Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	554287	16799711	5783	5587	0.0022	NA	NA	NA	2.04676218169396e-19	16668773	16836160
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	16814050	17086698	14	13	-0.4254	2.04676218169396e-19	16668773	16836160	1.66683212646916e-08	16961001	17104345
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	17094326	24382086	3032	2927	-0.0082	1.66683212646916e-08	16961001	17104345	1.31249704336517e-10	24375698	24389046
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	24384382	24397212	8	8	-0.499	1.31249704336517e-10	24375698	24389046	3.27579979566447e-14	24387710	24402487
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	24398563	35515694	4310	4175	-0.0292	3.27579979566447e-14	24387710	24402487	5.00983985944207e-13	35514062	35515694
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	35524702	35524702	1	0	NA	5.00983985944207e-13	35514062	35515694	NA	NA	NA
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	35526370	35528530	2	2	-0.9014	NA	NA	NA	6.60947370671362e-12	35528530	35530308
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	35530308	72525842	14738	14318	-0.0067	6.60947370671362e-12	35528530	35530308	1.02853869470905e-10	72523186	72533856
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	72528790	72537426	6	6	-0.5402	1.02853869470905e-10	72523186	72533856	2.94461477578405e-32	72537426	72537426
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	72539143	72579311	14	14	0.9643	2.94461477578405e-32	72537426	72537426	5.35598414755427e-59	72574479	72579311
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	72589682	108203143	11016	10693	0.0053	5.35598414755427e-59	72574479	72579311	5.15842754160364e-12	108203143	108203143
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	108205691	108206802	2	2	-1.1668	5.15842754160364e-12	108203143	108203143	7.58125952549384e-11	108206802	108206802
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	108207899	147346399	5253	5087	0.0048	7.58125952549384e-11	108206802	108206802	1.30114155737637e-05	146248754	147411158
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	147352661	147510532	27	26	0.2223	1.30114155737637e-05	146248754	147411158	2.79969537877911e-14	147490553	148115321
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	147644831	150823073	1259	1206	-0.0627	2.79969537877911e-14	147490553	148115321	4.77530393695698e-15	150819879	150836481
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	150836481	150839754	3	3	-0.8006	4.77530393695698e-15	150819879	150836481	0.00858190358484924	150839754	150846148
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	150841957	150851439	7	7	-2.4067	0.00858190358484924	150839754	150846148	1.66933510427601e-83	150851439	150851439
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	150852858	151026228	78	75	0.0509	1.66933510427601e-83	150851439	150851439	2.15758841010896e-12	151024118	151026228
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	151028700	151036435	4	4	0.9243	2.15758841010896e-12	151024118	151026228	4.62852562319737e-14	151036435	151036435
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	151038091	167479184	6787	6586	-0.0034	4.62852562319737e-14	151036435	151036435	4.23347131248681e-13	167473499	167493768
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	167481271	167507898	10	10	-0.4461	4.23347131248681e-13	167473499	167493768	1.20104328789187e-08	167506259	167529221
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	167520743	174868055	2912	2815	-0.0123	1.20104328789187e-08	167506259	167529221	6.86948697303866e-07	174840638	174875333
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	174869189	174893762	10	10	-0.278	6.86948697303866e-07	174840638	174875333	0.000661239384296719	174880354	174926512
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	174895354	185979586	4287	4154	-0.0034	0.000661239384296719	174880354	174926512	1.01463816707081e-12	185979586	185979586
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	185984652	185988138	2	2	-1.2481	1.01463816707081e-12	185979586	185979586	2.72701806780471e-16	185988138	185988138
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	186000612	194978218	1969	1919	0.0106	2.72701806780471e-16	185988138	185988138	6.3342257188468e-32	194976022	195011344
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	195009358	195065867	9	9	-0.8154	6.3342257188468e-32	194976022	195011344	1.31768930727148e-25	195048208	195091758
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	195091758	200609726	2161	2091	0.0019	1.31768930727148e-25	195048208	195091758	3.19400879822592e-17	200598243	200613454
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	200612164	200665389	20	20	-0.4499	3.19400879822592e-17	200598243	200613454	5.88287666439695e-05	200646926	200665389
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	200667381	200693672	11	10	-0.1314	5.88287666439695e-05	200646926	200665389	0.000213894744620182	200683992	200693672
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	200696309	200701140	3	3	-0.4373	0.000213894744620182	200683992	200693672	1.97130258035644e-07	200701140	200816497
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	200787319	246769018	17285	16786	9e-04	1.97130258035644e-07	200701140	200816497	1.78480619261217e-53	246755298	246805521
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	246794552	246875016	30	29	-0.6549	1.78480619261217e-53	246755298	246805521	8.96612051930507e-43	246864725	246878405
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	246878405	247186514	95	93	0.0244	8.96612051930507e-43	246864725	246878405	NA	NA	NA
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	2	7019	34543992	11522	11164	0.013	NA	NA	NA	4.84365593145078e-34	34539740	34552935
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	2	34551222	34583814	17	17	0.5849	4.84365593145078e-34	34539740	34552935	3.14500542467506e-27	34582272	34589997
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	2	34589997	35821494	485	473	-0.012	3.14500542467506e-27	34582272	34589997	9.99086419939272e-20	35821494	35821494
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	2	35841255	35844884	2	2	-1.4952	9.99086419939272e-20	35821494	35821494	3.61235811101994e-18	35844884	35844884
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	2	35851593	37810001	883	853	-0.0316	3.61235811101994e-18	35844884	35844884	8.52921683902837e-12	37775420	37828267
