Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	34869589	12894	11693	-0.0934	NA	NA	NA	2.00426915765463e-10	34853835	34869589
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34876833	34883375	4	4	-1.0799	2.00426915765463e-10	34853835	34869589	1.17320273289850e-10	34883375	34884849
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34884849	43131392	3292	2976	-0.1181	1.1732027328985e-10	34883375	34884849	1.21590034328789e-13	43131392	43131392
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	43132077	43139091	2	2	-1.649	1.21590034328789e-13	43131392	43131392	6.26322113940262e-13	43139091	43139091
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	43142878	72537426	11702	10630	-0.1252	6.26322113940262e-13	43139091	43139091	0	72537426	72537426
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	-3.6414	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	113841017	13176	11980	-0.1256	0	72579311	72579311	1.07203837301552e-12	113841017	113841017
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	113847479	113848985	2	2	-1.5843	1.07203837301552e-12	113841017	113841017	1.28630050235947e-13	113848985	113848985
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	113850483	143706582	2446	2220	-0.1182	1.28630050235947e-13	113848985	113848985	0	143697723	143712550
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143708689	150819879	1932	1762	0.3679	0	143697723	143712550	5.79157697315408e-11	150818222	150823073
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150839754	4	4	-0.5943	5.79157697315408e-11	150818222	150823073	3.90000397270694e-05	150839754	150844444
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150851439	7	7	-3.2185	3.90000397270694e-05	150839754	150844444	1.48141924098388e-99	150851439	150851439
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	150852858	1	0	NA	1.48141924098388e-99	150851439	150851439	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150857070	151026228	77	70	0.3808	NA	NA	NA	4.44319792244326e-227	151026228	151026228
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	-4.4331	4.44319792244326e-227	151026228	151026228	2.32995404119895e-275	151036435	151036435
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	189386590	14738	13383	0.3556	2.32995404119895e-275	151036435	151036435	1.07347482030566e-110	189374553	189430684
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	189398539	189398539	1	0	NA	1.07347482030566e-110	189374553	189430684	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	189402827	190774579	265	240	-0.0398	NA	NA	NA	1.72724459951523e-112	190756209	190788638
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	190777774	247186514	20587	18727	0.3586	1.72724459951523e-112	190756209	190788638	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	242501239	77760	70603	-0.1217	NA	NA	NA	1.31983271667071e-116	242495169	242505261
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242505261	242682950	65	59	-0.9273	1.31983271667071e-116	242495169	242505261	0.000523782121802578	242677069	242682950
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242686945	242689978	2	2	-0.0892	0.000523782121802578	242677069	242682950	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	33894847	11521	10470	0.3853	NA	NA	NA	3.73078101592152e-68	33889683	33912479
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	33896459	33896459	1	0	NA	3.73078101592152e-68	33889683	33912479	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	33900745	34516817	93	81	-0.1448	NA	NA	NA	3.65023709207845e-62	34502014	34533432
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	34520979	34520979	1	0	NA	3.65023709207845e-62	34502014	34533432	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	34524991	37953375	1065	980	0.3866	NA	NA	NA	1.57920452688845e-18	37953375	37954819
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37954819	37961110	6	6	-0.6562	1.57920452688845e-18	37953375	37954819	5.45892753429064e-18	37960019	37963014
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37963014	47460892	3531	3209	0.3998	5.45892753429064e-18	37960019	37963014	2.70437528256798e-131	47460892	47460892
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	-4.4628	2.70437528256798e-131	47460892	47460892	2.27143783565351e-143	47466921	47466921
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	163989367	37267	33863	0.3897	2.27143783565351e-143	47466921	47466921	0	163989367	163997228
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163992903	163992903	1	0	NA	0	163989367	163997228	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164107951	28	25	-3.9593	NA	NA	NA	0	164105613	164107951
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	194354505	10130	9230	0.3926	0	164105613	164107951	0	194354505	194354505
