	2.89139585285715e-13	73058103	73075500
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73092112	8	6	0.572	2.89139585285715e-13	73058103	73075500	8.5523530846554e-12	73092112	73092112
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	73104540	2	2	-0.9287	8.5523530846554e-12	73092112	73092112	2.09435652661862e-12	73104540	73104540
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73106558	105597555	12213	11671	0.0076	2.09435652661862e-12	73104540	73104540	1.27104600663877e-29	105595302	105597555
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	10	0.644	1.27104600663877e-29	105595302	105597555	5.39827277627264e-14	105632168	105673157
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105787390	21	20	0.0067	5.39827277627264e-14	105632168	105673157	3.3415893377216e-18	105787390	105787390
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105788623	105798116	6	6	-0.8241	3.3415893377216e-18	105787390	105787390	3.64962516780486e-19	105798116	105798116
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105799261	105948347	45	45	0.1492	3.64962516780486e-19	105798116	105798116	3.47405195237109e-31	105948347	105951399
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105951399	105989160	13	12	-0.7992	3.47405195237109e-31	105948347	105951399	0.000508627318421411	105977946	105989160
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105994646	106002179	4	4	-0.2695	0.000508627318421411	105977946	105989160	0.0564293835073045	105998412	106137963
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106218059	90	90	0.011	0.0564293835073045	105998412	106137963	1.65614144247529e-05	106196705	106223137
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106219784	106253648	16	16	0.2546	1.65614144247529e-05	106196705	106223137	0.000110896699101462	106249962	106279632
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106255190	106311855	23	22	0.022	0.000110896699101462	106249962	106279632	2.51580987818279e-06	106305325	106334465
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106329780	106358491	13	13	-0.3098	2.51580987818279e-06	106305325	106334465	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18692865	6	6	0.0815	NA	NA	NA	1.29096328555143e-10	18692865	18741716
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18741716	18837737	9	9	-0.7027	1.29096328555143e-10	18692865	18741716	1.23797418728398e-06	18837737	18837737
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18842565	18848213	4	4	-1.5648	1.23797418728398e-06	18837737	18837737	4.14674902153478e-10	18848213	18851513
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18851513	19845942	91	89	-0.6782	4.14674902153478e-10	18848213	18851513	3.72163883362288e-07	19839695	19845942
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19874677	19882711	3	3	0.1687	3.72163883362288e-07	19839695	19845942	0.00346273553975965	19879448	19927496
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19910696	20088256	43	40	-0.3242	0.00346273553975965	19879448	19927496	7.9796331246345e-30	20045859	20316992
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	56035000	13282	12692	-0.0041	7.9796331246345e-30	20045859	20316992	4.64450635410081e-11	56035000	56035000
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	56036057	56039530	2	2	-0.8926	4.64450635410081e-11	56035000	56035000	2.35718311953204e-11	56039530	56039530
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	56041445	74669752	8271	7888	0.0012	2.35718311953204e-11	56039530	56039530	1.04014273806221e-251	74669752	74669752
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-2.8973	1.04014273806221e-251	74669752	74669752	7.59798175880549e-252	74680439	74680439
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	92683307	6833	6529	0.005	7.59798175880549e-252	74680439	74680439	1.85950029317411e-07	92681959	92683307
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	92684402	92689467	4	4	-0.514	1.85950029317411e-07	92681959	92683307	5.92786367137805e-08	92689467	92693643
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	92691304	100298352	2770	2639	0.0032	5.92786367137805e-08	92689467	92693643	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	21258019	7255	6930	-0.0012	NA	NA	NA	1.73917494848771e-12	21244385	21382540
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	21382540	21501073	10	9	-0.4531	1.73917494848771e-12	21244385	21382540	1.37106545039872e-14	21493483	21504151
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	21504151	22338034	283	268	-0.0107	1.37106545039872e-14	21493483	21504151	3.19237152771649e-07	22315373	22541389
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22541389	22598209	8	8	-0.3436	3.19237152771649e-07	22315373	22541389	1.10973171221566e-06	22593246	22647089
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22604851	22604851	1	0	NA	1.10973171221566e-06	22593246	22647089	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22609825	28523145	2059	1965	0.0026	NA	NA	NA	3.05600516076756e-13	28512937	28523145
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	28525086	28529948	3	3	0.7858	3.05600516076756e-13	28512937	28523145	2.61721457971765e-14	28529948	28529948
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	28536745	32379126	954	904	-1e-04	2.61721457971765e-14	28529948	28529948	1.7121913553119e-52	31854794	32518665
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33559207	45	44	0.4032	1.7121913553119e-52	31854794	32518665	7.60701891556439e-51	33528385	33841331
