Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	12761998	4513	4358	0.014	NA	NA	NA	9.22272457700561e-11	12759176	12769521
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12762774	12839991	8	8	-0.5342	9.22272457700561e-11	12759176	12769521	3.68543254687007e-11	12793354	13104898
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	13101056	34869589	8373	8086	0.0152	3.68543254687007e-11	12793354	13104898	4.64934851743823e-10	34859068	34869589
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34876833	34883375	4	4	-0.7239	4.64934851743823e-10	34859068	34869589	5.98821791294768e-10	34883375	34884849
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34884849	72525842	14990	14512	0.0018	5.98821791294768e-10	34883375	34884849	2.54594704190998e-07	72523186	72533856
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72528790	72537426	6	6	-0.5138	2.54594704190998e-07	72523186	72533856	8.44945911533845e-36	72537426	72537426
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	1.6074	8.44945911533845e-36	72537426	72537426	4.47720588952792e-172	72579311	72579311
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	150823073	17557	16985	0.0013	4.47720588952792e-172	72579311	72579311	2.08680027955254e-31	150823073	150836484
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150851439	10	10	0.7921	2.08680027955254e-31	150823073	150836484	1.11066073437123e-31	150847304	150851439
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	200616638	18232	17642	0.0022	1.11066073437123e-31	150847304	150851439	6.24479469425302e-11	200598243	200633348
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200618814	200673525	22	22	-0.3184	6.24479469425302e-11	200598243	200633348	3.00274395835344e-10	200661094	200696309
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200676505	247186514	17419	16914	-0.0044	3.00274395835344e-10	200661094	200696309	NA	NA	NA
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	3708749	1388	1339	0.0117	NA	NA	NA	5.25788211278661e-08	3707057	3708749
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	3713664	3714236	3	3	-0.751	5.25788211278661e-08	3707057	3708749	1.78920703144765e-08	3714236	3718746
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	3718746	13113316	2771	2692	0.0056	1.78920703144765e-08	3714236	3718746	5.41330033310273e-20	13103660	13113316
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	13119002	13199426	14	14	0.5346	5.41330033310273e-20	13103660	13113316	9.50894392019984e-20	13199426	13202691
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	13200787	34542224	7345	7128	-0.0017	9.50894392019984e-20	13199426	13202691	2.42237535284790e-59	34539740	34542224
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34543992	34543992	1	0	NA	2.4223753528479e-59	34539740	34542224	NA	NA	NA
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	18	0.8096	NA	NA	NA	1.79513428173968e-61	34589997	34591681
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	52600588	7192	6933	-0.0049	1.79513428173968e-61	34589997	34591681	6.60035786060889e-12	52588009	52600588
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	6.60035786060889e-12	52588009	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	0.7717	NA	NA	NA	1.08015110211748e-12	52635695	52639605
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	66357387	4557	4399	-0.007	1.08015110211748e-12	52635695	52639605	2.44597120353091e-19	66357387	66357387
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	1.3416	2.44597120353091e-19	66357387	66357387	2.61290479741965e-17	66360747	66360747
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	122537188	14954	14484	9e-04	2.61290479741965e-17	66360747	66360747	6.03376129598908e-10	122532860	122537188
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	122541719	122545026	2	2	-1.0324	6.03376129598908e-10	122532860	122537188	1.34022920973912e-10	122545026	122545026
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	122549510	146571330	6822	6599	-5e-04	1.34022920973912e-10	122545026	122545026	5.93114868702978e-33	146571330	146571330
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	1.2605	5.93114868702978e-33	146571330	146571330	4.25859909596206e-33	146592775	146592775
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	175495923	9563	9249	-0.0061	4.25859909596206e-33	146592775	146592775	1.82414334579030e-15	175493455	175495923
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	175497702	175502778	4	4	-0.8824	1.8241433457903e-15	175493455	175495923	1.59016838097719e-15	175502778	175504117
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	175504117	242689978	23182	22406	8e-04	1.59016838097719e-15	175502778	175504117	NA	NA	NA
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	46769081	15925	15420	0.0018	NA	NA	NA	2.36320202855109e-58	46769081	46769081
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46771035	46825048	8	7	-1.2505	2.36320202855109e-58	46769081	46769081	3.98252650855165e-56	46825048	46825048
