Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	14326287	4804	4613	0.0216	NA	NA	NA	8.09202904857258e-08	14323618	14326287
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	14328035	14332541	3	3	-0.925	8.09202904857258e-08	14323618	14326287	6.16161903956221e-08	14332541	14334974
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	14334974	72537426	23087	22074	0.0084	6.16161903956221e-08	14332541	14334974	0	72537426	72540240
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72539143	1	0	NA	0	72537426	72540240	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72540240	72574479	12	12	-2.9112	NA	NA	NA	0	72571158	72574479
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72579311	72579311	1	0	NA	0	72571158	72574479	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	84484082	3488	3340	-0.009	NA	NA	NA	4.46928750674098e-16	84484082	84484082
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	84485205	84487429	2	2	-1.4678	4.46928750674098e-16	84484082	84484082	6.49618654343791e-15	84487429	84487429
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	84488775	110014625	8211	7879	-0.0055	6.49618654343791e-15	84487429	84487429	1.35145412321084e-08	110008873	110023268
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110015739	110041712	6	6	-0.6567	1.35145412321084e-08	110008873	110023268	1.20239588652628e-08	110034542	110060587
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	150819879	5849	5574	-0.0027	1.20239588652628e-08	110034542	110060587	6.79105975251455e-15	150816180	150823073
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150852858	12	11	0.6225	6.79105975251455e-15	150816180	150823073	4.4942827495666e-13	150851439	150858516
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150857070	157133150	2760	2641	0.0172	4.4942827495666e-13	150851439	150858516	2.79055503439486e-45	157133150	157133150
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	2.6144	2.79055503439486e-45	157133150	157133150	6.45138217458207e-48	157136342	157136342
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	161099582	1622	1550	-0.0021	6.45138217458207e-48	157136342	157136342	2.32700939029789e-13	161099582	161099582
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161104752	161108722	3	3	-1.147	2.32700939029789e-13	161099582	161099582	2.08321221703087e-13	161108722	161108722
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161110682	179772660	7356	7047	-0.0094	2.08321221703087e-13	161108722	161108722	1.39808819705706e-10	179772660	179772660
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	179774532	179775904	2	2	1.2359	1.39808819705706e-10	179772660	179772660	2.61661088245588e-11	179775904	179775904
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	179778099	195009358	4314	4109	-0.0058	2.61661088245588e-11	179775904	179775904	5.71743445995034e-16	194978218	195009358
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195011344	195046932	5	5	-0.9328	5.71743445995034e-16	194978218	195009358	2.44241965169902e-14	195046932	195048208
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195048208	200602881	2163	2071	-0.0034	2.44241965169902e-14	195046932	195048208	1.20904576730953e-11	200587846	200633348
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200609726	200787319	36	34	-0.3288	1.20904576730953e-11	200587846	200633348	7.32270643711601e-12	200678532	200807586
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200797743	247186514	17409	16689	-0.0027	7.32270643711601e-12	200678532	200807586	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	8045619	2397	2292	0.0083	NA	NA	NA	2.04619989576840e-11	8042298	8045619
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	8048423	8053654	3	3	-1.0622	2.0461998957684e-11	8042298	8045619	2.21805347409546e-11	8053654	8058417
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	8058417	34543992	9122	8771	0.0014	2.21805347409546e-11	8053654	8058417	9.08835855022765e-21	34539740	34551222
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34580533	15	15	0.6357	9.08835855022765e-21	34539740	34551222	1.69038941759278e-21	34579933	34583814
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34582272	146571330	33537	32092	-0.0035	1.69038941759278e-21	34579933	34583814	7.88769256776694e-15	146562545	146571330
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	1.0349	7.88769256776694e-15	146562545	146571330	2.12987702351170e-16	146592775	146597405
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	154601442	2203	2113	-0.0085	2.1298770235117e-16	146592775	146597405	5.07483094553293e-266	154601442	154601442
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154605621	154606943	2	2	-5.8542	5.07483094553293e-266	154601442	154601442	1.06967838844647e-256	154606943	154606943
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154608095	180117780	9106	8698	-0.0132	1.06967838844647e-256	154606943	154606943	2.38946619146524e-20	180115198	180117780
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	180121271	180129680	6	6	-0.9789	2.38946619146524e-20	180115198	180117780	9.90101846815531e-24	180129680	180131608
