Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	16713074	5782	5640	0.014	NA	NA	NA	1.55161769053229e-18	16668773	16836160
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16799711	17127039	25	24	-0.3592	1.55161769053229e-18	16668773	16836160	3.84744901138702e-21	17107476	17155989
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17148592	34869589	7087	6900	0.0207	3.84744901138702e-21	17107476	17155989	8.88755236402927e-12	34859068	34869589
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34876833	34883375	4	4	-0.6797	8.88755236402927e-12	34859068	34869589	2.19925622577325e-11	34883375	34884849
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34884849	72537426	14996	14671	1e-04	2.19925622577325e-11	34883375	34884849	0	72537426	72539143
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	11	-3.3194	0	72537426	72539143	0	72574479	72579311
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	100545896	9249	9029	-0.0066	0	72574479	72579311	2.38187701234523e-11	100545896	100545896
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	100547338	100551071	2	2	-0.9336	2.38187701234523e-11	100545896	100545896	6.2514290271241e-12	100551071	100551071
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	100552814	109373255	2155	2114	-0.0092	6.2514290271241e-12	100551071	100551071	3.54934949107233e-12	109373255	109373255
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109374790	109376249	2	2	-0.9423	3.54934949107233e-12	109373255	109373255	6.07048997463622e-12	109376249	109376249
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109379566	109987341	280	277	0.0016	6.07048997463622e-12	109376249	109376249	1.82736869059616e-27	109987341	109987341
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109988743	109989998	2	2	1.4285	1.82736869059616e-27	109987341	109987341	9.94061767992865e-24	109989998	109989998
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109994195	113841017	1486	1444	0.0052	9.94061767992865e-24	109989998	109989998	1.62077676792383e-10	113841017	113841017
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	113847479	113848985	2	2	-0.9533	1.62077676792383e-10	113841017	113841017	3.98215798695692e-12	113848985	113848985
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	113850483	150818222	4377	4264	0.0033	3.98215798695692e-12	113848985	113848985	3.03421306739816e-12	150816180	150818222
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150819879	150839754	5	5	-0.6049	3.03421306739816e-12	150816180	150818222	1.29513400649676e-52	150839754	150839754
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150846148	4	4	-2.8493	1.29513400649676e-52	150839754	150839754	6.8608043504935e-10	150846148	150846148
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150847304	150847304	1	0	NA	6.8608043504935e-10	150846148	150846148	NA	NA	NA
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150848509	150851439	2	2	-1.022	NA	NA	NA	1.11257322390266e-12	150851439	150851439
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2695	0.0145	1.11257322390266e-12	150851439	150851439	9.97544140809646e-80	157133150	157133150
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	2.5612	9.97544140809646e-80	157133150	157133150	3.28828708248483e-82	157136342	157136342
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	157280738	55	54	-0.0431	3.28828708248483e-82	157136342	157136342	2.35710033121984e-08	157278016	157280738
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157282939	157286510	2	2	-0.885	2.35710033121984e-08	157278016	157280738	3.60954739042248e-10	157286510	157286510
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157287924	167483267	4051	3954	-0.0032	3.60954739042248e-10	157286510	157286510	1.49689824937240e-11	167479184	167493768
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	0.4655	1.4968982493724e-11	167479184	167493768	5.43293775060547e-12	167507882	167520743
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	200602881	11349	11070	-0.0097	5.43293775060547e-12	167507882	167520743	9.8712119562704e-17	200596027	200620756
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200609726	200673525	26	24	-0.3315	9.8712119562704e-17	200596027	200620756	3.4404785915544e-18	200661094	200679934
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200676505	208842547	3168	3094	0.0154	3.4404785915544e-18	200661094	200679934	1.92071178977526e-11	208842547	208842547
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	208843733	208845294	2	2	-0.9397	1.92071178977526e-11	208842547	208842547	3.23620596131361e-11	208845294	208847700
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	208847700	246753652	14121	13829	-0.0042	3.23620596131361e-11	208845294	208847700	6.86786937589923e-09	246696388	246805521
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246755225	246862029	30	30	0.2129	6.86786937589923e-09	246696388	246805521	2.27264856032497e-09	246853406	246902260
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246863179	247186514	98	97	-0.0129	2.27264856032497e-09	246853406	246902260	NA	NA	NA
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	146571330	45074	43987	-0.0031	NA	NA	NA	6.58605038460422e-28	146571330	146571330
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	1.0352	6.58605038460422e-28	146571330	146571330	6.44225187663738e-29	146592775	146592775
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	242689978	32749	31968	-0.0078	6.44225187663738e-29	146592775	146592775	NA	NA	NA
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	163992903	53488	52186	-0.0033	NA	NA	NA	4.98258553389118e-202	163992903	163997228
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164107951	28	25	1.0912	4.98258553389118e-202	163992903	163997228	6.14713201481244e-206	164105613	164107951
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	190844369	8913	8691	-0.0032	6.14713201481244e-206	164105613	164107951	7.38511490984506e-18	190844369	190844369