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	2	37812045	37917705	52	50	0.2111	8.52921683902837e-12	37775420	37828267	1.80308186049626e-10	37900885	37941530
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	2	37919732	52600588	5771	5597	-0.0076	1.80308186049626e-10	37900885	37941530	1.15792070940351e-232	52600588	52600588
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	2	52604016	52622353	4	4	-3.5911	1.15792070940351e-232	52600588	52600588	6.12325850699578e-233	52622353	52622353
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	2	52635695	52635695	1	0	NA	6.12325850699578e-233	52622353	52622353	NA	NA	NA
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	2	52639605	146571330	26337	25507	0.0137	NA	NA	NA	5.28540967120833e-31	146571330	146571330
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	2	146582195	146592775	4	4	1.1006	5.28540967120833e-31	146571330	146571330	5.48874372184504e-22	146592775	146592775
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	2	146597405	212890878	22057	21384	-4e-04	5.48874372184504e-22	146592775	146592775	1.45727912546835e-15	212890878	212890878
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	2	212892884	212898875	4	4	-0.9342	1.45727912546835e-15	212890878	212890878	2.84197563591174e-19	212898875	212900857
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	2	212900857	242689978	10688	10385	0.0119	2.84197563591174e-19	212898875	212900857	NA	NA	NA
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	3	37075	45674639	15543	15050	0.0096	NA	NA	NA	9.94334249169429e-08	45661862	45678701
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	3	45676816	45694657	9	9	-0.3856	9.94334249169429e-08	45661862	45678701	3.89980941455564e-08	45687991	45707920
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	3	45696272	47460892	666	646	0.001	3.89980941455564e-08	45687991	45707920	6.86247051377756e-85	47460892	47460892
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	3	47466423	47466921	2	2	-3.2073	6.86247051377756e-85	47460892	47460892	1.07620711575675e-73	47466921	47466921
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	3	47469018	53705606	2749	2653	-0.029	1.07620711575675e-73	47466921	47466921	2.02577194207964e-15	53673180	53717288
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	3	53708732	53853757	78	77	0.2108	2.02577194207964e-15	53673180	53717288	4.26575872066067e-16	53832337	53882179
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	3	53856942	53856942	1	0	NA	4.26575872066067e-16	53832337	53882179	NA	NA	NA
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	3	53858381	61799408	3142	3025	-0.0067	NA	NA	NA	4.36199059456823e-12	61797058	61799408
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	3	61801830	61810681	5	5	-0.7807	4.36199059456823e-12	61797058	61799408	1.99022018918223e-14	61810681	61812559
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	3	61812559	101817141	10636	10323	0.0058	1.99022018918223e-14	61810681	61812559	2.27546942399942e-55	101812920	101830195
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	3	101818659	101928096	43	43	0.5226	2.27546942399942e-55	101812920	101830195	1.49125932873248e-49	101926740	101933912
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	3	101930007	133189686	10835	10518	0.0106	1.49125932873248e-49	101926740	101933912	7.3290844562839e-08	133189686	133189686
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	3	133191877	133194685	2	2	0.9908	7.3290844562839e-08	133189686	133189686	1.01829199320472e-07	133194685	133198618
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	3	133197276	133197276	1	0	NA	1.01829199320472e-07	133194685	133198618	NA	NA	NA
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	3	133198618	164001657	9778	9495	0.0199	NA	NA	NA	6.03222054246921e-16	163997228	164009321
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	3	164005577	164005577	1	0	NA	6.03222054246921e-16	163997228	164009321	NA	NA	NA
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	3	164009321	164027724	5	5	0.8832	NA	NA	NA	2.63681220561363e-17	164023502	164036648
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	3	164036648	191219222	9142	8835	0.0072	2.63681220561363e-17	164023502	164036648	1.27669631502222e-09	191219222	191219222
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	3	191221758	191222891	2	2	1.0554	1.27669631502222e-09	191219222	191219222	2.86745198103286e-09	191222891	191222891
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	3	191224191	196822133	2008	1941	0.0084	2.86745198103286e-09	191222891	191222891	2.93441331704672e-38	196810503	196905767
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	3	196835413	196961238	31	29	-0.5464	2.93441331704672e-38	196810503	196905767	1.7772600006805e-23	196946355	196968244
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	3	196964180	199329592	953	919	-0.0826	1.7772600006805e-23	196946355	196968244	NA	NA	NA
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	4	34020	58159	9	9	0.3103	NA	NA	NA	7.088348839741e-26	49553	137619
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	4	61552	9815760	3384	3298	0.0465	7.088348839741e-26	49553	137619	1.22064249166281e-199	9815760	9815760
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	4	9821327	9842644	4	4	-3.5115	1.22064249166281e-199	9815760	9815760	1.99979581148524e-238	9842644	9842644
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	4	9853710	34445002	6167	5974	0.0118	1.99979581148524e-238	9842644	9842644	1.12549972183467e-06	34425046	34445002
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	4	34457648	34491115	6	6	0.515	1.12549972183467e-06	34425046	34445002	2.85009442120661e-17	34491115	34519267
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	4	34506297	40262957	1901	1842	-0.0311	2.85009442120661e-17	34491115	34519267	1.01393951790762e-17	40261375	40262957
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	4	40264490	40267639	3	3	-0.8833	1.01393951790762e-17	40261375	40262957	2.96116772762622e-10	40267639	40271184
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	4	40271184	68905670	6959	6734	-0.0104	2.96116772762622e-10	40267639	40271184	4.3171183317475e-20	68899247	69069651
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	4	69069651	69165814	14	13	0.5681	4.3171183317475e-20	68899247	69069651	7.59968849555873e-20	69153675	69656183
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	4	69643272	129139508	18933	18372	-0.0055	7.59968849555873e-20	69153675	69656183	1.13284686729317e-07	129115655	129152323
