Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	16838573	5788	5540	-0.3778	NA	NA	NA	1.10022314803126e-09	16814050	16926444
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16888048	17127039	19	18	0.164	1.10022314803126e-09	16814050	16926444	9.03986747916542e-11	17107476	17157415
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17148592	32000274	5929	5702	-0.3975	9.03986747916542e-11	17107476	17157415	1.09968450916028e-133	31995460	32006211
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	32003131	32446834	180	169	0.2363	1.09968450916028e-133	31995460	32006211	1.17803821523290e-09	32427625	32461349
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	32449772	32529429	37	35	0.5938	1.1780382152329e-09	32427625	32461349	9.24044927688312e-14	32521602	32548204
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	32530919	72537426	15941	15336	0.1953	9.24044927688312e-14	32521602	32548204	4.22655252829226e-295	72537426	72539143
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	10	-3.4603	4.22655252829226e-295	72537426	72539143	4.03473789745213e-303	72574479	72579311
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	110023268	11703	11265	0.1608	4.03473789745213e-303	72574479	72579311	1.30232183032223e-12	110023268	110023268
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110039388	3	3	-1.2159	1.30232183032223e-12	110023268	110023268	1.66293806702605e-12	110039388	110039388
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	150819879	5850	5613	0.1626	1.66293806702605e-12	110039388	110039388	3.33116275300092e-63	150819879	150819879
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	11	1.7494	3.33116275300092e-63	150819879	150819879	1.51602779791027e-61	150851439	150851439
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151024118	77	76	0.0847	1.51602779791027e-61	150851439	150851439	2.55298384641725e-07	151020826	151024118
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151026228	151036435	5	5	0.8798	2.55298384641725e-07	151020826	151024118	4.85908453416283e-05	151036435	151047260
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	151038091	1	0	NA	4.85908453416283e-05	151036435	151047260	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151040463	152774139	778	745	0.1881	NA	NA	NA	1.79817295390875e-06	152764337	152777161
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	152777161	152793018	8	8	0.8047	1.79817295390875e-06	152764337	152777161	2.96935663423309e-09	152793018	152800835
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	152794152	163612906	4349	4201	0.1537	2.96935663423309e-09	152793018	152800835	3.62028104262852e-08	163587322	163618047
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	163615467	163658250	24	23	0.5667	3.62028104262852e-08	163587322	163618047	2.18181912843221e-08	163654002	163672396
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	163659611	185979586	8846	8499	0.1502	2.18181912843221e-08	163654002	163672396	6.79837089593658e-12	185979586	185979586
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	-1.5125	6.79837089593658e-12	185979586	185979586	4.66313660105368e-13	185988138	185988138
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	195009358	1970	1899	0.1519	4.66313660105368e-13	185988138	185988138	1.27824667078911e-08	194977713	195014129
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195011344	195065867	8	8	-0.5294	1.27824667078911e-08	194977713	195014129	1.06083912245471e-08	195048208	195095156
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	200613454	2163	2087	0.181	1.06083912245471e-08	195048208	195095156	1.33596316553583e-10	200596027	200618814
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200616638	200665389	18	18	-0.3394	1.33596316553583e-10	200596027	200618814	3.26714758994503e-09	200659076	200678532
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200667381	240485842	14859	14327	0.1423	3.26714758994503e-09	200659076	200678532	1.49192543229320e-11	240468647	240513555
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	240489591	240568872	27	27	-0.2911	1.4919254322932e-11	240468647	240513555	9.38681060893002e-11	240544811	240596160
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	240572868	247186514	2538	2454	0.1449	9.38681060893002e-11	240544811	240596160	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	23980127	6868	6598	-0.5448	NA	NA	NA	0	23977682	23989408
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	23981946	34543992	4654	4497	0.135	0	23977682	23989408	0	34543992	34543992
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	18	-4.4906	0	34543992	34543992	0	34589997	34589997
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	112749123	23801	22879	0.1204	0	34589997	34589997	4.60467429733346e-12	112749123	112749123
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	112750646	112752277	2	2	1.795	4.60467429733346e-12	112749123	112749123	1.32973810231346e-12	112752277	112752277
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	112761950	213321815	31978	30730	0.111	1.32973810231346e-12	112752277	112752277	0	213315697	213341383
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	213336807	237915112	8674	8359	-0.4928	0	213315697	213341383	0	237909871	237923708
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	237918358	242677011	1827	1755	0.081	0	237909871	237923708	0.00610094735156369	242586855	242682950
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242677069	242689978	5	5	-0.3782	0.00610094735156369	242586855	242682950	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	7997441	2734	2625	0.1052	NA	NA	NA	7.024169669569e-25	7975253	8006573
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	7999551	8225622	46	46	0.5869	7.024169669569e-25	7975253	8006573	3.71242593374525e-22	8215033	8248054
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	8228202	32074432	8016	7694	0.1317	3.71242593374525e-22	8215033	8248054	2.19820852799581e-76	32074432	32074432
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	-3.9407	2.19820852799581e-76	32074432	32074432	2.33571922314617e-74	32080848	32080848
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	129815280	31578	30380	0.1284	2.33571922314617e-74	32080848	32080848	0	129798743	129826808
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	129816593	146842195	5852	5645	0.528	0	129798743	129826808	6.985341852124e-300	146804584	146860254
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	146850029	148503648	381	368	1.1449	6.985341852124e-300	146804584	146860254	8.54751515854474e-268	148499121	148514232
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	148507154	153584327	1581	1521	0.5237	8.54751515854474e-268	148499121	148514232	2.24196489622769e-303	153578082	153591796
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	153587923	155372521	440	430	1.1283	2.24196489622769e-303	153578082	153591796	0	155369353	155379531