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	190847899	190850562	3	3	-0.9448	7.38511490984506e-18	190844369	190844369	1.69374330310279e-18	190850562	190850562
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	190854164	194354505	1214	1191	-0.0206	1.69374330310279e-18	190850562	190850562	0	194354505	194354505
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-4.1168	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196822133	996	978	-0.0043	0	194366950	194366950	4.92984985857015e-09	196802920	196911573
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196957322	29	28	-0.2315	4.92984985857015e-09	196802920	196911573	7.5863116095579e-08	196942158	196974018
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196958467	199329592	955	926	-0.004	7.5863116095579e-08	196942158	196974018	NA	NA	NA
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	68905670	18433	17998	-0.0061	NA	NA	NA	0	68905670	69069651
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	-2.8612	0	68905670	69069651	0	69163312	69165814
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	107275274	12705	12390	-0.0108	0	69163312	69165814	0	107275274	107275274
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107276428	107281410	4	4	-4.2464	0	107275274	107275274	0	107281410	107281410
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107283257	173224400	18484	18027	-0.0147	0	107281410	107281410	1.46523366256367e-22	173224400	173224400
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	1.2566	1.46523366256367e-22	173224400	173224400	2.50755977801933e-23	173228860	173228860
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	185990783	3702	3624	-0.0078	2.50755977801933e-23	173228860	173228860	1.82624023441666e-22	185990783	185990783
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	185992856	185995739	3	3	-1.0208	1.82624023441666e-22	185990783	185990783	1.19558847748908e-23	185995739	185995739
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	185998398	186676034	263	258	0.0131	1.19558847748908e-23	185995739	185995739	8.60713453963055e-159	186676034	186676034
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	3.2708	8.60713453963055e-159	186676034	186676034	7.26244623726267e-142	186680176	186680176
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	191153613	1549	1505	-0.0118	7.26244623726267e-142	186680176	186680176	NA	NA	NA
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	127434789	35318	34426	-0.0106	NA	NA	NA	4.71956583040291e-183	127434789	127434789
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	127436376	127438118	2	2	-3.6312	4.71956583040291e-183	127434789	127434789	8.23085499735176e-171	127438118	127438118
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	127439603	180644810	18446	18003	0.0039	8.23085499735176e-171	127438118	127438118	NA	NA	NA
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	198124	39	37	-0.0054	NA	NA	NA	7.71307382318714e-29	191387	202063
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	200350	200350	1	0	NA	7.71307382318714e-29	191387	202063	NA	NA	NA
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	237952	15	15	-0.5991	NA	NA	NA	1.86721354440149e-36	236535	240119
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	240119	29950805	10532	10288	2e-04	1.86721354440149e-36	236535	240119	1.48749023748412e-35	29941766	29980445
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30033946	21	21	0.502	1.48749023748412e-35	29941766	29980445	6.3465849737188e-25	30021908	30040917
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30040901	31381060	571	554	0.0185	6.3465849737188e-25	30021908	30040917	1.76428136349402e-13	31379839	31383925
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31382291	31390982	6	6	-0.6247	1.76428136349402e-13	31379839	31383925	3.25169063543439e-15	31387708	31393624
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31393624	32558677	492	477	0.014	3.25169063543439e-15	31387708	31393624	3.69368374657305e-48	32558677	32558677
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32590568	5	5	1.2286	3.69368374657305e-48	32558677	32558677	6.89936368815214e-08	32590568	32590568
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32593151	32626619	8	8	0.6319	6.89936368815214e-08	32590568	32590568	1.82127817016299e-08	32626619	32633691
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32628420	32745693	49	49	-0.0616	1.82127817016299e-08	32626619	32633691	0.000535411850341888	32738443	32758904
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32756637	32762061	4	4	-0.7778	0.000535411850341888	32738443	32758904	3.10180954349693e-14	32760574	32766023
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32766023	35862270	1332	1303	0.0092	3.10180954349693e-14	32760574	32766023	1.31610131769568e-09	35855652	35862502
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35862502	35873335	7	7	-0.482	1.31610131769568e-09	35855652	35862502	3.33477325942134e-10	35872078	35878656
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35875112	65767409	9308	9063	-0.0041	3.33477325942134e-10	35872078	35878656	6.65940695278417e-10	65767409	65767409
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65769146	65771532	2	2	-0.8854	6.65940695278417e-10	65767409	65767409	8.34877944151838e-12	65771532	65771532
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65778663	69741348	911	886	-0.0035	8.34877944151838e-12	65771532	65771532	1.36628205733112e-13	69741348	69741348
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	69744535	69747051	2	2	-0.9478	1.36628205733112e-13	69741348	69741348	1.30326973481963e-11	69747051	69747051
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	69749504	79018959	3119	3036	-0.0072	1.30326973481963e-11	69747051	69747051	1.02914924370819e-75	79018959	79018959
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-0.9305	1.02914924370819e-75	79018959	79018959	2.40949117249533e-79	79091850	79091850
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	102039635	6272	6119	-0.0093	2.40949117249533e-79	79091850	79091850	4.69925322848543e-15	102039635	102039635
