Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	16458124	5679	5465	3e-04	NA	NA	NA	2.84184482566617e-09	16435308	16481149
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16460528	16550347	44	44	-0.1426	2.84184482566617e-09	16435308	16481149	3.17611892261793e-06	16531205	16569904
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16552239	16704522	58	55	0.0207	3.17611892261793e-06	16531205	16569904	4.70411015911732e-15	16668773	16713074
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16713074	16923767	11	10	-0.4135	4.70411015911732e-15	16668773	16713074	3.63214011370446e-18	16921319	16926444
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16926444	34869589	7102	6827	0.0012	3.63214011370446e-18	16921319	16926444	1.97494896881637e-16	34869589	34869589
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34876833	34881595	3	3	-0.7198	1.97494896881637e-16	34869589	34869589	1.37076254262000e-17	34881595	34881595
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34883375	72537426	14997	14388	-8e-04	1.37076254262e-17	34881595	34881595	0	72537426	72537426
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	10	-2.6345	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	103904723	10105	9741	0.0045	0	72579311	72579311	1.41506354074737e-51	103904723	103906464
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103906464	103932025	13	13	0.5812	1.41506354074737e-51	103904723	103906464	2.30737783776409e-51	103929627	103932025
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103956767	107454010	548	522	-0.0178	2.30737783776409e-51	103929627	103932025	1.43729112985818e-18	107454010	107454010
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	107459424	107463434	2	2	-0.927	1.43729112985818e-18	107454010	107454010	5.56605655337032e-20	107463434	107463434
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	107466749	109373255	738	713	0.0014	5.56605655337032e-20	107463434	107463434	1.20905126387305e-15	109373255	109373255
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109374790	109376249	2	2	-0.8212	1.20905126387305e-15	109373255	109373255	3.15763366806193e-18	109376249	109376249
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109379566	110023268	295	284	0.0096	3.15763366806193e-18	109376249	109376249	4.99987789622426e-13	110023268	110023268
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110041712	4	4	-0.494	4.99987789622426e-13	110023268	110023268	6.3538037654389e-11	110041712	110058441
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	150816180	5847	5599	0.0068	6.3538037654389e-11	110041712	110058441	5.73974600551616e-12	150805561	150816180
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150818222	150839754	6	6	-0.2656	5.73974600551616e-12	150805561	150816180	5.09419883558117e-123	150839754	150839754
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150846148	4	4	-2.8014	5.09419883558117e-123	150839754	150839754	7.64481155703335e-22	150846148	150846148
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150847304	150847304	1	0	NA	7.64481155703335e-22	150846148	150846148	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150848509	150851439	2	2	-1.1123	NA	NA	NA	7.69224022599257e-28	150851439	150851439
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	173060997	9056	8700	7e-04	7.69224022599257e-28	150851439	150851439	8.45074149889153e-19	173060997	173060997
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	173063537	173067337	3	2	-0.9192	8.45074149889153e-19	173060997	173060997	1.18410466188189e-19	173067337	173067337
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	173068576	200602881	9169	8807	0.0049	1.18410466188189e-19	173067337	173067337	2.93835694448990e-34	200600795	200613454
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200609726	200667381	22	22	-0.3613	2.9383569444899e-34	200600795	200613454	3.66925673475183e-33	200659076	200668993
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200668993	228259793	10013	9591	0.0036	3.66925673475183e-33	200659076	200668993	2.80765636013485e-19	228259793	228261810
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	228261810	228268844	3	3	0.7617	2.80765636013485e-19	228259793	228261810	5.01592460780345e-21	228265976	228268844
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	228271750	246769018	7282	6996	-0.0126	5.01592460780345e-21	228265976	228268844	1.51949433134754e-25	246753652	246812425
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246794552	246862029	27	26	0.2769	1.51949433134754e-25	246753652	246812425	7.78477167771174e-13	246853406	246875016
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246863179	247186514	98	93	0.0301	7.78477167771174e-13	246853406	246875016	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	8045619	2397	2305	0.0089	NA	NA	NA	2.53794535247018e-20	8045619	8045619
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	8048423	8053654	3	3	-0.7527	2.53794535247018e-20	8045619	8045619	3.61443619670613e-20	8053654	8053654
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	8058417	33617141	8732	8384	7e-04	3.61443619670613e-20	8053654	8053654	2.66857828990741e-14	33617141	33617141
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33619260	33621111	2	2	-0.7817	2.66857828990741e-14	33617141	33617141	3.44782911246076e-15	33621111	33621111
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33622478	34543992	388	375	-0.0142	3.44782911246076e-15	33621111	33621111	1.22323341359818e-27	34539740	34552935
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34591681	19	19	-0.3561	1.22323341359818e-27	34539740	34552935	8.4055819693618e-28	34583814	34597294
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34595734	37810001	1368	1321	-0.0023	8.4055819693618e-28	34583814	34597294	5.16022845957613e-15	37797909	37815049
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37812045	37855837	22	21	0.2474	5.16022845957613e-15	37797909	37815049	4.12017809346476e-15	37848754	37862351
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	66357387	10363	9923	-0.0033	4.12017809346476e-15	37848754	37862351	6.63287117340433e-15	66357387	66357387
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	0.8029	6.63287117340433e-15	66357387	66357387	3.43244164987552e-14	66360747	66360747
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	132753228	17065	16448	0.0028	3.43244164987552e-14	66360747	66360747	3.64333969013501e-15	132753228	132753228
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	132754617	132755508	2	2	0.8285	3.64333969013501e-15	132753228	132753228	2.01996657014537e-16	132755508	132755508
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	132763461	142039625	3226	3099	-0.0075	2.01996657014537e-16	132755508	132755508	6.56582260227983e-22	142039625	142039625
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	142041792	142043930	2	2	-0.9687	6.56582260227983e-22	142039625	142039625	2.85981893479167e-25	142043930	142043930
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	142051022	146571330	1483	1441	0.028	2.85981893479167e-25	142043930	142043930	5.25875209065741e-48	146571330	146571330
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	0.9958	5.25875209065741e-48	146571330	146571330	3.02229649551897e-47	146592775	146592775
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	236651944	30517	29295	0.0028	3.02229649551897e-47	146592775	146592775	3.20495504704536e-07	236641308	236667034
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	236653182	236682298	15	15	-0.2093	3.20495504704536e-07	236641308	236667034	8.42924561506585e-08	236667034	236690995
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	236684010	242689978	2217	2131	0.02	8.42924561506585e-08	236667034	236690995	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	194354505	63646	61166	0.0028	NA	NA	NA	0	194354505	194354505
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-3.7163	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	194368145	1	0	NA	0	194366950	194366950	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194371608	196822133	995	954	-0.0024	NA	NA	NA	7.11275761826125e-13	196807153	196907040
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196929826	21	21	-0.2395	7.11275761826125e-13	196807153	196907040	1.02325844364702e-08	196924340	196952514
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196940125	199329592	963	923	-0.0219	1.02325844364702e-08	196924340	196952514	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	146102	37	37	-0.0046	NA	NA	NA	1.40570878471909e-09	146102	156454
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	147296	164413	8	8	-0.315	1.40570878471909e-09	146102	156454	8.9571018816382e-09	160345	175366
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	174414	9815760	3348	3219	0.0121	8.9571018816382e-09	160345	175366	4.12757918539702e-14	9815760	9815760