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-4.3951	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196822133	996	903	0.3853	0	194366950	194366950	1.41740932655665e-25	196810503	196835413
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196929805	20	19	-0.3329	1.41740932655665e-25	196810503	196835413	1.08421163565743e-24	196928503	196940125
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196929826	199329592	964	872	0.3971	1.08421163565743e-24	196928503	196940125	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	34445002	9564	8705	-0.1171	NA	NA	NA	8.50371449514876e-262	34445002	34445002
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34457648	1	0	NA	8.50371449514876e-262	34445002	34445002	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34463523	34491115	5	4	-4.7826	NA	NA	NA	5.41473535973856e-274	34491115	34491115
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	34506297	1	0	NA	5.41473535973856e-274	34491115	34491115	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34509895	191153613	45590	41451	-0.1282	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	134440936	37796	34410	-0.1256	NA	NA	NA	2.13029851372343e-192	134435272	134448002
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	134446035	135023982	201	183	-0.7097	2.13029851372343e-192	134435272	134448002	5.11485555258827e-193	135005311	135046334
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	135033652	180644810	15769	14340	-0.1145	5.11485555258827e-193	135005311	135046334	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	29950805	10587	9606	-0.1226	NA	NA	NA	4.32945706144742e-12	29939288	29962849
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30005338	14	12	0.4585	4.32945706144742e-12	29939288	29962849	1.33595998019430e-09	30000990	30031367
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30010234	30010234	1	0	NA	1.3359599801943e-09	30000990	30031367	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30021908	31385778	580	532	-0.0927	NA	NA	NA	1.51427876103834e-193	31385778	31385778
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31393624	4	3	-5.1649	1.51427876103834e-193	31385778	31385778	0.00169971165985755	31390982	31393624
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31395330	31418006	2	2	-2.0577	0.00169971165985755	31390982	31393624	3.90905042585841e-22	31418006	31418006
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	32539864	486	438	-0.0996	3.90905042585841e-22	31418006	31418006	1.28822443950414e-10	32535066	32564884
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32543054	32605300	13	12	0.4763	1.28822443950414e-10	32535066	32564884	1.45339925914429e-12	32588005	32613538
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32609525	79018959	14737	13380	-0.1205	1.45339925914429e-12	32588005	32613538	1.49410410391942e-21	79015901	79032059
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-0.8621	1.49410410391942e-21	79015901	79032059	1.31309619166654e-21	79074911	79095415
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	103841482	6762	6131	-0.1247	1.31309619166654e-21	79074911	79095415	2.54813718396415e-156	103841482	103841482
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-3.6421	2.54813718396415e-156	103841482	103841482	1.97911385195777e-154	103868154	103868154
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	152053279	16508	15043	-0.1272	1.97911385195777e-154	103868154	103868154	6.18646869497365e-10	152051027	152053279
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	152054889	152058503	3	3	-1.1957	6.18646869497365e-10	152051027	152053279	1.31280851922517e-09	152058503	152061539
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	152061539	165643653	4595	4191	-0.122	1.31280851922517e-09	152058503	152061539	6.49490722027858e-18	165643653	165643653
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165645537	1	0	NA	6.49490722027858e-18	165643653	165643653	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165648188	165650610	3	3	1.3254	NA	NA	NA	1.27525250174778e-18	165650610	165650610
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1633	-0.1218	1.27525250174778e-18	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	178408	14	10	1.1471	NA	NA	NA	5.23051296264973e-16	163711	181901
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	180716	141698634	49920	45354	0.389	5.23051296264973e-16	163711	181901	8.53755484864955e-12	141689547	141698634
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141700432	141714168	9	7	1.1763	8.53755484864955e-12	141689547	141698634	2.62072864107531e-12	141714168	141721894