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46827727	163992903	37555	36343	-8e-04	3.98252650855165e-56	46825048	46825048	5.60145009478368e-86	163989367	163997228
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164107951	28	28	0.7705	5.60145009478368e-86	163989367	163997228	1.16954233449497e-85	164101776	164112873
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	194354505	10130	9790	-0.001	1.16954233449497e-85	164101776	164112873	3.20915033503227e-117	194354505	194354505
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-1.9447	3.20915033503227e-117	194354505	194354505	1.14533960886550e-107	194366950	194366950
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	199329592	1980	1900	-0.0027	1.1453396088655e-107	194366950	194366950	NA	NA	NA
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	191153613	55161	53446	-0.003	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	93651520	26186	25366	-0.0028	NA	NA	NA	4.99550831895562e-28	93651520	93658878
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	93658878	93672362	8	8	-0.8319	4.99550831895562e-28	93651520	93658878	2.87693650492296e-28	93670324	93673936
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	93673936	177319638	26256	25394	7e-04	2.87693650492296e-28	93670324	93673936	2.58973013238645e-15	177317688	177319638
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	177322431	177333426	5	4	-0.8776	2.58973013238645e-15	177317688	177319638	1.15726225076110e-13	177333426	177340297
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	177340297	180644810	1311	1273	0.0096	1.1572622507611e-13	177333426	177340297	NA	NA	NA
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	29950805	10587	10285	-0.0011	NA	NA	NA	3.68374862563213e-08	29937319	29973024
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	29998009	11	11	0.3883	3.68374862563213e-08	29937319	29973024	1.39853460741173e-06	29981912	30021908
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30000990	31390982	587	563	0.012	1.39853460741173e-06	29981912	30021908	2.35730810718488e-06	31389372	31390982
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31393624	31418006	3	3	0.7124	2.35730810718488e-06	31389372	31390982	1.84369978388763e-07	31418006	31425113
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	32558677	489	474	0.0098	1.84369978388763e-07	31418006	31425113	2.7000541800466e-32	32558677	32564884
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32597877	8	8	-0.8936	2.7000541800466e-32	32558677	32564884	2.35527654179584e-08	32590568	32605300
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32600962	32711957	36	35	-0.1228	2.35527654179584e-08	32590568	32605300	9.37183623884734e-11	32709263	32718991
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32713363	32728487	9	8	-1.1019	9.37183623884734e-11	32709263	32718991	7.00389375234433e-41	32721872	32728487
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	35864636	1347	1307	-0.0012	7.00389375234433e-41	32721872	32728487	2.95066803701019e-11	35862270	35870753
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35866245	35887585	11	11	-0.4955	2.95066803701019e-11	35862270	35870753	7.15150321728571e-14	35880489	35891023
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35889353	54035000	6901	6673	0.0045	7.15150321728571e-14	35880489	35891023	4.978314616086e-48	54035000	54035000
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-1.7449	4.978314616086e-48	54035000	54035000	6.49760172646901e-48	54042734	54042734
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	165643653	34317	33247	-0.005	6.49760172646901e-48	54042734	54042734	1.46844364979982e-27	165643653	165643653
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165649379	3	3	-1.3343	1.46844364979982e-27	165643653	165643653	6.62889252629727e-24	165649379	165649379
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165650610	170753106	1805	1746	0.0036	6.62889252629727e-24	165649379	165649379	NA	NA	NA
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	118611324	39265	38061	-0.0025	NA	NA	NA	7.67947066266106e-40	118611324	118611324
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	-1.6225	7.67947066266106e-40	118611324	118611324	3.68760855499282e-36	118620875	118620875
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	120089714	604	585	0.0084	3.68760855499282e-36	118620875	118620875	2.74975983762848e-15	120087494	120089714
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	120092153	120098907	5	5	-0.8189	2.74975983762848e-15	120087494	120089714	4.33874144960317e-16	120098907	120101979
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	120101979	141410894	9926	9590	-0.0032	4.33874144960317e-16	120098907	120101979	4.98736795224477e-09	141406414	141417702
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	12	0.3982	4.98736795224477e-09	141406414	141417702	3.02424621224908e-08	141431668	141443577
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	141690753	117	113	0.0098	3.02424621224908e-08	141431668	141443577	3.74526666488401e-79	141690753	141700432