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	180131608	182762084	806	778	-0.0135	9.90101846815531e-24	180129680	180131608	7.48063417716749e-13	182760617	182762084
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	182764417	182769471	4	4	-0.887	7.48063417716749e-13	182760617	182762084	2.92498326361832e-10	182769471	182772521
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	182772521	242689978	20622	19737	-0.0049	2.92498326361832e-10	182769471	182772521	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10312	-0.0038	NA	NA	NA	1.91149145582937e-72	32074432	32074432
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	-3.1519	1.91149145582937e-72	32074432	32074432	6.87986475566355e-71	32080848	32080848
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	163992903	42690	40885	-0.0041	6.87986475566355e-71	32080848	32080848	4.6370765787186e-74	163992903	164001657
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164027724	8	8	1.598	4.6370765787186e-74	163992903	164001657	0.00081815979087235	164005577	164036648
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	20	0.953	0.00081815979087235	164005577	164036648	1.08261034331761e-69	164107951	164107951
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	194354505	10130	9669	-0.0091	1.08261034331761e-69	164107951	164107951	3.31300772221447e-16	194353315	194360242
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194368145	7	7	0.7883	3.31300772221447e-16	194353315	194360242	5.10204465297418e-15	194365648	194375211
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194371608	194371608	1	0	NA	5.10204465297418e-15	194365648	194375211	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194375211	199329592	1978	1887	-0.0102	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	58159	9	9	0.1458	NA	NA	NA	1.06991743469188e-07	58159	58159
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	61552	84450	7	7	-0.2072	1.06991743469188e-07	58159	58159	3.57920733986441e-06	84450	93573
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	92093	96888	4	4	0.3336	3.57920733986441e-06	84450	93573	1.60955766850544e-05	95022	103540
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	100189	163294	24	23	-0.2789	1.60955766850544e-05	95022	103540	1.53102350093713e-06	149232	199922
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	164413	9815760	3349	3182	0.0298	1.53102350093713e-06	149232	199922	5.2190768271543e-316	9815760	9815760
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.8965	5.2190768271543e-316	9815760	9815760	0	9842644	9842644
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	34445002	6167	5898	-0.0058	0	9842644	9842644	0	34445002	34445002
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	-4.4734	0	34445002	34445002	0	34491115	34491115
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	68905670	8863	8482	-0.0108	0	34491115	34491115	0	68905670	69069651
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	13	-2.9742	0	68905670	69069651	0	69163312	69165814
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	119334954	16298	15612	-0.0119	0	69163312	69165814	2.87545977233351e-09	119333701	119334954
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119345371	119348829	3	3	-0.9432	2.87545977233351e-09	119333701	119334954	3.81794966078552e-09	119348829	119350354
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119350354	191153613	20413	19540	-0.0126	3.81794966078552e-09	119348829	119350354	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	155405839	45483	43504	-0.0065	NA	NA	NA	4.01289679171898e-311	155405839	155405839
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155411053	155421443	5	5	-4.1218	4.01289679171898e-311	155405839	155405839	3.25206045412140e-297	155421443	155421443
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155427589	179429409	7854	7543	0.0038	3.2520604541214e-297	155421443	155421443	3.84122357862554e-14	179429409	179429409
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	179430821	179431937	2	2	-1.4431	3.84122357862554e-14	179429409	179429409	5.02017821506655e-15	179431937	179431937
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	179433578	180194323	301	290	0.0157	5.02017821506655e-15	179431937	179431937	5.91329147065273e-208	180194323	180344964
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180342860	180342860	1	0	NA	5.91329147065273e-208	180194323	180344964	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	7	-3.4478	NA	NA	NA	1.83195365880321e-110	180357210	180358977
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	105	-0.01	1.83195365880321e-110	180357210	180358977	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	237952	55	51	-0.0557	NA	NA	NA	2.21271318538685e-07	219639	254509
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	240119	320854	43	41	0.2482	2.21271318538685e-07	219639	254509	7.8125217386241e-08	295724	350177
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	322557	29950805	10489	10052	0.0037	7.8125217386241e-08	295724	350177	4.11964847062513e-12	29939288	29962849
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	29995247	10	10	0.6087	4.11964847062513e-12	29939288	29962849	1.65697286101614e-11	29992946	30000990