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	155374007	164005577	2861	2749	0.527	0	155369353	155379531	2.12120550992303e-95	164005577	164005577
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	-2.333	2.12120550992303e-95	164005577	164005577	2.06437469571284e-30	164027724	164027724
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164112873	21	20	1.0016	2.06437469571284e-30	164027724	164027724	1.20946980080900e-09	164101776	164138342
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164115417	192546280	9547	9175	0.5305	1.209469800809e-09	164101776	164138342	6.75066444397879e-16	192546280	192548135
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192548135	192552734	4	4	-0.8034	6.75066444397879e-16	192546280	192548135	3.28915814682251e-16	192550989	192552734
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192554451	196820428	1579	1519	0.5322	3.28915814682251e-16	192550989	192552734	5.13386652061961e-55	196810503	196820428
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196822133	196822133	1	0	NA	5.13386652061961e-55	196810503	196820428	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196929826	21	20	-0.5583	NA	NA	NA	0.00234122696200879	196927528	196946355
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196940125	196957322	8	7	-0.0402	0.00234122696200879	196927528	196946355	0.000173490036045267	196946355	196970927
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196958467	196958467	1	0	NA	0.000173490036045267	196946355	196970927	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196961238	199307774	948	918	0.536	NA	NA	NA	0.0622964898331888	199228720	199320046
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	199309650	199329592	6	6	0.1245	0.0622964898331888	199228720	199320046	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	75050	13	12	-0.0058	NA	NA	NA	4.50623359236456e-07	58159	93573
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	78043	5370189	1774	1711	0.549	4.50623359236456e-07	58159	93573	0	5320836	5382901
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	5373225	55009984	13440	12918	0.1107	0	5320836	5382901	0	54996005	55039233
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	55015839	68905670	3206	3066	-0.5401	0	54996005	55039233	9.67197936715163e-68	68905670	68905670
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	-1.9404	9.67197936715163e-68	68905670	68905670	8.50744982309271e-65	69165814	69165814
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	102575047	11271	10869	-0.5231	8.50744982309271e-65	69165814	69165814	2.86496887545474e-20	102566393	102582644
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	102580828	102684060	25	25	0.0777	2.86496887545474e-20	102566393	102582644	3.65711185562161e-99	102667813	102695583
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	102687552	157099512	15379	14794	-0.4954	3.65711185562161e-99	102667813	102695583	3.30327471348666e-93	157095741	157099512
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	157101726	157138459	10	9	0.4047	3.30327471348666e-93	157095741	157099512	9.85748131937409e-19	157138459	157143887
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	157143887	173224400	4508	4328	-0.5321	9.8574813193741e-19	157138459	157143887	1.76893769320342e-12	173224400	173224400
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	1.0996	1.76893769320342e-12	173224400	173224400	3.21944269419036e-12	173228860	173228860
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	188404977	4679	4469	-0.5371	3.21944269419036e-12	173228860	173228860	0	188396640	188412477
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	188406973	190425991	649	625	0.1139	0	188396640	188412477	3.30391583185455e-11	190424374	190425991
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190431567	190437365	3	3	-1.1947	3.30391583185455e-11	190424374	190425991	8.20069378663982e-11	190437365	190437365
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190439544	190706272	76	75	0.0442	8.20069378663982e-11	190437365	190437365	4.92559786196433e-14	190676708	190754887
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190708316	190921041	67	64	-0.3835	4.92559786196433e-14	190676708	190754887	1.70141034843548e-11	190899545	190936155
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190924564	191153613	45	44	0.0928	1.70141034843548e-11	190899545	190936155	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	776194	223	215	0.3691	NA	NA	NA	2.52510922978069e-19	730853	776194
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	812169	829954	5	5	-1.286	2.52510922978069e-19	730853	776194	1.27782372726612e-30	829954	829954
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	17395391	5238	5049	0.3601	1.27782372726612e-30	829954	829954	1.66399689132172e-27	17394016	17395391
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	17397258	17409796	8	8	-0.875	1.66399689132172e-27	17394016	17395391	2.23179794963415e-181	17409796	17409796
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	17411379	37752850	5243	5059	0.4746	2.23179794963415e-181	17409796	17409796	0	37707528	37770846
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	37754314	52700599	3088	2984	0.1193	0	37707528	37770846	0	52688810	52711939
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	52706818	114677626	18093	17436	-0.5217	0	52688810	52711939	4.82334236196221e-10	114669716	114677626
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	114684491	114713274	6	6	0.3476	4.82334236196221e-10	114669716	114677626	1.08238637364766e-15	114713274	114724080
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	114718791	140201609	8175	7855	-0.4806	1.08238637364766e-15	114713274	114724080	1.05957800755901e-109	140201609	140201609
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140203440	140216524	8	7	-3.0585	1.05957800755901e-109	140201609	140201609	6.19607290094635e-108	140216524	140216524
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	150181399	3767	3637	-0.4616	6.19607290094635e-108	140216524	140216524	4.05216013586192e-69	150181399	150181399
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150185190	150202601	7	7	-2.5443	4.05216013586192e-69	150181399	150181399	1.48883238034901e-67	150202601	150202601
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	155405839	1622	1564	-0.4781	1.48883238034901e-67	150202601	150202601	6.17934145736081e-43	155405839	155405839
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155411053	155420791	4	4	-2.6597	6.17934145736081e-43	155405839	155405839	4.61177220008797e-42	155420791	155420791
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155421443	180346557	8161	7846	-0.4617	4.61177220008797e-42	155420791	155420791	8.4334899205923e-239	180346557	180346557
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180348365	180358977	6	6	-4.7139	8.4334899205923e-239	180346557	180346557	6.35323996314435e-146	180358977	180358977
