Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	16838573	5788	5281	-0.0021	NA	NA	NA	1.30969814158353e-09	16814050	16961001
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16888048	17127039	19	17	-0.3419	1.30969814158353e-09	16814050	16961001	4.70835814368562e-11	17094475	17157415
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17148592	72537426	22087	20316	0.0017	4.70835814368562e-11	17094475	17157415	0	72537426	72537426
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	11	-3.7659	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	103929627	10117	9337	-0.0054	0	72579311	72579311	3.86285297163107e-20	103929627	103929627
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103932025	103932025	1	0	NA	3.86285297163107e-20	103929627	103929627	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103956767	104012520	3	3	-1.0516	NA	NA	NA	7.37188665281522e-20	104012520	104012520
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	104108153	143697723	5499	5057	0.0045	7.37188665281522e-20	104012520	104012520	2.50224306516113e-09	143639135	143712550
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143700072	143780677	40	38	-0.203	2.50224306516113e-09	143639135	143712550	5.06070788278803e-09	143766955	143803856
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143783358	150819879	1896	1745	-0.0047	5.06070788278803e-09	143766955	143803856	1.72731378043512e-35	150818222	150819879
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150852858	12	10	0.7408	1.72731378043512e-35	150818222	150819879	1.11293122152085e-27	150851439	150852858
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150857070	150915504	27	25	0.051	1.11293122152085e-27	150851439	150852858	3.58885487776037e-05	150907103	150915504
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150916294	150924208	4	4	-0.3222	3.58885487776037e-05	150907103	150915504	5.11871495827162e-06	150924208	150927047
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150926291	151026228	46	42	0.0517	5.11871495827162e-06	150924208	150927047	2.05825219536903e-15	151026228	151028700
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.7302	2.05825219536903e-15	151026228	151028700	2.55875523045056e-11	151033188	151038091
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2505	0.0098	2.55875523045056e-11	151033188	151038091	1.21904997497467e-18	157133150	157133150
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	1.3119	1.21904997497467e-18	157133150	157133150	1.28162199095795e-20	157136342	157136342
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	177595302	8104	7450	-0.0053	1.28162199095795e-20	157136342	157136342	2.07942509310688e-09	177593746	177595302
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	177596757	177599597	3	3	-0.7437	2.07942509310688e-09	177593746	177595302	1.81430128776421e-09	177599597	177601540
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	177601540	200598243	7356	6764	-0.0013	1.81430128776421e-09	177599597	177601540	4.51013715401721e-15	200589108	200613454
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200600795	200667381	24	22	-0.3439	4.51013715401721e-15	200589108	200613454	4.83210524000096e-15	200649025	200673525
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200668993	229974646	10775	9923	0.0021	4.83210524000096e-15	200649025	200673525	1.03029780262597e-16	229965900	229985455
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	229977483	230046515	35	33	-0.2951	1.03029780262597e-16	229965900	229985455	9.32454340856598e-15	230031679	230063133
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	230049020	246769018	6488	5982	-0.0195	9.32454340856598e-15	230031679	230063133	7.37668083634254e-10	246738832	246811355
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246794552	246863179	28	28	0.2272	7.37668083634254e-10	246738832	246811355	6.57023317000197e-07	246853406	246912838
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246864725	247186514	97	89	0.0108	6.57023317000197e-07	246853406	246912838	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34539603	11519	10576	-0.004	NA	NA	NA	4.02231118896659e-16	34520482	34542224
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34539740	34599239	25	24	-0.3464	4.02231118896659e-16	34520482	34542224	1.47842080798207e-16	34591681	34610922
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34602813	78494020	15882	14597	-3e-04	1.47842080798207e-16	34591681	34610922	2.22925617515686e-10	78494020	78494020
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	78496580	78500073	3	2	-0.9621	2.22925617515686e-10	78494020	78494020	1.89543759609242e-10	78500073	78500073
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	78502407	108279974	6877	6345	0.0035	1.89543759609242e-10	78500073	78500073	8.83053236256397e-12	108279974	108279974
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	108282483	108285877	2	2	-1.0184	8.83053236256397e-12	108279974	108279974	1.87894392297414e-11	108285877	108285877
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	108287130	146571330	10766	9930	-0.0056	1.87894392297414e-11	108285877	108285877	2.93057511423541e-24	146571330	146571330
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	1.0201	2.93057511423541e-24	146571330	146571330	4.43410002582978e-28	146592775	146592775
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	154601442	2203	2026	-0.0041	4.43410002582978e-28	146592775	146592775	4.47568192701807e-12	154601442	154601442
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154605621	154606943	2	2	0.9567	4.47568192701807e-12	154601442	154601442	2.08063878379952e-10	154606943	154606943
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154608095	242689978	30544	28030	0.0045	2.08063878379952e-10	154606943	154606943	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	12083726	4341	4008	-0.0061	NA	NA	NA	2.74805941908279e-10	12083726	12083726
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	12088055	12090170	2	2	-0.9424	2.74805941908279e-10	12083726	12083726	7.03518617957578e-10	12090170	12090170
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	12092030	75799026	22539	20745	-0.0044	7.03518617957578e-10	12090170	12090170	5.84571357672394e-16	75791158	75845446