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	4	129143611	129222892	35	34	-0.2336	1.13284686729317e-07	129115655	129152323	5.03537809968806e-08	129213054	129253543
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	4	129225357	173660684	12420	12032	-0.0021	5.03537809968806e-08	129213054	129253543	1.20041556826476e-09	173660684	173660684
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	4	173663054	173666072	2	2	-1.0398	1.20041556826476e-09	173660684	173660684	2.63826886601668e-10	173666072	173666072
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	4	173672958	186676034	3773	3628	0.0089	2.63826886601668e-10	173666072	173666072	1.37117828009784e-131	186676034	186676034
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	4	186678729	186680176	2	2	3.6581	1.37117828009784e-131	186676034	186676034	8.4084451883505e-128	186680176	186680176
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	4	186681553	187330240	306	300	0.0082	8.4084451883505e-128	186680176	186680176	3.70674805149189e-07	187329037	187330240
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	4	187331981	187338465	4	4	0.6361	3.70674805149189e-07	187329037	187330240	1.75605365805228e-09	187338465	187346097
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	4	187346058	191153613	1239	1198	0.0061	1.75605365805228e-09	187338465	187346097	NA	NA	NA
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	5	79142	130579586	36174	35158	0.0099	NA	NA	NA	3.78547232678319e-91	130563251	130590484
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	5	130583605	130695464	49	48	-0.2955	3.78547232678319e-91	130563251	130590484	9.94664843445551e-17	130685353	130716369
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	5	130701727	137831933	2865	2776	0.0177	9.9466484344555e-17	130685353	130716369	1.54643270700342e-14	137828681	137831933
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	5	137833920	137839226	3	3	-0.8199	1.54643270700342e-14	137828681	137831933	9.99895357653495e-14	137839226	137842107
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	5	137842107	180342860	14555	14111	0.0197	9.99895357653495e-14	137839226	137842107	1.20723344577361e-12	180192214	180346557
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	5	180344964	180358977	8	8	0.5764	1.20723344577361e-12	180192214	180346557	2.08284768135776e-12	180355807	180365950
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	5	180362342	180362342	1	0	NA	2.08284768135776e-12	180355807	180365950	NA	NA	NA
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	5	180364670	180644810	111	105	-0.0669	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	6	99130	99130	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	6	109360	18371831	6537	6338	0.0075	NA	NA	NA	1.02547885229625e-20	18368026	18371831
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	6	18373481	18378787	3	3	0.8817	1.02547885229625e-20	18368026	18371831	1.32252068127620e-10	18378787	18378787
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	6	18380299	29950805	4046	3918	-0.0106	1.3225206812762e-10	18378787	18378787	1.42789678257350e-11	29939288	29966336
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	6	29962849	29995247	10	9	0.5264	1.4278967825735e-11	29939288	29966336	5.4411852846127e-10	29986370	30000990
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	6	29998009	31390982	588	570	-0.0333	5.4411852846127e-10	29986370	30000990	3.63042748223596e-05	31387708	31390982
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	6	31393624	31418006	3	3	0.6688	3.63042748223596e-05	31387708	31390982	7.24131249433278e-06	31418006	31425113
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	6	31425113	32558677	489	472	-0.0029	7.24131249433278e-06	31418006	31425113	9.51440549633726e-82	32558677	32563252
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	6	32563252	32605300	10	10	1.4076	9.51440549633726e-82	32558677	32563252	0.000413974910405565	32595402	32626619
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	6	32609525	32633691	7	7	0.439	0.000413974910405565	32595402	32626619	8.26561621235123e-08	32613538	32650672
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	6	32634977	54035000	8295	8052	0.002	8.26561621235123e-08	32613538	32650672	2.23967111466864e-108	54035000	54035000
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	6	54037199	54042734	3	3	-2.87	2.23967111466864e-108	54035000	54035000	1.38414664900426e-119	54042734	54042734
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	6	54045472	103841482	13207	12831	0.0061	1.38414664900426e-119	54042734	54042734	2.7757273020767e-225	103841482	103841482
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	6	103845083	103868154	4	4	-3.4137	2.7757273020767e-225	103841482	103841482	2.77136614372299e-219	103868154	103868154
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	6	103873584	103873584	1	0	NA	2.77136614372299e-219	103868154	103868154	NA	NA	NA
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	6	103882598	132154299	9539	9234	0.0018	NA	NA	NA	1.98259445192751e-12	132154299	132154299
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	6	132156778	132159522	2	2	-1.1754	1.98259445192751e-12	132154299	132154299	5.88741359363359e-12	132159522	132159522
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	6	132161292	165643653	11564	11241	-0.003	5.88741359363359e-12	132159522	132159522	7.70905363771954e-94	165643653	165643653
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	6	165645537	165649379	3	3	-2.6139	7.70905363771954e-94	165643653	165643653	1.22923047710614e-84	165649379	165649379
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	6	165650610	170753106	1805	1758	0.0344	1.22923047710614e-84	165649379	165649379	NA	NA	NA
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	136373	11558485	3856	3729	-0.0062	NA	NA	NA	5.75264294082163e-09	11551527	11558485
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	11560045	11564484	2	2	-1.0521	5.75264294082163e-09	11551527	11558485	6.642847753261e-10	11564484	11564484
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	11564516	14261787	800	775	-0.005	6.642847753261e-10	11564484	11564484	1.11279992334597e-08	14259626	14263414
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	14263414	14266755	3	3	-0.8127	1.11279992334597e-08	14259626	14263414	1.95331721088713e-09	14265179	14268336
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	14268336	18244187	1478	1436	7e-04	1.95331721088713e-09	14265179	14268336	4.27416285606549e-07	18236631	18244187
