Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72537426	27894	26839	0.0014	NA	NA	NA	0	72537426	72537426
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72574479	13	10	-3.4971	0	72537426	72537426	0	72574479	72574479
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72579311	72579311	1	0	NA	0	72574479	72574479	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	86171390	4220	4069	-3e-04	NA	NA	NA	1.06272653537493e-13	86171390	86171390
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	86173546	86175273	2	2	-0.987	1.06272653537493e-13	86171390	86171390	3.58476153043927e-13	86175273	86175273
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	86179068	108203143	6794	6530	-0.0029	3.58476153043927e-13	86175273	86175273	2.33597951866439e-14	108203143	108203143
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108205691	108206802	2	2	-1.0285	2.33597951866439e-14	108203143	108203143	3.61148317322294e-14	108206802	108206802
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108207899	146290772	5241	5043	0.0129	3.61148317322294e-14	108206802	108206802	6.85919817497279e-12	146259710	147308557
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	146294654	147510532	39	37	0.2362	6.85919817497279e-12	146259710	147308557	7.6834770445817e-17	147471665	148084402
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147644831	150819879	1258	1202	-0.0141	7.6834770445817e-17	147471665	148084402	1.66467042045503e-48	150819879	150819879
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	11	0.7472	1.66467042045503e-48	150819879	150819879	3.13917645604326e-37	150851439	150851439
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	77	0.0535	3.13917645604326e-37	150851439	150851439	2.72107956454811e-18	151026228	151026228
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.8036	2.72107956454811e-18	151026228	151026228	1.16885626546963e-16	151036435	151036435
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2564	-8e-04	1.16885626546963e-16	151036435	151036435	1.06458641677651e-75	157133150	157133150
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	2.39	1.06458641677651e-75	157133150	157133150	2.43237328004891e-83	157136342	157136342
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167483267	4108	3944	0.0085	2.43237328004891e-83	157136342	157136342	3.8488623780354e-11	167477428	167483267
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	7	0.4848	3.8488623780354e-11	167477428	167483267	4.87265708323709e-11	167507898	167523140
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	173060997	2177	2087	-0.0059	4.87265708323709e-11	167507898	167523140	4.97877791235819e-17	173060997	173060997
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	173063537	173067337	3	3	-0.9302	4.97877791235819e-17	173060997	173060997	7.12233142165998e-20	173067337	173067337
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	173068576	177595302	1808	1757	0.0069	7.12233142165998e-20	173067337	173067337	1.82172925569025e-18	177595302	177595302
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	177596757	177599597	3	3	-0.8962	1.82172925569025e-18	177595302	177595302	1.88104959081673e-16	177599597	177599597
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	177601540	185979586	3218	3090	-0.0044	1.88104959081673e-16	177599597	177599597	1.22864526920220e-272	185979586	185979586
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	-4.372	1.2286452692022e-272	185979586	185979586	5.40489471571728e-274	185988138	185988138
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	200602881	4138	3981	-0.0021	5.40489471571728e-274	185988138	185988138	1.01177692974617e-12	200594055	200620756
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200609726	200667381	22	20	-0.3087	1.01177692974617e-12	200594055	200620756	1.3852570546831e-21	200644068	200673525
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200668993	246751473	17294	16669	-0.004	1.3852570546831e-21	200644068	200673525	3.01863203220654e-20	246691241	246805521
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246753652	246878405	35	35	0.2035	3.01863203220654e-20	246691241	246805521	6.57412523302076e-08	246857496	246918951
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246882156	247186514	94	93	0.0136	6.57412523302076e-08	246857496	246918951	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	3708749	1388	1339	0.0326	NA	NA	NA	2.65656591098735e-89	3708749	3708749
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	3713664	3714236	3	3	-2.0645	2.65656591098735e-89	3708749	3708749	3.19138339175888e-88	3714236	3714236
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	3718746	24452394	5691	5473	0.0272	3.19138339175888e-88	3714236	3714236	7.66958540849509e-20	24452394	24452394
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	24455322	24462631	4	4	-0.8429	7.66958540849509e-20	24452394	24452394	3.81961744988820e-19	24462631	24462631
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	24467164	34543992	4436	4267	0.0126	3.8196174498882e-19	24462631	24462631	0	34543992	34543992
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	17	-4.3667	0	34543992	34543992	0	34589997	34589997
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	52600588	7192	6915	0.0149	0	34589997	34589997	1.47046155592877e-11	52588009	52600588
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	1.47046155592877e-11	52588009	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	0.6716	NA	NA	NA	9.80010356053388e-12	52635695	52639605
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	66038336	4484	4314	0.0112	9.80010356053388e-12	52635695	52639605	8.16620088195504e-16	66038336	66038336
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66041319	66049853	3	3	-0.8685	8.16620088195504e-16	66038336	66038336	4.9621112345012e-15	66049853	66049853
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66055464	154601442	24057	23116	0.0034	4.9621112345012e-15	66049853	66049853	8.93666586880481e-91	154601442	154601442
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154605621	154606943	2	2	-2.5705	8.93666586880481e-91	154601442	154601442	7.1491320050112e-91	154606943	154606943
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154608095	179767214	8999	8680	5e-04	7.1491320050112e-91	154606943	154606943	7.75622200804857e-118	179767214	179767214
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179777850	179778919	3	3	-2.3569	7.75622200804857e-118	179767214	179767214	1.39994282260236e-117	179778919	179778919
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791128	208057199	9107	8728	-0.0017	1.39994282260236e-117	179778919	179778919	2.46123261435062e-07	208049901	208057199
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	208061390	208066245	2	2	-0.7537	2.46123261435062e-07	208049901	208057199	5.61053627585321e-11	208066245	208066245