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29998009	32558677	1080	1025	0.0158	1.65697286101614e-11	29992946	30000990	1.46454304067778e-170	32558677	32558677
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32588005	4	4	-3.5163	1.46454304067778e-170	32558677	32558677	4.32572931307181e-25	32588005	32588005
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32590568	32600962	5	4	-1.2447	4.32572931307181e-25	32588005	32588005	6.58527429030262e-22	32600962	32600962
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	134629897	31997	30626	-0.0071	6.58527429030262e-22	32600962	32600962	1.26476833275516e-11	134627341	134629897
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134631701	134635779	4	4	-0.9263	1.26476833275516e-11	134627341	134629897	1.85611585145951e-12	134635779	134641054
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134639397	134639397	1	0	NA	1.85611585145951e-12	134635779	134641054	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134641054	139643729	1895	1817	-0.0086	NA	NA	NA	1.80667047619374e-12	139643729	139643729
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139645417	139648318	3	3	-1.0686	1.80667047619374e-12	139643729	139643729	1.81033698141882e-11	139648318	139648318
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139651247	165643653	8723	8336	-0.011	1.81033698141882e-11	139648318	139648318	6.52877257198817e-182	165643653	165643653
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	-3.5588	6.52877257198817e-182	165643653	165643653	9.67562280791561e-165	165650610	165650610
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	165653315	1	0	NA	9.67562280791561e-165	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165655123	170753106	1803	1723	1e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	20236099	6760	6435	0.0017	NA	NA	NA	2.90360796564831e-10	20234398	20236099
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	20238450	20243406	3	3	-1.0054	2.90360796564831e-10	20234398	20236099	9.24093613937269e-10	20243406	20245704
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	20245704	125831554	35675	34173	-0.0037	9.24093613937269e-10	20243406	20245704	1.51015130904916e-17	125831554	125831554
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	1.3091	1.51015130904916e-17	125831554	125831554	1.29222184862856e-17	125837524	125837524
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	141410894	7362	7042	-0.001	1.29222184862856e-17	125837524	125837524	1.20819118115516e-12	141406414	141417702
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	12	0.5585	1.20819118115516e-12	141406414	141417702	3.22615821211854e-12	141432778	141442231
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	158821263	6879	6563	-0.0044	3.22615821211854e-12	141432778	141442231	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	39350798	13074	12484	0.0022	NA	NA	NA	1.00359257881323e-98	39345557	39352361
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	57	0.7038	1.00359257881323e-98	39345557	39352361	2.84603230983193e-107	39504332	39508035
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	109343455	20171	19294	-0.0073	2.84603230983193e-107	39504332	39508035	1.11543339659159e-13	109343455	109343455
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	109347506	109353160	3	3	-1.1428	1.11543339659159e-13	109343455	109343455	5.38180821075412e-13	109353160	109354420
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	109354420	146253929	11258	10801	0.0037	5.38180821075412e-13	109353160	109354420	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	146264846	146264846	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	140145683	37944	36264	-0.003	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	135285645	44808	42867	-0.004	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1698	4e-04	NA	NA	NA	1.93218104401319e-176	4923300	4923300
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4931000	4	4	-3.8429	1.93218104401319e-176	4923300	4923300	1.26000223608806e-155	4931000	4931000
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4932214	4932214	1	0	NA	1.26000223608806e-155	4931000	4931000	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	5741031	361	345	-0.0078	NA	NA	NA	3.50845426920676e-21	5734978	5742476
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	15	-0.741	3.50845426920676e-21	5734978	5742476	5.57668106418315e-29	5763749	5766615
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	55118214	14752	14114	-5e-04	5.57668106418315e-29	5763749	5766615	3.83349724272886e-55	55114405	55124730
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55217189	40	37	-0.6475	3.83349724272886e-55	55114405	55124730	1.33736966860322e-53	55207305	55221692
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	134450318	28359	27104	-9e-04	1.33736966860322e-53	55207305	55221692	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3602	0.0135	NA	NA	NA	7.8777116232369e-13	9456107	9554149
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9604633	14	13	0.5676	7.8777116232369e-13	9456107	9554149	3.07594475683015e-17	9589725	9610054