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33647856	57203733	4291	4076	0.0055	7.60701891556439e-51	33528385	33841331	2.65003913639622e-14	57203733	57203733
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	1.0015	2.65003913639622e-14	57203733	57203733	3.45378777924389e-14	57206772	57206772
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	75093957	5612	5358	-0.0057	3.45378777924389e-14	57206772	57206772	6.61825611045199e-84	75093957	75093957
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.957	6.61825611045199e-84	75093957	75093957	6.93834972617577e-84	75100865	75100865
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76923844	609	581	0.0078	6.93834972617577e-84	75100865	75100865	4.31890255394555e-49	76923844	76931247
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76925748	76925748	1	0	NA	4.31890255394555e-49	76923844	76931247	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	0.9616	NA	NA	NA	5.64644117490387e-53	76937156	76940218
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4322	0.0111	5.64644117490387e-53	76937156	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	32850723	12432	11833	7e-04	NA	NA	NA	7.72285365291107e-11	32850723	32850723
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32853293	32854956	2	2	-0.8943	7.72285365291107e-11	32850723	32850723	7.98173508103621e-11	32854956	32854956
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32857473	34741532	608	580	-0.0011	7.98173508103621e-11	32854956	32854956	1.4965049178435e-12	34741532	34741532
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	34744317	34746057	2	2	-0.9629	1.4965049178435e-12	34741532	34741532	4.11164249379315e-13	34746057	34746057
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	34750485	36673853	827	782	-0.0014	4.11164249379315e-13	34746057	34746057	1.46075580515232e-223	36673853	36673853
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36675987	1	0	NA	1.46075580515232e-223	36673853	36673853	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36678537	36684619	5	4	2.8549	NA	NA	NA	1.30561102039305e-228	36684619	36684619
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41519702	2011	1902	0.0043	1.30561102039305e-228	36684619	36684619	5.28690133433027e-45	41514481	41522429
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41710400	67	64	0.3214	5.28690133433027e-45	41514481	41522429	1.80835977104279e-49	41704093	42148637
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	72294735	11127	10601	-0.0055	1.80835977104279e-49	41704093	42148637	6.58468969148918e-11	72294735	72294735
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	72297674	72299153	2	2	-0.8945	6.58468969148918e-11	72294735	72294735	7.92295265810297e-11	72299153	72299153
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	72303321	78653545	2550	2424	0.0158	7.92295265810297e-11	72299153	72299153	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	1712500	568	551	-0.0078	NA	NA	NA	2.25913245046303e-297	1712500	1712500
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	1715225	1828882	56	55	-0.8543	2.25913245046303e-297	1712500	1712500	1.94722304398813e-303	1828882	1828882
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	1832477	76116026	22340	21330	0.001	1.94722304398813e-303	1828882	1828882	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	56823430	19873	18941	-0.0152	NA	NA	NA	2.69920870415492e-37	56823430	56823430
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	8	-0.8353	2.69920870415492e-37	56823430	56823430	1.14982971261092e-35	56840346	56840346
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	59246409	1085	1038	-0.0306	1.14982971261092e-35	56840346	56840346	1.39426508923682e-09	59244965	59246409
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59249279	59251831	3	3	-0.7204	1.39426508923682e-09	59244965	59246409	3.59320055824895e-10	59251831	59253728
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59253728	61557826	1020	969	-0.0097	3.59320055824895e-10	59251831	59253728	3.65163275423925e-09	61556428	61557826
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	61559132	61560427	2	2	-0.8383	3.65163275423925e-09	61556428	61557826	1.33318236599193e-11	61560427	61560427
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	61566194	63788698	1068	1023	-0.01	1.33318236599193e-11	61560427	61560427	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	560	0.007	NA	NA	NA	2.79491793009718e-138	1506379	1506379
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	9	1.5223	2.79491793009718e-138	1506379	1506379	2.77991165687607e-147	1532433	1532433
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	5971189	1781	1704	-0.0073	2.77991165687607e-147	1532433	1532433	6.54318129672882e-08	5968972	5971189
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	5974162	5975657	2	2	-0.7742	6.54318129672882e-08	5968972	5971189	1.59687815683473e-10	5975657	5979410
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	5979410	62419534	19200	18354	0.0053	1.59687815683473e-10	5975657	5979410	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	22573420	3063	2932	0.0011	NA	NA	NA	7.17238013009946e-17	22573420	22573420
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	22577751	22585040	3	3	-0.8604	7.17238013009946e-17	22573420	22573420	6.48177012085751e-16	22585040	22585040
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	22589739	46922972	10375	9917	9e-04	6.48177012085751e-16	22585040	22585040	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	21571489	2520	2411	0.0049	NA	NA	NA	2.25805278514906e-08	21571489	21571489