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	105	-0.4044	6.35323996314435e-146	180358977	180358977	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	198124	39	36	0.132	NA	NA	NA	4.38030143263425e-08	162463	202063
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	200350	278304	36	35	0.5446	4.38030143263425e-08	162463	202063	3.9998104164157e-08	268978	303353
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	279694	3235620	1202	1158	0.2066	3.9998104164157e-08	268978	303353	5.76429605524765e-146	3219429	3257324
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	3236943	6309051	1206	1154	0.5445	5.76429605524765e-146	3219429	3257324	1.08201722982702e-68	6288049	6333986
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	6312240	7292205	350	334	0.8888	1.08201722982702e-68	6288049	6333986	4.31703250639108e-39	7281589	7308971
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	7299520	7490705	87	84	1.4193	4.31703250639108e-39	7281589	7308971	2.38942944446223e-54	7482260	7499582
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	7491894	14658867	2309	2214	0.8709	2.38942944446223e-54	7482260	7499582	0	14609011	14710400
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	14664778	32548736	6447	6202	0.5042	0	14609011	14710400	1.57970603710104e-132	32548736	32593151
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32633691	18	17	-1.4559	1.57970603710104e-132	32548736	32593151	1.57297244302694e-125	32609525	32633691
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	44343791	4910	4726	0.5318	1.57297244302694e-125	32609525	32633691	0	44330791	44353374
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	44345792	54035000	3385	3257	0.0937	0	44330791	44353374	3.99092385039596e-199	54035000	54035000
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-5.0777	3.99092385039596e-199	54035000	54035000	3.88747000972116e-199	54042734	54042734
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	55931287	671	644	0.1454	3.88747000972116e-199	54042734	54042734	1.59169280558082e-08	55924749	55931287
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	55934816	55959474	7	7	-0.5753	1.59169280558082e-08	55924749	55931287	7.89894400185298e-08	55959474	55978389
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	55972300	64399587	1389	1338	0.1007	7.89894400185298e-08	55959474	55978389	5.53941164236378e-09	64395178	64406915
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	64401776	64424978	12	10	-0.5057	5.53941164236378e-09	64395178	64406915	2.05567524473417e-10	64416341	64430902
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	64428054	103841482	11128	10720	0.1744	2.05567524473417e-10	64416341	64430902	4.09743244073829e-11	103827105	103841482
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	1.2824	4.09743244073829e-11	103827105	103841482	6.13624266740388e-11	103868154	103873584
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	108375819	1377	1331	0.182	6.13624266740388e-11	103868154	103873584	0	108370126	108380764
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	108379254	121920136	4425	4262	-0.5202	0	108370126	108380764	0	121911253	121923831
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	121921908	154325669	11483	11021	0.1043	0	121911253	121923831	2.70089868736301e-152	154319751	154331355
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	154331355	154583869	100	98	0.9086	2.70089868736301e-152	154319751	154331355	6.8169639994688e-139	154580776	154587170
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	154585977	165643653	3721	3571	0.1025	6.8169639994688e-139	154580776	154587170	1.14666799926316e-09	165642393	165643653
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165649379	3	3	-1.1367	1.14666799926316e-09	165642393	165643653	2.63081368190149e-09	165649379	165650610
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165650610	170753106	1805	1744	0.0941	2.63081368190149e-09	165649379	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	136373	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	138059	3575931	1253	1200	-0.4565	NA	NA	NA	9.4635946280937e-23	3575931	3575931
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	3578428	3582201	3	3	-2.4623	9.4635946280937e-23	3575931	3575931	1.05087328592803e-24	3582201	3582201
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	3583854	45190313	14875	14322	-0.5213	1.05087328592803e-24	3582201	3582201	0	45184309	45194495
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	45192026	53218473	2025	1940	0.1503	0	45184309	45194495	3.93262145260168e-118	53212228	53223394
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	53223394	53540802	67	65	-0.7729	3.93262145260168e-118	53212228	53223394	7.69816509521995e-126	53527012	53545494
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	53545494	85295533	7529	7266	0.156	7.69816509521995e-126	53527012	53545494	0	85248513	85340643
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	85305666	109967918	9514	9130	0.5934	0	85248513	85340643	2.02106893383964e-218	109967918	109967918
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109970524	109974402	2	2	-6.4477	2.02106893383964e-218	109967918	109967918	9.89225848195597e-240	109974402	109974402
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109976628	118611324	3996	3831	0.5938	9.89225848195597e-240	109974402	109974402	2.66728063148106e-18	118611324	118611324
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	2.2084	2.66728063148106e-18	118611324	118611324	4.66403626329049e-17	118620875	118620875
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	125831554	3170	3047	0.5928	4.66403626329049e-17	118620875	118620875	2.96333597064916e-133	125831554	125831554
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-3.8606	2.96333597064916e-133	125831554	125831554	8.83024619807522e-131	125837524	125837524
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	138378001	5942	5693	0.6161	8.83024619807522e-131	125837524	125837524	0	138367439	138388756
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	138380240	141410894	1420	1361	0.2004	0	138367439	138388756	3.24670348919023e-07	141405145	141417702
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	12	0.7371	3.24670348919023e-07	141405145	141417702	1.41237979539674e-07	141429405	141449014
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	141783397	158	153	0.1697	1.41237979539674e-07	141429405	141449014	2.14271522186641e-59	141771153	141794834
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141784887	143503317	628	609	0.6352	2.14271522186641e-59	141771153	141794834	5.14023036062541e-10	143500499	143503317
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143582864	143584350	3	3	-0.6013	5.14023036062541e-10	143500499	143503317	1.60219718232811e-08	143584350	143705425
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143705425	144395186	313	303	0.602	1.60219718232811e-08	143584350	143705425	3.17372376202333e-109	144383635	144418031