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75803353	75875904	12	11	-0.5045	5.84571357672394e-16	75791158	75845446	1.15551089388748e-16	75870144	76000715
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76000715	163992903	26594	24485	0.0025	1.15551089388748e-16	75870144	76000715	0	163992903	163992903
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164027724	8	6	-3.5503	0	163992903	163992903	1.42687910912389e-06	164012645	164036648
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	16	-4.8672	1.42687910912389e-06	164012645	164036648	0	164107951	164107951
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	194354505	10130	9303	0.0065	0	164107951	164107951	0	194354505	194354505
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-4.8295	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196942158	1019	935	0.007	0	194366950	194366950	5.48404010831835e-07	196929826	196946355
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196943380	196943380	1	0	NA	5.48404010831835e-07	196929826	196946355	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196945209	196961238	7	6	0.4749	NA	NA	NA	5.6037670136424e-07	196952514	196966631
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196964180	199329592	953	865	-0.0072	5.6037670136424e-07	196952514	196966631	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	57658932	16160	14882	-0.0092	NA	NA	NA	4.48965987049175e-10	57658932	57658932
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	57660448	57660448	1	0	NA	4.48965987049175e-10	57658932	57658932	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	57662866	57665367	2	2	-0.9524	NA	NA	NA	3.52241431748057e-11	57665367	57665367
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	57668601	68905670	2270	2080	-0.0088	3.52241431748057e-11	57665367	57665367	8.79447527453307e-26	68901210	69069651
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	12	0.5703	8.79447527453307e-26	68901210	69069651	4.12786742807662e-25	69163312	69643272
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	173224400	31193	28787	-0.01	4.12786742807662e-25	69163312	69643272	1.64061371843448e-28	173224400	173224400
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	1.5008	1.64061371843448e-28	173224400	173224400	1.35140577654011e-27	173228860	173228860
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	187330240	4276	3925	-0.0063	1.35140577654011e-27	173228860	173228860	3.55336820094044e-117	187330240	187330240
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-3.0854	3.55336820094044e-117	187330240	187330240	1.20416001592782e-121	187333619	187333619
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	190717801	1132	1042	-0.03	1.20416001592782e-121	187333619	187333619	5.65888688704289e-67	190708316	190730982
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190725579	190921041	64	54	-0.4767	5.65888688704289e-67	190708316	190730982	1.95712139877405e-22	190915643	190930709
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190924564	191153613	45	42	-0.0746	1.95712139877405e-22	190915643	190930709	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	737829	222	204	0.004	NA	NA	NA	1.15834724035014e-10	729262	737829
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	776194	829954	6	6	-0.6449	1.15834724035014e-10	729262	737829	1.16958667735072e-14	829954	870657
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	82643666	23169	21353	-0.0086	1.16958667735072e-14	829954	870657	2.78663399535158e-13	82643666	82643666
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	82644783	82645974	2	2	-1.0608	2.78663399535158e-13	82643666	82643666	1.33172326534648e-13	82645974	82645974
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	82652867	82656285	2	0	NA	1.33172326534648e-13	82645974	82645974	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	82658346	140201609	16678	15365	-0.0048	NA	NA	NA	5.73299796838737e-12	140200229	140201609
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140203440	140216524	8	8	0.4925	5.73299796838737e-12	140200229	140201609	8.86611838307643e-14	140216524	140224323
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	140219465	1	0	NA	8.86611838307643e-14	140216524	140224323	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140221835	140533456	136	127	-0.0286	NA	NA	NA	1.30752251018772e-13	140533456	140533456
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140535820	140538666	2	2	-1.0704	1.30752251018772e-13	140533456	140533456	4.78322309944275e-13	140538666	140538666
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140541178	172345157	10748	9881	-0.0048	4.78322309944275e-13	140538666	140538666	1.38374195002359e-14	172345157	172345157
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	172348216	172349917	2	2	-1.128	1.38374195002359e-14	172345157	172345157	5.96667296114958e-20	172349917	172349917
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	172351264	172351264	1	0	NA	5.96667296114958e-20	172349917	172349917	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	172354422	172430564	38	35	-0.0247	NA	NA	NA	3.24230437394174e-09	172430564	172434549
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	172433128	172433128	1	0	NA	3.24230437394174e-09	172430564	172434549	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	172434549	172444032	5	3	-0.7353	NA	NA	NA	8.04772196459508e-09	172442075	172446217
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	172446217	178040439	1715	1591	-0.0036	8.04772196459508e-09	172442075	172446217	2.79704891518362e-06	178037603	178040439
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178044111	178045608	2	2	-0.7646	2.79704891518362e-06	178037603	178040439	2.96250447893024e-06	178045608	178053491
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178047480	178047480	1	0	NA	2.96250447893024e-06	178045608	178053491	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178053491	180346557	909	837	0.0048	NA	NA	NA	9.80668825067107e-27	180346557	180346557
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180348365	180358977	6	6	0.9021	9.80668825067107e-27	180346557	180346557	8.62498478365174e-21	180358977	180362342
