Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	554287	13110044	4524	4287	0.0104	NA	NA	NA	2.52076705981608e-13	13110044	13110044
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	13647633	13649201	2	2	-0.9482	2.52076705981608e-13	13110044	13110044	1.99295418668921e-12	13649201	13649201
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	13654754	16838573	1262	1200	0.0101	1.99295418668921e-12	13649201	13649201	1.0067420384677e-12	16836160	16838573
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	16888048	16923767	4	4	-0.6765	1.0067420384677e-12	16836160	16838573	1.75533394868783e-14	16923767	16926444
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	16926444	72537426	22102	20964	0.0049	1.75533394868783e-14	16923767	16926444	0	72537426	72537426
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	72539143	72574479	13	10	-4.1069	0	72537426	72537426	0	72574479	72574479
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	72579311	72579311	1	0	NA	0	72574479	72574479	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	72589682	100545896	9249	8799	-3e-04	NA	NA	NA	1.04698966661462e-11	100545896	100545896
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	100547338	100551071	2	2	-0.8517	1.04698966661462e-11	100545896	100545896	5.37542182093185e-12	100551071	100551071
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	100552814	109373255	2155	2045	0.0051	5.37542182093185e-12	100551071	100551071	0	109373255	109373255
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	109374790	109376249	2	2	-5.6663	0	109373255	109373255	0	109376249	109376249
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	109379566	150839754	6152	5794	0.0059	0	109376249	109376249	0	150839754	150839754
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	150841957	150851439	7	6	-3.493	0	150839754	150839754	6.79620388065064e-127	150851439	150851439
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	150852858	151026228	78	75	-0.0028	6.79620388065064e-127	150851439	150851439	2.05827015509210e-185	151026228	151026228
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	151028700	151036435	4	4	-4.3902	2.0582701550921e-185	151026228	151026228	0	151036435	151036435
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	151038091	157133150	2679	2552	0.0058	0	151036435	151036435	7.92856449460093e-98	157133150	157133150
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	157134796	157136342	2	2	2.4802	7.92856449460093e-98	157133150	157133150	2.24208441470156e-105	157136342	157136342
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	157138568	167483267	4108	3896	-0.0015	2.24208441470156e-105	157136342	157136342	5.40710617129049e-12	167479184	167493768
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	167493768	167507898	8	7	-0.4592	5.40710617129049e-12	167479184	167493768	2.39537218773865e-12	167507882	167520743
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	167520743	200602881	11349	10777	0.0029	2.39537218773865e-12	167507882	167520743	4.67647980230568e-22	200596027	200616638
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	200609726	200668993	23	23	-0.3341	4.67647980230568e-22	200596027	200616638	2.06781574417741e-22	200659076	200672373
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	200670407	211067168	4052	3862	0.0098	2.06781574417741e-22	200659076	200672373	6.10050738011024e-29	211067168	211067168
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	211070042	211079988	4	4	-0.9196	6.10050738011024e-29	211067168	211067168	2.58281816045256e-28	211079988	211079988
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	211082419	211082419	1	0	NA	2.58281816045256e-28	211079988	211079988	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	211083435	246794552	13241	12571	-0.0058	NA	NA	NA	4.41610075181052e-104	246794552	246805521
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	246805521	246862029	26	25	-0.7013	4.41610075181052e-104	246794552	246805521	2.59611241541476e-68	246860551	246862029
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	1	246863179	247186514	98	92	0.0119	2.59611241541476e-68	246860551	246862029	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	2	7019	8045619	2397	2274	-3e-04	NA	NA	NA	1.07864551945489e-21	8045619	8045619
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	2	8048423	8053654	3	3	-0.9573	1.07864551945489e-21	8045619	8045619	8.7528836502604e-23	8053654	8053654
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	2	8058417	34551222	9123	8675	-0.0029	8.7528836502604e-23	8053654	8053654	3.41817277800199e-42	34543992	34552935
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	2	34552935	34580533	14	13	0.6171	3.41817277800199e-42	34543992	34552935	9.84956265256686e-44	34579933	34580533
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	2	34582272	35821494	487	469	-0.0092	9.84956265256686e-44	34579933	34580533	8.51029201536626e-30	35821494	35821494
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	2	35841255	35844884	2	2	-1.391	8.51029201536626e-30	35821494	35821494	4.98243399823542e-33	35844884	35844884
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	2	35851593	66038336	11195	10614	-0.0014	4.98243399823542e-33	35844884	35844884	3.62682657491640e-295	66038336	66038336
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	2	66041319	66049853	3	3	-3.3662	3.6268265749164e-295	66038336	66038336	9.53697626446893e-285	66049853	66049853
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	2	66055464	132753228	17137	16283	4e-04	9.53697626446893e-285	66049853	66049853	2.39705366534403e-13	132753228	132753228
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	2	132754617	132755508	2	2	0.9165	2.39705366534403e-13	132753228	132753228	8.55520820303844e-14	132755508	132755508
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	2	132763461	146571330	4711	4469	-0.0015	8.55520820303844e-14	132755508	132755508	0	146571330	146571330
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	2	146582195	146592775	4	4	-3.936	0	146571330	146571330	0	146592775	146592775
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	2	146597405	154601442	2203	2079	-0.0019	0	146592775	146592775	2.91660979300625e-11	154601442	154601442
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	2	154605621	154606943	2	2	0.8265	2.91660979300625e-11	154601442	154601442	1.66990750726050e-11	154606943	154606943
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	2	154608095	179767214	8999	8584	-0.0015	1.6699075072605e-11	154606943	154606943	9.07017950632918e-21	179767214	179767214
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	2	179777850	179778919	3	3	-0.8981	9.07017950632918e-21	179767214	179767214	4.42312603590104e-20	179778919	179778919
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	2	179791128	242566796	21500	20402	3e-04	4.42312603590104e-20	179778919	179778919	2.65632660848988e-96	242566796	242566796
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	2	242571223	242596654	14	13	-0.9301	2.65632660848988e-96	242566796	242566796	3.84977786050227e-36	242596654	242596654
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	2	242596873	242689978	28	27	0.0513	3.84977786050227e-36	242596654	242596654	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	3	37075	37075	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	3	43644	22250408	7790	7422	-0.0012	NA	NA	NA	1.20853588774388e-23	22250408	22250408