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9607363	11104973	569	548	-0.0232	3.07594475683015e-17	9589725	9610054	2.44651455416349e-08	11099711	11110735
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11109483	11123452	6	6	-0.6243	2.44651455416349e-08	11099711	11110735	7.98202133636885e-06	11123452	11125311
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11125311	11128557	3	3	-2.719	7.98202133636885e-06	11123452	11125311	6.77625912614297e-78	11128557	11128557
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11130871	11130871	1	0	NA	6.77625912614297e-78	11128557	11128557	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	132289090	40826	39055	-0.0011	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	49958475	12218	11696	-0.0095	NA	NA	NA	2.9902859852005e-11	49958475	49958475
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49964838	49964838	1	0	NA	2.9902859852005e-11	49958475	49958475	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	1.2895	NA	NA	NA	4.3404774685798e-11	49971732	49971732
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56646284	1803	1725	-0.0045	4.3404774685798e-11	49971732	49971732	3.66246449073661e-15	56606183	56657371
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56650373	56650373	1	0	NA	3.66246449073661e-15	56606183	56657371	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56681665	14	13	0.5865	NA	NA	NA	2.71335662006437e-17	56680346	56688605
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56685341	56685341	1	0	NA	2.71335662006437e-17	56680346	56688605	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	100690991	13040	12463	-0.0087	NA	NA	NA	4.10403438496732e-213	100690991	100690991
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-5.2264	4.10403438496732e-213	100690991	100690991	1.97455646302030e-194	100693892	100693892
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	100695073	1	0	NA	1.9745564630203e-194	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100696985	114123340	4561	4360	-0.0076	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	59	-0.4885	NA	NA	NA	5.05435307788887e-44	19484013	19538610
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	20598110	539	521	-0.0014	5.05435307788887e-44	19484013	19538610	1.02505701718190e-05	20576934	20601371
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	20600175	20633003	20	20	0.2868	1.0250570171819e-05	20576934	20601371	1.71841853796047e-06	20629648	20649351
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	20634822	40676611	7029	6731	-0.0035	1.71841853796047e-06	20629648	20649351	2.40512224809796e-10	40663660	40676611
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40722360	7	7	-0.6366	2.40512224809796e-10	40663660	40676611	1.50336006177685e-10	40722360	40741934
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40726930	49785082	2205	2114	-0.005	1.50336006177685e-10	40722360	40741934	9.57181072044064e-15	49783387	49785082
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	49790812	49796327	4	4	-0.9863	9.57181072044064e-15	49783387	49785082	1.24912437297393e-13	49796327	49797755
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	49797755	69086125	7764	7440	-0.0121	1.24912437297393e-13	49796327	49797755	4.25359504017357e-08	69084841	69086125
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69092211	3	3	0.8686	4.25359504017357e-08	69084841	69086125	1.94162116836438e-07	69092211	69093444
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69093444	73061942	1788	1720	0.0049	1.94162116836438e-07	69092211	69093444	3.60418702704706e-19	73060301	73061942
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73092112	8	7	0.8991	3.60418702704706e-19	73060301	73061942	4.27977089270555e-18	73092112	73101327
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	105597555	12215	11688	0.0025	4.27977089270555e-18	73092112	73101327	4.12589403222705e-11	105594189	105607572
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	11	0.5701	4.12589403222705e-11	105594189	105607572	1.58242016424418e-06	105625010	105707746
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105945006	70	67	-0.0887	1.58242016424418e-06	105625010	105707746	1.02506634461828e-06	105906483	105948347
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105946993	106002179	19	18	-0.6125	1.02506634461828e-06	105906483	105948347	1.05820692356292e-14	105998412	106017453
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106221696	92	91	-0.0408	1.05820692356292e-14	105998412	106017453	1.84691096664956e-16	106218059	106223137
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106223137	106255190	15	15	0.6034	1.84691096664956e-16	106218059	106223137	5.92134572714281e-17	106253648	106260876
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106256498	106358491	35	34	-0.044	5.92134572714281e-17	106253648	106260876	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	19800789	100	97	-0.0981	NA	NA	NA	0.0134596900923324	18432558	19805960
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19803092	19835471	7	7	0.2261	0.0134596900923324	18432558	19805960	0.000193786002957449	19822150	19845942