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	100	0.0173	8.62498478365174e-21	180358977	180362342	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	38	0.0655	NA	NA	NA	3.66434220650424e-17	198124	200350
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	234115	13	11	-0.598	3.66434220650424e-17	198124	200350	1.12835838567211e-23	234115	236535
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	236535	29950805	10534	9671	-0.002	1.12835838567211e-23	234115	236535	1.44544817409317e-39	29941766	29966336
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30010234	15	15	0.6551	1.44544817409317e-39	29941766	29966336	7.822095112928e-29	30000990	30025480
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30021908	30021908	1	0	NA	7.822095112928e-29	30000990	30025480	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30025480	31385778	579	539	0.0182	NA	NA	NA	0	31385778	31387708
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31418006	6	6	-4.4512	0	31385778	31387708	0	31395330	31418006
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	32558677	489	443	0.0032	0	31395330	31418006	2.78952454193185e-75	32558677	32558677
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32605300	10	10	1.1326	2.78952454193185e-75	32558677	32558677	9.58546827323368e-21	32605300	32613538
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32609525	32609525	1	0	NA	9.58546827323368e-21	32605300	32613538	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32613538	32718991	36	33	-0.0102	NA	NA	NA	0.000988678959872924	32693779	32728285
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32720656	32766023	20	17	-0.4062	0.000988678959872924	32693779	32728285	1.16385798530694e-13	32745036	32775858
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32767722	35862502	1332	1224	7e-04	1.16385798530694e-13	32745036	32775858	8.26145507588926e-14	35862270	35862502
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35864636	35873335	6	6	-0.68	8.26145507588926e-14	35862270	35862502	9.77969262526376e-17	35873335	35875112
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35875112	54035000	6907	6376	0.0085	9.77969262526376e-17	35873335	35875112	0	54035000	54035000
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-4.2935	0	54035000	54035000	0	54042734	54042734
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	67060622	2771	2566	-0.0067	0	54042734	54042734	3.02230190098101e-23	67055837	67068673
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67068673	67105238	6	6	-0.8004	3.02230190098101e-23	67055837	67068673	4.21189658158823e-23	67101355	67105238
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67109079	155159371	28058	25876	-0.0065	4.21189658158823e-23	67101355	67105238	4.24760831758534e-13	155157679	155159371
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	155160734	155163895	3	3	-0.8646	4.24760831758534e-13	155157679	155159371	7.89720582401636e-14	155163895	155165959
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	155165959	162502077	2516	2317	0.0093	7.89720582401636e-14	155163895	155165959	5.8194809877178e-17	162502077	162502077
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	162504290	162505819	2	2	-1.1719	5.8194809877178e-17	162502077	162502077	4.93686536185533e-17	162505819	162505819
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	162508430	165643653	961	888	-0.0281	4.93686536185533e-17	162505819	162505819	5.84370266780434e-51	165643653	165643653
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.3781	5.84370266780434e-51	165643653	165643653	1.25184484280083e-44	165650610	165650610
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1643	0.0076	1.25184484280083e-44	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	18244187	6139	5678	-0.0036	NA	NA	NA	2.66067681943984e-13	18244187	18244187
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	18248366	18260638	3	3	-0.8832	2.66067681943984e-13	18244187	18244187	5.6652045462676e-13	18260638	18266003
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	18266003	76147819	16632	15350	-0.0064	5.6652045462676e-13	18260638	18266003	9.99433159250404e-11	76051954	76305940
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	76271458	76421843	9	8	0.4849	9.99433159250404e-11	76051954	76305940	5.65895288986378e-11	76331090	76551428
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	76539954	118609124	16481	15132	-0.0034	5.65895288986378e-11	76331090	76551428	3.28655632909838e-12	118609124	118609124
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118611324	118611324	1	0	NA	3.28655632909838e-12	118609124	118609124	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	0.8346	NA	NA	NA	9.4992033762338e-12	118620875	118620875
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	133433384	6827	6261	0.0022	9.4992033762338e-12	118620875	118620875	1.46225441013805e-10	133419940	133433384
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	-0.4825	1.46225441013805e-10	133419940	133433384	6.07451792780516e-11	133448277	133455682
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141410894	3700	3366	-0.0013	6.07451792780516e-11	133448277	133455682	2.57283352015185e-31	141409512	141417702
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	12	0.6566	2.57283352015185e-31	141409512	141417702	1.45827357826836e-26	141432778	141440184
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	141690753	117	109	0.0154	1.45827357826836e-26	141432778	141440184	7.3814616626569e-294	141690753	141690753
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	7	-4.6632	7.3814616626569e-294	141690753	141690753	0	141714168	141714168
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	141720303	1	0	NA	0	141714168	141714168	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720324	158821263	6751	6219	-0.0023	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	579405	118	110	-0.0146	NA	NA	NA	3.02947434998643e-57	579405	579405
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	581533	581533	1	0	NA	3.02947434998643e-57	579405	579405	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	2.2456	NA	NA	NA	1.69786217649726e-60	588865	588865
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	25022606	8008	7410	-0.0105	1.69786217649726e-60	588865	588865	2.29119990649371e-244	25022606	25022606