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	3	22256317	22260558	3	3	-0.9829	1.20853588774388e-23	22250408	22250408	1.16445775208770e-23	22260558	22260558
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	3	22263265	65160634	15716	14944	-4e-04	1.1644577520877e-23	22260558	22260558	8.05369071011673e-20	65160634	65160634
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	3	65170560	65184180	2	2	-1.1052	8.05369071011673e-20	65160634	65160634	7.22837268482687e-20	65184180	65184180
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	3	65195223	133189686	20197	19166	-1e-04	7.22837268482687e-20	65184180	65184180	3.14835568111892e-91	133189686	133189686
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	3	133191877	133194685	2	2	-2.3444	3.14835568111892e-91	133189686	133189686	1.23516126830313e-88	133194685	133194685
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	3	133197276	163992903	9777	9324	0.0015	1.23516126830313e-88	133194685	133194685	9.5295748971457e-181	163992903	163992903
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	3	163997228	164107951	28	27	0.9006	9.5295748971457e-181	163992903	163992903	3.19278934036877e-170	164107951	164107951
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	3	164112873	199329592	12116	11507	0.0017	3.19278934036877e-170	164107951	164107951	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	4	34020	34445002	9564	9088	-0.0015	NA	NA	NA	2.06407718790823e-09	34433787	34445002
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	4	34457648	34491115	6	6	-0.4493	2.06407718790823e-09	34433787	34445002	7.25900611061016e-10	34491115	34506297
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	4	34506297	64376590	7781	7388	-0.0072	7.25900611061016e-10	34491115	34506297	5.46147736710921e-13	64376590	64376590
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	4	64381871	64390333	2	2	-0.879	5.46147736710921e-13	64376590	64376590	2.94386591318699e-13	64390333	64390333
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	4	64398986	68905670	1080	1036	-2e-04	2.94386591318699e-13	64390333	64390333	1.19406355132342e-32	68901210	69069651
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	4	69069651	69165814	14	13	0.5411	1.19406355132342e-32	68901210	69069651	6.2324278577991e-22	69144974	69643272
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	4	69643272	70003334	93	89	0.0279	6.2324278577991e-22	69144974	69643272	2.77218425082074e-07	70000580	70003334
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	4	70006175	70007700	2	2	0.7058	2.77218425082074e-07	70000580	70003334	1.78850553950604e-08	70007700	70010651
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	4	70010651	87193253	5825	5537	-0.0014	1.78850553950604e-08	70007700	70010651	1.16613718287953e-14	87193253	87193253
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	4	87196350	87198840	2	2	-0.9183	1.16613718287953e-14	87193253	87193253	3.2009380003904e-15	87198840	87198840
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	4	87201443	94073863	2526	2427	0.0021	3.2009380003904e-15	87198840	87198840	5.11973797424138e-10	94070673	94073863
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	4	94076749	94084961	3	2	-0.7514	5.11973797424138e-10	94070673	94073863	1.02875111282910e-09	94084961	94084961
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	4	94086315	114561406	6721	6367	-2e-04	1.0287511128291e-09	94084961	94084961	8.0295370786315e-11	114561406	114561406
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	4	114563552	114565031	2	2	0.79	8.0295370786315e-11	114561406	114561406	5.42545437259842e-11	114565031	114565031
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	4	114573667	161260146	12650	11976	-0.002	5.42545437259842e-11	114565031	114565031	3.26868874602428e-32	161260146	161260146
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	4	161268543	161302611	4	4	-0.9403	3.26868874602428e-32	161260146	161260146	8.23630647930074e-32	161302611	161302611
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	4	161311021	173660684	3560	3353	0.0014	8.23630647930074e-32	161302611	161302611	5.28045177534817e-73	173660684	173660684
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	4	173663054	173666072	2	2	2.0025	5.28045177534817e-73	173660684	173660684	3.70532467551972e-69	173666072	173666072
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	4	173672958	190670997	5205	4943	-0.0057	3.70532467551972e-69	173666072	173666072	8.37767053325042e-18	190637022	190706272
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	4	190674430	190927969	76	73	0.1662	8.37767053325042e-18	190637022	190706272	3.66484700465382e-08	190899545	190958901
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	4	190930709	191153613	43	41	-0.0053	3.66484700465382e-08	190899545	190958901	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	5	79142	776194	223	213	0.0076	NA	NA	NA	1.71851856438984e-10	730853	776194
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	5	812169	829954	5	5	-0.5617	1.71851856438984e-10	730853	776194	9.929519722275e-13	829954	870657
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	5	870657	12840501	3745	3566	-0.0027	9.929519722275e-13	829954	870657	2.11815748500621e-10	12837736	12853151
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	5	12853151	12873052	4	4	0.5658	2.11815748500621e-10	12837736	12853151	1.92895100897041e-10	12866038	13263185
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	5	13263185	137833920	35112	33293	-5e-04	1.92895100897041e-10	12866038	13263185	2.06162414703945e-26	137833920	137836466
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	5	137836466	137843309	4	4	-0.8758	2.06162414703945e-26	137833920	137836466	8.25897240407978e-24	137842107	137843309
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	5	137844931	140201609	986	944	0.0136	8.25897240407978e-24	137842107	137843309	5.49376654613781e-11	140198797	140203440
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	5	140203440	140219465	9	9	0.4194	5.49376654613781e-11	140198797	140203440	9.77859435761088e-12	140216524	140221835
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	5	140221835	140533456	136	131	-0.0035	9.77859435761088e-12	140216524	140221835	1.68674882101566e-14	140533456	140533456
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	5	140535820	140538666	2	2	-0.9762	1.68674882101566e-14	140533456	140533456	2.42527635748315e-17	140538666	140538666
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	5	140541178	150156233	3622	3443	-1e-04	2.42527635748315e-17	140538666	140538666	6.65489114004967e-48	150156233	150171154
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	5	150159466	150202601	13	13	-0.6395	6.65489114004967e-48	150156233	150171154	1.25348930868810e-43	150191322	150202601
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	5	150204134	155404062	1621	1537	0.0043	1.2534893086881e-43	150191322	150202601	6.66695374410028e-09	155397261	155405839
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	5	155405839	155421443	6	6	0.4288	6.66695374410028e-09	155397261	155405839	1.22877534567283e-08	155420791	155432745
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	5	155427589	180342860	8158	7770	0.0021	1.22877534567283e-08	155420791	155432745	1.82827603104915e-26	180194323	180346557