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	208071101	242689978	12433	11979	0.0048	5.61053627585321e-11	208066245	208066245	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	164005577	53491	51518	0.0024	NA	NA	NA	2.26682718095150e-73	164005577	164005577
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	4	-1.6242	2.2668271809515e-73	164005577	164005577	3.19777089400345e-92	164027724	164027724
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	19	0.9058	3.19777089400345e-92	164027724	164027724	3.28777960013325e-106	164105613	164107951
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	191219222	9122	8737	0.0153	3.28777960013325e-106	164105613	164107951	1.46716383360785e-10	191219222	191219222
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191221758	191222891	2	2	0.9054	1.46716383360785e-10	191219222	191219222	1.18502699910165e-11	191222891	191222891
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191224191	196942158	2031	1953	0.0058	1.18502699910165e-11	191222891	191222891	1.43650980746100e-11	196929826	196946355
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196943380	196964180	9	9	0.4308	1.436509807461e-11	196929826	196946355	4.95726587723966e-12	196957322	196968244
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196966631	199329592	952	909	-0.0321	4.95726587723966e-12	196957322	196968244	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	58159	9	8	0.3041	NA	NA	NA	0.000462669914501566	58159	93573
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	61552	9815760	3384	3266	0.0237	0.000462669914501566	58159	93573	4.91992339206176e-10	9800777	9815760
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	0.6917	4.91992339206176e-10	9800777	9815760	1.04290545944082e-13	9842644	9853710
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	34439897	6166	5947	-0.005	1.04290545944082e-13	9842644	9853710	7.62900519232656e-10	34425046	34439897
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34445002	34491115	7	7	0.4451	7.62900519232656e-10	34425046	34439897	4.44019021708104e-10	34491115	34509895
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	68905670	8863	8518	-0.0169	4.44019021708104e-10	34491115	34509895	0	68905670	68905670
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	-3.5556	0	68905670	68905670	0	69165814	69165814
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	83854562	4730	4534	-0.0026	0	69165814	69165814	7.98756936240446e-20	83854562	83854562
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	83855877	83862396	4	4	-0.8411	7.98756936240446e-20	83854562	83854562	5.54827107279465e-19	83862396	83862396
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	83863683	191153613	31980	30766	-0.0118	5.54827107279465e-19	83862396	83862396	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	180644810	53766	51675	4e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	741195	281	271	0.0103	NA	NA	NA	5.39608439557268e-08	720247	756389
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	744387	820341	23	21	-0.2257	5.39608439557268e-08	720247	756389	7.40054759251156e-08	800045	831674
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	823164	1325468	185	177	0.0162	7.40054759251156e-08	800045	831674	3.43283761478587e-09	1325468	1326887
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	1326887	1334085	4	3	0.773	3.43283761478587e-09	1325468	1326887	4.33180233983961e-12	1328281	1334085
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	1337561	26811016	8873	8523	0.0025	4.33180233983961e-12	1328281	1334085	2.82665930294545e-18	26811016	26811016
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26849722	26861184	4	4	-0.8075	2.82665930294545e-18	26811016	26811016	1.7472060132602e-17	26861184	26861184
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26863540	29950805	1217	1171	4e-04	1.7472060132602e-17	26861184	26861184	1.16436065477252e-25	29941766	29962849
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	29992946	9	9	0.6556	1.16436065477252e-25	29941766	29962849	0.00111549899654743	29986370	30030032
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29995247	30040917	14	14	0.0563	0.00111549899654743	29986370	30030032	0.0390821550931774	29998009	30199769
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30046181	31385778	572	549	0.005	0.0390821550931774	29998009	30199769	1.31626442473805e-21	31383925	31385778
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31418006	6	6	-0.7865	1.31626442473805e-21	31383925	31385778	3.52397707482736e-23	31418006	31425113
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	32558677	489	473	0.0064	3.52397707482736e-23	31418006	31425113	1.46926949527509e-138	32558677	32588005
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32595402	7	6	-2.4997	1.46926949527509e-138	32558677	32588005	5.43636723009678e-05	32564884	32595402
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	32628420	7	7	0.0775	5.43636723009678e-05	32564884	32595402	6.28677549846357e-19	32628420	32628420
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32629848	32633691	3	3	-2.1428	6.28677549846357e-19	32628420	32628420	1.17073281940103e-27	32633691	32633691
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32713363	28	27	-0.1467	1.17073281940103e-27	32633691	32633691	6.11972411136077e-36	32713363	32713363
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	7	-1.9671	6.11972411136077e-36	32713363	32713363	1.59055884054867e-20	32728487	32728487
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	32745693	9	9	-0.1523	1.59055884054867e-20	32728487	32728487	0.00208518108627030	32742767	32758904
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32756637	32762061	4	4	-0.8469	0.0020851810862703	32742767	32758904	4.9344013628762e-19	32760574	32762061
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32766023	54035000	8246	7929	0.0055	4.9344013628762e-19	32760574	32762061	1.48365529959098e-31	54035000	54035000
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	1.2633	1.48365529959098e-31	54035000	54035000	1.43307504991538e-34	54042734	54042734
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	103841482	13207	12699	-0.0065	1.43307504991538e-34	54042734	54042734	9.53676783060702e-33	103841482	103841482
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	1.0643	9.53676783060702e-33	103841482	103841482	9.18668711854506e-32	103868154	103868154
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	165643653	21106	20312	-0.0086	9.18668711854506e-32	103868154	103868154	0	165643653	165643653
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165649379	3	3	-4.5879	0	165643653	165643653	0	165649379	165649379