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9821327	1	0	NA	4.12757918539702e-14	9815760	9815760	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9827233	9832823	2	2	0.8307	NA	NA	NA	1.79580181747727e-16	9832823	9832823
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9842644	9842644	1	0	NA	1.79580181747727e-16	9832823	9832823	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	34445002	6167	5941	-0.0032	NA	NA	NA	1.11124050350978e-12	34439897	34445002
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34457648	1	0	NA	1.11124050350978e-12	34439897	34445002	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34463523	34491115	5	4	0.5172	NA	NA	NA	2.56322162531566e-12	34491115	34506297
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	68905670	8863	8532	-0.0075	2.56322162531566e-12	34491115	34506297	1.06552634917993e-48	68905670	68905670
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	0.5387	1.06552634917993e-48	68905670	68905670	1.2381018488923e-48	69165814	69643272
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	107275274	12705	12228	6e-04	1.2381018488923e-48	69165814	69643272	2.41129878612532e-12	107274138	107275274
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107276428	107281410	4	4	-0.5181	2.41129878612532e-12	107274138	107275274	1.20256587605326e-11	107281410	107283257
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107283257	108281452	262	254	0.0205	1.20256587605326e-11	107281410	107283257	2.02348650563903e-24	108281452	108281452
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	108283417	108290095	3	3	-0.872	2.02348650563903e-24	108281452	108281452	8.8767789333013e-28	108290095	108290095
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	108296216	119334954	3324	3187	0.0045	8.8767789333013e-28	108290095	108290095	6.25544850194349e-28	119334954	119334954
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119345371	119348829	3	3	-0.8749	6.25544850194349e-28	119334954	119334954	1.25276199864843e-27	119348829	119348829
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119350354	173660684	15087	14503	7e-04	1.25276199864843e-27	119348829	119348829	1.91612662420231e-215	173660684	173660684
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	2.9574	1.91612662420231e-215	173660684	173660684	5.83581368796558e-215	173666072	173666072
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	187330240	4081	3942	-0.0056	5.83581368796558e-215	173666072	173666072	3.6298195776192e-24	187330240	187330240
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	0.9997	3.6298195776192e-24	187330240	187330240	3.63843973599758e-25	187333619	187333619
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1187	-0.0322	3.63843973599758e-25	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	737829	222	220	0.024	NA	NA	NA	3.51190952457562e-15	730853	737829
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	776194	829954	6	6	-0.5062	3.51190952457562e-15	730853	737829	2.55457403211951e-18	829954	870657
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	8750027	2375	2288	0.017	2.55457403211951e-18	829954	870657	7.52428177312927e-60	8750027	8750027
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	8758735	8800001	6	6	-0.9183	7.52428177312927e-60	8750027	8750027	1.95900774812319e-61	8800001	8800001
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	8809384	8809384	1	0	NA	1.95900774812319e-61	8800001	8800001	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	8819532	68885350	16440	15786	-0.0036	NA	NA	NA	6.25184459843003e-14	68885350	68885350
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	70343857	70345552	2	2	0.7677	6.25184459843003e-14	68885350	68885350	8.53921370812795e-15	70345552	70345552
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	70405656	77721879	2455	2361	0.0026	8.53921370812795e-15	70345552	70345552	2.71882662193904e-12	77721879	77721879
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	77724204	77725392	2	2	0.7023	2.71882662193904e-12	77721879	77721879	7.38376880629903e-13	77725392	77725392
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	77727599	78477617	327	313	6e-04	7.38376880629903e-13	77725392	77725392	3.18071885685384e-11	78460789	78483453
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	78478756	78528240	23	23	-0.1973	3.18071885685384e-11	78460789	78483453	1.67625555311640e-10	78522947	78545391
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	78531091	140201609	18220	17546	0.0046	1.6762555531164e-10	78522947	78545391	8.0655633170985e-10	140196482	140201609
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140203440	140219465	9	9	0.3175	8.0655633170985e-10	140196482	140201609	2.89409441442673e-11	140219465	140226256
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140221835	140533456	136	134	-0.0088	2.89409441442673e-11	140219465	140226256	5.85194205638868e-18	140533456	140533456
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140535820	140538666	2	2	-0.8864	5.85194205638868e-18	140533456	140533456	4.44088363591318e-18	140538666	140538666
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140541178	155416484	5259	5085	0.0033	4.44088363591318e-18	140538666	140538666	2.74153045041546e-09	155411053	155418745
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155418745	155421443	3	3	0.5321	2.74153045041546e-09	155411053	155418745	6.99657223847579e-10	155420791	155427589
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155427589	160413780	1759	1677	-0.006	6.99657223847579e-10	155420791	155427589	7.5215165489879e-08	160406344	160413780
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	160425418	160430861	2	2	-0.5958	7.5215165489879e-08	160406344	160413780	6.59278095154075e-08	160430861	160438997
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	160438997	177319638	5201	5021	-0.0024	6.59278095154075e-08	160430861	160438997	3.69220352999017e-49	177319638	177319638
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	177322431	177333426	5	5	-0.9092	3.69220352999017e-49	177319638	177319638	1.85127324063703e-42	177333426	177333426
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	177340297	180346557	1193	1146	-0.0025	1.85127324063703e-42	177333426	177333426	8.17458330670444e-29	180346557	180346557
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180348365	180358977	6	6	0.6818	8.17458330670444e-29	180346557	180346557	4.12363482154356e-25	180358977	180362342
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	103	0.028	4.12363482154356e-25	180358977	180362342	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	241674	57	54	0.022	NA	NA	NA	8.03995087803118e-43	240119	244363
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	244363	327962	45	42	-0.3283	8.03995087803118e-43	240119	244363	3.05348317129532e-52	326323	331014
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	329100	29950805	10485	10058	-5e-04	3.05348317129532e-52	326323	331014	2.26854136177843e-26	29941766	29973024
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30010234	15	15	0.3923	2.26854136177843e-26	29941766	29973024	5.10790409776733e-21	29998009	30025480
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30021908	31382291	578	549	0.0055	5.10790409776733e-21	29998009	30025480	3.43761379726549e-15	31382291	31382291
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31383925	31385778	2	2	-0.8634	3.43761379726549e-15	31382291	31382291	9.15697375941348e-09	31385778	31385778
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31418006	6	6	0.3886	9.15697375941348e-09	31385778	31385778	2.41277334484913e-08	31389372	31425113
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	32558677	489	476	-0.0015	2.41277334484913e-08	31389372	31425113	4.88494681619675e-126	32558677	32564884
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32600962	9	8	-1.4708	4.88494681619675e-126	32558677	32564884	2.86724810476623e-11	32595402	32605300
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	32713363	36	36	-0.1275	2.86724810476623e-11	32595402	32605300	7.13043587990691e-13	32711957	32716255
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	7	-1.4938	7.13043587990691e-13	32711957	32716255	8.6476142766873e-23	32723722	32728487
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	32807261	32	31	-0.1681	8.6476142766873e-23	32723722	32728487	1.28844438764613e-09	32762061	32821094
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32808637	69574853	11466	11020	5e-04	1.28844438764613e-09	32762061	32821094	2.76147015324757e-06	69573711	69574853
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	69576211	69577630	2	2	0.5449	2.76147015324757e-06	69573711	69574853	3.44841263689076e-07	69577630	69577630