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	-3.7122	2.29119990649371e-244	25022606	25022606	1.00573918327196e-172	25039370	25039370
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	25047250	1	0	NA	1.00573918327196e-172	25039370	25039370	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25057567	25463846	192	171	-0.0402	NA	NA	NA	9.95663135722918e-17	25463846	25463846
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25467611	25470598	3	3	-0.9963	9.95663135722918e-17	25463846	25463846	8.08483655368675e-18	25470598	25470598
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25472648	39350798	4746	4354	-0.0141	8.08483655368675e-18	25470598	25470598	0	39350798	39350798
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	50	-4.7424	0	39350798	39350798	0	39505256	39505256
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	51191560	2179	2011	-0.0248	0	39505256	39505256	0	51191560	51191560
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51193977	51200291	4	4	-5.0727	0	51191560	51191560	0	51200291	51200291
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51202490	51202490	1	0	NA	0	51200291	51200291	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51204788	146264846	29249	26947	-0.0076	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	808126	279	257	-0.0262	NA	NA	NA	7.65099559086518e-16	808126	808126
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	810290	810290	1	0	NA	7.65099559086518e-16	808126	808126	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	813277	817900	3	3	-0.9739	NA	NA	NA	4.42794537449861e-17	817900	817900
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	821415	15802255	5175	4757	-0.0143	4.42794537449861e-17	817900	817900	9.90251617237396e-28	15802255	15802255
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	1.4733	9.90251617237396e-28	15802255	15802255	3.64707188447202e-26	15807123	15807123
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	123448269	25517	23531	-0.0069	3.64707188447202e-26	15807123	15807123	1.64120561989060e-07	123445852	123448269
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	123449399	123455396	4	4	0.5781	1.6412056198906e-07	123445852	123448269	9.17502313895183e-08	123455396	123465307
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	123458013	123458013	1	0	NA	9.17502313895183e-08	123455396	123465307	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	123460604	129219834	2523	2319	0.0052	NA	NA	NA	4.60467834653639e-11	129218343	129219834
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	129221786	129224728	3	3	-0.7771	4.60467834653639e-11	129218343	129219834	7.26030876674516e-09	129224728	129226241
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	129226241	137286520	3312	3036	0.0011	7.26030876674516e-09	129224728	129226241	7.18788350905994e-65	137273032	137291390
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137288595	137449020	56	53	0.4942	7.18788350905994e-65	137273032	137291390	2.72390577661593e-59	137440943	137454550
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137452191	140145683	1068	962	-0.0095	2.72390577661593e-59	137440943	137454550	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	8934	-0.0118	NA	NA	NA	9.59509955286548e-259	27038538	27038538
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-4.6572	9.59509955286548e-259	27038538	27038538	3.35240396448816e-274	27041812	27041812
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	46389734	4729	4397	-0.0135	3.35240396448816e-274	27041812	27041812	8.90617377807626e-74	46384985	46393097
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46391653	46568496	69	61	-0.4548	8.90617377807626e-74	46384985	46393097	2.27903928071704e-73	46558272	47021415
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47017598	77917893	10063	9288	-0.005	2.27903928071704e-73	46558272	47021415	1.27671339132502e-66	77917893	77917893
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	-1.932	1.27671339132502e-66	77917893	77917893	2.91587966010591e-67	77928738	77928738
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	97449717	6323	5843	-9e-04	2.91587966010591e-67	77928738	77928738	7.50771628525593e-11	97449717	97449717
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	97458529	97460217	2	2	-0.9746	7.50771628525593e-11	97449717	97449717	1.57241924627349e-10	97460217	97460217
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	97464566	135285645	13888	12755	0.0016	1.57241924627349e-10	97460217	97460217	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	187649	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	190215	4923300	1771	1629	0.004	NA	NA	NA	1.92064260198959e-12	4920907	4923300
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-0.7033	1.92064260198959e-12	4920907	4923300	3.48419570705548e-14	4932214	4934594
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	36188091	11246	10338	0.0015	3.48419570705548e-14	4932214	4934594	2.49386886889825e-08	36186041	36188091
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	36190502	36195304	3	3	-0.7079	2.49386886889825e-08	36186041	36188091	1.22994828502912e-08	36195304	36196809
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	36196809	55118214	3879	3548	-0.0079	1.22994828502912e-08	36195304	36196809	1.29850123955837e-102	55112618	55123719
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55217189	40	35	-0.6982	1.29850123955837e-102	55112618	55123719	4.79786912588973e-95	55209626	55219985
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	66463477	4637	4239	0.0017	4.79786912588973e-95	55209626	55219985	2.55831964994055e-17	66463477	66463477
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	1.2637	2.55831964994055e-17	66463477	66463477	2.35451104960570e-18	66469412	66469412
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	134450318	23720	21819	-4e-04	2.3545110496057e-18	66469412	66469412	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	10464018	4085	3784	-0.0034	NA	NA	NA	1.30024010275919e-11	10459455	10465787
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10465787	10485848	9	9	-0.4837	1.30024010275919e-11	10459455	10465787	1.89897941171294e-12	10484956	10493984
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10491341	11112600	234	217	0.0024	1.89897941171294e-12	10484956	10493984	2.73329086591851e-209	11112600	11112600