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	141720303	1	0	NA	2.62072864107531e-12	141714168	141721894	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720324	147702365	2511	2295	0.3802	NA	NA	NA	4.57670933179886e-12	147697712	147702365
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147710037	4	3	-0.8237	4.57670933179886e-12	147697712	147702365	3.39808975036963e-11	147710037	147711471
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147711471	158815157	4235	3888	0.4045	3.39808975036963e-11	147710037	147711471	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158821263	158821263	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	32800775	11194	10120	-0.1147	NA	NA	NA	4.1006200263308e-31	32800775	32800775
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32805686	32808049	2	2	-2.3944	4.1006200263308e-31	32800775	32800775	2.04386679272712e-33	32808049	32808049
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32812909	39352361	1879	1708	-0.1117	2.04386679272712e-33	32808049	32808049	8.23409582287416e-97	39350798	39354149
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39354149	39505256	58	52	0.6618	8.23409582287416e-97	39350798	39354149	5.50317443051037e-86	39504332	39508035
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40892587	441	399	-0.1285	5.50317443051037e-86	39504332	39508035	2.31570583540430e-199	40892587	40892587
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-5.7623	2.3157058354043e-199	40892587	40892587	2.33758510733179e-196	40897469	40897469
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	146264846	30990	28212	-0.1239	2.33758510733179e-196	40897469	40897469	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	36883592	12022	10880	-0.1268	NA	NA	NA	9.57516638798479e-13	36883592	36883592
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	36886166	36887793	2	2	1.3551	9.57516638798479e-13	36883592	36883592	1.13744792849744e-12	36887793	36887793
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	36889524	70926188	1048	952	-0.1183	1.13744792849744e-12	36887793	36887793	9.6095506105494e-32	70926188	70926188
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-2.4751	9.6095506105494e-32	70926188	70926188	1.64816567298173e-32	70930528	70930528
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	70935055	1	0	NA	1.64816567298173e-32	70930528	70930528	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70939069	140145683	24869	22670	-0.117	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	45489823	14457	13186	-0.1187	NA	NA	NA	1.37178843805061e-11	45458783	46404919
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46384985	46512806	52	45	0.1812	1.37178843805061e-11	45458783	46404919	4.18234565966085e-11	46497143	46541598
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46516583	135285645	30299	27588	-0.1188	4.18234565966085e-11	46497143	46541598	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	18906505	7373	6710	-0.1132	NA	NA	NA	1.73968410161848e-09	18896166	18906505
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18908541	18917191	5	4	0.7995	1.73968410161848e-09	18896166	18906505	1.72352514828507e-14	18917191	18929375
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18929375	74468905	17195	15577	-0.1156	1.72352514828507e-14	18917191	18929375	2.64985021959021e-14	74468905	74468905
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	74470292	74476044	2	2	-1.4926	2.64985021959021e-14	74468905	74468905	1.06507448024409e-10	74476044	74476044
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	74477359	107249211	10643	9659	-0.1277	1.06507448024409e-10	74476044	74476044	9.49533501572082e-61	107243657	107269435
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107256904	107455467	81	74	0.3955	9.49533501572082e-61	107243657	107269435	2.71141319355496e-58	107446476	107464504
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107460039	134450318	10005	9127	-0.1184	2.71141319355496e-58	107446476	107464504	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	11116883	4329	3934	0.3933	NA	NA	NA	1.87887873122179e-235	11116883	11116883
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11130871	6	6	-3.2402	1.87887873122179e-235	11116883	11116883	4.40605220624445e-235	11130871	11130871
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	124087857	38054	34594	0.3883	4.40605220624445e-235	11130871	11130871	2.34894608160842e-42	124079436	124093470
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	124089805	124227709	61	54	-0.1296	2.34894608160842e-42	124079436	124093470	4.5808321813537e-43	124216867	124239290
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	124230718	130936199	2158	1968	0.3913	4.5808321813537e-43	124216867	124239290	1.96046154812682e-10	130932920	130936199