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141711513	8	8	-1.8486	3.74526666488401e-79	141690753	141700432	2.09167913315173e-75	141707826	141711513
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141712786	142156165	170	167	0.033	2.09167913315173e-75	141707826	141711513	7.79987933438253e-18	142152205	142161005
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142159173	142167908	5	5	-1.0129	7.79987933438253e-18	142152205	142161005	2.43028907000088e-20	142166710	142176074
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142176074	142526341	150	145	0.0038	2.43028907000088e-20	142166710	142176074	2.13928789042414e-64	142526254	142535936
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142535936	142602080	33	31	-0.7599	2.13928789042414e-64	142526254	142535936	3.74697741054797e-82	142600731	142605735
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142605735	145624787	1135	1099	-0.0098	3.74697741054797e-82	142600731	142605735	1.40401251308416e-10	145624787	145624787
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	145628790	145631369	2	2	-1.0653	1.40401251308416e-10	145624787	145624787	2.74620151472948e-10	145631369	145631369
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	145637032	158821263	5259	5095	-0.0022	2.74620151472948e-10	145631369	145631369	NA	NA	NA
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	25120552	8159	7906	-0.0036	NA	NA	NA	7.48495366958653e-09	25119007	25120552
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25125700	3	3	-0.8073	7.48495366958653e-09	25119007	25120552	8.4320327824337e-10	25125700	25127887
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	32797545	3031	2931	-0.0092	8.4320327824337e-10	25125700	25127887	3.24889376548321e-08	32797545	32797545
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32800775	32800775	1	0	NA	3.24889376548321e-08	32797545	32797545	NA	NA	NA
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32805686	32808049	2	2	0.8899	NA	NA	NA	4.20932057172994e-08	32808049	32808049
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32812909	39350798	1878	1814	-4e-04	4.20932057172994e-08	32808049	32808049	9.05225629598774e-176	39350798	39352361
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	57	0.7669	9.05225629598774e-176	39350798	39352361	2.26741212187104e-166	39500219	39508035
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	51191560	2179	2111	-0.0105	2.26741212187104e-166	39500219	39508035	5.14907424367001e-09	51189068	51191560
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51193977	51193977	1	0	NA	5.14907424367001e-09	51189068	51191560	NA	NA	NA
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51196227	51200291	3	3	-0.8104	NA	NA	NA	1.34789408272568e-09	51200291	51204788
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51202490	51202490	1	0	NA	1.34789408272568e-09	51200291	51204788	NA	NA	NA
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51204788	87255865	10503	10158	-0.0045	NA	NA	NA	9.0021580609527e-10	87255865	87255865
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87258019	87258019	1	0	NA	9.0021580609527e-10	87255865	87255865	NA	NA	NA
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87259940	87262662	2	2	-0.9998	NA	NA	NA	1.60159753197579e-09	87262662	87262662
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87265435	145330767	18442	17887	-2e-04	1.60159753197579e-09	87262662	87262662	1.35964417559598e-08	145330767	145330767
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	145333207	145334573	2	2	-0.9542	1.35964417559598e-08	145330767	145330767	7.05015707493543e-08	145334573	145336073
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	145336073	146264846	299	284	0.0221	7.05015707493543e-08	145334573	145336073	NA	NA	NA
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	22477358	7837	7610	-0.0036	NA	NA	NA	1.47018186633791e-11	22477358	22477358
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	-1.0719	1.47018186633791e-11	22477358	22477358	3.88294729856e-11	22492603	22492603
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	129221786	25667	24843	-0.0036	3.88294729856e-11	22492603	22492603	4.67101466843635e-39	129221786	129221786
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	129223189	129224728	2	2	-1.9471	4.67101466843635e-39	129221786	129221786	3.96784349488237e-33	129224728	129224728
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	129226241	137352394	3331	3207	0.0064	3.96784349488237e-33	129224728	129224728	9.14697194083445e-15	137352394	137352394
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.3235	9.14697194083445e-15	137352394	137352394	6.64413580202995e-14	137356880	137356880
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1069	-0.0037	6.64413580202995e-14	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	152490	12	11	0.5006	NA	NA	NA	2.32242352383931e-13	145855	159377
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	154594	13553503	4670	4532	-0.0058	2.32242352383931e-13	145855	159377	7.19737932110585e-08	13551930	13553503