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	18248366	18251736	2	2	-0.8653	4.27416285606549e-07	18236631	18244187	4.91893709878382e-06	18251736	18260638
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	18260638	28231831	3604	3518	-0.0034	4.91893709878382e-06	18251736	18260638	2.22625305581883e-07	28212226	28238117
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	28238117	28277839	10	10	-0.4274	2.22625305581883e-07	28212226	28238117	7.70917873496212e-35	28272993	28286290
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	28280997	100166257	21308	20661	0.0028	7.70917873496212e-35	28272993	28286290	9.02559416178616e-124	100166257	100166257
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	100170227	100174991	3	3	-3.0557	9.02559416178616e-124	100166257	100166257	1.34392041640882e-120	100174991	100174991
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	100178968	109217320	3895	3772	-0.0152	1.34392041640882e-120	100174991	100174991	1.52075573291747e-08	109212149	109231462
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	109230336	109251084	11	11	0.3999	1.52075573291747e-08	109212149	109231462	1.90839053259006e-07	109248626	109260737
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	109252574	125831554	7466	7240	0.005	1.90839053259006e-07	109248626	109260737	7.09119528978581e-98	125831554	125831554
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	125833251	125837524	3	3	-2.6277	7.09119528978581e-98	125831554	125831554	1.33809615129987e-83	125837524	125837524
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	125839386	133433384	3654	3536	-0.0029	1.33809615129987e-83	125837524	125837524	0.000185069125121911	133414697	133437464
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	133436265	133448277	8	8	-0.3949	0.000185069125121911	133414697	133437464	6.80436193575512e-05	133444486	133460976
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	133453811	141652247	3810	3705	-0.0027	6.80436193575512e-05	133444486	133460976	5.760515437047e-06	141631195	141663456
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	141654441	141690753	20	20	0.2691	5.760515437047e-06	141631195	141663456	3.75606799581983e-82	141690753	141690753
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	141698634	141711513	8	8	-3.7234	3.75606799581983e-82	141690753	141690753	0	141711513	141711513
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	141712786	158821263	6754	6567	0.0296	0	141711513	141711513	NA	NA	NA
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	8	151472	151472	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	8	166493	3771559	1366	1330	0.0527	NA	NA	NA	1.87370695930601e-114	3771559	3771559
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	8	3773975	3776617	2	2	-3.6504	1.87370695930601e-114	3771559	3771559	4.65198754595005e-142	3776617	3776617
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	8	3779135	5574577	641	629	0.0404	4.65198754595005e-142	3776617	3776617	1.66112663369735e-28	5574577	5574577
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	8	5585615	5591702	2	2	-1.6859	1.66112663369735e-28	5574577	5574577	3.70778948752589e-24	5591702	5591702
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	8	5596343	25022606	6117	5921	0.0104	3.70778948752589e-24	5591702	5591702	2.61548626366937e-15	25022606	25022606
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	8	25030003	25039370	3	3	1.1173	2.61548626366937e-15	25022606	25022606	6.65108212874161e-17	25039370	25039370
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	8	25047250	39350798	4942	4790	-0.0193	6.65108212874161e-17	25039370	25039370	8.99673785022506e-122	39345557	39352361
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	8	39352361	39505256	59	59	0.6609	8.99673785022506e-122	39345557	39352361	9.68273621852007e-117	39504332	39508035
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	8	39508035	97302047	15644	15188	0.0054	9.68273621852007e-117	39504332	39508035	1.15034968569690e-08	97280143	97310230
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	8	97303589	97338879	18	18	-0.3314	1.1503496856969e-08	97280143	97310230	2.17732561726790e-10	97332260	97346487
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	8	97340797	98732362	523	516	0.0216	2.1773256172679e-10	97332260	97346487	1.52927850878273e-12	98701839	98761411
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	8	98734944	98898441	76	74	-0.1785	1.52927850878273e-12	98701839	98761411	2.17631175607892e-36	98878002	98926840
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	8	98899692	145330767	14871	14373	0.0266	2.17631175607892e-36	98878002	98926840	6.79296743662072e-33	145328970	145334573
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	8	145333207	145344674	6	6	-0.6624	6.79296743662072e-33	145328970	145334573	3.30738230547456e-07	145334573	145351798
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	8	145346935	146264846	295	290	-0.0407	3.30738230547456e-07	145334573	145351798	NA	NA	NA
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	9	189055	19148673	6631	6412	-0.0142	NA	NA	NA	2.39342643056799e-33	19148673	19148673
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	9	19153902	19153902	1	0	NA	2.39342643056799e-33	19148673	19148673	NA	NA	NA
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	9	19162242	19179870	6	6	-1.1002	NA	NA	NA	1.82062812069293e-31	19179870	19179870
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	9	19183441	70926188	6434	6209	-0.0047	1.82062812069293e-31	19179870	19179870	9.77152548815192e-64	70926188	70926188
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	9	70928471	70930528	2	2	-2.6904	9.77152548815192e-64	70926188	70926188	1.47383303512034e-65	70930528	70930528
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	9	70935055	115721931	15254	14797	-0.0099	1.47383303512034e-65	70930528	70930528	4.37649458342986e-05	115717644	115721931
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	9	115723165	115731579	3	3	-0.6634	4.37649458342986e-05	115717644	115721931	2.24414999049814e-09	115731579	115733132
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	9	115733132	115833680	50	49	0.1207	2.24414999049814e-09	115731579	115733132	7.93128479327737e-07	115832420	115836210
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	9	115836210	115842212	3	3	-0.5791	7.93128479327737e-07	115832420	115836210	6.07768027258491e-22	115839900	115854147