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144399712	147702365	1537	1476	0.1724	3.17372376202333e-109	144383635	144418031	1.20133011800053e-14	147702365	147702365
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.5911	1.20133011800053e-14	147702365	147702365	3.66969212911656e-14	147707161	147707161
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	147770403	29	28	0.1484	3.66969212911656e-14	147707161	147707161	1.17949789594411e-09	147766644	147770403
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147774710	147794388	10	10	-0.5477	1.17949789594411e-09	147766644	147770403	5.91642921226903e-14	147794388	147798340
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147796581	148057975	117	115	0.2365	5.91642921226903e-14	147794388	147798340	1.49245022166310e-29	148047361	148063496
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	148060280	148174547	58	54	-0.3353	1.4924502216631e-29	148047361	148063496	1.29816820054830e-28	148167231	148183967
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	148176654	158821263	4024	3869	0.1905	1.2981682005483e-28	148167231	148183967	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	7327293	2396	2311	-0.5275	NA	NA	NA	1.75868475112512e-08	6909487	7729311
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7697025	8139999	7	6	-1.1332	1.75868475112512e-08	6909487	7729311	1.10609370574243e-05	7824059	8148437
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8143301	9533226	481	466	-0.4839	1.10609370574243e-05	7824059	8148437	7.24185582527907e-31	9533226	9533226
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	9535456	9538031	3	3	-2.5697	7.24185582527907e-31	9533226	9533226	5.57027217270184e-28	9538031	9538031
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	9539424	25022606	5242	5024	-0.4927	5.57027217270184e-28	9538031	9538031	6.43822025490289e-11	25022606	25022606
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25034970	2	2	1.1227	6.43822025490289e-11	25022606	25022606	4.01007358873987e-11	25034970	25034970
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25039370	25039370	1	0	NA	4.01007358873987e-11	25034970	25034970	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	33422294	3212	3071	-0.5036	NA	NA	NA	2.51046398881344e-311	33398820	33438760
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	33424056	39350798	1730	1658	-0.1462	2.51046398881344e-311	33398820	33438760	0	39350798	39350798
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	55	-4.4093	0	39350798	39350798	0	39504332	39505256
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	87255865	12687	12216	-0.1551	0	39504332	39505256	1.16432043156326e-99	87255865	87255865
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87258019	87262662	3	3	-2.6044	1.16432043156326e-99	87255865	87255865	1.12604398695745e-36	87262662	87262662
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87265435	94223859	1975	1900	-0.3745	1.12604398695745e-36	87262662	87262662	0	94213741	94232767
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	94226680	104054700	3681	3565	0.2475	0	94213741	94232767	3.99466134532316e-32	104043069	104068094
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	104056914	104155985	39	39	0.8552	3.99466134532316e-32	104043069	104068094	1.49420420082637e-25	104148894	104163460
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	104157913	106966581	1055	1021	0.3037	1.49420420082637e-25	104148894	104163460	4.20282458294031e-05	106889507	106996349
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	106969746	107081530	28	27	0.6155	4.20282458294031e-05	106889507	106996349	6.9545969881171e-08	107067843	107081530
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	107087376	107112478	4	3	1.5831	6.9545969881171e-08	107067843	107081530	2.34989915160829e-10	107112478	107117236
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	107117236	145051910	11553	11123	0.2736	2.34989915160829e-10	107112478	107117236	1.35048246017428e-07	145045691	145065081
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	145062148	145084638	10	9	-0.3823	1.35048246017428e-07	145045691	145065081	3.20488837669721e-07	145081795	145093149
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	145088337	146264846	398	382	0.3411	3.20488837669721e-07	145081795	145093149	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	109505077	25898	24881	0.1294	NA	NA	NA	0	109485168	109539772
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	109512401	109512401	1	0	NA	0	109485168	109539772	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	109520035	122276323	4543	4377	0.5514	NA	NA	NA	1.70754009546643e-222	122262603	122293493
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	122279215	124183283	883	847	0.9162	1.70754009546643e-222	122262603	122293493	8.82661663392709e-176	124170982	124233579
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	124186266	140145683	6619	6318	0.5589	8.82661663392709e-176	124170982	124233579	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	3215770	1185	1138	-0.4603	NA	NA	NA	1.33388613543779e-50	3211159	3218438
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	3218438	3309774	32	31	0.4148	1.33388613543779e-50	3211159	3218438	2.97853688512288e-59	3309774	3314978
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	3314978	3927356	197	188	-0.488	2.97853688512288e-59	3309774	3314978	4.64815950236243e-06	3918205	3927356
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	3930376	3945581	5	5	0.1927	4.64815950236243e-06	3918205	3927356	1.29241785631602e-05	3945581	3952368
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	3947742	4979897	326	313	-0.4838	1.29241785631602e-05	3945581	3952368	7.66271097009668e-06	4979727	4979897
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	4986851	4987919	2	2	-1.5717	7.66271097009668e-06	4979727	4979897	0.000110404648994939	4987919	4994855
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	4989281	4989281	1	0	NA	0.000110404648994939	4987919	4994855	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	4994855	7480070	986	951	-0.4506	NA	NA	NA	9.23391302062896e-144	7475315	7483876
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	7481582	7805372	143	138	0.3318	9.23391302062896e-144	7475315	7483876	1.88674823802888e-215	7802450	7810860
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	7809218	45489823	11580	11129	-0.5096	1.88674823802888e-215	7802450	7810860	3.64789475762543e-14	45458783	46427571
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46384985	47017598	73	69	-0.1982	3.64789475762543e-14	45458783	46427571	1.98749931200547e-13	46523510	47080155
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47021415	54113607	1882	1810	-0.5151	1.98749931200547e-13	46523510	47080155	4.70217052624864e-23	54103553	54117470