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102041299	102044331	3	3	-0.8595	4.69925322848543e-15	102039635	102039635	2.0102838511768e-14	102044331	102044331
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102046884	103841482	487	476	-0.0016	2.0102838511768e-14	102044331	102044331	7.85808427658932e-307	103841482	103841482
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-3.4431	7.85808427658932e-307	103841482	103841482	0	103868154	103868154
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	165643653	21106	20608	-0.0083	0	103868154	103868154	3.21699310001872e-34	165643653	165643653
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.1213	3.21699310001872e-34	165643653	165643653	3.42923552416108e-30	165650610	165650610
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1759	-0.0096	3.42923552416108e-30	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	1036135	258	254	-0.0042	NA	NA	NA	9.92527508835696e-08	1033418	1036135
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1037402	1038517	2	2	-0.9073	9.92527508835696e-08	1033418	1036135	2.94560806827393e-10	1038517	1038517
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1047636	18244187	5879	5702	9e-04	2.94560806827393e-10	1038517	1038517	4.433361775145e-11	18244187	18244187
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	18248366	18251736	2	2	-0.8838	4.433361775145e-11	18244187	18244187	9.77079370044685e-11	18251736	18251736
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	18260638	26097755	2657	2598	-0.0027	9.77079370044685e-11	18251736	18251736	2.63228455607398e-35	26097755	26097755
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26103844	26108369	2	2	-1.59	2.63228455607398e-35	26097755	26097755	1.25784369451704e-32	26108369	26108369
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26112566	109217320	26161	25501	-0.0021	1.25784369451704e-32	26108369	26108369	1.04954227074303e-249	109217320	109217320
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109230336	109233214	3	3	-3.5446	1.04954227074303e-249	109217320	109217320	1.30417798240052e-258	109233214	109233214
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109236813	119127691	4501	4407	-0.0154	1.30417798240052e-258	109233214	109233214	2.34324815392084e-79	119127691	119134565
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	119130247	119175617	17	16	-0.8681	2.34324815392084e-79	119127691	119134565	6.35234592441587e-77	119169964	119175617
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	119178314	141410894	10321	10052	-0.005	6.35234592441587e-77	119169964	119175617	2.36547493621055e-28	141409512	141413352
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	13	0.58	2.36547493621055e-28	141409512	141413352	2.32191537585986e-26	141435643	141440184
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	158821263	6879	6729	-0.005	2.32191537585986e-26	141435643	141440184	NA	NA	NA
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	118	-0.0082	NA	NA	NA	4.98391725089932e-24	581533	581533
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-1.3965	4.98391725089932e-24	581533	581533	6.08979363014418e-25	588865	588865
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	39341524	12951	12633	-0.0043	6.08979363014418e-25	588865	588865	3.63161260867209e-15	39314620	39363050
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39345557	39488281	53	53	-0.2177	3.63161260867209e-15	39314620	39363050	3.0483661451587e-13	39465285	39509423
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39490826	40892587	449	441	-0.0105	3.0483661451587e-13	39465285	39509423	1.86237942477773e-241	40892587	40892587
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-4.2951	1.86237942477773e-241	40892587	40892587	2.26810795199187e-241	40897469	40897469
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	51191560	1736	1694	-0.0048	2.26810795199187e-241	40897469	40897469	5.91185560489211e-12	51189068	51191560
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51193977	51193977	1	0	NA	5.91185560489211e-12	51189068	51191560	NA	NA	NA
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51196227	51200291	3	3	-0.7999	NA	NA	NA	1.21016029465501e-12	51200291	51200291
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51202490	51202490	1	0	NA	1.21016029465501e-12	51200291	51200291	NA	NA	NA
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51204788	107567776	17437	17034	-0.0097	NA	NA	NA	2.84508777580312e-18	107567776	107567776
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	107571595	107576957	3	3	-0.9503	2.84508777580312e-18	107567776	107567776	1.30949488582974e-16	107576957	107576957
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	107579016	146264846	11809	11517	-0.0024	1.30949488582974e-16	107576957	107576957	NA	NA	NA
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5316	-0.0138	NA	NA	NA	1.73122802241963e-19	15802255	15802255
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	1.1876	1.73122802241963e-19	15802255	15802255	5.4020183139285e-19	15807123	15807123
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	34269444	5499	5348	-0.0082	5.4020183139285e-19	15807123	15807123	1.63076417843971e-29	34269444	34269444
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	34270912	34285040	7	6	-0.8644	1.63076417843971e-29	34269444	34269444	4.10774320299909e-27	34285040	34285040
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	34286609	70926188	2106	2062	0.0047	4.10774320299909e-27	34285040	34285040	1.49628266262008e-34	70926188	70926188
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-1.717	1.49628266262008e-34	70926188	70926188	5.37055286285465e-40	70930528	70930528
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	84556366	4516	4412	-0.01	5.37055286285465e-40	70930528	70930528	1.89706220989531e-16	84556366	84556366
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	84564109	84568906	4	3	-0.9055	1.89706220989531e-16	84556366	84556366	7.97141739789128e-15	84568906	84568906