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	5	180344964	180358977	8	8	0.6332	1.82827603104915e-26	180194323	180346557	7.69843814951001e-22	180355807	180362342
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	5	180362342	180644810	112	106	0.0178	7.69843814951001e-22	180355807	180362342	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	6	99130	29950805	10587	10032	-6e-04	NA	NA	NA	4.53113756084584e-30	29939288	29966336
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	6	29962849	30010234	15	14	0.5077	4.53113756084584e-30	29939288	29966336	8.60768298521297e-22	30000990	30021908
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	6	30021908	32548736	1074	1016	0.009	8.60768298521297e-22	30000990	30021908	9.35282469217372e-11	32543054	32548736
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	6	32558677	32564884	3	3	-0.7502	9.35282469217372e-11	32543054	32548736	2.02127448976874e-63	32564884	32564884
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	6	32567462	32588005	2	2	-4.3508	2.02127448976874e-63	32564884	32564884	2.90939740804345e-08	32588005	32588005
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	6	32590568	32590568	1	0	NA	2.90939740804345e-08	32588005	32588005	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	6	32593151	32653710	15	15	-0.9097	NA	NA	NA	0.000369807289388207	32609525	32654861
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	6	32654861	32713363	25	24	-0.1406	0.000369807289388207	32609525	32654861	1.21831495657520e-05	32709263	32728285
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	6	32716255	32716255	1	0	NA	1.2183149565752e-05	32709263	32728285	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	6	32718991	32742767	14	14	-0.9078	NA	NA	NA	1.31263982685268e-99	32732764	32742767
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	6	32745036	103841482	21462	20426	0.0021	1.31263982685268e-99	32732764	32742767	3.34413558383794e-35	103841482	103841482
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	6	103845083	103868154	4	4	1.0165	3.34413558383794e-35	103841482	103841482	3.84271464370146e-37	103868154	103868154
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	6	103873584	151546355	16281	15520	-0.0033	3.84271464370146e-37	103868154	103868154	3.33337337236049e-20	151546355	151546355
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	6	151549525	151552684	3	3	-0.8796	3.33337337236049e-20	151546355	151546355	1.65131389197144e-18	151552684	151552684
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	6	151554478	165643653	4822	4581	-0.0055	1.65131389197144e-18	151552684	151552684	3.28075413361031e-313	165643653	165643653
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	6	165645537	165649379	3	3	-3.541	3.28075413361031e-313	165643653	165643653	3.07174079211471e-314	165649379	165649379
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	6	165650610	165650610	1	0	NA	3.07174079211471e-314	165649379	165649379	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	6	165653315	170753106	1804	1710	-0.0061	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	136373	26411932	8925	8514	0.0027	NA	NA	NA	1.92047316845418e-21	26411932	26411932
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	26414019	26421194	3	3	-0.9202	1.92047316845418e-21	26411932	26411932	4.01232415810578e-21	26421194	26421194
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	26424047	38257171	4671	4443	0.0018	4.01232415810578e-21	26421194	26421194	2.91155876172517e-81	38254010	38264758
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	38258332	38258332	1	0	NA	2.91155876172517e-81	38254010	38264758	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	38262701	38341239	41	40	-0.491	NA	NA	NA	8.26439175290218e-76	38337912	38343026
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	38343026	48551463	3423	3275	-0.0088	8.26439175290218e-76	38337912	38343026	9.77601409908657e-46	48551463	48551463
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	48554059	48562631	7	7	-0.9024	9.77601409908657e-46	48551463	48551463	1.54025284260935e-48	48562631	48562631
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	48572106	64523575	2491	2365	0.003	1.54025284260935e-48	48562631	48562631	5.05318004115723e-18	64523575	64523575
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	64532019	64532949	2	2	-1.0353	5.05318004115723e-18	64523575	64523575	2.45615373583343e-18	64532949	64532949
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	64534167	100166257	11499	10914	-0.002	2.45615373583343e-18	64532949	64532949	2.89337406352782e-09	100164752	100166257
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	100170227	100174991	3	3	-0.613	2.89337406352782e-09	100164752	100166257	4.61082157084704e-09	100174991	100178968
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	100178968	100370059	87	87	0.0138	4.61082157084704e-09	100174991	100178968	2.79615824876988e-14	100370059	100370059
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	100371669	100373585	2	2	-0.9467	2.79615824876988e-14	100370059	100370059	2.21965491912921e-14	100373585	100373585
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	100376911	109967918	4112	3895	-0.0037	2.21965491912921e-14	100373585	100373585	3.24648325274991e-14	109967918	109967918
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	109970524	109974402	2	2	-0.9416	3.24648325274991e-14	109967918	109967918	2.65775759084926e-15	109974402	109974402
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	109976628	118609124	3995	3783	-0.001	2.65775759084926e-15	109974402	109974402	0	118609124	118609124
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	118611324	118611324	1	0	NA	0	118609124	118609124	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	118618468	118620875	3	3	-3.6248	NA	NA	NA	0	118620875	118620875
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	118622742	125829681	3169	2995	-0.001	0	118620875	118620875	3.30201231946622e-309	125829681	125829681
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	125831554	125831554	1	0	NA	3.30201231946622e-309	125829681	125829681	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	125833251	125837524	3	3	-3.4528	NA	NA	NA	5.50223700291949e-286	125837524	125837524
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	125839386	133426938	3651	3495	0.0024	5.50223700291949e-286	125837524	125837524	6.81693742672994e-16	133418420	133432281
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	133426996	133453811	12	12	-0.4118	6.81693742672994e-16	133418420	133432281	5.99873426369174e-17	133447868	133456873
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	133455682	141410894	3699	3526	-0.0038	5.99873426369174e-17	133447868	133456873	1.54355921540790e-13	141406414	141417702
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	141413352	141440184	14	14	-0.3429	1.5435592154079e-13	141406414	141417702	2.31839277750024e-08	141432778	141446728
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	141442231	141948396	217	204	-0.0381	2.31839277750024e-08	141432778	141446728	1.03085347325718e-15	141927374	141967554
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	141949629	142202274	91	84	-0.2307	1.03085347325718e-15	141927374	141967554	8.88077346919853e-33	142176074	142215216
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	142205830	156483966	5513	5237	-0.0065	8.88077346919853e-33	142176074	142215216	4.38856175961534e-16	156483966	156490484