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11116883	11116883	1	0	NA	2.73329086591851e-209	11112600	11112600	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11128557	5	5	-3.6491	NA	NA	NA	0	11128557	11128557
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11130871	11130871	1	0	NA	0	11128557	11128557	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	29769947	6505	5989	-0.0029	NA	NA	NA	3.81860646123526e-24	29769947	29769947
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	29774307	29783059	5	4	-1.0057	3.81860646123526e-24	29769947	29769947	5.72425264404376e-24	29783059	29783059
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	29785503	79262470	15898	14610	-0.0033	5.72425264404376e-24	29783059	29783059	4.61884332373111e-13	79260182	79264802
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	79264802	79274017	5	5	-0.6744	4.61884332373111e-13	79260182	79264802	7.80156983476067e-13	79272903	79276503
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	79276503	132289090	18413	16945	-0.0033	7.80156983476067e-13	79272903	79276503	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	31428172	4884	4519	-0.0073	NA	NA	NA	1.29520468867735e-11	31428172	31428172
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	31431833	31436314	2	2	-1.028	1.29520468867735e-11	31428172	31428172	5.07865219249372e-13	31436314	31436314
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	31441218	36969571	2153	1979	-0.0032	5.07865219249372e-13	31436314	31436314	3.09815450840298e-12	36969571	36969571
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36976441	36982877	2	2	0.9923	3.09815450840298e-12	36969571	36969571	1.58438449506809e-11	36982877	36982877
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36989091	36989091	1	0	NA	1.58438449506809e-11	36982877	36982877	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36993048	49964838	5177	4752	-0.0092	NA	NA	NA	9.56571527802854e-98	49964838	49964838
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-2.8559	9.56571527802854e-98	49964838	49964838	8.89361570267108e-99	49971732	49971732
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56650373	1804	1665	0.002	8.89361570267108e-99	49971732	49971732	3.49346883504175e-14	56610886	56662112
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56685341	15	15	-0.4033	3.49346883504175e-14	56610886	56662112	1.17142370470547e-13	56677538	56693033
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	114123340	17604	16217	-0.0086	1.17142370470547e-13	56677538	56693033	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18544772	6	5	0.1252	NA	NA	NA	4.97722092655182e-07	18508651	18798641
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	19494416	54	49	0.6353	4.97722092655182e-07	18508651	18798641	5.8858065899007e-97	19492531	19497023
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	20411202	455	413	-0.0195	5.8858065899007e-97	19492531	19497023	2.01622359307162e-40	20407882	20424171
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	20424171	20481852	25	22	0.5987	2.01622359307162e-40	20407882	20424171	3.21437246855594e-41	20477432	20488177
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	20488177	21677411	580	540	-0.0013	3.21437246855594e-41	20477432	20488177	1.49019635875718e-34	21654727	21692412
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21678640	22051630	193	180	0.2135	1.49019635875718e-34	21654727	21692412	3.62017700934679e-50	22035729	22064175
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22052799	40676611	6335	5855	-0.0058	3.62017700934679e-50	22035729	22064175	2.91173671073635e-12	40663660	40680589
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40726930	8	8	0.5112	2.91173671073635e-12	40663660	40680589	1.73675848494030e-12	40722360	40741934
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40741934	73061942	11763	10857	9e-04	1.7367584849403e-12	40722360	40741934	2.11578826730204e-74	73061942	73061942
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73092112	8	7	1.3005	2.11578826730204e-74	73061942	73061942	1.05794206495184e-66	73092112	73092112
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	79174722	2914	2684	-0.0024	1.05794206495184e-66	73092112	73092112	6.95929963702898e-11	79172702	79174722
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79176037	79183154	4	4	-0.7138	6.95929963702898e-11	79172702	79174722	1.47491764912410e-11	79183154	79185548
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	105597555	9297	8568	0.0031	1.4749176491241e-11	79183154	79185548	0	105597555	105597555
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	-3.2249	0	105597555	105597555	4.35094209872231e-129	105632168	105632168
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105856591	49	44	-0.0564	4.35094209872231e-129	105632168	105632168	3.82716070695623e-17	105850033	105856591
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856972	105881893	6	6	0.7871	3.82716070695623e-17	105850033	105856591	7.9795976494687e-13	105881893	105897061
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	106358491	176	154	0.037	7.9795976494687e-13	105881893	105897061	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	20088256	156	147	-0.4136	NA	NA	NA	3.90050387893918e-135	20045859	20316992
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	45959981	8949	8268	-0.0089	3.90050387893918e-135	20045859	20316992	4.64710471279764e-19	45958505	45962341
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	45962341	45979866	11	10	0.5665	4.64710471279764e-19	45958505	45962341	3.50738378517211e-18	45978504	45981408
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	45981408	99632987	21932	20187	-3e-04	3.50738378517211e-18	45978504	45981408	2.01006319126888e-10	99632987	99632987
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	0.976	2.01006319126888e-10	99632987	99632987	1.28086944123837e-09	99635701	99635701
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	250	-0.0067	1.28086944123837e-09	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	21382540	7256	6649	-0.0063	NA	NA	NA	4.43129153183964e-09	21245809	21382540