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	69580071	74647491	2050	1968	-0.002	3.44841263689076e-07	69577630	69577630	1.72389017240385e-08	74644381	74647491
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74650995	74653360	2	2	0.6013	1.72389017240385e-08	74644381	74647491	9.67841071378943e-08	74653360	74655219
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74655219	78043111	925	893	-0.0132	9.67841071378943e-08	74653360	74655219	2.30961514439800e-30	78043111	78043111
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	78055819	78079556	4	4	-0.8604	2.309615144398e-30	78043111	78043111	1.99928074671182e-35	78079556	78079556
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	78086691	160307659	26225	25199	0.0011	1.99928074671182e-35	78079556	78079556	5.3804416898498e-14	160307659	160307659
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	160309644	160310881	2	2	0.7818	5.3804416898498e-14	160307659	160307659	1.63897276112025e-14	160310881	160310881
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	160312452	165643653	1871	1797	-0.0016	1.63897276112025e-14	160310881	160310881	1.62195075142848e-285	165643653	165643653
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165649379	3	3	-2.7855	1.62195075142848e-285	165643653	165643653	8.25911549089461e-254	165649379	165649379
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165650610	170753106	1805	1743	0.0164	8.25911549089461e-254	165649379	165649379	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	16135701	5388	5190	0.003	NA	NA	NA	1.25142517784671e-10	16135701	16135701
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	0.7026	1.25142517784671e-10	16135701	16135701	7.03436908100974e-12	16140018	16140018
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	18244187	749	705	-0.0017	7.03436908100974e-12	16140018	16140018	5.07413364112458e-28	18244187	18244187
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	18248366	18251736	2	2	-1.0721	5.07413364112458e-28	18244187	18244187	1.48738915089539e-26	18251736	18251736
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	18260638	38258332	7459	7183	0.0053	1.48738915089539e-26	18251736	18251736	5.437603329202e-127	38258332	38262701
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38262701	38305379	23	23	-0.684	5.437603329202e-127	38258332	38262701	4.80497789802548e-06	38297984	38312900
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38307956	38340009	17	16	-0.3897	4.80497789802548e-06	38297984	38312900	6.7955990571902e-28	38335964	38341239
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38341239	43590850	1847	1776	-0.0174	6.7955990571902e-28	38335964	38341239	4.67781117454391e-15	43590850	43590850
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	43592620	43597673	3	3	-0.6586	4.67781117454391e-15	43590850	43590850	8.6862573417366e-19	43597673	43597673
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	43601254	118611324	23775	22898	-0.0084	8.6862573417366e-19	43597673	43597673	2.7375135387049e-65	118611324	118611324
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	1.3793	2.7375135387049e-65	118611324	118611324	6.94782315820226e-66	118620875	118620875
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	133433384	6827	6549	0.002	6.94782315820226e-66	118620875	118620875	0	133433384	133436265
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	7	-2.8039	0	133433384	133436265	0	133447868	133448277
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141410894	3700	3544	-0.0057	0	133447868	133448277	1.56405998857063e-33	141409512	141413352
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	14	0.4433	1.56405998857063e-33	141409512	141413352	9.91223328385576e-39	141438504	141442231
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141690753	116	115	-9e-04	9.91223328385576e-39	141438504	141442231	3.99301082156684e-165	141690753	141698634
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	-2.6307	3.99301082156684e-165	141690753	141698634	4.96087547021273e-119	141712786	141714168
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	141951459	93	91	-0.0553	4.96087547021273e-119	141712786	141714168	6.60381770782323e-09	141926131	141978682
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141953817	142161005	77	74	-0.2133	6.60381770782323e-09	141926131	141978682	1.5180433576075e-103	142161005	142161005
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142166710	142166710	1	0	NA	1.5180433576075e-103	142161005	142161005	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142167901	142167908	2	2	-2.7714	NA	NA	NA	6.45272314168893e-35	142167908	142167908
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142176074	142202274	9	9	-0.411	6.45272314168893e-35	142167908	142167908	2.510205858136e-18	142192030	142205830
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142205830	144399712	794	762	0.0081	2.510205858136e-18	142192030	142205830	8.9625578821509e-14	144399712	144399712
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144403133	144404463	2	2	-0.7538	8.9625578821509e-14	144399712	144399712	1.79040171960407e-06	144404463	144415019
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144411778	144411778	1	0	NA	1.79040171960407e-06	144404463	144415019	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144415019	144546976	62	61	-0.0315	NA	NA	NA	1.03143578103319e-293	144546976	144546976
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144548093	144551256	2	2	-4.8214	1.03143578103319e-293	144546976	144546976	0	144551256	144551256
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144554448	156483966	4652	4472	-0.0013	0	144551256	144551256	3.27864110545339e-19	156483966	156483966
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156485711	156490484	3	2	0.9521	3.27864110545339e-19	156483966	156483966	1.68742041537427e-17	156490484	156490484
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156492262	158821263	1054	1016	0.0201	1.68742041537427e-17	156490484	156490484	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	2234351	737	720	0.0371	NA	NA	NA	2.58323607421215e-21	2234351	2234351
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2242849	2245838	3	3	-0.8127	2.58323607421215e-21	2234351	2234351	1.18598338314502e-21	2245838	2245838
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2251011	2251011	1	0	NA	1.18598338314502e-21	2245838	2245838	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2257255	25022606	7388	7122	-0.0052	NA	NA	NA	6.13200460413138e-48	25022606	25022606
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	1.1863	6.13200460413138e-48	25022606	25022606	5.9786224305623e-52	25039370	25039370
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	39350798	4942	4735	-0.0177	5.9786224305623e-52	25039370	25039370	0	39350798	39354149
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	59	-3.1689	0	39350798	39354149	0	39504332	39505256
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	115701209	21738	20939	-0.0056	0	39504332	39505256	2.36609798460276e-15	115701209	115701209
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115705898	115711730	2	2	-0.8302	2.36609798460276e-15	115701209	115701209	5.36341563275435e-15	115711730	115711730
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115718942	115718942	1	0	NA	5.36341563275435e-15	115711730	115711730	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115725316	146264846	9692	9303	0.0068	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5262	-0.0031	NA	NA	NA	6.34998415157967e-124	15802255	15802255
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	-2.2725	6.34998415157967e-124	15802255	15802255	8.81965454549942e-132	15807123	15807123
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	23343915	2540	2437	0.0022	8.81965454549942e-132	15807123	15807123	0	23343915	23343915
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	-3.3113	0	23343915	23343915	0	23365926	23365926
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	39062211	4724	4543	-0.0011	0	23365926	23365926	5.24559106864986e-21	38758232	39091349
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	39088753	67903104	16	15	-0.3512	5.24559106864986e-21	38758232	39091349	0.00071482719180288	43445839	67913672
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	67907649	70217543	17	17	-0.1203	0.00071482719180288	43445839	67913672	0.000513464189956362	67942846	70250494
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70221479	70851104	285	271	0.0238	0.000513464189956362	67942846	70250494	0.00147125135840420	70803415	70876981
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70854281	70926188	27	26	-0.088	0.0014712513584042	70803415	70876981	1.22287975722647e-09	70926188	70926188
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-1.3426	1.22287975722647e-09	70926188	70926188	1.52337712278859e-29	70930528	70930528