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	156485711	156495904	6	5	0.6396	4.38856175961534e-16	156483966	156490484	2.74532647547963e-13	156492262	156497496
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	7	156497496	158821263	1051	1013	0.0049	2.74532647547963e-13	156492262	156497496	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	8	151472	581533	119	113	0.0092	NA	NA	NA	5.76896509040338e-85	581533	581533
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	8	585010	588865	2	2	-2.391	5.76896509040338e-85	581533	581533	1.56432771884778e-92	588865	588865
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	8	591112	15457778	4948	4705	-0.0054	1.56432771884778e-92	588865	588865	1.14831802901347e-44	15457778	15457778
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	8	15464010	15478031	7	6	-0.9663	1.14831802901347e-44	15457778	15457778	4.54372798507246e-47	15478031	15478031
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	8	15484243	32797545	6117	5808	-0.003	4.54372798507246e-47	15478031	15478031	2.66858682798219e-58	32797545	32797545
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	8	32800775	32800775	1	0	NA	2.66858682798219e-58	32797545	32797545	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	8	32805686	32808049	2	2	-1.8564	NA	NA	NA	1.02129631749772e-63	32808049	32808049
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	8	32812909	39350798	1878	1780	-0.0065	1.02129631749772e-63	32808049	32808049	5.62537124092866e-271	39350798	39350798
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	8	39352361	39505256	59	57	0.7142	5.62537124092866e-271	39350798	39350798	4.15480765454052e-264	39505256	39505256
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	8	39508035	40892587	441	417	-0.0222	4.15480765454052e-264	39505256	39505256	0	40892587	40892587
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	8	40895468	40897469	2	2	-5.0038	0	40892587	40892587	0	40897469	40897469
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	8	40904488	87255865	12244	11657	-0.0065	0	40897469	40897469	0	87255865	87255865
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	8	87258019	87262662	3	3	-5.7935	0	87255865	87255865	0	87262662	87262662
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	8	87265435	87265435	1	0	NA	0	87262662	87262662	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	8	87269233	144967252	18287	17321	-3e-04	NA	NA	NA	5.43292458004654e-09	144966109	144968840
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	8	144968042	144970777	4	4	0.5268	5.43292458004654e-09	144966109	144968840	4.19864044562318e-06	144968840	144973771
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	8	144972090	146264846	451	427	4e-04	4.19864044562318e-06	144968840	144973771	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	9	189055	6685358	2471	2348	-0.0035	NA	NA	NA	0	6685358	6685358
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	9	6692831	6698290	3	3	-3.5436	0	6685358	6685358	0	6698290	6698290
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	9	6701392	23343915	5526	5232	-0.0028	0	6698290	6698290	1.13734389244835e-12	23338535	23343915
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	9	23353267	23365926	3	3	0.7087	1.13734389244835e-12	23338535	23343915	1.67059568875620e-12	23365926	23365926
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	9	23377660	23377660	1	0	NA	1.6705956887562e-12	23365926	23365926	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	9	23395558	70926188	5068	4819	0.0013	NA	NA	NA	1.90776724181812e-39	70926188	70926188
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	9	70928471	70930528	2	2	1.5144	1.90776724181812e-39	70926188	70926188	4.10556471773081e-37	70930528	70930528
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	9	70935055	140145683	24870	23651	8e-04	4.10556471773081e-37	70930528	70930528	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	10	126361	77917893	24592	23405	-0.0057	NA	NA	NA	0	77917893	77917893
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	10	77926390	77928669	2	2	-4.4219	0	77917893	77917893	0	77928669	77928669
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	10	77928738	84395740	1942	1857	0.0036	0	77928669	77928669	5.93816256557593e-26	84393299	84399853
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	10	84399853	84421526	10	10	0.5542	5.93816256557593e-26	84393299	84399853	5.96560189670982e-25	84417864	84423965
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	10	84423965	135285645	18262	17376	-0.0015	5.96560189670982e-25	84417864	84423965	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	11	187649	4923300	1772	1688	0.01	NA	NA	NA	6.82944697388119e-15	4920907	4923300
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	11	4926583	4932214	5	5	-0.644	6.82944697388119e-15	4920907	4923300	9.25140188658337e-17	4932214	4937118
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	11	4934594	4934594	1	0	NA	9.25140188658337e-17	4932214	4937118	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	11	4937118	55118214	15127	14363	0.0023	NA	NA	NA	1.70572299362187e-158	55118214	55123719
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	11	55123719	55209626	39	37	-0.7145	1.70572299362187e-158	55118214	55123719	1.21696657975072e-160	55207305	55209626
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	11	55217189	134450318	28360	26938	0.0027	1.21696657975072e-160	55207305	55209626	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	12	33854	6857051	2870	2727	-0.0022	NA	NA	NA	1.23989052093312e-16	6857051	6857051
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	12	6858668	6863117	3	3	-0.8439	1.23989052093312e-16	6857051	6857051	1.50130351846919e-18	6863117	6863117
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	12	6864599	11121204	1457	1376	-4e-04	1.50130351846919e-18	6863117	6863117	5.61757138109863e-08	11112600	11121204
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	12	11123452	11140421	6	6	0.3966	5.61757138109863e-08	11112600	11121204	1.07025209284769e-07	11140421	11151185
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	12	11143592	31132762	6819	6479	-0.0012	1.07025209284769e-07	11140421	11151185	1.24387391258355e-10	31058854	31192445
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	12	31169263	31289039	39	34	-0.1961	1.24387391258355e-10	31058854	31192445	2.48795045487369e-10	31268595	31310779
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	12	31292507	46992235	4289	4075	-0.0056	2.48795045487369e-10	31268595	31310779	4.42800516089686e-43	46992235	46992235
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	12	46995053	46996769	2	2	-1.5874	4.42800516089686e-43	46992235	46992235	3.03947634161479e-42	46996769	46996769
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	12	46998876	130694393	29030	27550	0.0014	3.03947634161479e-42	46996769	46996769	3.41341451805434e-13	130694393	130694393
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	12	130698885	130701040	2	2	0.9094	3.41341451805434e-13	130694393	130694393	9.94534499908352e-13	130701040	130701040
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	12	130718440	130943064	92	86	-0.0339	9.94534499908352e-13	130701040	130701040	1.33262862397911e-14	130943064	130943064
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	12	130944468	130946248	2	2	1.0896	1.33262862397911e-14	130943064	130943064	1.14035363398975e-13	130946248	130946248