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	84580673	140145683	20350	19818	-3e-04	7.97141739789128e-15	84568906	84568906	NA	NA	NA
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9479	-0.0054	NA	NA	NA	1.50910853463493e-22	27038538	27038538
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	1.3164	1.50910853463493e-22	27038538	27038538	7.58421444656649e-23	27041812	27041812
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	46384985	4727	4610	-0.0077	7.58421444656649e-23	27041812	27041812	2.33052057698186e-142	45489823	46391653
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46388078	47167144	118	116	0.4286	2.33052057698186e-142	45489823	46391653	1.92325920520848e-141	47162381	47938346
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47172534	77917893	10016	9771	-0.0065	1.92325920520848e-141	47162381	47938346	8.73328003790413e-43	77917893	77917893
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-1.8304	8.73328003790413e-43	77917893	77917893	1.36594625915538e-42	77928669	77928669
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	135285645	20214	19759	-9e-04	1.36594625915538e-42	77928669	77928669	NA	NA	NA
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	84939605	28265	27582	0.0014	NA	NA	NA	2.05636177312488e-35	84939605	84939605
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	84942392	84951675	6	6	-0.9631	2.05636177312488e-35	84939605	84939605	1.62680593452609e-36	84951675	84951675
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	84961098	134450318	17033	16623	-0.0064	1.62680593452609e-36	84951675	84951675	NA	NA	NA
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	2109441	920	900	-0.0066	NA	NA	NA	2.33754236390129e-23	2106791	2109441
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2115933	2127537	7	7	-0.7495	2.33754236390129e-23	2106791	2109441	6.11367340415427e-26	2127537	2128807
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2128807	11104085	3397	3317	0.001	6.11367340415427e-26	2127537	2128807	7.52578460648669e-08	11090914	11109483
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11104973	11140421	12	12	0.3241	7.52578460648669e-08	11090914	11109483	1.90974190487024e-08	11128557	11163596
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	31098259	6817	6665	-0.0079	1.90974190487024e-08	11128557	11163596	1.47493834847025e-10	31048362	31200356
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31132716	31289039	41	40	-0.2105	1.47493834847025e-10	31048362	31200356	3.9954851115376e-13	31268595	31305068
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31292507	130694393	33321	32542	-0.0012	3.9954851115376e-13	31268595	31305068	6.16342636389319e-13	130690343	130694393
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130718440	3	3	0.6813	6.16342636389319e-13	130690343	130694393	3.58519967802438e-08	130718440	130722733
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130722733	132289090	643	625	-0.0057	3.58519967802438e-08	130718440	130722733	NA	NA	NA
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	114123340	31644	30899	-0.0076	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	59	0.338	NA	NA	NA	9.67782401021656e-42	19484013	19538610
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	21695355	1071	1043	0.0048	9.67782401021656e-42	19484013	19538610	1.496391569484e-38	21681204	21710990
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21698018	22044438	177	171	0.2041	1.496391569484e-38	21681204	21710990	2.33012786474371e-50	22028350	22054604
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22046097	73061942	18111	17643	-0.0044	2.33012786474371e-50	22028350	22054604	3.24838119245847e-17	73060301	73061942
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73092112	8	7	-0.6135	3.24838119245847e-17	73060301	73061942	8.48788318325829e-17	73092112	73104540
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	73101327	1	0	NA	8.48788318325829e-17	73092112	73104540	NA	NA	NA
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73104540	79174722	2913	2833	0.007	NA	NA	NA	1.09318944835448e-11	79172702	79174722
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79176037	79183154	4	4	-0.6818	1.09318944835448e-11	79172702	79174722	4.1582373852979e-11	79183154	79185548
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	105607572	9300	9048	0.001	4.1582373852979e-11	79183154	79185548	1.34525420680341e-24	105606424	105609466
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105609466	105632168	9	9	0.6674	1.34525420680341e-24	105606424	105609466	1.11619440614331e-15	105630089	105681007
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105856591	49	47	0.0057	1.11619440614331e-15	105630089	105681007	2.78167479071818e-19	105856591	105872360
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856972	105856972	1	0	NA	2.78167479071818e-19	105856591	105872360	NA	NA	NA
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105872360	105881893	5	5	-0.9972	NA	NA	NA	4.49291370163302e-19	105881677	105897061
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	106355517	175	170	-0.0299	4.49291370163302e-19	105881677	105897061	NA	NA	NA
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106358491	106358491	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.2016	NA	NA	NA	2.47904864231596e-18	18452491	18452491
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	18837737	10	10	-0.4344	2.47904864231596e-18	18452491	18452491	1.46198940943642e-15	18837737	18842565
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18842565	18848213	4	4	-1.1762	1.46198940943642e-15	18837737	18842565	4.59020424251553e-13	18848213	18851513
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18851513	19537035	80	78	-0.3441	4.59020424251553e-13	18848213	18851513	2.24346384777196e-57	19424067	19805960
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	52517110	11901	11615	-0.0077	2.24346384777196e-57	19424067	19805960	1.77905676384173e-20	52517110	52517110