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130943064	130943064	1	0	NA	1.96046154812682e-10	130932920	130936199	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.7327	NA	NA	NA	1.17910590798975e-08	130946248	130947790
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	502	0.3956	1.17910590798975e-08	130946248	130947790	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	42657365	9245	8401	-0.1265	NA	NA	NA	6.02406789349523e-10	42655055	42657365
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	42659524	42661941	2	2	1.193	6.02406789349523e-10	42655055	42657365	4.20611356659692e-10	42661941	42661941
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	42663797	56650373	4778	4341	-0.1289	4.20611356659692e-10	42661941	42661941	1.08653981760267e-16	56610886	56662112
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56657371	1	0	NA	1.08653981760267e-16	56610886	56662112	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56658479	56685341	14	14	0.508	NA	NA	NA	4.12287064947122e-19	56679017	56688605
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	68136198	2692	2441	-0.1368	4.12287064947122e-19	56679017	56688605	5.52560724571423e-25	68134536	68144264
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68138912	68142120	2	0	NA	5.52560724571423e-25	68134536	68144264	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68144264	68163523	10	9	-1.0491	NA	NA	NA	3.65574179021723e-23	68161714	68168882
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68167758	68167758	1	0	NA	3.65574179021723e-23	68161714	68168882	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68168882	114123340	14899	13544	-0.1302	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18544772	6	6	0.7382	NA	NA	NA	2.86693761756021e-12	18544772	18798641
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	21745532	1153	1069	-0.095	2.86693761756021e-12	18544772	18798641	3.33148261261695e-29	21727722	21768749
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21746994	22019726	137	122	0.2065	3.33148261261695e-29	21727722	21768749	2.24589185761955e-38	22005835	22040315
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22022060	73051686	18119	16485	-0.1184	2.24589185761955e-38	22005835	22040315	4.57018068790034e-13	73050285	73061942
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73054937	73092112	12	7	0.686	4.57018068790034e-13	73050285	73061942	4.30015886807163e-12	73091980	73101327
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	104400450	11866	10814	-0.1071	4.30015886807163e-12	73091980	73101327	3.34482732002428e-13	104400450	104400450
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	104400840	104403474	2	2	1.4387	3.34482732002428e-13	104400450	104400450	2.78804769296426e-09	104403474	104405493
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	104405493	105787390	380	356	-0.0794	2.78804769296426e-09	104403474	104405493	2.52523883568622e-09	105783533	105788623
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105788623	105798116	6	6	-0.9558	2.52523883568622e-09	105783533	105788623	2.36225213773148e-07	105795807	105801812
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105799261	106358491	204	187	-0.1444	2.36225213773148e-07	105795807	105801812	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18362555	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18427151	19430207	96	88	-0.1705	NA	NA	NA	5.04920296381606e-16	19421704	19805960
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19465359	20088256	59	57	-0.5627	5.04920296381606e-16	19421704	19805960	1.99396543880661e-105	20079935	20308014
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	20735821	146	135	0.4397	1.99396543880661e-105	20079935	20308014	6.28074310344722e-125	20713089	20760283
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20742444	99632987	30746	28031	-0.1186	6.28074310344722e-125	20713089	20760283	1.54603988128566e-13	99632987	99632987
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.4337	1.54603988128566e-13	99632987	99632987	1.86753957500014e-14	99635701	99635701
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	252	-0.1147	1.86753957500014e-14	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	1296506	472	422	-0.0187	NA	NA	NA	3.538558023873e-09	1290167	1296506
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1296767	1300341	3	3	1.2384	3.538558023873e-09	1290167	1296506	2.94915955057588e-15	1300341	1300341
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1302875	76922411	20659	18746	-0.1013	2.94915955057588e-15	1300341	1300341	3.32666406209955e-24	76919570	76922411