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	12	130947790	132287226	549	524	0.0066	1.14035363398975e-13	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	12	132289090	132289090	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	13	18194544	18854263	187	180	-0.022	NA	NA	NA	2.47457731630319e-07	18846451	18857237
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	13	18855665	18864923	5	5	-0.4768	2.47457731630319e-07	18846451	18857237	5.72825190701101e-09	18861890	18975185
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	13	18898600	18898600	1	0	NA	5.72825190701101e-09	18861890	18975185	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	13	18975185	49964838	12026	11431	-0.002	NA	NA	NA	1.15122341189430e-79	49964838	49964838
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	13	49968215	49971732	2	2	-2.1595	1.1512234118943e-79	49964838	49964838	3.26110256226152e-77	49971732	49971732
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	13	49974447	50819012	360	346	0.0087	3.26110256226152e-77	49971732	49971732	7.72296642369126e-10	50819012	50819012
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	13	50820905	50822114	2	2	-0.7766	7.72296642369126e-10	50819012	50819012	4.6170784079659e-10	50822114	50822114
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	13	50826116	56650373	1442	1375	0.0057	4.6170784079659e-10	50822114	50822114	8.37465967746951e-41	56646284	56650373
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	13	56657371	56685341	15	15	0.5724	8.37465967746951e-41	56646284	56650373	1.11465865862158e-42	56685341	56688605
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	13	56686863	56686863	1	0	NA	1.11465865862158e-42	56685341	56688605	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	13	56688605	89657473	8251	7834	0.0079	NA	NA	NA	4.41326681752176e-11	89657473	89657473
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	13	89659397	89659397	1	0	NA	4.41326681752176e-11	89657473	89657473	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	13	89661345	89662326	2	2	0.813	NA	NA	NA	6.21787914580867e-11	89662326	89662326
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	13	89663261	93318358	1441	1374	-0.0047	6.21787914580867e-11	89662326	89662326	8.37703955461572e-07	93317214	93318358
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	13	93319960	93321269	2	2	0.6474	8.37703955461572e-07	93317214	93318358	5.51921507224697e-07	93321269	93323171
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	13	93323171	100690991	3342	3158	-0.0091	5.51921507224697e-07	93321269	93323171	2.77428861486694e-15	100690991	100690991
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	13	100692746	100693892	2	2	0.9434	2.77428861486694e-15	100690991	100690991	1.04446531735276e-14	100693892	100693892
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	13	100695073	114123340	4562	4334	-0.0062	1.04446531735276e-14	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	14	18446762	18544772	6	6	0.0605	NA	NA	NA	4.85950835355144e-08	18508651	18864561
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	14	18798641	19494416	54	50	-0.487	4.85950835355144e-08	18508651	18864561	5.24007702574336e-85	19490630	19497023
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	14	19497023	21529816	992	948	-0.0138	5.24007702574336e-85	19490630	19497023	5.21916309734641e-271	21528132	21536847
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	14	21533558	22022060	245	231	-0.4574	5.21916309734641e-271	21528132	21536847	0.00116366426183511	21986973	22034704
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	14	22025617	22048569	14	14	-0.2497	0.00116366426183511	21986973	22034704	5.63204356206051e-09	22044438	22057437
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	14	22049850	40680589	6338	6026	-0.0013	5.63204356206051e-09	22044438	22057437	7.69365174475557e-18	40676611	40680589
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	14	40687108	40722360	6	6	-0.5853	7.69365174475557e-18	40676611	40680589	1.11077870718836e-17	40722360	40726930
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	14	40726930	69086125	9973	9462	0.0026	1.11077870718836e-17	40722360	40726930	1.64245554247275e-13	69086125	69086125
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	14	69088190	69092211	3	3	0.7336	1.64245554247275e-13	69086125	69086125	5.06917296518491e-13	69092211	69092211
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	14	69093444	73071404	1789	1694	5e-04	5.06917296518491e-13	69092211	69092211	1.27839946326855e-85	73071404	73071404
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	14	73072457	73092112	7	7	1.2114	1.27839946326855e-85	73071404	73071404	1.20478761548052e-77	73092112	73092112
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	14	73101327	78227579	2404	2282	0.004	1.20478761548052e-77	73092112	73092112	1.48092282289285e-30	78227579	78227579
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	14	78229428	78233664	4	4	-1.0036	1.48092282289285e-30	78227579	78227579	2.18479577285144e-41	78233664	78233664
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	14	78235693	79174722	506	477	-0.0228	2.18479577285144e-41	78233664	78233664	7.037552108907e-15	79172702	79174722
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	14	79176037	79183154	4	4	-0.6127	7.037552108907e-15	79172702	79174722	1.11140179951912e-12	79183154	79185548
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	14	79185548	99935270	6963	6613	0.0041	1.11140179951912e-12	79183154	79185548	1.55520926710607e-50	99935270	99935270
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	14	99937190	99937190	1	0	NA	1.55520926710607e-50	99935270	99935270	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	14	99938814	99948338	7	7	-0.9092	NA	NA	NA	1.71651942781247e-39	99948338	99948338
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	14	99951312	105848335	2385	2266	-0.0015	1.71651942781247e-39	99948338	99948338	5.99092392108512e-22	105846004	105848335
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	14	105850033	105850033	1	0	NA	5.99092392108512e-22	105846004	105848335	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	14	105856591	105881893	7	7	0.6792	NA	NA	NA	5.31868503269195e-25	105881893	105881893
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	14	105897061	105946993	16	14	-0.0244	5.31868503269195e-25	105881893	105881893	2.77355323813791e-18	105945006	105951399
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	14	105948347	106002179	18	16	-0.6755	2.77355323813791e-18	105945006	105951399	4.99207969904522e-37	105998412	106013552
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	14	106013552	106358491	142	137	0.006	4.99207969904522e-37	105998412	106013552	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	15	18362555	18452491	5	5	0.1175	NA	NA	NA	7.84000989246843e-15	18452491	18452491
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	15	18692865	18837737	10	10	-0.4144	7.84000989246843e-15	18452491	18452491	4.23502150865669e-17	18837737	18837737
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	15	18842565	18848213	4	4	-1.4994	4.23502150865669e-17	18837737	18837737	1.71374108667719e-25	18848213	18848213
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	15	18851513	19130748	17	17	-0.4023	1.71374108667719e-25	18848213	18848213	1.14796695222430e-11	19120442	19137963