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165650610	165650610	1	0	NA	0	165649379	165649379	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1731	0.0201	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	1036135	258	253	1e-04	NA	NA	NA	5.98910373815214e-20	1033418	1036135
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1037402	1047707	4	4	-0.9122	5.98910373815214e-20	1033418	1036135	1.68204129209108e-22	1047707	1047707
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1049599	16135701	5126	4908	0.0043	1.68204129209108e-22	1047707	1047707	5.77328561985932e-11	16135701	16135701
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	0.9214	5.77328561985932e-11	16135701	16135701	6.25931019154526e-12	16140018	16140018
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	26093050	3407	3287	-6e-04	6.25931019154526e-12	16140018	16140018	0	26093050	26093050
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26097755	26097755	1	0	NA	0	26093050	26093050	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26103844	26108369	2	2	-4.7478	NA	NA	NA	1.9118775394429e-307	26108369	26108369
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26112566	118611324	30465	29335	-0.0035	1.9118775394429e-307	26108369	26108369	3.65039737550445e-48	118611324	118611324
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	1.5423	3.65039737550445e-48	118611324	118611324	7.81012735710566e-47	118620875	118620875
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	133433384	6827	6539	-0.0017	7.81012735710566e-47	118620875	118620875	0	133433384	133437464
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	-3.7165	0	133433384	133437464	0	133444486	133448277
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141410894	3700	3564	-5e-04	0	133444486	133448277	0	141410894	141410894
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	13	-4.2108	0	141410894	141410894	0	141440184	141440184
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	142152205	293	280	0.0674	0	141440184	141440184	3.09228022694303e-08	142140540	142166710
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142156165	142192030	11	9	0.4852	3.09228022694303e-08	142140540	142166710	5.59522800337341e-13	142187073	142196011
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142194531	158821263	6574	6303	-0.0026	5.59522800337341e-13	142187073	142196011	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	117	-0.0038	NA	NA	NA	5.5753343017583e-68	581533	581533
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	2.2528	5.5753343017583e-68	581533	581533	2.68674006408446e-58	588865	588865
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	2117743	585	562	0.0097	2.68674006408446e-58	588865	588865	5.8110303511546e-76	2117743	2117743
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2121398	2165688	14	13	-1.0086	5.8110303511546e-76	2117743	2117743	4.29321312193848e-60	2165688	2165688
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2171384	2327571	37	36	-0.0051	4.29321312193848e-60	2165688	2165688	1.19000038154947e-61	2311696	2331599
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2331599	2572513	69	67	0.5768	1.19000038154947e-61	2311696	2331599	2.11913529907562e-151	2572513	2578262
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2578262	25119007	7332	7078	-0.0098	2.11913529907562e-151	2572513	2578262	1.23438457073899e-30	25119007	25119007
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25120552	25125700	4	3	1.245	1.23438457073899e-30	25119007	25119007	1.68352719904517e-33	25125700	25125700
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	39350798	4912	4735	-0.0183	1.68352719904517e-33	25125700	25125700	5.76981127517423e-211	39350798	39350798
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	57	0.7061	5.76981127517423e-211	39350798	39350798	1.03108173084831e-205	39505256	39505256
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	115701209	21738	20881	-0.0031	1.03108173084831e-205	39505256	39505256	1.15605604650530e-13	115701209	115701209
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115705898	115711730	2	2	-1.0065	1.1560560465053e-13	115701209	115701209	4.25989518049667e-17	115711730	115711730
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115718942	115718942	1	0	NA	4.25989518049667e-17	115711730	115711730	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115725316	117920478	550	531	0.0376	NA	NA	NA	1.33744420034838e-10	117917747	117920478
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	117922948	117924374	2	2	-0.7915	1.33744420034838e-10	117917747	117920478	7.20489255493924e-09	117924374	117926285
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	117926285	146264846	9140	8785	0.0376	7.20489255493924e-09	117924374	117926285	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	140145683	37944	36507	-0.0036	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9321	-0.0213	NA	NA	NA	2.62384577333417e-17	27038538	27038538
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	1.1165	2.62384577333417e-17	27038538	27038538	6.61021614797589e-17	27041812	27041812
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	76976973	14408	13861	-0.0097	6.61021614797589e-17	27041812	27041812	1.67959298677681e-07	76975661	76978679
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	76977706	76980984	4	4	-0.4935	1.67959298677681e-07	76975661	76978679	1.33236095169556e-19	76978679	76984210
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	76983402	100672415	8213	7891	0.0044	1.33236095169556e-19	76978679	76984210	3.89130344587218e-21	100670683	100672415
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100676022	100676022	1	0	NA	3.89130344587218e-21	100670683	100672415	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100678817	100686787	4	4	-0.7122	NA	NA	NA	1.07796607188918e-13	100686787	100693036
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100693036	114100979	4626	4451	-0.0028	1.07796607188918e-13	100686787	100693036	9.6711191192999e-103	114100979	114100979
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114103547	114106460	2	2	-2.6955	9.6711191192999e-103	114100979	114100979	6.53463520019577e-96	114106460	114106460
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114108041	135285645	7819	7513	0.0143	6.53463520019577e-96	114106460	114106460	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	2122855	792	749	0.0138	NA	NA	NA	1.38934666443327e-07	2122257	2122855
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	2123410	2124427	2	2	0.8308	1.38934666443327e-07	2122257	2122855	2.10016143823382e-08	2124427	2124427
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	2125618	4923300	978	940	0.0073	2.10016143823382e-08	2124427	2124427	2.00404152042633e-08	4919011	4923300
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-0.5141	2.00404152042633e-08	4919011	4923300	4.91725167024249e-13	4932214	4937118