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21574577	21576859	3	2	0.8111	2.25805278514906e-08	21571489	21571489	1.68511848263939e-09	21576859	21576859
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21579649	32110063	5523	5247	0.0118	1.68511848263939e-09	21576859	21576859	1.06546150312097e-11	32110063	32110063
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	32110939	32112051	2	2	-0.9158	1.06546150312097e-11	32110063	32110063	1.06905979060242e-11	32112051	32112051
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	32114341	49571068	8508	8138	0.0132	1.06905979060242e-11	32112051	32112051	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	127113	30	29	-0.1536	NA	NA	NA	5.59519813097208e-11	124528	127113
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127779	129104	2	0	NA	5.59519813097208e-11	124528	127113	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	129544	130528	2	2	1.2518	NA	NA	NA	3.49150521044689e-21	130528	130528
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	845758	533	504	0.0131	3.49150521044689e-21	130528	130528	3.17067609798336e-07	840228	848806
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	848806	859452	9	9	0.361	3.17067609798336e-07	840228	848806	1.65523240620079e-08	856655	861050
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	859493	1751766	475	448	0.0076	1.65523240620079e-08	856655	861050	2.48978181790973e-30	1751766	1751766
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1753446	1755168	3	3	-1.1274	2.48978181790973e-30	1751766	1751766	4.59838469188159e-23	1755168	1755168
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1755974	2672401	712	675	-0.0066	4.59838469188159e-23	1755168	1755168	4.01875203420254e-10	2668473	2696434
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672477	2708291	27	27	-0.2697	4.01875203420254e-10	2668473	2696434	1.51711925552024e-121	2708291	2711273
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	8417817	1777	1705	0.831	1.51711925552024e-121	2708291	2711273	1.47878593940501e-14	8375481	8447855
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8420787	8475091	23	21	0.5454	1.47878593940501e-14	8375481	8447855	2.26465080920282e-33	8450789	8487546
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8477126	154038318	43201	41196	0.8748	2.26465080920282e-33	8450789	8487546	8.97663257723846e-35	154038318	154038318
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154070953	9	8	1.8493	8.97663257723846e-35	154038318	154038318	8.54430345656258e-32	154070953	154078401
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154078401	154582414	124	118	0.8606	8.54430345656258e-32	154070953	154078401	5.34076637837062e-295	154578922	154582414
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	195	0.0074	5.34076637837062e-295	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	116	-2.9311	NA	NA	NA	9.45031127428532e-23	3223585	3772482
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-0.5353	9.45031127428532e-23	3223585	3772482	1.05524664833401e-14	5531459	6652845
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6953343	118	110	-2.7226	1.05524664833401e-14	5531459	6652845	0.000112475642225985	6907614	7009137
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6954864	7259689	111	103	-2.0713	0.000112475642225985	6907614	7009137	0.000351116079665246	7219774	7273713
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7261174	7304209	23	21	-1.0582	0.000351116079665246	7219774	7273713	0.000495131328108412	7292494	7339162
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7305143	7645258	77	71	-2.1875	0.000495131328108412	7292494	7339162	0.000146647494768968	7572591	7658121
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7647060	7709619	40	37	-3.1308	0.000146647494768968	7572591	7658121	1.51858814375970e-11	7705876	7714929
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7782532	27	24	-1.5648	1.5185881437597e-11	7705876	7714929	0.0024915482116924	7740903	7835361
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	8036254	64	62	-2.4459	0.0024915482116924	7740903	7835361	6.61559411624208e-05	7919636	8069958
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8043008	8241630	54	48	-3.2185	6.61559411624208e-05	7919636	8069958	7.36445957523015e-05	8193270	8308608
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8245608	8533866	63	59	-2.5408	7.36445957523015e-05	8193270	8308608	0.000212977869750815	8463583	8544417
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8536761	8572180	27	24	-1.7366	0.000212977869750815	8463583	8544417	2.69117366207912e-05	8566630	8647327
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8573273	10513747	221	205	-2.7073	2.69117366207912e-05	8566630	8647327	1.55413777430028e-17	10511255	10515697
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	12	-0.3214	1.55413777430028e-17	10511255	10515697	0.110410714992753	10617908	11660512
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	11698871	6	6	-1.1972	0.110410714992753	10617908	11660512	0.00906750552591807	10655750	12511461
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12541506	12	12	-2.5584	0.00906750552591807	10655750	12511461	6.05268857263787e-06	12533900	12554612
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	53	-1.3207	6.05268857263787e-06	12533900	12554612	2.33683147465493e-10	12668435	12696242