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	15	19134391	19202505	22	21	-0.1562	1.1479669522243e-11	19120442	19137963	0.00103300811847205	19195299	19389869
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	15	19203646	19427350	38	37	-0.326	0.00103300811847205	19195299	19389869	6.58524460645248e-11	19424067	19537035
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	15	19430207	19845942	14	13	0.1482	6.58524460645248e-11	19424067	19537035	3.78963764407286e-12	19845942	19845942
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	15	19874677	19882711	3	3	-1.1032	3.78963764407286e-12	19845942	19845942	9.59568833975831e-30	19882711	19882711
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	15	19910696	52511733	11885	11314	-0.0053	9.5956883397583e-30	19882711	19882711	4.98553711011187e-13	52511733	52511733
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	15	52516459	52517110	2	0	NA	4.98553711011187e-13	52511733	52511733	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	15	52519074	52533227	2	2	-0.9094	NA	NA	NA	8.79445862303026e-15	52533227	52533227
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	15	52540479	53316553	229	222	0.0015	8.79445862303026e-15	52533227	52533227	1.77591021626231e-06	53315011	53316553
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	15	53318935	53320734	2	2	-0.6022	1.77591021626231e-06	53315011	53316553	6.43758247792215e-07	53320734	53322717
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	15	53322717	53439868	66	60	0.0072	6.43758247792215e-07	53320734	53322717	1.75746589652589e-10	53438917	53440850
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	15	53440850	53443742	4	4	-0.5648	1.75746589652589e-10	53438917	53440850	4.29789529925962e-10	53442883	53444740
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	15	53444740	75115806	9582	9096	0.0061	4.29789529925962e-10	53442883	53444740	1.26991951142162e-19	75115806	75115806
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	15	75117799	75119713	2	2	-1.1021	1.26991951142162e-19	75115806	75115806	1.34714334338760e-19	75119713	75119713
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	15	75121466	78855195	1488	1419	0.0108	1.3471433433876e-19	75119713	75119713	8.18362814975351e-13	78855195	78855195
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	15	78856680	78858227	2	2	0.912	8.18362814975351e-13	78855195	78855195	9.31199855309527e-14	78858227	78858227
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	15	78861458	100298352	7945	7571	-0.0026	9.31199855309527e-14	78858227	78858227	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	16	33628	33628	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	16	37560	76923844	21134	20087	-9e-04	NA	NA	NA	4.78087285750835e-95	76923844	76923844
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	16	76925748	76925748	1	0	NA	4.78087285750835e-95	76923844	76923844	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	16	76929598	76940218	8	8	1.248	NA	NA	NA	2.31821531797051e-93	76940218	76940218
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	16	76942679	88690571	4513	4312	-0.0042	2.31821531797051e-93	76940218	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	17	47546	1028979	417	397	-0.0074	NA	NA	NA	1.45001858053787e-52	1028979	1028979
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	17	1030715	1030766	2	2	1.759	1.45001858053787e-52	1028979	1028979	3.61269960571783e-44	1030766	1030766
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	17	1031233	1904451	435	412	-0.0012	3.61269960571783e-44	1030766	1030766	4.61516964582316e-09	1903358	1904451
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	17	1906319	1906391	3	3	0.6604	4.61516964582316e-09	1903358	1904451	6.73144869474235e-10	1906391	1909371
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	17	1909371	26220790	8975	8512	0.0063	6.73144869474235e-10	1906391	1909371	1.04606887599747e-08	26220790	26220790
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	17	26225330	26226519	2	2	-0.7484	1.04606887599747e-08	26220790	26220790	1.18303709331347e-08	26226519	26226519
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	17	26229215	31457889	2203	2095	0.0025	1.18303709331347e-08	26226519	26226519	5.25508282316545e-26	31447686	31462463
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	17	31461588	31499568	18	18	-0.4256	5.25508282316545e-26	31447686	31462463	4.18601654309286e-24	31492553	31891535
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	17	31503774	31503774	1	0	NA	4.18601654309286e-24	31492553	31891535	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	17	31889566	41519702	3832	3643	0.0075	NA	NA	NA	2.25462849944645e-32	41515622	41519702
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	17	41521544	41566540	21	21	-0.4552	2.25462849944645e-32	41515622	41519702	1.03085623211437e-36	41566540	41568539
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	17	41568539	41710400	46	45	0.2865	1.03085623211437e-36	41566540	41568539	8.98750351533618e-28	41648545	42148637
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	17	42142363	78653545	13679	12950	0.0033	8.98750351533618e-28	41648545	42148637	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	18	4316	76116026	22964	21863	-0.0026	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	19	210395	1398325	492	458	0.0171	NA	NA	NA	2.37260437516921e-27	1398325	1398325
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	19	1400798	1400840	2	2	1.5827	2.37260437516921e-27	1398325	1398325	7.94105336761977e-35	1400840	1400840
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	19	1405308	11448975	4678	4411	0.0068	7.94105336761977e-35	1400840	1400840	6.83514421948257e-20	11448975	11448975
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	19	11450908	11452390	2	2	1.2063	6.83514421948257e-20	11448975	11448975	2.39182192965622e-21	11452390	11452390
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	19	11453579	19694025	3853	3655	0.0057	2.39182192965622e-21	11452390	11452390	1.40953929364179e-09	19692626	19694025
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	19	19699024	19700620	3	3	-0.6609	1.40953929364179e-09	19692626	19694025	2.30779619744714e-09	19700620	19702214
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	19	19702214	40352568	3579	3391	-0.0066	2.30779619744714e-09	19700620	19702214	1.42076179618243e-12	40352568	40352568
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	19	40354034	40356341	2	2	-0.9287	1.42076179618243e-12	40352568	40352568	3.66061843870826e-17	40356341	40356341
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	19	40359145	40540618	82	76	0.0184	3.66061843870826e-17	40356341	40356341	1.21608665815414e-13	40540618	40540618
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	19	40543992	40553315	3	3	-0.6763	1.21608665815414e-13	40540618	40540618	1.81887808233151e-10	40553315	40556205
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	19	40556205	55769042	6659	6312	0.004	1.81887808233151e-10	40553315	40556205	2.65827070594214e-09	55766650	55769042
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	19	55770195	55772729	2	2	-0.7841	2.65827070594214e-09	55766650	55769042	1.28298641724883e-08	55772729	55776055
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	19	55776055	58208527	1110	1055	-0.0051	1.28298641724883e-08	55772729	55776055	1.9287008429993e-09	58198955	58208527