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	71339702	178	172	-0.0017	1.52337712278859e-29	70930528	70930528	2.31018531921887e-11	71338320	71339702
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	71340879	71342650	3	3	-0.57	2.31018531921887e-11	71338320	71339702	3.55710878436746e-11	71342650	71346634
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	71346634	77192566	2156	2058	-0.0044	3.55710878436746e-11	71342650	71346634	3.27373712298082e-14	77192566	77192566
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	77194207	77200826	3	3	-0.6391	3.27373712298082e-14	77192566	77192566	1.19001336214273e-15	77200826	77200826
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	77202889	78337337	401	386	0.009	1.19001336214273e-15	77200826	77200826	4.72955217418872e-20	78337337	78337337
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	78340563	78348389	5	5	-0.5635	4.72955217418872e-20	78337337	78337337	1.34904272141661e-17	78348389	78355634
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	78353163	78353163	1	0	NA	1.34904272141661e-17	78348389	78355634	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	78355634	116124007	12721	12260	-0.0067	NA	NA	NA	1.05183280191803e-29	116124007	116124007
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	1.1269	1.05183280191803e-29	116124007	116124007	8.04283572809821e-28	116130333	116130333
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	137352394	8295	7989	-1e-04	8.0428357280982e-28	116130333	116130333	1.27886621303786e-24	137352394	137352394
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.0619	1.27886621303786e-24	137352394	137352394	2.25763246628764e-21	137356880	137356880
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1054	9e-04	2.25763246628764e-21	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9343	-0.0108	NA	NA	NA	3.25997008922806e-206	27038538	27038538
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-3.0035	3.25997008922806e-206	27038538	27038538	1.31011931883707e-209	27041812	27041812
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	31284926	1561	1508	-0.0211	1.31011931883707e-209	27041812	27041812	0	31284926	31284926
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31287101	31291525	3	3	-3.4721	0	31284926	31284926	0	31291525	31291525
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31293140	53683740	5007	4807	-0.0047	0	31291525	31291525	2.93970709295969e-13	53683740	53683740
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53686515	53687880	2	2	0.7077	2.93970709295969e-13	53683740	53683740	3.42128279621346e-11	53687880	53687880
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53689554	76977706	7836	7551	-0.0085	3.42128279621346e-11	53687880	53687880	1.44678113539202e-07	76976973	76977706
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	76978679	76980809	2	2	-0.6051	1.44678113539202e-07	76976973	76977706	5.00470300993253e-07	76980809	76980984
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	76980984	77917893	450	431	-0.0042	5.00470300993253e-07	76980809	76980984	5.74665641582077e-50	77917893	77917893
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-1.6793	5.74665641582077e-50	77917893	77917893	2.88010573456592e-65	77928669	77928669
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	96596646	6007	5790	-0.0037	2.88010573456592e-65	77928669	77928669	1.05149442461749e-09	96594765	96600362
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	96600362	96604625	3	3	-0.5223	1.05149442461749e-09	96594765	96600362	9.20732200195993e-11	96602704	96615700
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	96615700	114100979	6383	6130	-0.0021	9.20732200195993e-11	96602704	96615700	1.20429614799130e-48	114100979	114100979
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114103547	114106460	2	2	-1.4712	1.2042961479913e-48	114100979	114100979	9.99555700528514e-51	114106460	114106460
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114108041	127563278	5101	4901	0.0064	9.99555700528514e-51	114106460	114106460	1.47297504213102e-12	127556450	127563278
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127566573	127598425	14	14	-0.2768	1.47297504213102e-12	127556450	127563278	4.58206828070281e-13	127598425	127608087
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127599309	135124875	2659	2579	0.0157	4.58206828070281e-13	127598425	127608087	4.35944023918949e-65	135122727	135126486
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	135126486	135227463	35	32	0.4424	4.35944023918949e-65	135122727	135126486	8.9165936319685e-16	135222424	135229796
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	135229796	135285645	10	10	0.0232	8.9165936319685e-16	135222424	135229796	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4195010	1524	1461	2e-04	NA	NA	NA	4.0941481024908e-06	4185612	4195010
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4229388	4343816	3	3	0.4593	4.0941481024908e-06	4185612	4195010	1.13248299843172e-08	4343816	4346208
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4346208	4923300	245	238	0.0081	1.13248299843172e-08	4343816	4346208	8.66911903872912e-24	4923300	4923300
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-0.5632	8.66911903872912e-24	4923300	4923300	1.23377137558303e-15	4932214	4934594
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	5741031	361	342	0.0038	1.23377137558303e-15	4932214	4934594	3.90400846153314e-53	5741031	5742476
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	15	-0.6139	3.90400846153314e-53	5741031	5742476	3.60508405344209e-66	5763749	5765438
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	49503480	14520	13942	0.0046	3.60508405344209e-66	5763749	5765438	3.75735372113607e-21	49483974	49520018
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49514526	49565834	17	16	0.3474	3.75735372113607e-21	49483974	49520018	1.84677879918501e-13	49555339	49570570
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49567120	49671267	29	29	0.0026	1.84677879918501e-13	49555339	49570570	2.37552011316356e-19	49671267	49671267
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49683052	49710027	8	8	-0.4649	2.37552011316356e-19	49671267	49671267	4.19246508437405e-19	49710027	49721954
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49721954	55142203	188	182	-0.0293	4.19246508437405e-19	49710027	49721954	3.30968718819887e-20	55136234	55162949
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55158078	55207305	28	28	0.2255	3.30968718819887e-20	55136234	55162949	2.54445132391162e-16	55200744	55221692
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55209626	58383355	1247	1203	-0.0051	2.54445132391162e-16	55200744	55221692	3.24077873859308e-13	58383355	58383355
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	58389208	58390670	2	2	-0.7752	3.24077873859308e-13	58383355	58383355	7.13452379671122e-13	58390670	58390670
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	58404501	62365921	1612	1547	0.0035	7.13452379671122e-13	58390670	58390670	1.54566976052351e-23	62365921	62365921
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	62367085	62367085	1	0	NA	1.54566976052351e-23	62365921	62365921	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	62368348	62372091	3	3	0.8566	NA	NA	NA	1.85156302360757e-25	62372091	62372091
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	62373800	92573809	10675	10270	-3e-04	1.85156302360757e-25	62372091	62372091	7.04772412970431e-11	92572545	92573809
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	92576164	92580540	3	3	-0.5711	7.04772412970431e-11	92572545	92573809	4.63895012395824e-11	92580540	92590466
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	92585777	92585777	1	0	NA	4.63895012395824e-11	92580540	92590466	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	92590466	124574550	11161	10731	0.0044	NA	NA	NA	0.000729023791620911	124564628	124574550
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	124576827	124578058	2	2	0.3898	0.000729023791620911	124564628	124574550	1.86858116000406e-16	124578058	124578058
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	124579236	124579236	1	0	NA	1.86858116000406e-16	124578058	124578058	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	124580889	124588223	5	4	-0.7371	NA	NA	NA	7.95815393757644e-27	124588223	124588223
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	124591102	134450318	3648	3496	0.01	7.95815393757644e-27	124588223	124588223	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	736988	296	287	-0.007	NA	NA	NA	2.68907876038618e-06	731485	736988
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	738240	743223	4	4	0.3854	2.68907876038618e-06	731485	736988	2.28252594983749e-06	743223	747365
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	745410	9523923	3442	3314	0.0104	2.28252594983749e-06	743223	747365	1.00389505940339e-50	9523923	9531133