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	54117470	54199122	22	22	0.1982	4.70217052624864e-23	54103553	54117470	4.52401052877382e-20	54197785	54203980
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	54201406	54373428	38	36	-0.5321	4.52401052877382e-20	54197785	54203980	6.8913358723086e-33	54353517	54398484
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	54387116	54387116	1	0	NA	6.8913358723086e-33	54353517	54398484	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	54394064	55213613	147	139	0.1646	NA	NA	NA	8.56901352864768e-120	55209580	55219757
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	55215760	75540637	6904	6632	-0.4717	8.56901352864768e-120	55209580	55219757	0	75540637	75543054
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	75543054	75959984	181	179	-1.9796	0	75540637	75543054	0	75958138	75959984
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	75964097	77917893	887	858	-0.4405	0	75958138	75959984	2.30490145297081e-68	77917893	77917893
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-4.3553	2.30490145297081e-68	77917893	77917893	1.71218236462456e-66	77928669	77928669
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	135285645	20214	19427	-0.434	1.71218236462456e-66	77928669	77928669	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5741031	2138	2052	-0.483	NA	NA	NA	1.18658308461789e-145	5741031	5741031
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	15	-2.8234	1.18658308461789e-145	5741031	5741031	1.47361618920755e-179	5765438	5765438
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	12228830	2714	2619	-0.4998	1.47361618920755e-179	5765438	5765438	4.68645592379631e-08	12227265	12228830
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	12230938	12236593	3	3	0.6306	4.68645592379631e-08	12227265	12228830	2.71823979317566e-08	12236593	12238783
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	12238783	46096588	10681	10252	-0.5066	2.71823979317566e-08	12236593	12238783	3.05628768817625e-08	46092824	46096588
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	46099212	46103800	4	4	0.4753	3.05628768817625e-08	46092824	46096588	1.20142291707546e-07	46103800	46109573
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	46105220	54840587	1278	1230	-0.4315	1.20142291707546e-07	46103800	46109573	0	51371826	54850040
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	54843571	72176550	6753	6502	0.1715	0	51371826	54850040	0	72163882	72187495
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	72178043	88925632	6063	5838	0.5854	0	72163882	72187495	4.28546886896226e-25	88891133	88961148
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	88930154	89474090	61	59	0.2336	4.28546886896226e-25	88891133	88961148	1.47941747554169e-16	89100161	89506898
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	89486315	89486315	1	0	NA	1.47941747554169e-16	89100161	89506898	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	89491010	101827140	3715	3553	0.5835	NA	NA	NA	0	101812787	101837228
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	101829483	129992742	10047	9668	0.1482	0	101812787	101837228	0	129986670	130000705
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	129995780	134450318	1831	1760	-0.5224	0	129986670	130000705	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	736988	296	287	-0.4121	NA	NA	NA	2.95713512085492e-38	736988	736988
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	738240	743223	4	4	-2.4687	2.95713512085492e-38	736988	736988	8.590308264011e-33	743223	743223
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	745410	2109441	620	594	-0.4818	8.590308264011e-33	743223	743223	6.44740316925332e-96	2109441	2109441
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2115933	2127537	7	7	-3.0694	6.44740316925332e-96	2109441	2109441	7.13600972238501e-110	2127537	2127537
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2128807	5291289	1249	1205	-0.4722	7.13600972238501e-110	2127537	2127537	1.52834749801758e-18	5247492	5322188
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	5296567	5296567	1	0	NA	1.52834749801758e-18	5247492	5322188	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	5303867	5403219	33	33	0.0313	NA	NA	NA	1.37124495712864e-11	5387848	5408688
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	5406005	5504938	50	50	0.5976	1.37124495712864e-11	5387848	5408688	5.11939014661469e-22	5489238	5530153
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	5507966	23919827	6364	6118	0.1548	5.11939014661469e-22	5489238	5530153	1.45911728533461e-19	23908056	23926235
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	23922671	23982250	33	31	0.6843	1.45911728533461e-19	23908056	23926235	6.04153387620392e-21	23979201	23988707
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	23983820	41539121	5044	4857	0.1396	6.04153387620392e-21	23979201	23988707	0	41507101	41567402
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	41549390	46992235	1782	1731	-0.5328	0	41507101	41567402	2.56462419113741e-10	46992235	46992235
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46995053	46996769	2	2	-2.0367	2.56462419113741e-10	46992235	46992235	4.59605768947975e-21	46996769	46996769
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46998876	94053553	15417	14810	-0.5092	4.59605768947975e-21	46996769	46996769	4.86837658995808e-95	94053553	94053553
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	94055539	94086867	15	15	-2.1806	4.86837658995808e-95	94053553	94053553	3.1686577206468e-92	94086867	94086867
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	94089157	130694393	13598	13090	-0.4741	3.1686577206468e-92	94086867	94086867	1.30806796339856e-15	130690343	130694393
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	0.9506	1.30806796339856e-15	130690343	130694393	3.37555424772915e-07	130701040	130718440
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	608	-0.4779	3.37555424772915e-07	130701040	130718440	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	36004588	6716	6464	-0.514	NA	NA	NA	0	35987226	36023801
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36015828	37597755	547	526	0.1706	0	35987226	36023801	1.68609801089070e-88	37583342	37615366
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37606316	37606316	1	0	NA	1.6860980108907e-88	37583342	37615366	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37615366	37953582	74	74	-0.5497	NA	NA	NA	2.14700689167707e-27	37953582	37953582
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-2.3988	2.14700689167707e-27	37953582	37953582	2.79928123972962e-16	37957844	37957844
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	46278365	3520	3382	-0.515	2.79928123972962e-16	37957844	37957844	5.61549653720334e-12	46270919	46282821
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	46281680	46303440	12	12	0.1503	5.61549653720334e-12	46270919	46282821	5.11221005214063e-14	46300478	46306059