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	21477973	21493483	8	7	-0.5079	4.43129153183964e-09	21245809	21382540	2.37087544247274e-10	21492912	21507188
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	21501073	21501073	1	0	NA	2.37087544247274e-10	21492912	21507188	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	21504151	22338034	283	261	-0.0158	NA	NA	NA	1.49591600967224e-08	22320911	22338034
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22541389	22604851	9	9	-0.4105	1.49591600967224e-08	22320911	22338034	4.41590266197731e-08	22604851	22636249
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22609825	32379126	3016	2792	-0.0061	4.41590266197731e-08	22604851	22636249	4.67345733788303e-64	31854794	32481309
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33842125	49	48	-0.4885	4.67345733788303e-64	31854794	32481309	2.87256955654097e-63	33841331	33868686
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33846647	75092501	9900	9136	-0.0095	2.87256955654097e-63	33841331	33868686	1.17091990754091e-139	75092501	75092501
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75093957	75093957	1	0	NA	1.17091990754091e-139	75092501	75092501	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-2.8428	NA	NA	NA	6.37172961997327e-150	75100865	75100865
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76923844	609	562	-0.0203	6.37172961997327e-150	75100865	75100865	0	76923844	76923844
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76925748	76925748	1	0	NA	0	76923844	76923844	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	-3.2884	NA	NA	NA	0	76940218	76940218
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4155	-0.006	0	76940218	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1904451	854	797	-0.0091	NA	NA	NA	7.55974473087415e-14	1904451	1904451
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906319	1906391	3	3	1.002	7.55974473087415e-14	1904451	1904451	5.5774596527752e-17	1906391	1906391
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	1909371	1	0	NA	5.5774596527752e-17	1906391	1906391	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909874	31461588	11180	10293	-0.0015	NA	NA	NA	3.92338696843184e-22	31451114	31467971
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31462463	31499568	17	17	-0.4807	3.92338696843184e-22	31451114	31467971	2.36685211364706e-08	31490899	31889566
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31503774	31922861	16	15	-0.034	2.36685211364706e-08	31490899	31889566	1.76401956922820e-07	31922861	31922861
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31925650	31928557	2	2	0.7299	1.7640195692282e-07	31922861	31922861	3.90368549902991e-07	31928557	31930168
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31930168	32828797	348	314	-0.0238	3.90368549902991e-07	31928557	31930168	1.25085599946929e-19	32828797	32828797
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	1.2096	1.25085599946929e-19	32828797	32828797	9.19525786906796e-16	32832642	32832642
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	41519702	3465	3166	0.003	9.19525786906796e-16	32832642	32832642	3.17580850417318e-23	41515622	41519702
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41521544	1	0	NA	3.17580850417318e-23	41515622	41519702	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41522429	41564408	19	18	-0.4831	NA	NA	NA	0.00226562668024934	41552048	41599011
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41566540	41710400	47	45	-0.6593	0.00226562668024934	41552048	41599011	1.09873029280325e-109	41708551	42142363
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	74875257	12208	11216	-0.0023	1.09873029280325e-109	41708551	42142363	1.45619959331987e-21	74872990	74875257
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	74877854	74902356	14	12	0.5691	1.45619959331987e-21	74872990	74875257	7.1627583985154e-20	74902356	74905971
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	74904114	78653545	1457	1333	-0.0016	7.1627583985154e-20	74902356	74905971	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	21119	-0.0092	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	11448975	5172	4753	-0.0187	NA	NA	NA	2.36517547923137e-27	11448975	11448975
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.6402	2.36517547923137e-27	11448975	11448975	2.02621753218971e-29	11452390	11452390
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	14509470	1311	1218	-0.0203	2.02621753218971e-29	11452390	11452390	3.74348930261572e-11	14509470	14509470
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	14511347	14511347	1	0	NA	3.74348930261572e-11	14509470	14509470	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	14513289	14514080	2	2	-1.0562	NA	NA	NA	4.12816922243892e-12	14514080	14514080
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	14515128	38278478	5252	4856	0.0019	4.12816922243892e-12	14514080	14514080	7.46863510676673e-08	38278478	38278478
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	38281159	38282953	2	2	-0.8611	7.46863510676673e-08	38278478	38278478	1.63676742808934e-08	38282953	38282953
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	38284351	40540618	951	876	0.0056	1.63676742808934e-08	38282953	38282953	2.66015448302147e-95	40540618	40540618
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40543992	40553315	3	3	-2.3042	2.66015448302147e-95	40540618	40540618	3.20132603669084e-89	40553315	40553315
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40556205	55769042	6659	6113	0.0014	3.20132603669084e-89	40553315	40553315	2.05172385211059e-14	55769042	55769042
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55770195	55772729	2	2	-1.1556	2.05172385211059e-14	55769042	55769042	6.84096196257342e-13	55772729	55772729
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55776055	58197961	1104	1009	-0.0269	6.84096196257342e-13	55772729	55772729	3.98156328511775e-06	58165551	58204170
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58198955	58249435	23	23	-0.2612	3.98156328511775e-06	58165551	58204170	1.15198387489758e-06	58241773	58271979
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58252109	59491509	603	561	-0.0272	1.15198387489758e-06	58241773	58271979	8.73956380075663e-09	59488537	59491509