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9610054	16	15	0.5425	1.00389505940339e-50	9523923	9531133	1.23499793773509e-38	9604633	9626623
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	11395862	648	616	0.0188	1.23499793773509e-38	9604633	9626623	0	11395862	11395862
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11435643	6	5	-3.2873	0	11395862	11395862	0	11435643	11435643
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	33270966	7524	7241	-0.0014	0	11435643	11435643	1.0652546618101e-22	33270966	33270966
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33278235	33283825	2	2	-0.7063	1.0652546618101e-22	33270966	33270966	4.78885951700235e-12	33283825	33283825
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33290235	46865911	3511	3380	1e-04	4.78885951700235e-12	33283825	33283825	3.08858566770589e-07	46858603	46870098
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46868794	46880294	8	8	0.278	3.08858566770589e-07	46858603	46870098	1.32728866490668e-06	46873122	46885219
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46883811	46992235	26	26	0.0092	1.32728866490668e-06	46873122	46885219	1.50231812205488e-11	46992235	46992235
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46995053	46996769	2	2	0.6211	1.50231812205488e-11	46992235	46992235	8.27916381459058e-09	46996769	46996769
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46998876	130936199	29123	28028	-0.0043	8.27916381459058e-09	46996769	46996769	8.72846876059129e-117	130936199	130936199
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130943064	130943064	1	0	NA	8.72846876059129e-117	130936199	130936199	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	2.2343	NA	NA	NA	3.14010250202254e-85	130946248	130946248
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	527	0.0054	3.14010250202254e-85	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	49964838	12219	11809	-1e-04	NA	NA	NA	5.71502671675042e-47	49964838	49964838
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-1.4183	5.71502671675042e-47	49964838	49964838	1.62954515236049e-48	49971732	49971732
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	51383746	634	607	0.0261	1.62954515236049e-48	49971732	49971732	3.33503747175338e-05	51376622	51383746
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	51385452	51392430	4	4	0.3717	3.33503747175338e-05	51376622	51383746	3.11932298032328e-06	51392430	51399688
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	51393973	51397382	3	0	NA	3.11932298032328e-06	51392430	51399688	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	51398548	56650373	1163	1124	0.0023	NA	NA	NA	1.84631746690023e-49	56650373	56650373
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56685341	15	14	0.544	1.84631746690023e-49	56650373	56650373	3.83464740989295e-47	56685341	56686863
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	114123340	17604	16952	0.0054	3.83464740989295e-47	56685341	56686863	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18544772	6	5	-0.1258	NA	NA	NA	1.55461480141566e-05	18544772	19271102
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	19494416	54	52	-0.4933	1.55461480141566e-05	18544772	19271102	5.16218217301543e-133	19492531	19497023
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	21408994	935	897	-0.0103	5.16218217301543e-133	19492531	19497023	2.45591251928117e-24	21397581	21418192
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21412148	21548222	66	62	-0.2005	2.45591251928117e-24	21397581	21418192	5.08587377626655e-21	21542605	21555572
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21549262	21766804	110	107	-0.4678	5.08587377626655e-21	21542605	21555572	5.60404061796719e-14	21749736	21799456
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21768749	22019726	125	119	-0.6674	5.60404061796719e-14	21749736	21799456	0.00390351871469969	21993784	22022060
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22022060	22038206	8	8	-0.4124	0.00390351871469969	21993784	22022060	1.01247801701492e-19	22035729	22040315
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22040315	40676611	6344	6077	-0.0071	1.01247801701492e-19	22035729	22040315	8.90106976950644e-14	40663660	40676611
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40726930	8	8	0.3822	8.90106976950644e-14	40663660	40676611	2.15272800584415e-13	40726930	40741934
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40741934	69086125	9972	9573	0.0011	2.15272800584415e-13	40726930	40741934	1.31456357985607e-16	69086125	69086125
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69092211	3	3	0.6906	1.31456357985607e-16	69086125	69086125	1.06039988296308e-16	69092211	69092211
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69093444	73061942	1788	1716	0.0062	1.06039988296308e-16	69092211	69092211	8.33904944293594e-27	73061942	73061942
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73082262	4	3	-0.8588	8.33904944293594e-27	73061942	73061942	4.22512683028089e-25	73082262	73082262
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73083141	105597555	12219	11751	0.0038	4.22512683028089e-25	73082262	73082262	0	105597555	105597555
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	-1.981	0	105597555	105597555	1.72266024165192e-116	105632168	105632168
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105856591	49	47	-0.0022	1.72266024165192e-116	105632168	105632168	8.17535825600445e-17	105850033	105856972
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856972	105881893	6	6	0.5179	8.17535825600445e-17	105850033	105856972	3.51916965324679e-08	105881677	105898108
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	106358491	176	168	0.0578	3.51916965324679e-08	105881677	105898108	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	4	0.0324	NA	NA	NA	2.58888329073227e-08	18452491	18692865
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	19537035	94	92	-0.716	2.58888329073227e-08	18452491	18692865	2.01036830665126e-15	19421704	19805960
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	20088256	57	55	-0.391	2.01036830665126e-15	19421704	19805960	4.82692187138403e-96	20060061	20308014
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	74669752	21555	20743	-0.0023	4.82692187138403e-96	20060061	20308014	2.139368179678e-18	74669752	74669752
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	3	0.7378	2.139368179678e-18	74669752	74669752	2.43972883287849e-18	74680439	74680439
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	98232932	8693	8372	0.005	2.43972883287849e-18	74680439	74680439	5.09792774283421e-11	98228743	98232932
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98239454	3	3	0.5799	5.09792774283421e-11	98228743	98232932	7.93246577809925e-11	98239454	98243586
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	99632987	637	606	0.0119	7.93246577809925e-11	98239454	98243586	1.30572577826169e-29	99632987	99632987
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.149	1.30572577826169e-29	99632987	99632987	3.55248772387887e-28	99635701	99635701
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	260	-0.004	3.55248772387887e-28	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	12068569	4571	4391	-0.0203	NA	NA	NA	5.17744718446439e-33	12065375	12070953
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	12070953	12105334	15	14	0.4565	5.17744718446439e-33	12065375	12070953	1.84880426697629e-34	12102451	12106892
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	12106892	34333833	6124	5894	-0.0159	1.84880426697629e-34	12102451	12106892	1.30419962595339e-09	34240270	34422716
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34339543	34631759	55	52	-0.1487	1.30419962595339e-09	34240270	34422716	7.47655344933594e-14	34574587	34664645
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34634686	54352394	2931	2824	0.0027	7.47655344933594e-14	34574587	34664645	1.95551196689436e-20	54352394	54356704
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54353978	54365385	5	5	-0.5837	1.95551196689436e-20	54352394	54356704	0.000369692909421131	54362111	54379834
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54366535	54408446	11	10	0.187	0.000369692909421131	54362111	54379834	0.000156265261318763	54368717	54440345
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54410800	57201427	1196	1136	2e-04	0.000156265261318763	54368717	54440345	1.20118167116150e-22	57201427	57201427
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57203733	57203733	1	0	NA	1.2011816711615e-22	57201427	57201427	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	-1.0199	NA	NA	NA	1.02180369557202e-24	57206772	57206772
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	67456060	2835	2724	-0.0087	1.02180369557202e-24	57206772	57206772	3.86728563856172e-09	67456060	67456060