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	9	115849028	137352394	8455	8157	-0.0035	6.07768027258491e-22	115839900	115854147	2.91765766153508e-22	137352394	137352394
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	9	137354256	137356880	2	2	1.4076	2.91765766153508e-22	137352394	137352394	5.26223841239398e-15	137356880	137356880
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	9	137359947	140145683	1103	1069	-0.0316	5.26223841239398e-15	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	10	126361	46384985	14458	14030	-0.0092	NA	NA	NA	4.78310275603316e-138	45487335	46389734
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	10	46388078	47167144	118	112	0.5195	4.78310275603316e-138	45487335	46389734	1.18004168719766e-129	47162381	47938346
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	10	47172534	70949263	7099	6913	0.0019	1.18004168719766e-129	47162381	47938346	8.98639080326724e-41	70945853	70949263
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	10	70952973	70960187	4	3	-0.7819	8.98639080326724e-41	70945853	70949263	1.72183819274836e-16	70960187	70964344
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	10	70964344	77917893	2913	2828	-0.012	1.72183819274836e-16	70960187	70964344	6.64648309663301e-92	77917893	77917893
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	10	77926390	77928669	2	2	-3.3632	6.64648309663301e-92	77917893	77917893	2.57511318034554e-94	77928669	77928669
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	10	77928738	135124875	20169	19567	0.0149	2.57511318034554e-94	77928669	77928669	2.54643949215333e-28	135110218	135135745
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	10	135126486	135227463	35	33	0.3972	2.54643949215333e-28	135110218	135135745	0.000280542287341324	135204397	135252519
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	10	135229796	135285645	10	9	0.0452	0.000280542287341324	135204397	135252519	NA	NA	NA
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	11	187649	5741031	2138	2063	-0.0075	NA	NA	NA	6.14798409237125e-36	5738494	5742476
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	11	5742476	5765438	15	15	-0.7815	6.14798409237125e-36	5738494	5742476	2.21814042247529e-40	5763749	5766615
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	11	5766615	55118214	14752	14322	0.0063	2.21814042247529e-40	5763749	5766615	2.19943539561265e-62	55114405	55124730
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	11	55123719	55209626	39	36	-0.624	2.19943539561265e-62	55114405	55124730	1.22815984701204e-57	55205278	55217189
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	11	55217189	69721335	5700	5521	-0.0031	1.22815984701204e-57	55205278	55217189	1.82668703974663e-06	69719071	69721335
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	11	69726572	69728478	3	3	-0.7514	1.82668703974663e-06	69719071	69721335	5.83539198093693e-07	69728478	69730962
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	11	69730962	113360879	14726	14281	0.0052	5.83539198093693e-07	69728478	69730962	9.79635737998661e-05	113342912	113362073
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	11	113362073	113377729	9	8	0.3444	9.7963573799866e-05	113342912	113362073	9.87856147858726e-07	113375091	113423678
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	11	113380316	118112050	1717	1659	0.0088	9.87856147858726e-07	113375091	113423678	2.21917259131950e-13	118071809	118129575
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	11	118115430	118198010	44	42	-0.2544	2.2191725913195e-13	118071809	118129575	4.85880986898369e-20	118188741	118215484
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	11	118198892	134450318	6161	5986	0.0395	4.85880986898369e-20	118188741	118215484	NA	NA	NA
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	12	33854	9523923	3742	3624	-0.0049	NA	NA	NA	3.28034847792438e-208	9523923	9523923
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	12	9528590	9554149	5	5	-3.2616	3.28034847792438e-208	9523923	9523923	5.13071259882052e-21	9554149	9554149
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	12	9555181	9610054	11	11	-1.0354	5.13071259882052e-21	9554149	9554149	1.36587710123238e-47	9610054	9610054
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	12	9626623	11104973	567	547	-0.0214	1.36587710123238e-47	9610054	9610054	1.02131849777776e-38	11104973	11104973
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	12	11109483	11140421	11	9	1.0009	1.02131849777776e-38	11104973	11104973	6.56301749917971e-19	11140421	11143592
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	12	11143592	11395862	70	68	0.0077	6.56301749917971e-19	11140421	11143592	3.79684135760311e-11	11389830	11395862
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	12	11419189	11440927	7	6	-0.8318	3.79684135760311e-11	11389830	11395862	1.02490924039169e-16	11440927	11452868
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	12	11452868	12422129	389	380	-0.0392	1.02490924039169e-16	11440927	11452868	1.65007240199674e-10	12419910	12422129
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	12	12423720	12433043	5	5	-0.7298	1.65007240199674e-10	12419910	12422129	9.04198080401415e-12	12433043	12435301
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	12	12435301	31132762	6348	6169	-0.007	9.04198080401415e-12	12433043	12435301	6.30786653430816e-32	31098259	31169263
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	12	31169263	31246624	20	19	-0.6083	6.30786653430816e-32	31098259	31169263	1.45689649105211e-29	31245432	31249495
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	12	31248212	46566095	4128	4003	-0.0206	1.45689649105211e-29	31245432	31249495	1.11165602843730e-14	46525950	46567831
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	12	46567831	46574681	5	5	-0.3381	1.1116560284373e-14	46525950	46567831	0.00136348550042740	46573167	46612358
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	12	46576406	46996769	177	174	0.0153	0.0013634855004274	46573167	46612358	0.00188765734142257	46868794	47014724
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	12	46998876	47029471	15	14	0.2285	0.00188765734142257	46868794	47014724	4.03907490131842e-17	47020619	47074939
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	12	47031804	78676440	11054	10709	-0.0164	4.03907490131842e-17	47020619	47074939	4.08405955212806e-19	78640753	78681634
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	12	78679297	78692550	7	7	0.3423	4.08405955212806e-19	78640753	78681634	8.03185898379295e-13	78688893	78706078