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59492650	59497049	2	2	-0.9229	8.73956380075663e-09	59488537	59491509	1.01320510237513e-08	59497049	59500575
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59500575	63788698	1970	1826	-0.0201	1.01320510237513e-08	59497049	59500575	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	12719	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	15778	1506379	585	543	0.0025	NA	NA	NA	4.01581123064203e-16	1506379	1506379
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1516966	3	3	-1.0068	4.01581123064203e-16	1506379	1506379	0.00095422583857169	1516966	1523000
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1518825	1518825	1	0	NA	0.00095422583857169	1516966	1523000	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1521410	1531162	5	5	-2.9809	NA	NA	NA	1.06861917634462e-266	1531162	1531162
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	51906833	17177	15850	-6e-04	1.06861917634462e-266	1531162	1531162	5.02924097685005e-11	51903443	51906833
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	51910029	51916264	3	3	-0.8082	5.02924097685005e-11	51903443	51906833	8.18028325654136e-10	51916264	51917762
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	51917762	62419534	3804	3475	0.0134	8.18028325654136e-10	51916264	51917762	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	9994686	7	7	-0.4643	NA	NA	NA	2.02878578177537e-08	9994686	10022306
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	10004854	46922972	13434	12377	4e-04	2.02878578177537e-08	9994686	10022306	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	23251050	3257	3017	0.0011	NA	NA	NA	2.76139182658401e-07	23247896	23254181
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	23254181	23264359	7	7	0.4677	2.76139182658401e-07	23247896	23254181	2.7504556483231e-08	23264294	23267830
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	23266430	35472378	6287	5804	0.0027	2.7504556483231e-08	23264294	23267830	2.19927251842795e-200	35472378	35472378
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-4.119	2.19927251842795e-200	35472378	35472378	1.15468388964554e-174	35476942	35476942
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6427	0.0036	1.15468388964554e-174	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.023	NA	NA	NA	0.00105581858433825	1529	94062
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	-0.5051	0.00105581858433825	1529	94062	5.68930302604417e-12	104732	104732
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	106242	1	0	NA	5.68930302604417e-12	104732	104732	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	108902	122273	14	13	0.0505	NA	NA	NA	6.03024724964363e-06	122159	127113
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	124528	130528	6	5	0.5993	6.03024724964363e-06	122159	127113	3.63097704840274e-09	130528	133501
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	849437	535	505	-0.0251	3.63097704840274e-09	130528	133501	5.40548055492987e-10	845758	851251
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	851066	859452	7	6	-0.6216	5.40548055492987e-10	845758	851251	8.54151550810883e-09	856619	860688
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	859493	2708291	1217	1123	-0.0631	8.54151550810883e-09	856619	860688	0	2708291	2711273
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	7769323	1554	1436	0.902	0	2708291	2711273	2.25841411489243e-08	7764729	7769323
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	7773950	7773981	2	2	0.0474	2.25841411489243e-08	7764729	7769323	8.83884941822985e-08	7773981	7779354
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	7779354	8449254	233	215	0.93	8.83884941822985e-08	7773981	7779354	9.24376396623923e-09	8445177	8458058
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8450789	8473482	10	9	0.4698	9.24376396623923e-09	8445177	8458058	1.66025931873973e-10	8461739	8481816
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8475091	8477126	2	0	NA	1.66025931873973e-10	8461739	8481816	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8481280	35921332	10617	9805	0.9671	NA	NA	NA	2.09007477720171e-135	35917500	35923706
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	35922687	36186175	108	98	1.4936	2.09007477720171e-135	35917500	35923706	1.13065606670572e-123	36181528	36197313
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	36187470	36187470	1	0	NA	1.13065606670572e-123	36181528	36197313	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	36195135	47739324	4008	3691	0.9642	NA	NA	NA	4.5181046188794e-50	47734767	47765476
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	47746322	47746322	1	0	NA	4.5181046188794e-50	47734767	47765476	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	47747688	47906417	44	41	1.4838	NA	NA	NA	6.32013073406945e-51	47845497	47925945
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	47913452	154442377	28522	26312	0.9563	6.32013073406945e-51	47845497	47925945	0	154442377	154442377
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	3	-3.9728	0	154442377	154442377	0	154450309	154450309
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	28	0.8998	0	154450309	154450309	5.18040842128149e-118	154578922	154582414
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	187	0.0105	5.18040842128149e-118	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3219200	122	113	-4.4097	NA	NA	NA	3.65593241653218e-32	3034907	3219200
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3223585	3733715	2	0	NA	3.65593241653218e-32	3034907	3219200	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	4431527	10	9	-0.1642	NA	NA	NA	1.37386045141491e-21	4431527	4597974
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4597974	7027599	165	151	-4.0542	1.37386045141491e-21	4431527	4597974	1.74379857955620e-06	6973086	7190466
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7028989	7653082	175	158	-3.2747	1.7437985795562e-06	6973086	7190466	5.8394284861757e-11	7436876	7701303
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	10515697	492	438	-4.0036	5.8394284861757e-11	7436876	7701303	9.57566850968303e-24	10513747	10515697
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10645500	12	10	-0.6697	9.57566850968303e-24	10513747	10515697	2.02059494650611e-10	10645500	11660512