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19839695	19882711	6	6	0.7675	0.000193786002957449	19822150	19845942	0.000130146943137805	19874677	19927262
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19910696	20014107	33	30	0.2273	0.000130146943137805	19874677	19927262	0.000168312222625289	19985258	20347935
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20020938	20020938	1	0	NA	0.000168312222625289	19985258	20347935	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20022359	100298352	31175	29804	-0.0015	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	75093957	20523	19646	0.011	NA	NA	NA	4.20257218628037e-53	75093957	75093957
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	2.3199	4.20257218628037e-53	75093957	75093957	1.98009438951324e-51	75100865	75100865
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	588	-0.0045	1.98009438951324e-51	75100865	75100865	2.60762132082126e-159	76925748	76929598
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	-2.7196	2.60762132082126e-159	76925748	76929598	2.72484675325742e-184	76938723	76940218
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	87165574	3852	3702	0.0061	2.72484675325742e-184	76938723	76940218	4.68367809600587e-09	87163938	87165574
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	87167051	87169085	2	2	-1.2223	4.68367809600587e-09	87163938	87165574	1.64737565777302e-07	87169085	87170962
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	87170962	88690571	659	624	-0.0193	1.64737565777302e-07	87169085	87170962	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	31457889	12037	11487	0.0117	NA	NA	NA	7.53936346016966e-10	31441419	31473186
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31503774	19	15	-0.4481	7.53936346016966e-10	31441419	31473186	1.00208432929241e-10	31479804	31895551
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	36673853	1815	1738	0.006	1.00208432929241e-10	31479804	31895551	2.5395804567805e-158	36673853	36673853
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	5	-2.9311	2.5395804567805e-158	36673853	36673853	4.23789047069401e-144	36683509	36683509
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	78653545	15758	15080	0.0135	4.23789047069401e-144	36683509	36683509	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	21943	-0.0062	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	63787171	23058	22013	0.0193	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	63788698	63788698	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	562	-0.0063	NA	NA	NA	1.07952224545319e-19	1499421	1515948
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	0.7635	1.07952224545319e-19	1499421	1515948	9.6280410821362e-20	1528899	1544485
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	8755317	2603	2497	0.0034	9.6280410821362e-20	1528899	1544485	1.56350116332801e-06	8752722	8755317
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	8756968	8758367	2	2	1.0021	1.56350116332801e-06	8752722	8755317	5.88351325093127e-07	8758367	8761227
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	8761227	52080395	14640	14000	0.0029	5.88351325093127e-07	8758367	8761227	1.07946379351540e-10	52078884	52080395
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52081719	52092989	6	6	-0.7457	1.0794637935154e-10	52078884	52080395	9.1308108516076e-10	52092989	52095933
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52094361	62419534	3732	3568	0.0053	9.1308108516076e-10	52092989	52095933	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12873	-0.0026	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	22667608	2982	2856	0.0165	NA	NA	NA	3.22912058559496e-30	22644243	22686731
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22677959	1	0	NA	3.22912058559496e-30	22644243	22686731	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22679305	22725305	21	20	0.7255	NA	NA	NA	1.05319332902559e-31	22714979	22736990
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	35472378	6547	6237	0.0193	1.05319332902559e-31	22714979	22736990	1.13683446004028e-10	35472378	35472378
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	1.3342	1.13683446004028e-10	35472378	35472378	3.36197151113440e-10	35476942	35476942
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6682	0.0161	3.3619715111344e-10	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	124528	29	29	0.0189	NA	NA	NA	1.86356370860647e-07	122273	127779
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	5	-0.7832	1.86356370860647e-07	122273	127779	1.31156739980083e-08	129104	132689
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	1431411	755	723	0.0067	1.31156739980083e-08	129104	132689	2.89260434696079e-12	1431411	1431411
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-1.4633	2.89260434696079e-12	1431411	1431411	2.70505973809884e-13	1432953	1432953
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2708113	1001	974	-0.0179	2.70505973809884e-13	1432953	1432953	0	2708113	2711273