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	55140052	15136	14538	0.005	4.91725167024249e-13	4932214	4937118	1.64984665295828e-10	55090306	55162949
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55142193	55209626	31	28	0.1751	1.64984665295828e-10	55090306	55162949	7.17514781468877e-13	55200744	55264250
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	134450318	28360	27255	0.0053	7.17514781468877e-13	55200744	55264250	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	736988	296	286	-0.0166	NA	NA	NA	2.99444088699482e-09	731485	736988
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	738240	743223	4	4	-0.6743	2.99444088699482e-09	731485	736988	2.92649052429674e-12	743223	745410
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	745410	10470425	3788	3637	0.0051	2.92649052429674e-12	743223	745410	2.05949236694158e-09	10466791	10470425
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10474825	10480460	3	3	-0.6869	2.05949236694158e-09	10466791	10470425	5.50160730436042e-09	10480460	10482217
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10482217	11104085	233	222	0.0099	5.50160730436042e-09	10480460	10482217	1.38474576523690e-08	11096366	11109483
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11104973	11140421	12	11	0.3746	1.3847457652369e-08	11096366	11109483	1.03039958435379e-10	11126558	11151185
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	28486517	6120	5898	0.0034	1.03039958435379e-10	11126558	11151185	1.60092966046071e-13	28486517	28489394
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	28489394	28492064	3	3	-0.791	1.60092966046071e-13	28486517	28489394	5.91239373361374e-13	28490565	28492064
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	28493347	31081498	692	674	-0.0015	5.91239373361374e-13	28490565	28492064	3.00612303471507e-13	31048362	31173065
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31084265	31298659	47	45	-0.2081	3.00612303471507e-13	31048362	31173065	7.70812684846671e-17	31282463	31323162
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31299898	132287226	33962	32635	-0.0067	7.7081268484667e-17	31282463	31323162	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	132289090	132289090	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	36969571	7039	6758	-0.0051	NA	NA	NA	0	36969571	36969571
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36976441	36982877	2	2	-4.9233	0	36969571	36969571	0	36982877	36982877
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36989091	37953582	297	288	0.0219	0	36982877	36982877	7.15411424325357e-21	37953582	37953582
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	1.0418	7.15411424325357e-21	37953582	37953582	1.03385102679072e-14	37957844	37957844
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	56646284	6684	6428	-0.0017	1.03385102679072e-14	37957844	37957844	6.73439862148094e-23	56610886	56657371
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56650373	56650373	1	0	NA	6.73439862148094e-23	56610886	56657371	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56681665	14	14	0.4872	NA	NA	NA	1.45971580108090e-25	56680346	56685341
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56685341	89659397	8254	7946	-0.0079	1.4597158010809e-25	56680346	56685341	9.0892969719724e-97	89659397	89659397
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	-2.5644	9.0892969719724e-97	89659397	89659397	1.24626114664300e-89	89662326	89662326
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	100690991	4785	4597	-0.0111	1.246261146643e-89	89662326	89662326	0	100690991	100690991
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-5.9755	0	100690991	100690991	0	100693892	100693892
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4367	0.0068	0	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18544772	6	5	0.2619	NA	NA	NA	3.9151786325968e-19	18537177	18544772
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	19494416	54	51	-0.5373	3.9151786325968e-19	18537177	18544772	4.73511415645022e-84	19490630	19497023
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	21633170	1038	995	-0.0129	4.73511415645022e-84	19490630	19497023	1.50670556066019e-77	21618746	21641118
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21635428	22049850	214	205	0.2534	1.50670556066019e-77	21618746	21641118	7.65684707499241e-102	22044438	22057437
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22051630	73061942	18107	17388	-0.0139	7.65684707499241e-102	22044438	22057437	9.1561907925488e-56	73061942	73061942
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73072457	2	0	NA	9.1561907925488e-56	73061942	73061942	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73075500	73092112	6	6	1.1403	NA	NA	NA	5.15843132930542e-49	73092112	73092112
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	79174722	2914	2807	-0.0096	5.15843132930542e-49	73092112	73092112	2.90214357819434e-09	79172702	79174722
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79176037	79183154	4	4	-0.6352	2.90214357819434e-09	79172702	79174722	8.3942119837539e-10	79183154	79185548
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	105597555	9297	8939	-0.0034	8.3942119837539e-10	79183154	79185548	0	105597555	105597555
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105602602	1	0	NA	0	105597555	105597555	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105606424	105632168	11	11	-2.8255	NA	NA	NA	5.03439434993438e-89	105632168	105632168
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105923159	68	65	0.0113	5.03439434993438e-89	105632168	105632168	1.04961747776623e-05	105904455	105962305
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105923686	105923686	1	0	NA	1.04961747776623e-05	105904455	105962305	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105945006	106002179	20	18	0.3484	NA	NA	NA	4.42600951476693e-05	105973615	106037440
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106358491	142	137	0.0727	4.42600951476693e-05	105973615	106037440	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18450562	4	4	-0.0655	NA	NA	NA	8.87742367850812e-07	18450562	18452491
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18452491	18886649	26	26	0.4429	8.87742367850812e-07	18450562	18452491	3.38799336498016e-07	18863056	19134391
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19109124	19537035	69	69	0.6777	3.38799336498016e-07	18863056	19134391	2.08646834536485e-203	19465359	19800789
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	32456500	3728	3579	-0.0062	2.08646834536485e-203	19465359	19800789	1.21931477439945e-123	32456500	32514939
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32514939	32594200	25	25	-0.8935	1.21931477439945e-123	32456500	32514939	1.03071729327595e-131	32583146	32594200