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	52519074	52533227	2	2	-1.272	1.77905676384173e-20	52517110	52517110	8.66766292999578e-21	52533227	52533227
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	52540479	64842071	5515	5357	0.001	8.66766292999578e-21	52533227	52533227	1.16107909585305e-13	64842071	64842071
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	64843939	64845460	2	2	-1.0389	1.16107909585305e-13	64842071	64842071	3.33144481427741e-13	64845460	64845460
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	64847835	74669752	4192	4077	0.0084	3.33144481427741e-13	64845460	64845460	4.85899269658151e-13	74665386	74669752
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	0.7447	4.85899269658151e-13	74665386	74669752	8.14571322160748e-14	74680439	74680439
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	99632987	9333	9100	-5e-04	8.14571322160748e-14	74680439	74680439	4.22328502100712e-17	99632987	99632987
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.1666	4.22328502100712e-17	99632987	99632987	5.78956649353054e-15	99635701	99635701
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	260	0.0121	5.78956649353054e-15	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	4043257	1609	1563	0.0062	NA	NA	NA	7.73555229131659e-07	4039463	4043257
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	4046107	4048558	2	2	0.8372	7.73555229131659e-07	4039463	4043257	2.51836545239733e-08	4048558	4048558
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	4050208	14876356	3857	3776	0.0056	2.51836545239733e-08	4048558	4048558	1.96828992324062e-13	14678535	14876356
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14956177	15029941	14	14	-0.3889	1.96828992324062e-13	14678535	14876356	7.75037884331325e-14	15029941	15039224
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15034210	32379126	5091	4965	0.0149	7.75037884331325e-14	15029941	15039224	8.27385853226641e-61	31854794	32513457
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	32481309	1	0	NA	8.2738585322664e-61	31854794	32513457	NA	NA	NA
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32513457	33647856	45	43	-0.4612	NA	NA	NA	3.01844268188912e-32	33559207	33842125
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33830585	34350707	95	94	-0.0222	3.01844268188912e-32	33559207	33842125	8.32250948957513e-06	34244935	34493798
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34357366	34646477	57	56	-0.2029	8.32250948957513e-06	34244935	34493798	1.93543843161723e-14	34617260	34838532
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34661255	54340649	2922	2840	0.0023	1.93543843161723e-14	34617260	34838532	2.82859596993178e-11	54333712	54362111
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54343465	54390060	14	13	-0.3731	2.82859596993178e-11	54333712	54362111	1.75194102411952e-06	54379834	54390060
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54399890	54408446	5	5	0.4938	1.75194102411952e-06	54379834	54390060	7.13214248972182e-07	54402057	54428808
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54410800	54410800	1	0	NA	7.13214248972182e-07	54402057	54428808	NA	NA	NA
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54424734	57230251	1208	1168	0.0062	NA	NA	NA	6.23603354175761e-34	57230251	57230251
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57232392	57233657	2	2	-1.6586	6.23603354175761e-34	57230251	57230251	2.61819224862507e-35	57233657	57233657
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57235636	68693086	3376	3299	0.0106	2.61819224862507e-35	57233657	57233657	2.20014938472421e-21	68693014	68693086
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68753209	10	10	-0.5743	2.20014938472421e-21	68693014	68693086	4.69344741592754e-22	68753209	68838384
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	72918129	1453	1412	0.0046	4.69344741592754e-22	68753209	68838384	8.98152435294141e-10	72915477	72941901
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72929786	72963578	6	6	-0.4988	8.9815243529414e-10	72915477	72941901	2.45336386644097e-10	72955519	73022578
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72964783	75093957	755	732	-7e-04	2.45336386644097e-10	72955519	73022578	1.91500352175891e-37	75093957	75093957
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.3165	1.91500352175891e-37	75093957	75093957	8.25189187032364e-33	75100865	75100865
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	597	9e-04	8.25189187032364e-33	75100865	75100865	2.12482528857929e-09	76919570	76929598
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	0.4381	2.12482528857929e-09	76919570	76929598	1.24718184812488e-08	76938723	76944661
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4408	0.0011	1.24718184812488e-08	76938723	76944661	NA	NA	NA
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	405	0.0157	NA	NA	NA	8.76847567995241e-23	1028979	1028979
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.4929	8.76847567995241e-23	1028979	1028979	9.52297945924558e-27	1030766	1030766
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	32828797	12002	11663	0.0099	9.52297945924558e-27	1030766	1030766	2.37442617498627e-145	32828797	32828797
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	-3.4066	2.37442617498627e-145	32828797	32828797	1.95320592118703e-147	32832642	32832642
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36673853	1448	1407	0.016	1.95320592118703e-147	32832642	32832642	4.46042014964763e-112	36673853	36673853
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	1.753	4.46042014964763e-112	36673853	36673853	3.9418879925641e-114	36684619	36684619
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	78653545	15757	15359	0.0105	3.9418879925641e-114	36684619	36684619	NA	NA	NA
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	40226609	11794	11535	-0.0079	NA	NA	NA	3.36658880539894e-17	40226609	40226609
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	40230827	40235901	3	3	-0.9296	3.36658880539894e-17	40226609	40226609	4.40133342565007e-16	40235901	40235901