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12541506	18	17	-4.1423	2.02059494650611e-10	10645500	11660512	0.00454546019738764	12514978	12576110
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	49	-2.6079	0.00454546019738764	12514978	12576110	3.28269080113797e-05	12602617	12721434
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12928074	57	55	-3.7446	3.28269080113797e-05	12602617	12721434	6.7660346878485e-14	12922667	12960717
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12939004	13048283	46	44	-2.0531	6.7660346878485e-14	12922667	12960717	0.000131109486715217	13021620	13059372
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13050965	13101234	22	22	-3.4305	0.000131109486715217	13021620	13059372	2.71678992749694e-06	13089124	13101234
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13104920	13104920	1	0	NA	2.71678992749694e-06	13089124	13101234	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13106723	13128515	9	9	-1.4729	NA	NA	NA	6.23562523070295e-20	13128515	13129843
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13603478	205	192	-4.2409	6.23562523070295e-20	13128515	13129843	4.67998627342121e-05	13568153	13644667
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13606316	13716331	16	14	-3.1004	4.67998627342121e-05	13568153	13644667	7.91139054499529e-10	13701755	13718946
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13717328	13816133	24	21	-4.5804	7.91139054499529e-10	13701755	13718946	6.85932045026153e-06	13785396	13828384
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13820955	13820955	1	0	NA	6.85932045026153e-06	13785396	13828384	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13823928	13863657	9	8	-3.2499	NA	NA	NA	0.00029599590044017	13854447	13872200
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13866668	14343139	155	141	-4.5239	0.00029599590044017	13854447	13872200	4.10777092181606e-12	14322984	14377844
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14349668	14524829	97	89	-3.641	4.10777092181606e-12	14322984	14377844	1.44589118739321e-07	14506319	14524829
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14526446	14536962	5	5	-1.0063	1.44589118739321e-07	14506319	14524829	2.19489327313753e-06	14530134	14539230
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14538156	14538156	1	0	NA	2.19489327313753e-06	14530134	14539230	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14539230	14561228	13	11	-2.9936	NA	NA	NA	1.01657215791533e-10	14557473	14561228
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14563486	14598838	11	9	-4.6874	1.01657215791533e-10	14557473	14561228	1.12064911800504e-48	14598838	14598838
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14601309	14644293	4	4	-0.8335	1.12064911800504e-48	14598838	14598838	3.3393032673524e-11	14644293	14681738
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	14701706	14	14	-3.6923	3.3393032673524e-11	14644293	14681738	3.66315379457795e-06	14695441	14707011
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14702545	14883615	42	39	-4.7943	3.66315379457795e-06	14695441	14707011	0.00222914672088174	14836085	15118268
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14894476	15204346	83	81	-3.9792	0.00222914672088174	14836085	15118268	0.000340925574724518	15199550	15204346
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15205160	15205160	1	0	NA	0.000340925574724518	15199550	15204346	NA	NA	NA
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15206674	15221212	6	5	-1.6329	NA	NA	NA	0.107882728462126	15221212	15228303
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15222741	15241527	7	7	-3.0673	0.107882728462126	15221212	15228303	0.00628896836912877	15223545	15252823
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15242592	15434486	129	117	-4.2646	0.00628896836912877	15223545	15252823	6.95569067699252e-06	15412637	15519963
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15443458	15707307	92	87	-3.557	6.95569067699252e-06	15412637	15519963	0.0004054140764812	15658114	15707307
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15713288	15761232	8	8	-5.2994	0.0004054140764812	15658114	15707307	3.61361309125542e-05	15761232	15788556
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15765251	15848986	16	15	-4.1569	3.61361309125542e-05	15761232	15788556	6.21069431323435e-05	15826121	15862122
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15854496	15915466	9	9	-5.3079	6.21069431323435e-05	15826121	15862122	3.07553931498208e-05	15915466	15951430
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16206224	123	113	-3.4737	3.07553931498208e-05	15915466	15951430	1.11278886637660e-12	16173830	16300643
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16212418	22139807	977	907	-4.2313	1.1127888663766e-12	16173830	16300643	4.63614008396667e-11	22056953	22157319
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.7707	4.63614008396667e-11	22056953	22157319	1.84542799671852e-23	22176501	22177335
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22202315	7	7	-4.2568	1.84542799671852e-23	22176501	22177335	0.00094168796300374	22202315	22210081
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22203194	22252446	18	14	-5.2999	0.00094168796300374	22202315	22210081	1.81939173403641e-05	22240294	22367156
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22252795	25737663	70	62	-4.2401	1.81939173403641e-05	22240294	22367156	3.46598053931229e-85	25737663	25737663
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26945893	31	26	-1.0572	3.46598053931229e-85	25737663	25737663	1.07435837715359e-17	26945084	26950080
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	26980386	5	5	-4.0861	1.07435837715359e-17	26945084	26950080	2.84739280447652e-05	26957814	26990807
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26984336	27019256	12	12	-1.5026	2.84739280447652e-05	26957814	26990807	7.71434220473528e-08	27009433	27019256
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27039222	4	4	-4.5029	7.71434220473528e-08	27009433	27019256	1.33988833848178e-25	27039222	27053237
MSK_252152916790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	30	-0.7112	1.33988833848178e-25	27039222	27053237	NA	NA	NA