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32661846	32661846	1	0	NA	1.03071729327595e-131	32583146	32594200	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32664506	39269602	2369	2275	0.0061	NA	NA	NA	1.52021339193416e-07	39262083	39275397
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	39270740	39290354	10	9	-0.3597	1.52021339193416e-07	39262083	39275397	8.25282400703091e-07	39282442	39297402
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	39290931	59468560	8749	8425	-0.0096	8.25282400703091e-07	39282442	39297402	2.78263878080853e-19	59468560	59468560
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	59475528	59483715	3	3	-0.9987	2.78263878080853e-19	59468560	59468560	2.35647359271792e-21	59483715	59483715
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	59488251	62863693	1519	1464	-0.0032	2.35647359271792e-21	59483715	59483715	1.05290345879491e-15	62863693	62863693
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	62866302	62869356	3	3	-0.8594	1.05290345879491e-15	62863693	62863693	2.19634922152900e-14	62869356	62869356
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	62871651	72005403	4049	3908	0.0092	2.196349221529e-14	62869356	62869356	7.55543156307971e-08	72005403	72005403
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	72009122	72010956	2	2	0.807	7.55543156307971e-08	72005403	72005403	2.31120111729266e-07	72010956	72012207
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	72012207	74669752	1154	1108	0.0049	2.31120111729266e-07	72010956	72012207	6.43424913571931e-13	74665386	74669752
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	0.7485	6.43424913571931e-13	74665386	74669752	4.40389594581807e-14	74680439	74680439
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	99632987	9333	8970	0.0043	4.40389594581807e-14	74680439	74680439	2.3744194907378e-14	99632987	99632987
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.0661	2.3744194907378e-14	99632987	99632987	1.87847245069223e-15	99635701	99635701
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100217283	268	255	-0.0138	1.87847245069223e-15	99635701	99635701	1.26283815023755e-08	100217181	100217283
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	100278665	100298352	4	4	0.5633	1.26283815023755e-08	100217181	100217283	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	1296506	472	452	-0.0025	NA	NA	NA	4.94754392575509e-08	1290167	1296506
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1296767	1300341	3	3	0.7355	4.94754392575509e-08	1290167	1296506	2.15001153425874e-10	1300341	1302875
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1302875	54348362	13220	12740	-0.0134	2.15001153425874e-10	1300341	1302875	1.17184131543664e-20	54343465	54362111
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54352394	54379839	11	11	-0.5559	1.17184131543664e-20	54343465	54362111	6.49037375476199e-07	54376805	54390060
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	54408446	6	6	0.4293	6.49037375476199e-07	54376805	54390060	1.54365219223247e-07	54400475	54424734
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54410800	68693086	4587	4436	-0.0184	1.54365219223247e-07	54400475	54424734	7.31657211149295e-12	68687301	68710277
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68753209	10	10	0.4104	7.31657211149295e-12	68687301	68710277	1.89278581770055e-13	68751390	68842364
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	75093957	2214	2130	-0.0285	1.89278581770055e-13	68751390	68842364	2.13675718203985e-63	75093957	75093957
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	-2.1231	2.13675718203985e-63	75093957	75093957	1.82866270203729e-57	75100865	75100865
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	4930	-0.0036	1.82866270203729e-57	75100865	75100865	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	404	-0.0454	NA	NA	NA	1.76831849056832e-08	1028979	1028979
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	0.732	1.76831849056832e-08	1028979	1028979	1.20102622887755e-06	1030766	1031233
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	1904451	435	422	-0.0481	1.20102622887755e-06	1030766	1031233	5.34042813869411e-29	1904451	1904451
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906319	1906391	3	3	1.2585	5.34042813869411e-29	1904451	1904451	2.38350723462704e-32	1906391	1906391
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	31457889	11180	10746	-0.0135	2.38350723462704e-32	1906391	1906391	1.60664383408751e-36	31451114	31461588
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31503774	19	18	0.538	1.60664383408751e-36	31451114	31461588	2.36206092647659e-43	31499568	31889566
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	32828797	365	351	-0.0213	2.36206092647659e-43	31499568	31889566	0	32828797	32828797
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	-5.2253	0	32828797	32828797	0	32832642	32832642
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36675987	1449	1391	-0.0157	0	32832642	32832642	2.00130418361887e-74	36675987	36675987
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36678537	36680557	2	2	-2.4424	2.00130418361887e-74	36675987	36675987	3.48589051850352e-75	36680557	36680557
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36682031	36683509	2	0	NA	3.48589051850352e-75	36680557	36680557	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	40869151	1807	1739	-0.0166	NA	NA	NA	7.00366245979217e-07	40863808	40869151
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	40874079	41017338	5	5	-0.4957	7.00366245979217e-07	40863808	40869151	6.10230950360209e-09	41017338	41026062
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41026062	41519702	200	193	0.0031	6.10230950360209e-09	41017338	41026062	3.9392655851134e-39	41518222	41521544
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41576147	27	26	-0.4748	3.9392655851134e-39	41518222	41521544	5.66311573383315e-36	41574775	41579322
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41577520	56471985	5258	5048	-0.0076	5.66311573383315e-36	41574775	41579322	3.90488983056606e-32	56471985	56471985
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	56473793	56480300	6	5	-1.0131	3.90488983056606e-32	56471985	56471985	2.12035667052888e-31	56480300	56480300
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	56484552	72149332	5812	5589	-0.0118	2.12035667052888e-31	56480300	56480300	1.57033325882202e-20	72149332	72149332
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	72151189	72159238	5	5	-0.8263	1.57033325882202e-20	72149332	72149332	2.03623444923563e-20	72159238	72159238
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	72162800	78653545	2638	2531	-7e-04	2.03623444923563e-20	72159238	72159238	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	54022090	16554	15924	-0.0052	NA	NA	NA	5.5060524501617e-12	54022090	54023539
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	54023539	54027809	3	3	0.7683	5.5060524501617e-12	54022090	54023539	3.6192060362256e-11	54026296	54027809