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	67458787	67461846	2	2	0.615	3.86728563856172e-09	67456060	67456060	1.02876406467040e-09	67461846	67461846
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	67466009	75093957	2775	2662	-0.0275	1.0287640646704e-09	67461846	67461846	9.27001519288107e-39	75093957	75093957
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	0.9991	9.27001519288107e-39	75093957	75093957	1.65225359230241e-34	75100865	75100865
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76358562	335	316	-0.0076	1.65225359230241e-34	75100865	75100865	3.18139304960775e-06	76355826	76358562
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76359883	76361279	2	2	-0.5394	3.18139304960775e-06	76355826	76358562	3.09388324538421e-06	76361279	76363514
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76363514	76925748	273	261	-0.0138	3.09388324538421e-06	76361279	76363514	1.42852607379183e-106	76925748	76925748
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	1.0882	1.42852607379183e-106	76925748	76925748	2.58965167322334e-106	76940218	76940218
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	87308012	3921	3750	0.0039	2.58965167322334e-106	76940218	76940218	2.92535102244186e-08	87303714	87313486
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	87313483	87329338	8	7	-0.3292	2.92535102244186e-08	87303714	87313486	9.04461308926698e-07	87321844	87335248
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	87330963	88690571	584	560	-0.0021	9.04461308926698e-07	87321844	87335248	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	403	-0.0094	NA	NA	NA	4.02844507658496e-11	1028979	1028979
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	0.7509	4.02844507658496e-11	1028979	1028979	3.74130280570868e-12	1030766	1030766
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	9281217	3622	3490	-0.0139	3.74130280570868e-12	1030766	1030766	1.22179480658122e-24	9281217	9281217
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	9284877	9289728	3	3	-0.8917	1.22179480658122e-24	9281217	9281217	2.62211729714282e-28	9289728	9289728
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	9291114	31457889	7993	7652	-0.0029	2.62211729714282e-28	9289728	9289728	7.6493773410196e-35	31451114	31462463
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31499568	18	18	-0.4051	7.6493773410196e-35	31451114	31462463	3.65857242771787e-34	31492553	31503774
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31503774	36673853	1816	1741	-0.0064	3.65857242771787e-34	31492553	31503774	1.52611910836655e-142	36673853	36673853
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	1.4008	1.52611910836655e-142	36673853	36673853	1.34189356696369e-127	36684619	36684619
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41519702	2011	1928	-0.0111	1.34189356696369e-127	36684619	36684619	2.26349741574563e-43	41518222	41521544
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41568539	22	20	-0.4615	2.26349741574563e-43	41518222	41521544	8.30017278552992e-13	41564408	41574775
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41570512	41704093	42	42	-0.1614	8.30017278552992e-13	41564408	41574775	6.66399410908133e-11	41632724	42155643
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41706870	72294735	11130	10663	-0.007	6.66399410908133e-11	41632724	42155643	1.55712476471564e-11	72294735	72294735
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	72297674	72299153	2	2	-0.732	1.55712476471564e-11	72294735	72294735	2.23607297913732e-10	72299153	72299153
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	72303321	78617761	2539	2437	0.0011	2.23607297913732e-10	72299153	72299153	0.000949022233178577	78591544	78636731
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	78618887	78653545	11	11	0.1855	0.000949022233178577	78591544	78636731	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	35423753	10757	10363	-0.0068	NA	NA	NA	1.65024074632597e-24	35423753	35423753
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	35425943	35427276	2	2	-1.0188	1.65024074632597e-24	35423753	35423753	2.58035203832479e-24	35427276	35427276
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	35428504	70614637	10301	9928	0.0013	2.58035203832479e-24	35427276	35427276	4.23273221630809e-07	70613271	70614637
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	70617340	70619972	2	2	0.5717	4.23273221630809e-07	70613271	70614637	1.36833897421218e-06	70619972	70622367
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	70622367	76116026	1902	1829	0.0239	1.36833897421218e-06	70619972	70622367	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	790526	219	210	-0.0057	NA	NA	NA	2.31473271684694e-19	790526	790526
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	794973	794978	2	2	1.0407	2.31473271684694e-19	790526	790526	1.67257161134684e-23	794978	794978
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	798817	1398325	271	257	-0.025	1.67257161134684e-23	794978	794978	8.10451708687901e-22	1398325	1398325
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.0118	8.10451708687901e-22	1398325	1398325	1.39166159521547e-20	1400840	1400840
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	3353960	926	889	-0.0266	1.39166159521547e-20	1400840	1400840	2.66532256018638e-17	3353960	3353960
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3355220	3356334	2	2	0.9252	2.66532256018638e-17	3353960	3353960	5.77619078116146e-18	3356334	3356334
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3357750	36526750	9763	9387	-0.0218	5.77619078116146e-18	3356334	3356334	1.23260102572163e-13	36521805	36526750
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	36528282	36535352	5	5	0.3191	1.23260102572163e-13	36521805	36526750	1.43621087524707e-05	36535352	36540947
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	36537505	56823430	8683	8310	-0.0164	1.43621087524707e-05	36535352	36540947	9.33949976752021e-56	56823430	56823430
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	8	-0.8131	9.3394997675202e-56	56823430	56823430	1.20079436524765e-52	56840346	56840346
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	60876899	1790	1728	-0.0252	1.20079436524765e-52	56840346	56840346	2.35315273646821e-11	60875830	60876899
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	60879072	60882128	3	3	0.5822	2.35315273646821e-11	60875830	60876899	2.15146213451095e-11	60882128	60884879
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	60884879	63788698	1385	1337	-0.0165	2.15146213451095e-11	60882128	60884879	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	563	0.0124	NA	NA	NA	9.40211646400918e-16	1506379	1506379
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1516966	3	3	-0.6791	9.40211646400918e-16	1506379	1506379	0.000120661702697478	1516966	1518825
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1518825	1525300	4	4	-1.737	0.000120661702697478	1516966	1518825	1.38190626316e-120	1525300	1525300
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1528899	3767748	933	894	-1e-04	1.38190626316e-120	1525300	1525300	8.04383726658068e-16	3767748	3767748
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	3771151	3772462	2	2	-0.8806	8.04383726658068e-16	3767748	3767748	7.37784848354726e-18	3772462	3772462
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	3774394	26122896	7486	7181	-0.0034	7.37784848354726e-18	3772462	3772462	4.14920606627294e-17	26122896	26122896
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26124782	26125721	2	2	-0.8627	4.14920606627294e-17	26122896	26122896	1.17498022183324e-16	26125721	26125721
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26126306	52080395	8825	8483	-5e-04	1.17498022183324e-16	26125721	26125721	5.1628946969653e-29	52080395	52080395
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52081719	52090393	5	4	-0.7987	5.1628946969653e-29	52080395	52080395	1.98833021215006e-27	52090393	52090393
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52092989	62069950	3591	3455	0.0112	1.98833021215006e-27	52090393	52090393	4.23192659566855e-12	62069950	62069950
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	62070900	62072374	2	2	0.7811	4.23192659566855e-12	62069950	62069950	2.88839911276595e-11	62072374	62072374
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	62073952	62419534	140	134	0.0173	2.88839911276595e-11	62072374	62072374	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	36789648	8545	8210	9e-04	NA	NA	NA	9.72457440022146e-26	36789648	36789648
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36790648	36791668	2	2	1.0479	9.72457440022146e-26	36789648	36789648	1.22110473152740e-22	36791668	36791668