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76923844	76925748	2	0	NA	3.32666406209955e-24	76919570	76922411	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	0.9221	NA	NA	NA	6.25854954909393e-24	76940218	76942679
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4090	-0.0963	6.25854954909393e-24	76940218	76942679	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	25082099	9393	8546	-0.0958	NA	NA	NA	1.58649629831640e-08	25074978	25088886
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	25084589	25094941	7	7	0.5788	1.5864962983164e-08	25074978	25088886	5.46482234514892e-10	25087519	25099200
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	25096649	31457889	2637	2384	-0.1146	5.46482234514892e-10	25087519	25099200	2.44291035716822e-10	31441419	31467971
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31499568	18	16	-0.5805	2.44291035716822e-10	31441419	31467971	1.36548229711731e-08	31490899	31897238
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31503774	31889566	2	0	NA	1.36548229711731e-08	31490899	31897238	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31891535	32828797	364	330	-0.1339	NA	NA	NA	2.00296979393347e-13	32828797	32828797
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	1.406	2.00296979393347e-13	32828797	32828797	1.76993167146345e-12	32832642	32832642
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36673853	1448	1304	-0.0933	1.76993167146345e-12	32832642	32832642	5.10985340861941e-33	36673853	36673853
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	5	1.4412	5.10985340861941e-33	36673853	36673853	3.00784412159647e-32	36683509	36683509
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	41514481	2009	1818	-0.0916	3.00784412159647e-32	36683509	36683509	9.88468372564814e-20	41491006	41522429
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41515622	41648545	62	60	-0.4415	9.88468372564814e-20	41491006	41522429	4.75477486585138e-20	41636402	41708551
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41652861	52440878	3488	3140	-0.1033	4.75477486585138e-20	41636402	41708551	7.05052509195535e-147	52440878	52440878
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52445183	52447064	3	3	-4.1324	7.05052509195535e-147	52440878	52440878	5.0928101007506e-137	52447064	52447064
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52454171	78653545	10196	9262	-0.1002	5.0928101007506e-137	52447064	52447064	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	20887	-0.1231	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	210395	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	216768	63788698	23058	20978	-0.0908	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	524	-0.1127	NA	NA	NA	1.88419312006634e-12	1506379	1506379
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1516966	3	3	-1.3745	1.88419312006634e-12	1506379	1506379	0.0368043160592644	1516966	1525300
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1518825	1531162	6	6	-3.349	0.0368043160592644	1516966	1525300	5.90806163110848e-186	1525300	1531162
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	19123	-0.1178	5.90806163110848e-186	1525300	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12220	-0.1183	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	35472378	9551	8712	-0.1011	NA	NA	NA	4.75054408272395e-134	35472378	35472378
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-4.9527	4.75054408272395e-134	35472378	35472378	7.18616520482962e-127	35476942	35476942
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	40017002	2429	2191	-0.0776	7.18616520482962e-127	35476942	35476942	3.65023770948742e-11	40017002	40017002
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	40025517	40025517	1	0	NA	3.65023770948742e-11	40017002	40017002	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	40027630	40028911	2	2	1.4013	NA	NA	NA	1.95615852763545e-11	40028911	40030431
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	40030431	49571068	4571	4139	-0.0891	1.95615852763545e-11	40028911	40030431	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	-0.1258	NA	NA	NA	0.000342963819572974	94062	99430
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	95819	1	0	NA	0.000342963819572974	94062	99430	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	98390	106242	7	7	0.6678	NA	NA	NA	1.81397747841459e-11	104486	109064
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	108902	1691644	991	920	-0.089	1.81397747841459e-11	104486	109064	6.20807671771159e-10	1686194	1694016
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1691671	1708263	15	14	0.4102	6.20807671771159e-10	1686194	1694016	2.11219359152060e-11	1703906	1711936
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1708665	1708665	1	0	NA	2.1121935915206e-11	1703906	1711936	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1710966	2708291	772	698	-0.1263	NA	NA	NA	0	2708113	2712641