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	54029609	76116026	6407	6159	0.002	3.6192060362256e-11	54026296	54027809	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	790526	219	215	-0.0374	NA	NA	NA	1.10915858737923e-14	790526	790526
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	794973	794978	2	2	1.1221	1.10915858737923e-14	790526	790526	4.7735999069905e-13	794978	794978
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	798817	1398325	271	261	-0.0202	4.7735999069905e-13	794978	794978	1.22695271708307e-36	1398325	1398325
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.8653	1.22695271708307e-36	1398325	1398325	7.3077962406538e-43	1400840	1400840
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	11448975	4678	4494	-0.0331	7.3077962406538e-43	1400840	1400840	3.73524720733946e-30	11448975	11448975
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.5654	3.73524720733946e-30	11448975	11448975	1.98904840107694e-33	11452390	11452390
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	14903239	1504	1454	-0.0432	1.98904840107694e-33	11452390	11452390	9.6753541650470e-09	14902072	14903239
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	14906155	14908619	2	2	0.7941	9.675354165047e-09	14902072	14903239	1.15091654193630e-07	14908619	14908619
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	14910693	20386500	2535	2430	-0.016	1.1509165419363e-07	14908619	14908619	9.3588263877932e-78	20386500	20399700
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20399700	20507235	17	17	-0.8855	9.3588263877932e-78	20386500	20399700	8.64359646008196e-80	20493401	20507235
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20510787	55769042	10123	9718	-0.0255	8.64359646008196e-80	20493401	20507235	1.21172399671134e-09	55769042	55769042
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55770195	55772729	2	2	-0.9226	1.21172399671134e-09	55769042	55769042	2.79243460695562e-10	55772729	55772729
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55776055	58198955	1105	1056	-0.033	2.79243460695562e-10	55772729	55772729	1.7640624147041e-11	58190177	58204170
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58201323	58249435	22	21	-0.3246	1.7640624147041e-11	58190177	58204170	1.21448304764088e-09	58239871	58264130
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58252109	59246409	482	463	-0.0508	1.21448304764088e-09	58239871	58264130	1.09682884543711e-09	59244965	59246409
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59249279	59251831	3	3	-0.7684	1.09682884543711e-09	59244965	59246409	1.55056433298923e-09	59251831	59253728
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59253728	59410642	82	79	-0.0152	1.55056433298923e-09	59251831	59253728	1.52955104320177e-10	59403499	59412581
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59411618	59434159	13	13	0.3831	1.52955104320177e-10	59403499	59412581	5.70446222058388e-15	59433190	59440274
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59434202	59434202	1	0	NA	5.70446222058388e-15	59433190	59440274	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	63788698	1994	1917	-0.0445	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	312490	114	109	-0.0467	NA	NA	NA	8.72654036412495e-41	312490	312490
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	314877	325932	6	6	-0.9957	8.72654036412495e-41	312490	312490	2.13341570961819e-37	325932	325932
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	328788	1506379	466	443	-0.01	2.13341570961819e-37	325932	325932	1.89903755056438e-157	1506379	1506379
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	9	-1.7431	1.89903755056438e-157	1506379	1506379	2.34756541804707e-178	1532433	1532433
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	4877428	1389	1316	-0.0075	2.34756541804707e-178	1532433	1532433	6.27311761192733e-119	4877428	4877428
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	4879876	4918492	18	17	-1.0242	6.27311761192733e-119	4877428	4877428	2.06768491506307e-120	4918492	4918492
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	4920758	40616108	11439	11012	-0.0012	2.06768491506307e-120	4918492	4918492	8.82602684351315e-07	40591133	40627618
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	40618544	40667597	26	25	0.2095	8.82602684351315e-07	40591133	40627618	2.37395889534733e-07	40654994	40693201
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	40669591	51718128	4273	4133	-0.0072	2.37395889534733e-07	40654994	40693201	5.72076450034471e-11	51718128	51718128
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	51721658	51724755	2	2	-0.9291	5.72076450034471e-11	51718128	51718128	3.48204946500564e-18	51724755	51724755
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	51726915	52080395	98	92	-8e-04	3.48204946500564e-18	51724755	51724755	1.36240365428463e-32	52080395	52080395
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52081719	52090393	5	5	-0.8085	1.36240365428463e-32	52080395	52080395	2.62243174241121e-19	52090393	52090393
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52092989	55905016	1031	997	0.0033	2.62243174241121e-19	52090393	52090393	2.91778049837376e-13	55905016	55905016
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	55907126	55918742	4	3	0.8779	2.91778049837376e-13	55905016	55905016	5.15804687002055e-12	55918742	55920690
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	55920690	62419534	2698	2578	0.0238	5.15804687002055e-12	55918742	55920690	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12921	-0.007	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	16521073	406	389	-0.0521	NA	NA	NA	2.27328477015288e-09	16519953	16521073
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16523019	16524408	2	2	-0.9611	2.27328477015288e-09	16519953	16521073	1.75779581926768e-10	16524408	16524408
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16525922	21571489	2113	2043	-0.0086	1.75779581926768e-10	16524408	16524408	3.2642451229375e-29	21571489	21571489
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21574577	21576859	3	3	1.2688	3.2642451229375e-29	21571489	21571489	2.21890041751356e-30	21576859	21576859
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21579649	37685496	8241	7899	-0.0034	2.21890041751356e-30	21576859	21576859	8.61972096068372e-71	37685496	37689058
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37689058	37715385	16	16	-0.8399	8.61972096068372e-71	37685496	37689058	4.34507839100825e-69	37715370	37715385
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37718669	41220567	1824	1750	-0.0328	4.34507839100825e-69	37715370	37715385	1.44178897741597e-12	41216678	41237731
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41226643	41279485	11	11	0.3886	1.44178897741597e-12	41216678	41237731	5.74631140524792e-09	41254820	41289552