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	12	78694537	107584993	9362	9093	-0.0057	8.03185898379295e-13	78688893	78706078	1.66862855514202e-11	107570149	107597321
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	12	107587262	107622418	18	18	-0.2898	1.66862855514202e-11	107570149	107597321	3.17843372563821e-10	107611380	107647592
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	12	107627229	120571021	5022	4862	-0.0201	3.17843372563821e-10	107611380	107647592	1.28617628062734e-19	120559848	120576674
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	12	120573672	120628339	25	24	-0.4741	1.28617628062734e-19	120559848	120576674	2.26095068085692e-35	120619972	120636296
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	12	120630733	132289090	4173	4035	8e-04	2.26095068085692e-35	120619972	120636296	NA	NA	NA
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	13	18194544	31428172	4884	4742	0.0035	NA	NA	NA	7.4385523419505e-08	31426287	31428172
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	13	31431833	31436314	2	2	-0.9876	7.4385523419505e-08	31426287	31428172	1.35274876045774e-08	31436314	31436314
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	13	31441218	37953582	2452	2384	0.0014	1.35274876045774e-08	31436314	31436314	1.26092126185148e-133	37953582	37953582
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	13	37955475	37957844	2	2	-3.7842	1.26092126185148e-133	37953582	37953582	5.90777309264063e-134	37957844	37957844
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	13	37959274	49964838	4879	4722	-0.0193	5.90777309264063e-134	37957844	37957844	6.4097200064517e-16	49964838	49964838
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	13	49968215	49971732	2	2	1.3018	6.4097200064517e-16	49964838	49964838	3.72548413976275e-13	49971732	49971732
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	13	49974447	56650373	1804	1751	0.0257	3.72548413976275e-13	49971732	49971732	3.88074637124675e-18	56610886	56657371
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	13	56657371	56681665	14	14	0.5904	3.88074637124675e-18	56610886	56657371	1.40840343660183e-22	56681665	56685341
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	13	56685341	100690991	13041	12673	0.0054	1.40840343660183e-22	56681665	56685341	2.93326863515838e-07	100690991	100690991
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	13	100692746	100693892	2	2	0.9135	2.93326863515838e-07	100690991	100690991	1.32839051508850e-06	100693892	100695073
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	13	100695073	114123340	4562	4411	0.0306	1.3283905150885e-06	100693892	100695073	NA	NA	NA
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	14	18446762	18544772	6	5	-0.085	NA	NA	NA	0.00376263430129691	18527871	19287128
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	14	18798641	19494416	54	52	-0.5123	0.00376263430129691	18527871	19287128	1.54238899384397e-48	19490630	19538610
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	14	19497023	21528132	991	956	-0.0255	1.54238899384397e-48	19490630	19538610	2.10698038690341e-54	21505880	21548222
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	14	21529816	22061243	268	261	0.2276	2.10698038690341e-54	21505880	21548222	2.57334199015696e-63	22042671	22074706
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	14	22062453	34674458	4431	4281	-0.0082	2.57334199015696e-63	22042671	22074706	2.06221338785963e-18	34674458	34674458
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	14	34676390	34683810	3	3	-0.9237	2.06221338785963e-18	34674458	34674458	7.90295308051403e-10	34683810	34685308
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	14	34685308	79174722	16588	16044	-0.0162	7.90295308051403e-10	34683810	34685308	8.09144409904415e-210	79174722	79174722
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	14	79176037	79176037	1	0	NA	8.09144409904415e-210	79174722	79174722	NA	NA	NA
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	14	79177462	79183154	3	3	-4.0525	NA	NA	NA	5.55619950354755e-209	79183154	79183154
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	14	79185548	105607572	9300	9024	0.0099	5.55619950354755e-209	79183154	79183154	7.77409859099101e-12	105597555	105607572
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	14	105609466	105673157	10	10	0.5535	7.77409859099101e-12	105597555	105607572	3.12524808715598e-08	105630089	105724133
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	14	105681007	106358491	230	222	0.0224	3.12524808715598e-08	105630089	105724133	NA	NA	NA
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	15	18362555	18452491	5	5	0.2304	NA	NA	NA	1.12754145769046e-05	18427151	18741716
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	15	18692865	19844217	104	102	-0.2878	1.12754145769046e-05	18427151	18741716	2.1028065718602e-39	19819961	19927040
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	15	19845942	32514939	3719	3598	0.0205	2.1028065718602e-39	19819961	19927040	1.93416939075434e-40	32456500	32517839
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	15	32517839	32578483	20	19	-0.6954	1.93416939075434e-40	32456500	32517839	3.66291498158495e-48	32576881	32580871
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	15	32580871	99632987	27200	26352	-0.0077	3.66291498158495e-48	32576881	32580871	4.86861720596774e-47	99630163	99632987
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	15	99634434	99635701	2	2	0.9369	4.86861720596774e-47	99630163	99632987	1.68175902251447e-08	99635701	99635701
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	15	99636724	100298352	272	263	-0.0076	1.68175902251447e-08	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	16	33628	11987742	4540	4419	-0.02	NA	NA	NA	9.13034213833036e-05	11822451	11990846
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	16	11989676	12002375	8	8	0.1779	9.13034213833036e-05	11822451	11990846	1.43369618986990e-20	11996851	12176053
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	16	12004863	75093957	15975	15472	-0.0147	1.4336961898699e-20	11996851	12176053	7.53698413719425e-53	75093957	75093957
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	16	75097331	75100865	3	3	2.0482	7.53698413719425e-53	75093957	75093957	2.75044408797049e-56	75100865	75100865
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	16	75102639	76923844	609	586	0.0066	2.75044408797049e-56	75100865	75100865	2.56930493602475e-33	76923844	76931247
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	16	76925748	76929598	2	0	NA	2.56930493602475e-33	76923844	76931247	NA	NA	NA