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	154436759	45100	41030	0.7879	0	2708113	2712641	3.21249581678178e-76	154436759	154446801
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154441943	154441943	1	0	NA	3.21249581678178e-76	154436759	154446801	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154442377	154450309	5	5	-2.1255	NA	NA	NA	3.05886922661282e-19	154447839	154450309
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	28	0.738	3.05886922661282e-19	154447839	154450309	4.47117652282257e-55	154578922	154586690
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	180	-0.143	4.47117652282257e-55	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	114	-4.2315	NA	NA	NA	4.01199364458232e-25	3034907	3773948
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-0.899	4.01199364458232e-25	3034907	3773948	7.61425327683443e-14	5422507	6696721
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7051884	173	166	-3.7443	7.61425327683443e-14	5422507	6696721	1.82834325108951e-05	7005620	7248437
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7653082	161	146	-2.8767	1.82834325108951e-05	7005620	7248437	3.05893860706971e-06	7614417	7660965
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7709619	35	33	-4.4779	3.05893860706971e-06	7614417	7660965	3.31754369710773e-07	7701303	7733351
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	8005148	88	78	-2.9302	3.31754369710773e-07	7701303	7733351	1.7101350949969e-09	7942730	8048263
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8010446	8289709	64	57	-4.3562	1.7101350949969e-09	7942730	8048263	2.27921433956491e-08	8219845	8297645
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8292347	8474062	41	36	-3.124	2.27921433956491e-08	8219845	8297645	8.37950610615397e-07	8454258	8501447
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8477958	8543430	21	21	-4.3561	8.37950610615397e-07	8454258	8501447	4.58166719133562e-05	8538835	8554113
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8544417	8689019	50	48	-3.042	4.58166719133562e-05	8538835	8554113	5.99589329295731e-06	8641679	8725431
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8690572	8690572	1	0	NA	5.99589329295731e-06	8641679	8725431	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8692156	10513747	191	175	-4.051	NA	NA	NA	9.90086535682658e-17	10506718	10595079
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	12452734	20	19	-1.4398	9.90086535682658e-17	10506718	10595079	6.4289148231729e-11	11673476	12452734
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12537944	10	9	-5.2523	6.4289148231729e-11	11673476	12452734	1.88949946214955e-09	12537944	12545716
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12541506	12682301	55	52	-2.2024	1.88949946214955e-09	12537944	12545716	3.03494072673895e-05	12634446	12715696
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12804329	19	16	-4.0231	3.03494072673895e-05	12634446	12715696	0.00107266454024935	12733867	12833424
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12809152	12905395	29	25	-2.8981	0.00107266454024935	12733867	12833424	0.00836676774656716	12859309	12911576
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12909643	12926941	8	8	-3.8508	0.00836676774656716	12859309	12911576	1.75238342983958e-06	12925401	12953078
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12928074	13040293	44	42	-1.9395	1.75238342983958e-06	12925401	12953078	4.71620227432276e-08	13029929	13045641
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13041812	13066849	13	12	-3.8459	4.71620227432276e-08	13029929	13045641	1.12535785428364e-07	13062151	13078432
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13076862	13129843	23	21	-1.9364	1.12535785428364e-07	13062151	13078432	3.17940164971114e-11	13128515	13137597
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13158272	15	12	-4.4779	3.17940164971114e-11	13128515	13137597	0.0160272847180481	13148290	13208776
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13159901	13254711	26	25	-3.0566	0.0160272847180481	13148290	13208776	5.76325245620587e-08	13233514	13261173
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13256555	13256555	1	0	NA	5.76325245620587e-08	13233514	13261173	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13259414	13329968	25	23	-4.8326	NA	NA	NA	0.00540675463784998	13314244	13386118
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13330707	13767434	163	151	-3.9986	0.00540675463784998	13314244	13386118	0.0485922008278116	13508638	13776202