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13555034	13556315	2	2	-0.928	7.19737932110585e-08	13551930	13553503	3.00481444732532e-08	13556315	13557998
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13557998	27038538	5045	4869	-0.0142	3.00481444732532e-08	13556315	13557998	8.68157972792647e-21	27038538	27038538
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	1.4063	8.68157972792647e-21	27038538	27038538	5.92470929753785e-19	27041812	27041812
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	135285645	35077	33996	-0.0011	5.92470929753785e-19	27041812	27041812	NA	NA	NA
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5741031	2138	2076	-0.0016	NA	NA	NA	1.51472101084570e-19	5738494	5742476
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	13	-0.5879	1.5147210108457e-19	5738494	5742476	1.56890517901355e-22	5763749	5766615
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	55118214	14752	14270	0.0022	1.56890517901355e-22	5763749	5766615	3.01890423724589e-60	55112618	55124730
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55217189	40	39	-0.5495	3.01890423724589e-60	55112618	55124730	3.6455555203986e-61	55207305	55219985
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	66463477	4637	4496	0.0115	3.6455555203986e-61	55207305	55219985	1.3739519189044e-09	66463477	66463477
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	1.0126	1.3739519189044e-09	66463477	66463477	4.98955911922741e-09	66469412	66469412
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	69717629	1058	1024	-2e-04	4.98955911922741e-09	66469412	66469412	2.68126416350487e-07	69715296	69719071
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	69719071	69727018	4	4	-0.649	2.68126416350487e-07	69715296	69719071	1.55987598384927e-08	69727018	69728478
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	69728478	81530809	4253	4101	0.0085	1.55987598384927e-08	69727018	69728478	3.69359402787867e-148	81530809	81530809
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81536990	81540765	3	3	-3.0524	3.69359402787867e-148	81530809	81530809	1.52434624483461e-147	81540765	81540765
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81544262	134450318	18402	17787	0.0014	1.52434624483461e-147	81540765	81540765	NA	NA	NA
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	11104973	4325	4174	0.0042	NA	NA	NA	9.99722263601396e-07	11093358	11116883
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11109483	11140421	11	11	0.3681	9.99722263601396e-07	11093358	11116883	5.30083805455663e-07	11126558	11163596
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	11395862	70	70	-0.0291	5.30083805455663e-07	11126558	11163596	4.11643878443893e-19	11393473	11395862
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11435643	6	5	0.9119	4.11643878443893e-19	11393473	11395862	1.53499127841774e-20	11435643	11435643
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	130694393	40103	38790	4e-04	1.53499127841774e-20	11435643	11435643	2.97722373920021e-17	130694393	130694393
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	1.3274	2.97722373920021e-17	130694393	130694393	1.10425530745005e-16	130701040	130701040
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	622	-0.0045	1.10425530745005e-16	130701040	130701040	NA	NA	NA
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	34578806	6015	5833	-0.008	NA	NA	NA	1.87420757785270e-07	34568451	34582845
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	34580008	34613316	17	17	0.2978	1.8742075778527e-07	34568451	34582845	9.6702748253204e-08	34606866	34628064
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	34614409	49964838	6187	5997	-0.0044	9.6702748253204e-08	34606866	34628064	1.63927615046103e-11	49964838	49964838
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	1.0556	1.63927615046103e-11	49964838	49964838	1.10308858355134e-10	49971732	49971732
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56657371	1805	1764	0.0041	1.10308858355134e-10	49971732	49971732	3.83340747776787e-34	56650373	56657371
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56658479	56681665	13	13	0.7315	3.83340747776787e-34	56650373	56657371	1.40009980264713e-35	56681665	56685341
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56685341	63118944	1461	1413	0.0023	1.40009980264713e-35	56681665	56685341	1.24132816624758e-07	63118944	63118944
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	63123793	63130828	2	2	-0.8757	1.24132816624758e-07	63118944	63118944	4.09769440441496e-08	63130828	63130828
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	63140078	71373779	2160	2089	0.0146	4.09769440441496e-08	63130828	63130828	2.35203807773576e-18	71373779	71373779
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71375082	71377671	3	3	-1.0629	2.35203807773576e-18	71373779	71373779	3.42957283880117e-18	71377671	71377671
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	89657473	4627	4491	0.0046	3.42957283880117e-18	71377671	71377671	1.13577686153042e-13	89657473	89657473
