Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	16838573	5788	5471	0.2162	NA	NA	NA	3.64830331823051e-29	16838573	16888048
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16888048	16963812	7	7	-0.7534	3.64830331823051e-29	16838573	16888048	6.41168092219216e-31	16961001	16963812
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17080364	34869589	7099	6722	0.2076	6.41168092219216e-31	16961001	16963812	4.45552236266847e-09	34859068	34869589
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34876833	34883375	4	4	-0.4976	4.45552236266847e-09	34859068	34869589	1.13671301551635e-09	34883375	34884849
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34884849	72537426	14996	14192	0.1985	1.13671301551635e-09	34883375	34884849	1.35691508778481e-63	72537426	72537426
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	1.1558	1.35691508778481e-63	72537426	72537426	3.25990964069105e-66	72579311	72579311
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	109373255	11406	10806	0.2016	3.25990964069105e-66	72579311	72579311	3.47918802550494e-100	109373255	109373255
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109374790	109376249	2	2	-2.7833	3.47918802550494e-100	109373255	109373255	2.06109894253395e-90	109376249	109376249
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109379566	111177741	780	731	0.2078	2.06109894253395e-90	109376249	109376249	2.21168190071924e-11	111177741	111177741
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	111180807	111188857	3	3	-0.6724	2.21168190071924e-11	111177741	111177741	1.17776239715296e-11	111188857	111188857
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	111190763	147203277	4071	3825	0.1909	1.17776239715296e-11	111188857	111188857	6.2727508372284e-47	146297175	147308557
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147306304	147510532	36	36	-0.303	6.2727508372284e-47	146297175	147308557	5.84923392267411e-45	147497268	147847659
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147644831	147644831	1	0	NA	5.84923392267411e-45	147497268	147847659	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147847659	150823073	1258	1182	0.215	NA	NA	NA	2.43134319288304e-108	150823073	150836481
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150851439	10	10	1.7309	2.43134319288304e-108	150823073	150836481	2.19691851663611e-114	150848509	150851439
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2620	0.2127	2.19691851663611e-114	150848509	150851439	5.52058397415389e-67	157133150	157133150
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	2.7975	5.52058397415389e-67	157133150	157133150	1.22114726681124e-71	157136342	157136342
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	200602881	15465	14677	0.1987	1.22114726681124e-71	157136342	157136342	5.36016511181273e-09	200589108	200620756
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200609726	200667381	22	21	-0.0937	5.36016511181273e-09	200589108	200620756	4.79088110328526e-36	200649025	200678532
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200668993	236543336	13405	12710	0.2193	4.79088110328526e-36	200649025	200678532	1.52002910804292e-33	236543336	236545187
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	236545187	236551727	4	3	-0.8181	1.52002910804292e-33	236543336	236545187	5.2378084641225e-16	236549103	236551727
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	236554138	246429285	3787	3574	0.2194	5.2378084641225e-16	236549103	236551727	0	246429285	246430621
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246430621	246769018	102	91	-0.655	0	246429285	246430621	4.15964244100983e-101	246769018	246769018
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246794552	246862029	27	24	0.4581	4.15964244100983e-101	246769018	246769018	7.41762065610358e-07	246847818	246902260
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246863179	247186514	98	92	0.1736	7.41762065610358e-07	246847818	246902260	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	23242446	6625	6286	-0.4956	NA	NA	NA	0	23235717	23259056
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	23259056	33076512	4251	4018	0.2102	0	23235717	23259056	1.03548573513239e-66	33076512	33076512
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	-2.3573	1.03548573513239e-66	33076512	33076512	7.95395024932956e-74	33080437	33080437
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	34543992	644	611	0.1821	7.95395024932956e-74	33080437	33080437	0	34543992	34543992
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	17	-2.9243	0	34543992	34543992	0	34589997	34589997
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	35818921	483	458	0.2402	0	34589997	34589997	3.63360753091724e-08	35812322	35818921