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36792708	46922972	4894	4704	0.011	1.2211047315274e-22	36791668	36791668	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	18125356	1132	1090	-0.0139	NA	NA	NA	2.89470032102181e-10	18125356	18125356
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18127933	18129194	2	2	0.7172	2.89470032102181e-10	18125356	18125356	5.12509397616251e-10	18129194	18129194
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18131561	23298011	2152	2049	0.0084	5.12509397616251e-10	18129194	18129194	8.22420502147204e-09	23297130	23298011
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	23299972	23299972	1	0	NA	8.22420502147204e-09	23297130	23298011	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	23303573	23307940	2	2	0.6754	NA	NA	NA	1.0837789253602e-09	23307940	23307940
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	23308015	28606054	2932	2797	0.0048	1.0837789253602e-09	23307940	23307940	5.74993518230273e-09	28599591	28606054
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	28610900	28620305	7	6	-0.3512	5.74993518230273e-09	28599591	28606054	4.03524298949193e-08	28620305	28627112
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	28624893	35472378	3324	3162	-0.0027	4.03524298949193e-08	28620305	28627112	2.84471306248008e-21	35472378	35472378
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	0.9549	2.84471306248008e-21	35472378	35472378	1.29081578851267e-18	35476942	35476942
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6720	0.0067	1.29081578851267e-18	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	2705378	1790	1720	-0.0369	NA	NA	NA	1.81128068510801e-10	2705374	2706218
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2706218	2708291	3	3	-0.574	1.81128068510801e-10	2705374	2706218	9.92205764986325e-35	2708291	2708291
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	8452395	1791	1731	0.8297	9.92205764986325e-35	2708291	2708291	6.10827526327891e-29	8449254	8459880
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8456422	8466917	7	6	0.2953	6.10827526327891e-29	8449254	8459880	1.28310010611511e-23	8459880	8475091
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8473482	8473482	1	0	NA	1.28310010611511e-23	8459880	8475091	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8475091	48340652	14869	14295	0.8829	NA	NA	NA	6.8765109555292e-27	48339561	48343387
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	48341821	48349677	6	6	0.2955	6.8765109555292e-27	48339561	48343387	2.05074161066839e-48	48346270	48353053
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	48351995	146087729	25420	24413	0.8679	2.05074161066839e-48	48346270	48353053	6.52854821185254e-47	146086841	146087729
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	146095685	146095707	2	2	0.1078	6.52854821185254e-47	146086841	146087729	7.39518724479638e-11	146095707	146098710
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	146098710	152300522	2199	2109	0.8777	7.39518724479638e-11	146095707	146098710	1.95994894538004e-49	152261947	152370003
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152303019	153542187	485	469	0.7156	1.95994894538004e-49	152261947	152370003	6.2479100280072e-13	153384615	153592390
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153555953	154038318	221	215	0.8753	6.2479100280072e-13	153384615	153592390	1.31981801245901e-12	154031239	154044828
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154078819	11	11	1.3234	1.31981801245901e-12	154031239	154044828	3.13557115458431e-12	154078401	154085354
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154442377	90	87	0.8826	3.13557115458431e-12	154078401	154085354	1.60306357906248e-175	154442377	154442377
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	4	-2.0936	1.60306357906248e-175	154442377	154442377	3.01150085081016e-123	154450309	154450309
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154578922	27	27	0.9017	3.01150085081016e-123	154450309	154450309	4.6484278793562e-203	154578922	154578922
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154582414	154582414	1	0	NA	4.6484278793562e-203	154578922	154578922	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	194	-0.005	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	2773629	26	26	-3.1047	NA	NA	NA	4.43280877386529e-06	2756034	2773629
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2774598	2774598	1	0	NA	4.43280877386529e-06	2756034	2773629	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2775895	2784560	8	8	-1.5928	NA	NA	NA	1.12171743731696e-10	2784560	2791440
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2787638	2810364	12	12	-3.6283	1.12171743731696e-10	2784560	2791440	2.58879679212154e-12	2807441	2810364
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2812116	2861090	19	17	-1.9853	2.58879679212154e-12	2807441	2810364	2.49537339486499e-09	2859887	2865932
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2862660	3733715	58	56	-3.1081	2.49537339486499e-09	2859887	2865932	2.36098220036955e-41	3733715	3733715
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	15	-0.5698	2.36098220036955e-41	3733715	3733715	2.54766924281244e-18	5593746	5593746
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6692482	4	4	-2.706	2.54766924281244e-18	5593746	5593746	1.18090177280088e-13	6692482	6692482
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6696721	6730882	6	6	-4.3023	1.18090177280088e-13	6692482	6692482	2.23776899683515e-07	6728131	6730882
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6735310	6749115	6	6	-3.2522	2.23776899683515e-07	6728131	6730882	0.087644063561301	6749115	6804170
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6756250	6836623	33	31	-2.2249	0.087644063561301	6749115	6804170	0.00352306662230144	6801155	6849773
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6837654	6871143	20	20	-3.2757	0.00352306662230144	6801155	6849773	3.62754674677278e-05	6854295	6899085
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6872263	7259689	160	150	-2.0921	3.62754674677278e-05	6854295	6899085	2.57145901535540e-05	7224954	7262785
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7261174	7304209	23	23	-1.0179	2.5714590153554e-05	7224954	7262785	0.000303003223732128	7296153	7340782
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7305143	7485594	49	48	-1.9366	0.000303003223732128	7296153	7340782	0.000346558076345772	7401540	7495687
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7491280	7606496	14	12	-3.1223	0.000346558076345772	7401540	7495687	0.00859550653286133	7600570	7631265
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7608619	7653082	19	19	-1.9406	0.00859550653286133	7600570	7631265	0.000435771061944301	7643041	7665429
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7709619	35	35	-3.2653	0.000435771061944301	7643041	7665429	2.45974711659785e-07	7698960	7722458
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7914104	67	64	-2.0572	2.45974711659785e-07	7698960	7722458	6.91591223981878e-05	7905286	7918899
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	7930528	5	5	-4.1018	6.91591223981878e-05	7905286	7918899	5.7606272460746e-08	7928317	7936024
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7936024	8005148	16	15	-1.7532	5.7606272460746e-08	7928317	7936024	8.17449898157277e-09	7997485	8043008
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8010446	8230756	56	51	-3.2791	8.17449898157277e-09	7997485	8043008	8.33472261225685e-09	8201959	8299833
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8241630	8241630	1	0	NA	8.33472261225685e-09	8201959	8299833	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8245608	8823361	167	161	-2.4173	NA	NA	NA	0.0265249881232835	8647327	8938284
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8824539	9081196	48	46	-2.85	0.0265249881232835	8647327	8938284	7.99934096709065e-05	9069601	9081196
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9087629	9101371	6	6	-4.531	7.99934096709065e-05	9069601	9081196	0.000301679839961714	9101371	9129443
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9102367	10515697	91	89	-2.8878	0.000301679839961714	9101371	9129443	3.23899105941145e-17	10512616	10595079
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	12502304	20	20	-0.8117	3.23899105941145e-17	10512616	10595079	6.1530695123335e-11	11673476	12502304
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12511461	12541506	10	10	-3.2942	6.1530695123335e-11	11673476	12502304	2.35550984001746e-13	12541506	12545716
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	53	-1.3143	2.35550984001746e-13	12541506	12545716	2.51682443032924e-08	12658135	12700767
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12776542	15	15	-2.7369	2.51682443032924e-08	12658135	12700767	1.09441140245465e-06	12745259	12820920