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13772047	13772047	1	0	NA	0.0485922008278116	13508638	13776202	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13773971	13816133	13	12	-4.8858	NA	NA	NA	1.89866862785427e-13	13812697	13823928
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13820955	13868296	12	12	-2.5176	1.89866862785427e-13	13812697	13823928	3.36101775957592e-10	13863657	13872200
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13869106	14122129	121	111	-4.5101	3.36101775957592e-10	13863657	13872200	5.92738890362566e-20	14112932	14266331
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14644293	163	142	-3.0464	5.92738890362566e-20	14112932	14266331	1.00215210843779e-07	14536962	14701706
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	15155598	114	102	-4.0181	1.00215210843779e-07	14536962	14701706	6.11289789339848e-07	15152354	15155598
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15157004	15165820	6	6	-1.5113	6.11289789339848e-07	15152354	15155598	0.000280466161832433	15165820	15175378
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15169415	15206674	21	20	-3.6498	0.000280466161832433	15165820	15175378	0.00692381804016141	15191780	15222741
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15207522	15208612	2	0	NA	0.00692381804016141	15191780	15222741	NA	NA	NA
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15209166	15241527	10	10	-2.0241	NA	NA	NA	0.000364847164643613	15227049	15241527
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15242592	15245772	4	4	-4.8808	0.000364847164643613	15227049	15241527	0.0299908784458815	15244992	15268792
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15249591	15315201	48	43	-3.7097	0.0299908784458815	15244992	15268792	1.61920195331790e-05	15303557	15339564
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15316364	15408015	58	52	-4.5516	1.6192019533179e-05	15303557	15339564	5.21591963705269e-09	15408015	15409110
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15409110	15412637	4	4	-1.5297	5.21591963705269e-09	15408015	15409110	7.57647713617511e-06	15411509	15413514
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15413514	15433122	14	14	-4.225	7.57647713617511e-06	15411509	15413514	2.35638971832725e-07	15431247	15433122
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15434486	15447091	6	6	-1.9483	2.35638971832725e-07	15431247	15433122	1.00795078734249e-09	15447091	15450495
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15448670	15473709	19	18	-4.5691	1.00795078734249e-09	15447091	15450495	0.000386628745857369	15470132	15532597
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15475310	15682936	63	57	-3.0822	0.000386628745857369	15470132	15532597	0.00039110048950089	15582236	15707307
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15687088	15915466	38	33	-4.253	0.00039110048950089	15582236	15707307	1.42087551503201e-08	15898644	15945921
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16006096	33	31	-2.499	1.42087551503201e-08	15898644	15945921	0.000150003071793288	15982684	16035717
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16007396	16103913	46	40	-3.8648	0.000150003071793288	15982684	16035717	0.00727735888152626	16066990	16124286
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16107406	16165328	16	15	-2.6408	0.00727735888152626	16066990	16124286	0.00262657568372823	16156464	16191571
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16166281	22192409	1019	935	-3.9585	0.00262657568372823	16156464	16191571	2.51293699764257e-05	22157319	22200078
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22200078	22268552	24	22	-5.3162	2.51293699764257e-05	22157319	22200078	3.66546825415006e-24	22263267	22268552
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22308420	22395796	10	10	-3.0017	3.66546825415006e-24	22263267	22268552	0.000344491715174898	22388804	22782417
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22400925	22930737	54	45	-4.4199	0.000344491715174898	22388804	22782417	5.27415737952079e-67	22926726	22930737
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	33	-0.9019	5.27415737952079e-67	22926726	22930737	5.46265709598501e-18	26945893	26950080
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	26980386	5	5	-4.427	5.46265709598501e-18	26945893	26950080	4.37449272790193e-06	26965406	26989053
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26984336	27019256	12	11	-1.1014	4.37449272790193e-06	26965406	26989053	6.24780210423203e-08	27009433	27019256
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27039222	4	4	-4.6337	6.24780210423203e-08	27009433	27019256	6.6151917453707e-08	27039222	27063070
MSK_252152917549_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	28	-1.11	6.6151917453707e-08	27039222	27063070	NA	NA	NA