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41286119	49571068	3941	3781	0.0039	5.74631140524792e-09	41254820	41289552	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	1427392	787	758	-0.0662	NA	NA	NA	2.07216638383828e-09	1427338	1427392
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	3	-0.7853	2.07216638383828e-09	1427338	1427392	3.43404304569358e-08	1432953	1434970
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2510846	821	797	-0.0736	3.43404304569358e-08	1432953	1434970	4.48243476645867e-10	2510846	2510846
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2512844	2512881	2	2	0.8912	4.48243476645867e-10	2510846	2510846	4.71875382119439e-08	2512881	2512881
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2514651	2708291	179	173	-0.0859	4.71875382119439e-08	2512881	2512881	0	2708291	2708291
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	31299786	10794	10369	0.9117	0	2708291	2708291	2.61356497448531e-28	31289273	31303521
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	31303521	31323707	10	10	0.511	2.61356497448531e-28	31289273	31303521	3.00962525167276e-07	31322205	31335004
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	31325565	47765476	5736	5516	0.9168	3.00962525167276e-07	31322205	31335004	1.03587762664973e-42	47748627	47770229
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	47766391	47845497	37	31	1.4584	1.03587762664973e-42	47748627	47770229	3.1168355884046e-43	47840342	47905326
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	47898068	103061281	11853	11423	0.8952	3.1168355884046e-43	47840342	47905326	3.50396870420348e-19	103054719	103062376
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	103062376	103109696	13	13	1.4803	3.50396870420348e-19	103054719	103062376	1.13607558603336e-08	103109696	103109696
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	103110259	103110259	1	0	NA	1.13607558603336e-08	103109696	103109696	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	103129734	103145335	3	3	0.6979	NA	NA	NA	1.78882926701094e-07	103145335	103146444
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	103146444	103234800	25	24	1.4369	1.78882926701094e-07	103145335	103146444	7.32617952466579e-30	103231402	103236983
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	103236983	153329988	16246	15644	0.911	7.32617952466579e-30	103231402	103236983	3.96796099221449e-10	153329988	153329988
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153332114	153333629	2	2	-0.1769	3.96796099221449e-10	153329988	153329988	3.34287482071169e-09	153333629	153335752
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153335752	154050185	285	277	0.8897	3.34287482071169e-09	153333629	153335752	8.73479726381859e-10	154047749	154050185
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154051619	154070179	4	4	1.674	8.73479726381859e-10	154047749	154050185	5.8127565010782e-11	154070179	154070953
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154070953	154442377	93	89	0.8941	5.8127565010782e-11	154070179	154070953	6.39420849760403e-235	154442377	154442377
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	4	-2.6063	6.39420849760403e-235	154442377	154442377	1.59547553204741e-218	154450309	154450309
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154578922	27	25	0.9024	1.59547553204741e-218	154450309	154450309	1.76305502495862e-100	154578922	154578922
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154582414	154888224	202	195	0.001	1.76305502495862e-100	154578922	154578922	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	119	-4.1704	NA	NA	NA	6.43254634122364e-27	3219200	3773948
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	15	-1.1986	6.43254634122364e-27	3219200	3773948	4.19576656048115e-17	5422507	6652845
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6951372	117	107	-3.8788	4.19576656048115e-17	5422507	6652845	0.000349747017112461	6940618	6953343
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6953343	6959256	6	6	-1.9156	0.000349747017112461	6940618	6953343	4.8029220274868e-08	6956705	6959256
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6960403	6997136	16	15	-3.5403	4.8029220274868e-08	6956705	6959256	6.72020936923214e-08	6995785	6999891
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6998513	7013903	10	8	-2.0217	6.72020936923214e-08	6995785	6999891	0.000167201604625502	7013903	7020318
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7016002	7054924	26	25	-4.0994	0.000167201604625502	7013903	7020318	0.0343939577147345	7039999	7210018
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7259689	54	49	-3.0678	0.0343939577147345	7039999	7210018	0.000642186978206272	7219774	7273713
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7261174	7307884	25	24	-1.7085	0.000642186978206272	7219774	7273713	0.000247504665069130	7292494	7332632
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7310052	7461576	42	39	-2.9967	0.00024750466506913	7292494	7332632	0.000795205756552037	7372772	7491280
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7465453	7608619	20	18	-4.184	0.000795205756552037	7372772	7491280	3.03354496115134e-05	7600570	7619476
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7612732	7630477	8	8	-2.4374	3.03354496115134e-05	7600570	7619476	1.05897717914240e-05	7619476	7643041
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7631265	7707621	43	41	-4.2002	1.0589771791424e-05	7619476	7643041	1.12224879246535e-10	7701303	7712882
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7708716	7782532	29	26	-2.6691	1.12224879246535e-10	7701303	7712882	1.47120225946737e-05	7745143	7789562
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7859390	29	29	-3.777	1.47120225946737e-05	7745143	7789562	8.72781936452027e-06	7852359	7893056
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7860364	7914104	11	11	-2.3009	8.72781936452027e-06	7852359	7893056	2.31889749059585e-08	7905553	7914104
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	7936024	6	6	-5.0352	2.31889749059585e-08	7905553	7914104	1.55692112021664e-06	7936024	7951683
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7938700	7938700	1	0	NA	1.55692112021664e-06	7936024	7951683	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7942730	8010446	15	15	-2.8309	NA	NA	NA	2.95075082175952e-08	7992221	8048263
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8016395	8289709	63	57	-4.2068	2.95075082175952e-08	7992221	8048263	6.36580131760195e-12	8259766	8292347
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8292347	8324291	12	12	-2.6158	6.36580131760195e-12	8259766	8292347	1.76483889784029e-07	8313045	8327502
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8324328	8463583	28	23	-3.6272	1.76483889784029e-07	8313045	8327502	0.00600576437504685	8414160	8532066