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35821494	35844884	3	3	1.0131	3.63360753091724e-08	35812322	35818921	8.8500774249734e-10	35844884	35851593
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	41105253	2395	2282	0.2094	8.8500774249734e-10	35844884	35851593	0	41100433	41109660
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	41108548	52600588	4311	4081	0.6435	0	41100433	41109660	2.07728822580923e-268	52600588	52600588
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	-2.6181	2.07728822580923e-268	52600588	52600588	5.77787387652985e-257	52635695	52635695
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	76954619	8203	7737	0.6423	5.77787387652985e-257	52635695	52635695	0	76950654	76957197
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	76956006	89877995	3412	3241	0.1892	0	76950654	76957197	4.71739840787272e-11	89867747	89879264
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89879264	91270311	18	17	-0.1685	4.71739840787272e-11	89867747	89879264	2.88080438983915e-08	91173586	94942193
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	94784165	97803931	715	679	0.1321	2.88080438983915e-08	91173586	94942193	0	97801961	97812688
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	97812688	103981004	2202	2079	-0.4832	0	97801961	97812688	1.11812982138053e-58	103975354	103981004
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	103987999	104182301	30	29	0.1829	1.11812982138053e-58	103975354	103981004	5.86460961186462e-07	104139696	104203999
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	104191524	104314626	17	16	0.4974	5.86460961186462e-07	104139696	104203999	4.18407384765203e-66	104314626	104327035
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	104327035	132119809	7007	6632	-0.4792	4.18407384765203e-66	104314626	104327035	9.32460162593727e-09	131914089	132397397
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	132127941	132844051	40	37	-0.2374	9.32460162593727e-09	131914089	132397397	6.30037396535024e-12	132802797	132874509
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	132850403	146571330	4693	4456	-0.4976	6.30037396535024e-12	132802797	132874509	5.04048041868651e-89	146571330	146571330
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-2.6106	5.04048041868651e-89	146571330	146571330	8.26552128658532e-89	146592775	146592775
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	154601442	2203	2099	-0.4836	8.26552128658532e-89	146592775	146592775	1.35318463062578e-08	154599133	154601442
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154605621	154611228	4	3	0.2958	1.35318463062578e-08	154599133	154601442	4.70571121606085e-09	154611228	154612441
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154612441	156514416	490	464	-0.4656	4.70571121606085e-09	154611228	154612441	7.27595763687395e-142	156455079	156569784
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	156525599	178545984	7967	7559	-0.2168	7.27595763687395e-142	156455079	156569784	1.76217751876694e-15	178545984	178545984
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	178552260	178555242	3	3	-1.2304	1.76217751876694e-15	178545984	178545984	3.0776039808449e-15	178555242	178555242
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	178556781	242689978	22082	20901	-0.2108	3.0776039808449e-15	178555242	178555242	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	586636	198	185	-0.5217	NA	NA	NA	8.72026420978467e-07	563904	595451
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	589224	635754	12	12	-0.1192	8.72026420978467e-07	563904	595451	3.70351751335233e-07	611874	654388
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	641257	32074432	10586	10042	-0.4939	3.70351751335233e-07	611874	654388	5.17681962881261e-09	32074432	32074432
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	-1.5132	5.17681962881261e-09	32074432	32074432	8.3645000556884e-28	32080848	32094956
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	64573068	12538	11869	-0.4723	8.3645000556884e-28	32080848	32094956	1.99859267235073e-33	64565072	64580658
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	64575958	64655416	42	40	-0.8922	1.99859267235073e-33	64565072	64580658	1.9989089221875e-27	64649409	64668109
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	64659366	76072748	3535	3346	-0.5168	1.9989089221875e-27	64649409	64668109	1.33925614001232e-07	76064054	76074359
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76074359	76091014	9	8	-0.0655	1.33925614001232e-07	76064054	76074359	7.0892044555167e-07	76086048	76103369
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76092500	87013241	3115	2938	-0.5046	7.0892044555167e-07	76086048	76103369	0	87000008	87020483