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	19	58212113	58241773	14	14	-0.3132	1.9287008429993e-09	58198955	58208527	2.79813475981731e-10	58241773	58254174
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	19	58244012	58620201	160	151	-0.0088	2.79813475981731e-10	58241773	58254174	6.15489833388083e-41	58616879	58624300
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	19	58624300	58709144	25	25	0.476	6.15489833388083e-41	58616879	58624300	2.82264327609717e-43	58706910	58712022
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	19	58712022	59246409	300	286	-0.0112	2.82264327609717e-43	58706910	58712022	1.58862365889280e-15	59246409	59246409
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	19	59249279	59251831	3	3	-0.823	1.5886236588928e-15	59246409	59246409	4.68310964151862e-15	59251831	59251831
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	19	59253728	63788698	2090	1984	-0.0032	4.68310964151862e-15	59251831	59251831	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	20	12719	1506379	586	546	0.0114	NA	NA	NA	1.20436873855906e-170	1506379	1506379
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	20	1511632	1532433	10	10	1.5171	1.20436873855906e-170	1506379	1506379	1.29032590874337e-184	1532433	1532433
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	20	1544485	62419534	20983	19994	0.0012	1.29032590874337e-184	1532433	1532433	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	21	9882922	36789648	8545	8118	0.0018	NA	NA	NA	8.13335350511842e-16	36789648	36789648
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	21	36790648	36791668	2	2	0.9706	8.13335350511842e-16	36789648	36789648	1.26052372687684e-13	36791668	36791668
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	21	36792708	46922972	4894	4658	9e-04	1.26052372687684e-13	36791668	36791668	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	22	14513474	16521073	406	389	-0.0014	NA	NA	NA	1.65578659078988e-16	16521073	16521073
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	22	16523019	16524408	2	2	-1.0893	1.65578659078988e-16	16521073	16521073	3.44275593208891e-19	16524408	16524408
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	22	16525922	18125356	724	690	0.0126	3.44275593208891e-19	16524408	16524408	1.79608458687301e-25	18125356	18125356
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	22	18127933	18129194	2	2	1.2834	1.79608458687301e-25	18125356	18125356	4.13687736433501e-24	18129194	18129194
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	22	18131561	22667608	1849	1770	7e-04	4.13687736433501e-24	18129194	18129194	4.10891361609911e-68	22667608	22679305
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	22	22677959	22725305	22	21	0.6678	4.10891361609911e-68	22667608	22679305	4.83801411366322e-72	22720195	22725305
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	22	22735036	49571068	13552	12843	0.0069	4.83801411366322e-72	22720195	22725305	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	23	1091	94062	6	5	0.2403	NA	NA	NA	9.46391969654302e-15	94062	94062
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	23	95819	104732	7	7	-1.0518	9.46391969654302e-15	94062	94062	6.56109455153457e-23	103089	104732
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	23	106242	124528	16	16	-0.0281	6.56109455153457e-23	103089	104732	6.51594519348056e-11	124528	127113
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	23	127113	130528	5	4	0.7104	6.51594519348056e-11	124528	127113	1.64326889625630e-12	129544	130528
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	23	132689	2708291	1759	1663	-0.0013	1.6432688962563e-12	129544	130528	0	2708291	2708291
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	23	2711273	152655026	44461	42153	0.9031	0	2708291	2708291	7.60986381968832e-30	152655026	152655026
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	23	152656332	152657445	2	2	-0.3901	7.60986381968832e-30	152655026	152655026	1.66155819286211e-09	152657445	152657445
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	23	152669192	153328351	254	241	0.8045	1.66155819286211e-09	152657445	152657445	9.74370560332918e-07	153322116	153340901
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	23	153329988	153329988	1	0	NA	9.74370560332918e-07	153322116	153340901	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	23	153332114	153348763	8	8	0.2848	NA	NA	NA	8.42569413208197e-12	153342841	153355101
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	23	153351248	153351248	1	0	NA	8.42569413208197e-12	153342841	153355101	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	23	153352463	154028488	271	256	0.8704	NA	NA	NA	4.80628546654172e-11	154022916	154037006
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	23	154031239	154078819	14	14	1.2884	4.80628546654172e-11	154022916	154037006	3.14219404653762e-09	154070953	154086636
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	23	154079002	154442377	90	84	0.8899	3.14219404653762e-09	154070953	154086636	1.71038971499861e-203	154442377	154442377
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	23	154446801	154450309	4	4	-2.9539	1.71038971499861e-203	154442377	154442377	1.25515846329400e-139	154450309	154450309
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	23	154456891	154582414	28	26	0.8833	1.255158463294e-139	154450309	154450309	7.57369859316846e-137	154582414	154582414
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	23	154586690	154888033	200	188	0.0082	7.57369859316846e-137	154582414	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	23	154888224	154888224	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	2710450	3733715	124	116	-4.2085	NA	NA	NA	1.65732777654382e-35	3219200	3733715
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	3772482	5531459	15	15	-0.8646	1.65732777654382e-35	3219200	3733715	1.02233591568826e-17	5422507	5672441
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	5593746	6953343	119	111	-3.9311	1.02233591568826e-17	5422507	5672441	2.40480284871021e-09	6930012	6993680
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	6954864	7495687	185	176	-2.8993	2.40480284871021e-09	6930012	6993680	2.17384652051053e-09	7410906	7608619
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	7568006	7722458	74	70	-4.0806	2.17384652051053e-09	7410906	7608619	5.8228052601981e-06	7712882	7723783
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	7723783	7745143	10	9	-1.8656	5.8228052601981e-06	7712882	7723783	0.00144263015629040	7740117	7788596
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	7749796	7905286	46	42	-3.2935	0.0014426301562904	7740117	7788596	0.00308442551918211	7860364	7905286
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	7905553	7914104	3	3	-1.0228	0.00308442551918211	7860364	7905286	5.7969378690406e-93	7914104	7914104
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	7918899	7930528	5	5	-5.128	5.7969378690406e-93	7914104	7914104	0.000455927009764492	7930528	7951683
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	7936024	8010446	17	16	-3.1175	0.000455927009764492	7930528	7951683	2.38280071855131e-11	7996758	8036254
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	8016395	8178487	36	34	-4.8235	2.38280071855131e-11	7996758	8036254	8.11111786012052e-12	8174858	8178487
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	8179883	8185182	3	3	-2.1011	8.11111786012052e-12	8174858	8178487	7.49690199892116e-06	8185182	8186463