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	46304913	47839715	408	397	-0.5431	5.11221005214063e-14	46300478	46306059	1.07305320866257e-07	47836039	47840415
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	47840415	47846244	7	7	0.1263	1.07305320866257e-07	47836039	47840415	2.59558735640957e-06	47844886	47848870
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	47847402	49964838	932	899	-0.5118	2.59558735640957e-06	47844886	47848870	5.31262902443001e-18	49964838	49964838
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-2.482	5.31262902443001e-18	49964838	49964838	2.37930783449422e-17	49971732	49971732
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56657371	1805	1751	-0.5066	2.37930783449422e-17	49971732	49971732	6.77547937590147e-16	56646284	56660235
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56658479	56686863	15	15	0.1878	6.77547937590147e-16	56646284	56660235	3.50738496095914e-18	56681665	56693033
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56688605	76071231	5156	4974	-0.526	3.50738496095914e-18	56681665	56693033	0	76052284	76080788
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	76076212	88861410	2915	2787	0.1437	0	76052284	76080788	1.03693641434397e-43	88843478	88867958
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	88867958	89021461	24	24	1.0206	1.03693641434397e-43	88843478	88867958	1.10211332359801e-40	89013801	89042262
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89025679	114123340	9508	9166	0.1455	1.10211332359801e-40	89013801	89042262	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	45114537	8591	8271	0.1467	NA	NA	NA	0	45103593	45133711
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	45126437	65138384	7316	7015	-0.5253	0	45103593	45133711	2.07270129044583e-41	65138384	65138384
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	65143023	65145120	3	3	-2.9709	2.07270129044583e-41	65138384	65138384	4.16355374919137e-40	65145120	65145120
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	65149384	69086125	1718	1658	-0.4938	4.16355374919137e-40	65145120	65145120	3.81742521008515e-06	69081023	69092211
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69097052	6	6	0.2159	3.81742521008515e-06	69081023	69092211	3.08255124184325e-16	69092211	69102970
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69098569	89871609	7754	7449	-0.5124	3.08255124184325e-16	69092211	69102970	3.89716137856356e-210	89868548	89875948
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	89873621	90345700	200	195	0.1944	3.89716137856356e-210	89868548	89875948	5.6241926893372e-79	90342061	90351136
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	90347233	90763949	208	204	-0.4542	5.6241926893372e-79	90342061	90351136	1.45277481526580e-153	90754281	90769209
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	90766078	93166886	1100	1060	0.187	1.4527748152658e-153	90754281	90769209	4.71358055223645e-08	93160411	93166886
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	93169296	93184879	8	8	-0.5016	4.71358055223645e-08	93160411	93166886	2.85506967258003e-06	93184879	93197114
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	93189077	105597555	4738	4577	0.1465	2.85506967258003e-06	93184879	93197114	1.32991161332593e-116	105597555	105597555
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	-2.1153	1.32991161332593e-116	105597555	105597555	2.98258017726965e-55	105632168	105632168
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105850033	48	48	0.0288	2.98258017726965e-55	105632168	105632168	4.04298117522721e-06	105839439	105850033
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105881893	7	7	0.7699	4.04298117522721e-06	105839439	105850033	3.67150262757928e-06	105881893	105901394
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	106358491	176	171	0.1071	3.67150262757928e-06	105881893	105901394	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18837737	15	14	0.1452	NA	NA	NA	0.000137454241960916	18831600	18837737
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18842565	18848213	4	4	-0.7736	0.000137454241960916	18831600	18837737	5.47992860519037e-06	18848213	18854068
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18851513	21490707	373	355	0.1614	5.47992860519037e-06	18848213	18854068	0	21481794	21502411
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	21498207	42526919	7501	7214	-0.5084	0	21481794	21502411	0	42522122	42529506
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	42528517	52103513	3903	3761	0.142	0	42522122	42529506	0	52098816	52108524
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	52105684	90069383	15796	15217	-0.4823	0	52098816	52108524	1.33724929923620e-63	90056627	90082986
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	90077649	90259976	62	60	0.2243	1.3372492992362e-63	90056627	90082986	2.18738260962746e-57	90256525	90265128
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	90261241	100298352	3668	3518	-0.4511	2.18738260962746e-57	90256525	90265128	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	32379126	10573	10208	0.106	NA	NA	NA	1.19537334875736e-13	31835555	32529486
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33538171	44	43	0.491	1.19537334875736e-13	31835555	32529486	1.39951196297696e-15	33527454	33841331
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33559207	34297461	86	84	-0.0275	1.39951196297696e-15	33527454	33841331	2.13255336527361e-08	34240270	34339543
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34302966	34602318	56	53	0.3243	2.13255336527361e-08	34240270	34339543	8.03475875756075e-05	34533735	34664645
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34617260	35003634	53	50	0.0351	8.03475875756075e-05	34533735	34664645	1.34651809287792e-14	34981772	45067187
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	35004950	45222517	57	55	0.4908	1.34651809287792e-14	34981772	45067187	1.08199553099512e-16	45210248	45250058
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	45226995	73288854	9018	8706	0.1124	1.08199553099512e-16	45210248	45250058	0	73285580	73295118
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73292418	74612583	479	462	0.8574	0	73285580	73295118	6.85491654038563e-241	74594925	74617170
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	74617170	75761600	306	292	0.057	6.85491654038563e-241	74594925	74617170	2.12697151769069e-113	75748685	75771366
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75763740	76729236	363	347	-0.5262	2.12697151769069e-113	75748685	75771366	1.04453301648996e-11	76725493	76734697
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76732435	76758476	13	13	0.1333	1.04453301648996e-11	76725493	76734697	8.17560169707829e-12	76753709	76762418
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76760650	76925748	88	84	-0.5687	8.17560169707829e-12	76753709	76762418	2.09048069390563e-12	76922411	76925748