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	87020483	134661619	14244	13511	0.1997	0	87000008	87020483	0	134654475	134665683
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	134662757	163536284	9140	8658	0.5942	0	134654475	134665683	7.4316149515898e-40	163490712	163562244
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163550260	163992903	67	63	0.9527	7.4316149515898e-40	163490712	163562244	0.00149680918318914	163984178	163992903
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164005577	3	3	0.4058	0.00149680918318914	163984178	163992903	1.37806620525342e-12	164005577	164005577
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	-0.7859	1.37806620525342e-12	164005577	164005577	1.21918074501547e-18	164027724	164027724
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164036648	1	0	NA	1.21918074501547e-18	164027724	164027724	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164038917	164105613	18	15	0.4069	NA	NA	NA	4.67019252896919e-18	164093750	164112873
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164107951	172822628	2647	2513	0.9095	4.67019252896919e-18	164093750	164112873	7.39924376179814e-80	172822628	172822628
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	172833275	172850471	9	7	-0.6186	7.39924376179814e-80	172822628	172822628	7.13492530526301e-47	172850471	172850471
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	172852023	172889374	19	19	0.7584	7.13492530526301e-47	172850471	172850471	2.63213638969877e-17	172886201	172897361
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	172892785	177369007	1692	1598	1.2079	2.63213638969877e-17	172886201	172897361	2.94671681084632e-18	177369007	177369007
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	177375389	177393195	3	3	0.0526	2.94671681084632e-18	177369007	177369007	1.20962903866833e-18	177393195	177393195
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	177401961	180286936	723	690	1.1943	1.20962903866833e-18	177393195	177393195	3.88434806392118e-239	180278252	180298343
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	180288576	186157855	2010	1904	0.8779	3.88434806392118e-239	180278252	180298343	1.27825681127014e-20	186142505	186173425
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	186161478	186293936	55	52	1.1789	1.27825681127014e-20	186142505	186173425	3.93993108786235e-20	186273461	186319306
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	186296740	194354505	2973	2833	0.8906	3.93993108786235e-20	186273461	186319306	0	194354505	194354505
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-2.71	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196822133	996	941	0.8833	0	194366950	194366950	7.95317421710424e-19	196807153	196911010
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196961238	31	29	1.2676	7.95317421710424e-19	196807153	196911010	4.36532472105792e-13	196945209	196970927
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196964180	199320046	950	888	0.8929	4.36532472105792e-13	196945209	196970927	0.074334367684555	199270824	199321387
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	199321387	199329592	3	3	0.441	0.074334367684555	199270824	199321387	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3207	-0.4262	NA	NA	NA	2.61136325570602e-191	9815760	9815760
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.0663	2.61136325570602e-191	9815760	9815760	1.78839211922696e-244	9842644	9842644
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	34445002	6167	5829	-0.5123	1.78839211922696e-244	9842644	9842644	3.68564412908090e-84	34445002	34445002
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	-2.2128	3.6856441290809e-84	34445002	34445002	4.99536684081775e-83	34491115	34491115
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	63346612	7653	7214	-0.4961	4.99536684081775e-83	34491115	34491115	1.34856418318918e-185	63346612	63346612
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	63357811	63358506	2	2	-4.9204	1.34856418318918e-185	63346612	63346612	2.66736712247386e-177	63358506	63358506
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	63360367	68905670	1208	1149	-0.4968	2.66736712247386e-177	63358506	63358506	7.25243852176774e-22	68899247	68905670
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	0.0995	7.25243852176774e-22	68899247	68905670	1.21421081949588e-21	69163312	69643272
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	191153613	36714	34730	-0.4812	1.21421081949588e-21	69163312	69643272	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	21480789	6352	5997	0.1654	NA	NA	NA	1.49194415494730e-39	21480789	21480789
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21485944	21487474	2	2	-1.7772	1.4919441549473e-39	21480789	21480789	6.06775847372183e-42	21487474	21487474