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89659397	89659397	1	0	NA	1.13577686153042e-13	89657473	89657473	NA	NA	NA
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	-1.1351	NA	NA	NA	1.16501211024743e-12	89662326	89662326
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	101577905	5250	5073	-0.0052	1.16501211024743e-12	89662326	89662326	2.80437193400869e-13	101575763	101577905
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	101582092	101587700	4	4	-0.8227	2.80437193400869e-13	101575763	101577905	8.8528351513527e-13	101587700	101590054
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	101590054	114123340	4095	3961	-9e-04	8.8528351513527e-13	101587700	101590054	NA	NA	NA
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	57	-0.2529	NA	NA	NA	1.48005658404957e-18	19471494	19549728
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	40676611	7588	7369	0.0013	1.48005658404957e-18	19471494	19549728	8.68262286930335e-11	40663660	40676611
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40722360	7	7	-0.5557	8.68262286930335e-11	40663660	40676611	2.62435759590339e-10	40722360	40741934
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40726930	69086125	9973	9616	-0.0048	2.62435759590339e-10	40722360	40741934	2.96620859051652e-13	69086125	69086125
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69092211	3	3	0.9424	2.96620859051652e-13	69086125	69086125	1.15488136713469e-12	69092211	69092211
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69093444	73071404	1789	1717	7e-04	1.15488136713469e-12	69092211	69092211	4.83523864239789e-14	73061942	73071404
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73072457	1	0	NA	4.83523864239789e-14	73061942	73071404	NA	NA	NA
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73075500	73092112	6	6	0.7029	NA	NA	NA	6.38632797844878e-14	73092112	73101327
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	105607572	12218	11841	0.0038	6.38632797844878e-14	73092112	73101327	2.14076565391016e-13	105602602	105609466
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105609466	105632168	9	9	0.5641	2.14076565391016e-13	105602602	105609466	4.23213284420964e-15	105630089	105673157
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105788623	22	20	-0.0267	4.23213284420964e-15	105630089	105673157	7.29259341736135e-11	105787390	105788623
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105789767	105795807	4	4	-0.7417	7.29259341736135e-11	105787390	105788623	1.91944824270581e-07	105795807	105798116
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105798116	105839439	18	18	-0.0014	1.91944824270581e-07	105795807	105798116	7.08995529657316e-05	105829955	105848335
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105843086	105881893	11	11	0.3996	7.08995529657316e-05	105829955	105848335	7.29178386059121e-07	105874293	105898108
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	105948347	17	16	-0.021	7.29178386059121e-07	105874293	105898108	1.28315570612593e-10	105948347	105961558
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105951399	106002179	17	15	-0.626	1.28315570612593e-10	105948347	105961558	1.93006302331634e-23	105996176	106015449
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106013552	1	0	NA	1.93006302331634e-23	105996176	106015449	NA	NA	NA
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106015449	106358491	141	137	0.0153	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18692865	6	5	0.0342	NA	NA	NA	0.0837567459801197	18427151	19346028
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18741716	19537035	93	91	0.3436	0.0837567459801197	18427151	19346028	0.00311798057994675	19389869	19803092
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	19800789	1	0	NA	0.00311798057994675	19389869	19803092	NA	NA	NA
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19803092	19835471	7	7	0.6899	NA	NA	NA	0.00361459063982490	19833542	19874677
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19839695	19882711	6	6	1.073	0.0036145906398249	19833542	19874677	1.32308051924605e-06	19874677	19927040
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19910696	20088256	43	41	0.5717	1.32308051924605e-06	19874677	19927040	1.40494289889e-66	20079935	20308014
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	98232932	30252	29284	-6e-04	1.40494289889e-66	20079935	20308014	1.14147706373553e-19	98232932	98232932
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98239454	3	3	1.1679	1.14147706373553e-19	98232932	98232932	2.04551065576344e-20	98239454	98239454
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	99632987	637	619	-0.0151	2.04551065576344e-20	98239454	98239454	2.30802415848706e-07	99630163	99632987
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99636724	3	3	0.7056	2.30802415848706e-07	99630163	99632987	1.51478453343111e-05	99636724	99638766
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99637714	100298352	271	265	0.0125	1.51478453343111e-05	99636724	99638766	NA	NA	NA