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	40244566	76116026	11167	10889	-0.0076	4.40133342565007e-16	40235901	40235901	NA	NA	NA
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	790526	219	212	-1e-04	NA	NA	NA	2.07180914680734e-13	790526	790526
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	794973	794978	2	2	1.1585	2.07180914680734e-13	790526	790526	4.19991438808998e-13	794978	794978
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	798817	1398325	271	261	0.0229	4.19991438808998e-13	794978	794978	4.86105467135326e-11	1398325	1398325
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.0762	4.86105467135326e-11	1398325	1398325	3.32581393289919e-11	1400840	1400840
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	3353960	926	901	0.0091	3.32581393289919e-11	1400840	1400840	2.73038128004849e-09	3353960	3353960
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3355220	3356334	2	2	0.982	2.73038128004849e-09	3353960	3353960	1.04045801578742e-09	3356334	3356334
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3357750	21181849	7991	7782	0.0215	1.04045801578742e-09	3356334	3356334	8.04677286293993e-20	21181849	21181849
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	21184323	21191761	4	4	-0.9326	8.04677286293993e-20	21181849	21181849	1.31509012115102e-22	21191761	21191761
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	21195253	40352568	3192	3123	6e-04	1.31509012115102e-22	21191761	21191761	3.35228105090812e-07	40350432	40352568
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40354034	40356341	2	2	-0.7622	3.35228105090812e-07	40350432	40352568	7.02758881430482e-07	40356341	40359145
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40359145	58208527	7856	7676	0.0171	7.02758881430482e-07	40356341	40359145	4.96010480966946e-09	58203159	58212113
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58212113	58241773	14	13	-0.3296	4.96010480966946e-09	58203159	58212113	7.51472845191628e-09	58237461	58254174
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58244012	63788698	2578	2522	0.0131	7.51472845191628e-09	58237461	58254174	NA	NA	NA
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1499421	585	569	8e-04	NA	NA	NA	3.9335367657049e-10	1499034	1499421
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1506379	1516966	4	4	-0.6245	3.9335367657049e-10	1499034	1499421	0.00627246041359262	1516966	1521410
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1518825	1531162	6	5	-2.1756	0.00627246041359262	1516966	1521410	1.20703712041760e-149	1525300	1531162
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	20469	0.0025	1.2070371204176e-149	1525300	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13130	-0.0051	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	16521073	405	394	0.0071	NA	NA	NA	9.42823977437034e-11	16521073	16521073
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16523019	16524408	2	2	-0.8723	9.42823977437034e-11	16521073	16521073	6.62725209883735e-09	16524408	16525922
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16525922	35472378	9144	8899	0.0142	6.62725209883735e-09	16524408	16525922	9.42469786591349e-15	35472378	35472378
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	1.1384	9.42469786591349e-15	35472378	35472378	3.22602022886187e-13	35476942	35476942
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	35478503	1	0	NA	3.22602022886187e-13	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35479767	37685496	1210	1183	0.0184	NA	NA	NA	3.78815066049237e-50	37683516	37685496
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37689058	37715385	16	16	-0.7489	3.78815066049237e-50	37683516	37685496	1.01072605518565e-51	37715385	37718669
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37718669	49571068	5776	5628	0.0097	1.01072605518565e-51	37715385	37718669	NA	NA	NA
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	124528	29	27	-0.0416	NA	NA	NA	0.000192167697973516	122273	129104
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	5	-0.6659	0.000192167697973516	122273	129104	7.66926237700303e-11	129104	132689
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	1431411	755	730	0.0117	7.66926237700303e-11	129104	132689	1.07775654043339e-11	1427392	1431411
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-1.0815	1.07775654043339e-11	1427392	1431411	1.81990429655769e-12	1432953	1432953
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	1688321	212	207	4e-04	1.81990429655769e-12	1432953	1432953	4.47836831640149e-14	1686157	1691671
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1688730	1712236	21	21	0.3686	4.47836831640149e-14	1686157	1691671	1.90741688355749e-13	1708665	1720574
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1715594	2302065	376	369	0.0095	1.90741688355749e-13	1708665	1720574	1.05425011276627e-43	2302065	2302065
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	-1.4452	1.05425011276627e-43	2302065	2302065	2.08040003747548e-45	2304398	2304398
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2672401	362	356	0.0121	2.08040003747548e-45	2304398	2304398	4.10827870153713e-10	2668419	2687984
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672477	2708291	27	27	-0.2705	4.10827870153713e-10	2668419	2687984	3.57341982424532e-119	2708291	2711273
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	8452395	1791	1754	0.8766	3.57341982424532e-119	2708291	2711273	9.21383867434261e-16	8447855	8458058
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8456422	8466917	7	7	0.2722	9.21383867434261e-16	8447855	8458058	6.36274629492017e-12	8463131	8475091
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8473482	8473482	1	0	NA	6.36274629492017e-12	8463131	8475091	NA	NA	NA
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8475091	146087729	40295	39292	0.919	NA	NA	NA	1.44578309109539e-10	146086841	146087729