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76942679	9	8	0.305	2.09048069390563e-12	76922411	76925748	3.65013422917513e-09	76942679	76946579
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76944661	87165574	3851	3708	-0.473	3.65013422917513e-09	76942679	76946579	3.05855980806413e-16	87165574	87165574
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	87167051	87169085	2	2	-2.5174	3.05855980806413e-16	87165574	87165574	1.71521273320022e-11	87169085	87169085
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	87170962	87736938	237	230	-0.5148	1.71521273320022e-11	87169085	87169085	0.000161598622602103	87720112	87748226
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	87738452	87756689	8	8	-1.164	0.000161598622602103	87720112	87748226	4.48609171740154e-07	87748226	87763002
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	87757502	88690571	414	389	-0.4277	4.48609171740154e-07	87748226	87763002	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	403	0.2158	NA	NA	NA	2.56461666151266e-13	1028979	1028979
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.9969	2.56461666151266e-13	1028979	1028979	4.68346870875194e-12	1030766	1030766
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	1906319	436	421	0.2018	4.68346870875194e-12	1030766	1030766	2.90553305528222e-11	1906319	1906319
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906352	1906391	2	2	1.9512	2.90553305528222e-11	1906319	1906319	6.62786599401234e-13	1906391	1906391
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	26457608	9064	8694	0.1651	6.62786599401234e-13	1906391	1906391	0	26453026	26461947
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	26459746	32828797	2500	2402	-0.4812	0	26453026	26461947	8.37223313909543e-16	32828797	32828797
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	-2.4353	8.37223313909543e-16	32828797	32828797	9.98763340602815e-16	32832642	32832642
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36673853	1448	1394	-0.4521	9.98763340602815e-16	32832642	32832642	9.11307473950663e-77	36673853	36673853
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	2.0527	9.11307473950663e-77	36673853	36673853	1.17852631441305e-77	36684619	36684619
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	78653545	15757	15124	-0.4537	1.17852631441305e-77	36684619	36684619	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	108760	2	2	-0.7675	NA	NA	NA	0.00222669858860429	108760	121665
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	112131	500897	173	167	0.14	0.00222669858860429	108760	121665	2.67256208345054e-22	500897	500897
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	503208	505456	2	2	2.4273	2.67256208345054e-22	500897	500897	7.55503375607811e-24	505456	505456
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	506827	62441668	18939	18213	0.1336	7.55503375607811e-24	505456	505456	0	62433482	62449133
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	62442687	72991380	2789	2694	-0.5447	0	62433482	62449133	5.09666679083876e-14	72980002	72991380
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	72994205	72994205	1	0	NA	5.09666679083876e-14	72980002	72991380	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	72997713	73048383	13	13	0.1387	NA	NA	NA	1.85526411224314e-10	73048383	73067168
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	73052581	73058713	2	0	NA	1.85526411224314e-10	73048383	73067168	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	73063265	76116026	1043	1007	-0.5219	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	477	0.0672	NA	NA	NA	3.05380001776392e-26	1398325	1398325
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	3.0278	3.05380001776392e-26	1398325	1398325	6.47294448024508e-29	1400840	1400840
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	9203416	3603	3449	0.1221	6.47294448024508e-29	1400840	1400840	2.00104429208368e-304	9190177	9214230
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	9204554	11448975	1075	1031	0.5828	2.00104429208368e-304	9190177	9214230	2.83562267659133e-11	11448975	11448975
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	2.2872	2.83562267659133e-11	11448975	11448975	8.52668490354047e-13	11452390	11452390
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	12617003	462	449	0.5514	8.52668490354047e-13	11452390	11452390	1.00200116077311e-131	12605731	12635234
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	12618798	39822256	6755	6509	0.1621	1.00200116077311e-131	12605731	12635234	0	39803651	39829370
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	39824384	56284748	7217	6910	-0.4437	0	39803651	39829370	5.72847196583921e-188	56277292	56288531
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56286481	56823430	265	256	0.1892	5.72847196583921e-188	56277292	56288531	1.75820322209970e-117	56823430	56823430
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	8	-2.5488	1.7582032220997e-117	56823430	56823430	4.56689470337801e-122	56840346	56840346
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	63788698	3178	3050	0.2184	4.56689470337801e-122	56840346	56840346	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	567	0.1307	NA	NA	NA	1.57078470426493e-13	1499034	1516966
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	0.9944	1.57078470426493e-13	1499034	1516966	7.03858720407717e-15	1525300	1546858
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	32947815	10059	9662	0.1469	7.03858720407717e-15	1525300	1546858	0	32941655	32961693
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	32952023	45112402	4675	4479	-0.4022	0	32941655	32961693	2.57045356673805e-185	45107695	45117296
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	45114944	45702193	239	229	0.2359	2.57045356673805e-185	45107695	45117296	6.91117598374234e-106	45696111	45713084
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	45704290	45704290	1	0	NA	6.91117598374234e-106	45696111	45713084	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	45707546	47254966	476	460	-0.3096	NA	NA	NA	8.31141732529806e-214	47242864	47263811
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	47257390	51590272	1652	1589	0.2269	8.31141732529806e-214	47242864	47263811	2.73108755323985e-06	51572912	51593683
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	51591869	51618614	12	12	0.7549	2.73108755323985e-06	51572912	51593683	3.26862865998933e-07	51617432	51630112
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	51620047	62168210	3770	3632	0.1813	3.26862865998933e-07	51617432	51630112	7.02413661283444e-10	62168210	62168226
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	62168226	62174991	3	3	-1.1496	7.02413661283444e-10	62168210	62168226	9.30072820935416e-08	62174093	62174991
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	62175081	62419534	96	92	0.2256	9.30072820935416e-08	62174093	62174991	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	10079654	13	12	-0.409	NA	NA	NA	1.47036783075064e-07	10022306	10144881