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	16	76931247	76940218	7	7	1.0494	NA	NA	NA	6.81638175424866e-28	76938723	76940218
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	16	76942679	88690571	4513	4387	0.0099	6.81638175424866e-28	76938723	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	17	47546	35376975	13364	12937	-0.0322	NA	NA	NA	4.27967482327419e-16	35371390	35376975
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	17	35379662	35385941	5	5	0.5507	4.27967482327419e-16	35371390	35376975	2.54746853318758e-08	35385941	35389178
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	17	35387755	36673853	502	484	-0.0497	2.54746853318758e-08	35385941	35389178	2.12178696411416e-204	36673853	36673853
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	17	36675987	36684619	6	6	2.6271	2.12178696411416e-204	36673853	36673853	6.86010729056616e-169	36684619	36684619
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	17	36686013	41508943	2006	1931	-0.0376	6.86010729056616e-169	36684619	36684619	4.15355903619819e-08	41397052	41515622
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	17	41512318	41521544	6	6	-0.2862	4.15355903619819e-08	41397052	41515622	0.00545507912473775	41518222	41542491
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	17	41522429	41566540	20	20	-0.6087	0.00545507912473775	41518222	41542491	5.41847938723657e-06	41552048	41574775
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	17	41568539	41648545	38	38	-0.3373	5.41847938723657e-06	41552048	41574775	4.58342815107343e-13	41644148	42143048
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	17	41652861	78653545	13687	13246	-0.0356	4.58342815107343e-13	41644148	42143048	NA	NA	NA
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	18	4316	22419555	6981	6787	-0.0106	NA	NA	NA	3.32019984655314e-09	22408377	22425695
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	18	22422450	22429634	4	4	-0.5357	3.32019984655314e-09	22408377	22425695	3.48585152663396e-08	22425695	22431171
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	18	22430867	76116026	15979	15491	0.0112	3.48585152663396e-08	22425695	22431171	NA	NA	NA
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	19	210395	5672455	2508	2417	-0.0697	NA	NA	NA	4.11079258030511e-05	5630487	5682146
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	19	5673537	5706237	17	17	-0.3305	4.11079258030511e-05	5630487	5682146	0.000261607205822901	5698971	5743754
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	19	5707559	11448975	2647	2555	-0.0622	0.000261607205822901	5698971	5743754	5.36884349809485e-12	11448975	11448975
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	19	11450908	11452390	2	2	1.2005	5.36884349809485e-12	11448975	11448975	4.77893727312261e-12	11452390	11452390
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	19	11453579	56825794	14700	14254	-0.0441	4.77893727312261e-12	11452390	11452390	2.94579102537119e-16	56823430	56825794
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	19	56828073	56840346	7	7	-0.8104	2.94579102537119e-16	56823430	56825794	2.56336180266927e-16	56840346	56842447
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	19	56842447	59491509	1206	1183	-0.0519	2.56336180266927e-16	56840346	56842447	4.31414812470163e-26	59491509	59491509
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	19	59492650	59497049	2	2	-1.8647	4.31414812470163e-26	59491509	59491509	6.1217526581274e-25	59497049	59497049
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	19	59500575	63788698	1970	1902	-0.0566	6.1217526581274e-25	59497049	59497049	NA	NA	NA
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	20	12719	1487457	579	563	-0.0362	NA	NA	NA	7.80695029351462e-05	1433247	1511632
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	20	1489769	1516966	10	9	-0.2825	7.80695029351462e-05	1433247	1511632	2.76154269688675e-06	1516966	1523000
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	20	1518825	1531162	6	6	-2.0072	2.76154269688675e-06	1516966	1523000	1.088688129042e-99	1525300	1531162
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	20	1532433	49436892	16318	15854	-0.0033	1.088688129042e-99	1525300	1531162	1.33043009923560e-14	49313349	49447766
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	20	49438796	49458908	9	9	-0.2564	1.3304300992356e-14	49313349	49447766	4.81752417523467e-07	49446139	49510014
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	20	49461266	56432617	2164	2107	0.0075	4.81752417523467e-07	49446139	49510014	1.88268641271348e-08	56429111	56432617
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	20	56435112	56438162	3	3	-0.8227	1.88268641271348e-08	56429111	56432617	4.92688352104882e-12	56438162	56440931
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	20	56440931	62419534	2490	2403	0.0334	4.92688352104882e-12	56438162	56440931	NA	NA	NA
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	21	9882922	41887383	11036	10726	0.0018	NA	NA	NA	4.10690412840948e-54	41877036	41892307
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	21	41892307	41973308	21	20	-0.7755	4.10690412840948e-54	41877036	41892307	6.76250135297957e-44	41971051	41976713
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	21	41976713	46922972	2384	2311	0.0032	6.76250135297957e-44	41971051	41976713	NA	NA	NA
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	22	14866086	22667608	2982	2901	-5e-04	NA	NA	NA	1.17438675573360e-33	22644243	22682428
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	22	22677959	22725305	22	21	0.6582	1.1743867557336e-33	22644243	22682428	1.68853744026192e-35	22714979	22735036
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	22	22735036	49571068	13552	13113	-0.0109	1.68853744026192e-35	22714979	22735036	NA	NA	NA
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	23	1091	1427392	787	758	-0.0556	NA	NA	NA	1.81798777988267e-12	1427392	1431411
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	23	1431240	1432953	4	4	-0.9831	1.81798777988267e-12	1427392	1431411	3.75486884231914e-11	1431411	1434970
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	23	1434970	2708291	1002	971	-0.0687	3.75486884231914e-11	1431411	1434970	0	2708291	2711273
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	23	2711273	8452395	1791	1739	0.895	0	2708291	2711273	8.31456229640143e-25	8446489	8452395
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	23	8456422	8473482	8	8	0.2614	8.31456229640143e-25	8446489	8452395	1.27581934456815e-17	8473482	8477126