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12786515	13129843	121	111	-1.4714	1.09441140245465e-06	12745259	12820920	1.37490213478369e-06	13104920	13155705
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13262997	45	43	-2.3525	1.37490213478369e-06	13104920	13155705	7.41147263255519e-06	13232295	13264329
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13264329	13328273	21	21	-3.5644	7.41147263255519e-06	13232295	13264329	1.75659437576797e-08	13327446	13330707
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13329968	13340647	5	5	-1.9211	1.75659437576797e-08	13327446	13330707	0.205644501498626	13330707	13460540
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13342125	13823928	175	168	-2.8762	0.205644501498626	13330707	13460540	0.000286493952446250	13781193	13851627
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13828384	13863657	8	8	-1.5581	0.00028649395244625	13781193	13851627	3.74126884390808e-06	13854528	13870622
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13866668	14122036	122	115	-3.2436	3.74126884390808e-06	13854528	13870622	8.01542474587114e-05	14091543	14310145
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14122129	14353244	36	33	-2.3947	8.01542474587114e-05	14091543	14310145	0.0027717000205424	14321882	14358464
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14354682	14376942	12	11	-1.1837	0.0027717000205424	14321882	14358464	5.49551606404766e-10	14375855	14380301
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14377844	14419087	24	24	-2.8732	5.49551606404766e-10	14375855	14380301	5.87443097107949e-05	14411113	14419903
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14419903	14436374	9	9	-1.6299	5.87443097107949e-05	14411113	14419903	3.08034437446224e-09	14434912	14436374
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14438363	14449913	8	8	-3.0087	3.08034437446224e-09	14434912	14436374	1.97166093930938e-17	14449913	14449913
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14451317	14473497	12	12	-1.5767	1.97166093930938e-17	14449913	14449913	3.18979944935378e-08	14466597	14477246
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14474414	14489032	14	14	-2.4455	3.18979944935378e-08	14466597	14477246	3.84867499029021e-06	14489032	14489032
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14489801	14491287	2	2	-0.8169	3.84867499029021e-06	14489032	14489032	2.00152046439144e-05	14491287	14492454
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14492454	14508021	11	11	-2.8379	2.00152046439144e-05	14491287	14492454	6.08749760986815e-10	14506319	14526446
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	6.08749760986815e-10	14506319	14526446	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	24	-1.2176	NA	NA	NA	0.0671410091310938	14559651	14696387
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14700040	23	23	-2.0492	0.0671410091310938	14559651	14696387	0.000403418512919309	14644293	14703568
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14701706	14883615	43	43	-3.092	0.000403418512919309	14644293	14703568	0.000475288055573952	14812822	15058332
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14894476	15208612	87	83	-2.4082	0.000475288055573952	14812822	15058332	6.88519695218089e-05	15199550	15209166
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15209166	15241527	10	9	-0.9303	6.88519695218089e-05	15199550	15209166	9.2771778569606e-08	15240367	15245772
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15242592	15433122	128	120	-2.8248	9.2771778569606e-08	15240367	15245772	2.39993736220176e-05	15426319	15433122
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15434486	15447091	6	6	-0.9153	2.39993736220176e-05	15426319	15433122	1.36687208292480e-06	15447091	15452656
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15448670	15518749	28	28	-2.714	1.3668720829248e-06	15447091	15452656	1.54902756893871e-06	15497443	15521958
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15519963	15546378	16	15	-1.4166	1.54902756893871e-06	15497443	15521958	4.97121409612268e-06	15546378	15546378
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15547576	15551462	5	5	-2.9742	4.97121409612268e-06	15546378	15546378	1.12651638130798e-05	15551462	15553682
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15552815	15558235	5	5	-1.3067	1.12651638130798e-05	15551462	15553682	1.82471352255049e-07	15558235	15558235
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15559959	15566377	5	5	-3.842	1.82471352255049e-07	15558235	15558235	4.94361134474311e-12	15566377	15566377
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15573579	15583573	5	5	-1.0767	4.94361134474311e-12	15566377	15566377	4.6081087570471e-06	15583573	15590299
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15585797	15915466	56	55	-2.9198	4.6081087570471e-06	15583573	15590299	4.82905682004194e-06	15829553	15986595
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16387273	162	155	-2.1327	4.82905682004194e-06	15829553	15986595	5.43824274360102e-14	16357759	16413874
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	16656177	38	36	-3.5601	5.43824274360102e-14	16357759	16413874	4.96176522919048e-05	16607621	16679419
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16659030	16914237	55	54	-2.6782	4.96176522919048e-05	16607621	16679419	4.62239061071120e-05	16894271	16922080
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16922080	17067188	8	8	-4.2047	4.6223906107112e-05	16894271	16922080	7.00440406839715e-21	17062567	17067188
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17073540	17107617	8	6	-1.7697	7.00440406839715e-21	17062567	17067188	1.77030363099363e-10	17107617	17107617
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17113261	17129499	4	4	-3.3791	1.77030363099363e-10	17107617	17107617	0.000102021432063138	17129499	17147469
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17138190	17238655	18	18	-2.1086	0.000102021432063138	17129499	17147469	4.60885391382525e-07	17227434	17280842
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17242317	17487972	43	38	-3.2064	4.60885391382525e-07	17227434	17280842	3.84764448171192e-14	17482749	17492482
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17492482	17548302	11	11	-1.247	3.84764448171192e-14	17482749	17492482	3.36302662108395e-06	17533546	17598928
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17557953	21036411	485	468	-2.7859	3.36302662108395e-06	17533546	17598928	1.39734432338711e-06	21034708	21041164
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21036503	21036503	1	0	NA	1.39734432338711e-06	21034708	21041164	NA	NA	NA
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054519	6	6	-0.6477	NA	NA	NA	7.7444482721548e-09	21048365	21054605
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	21224074	61	56	-2.9583	7.7444482721548e-09	21048365	21054605	4.64271132877389e-07	21161072	21245599
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21236497	21329709	25	25	-1.8753	4.64271132877389e-07	21161072	21245599	0.000201681691187326	21325972	21355253
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21330576	22157319	176	169	-2.7647	0.000201681691187326	21325972	21355253	0.000149421685067584	22041876	22158616
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22158616	22181855	11	11	-1.433	0.000149421685067584	22041876	22158616	1.09279413799145e-32	22181855	22181855
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22182080	22216169	12	12	-3.6961	1.09279413799145e-32	22181855	22181855	1.99850450685167e-07	22210081	22232997
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22232997	22249988	9	9	-4.7109	1.99850450685167e-07	22210081	22232997	0.000160517389401815	22244581	22252795
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22252446	22268552	5	5	-3.8156	0.000160517389401815	22244581	22252795	0.0260802150791142	22261337	22791720
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22308420	22877495	46	42	-2.9152	0.0260802150791142	22261337	22791720	4.09007196679488e-06	22868395	22884090
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22878671	22915679	11	10	-4.0672	4.09007196679488e-06	22868395	22884090	0.00159204853211642	22911915	22924754
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22916746	22930737	7	7	-2.685	0.00159204853211642	22911915	22924754	5.32651282370157e-17	22924754	23283689
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	30	-0.8216	5.32651282370157e-17	22924754	23283689	1.30736473556468e-16	26945893	26952278
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	26980386	5	5	-3.184	1.30736473556468e-16	26945893	26952278	1.33956595566108e-05	26957814	26998633
MSK_252152917527_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26984336	57440809	48	46	-0.8463	1.33956595566108e-05	26957814	26998633	NA	NA	NA