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	10101956	25358727	3639	3495	0.1144	1.47036783075064e-07	10022306	10144881	2.91492739071552e-310	25333155	25404687
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	25361167	29655892	1478	1411	0.47	2.91492739071552e-310	25333155	25404687	4.14877025245016e-300	29639293	29668909
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	29657574	36789648	3415	3284	0.1058	4.14877025245016e-300	29639293	29668909	1.38956809723733e-25	36789648	36789648
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36790648	36791668	2	2	2.5088	1.38956809723733e-25	36789648	36789648	9.87400551682328e-25	36791668	36791668
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36792708	43716689	3393	3270	0.122	9.87400551682328e-25	36791668	36791668	1.06231268722257e-270	43701308	43739034
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	43720519	46922972	1501	1446	0.4885	1.06231268722257e-270	43701308	43739034	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	18125356	1131	1089	-0.441	NA	NA	NA	5.99233871025684e-27	18125356	18125356
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18127933	18129194	2	2	2.1624	5.99233871025684e-27	18125356	18125356	1.50618206815449e-24	18129194	18129194
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18131561	22667608	1849	1783	-0.4514	1.50618206815449e-24	18129194	18129194	2.68506869400702e-38	22644243	22682428
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22721042	21	19	-1.5206	2.68506869400702e-38	22644243	22682428	1.95593433924109e-41	22714979	22725305
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22725305	49571068	13553	13011	-0.4459	1.95593433924109e-41	22714979	22725305	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	124528	29	29	0.295	NA	NA	NA	9.02160341618078e-11	122273	127113
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	5	1.9352	9.02160341618078e-11	122273	127113	7.10224714275948e-18	129544	132689
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	264886	92	90	0.102	7.10224714275948e-18	129544	132689	1.36532136172469e-08	264190	264886
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	266212	266212	1	0	NA	1.36532136172469e-08	264190	264886	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	267060	267079	2	2	2.0228	NA	NA	NA	2.64983285208429e-13	267079	267079
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	268402	1182356	561	538	0.1542	2.64983285208429e-13	267079	267079	7.93251587783586e-06	1174117	1282772
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1274736	1322183	14	14	0.6333	7.93251587783586e-06	1174117	1282772	1.60533504077821e-05	1307285	1338591
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1328203	2672401	1062	1013	0.1259	1.60533504077821e-05	1307285	1338591	5.04851158442914e-05	2657718	2687984
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672477	2708291	27	27	-0.2258	5.04851158442914e-05	2657718	2687984	6.13905994902859e-100	2708291	2708291
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	154582414	45134	43409	1.0859	6.13905994902859e-100	2708291	2708291	0	154578922	154586690
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	195	0.0556	0	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	116	-4.3457	NA	NA	NA	7.00382571912314e-29	3219200	3773948
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3733715	1	0	NA	7.00382571912314e-29	3219200	3773948	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	15	-0.9938	NA	NA	NA	1.16201119666770e-12	4948824	6688691
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	166	-3.8773	1.1620111966677e-12	4948824	6688691	6.23030794103907e-08	7021965	7197846
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7057026	1	0	NA	6.23030794103907e-08	7021965	7197846	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7070931	7495687	127	123	-2.7898	NA	NA	NA	2.37928100644067e-06	7375948	7614417
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7709619	66	63	-4.0827	2.37928100644067e-06	7375948	7614417	0.000656474732636559	7677946	7716001
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7751430	20	19	-2.6059	0.000656474732636559	7677946	7716001	4.19660342637907e-05	7733351	7799614
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7755522	8961669	329	306	-3.9653	4.19660342637907e-05	7733351	7799614	0.000233759185359575	8901974	8970039
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8963617	9132086	24	24	-5.0776	0.000233759185359575	8901974	8970039	0.000125513797753129	9102367	10001056
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9133230	10513747	83	78	-4.0261	0.000125513797753129	9102367	10001056	7.17680364945587e-36	10512616	10515697
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	11673476	18	15	-0.5649	7.17680364945587e-36	10512616	10515697	1.57538479812775e-06	11660512	12527445
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	13129843	203	192	-2.7312	1.57538479812775e-06	11660512	12527445	1.01693988185412e-41	13090026	13138841
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	14352278	411	393	-4.2008	1.01693988185412e-41	13090026	13138841	6.55370581318913e-08	14244120	14407293
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14353244	14508021	93	92	-3.4228	6.55370581318913e-08	14244120	14407293	0.0169452239332942	14466597	14598838
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	0.0169452239332942	14466597	14598838	NA	NA	NA
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14694578	43	41	-2.4642	NA	NA	NA	2.38560119662177e-11	14598838	14700040
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14695441	15122414	90	88	-4.2595	2.38560119662177e-11	14598838	14700040	1.54656686432767e-06	15078313	15165820
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15124246	15284717	86	78	-3.2387	1.54656686432767e-06	15078313	15165820	4.67049309998114e-11	15273305	15291532
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15286805	15386844	65	61	-4.6166	4.67049309998114e-11	15273305	15291532	0.000285709862053022	15364426	15450495
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15388044	15639408	113	107	-3.7187	0.000285709862053022	15364426	15450495	0.0275608367233693	15448670	15734650
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15642822	15932535	48	46	-4.4638	0.0275608367233693	15448670	15734650	4.7216021964076e-06	15898644	15980898
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15937162	16182565	105	98	-3.2904	4.7216021964076e-06	15898644	15980898	4.11691067416331e-10	16124286	16224597
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16183348	22930737	1094	1028	-4.1684	4.11691067416331e-10	16124286	16224597	4.99295278626687e-78	22923722	26871442
MSK_252152916859_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	79	-1.5132	4.99295278626687e-78	22923722	26871442	NA	NA	NA