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	23	8475091	146087729	40295	38992	0.9225	1.27581934456815e-17	8473482	8477126	2.03613005279739e-18	146086841	146087729
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	23	146095685	146095707	2	2	-0.2971	2.03613005279739e-18	146086841	146087729	1.35956725400143e-27	146095707	146098710
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	23	146098710	154582414	3038	2951	0.9197	1.35956725400143e-27	146095707	146098710	0	154578922	154582414
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	23	154586690	154888224	201	195	-0.0302	0	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	2710450	4174561	129	127	-3.1465	NA	NA	NA	2.04651196655136e-13	3777766	4272867
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	4272867	5593746	11	11	-0.7889	2.04651196655136e-13	3777766	4272867	7.28965877454498e-08	5531459	6696721
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	5672441	6953343	118	113	-3.0199	7.28965877454498e-08	5531459	6696721	8.18496542090326e-08	6919934	7005620
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	6954864	7653082	216	211	-2.1942	8.18496542090326e-08	6919934	7005620	5.00218868312682e-08	7619927	7664085
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	7655293	7709619	35	35	-3.4742	5.00218868312682e-08	7619927	7664085	4.6126748810504e-09	7700496	7717556
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	7711759	7914104	67	64	-2.1291	4.6126748810504e-09	7700496	7717556	3.80578676471584e-11	7870400	7964586
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	7918899	8289709	85	81	-3.3759	3.80578676471584e-11	7870400	7964586	0.000107121377392625	8229100	8294345
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	8292347	8324291	12	12	-1.8079	0.000107121377392625	8229100	8294345	0.00254566678090813	8300654	8348968
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	8324328	8538835	46	44	-2.9019	0.00254566678090813	8300654	8348968	0.00163750206608801	8450784	8552999
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	8539855	8693820	57	57	-2.2315	0.00163750206608801	8450784	8552999	3.90207499552661e-09	8683710	8725366
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	8695195	10513747	189	180	-3.1847	3.90207499552661e-09	8683710	8725366	3.70660454965718e-20	10512616	10515697
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	10515697	10645500	13	12	-0.3745	3.70660454965718e-20	10512616	10515697	0.000169752261659327	10620136	12511461
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	10646662	13129843	208	204	-1.9024	0.000169752261659327	10620136	12511461	2.68363359286145e-05	13106723	13137597
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	13133803	13153117	12	12	-3.5747	2.68363359286145e-05	13106723	13137597	5.18311796387755e-05	13148290	13158272
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	13153920	13221044	19	19	-2.1143	5.18311796387755e-05	13148290	13158272	1.19574171734866e-05	13202163	13254711
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	13230706	13553112	153	149	-3.2569	1.19574171734866e-05	13202163	13254711	0.000655059957582313	13520364	13591921
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	13555650	13705594	34	32	-2.4639	0.000655059957582313	13520364	13591921	1.40206733681519e-05	13603478	13773971
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	13716000	14353244	194	187	-3.3801	1.40206733681519e-05	13603478	13773971	1.63581048258908e-14	14330251	14379418
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	14354682	14508021	92	87	-2.3565	1.63581048258908e-14	14330251	14379418	3.98919298820023e-06	14491287	14536962
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	14508894	14508894	1	0	NA	3.98919298820023e-06	14491287	14536962	NA	NA	NA
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	14524829	14579298	25	25	-1.0719	NA	NA	NA	6.20577244074528e-09	14569287	14579298
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	14581797	14598838	6	6	-3.9418	6.20577244074528e-09	14569287	14579298	1.24483276715886e-05	14598838	14605090
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	14601309	14700040	17	17	-1.8091	1.24483276715886e-05	14598838	14605090	2.27053985380812e-06	14692847	14707011
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	14701706	14958284	56	54	-3.1106	2.27053985380812e-06	14692847	14707011	4.17870135214546e-06	14941202	14958284
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	14969835	15018205	6	6	-1.2698	4.17870135214546e-06	14941202	14958284	6.18844132366256e-06	15018205	15032971
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	15022037	15139441	28	27	-3.3	6.18844132366256e-06	15018205	15032971	5.39835134190041e-08	15126227	15139441
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	15140278	15149506	7	7	-1.1401	5.39835134190041e-08	15126227	15139441	2.98660522148960e-06	15149506	15155598
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	15152354	15208612	33	32	-3.1623	2.9866052214896e-06	15149506	15155598	6.5528374028052e-06	15204346	15220050
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	15209166	15241527	10	10	-1.3543	6.5528374028052e-06	15204346	15220050	2.16880110869967e-05	15228303	15250474
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	15242592	15915466	254	246	-3.0994	2.16880110869967e-05	15228303	15250474	2.37050307569294e-09	15750379	15977755
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	15920478	16224597	133	128	-2.3221	2.37050307569294e-09	15750379	15977755	2.86870575876074e-12	16186896	16354465
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	16228031	22179794	978	948	-3.1125	2.86870575876074e-12	16186896	16354465	6.74996045725304e-06	22043133	22200078
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	22181855	22268552	27	27	-4.2607	6.74996045725304e-06	22043133	22200078	3.86187153286099e-12	22252795	22371003
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	22308420	22876519	45	42	-2.8525	3.86187153286099e-12	22252795	22371003	0.000246141320557466	22856903	22911915
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	22877495	22877495	1	0	NA	0.000246141320557466	22856903	22911915	NA	NA	NA
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	22878671	22930737	18	17	-3.9091	NA	NA	NA	3.17185471208209e-21	22926726	25737663
MSK_252152916706_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	23283689	57440809	86	83	-1.1504	3.17185471208209e-21	22926726	25737663	NA	NA	NA