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8474062	8550197	28	28	-4.2463	0.00600576437504685	8414160	8532066	1.29941851401450e-05	8544417	8564257
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8551584	8697715	50	49	-3.3202	1.2994185140145e-05	8544417	8564257	0.000108010509193209	8678888	8760589
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8698878	10515697	187	169	-4.0429	0.000108010509193209	8678888	8760589	1.86761932893077e-37	10513747	10535786
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	11673476	17	16	-0.7145	1.86761932893077e-37	10513747	10535786	6.2454680132201e-21	11249952	11673476
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	12536761	11	11	-4.0629	6.2454680132201e-21	11249952	11673476	3.61169398665768e-05	12533900	12559410
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12537944	12682301	56	51	-2.1448	3.61169398665768e-05	12533900	12559410	8.36927407422328e-08	12627412	12700767
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12857197	30	26	-3.8086	8.36927407422328e-08	12627412	12700767	3.35896154727015e-08	12839975	12872417
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12859309	13129843	106	99	-2.3822	3.35896154727015e-08	12839975	12872417	8.99626373069637e-10	13109337	13138841
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13232295	33	31	-3.816	8.99626373069637e-10	13109337	13138841	0.000548114999544531	13173328	13233514
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13233514	13254711	8	8	-2.4563	0.000548114999544531	13173328	13233514	3.08693939341883e-07	13254095	13262997
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13256555	13414670	68	67	-4.1579	3.08693939341883e-07	13254095	13262997	1.64815741209700e-05	13405447	13422642
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13421917	13436273	9	9	-2.7166	1.648157412097e-05	13405447	13422642	3.31070687287893e-05	13431975	13445263
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13437661	13570660	76	74	-4.0694	3.31070687287893e-05	13431975	13445263	1.04772214029716e-08	13563756	13584982
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13572080	13705594	24	19	-2.7841	1.04772214029716e-08	13563756	13584982	7.78869687451613e-11	13699223	13729067
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716000	14342834	190	184	-4.246	7.78869687451613e-11	13699223	13729067	0.133055664249045	14013992	14352278
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14356069	6	6	-3.451	0.133055664249045	14013992	14352278	0.0253398161406752	14352278	14370346
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14358464	14358464	1	0	NA	0.0253398161406752	14352278	14370346	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14359748	14382361	14	14	-2.478	NA	NA	NA	7.59802552523695e-15	14381372	14382361
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14383746	14386474	4	4	-5.4753	7.59802552523695e-15	14381372	14382361	0.00104828120706349	14386474	14407293
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14388689	14508021	71	70	-3.1966	0.00104828120706349	14386474	14407293	2.69430068318544e-08	14498784	14528771
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	2.69430068318544e-08	14498784	14528771	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14572190	24	21	-1.5525	NA	NA	NA	7.98987202554004e-11	14569287	14572190
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14579298	14598838	7	7	-4.3108	7.98987202554004e-11	14569287	14572190	4.25038684745923e-08	14598838	14601309
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14601309	14687556	8	7	-1.6755	4.25038684745923e-08	14598838	14601309	6.8976398913101e-05	14684159	14695441
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14689490	15915466	403	379	-3.7593	6.8976398913101e-05	14684159	14695441	0.00431753555479714	15650200	15990153
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16040789	47	44	-3.0594	0.00431753555479714	15650200	15990153	0.00144630700035361	16027648	16040789
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16042014	16062961	7	5	-1.0775	0.00144630700035361	16027648	16040789	4.61209273921501e-06	16062961	16065378
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16064208	16156464	36	36	-3.2327	4.61209273921501e-06	16062961	16065378	0.00145938438565456	16068838	16362978
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16158338	16387273	72	70	-3.6125	0.00145938438565456	16068838	16362978	0.00467196028190210	16224597	16664691
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	17067188	101	97	-4.1806	0.0046719602819021	16224597	16664691	0.000351368849263645	16779212	17107617
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17073540	17196182	23	22	-3.1995	0.000351368849263645	16779212	17107617	2.78866216606619e-06	17143034	17227434
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17201569	17487972	50	44	-4.263	2.78866216606619e-06	17143034	17227434	1.88681673060614e-12	17470781	17487972
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17492482	17548302	11	11	-2.5732	1.88681673060614e-12	17470781	17487972	6.21936910570451e-05	17544651	17628298
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17557953	19610243	192	183	-4.0722	6.21936910570451e-05	17544651	17628298	2.67046208982243e-05	19608039	19610243
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19612530	19613864	2	2	-0.4708	2.67046208982243e-05	19608039	19610243	1.43370818385817e-07	19613864	19614809
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19614809	20384639	215	202	-4.1363	1.43370818385817e-07	19613864	19614809	2.62068884760111e-05	20359692	20393111
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	20387629	20496781	10	10	-2.7315	2.62068884760111e-05	20359692	20393111	3.7148231517316e-06	20479287	20598388
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	20543331	21036411	66	61	-4.2097	3.7148231517316e-06	20479287	20598388	6.32058102530522e-12	21034708	21036411
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21036503	21054605	8	7	-1.8731	6.32058102530522e-12	21034708	21036411	1.11269697681900e-07	21054605	21060047
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21057446	22139807	260	240	-3.985	1.112696976819e-07	21054605	21060047	2.47372874659061e-09	22052726	22139807
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.9369	2.47372874659061e-09	22052726	22139807	2.46100310918705e-17	22177335	22179794
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22178964	1	0	NA	2.46100310918705e-17	22177335	22179794	NA	NA	NA
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22179794	22930737	92	84	-4.3883	NA	NA	NA	1.73884934396566e-79	22930737	25737663
MSK_252152918066_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	81	-1.2691	1.73884934396566e-79	22930737	25737663	NA	NA	NA