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	76923844	21135	20427	0.0029	NA	NA	NA	3.19957300806055e-50	76923844	76929598
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76925748	76925748	1	0	NA	3.19957300806055e-50	76923844	76929598	NA	NA	NA
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	1.1314	NA	NA	NA	4.07069152069435e-46	76938723	76940218
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4353	-1e-04	4.07069152069435e-46	76938723	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	36673853	13871	13410	0.0056	NA	NA	NA	3.34278205845485e-90	36673853	36673853
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	1.7694	3.34278205845485e-90	36673853	36673853	2.21491103380721e-90	36684619	36684619
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41552048	2025	1947	0.0174	2.21491103380721e-90	36684619	36684619	2.12390229240382e-26	41542491	41561017
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41553226	42155643	60	59	-0.2871	2.12390229240382e-26	41542491	41561017	1.01769803193003e-23	42147225	42168548
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42158650	78653545	13672	13205	0.0046	1.01769803193003e-23	42147225	42168548	NA	NA	NA
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	11957806	4097	3996	-0.0027	NA	NA	NA	2.68838837024971e-13	11956060	11963520
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	11960746	11976735	7	7	-0.6134	2.68838837024971e-13	11956060	11963520	9.48355004668955e-13	11972960	11979412
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	11979412	76116026	18860	18222	-0.0034	9.48355004668955e-13	11972960	11979412	NA	NA	NA
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	3591120	1536	1477	-0.0175	NA	NA	NA	1.05265124682623e-07	3586215	3591120
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3592564	3596968	3	3	-0.835	1.05265124682623e-07	3586215	3591120	5.56743060560351e-09	3596968	3599322
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3599322	56823430	18334	17740	1e-04	5.56743060560351e-09	3596968	3599322	5.84910404023728e-17	56822197	56828073
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	8	-0.688	5.84910404023728e-17	56822197	56828073	1.86873104437564e-16	56833054	56842447
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	58208527	586	569	-0.0244	1.86873104437564e-16	56833054	56842447	9.38421100069927e-07	58194876	58219286
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58212113	58241773	14	14	-0.3489	9.38421100069927e-07	58194876	58219286	2.93027499525754e-07	58234974	58259101
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58244012	63788698	2578	2478	-0.0035	2.93027499525754e-07	58234974	58259101	NA	NA	NA
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1516966	589	565	0.0029	NA	NA	NA	1.00034775029952e-53	1516966	1521410
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1518825	1531162	6	6	-1.4165	1.00034775029952e-53	1516966	1521410	1.54341075142527e-59	1525300	1531162
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	20301	0.0019	1.54341075142527e-59	1525300	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13018	-0.0016	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	16521073	406	391	-0.0083	NA	NA	NA	3.93211028414971e-08	16519953	16521073
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16523019	16524408	2	2	-0.9824	3.93211028414971e-08	16519953	16521073	1.52380178800801e-08	16524408	16525922
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16525922	22667608	2575	2507	0.0127	1.52380178800801e-08	16524408	16525922	9.62118056975927e-113	22667608	22679305
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	21	-1.0944	9.62118056975927e-113	22667608	22679305	7.63811311134646e-124	22720195	22725305
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	37621766	7737	7486	0.0154	7.63811311134646e-124	22720195	22725305	2.09864893197287e-42	37621766	37621766
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37624278	37626069	2	2	-2.0852	2.09864893197287e-42	37621766	37621766	8.25081437910613e-39	37626069	37626069
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37633961	49571068	5813	5613	0.0066	8.25081437910613e-39	37626069	37626069	NA	NA	NA
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.0815	NA	NA	NA	1.01487062083297e-08	4926	95819
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	109064	10	9	-0.6365	1.01487062083297e-08	4926	95819	1.34051459442922e-14	106242	110583
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	110101	1182356	674	661	0.0088	1.34051459442922e-14	106242	110583	1.61967579585873e-07	1176629	1282772
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1274736	1322183	14	14	0.3851	1.61967579585873e-07	1176629	1282772	6.58550565076511e-08	1306664	1331177
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1328203	1427392	83	79	0.0249	6.58550565076511e-08	1306664	1331177	5.42364744313547e-15	1427338	1431240
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-0.9457	5.42364744313547e-15	1427338	1431240	1.82416802297844e-13	1432891	1435082