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	146095685	146095707	2	2	-0.2263	1.44578309109539e-10	146086841	146087729	4.9837480613488e-15	146095707	146098710
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	146098710	154028488	2902	2821	0.8893	4.9837480613488e-15	146095707	146098710	4.42790119104144e-13	154017980	154037006
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154031239	154078819	14	14	1.2871	4.42790119104144e-13	154017980	154037006	1.72406436603106e-08	154070953	154091384
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154582414	122	120	0.8938	1.72406436603106e-08	154070953	154091384	4.74933644409817e-315	154578922	154582414
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	194	-0.0054	4.74933644409817e-315	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	119	-3.5659	NA	NA	NA	5.9875722109656e-25	3034907	3223585
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	5593746	17	16	-0.8703	5.9875722109656e-25	3034907	3223585	3.40750926234578e-29	5593746	5593746
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6749115	16	16	-4.0078	3.40750926234578e-29	5593746	5593746	0.00278478768215231	6737995	6799508
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6756250	6908509	72	70	-2.7737	0.00278478768215231	6737995	6799508	0.0105431664764941	6857967	6930012
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6909375	6953343	30	28	-3.7091	0.0105431664764941	6857967	6930012	1.68021879374453e-06	6944497	6971636
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6954864	7485594	183	176	-2.2543	1.68021879374453e-06	6944497	6971636	2.53466835717287e-06	7368837	7619927
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7491280	7709619	68	66	-3.2822	2.53466835717287e-06	7368837	7619927	0.000182242262835173	7670119	7749796
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	8005148	88	83	-2.386	0.000182242262835173	7670119	7749796	6.72192473108724e-11	7985527	8036254
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8010446	8178487	37	36	-3.8209	6.72192473108724e-11	7985527	8036254	0.000118745320846061	8158234	8178487
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8179883	8195174	6	6	-2.3418	0.000118745320846061	8158234	8178487	5.17144815881367e-05	8195174	8204414
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8199414	8289709	21	19	-3.9708	5.17144815881367e-05	8195174	8204414	1.67257781470872e-14	8280065	8292347
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8292347	8324291	12	12	-1.5775	1.67257781470872e-14	8280065	8292347	4.15173301549007e-05	8308608	8341218
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8324328	8538835	46	46	-3.0652	4.15173301549007e-05	8308608	8341218	6.57736867739864e-05	8463583	8547778
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8539855	8696392	59	59	-2.2789	6.57736867739864e-05	8463583	8547778	1.48680915171114e-12	8692156	8722568
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8697715	10513747	187	180	-3.5013	1.48680915171114e-12	8692156	8722568	1.14341948141578e-23	10511255	10535786
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	11698871	19	19	-0.6192	1.14341948141578e-23	10511255	10535786	5.17250395619124e-05	10646662	12545716
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12960717	130	127	-1.9422	5.17250395619124e-05	10646662	12545716	0.00121249915941391	12696242	13001517
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12963078	13129843	72	68	-1.3566	0.00121249915941391	12696242	13001517	1.20074287979179e-09	13114969	13150942
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13254711	41	38	-2.7273	1.20074287979179e-09	13114969	13150942	0.0118842373515598	13153117	13327446
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13256555	13526852	125	120	-3.3744	0.0118842373515598	13153117	13327446	3.12199849012175e-05	13511347	13529620
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13527753	13539987	10	10	-4.7297	3.12199849012175e-05	13511347	13529620	7.23001767030638e-05	13537520	13551048
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13541025	13594931	25	25	-3.2724	7.23001767030638e-05	13537520	13551048	0.0314726601353126	13553112	13649497
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13596448	13705594	17	14	-2.3526	0.0314726601353126	13553112	13649497	6.2036618086707e-07	13691319	13718946
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716000	13716000	1	0	NA	6.2036618086707e-07	13691319	13718946	NA	NA	NA
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716331	13823928	27	25	-3.7622	NA	NA	NA	2.85313385188559e-10	13816133	13836933
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13828384	13863657	8	8	-1.7932	2.85313385188559e-10	13816133	13836933	1.48177038287083e-10	13863616	13868296
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13866668	14046104	87	86	-3.8503	1.48177038287083e-10	13863616	13868296	7.56863253601033e-06	14043659	14046104
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14047049	14063795	3	3	-1.422	7.56863253601033e-06	14043659	14046104	0.000152622589441157	14063795	14071430
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14064204	14122129	33	32	-3.9021	0.000152622589441157	14063795	14071430	0.150659672992661	14090255	14331599
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14342834	31	31	-3.2396	0.150659672992661	14090255	14331599	0.000292990493176496	14323815	14349668
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14376942	16	15	-1.8393	0.000292990493176496	14323815	14349668	3.71298764002454e-10	14375855	14379418
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14377844	14416385	22	20	-3.4787	3.71298764002454e-10	14375855	14379418	0.00146216264303363	14404284	14444446
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14418116	14508021	58	57	-2.5788	0.00146216264303363	14404284	14444446	1.05672014938176e-09	14502379	14530134
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	1.05672014938176e-09	14502379	14530134	NA	NA	NA
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14572190	24	22	-1.1045	NA	NA	NA	4.90057681458281e-19	14569287	14572190