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2708291	2708291	1	0	NA	0	2708113	2711273	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	8452395	1791	1712	0.9395	NA	NA	NA	3.46274782863572e-12	8449254	8459880
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8456422	8473482	8	8	0.1094	3.46274782863572e-12	8449254	8459880	6.00406231515356e-21	8463131	8475091
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8475091	154037006	43201	41362	0.9649	6.00406231515356e-21	8463131	8475091	8.35976405050088e-18	154022916	154038318
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154038318	154078819	12	12	1.4701	8.35976405050088e-18	154022916	154038318	5.03712043687038e-08	154078401	154088378
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154442377	90	89	0.9272	5.03712043687038e-08	154078401	154088378	7.5730003998115e-08	154441943	154442377
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154449960	3	3	1.9692	7.5730003998115e-08	154441943	154442377	4.7886322283371e-12	154449960	154450309
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154450309	154582414	29	28	1.0586	4.7886322283371e-12	154449960	154450309	3.95542068720723e-106	154582414	154582414
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888033	200	192	-0.0217	3.95542068720723e-106	154582414	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154888224	154888224	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4174561	129	119	-3.6534	NA	NA	NA	2.17437197236899e-08	2951981	6792895
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	8005148	468	450	-2.757	2.17437197236899e-08	2951981	6792895	3.02880136396433e-07	7866716	8058483
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8010446	8289709	64	63	-3.8624	3.02880136396433e-07	7866716	8058483	3.99452411297979e-08	8221620	8335081
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8292347	8823361	160	153	-2.8598	3.99452411297979e-08	8221620	8335081	1.45739743342120e-05	8714581	8955579
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8824539	10515697	145	139	-3.5138	1.4573974334212e-05	8714581	8955579	1.20571656983594e-18	10513747	10515697
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10631941	11	10	-0.3079	1.20571656983594e-18	10513747	10515697	0.00160295188335378	10631941	12527445
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10645500	10645500	1	0	NA	0.00160295188335378	10631941	12527445	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12682301	72	69	-1.923	NA	NA	NA	0.000336535539368685	12618263	12725675
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	23	-3.2267	0.000336535539368685	12618263	12725675	5.72029671088299e-09	12796639	12855363
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	13129843	113	113	-1.6221	5.72029671088299e-09	12796639	12855363	1.95508626219117e-10	13111594	13148290
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13254711	41	40	-3.0751	1.95508626219117e-10	13111594	13148290	0.00191797489135066	13158272	13356419
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13256555	14342834	367	349	-3.8116	0.00191797489135066	13158272	13356419	2.66583870003299e-18	14325320	14368151
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14508021	96	91	-2.6346	2.66583870003299e-18	14325320	14368151	2.61808884837716e-05	14489032	14536962
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	2.61808884837716e-05	14489032	14536962	NA	NA	NA
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	25	-1.2816	NA	NA	NA	0.0314421600046823	14553021	14698076
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14705886	28	25	-2.4336	0.0314421600046823	14553021	14698076	0.173125842725223	14598838	15062957
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14707011	15284717	166	163	-3.1991	0.173125842725223	14598838	15062957	9.73169458483217e-05	15209166	15303557
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15286805	15409110	80	77	-3.9855	9.73169458483217e-05	15209166	15303557	9.49945338667275e-06	15390599	15460238
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15410566	15915466	143	137	-3.1277	9.49945338667275e-06	15390599	15460238	0.0864428759316837	15532597	16133263
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16387273	162	153	-2.6905	0.0864428759316837	15532597	16133263	2.70994149415798e-13	16253090	16575926
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	22930737	1040	984	-3.53	2.70994149415798e-13	16253090	16575926	2.25362317881072e-30	22923722	22930737
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	33	-1.0259	2.25362317881072e-30	22923722	22930737	9.00396369416577e-10	26945084	26952278
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	26980386	5	5	-3.3408	9.00396369416577e-10	26945084	26952278	0.000149621087669123	26952278	26984336
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26984336	27019256	12	12	-1.1115	0.000149621087669123	26952278	26984336	3.38599079170482e-16	27019256	27019256
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27039222	4	4	-4.1828	3.38599079170482e-16	27019256	27019256	7.08684434696064e-28	27039222	27053237
MSK_252152917393_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	29	-0.7484	7.08684434696064e-28	27039222	27053237	NA	NA	NA