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	1434970	1	0	NA	1.82416802297844e-13	1432891	1435082	NA	NA	NA
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1435082	2708291	1001	970	-0.0039	NA	NA	NA	0	2708113	2711273
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	56800429	18994	18377	0.7891	0	2708113	2711273	7.87575342141788e-19	56789179	56810806
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	56802632	56848661	19	19	0.3859	7.87575342141788e-19	56789179	56810806	6.74356016264002e-22	56838339	56861669
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	56855445	154582414	26121	25283	0.7896	6.74356016264002e-22	56838339	56861669	0	154578922	154582414
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	195	0.015	0	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	120	-1.935	NA	NA	NA	3.60817530594241e-07	2954827	3772482
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-0.6263	3.60817530594241e-07	2954827	3772482	2.21978356002143e-07	5531459	6715636
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6951372	117	113	-2.1791	2.21978356002143e-07	5531459	6715636	0.0144777802214729	6913973	6953343
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6953343	6965062	9	9	-0.9638	0.0144777802214729	6913973	6953343	1.16695425169623e-06	6960403	6965062
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6966186	6973086	6	6	-2.2382	1.16695425169623e-06	6960403	6965062	3.93486805393844e-05	6969601	6993680
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6983447	7040494	34	34	-1.0899	3.93486805393844e-05	6969601	6993680	2.49050757624647e-20	7039999	7040494
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7041712	7051884	7	7	-3.151	2.49050757624647e-20	7039999	7040494	5.51216595997548e-05	7051884	7073916
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7653082	161	153	-1.4516	5.51216595997548e-05	7051884	7073916	0.000162810301330422	7643041	7653082
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7663037	6	6	-3.199	0.000162810301330422	7643041	7653082	2.80541681788043e-05	7663037	7668037
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7664085	7914104	96	95	-1.5332	2.80541681788043e-05	7663037	7668037	2.88618332163249e-06	7848999	7999759
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	8293425	87	80	-2.2315	2.88618332163249e-06	7848999	7999759	1.84063318005754e-06	8195174	8333193
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8294345	8690572	111	105	-1.5855	1.84063318005754e-06	8195174	8333193	0.00185430874579039	8585933	8907181
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8692156	10513747	191	183	-2.0169	0.00185430874579039	8585933	8907181	6.54954267942069e-26	10480759	10617908
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	13129843	221	215	-1.0812	6.54954267942069e-26	10480759	10617908	1.43316779009520e-26	13104920	13153117
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	14342834	408	397	-1.8666	1.4331677900952e-26	13104920	13153117	2.74020919145470e-05	14056906	14457286
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	15276098	309	302	-1.53	2.7402091914547e-05	14056906	14457286	0.00600669802132837	15155598	15293299
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15277060	15329893	38	36	-2.0371	0.00600669802132837	15155598	15293299	4.93469041764506e-06	15319560	15335578
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15330645	15360059	17	17	-2.9977	4.93469041764506e-06	15319560	15335578	1.99795935460630e-08	15355928	15367176
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15362520	15587741	121	118	-1.6906	1.9979593546063e-08	15355928	15367176	0.000433898450828676	15538983	15699459
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15590299	15915466	54	53	-2.291	0.000433898450828676	15538983	15699459	5.79963579549036e-12	15873423	15932535
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16006096	33	33	-1.0396	5.79963579549036e-12	15873423	15932535	1.46880249301326e-05	15987432	16065378
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16007396	22192409	1081	1044	-1.8696	1.46880249301326e-05	15987432	16065378	4.03095453513625e-05	22055660	22208351
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22200078	22200078	1	0	NA	4.03095453513625e-05	22055660	22208351	NA	NA	NA
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22202315	22308420	24	23	-2.8246	NA	NA	NA	2.08859018494505e-07	22252446	22382215
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22367156	22877495	45	42	-1.6864	2.08859018494505e-07	22252446	22382215	3.4578499240439e-07	22866553	22878671
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22878671	22914005	10	10	-3.1243	3.4578499240439e-07	22866553	22878671	0.00222532218680924	22912987	22923722
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22915679	22930737	8	8	-1.6986	0.00222532218680924	22912987	22923722	0.00466167759327731	22916746	26924187
MSK_252152918374_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	85	-0.8706	0.00466167759327731	22916746	26924187	NA	NA	NA