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14579298	14598838	7	7	-4.2937	4.90057681458281e-19	14569287	14572190	2.27334323688423e-07	14598838	14605090
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14601309	14707011	23	23	-1.9113	2.27334323688423e-07	14598838	14605090	7.24608325064482e-13	14703568	14708015
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14708015	14883615	37	35	-3.7544	7.24608325064482e-13	14703568	14708015	3.22842222636118e-05	14841337	15014767
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14894476	15284717	128	122	-2.7078	3.22842222636118e-05	14841337	15014767	1.77905730453730e-06	15245772	15304956
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15286805	15433122	97	93	-3.5325	1.7790573045373e-06	15245772	15304956	3.37128143319532e-07	15429742	15433122
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15434486	15447091	6	6	-1.2938	3.37128143319532e-07	15429742	15433122	0.00122886692918654	15447091	15460238
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15448670	15920478	121	118	-3.1972	0.00122886692918654	15447091	15460238	6.40610592969897e-06	15898644	15920478
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15928904	15949457	7	7	-0.9531	6.40610592969897e-06	15898644	15920478	0.00201512433367784	15949457	15977755
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15951430	16377188	152	149	-2.6256	0.00201512433367784	15949457	15977755	0.0816761208001213	16221882	16377188
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16380639	16387273	2	2	-0.3518	0.0816761208001213	16221882	16377188	9.28940819859174e-05	16387273	16413874
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	17062567	100	97	-3.6627	9.28940819859174e-05	16387273	16413874	9.13216936239074e-05	16899198	17107617
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17067188	17221481	28	27	-2.6423	9.13216936239074e-05	16899198	17107617	2.37409334996721e-06	17170574	17257030
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17227434	17487972	46	45	-3.9299	2.37409334996721e-06	17170574	17257030	9.5944771125976e-11	17473674	17487972
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17492482	17557953	12	12	-1.7522	9.5944771125976e-11	17473674	17487972	1.95905351485504e-06	17544651	17598928
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17566412	17772524	36	35	-3.4542	1.95905351485504e-06	17544651	17598928	4.88575772999891e-08	17731870	17782139
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17775484	17815797	17	16	-1.8038	4.88575772999891e-08	17731870	17782139	1.06064916091983e-07	17805953	17817586
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17817586	17832657	11	11	-3.399	1.06064916091983e-07	17805953	17817586	0.000580895047765212	17829003	17853106
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17833945	17833945	1	0	NA	0.000580895047765212	17829003	17853106	NA	NA	NA
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17841801	17893954	12	12	-2.1423	NA	NA	NA	0.00976374706193566	17873030	18067360
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17901399	21036411	407	392	-3.3599	0.00976374706193566	17873030	18067360	1.18910826509667e-05	21026715	21041164
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21036503	21036503	1	0	NA	1.18910826509667e-05	21026715	21041164	NA	NA	NA
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054519	6	6	-0.938	NA	NA	NA	5.56696596779743e-09	21048365	21054605
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	21140200	34	33	-3.2486	5.56696596779743e-09	21048365	21054605	4.66452348920431e-06	21117823	21140200
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21140427	21152414	7	7	-4.9009	4.66452348920431e-06	21117823	21140200	4.94205022894755e-05	21150955	21155908
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21153807	21236497	21	21	-3.557	4.94205022894755e-05	21150955	21155908	0.0199682522757742	21171431	21324207
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21241894	21348482	36	35	-2.768	0.0199682522757742	21171431	21324207	0.000497272666023262	21324207	21357341
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21349725	21497583	42	38	-3.6376	0.000497272666023262	21324207	21357341	5.14040416447255e-10	21490998	21497583
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21523522	21559551	4	4	-0.9935	5.14040416447255e-10	21490998	21497583	0.00145064925825869	21559551	21651837
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21569358	21896293	59	57	-3.2193	0.00145064925825869	21559551	21651837	4.83627124076835e-05	21787852	21904161
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21898297	22014413	36	33	-4.2021	4.83627124076835e-05	21787852	21904161	1.39344525585252e-11	22013074	22026566
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22015735	22192409	36	35	-2.7296	1.39344525585252e-11	22013074	22026566	9.89341679986022e-05	22166564	22200078
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22200078	22216169	10	10	-4.1805	9.89341679986022e-05	22166564	22200078	6.18664732697989e-05	22208351	22232997
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22232997	22249988	9	9	-5.1898	6.18664732697989e-05	22208351	22232997	0.000225351333020685	22244581	22249988
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22252446	22268552	5	5	-4.3416	0.000225351333020685	22244581	22249988	0.0145224263868369	22263267	22916746
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22308420	22924754	62	57	-3.3549	0.0145224263868369	22263267	22916746	4.70479376713722e-31	22921089	25737663
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22926726	27019256	52	48	-1.1188	4.70479376713722e-31	22921089	25737663	2.03591024786393e-07	27007874	27019256
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27039222	4	4	-4.0211	2.03591024786393e-07	27007874	27019256	1.37677254568176e-10	27039222	27063070
MSK_252152917394_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	30	-0.787	1.37677254568176e-10	27039222	27063070	NA	NA	NA