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	8186463	8289709	24	20	-4.2823	7.49690199892116e-06	8185182	8186463	0.00279645971863463	8251785	8347344
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	8292347	8687580	111	107	-3.342	0.00279645971863463	8251785	8347344	9.15275712243443e-08	8573273	8745585
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	8689019	10513747	193	181	-4.0796	9.15275712243443e-08	8573273	8745585	8.17208560540404e-32	10512616	10535786
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	10515697	12452734	20	17	-1.0189	8.17208560540404e-32	10512616	10535786	1.07903930164333e-13	11673476	12502304
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	12502304	12541506	11	11	-4.0896	1.07903930164333e-13	11673476	12502304	2.1010209657016e-06	12537944	12550566
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	12542979	12646477	47	44	-2.1215	2.1010209657016e-06	12537944	12550566	0.0314139793123922	12573266	12658135
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	12649357	12715696	12	12	-3.2154	0.0314139793123922	12573266	12658135	1.81226277830905e-09	12710000	12715696
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	12721434	12733867	4	4	-5.4813	1.81226277830905e-09	12710000	12715696	9.98301852569974e-12	12733867	12741404
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	12741404	12833424	14	14	-3.3306	9.98301852569974e-12	12733867	12741404	0.0958757378279207	12796639	12890628
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	12839975	12905395	25	25	-2.5446	0.0958757378279207	12796639	12890628	9.57051847231771e-06	12898049	12911576
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	12909643	12926941	8	8	-4.4816	9.57051847231771e-06	12898049	12911576	4.24102286103429e-07	12926941	12953078
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	12928074	13048283	47	44	-1.9662	4.24102286103429e-07	12926941	12953078	2.75399335768846e-05	13031576	13048283
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	13050965	13066849	10	9	-3.9741	2.75399335768846e-05	13031576	13048283	4.70741744663561e-11	13066849	13077621
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	13076862	13129843	23	23	-1.7883	4.70741744663561e-11	13066849	13077621	1.09372517307046e-10	13128515	13136828
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	13133803	13153117	12	10	-4.3866	1.09372517307046e-10	13128515	13136828	0.0135838281300758	13140274	13169265
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	13153920	13261173	32	32	-3.1417	0.0135838281300758	13140274	13169265	6.8886340875283e-10	13238502	13283695
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	13262997	13603478	160	156	-4.2031	6.8886340875283e-10	13238502	13283695	3.58554306904648e-06	13591921	13691261
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	13606316	13705594	14	11	-2.8758	3.58554306904648e-06	13591921	13691261	0.000171274226787869	13691261	13717328
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	13716000	13854447	33	30	-4.189	0.000171274226787869	13691261	13717328	7.10447863066168e-08	13853174	13854447
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	13854528	13863657	3	3	-1.6768	7.10447863066168e-08	13853174	13854447	8.7185605025992e-09	13863657	13866668
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	13866668	13918652	21	20	-4.0042	8.7185605025992e-09	13863657	13866668	0.0621667913345336	13885018	14033957
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	13918766	14116822	99	93	-4.6251	0.0621667913345336	13885018	14033957	0.00454544857316	14078145	14328579
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	14118164	14352278	37	35	-3.9177	0.00454544857316	14078145	14328579	0.00429882778607665	14318786	14448198
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	14353244	14692847	136	122	-3.1337	0.00429882778607665	14318786	14448198	0.266666506928972	14404284	14705129
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	14694578	14712496	16	14	-3.6938	0.266666506928972	14404284	14705129	0.0105608720758208	14696387	14731122
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	14713609	14713609	1	0	NA	0.0105608720758208	14696387	14731122	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	14714948	14857726	29	29	-4.5204	NA	NA	NA	1.71434563368730e-08	14841337	14899294
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	14868114	15018205	22	22	-3.2803	1.7143456336873e-08	14841337	14899294	0.000133871606487831	14952770	15018205
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	15022037	15081727	12	12	-4.4897	0.000133871606487831	14952770	15018205	1.1774945464998e-12	15072515	15081727
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	15089058	15139441	16	15	-3.4762	1.1774945464998e-12	15072515	15081727	1.20944214346830e-26	15139441	15139441
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	15140278	15149506	7	7	-1.7409	1.2094421434683e-26	15139441	15139441	6.27387125274414e-07	15149506	15154705
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	15152354	15206674	31	31	-3.8432	6.27387125274414e-07	15149506	15154705	2.98677754766625e-09	15204346	15209166
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	15207522	15241527	12	11	-1.6202	2.98677754766625e-09	15204346	15209166	1.51900718590139e-12	15228303	15244992
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	15242592	15434486	129	123	-4.1784	1.51900718590139e-12	15228303	15244992	1.50448103594313e-06	15415508	15470132
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	15443458	15639408	80	75	-3.2135	1.50448103594313e-06	15415508	15470132	4.3386566586784e-09	15583573	15655003
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	15642822	15915466	45	43	-4.6617	4.3386566586784e-09	15583573	15655003	2.38501690593544e-14	15902561	15949457
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	15920478	16309997	149	136	-3.2146	2.38501690593544e-14	15902561	15949457	2.10514785938221e-18	16245251	16453776
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	16318293	16318293	1	0	NA	2.10514785938221e-18	16245251	16453776	NA	NA	NA
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	16321288	22930737	1052	997	-4.0964	NA	NA	NA	9.46545465968079e-53	22924754	22930737
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	23283689	26945893	33	33	-1.1222	9.46545465968079e-53	22924754	22930737	1.12532938335318e-16	26945893	26952278
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	26950080	26980386	5	5	-4.1889	1.12532938335318e-16	26945893	26952278	2.73840806180276e-06	26957814	26980386
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	26984336	27019256	12	11	-0.9887	2.73840806180276e-06	26957814	26980386	1.21529742293828e-10	27019256	27019256
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	27019306	27039222	4	4	-4.2424	1.21529742293828e-10	27019256	27019256	6.13504037066716e-47	27039222	27039222
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	27053237	27137064	16	16	-0.41	6.13504037066716e-47	27039222	27039222	9.79848288939035e-30	27137064	27137064
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	27163598	27171797	3	3	-3.1586	9.79848288939035e-30	27137064	27137064	4.66279153463645e-37	27171797	27171797
MSK_252152916865_S01_CGH-v4_10_Apr08	24	27172283	57440809	13	13	-0.4128	4.66279153463645e-37	27171797	27171797	NA	NA	NA