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12733867	9	9	-3.2298	2.33683147465493e-10	12668435	12696242	1.42790759688572e-05	12721434	12772155
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12741404	13104920	117	112	-1.6455	1.42790759688572e-05	12721434	12772155	0.033348363960555	12973899	13109337
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13106723	13129843	10	10	-0.7212	0.033348363960555	12973899	13109337	3.06745200897086e-12	13129843	13136828
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13823928	246	231	-2.8088	3.06745200897086e-12	13129843	13136828	4.43100026183272e-05	13784030	13836933
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13828384	13863657	8	8	-1.2847	4.43100026183272e-05	13784030	13836933	2.25401848484801e-07	13863616	13869106
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13866668	14354682	159	148	-3.0108	2.25401848484801e-07	13863616	13869106	2.48485180163922e-11	14343139	14354682
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14356069	14377844	12	12	-1.2731	2.48485180163922e-11	14343139	14354682	7.26278767708128e-24	14377844	14377844
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14379418	14388689	9	9	-3.4953	7.26278767708128e-24	14377844	14377844	0.000416253552604779	14386474	14411982
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14390028	14503185	67	65	-2.274	0.000416253552604779	14386474	14411982	0.0179490292270755	14456240	14503927
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14503927	14508021	3	3	-3.7399	0.0179490292270755	14456240	14503927	5.44481882516675e-07	14508021	14524829
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	5.44481882516675e-07	14508021	14524829	NA	NA	NA
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	22	-1.227	NA	NA	NA	2.97951022431561e-07	14572190	14585542
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14598838	6	6	-3.3215	2.97951022431561e-07	14572190	14585542	5.75563284519099e-07	14596156	14598838
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14601309	14644293	4	4	-0.5464	5.75563284519099e-07	14596156	14598838	0.000277706031799733	14644293	14685149
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	14700040	13	13	-2.0492	0.000277706031799733	14644293	14685149	0.141590232515146	14687556	15053453
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14701706	15139441	90	86	-2.7331	0.141590232515146	14687556	15053453	0.000117387162841213	15095427	15144239
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15140278	15165820	17	17	-1.6858	0.000117387162841213	15095427	15144239	1.40390180442580e-06	15158623	15171394
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15169415	15206674	21	20	-2.8076	1.4039018044258e-06	15158623	15171394	5.20531332700639e-11	15205160	15208612
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15207522	15241527	12	12	-1.1922	5.20531332700639e-11	15205160	15208612	5.67432288794512e-09	15228303	15244992
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15242592	15396880	101	96	-2.7573	5.67432288794512e-09	15228303	15244992	0.000661626828973052	15358372	15452656
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15397704	15590299	100	93	-2.208	0.000661626828973052	15358372	15452656	0.0376723438717916	15445193	15590299
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15595870	15617621	4	4	-3.6909	0.0376723438717916	15445193	15590299	1.61901503634172e-11	15617621	15617621
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15621613	15655003	7	6	-1.7628	1.61901503634172e-11	15617621	15617621	8.85817729467268e-05	15655003	15690301
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15658114	15915466	42	39	-2.8761	8.85817729467268e-05	15655003	15690301	1.66074843011329e-12	15898644	15951430
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16094964	74	67	-1.7548	1.66074843011329e-12	15898644	15951430	4.2537981603525e-08	16091622	16094964
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16096672	16102267	4	4	-4.2597	4.2537981603525e-08	16091622	16094964	2.29103122911567e-08	16102267	16103913
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16103913	16177411	26	25	-1.8993	2.29103122911567e-08	16102267	16103913	0.00348911887990650	16165328	16215750
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16178192	16387273	58	54	-2.6348	0.0034891188799065	16165328	16215750	5.78937350265796e-05	16290147	16457556
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	16659030	39	36	-3.4615	5.78937350265796e-05	16290147	16457556	0.000176365829507790	16607621	16729877
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16660742	22139807	899	845	-2.6832	0.00017636582950779	16607621	16729877	1.12700784402962e-05	22049641	22157319
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-0.9649	1.12700784402962e-05	22049641	22157319	2.38360822506588e-06	22176501	22178964
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22192409	5	5	-2.3031	2.38360822506588e-06	22176501	22178964	0.000149029419783869	22192409	22204143
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22200078	22261337	22	22	-3.8743	0.000149029419783869	22192409	22204143	1.01834183924263e-05	22243796	22382215
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22263267	22930737	66	61	-2.8129	1.01834183924263e-05	22243796	22382215	4.27042758830551e-28	22923722	26871442
MSK_252152918373_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	81	-1.0683	4.27042758830551e-28	22923722	26871442	NA	NA	NA