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21488938	52946011	7523	7142	0.1842	6.06775847372183e-42	21487474	21487474	1.89491613414162e-10	52946011	52946011
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	52947658	52952260	3	3	-0.6338	1.89491613414162e-10	52946011	52946011	2.28234118647395e-10	52952260	52963889
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	52963889	87634839	10680	10122	0.188	2.28234118647395e-10	52952260	52963889	5.98955827635156e-22	87624277	87645739
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	87636807	87636807	1	0	NA	5.98955827635156e-22	87624277	87645739	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	87645739	87717979	22	22	0.622	NA	NA	NA	4.3448986802666e-23	87714943	87727004
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	87722621	100095584	3415	3218	0.1812	4.3448986802666e-23	87714943	87727004	4.77561498069868e-18	100093290	100098502
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	100098502	100124240	8	7	-0.5112	4.77561498069868e-18	100093290	100098502	7.51369242938803e-19	100119757	100129043
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	100129043	114033978	3735	3528	0.1939	7.51369242938803e-19	100119757	100129043	2.71063511512198e-10	114033978	114033978
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	114041084	114043256	2	2	-0.7922	2.71063511512198e-10	114033978	114033978	3.52118379996084e-10	114043256	114043256
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	114046919	137449076	7177	6819	0.1897	3.52118379996084e-10	114043256	114043256	4.47417029674523e-26	137447803	137449076
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	137451446	137477397	12	11	-0.4681	4.47417029674523e-26	137447803	137449076	1.32949721113396e-24	137477397	137479011
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	137479011	140201609	1147	1099	0.2046	1.32949721113396e-24	137477397	137479011	4.8076271815575e-07	140196482	140201609
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140203440	140216524	8	8	0.6341	4.8076271815575e-07	140196482	140201609	5.92400245460403e-08	140216524	140226256
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	140533456	137	129	0.2361	5.92400245460403e-08	140216524	140226256	1.00940713308366e-14	140533456	140533456
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140535820	140538666	2	2	-0.829	1.00940713308366e-14	140533456	140533456	4.63382370839048e-10	140538666	140538666
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140541178	180342860	13420	12770	0.1801	4.63382370839048e-10	140538666	140538666	1.40898251653585e-14	180192214	180346557
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	8	0.7807	1.40898251653585e-14	180192214	180346557	1.74070715791992e-10	180355807	180364670
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	105	0.2112	1.74070715791992e-10	180355807	180364670	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	38	0.1212	NA	NA	NA	6.96096757855805e-24	191387	204881
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	326323	61	59	-0.3015	6.96096757855805e-24	191387	204881	1.03977038564348e-70	322557	329100
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	12285851	4310	4067	0.1638	1.03977038564348e-70	322557	329100	1.27146425029945e-194	12284350	12288552
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	12288552	12593263	81	75	-0.5195	1.27146425029945e-194	12284350	12288552	1.16012305345402e-203	12586259	12597277
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	12597277	20513060	2647	2527	0.2051	1.16012305345402e-203	12586259	12597277	5.15510571143217e-10	20497410	20517597
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	20515356	20557582	24	22	-0.0962	5.15510571143217e-10	20497410	20517597	1.72876834018141e-09	20555975	20569864
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	20562040	32558677	4514	4296	0.1977	1.72876834018141e-09	20555975	20569864	4.12979929649489e-61	32558677	32567462
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32633691	17	17	1.0303	4.12979929649489e-61	32558677	32567462	2.40071298245034e-10	32628420	32634977
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32700719	23	22	0.2658	2.40071298245034e-10	32628420	32634977	0.000276863289614043	32683958	32713363
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32703109	32739800	19	18	0.6276	0.000276863289614043	32683958	32713363	1.92539362222172e-16	32732764	32745693
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32742767	54035000	8253	7819	0.2013	1.92539362222172e-16	32732764	32745693	1.51453703391446e-162	54035000	54035000
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54039814	2	2	-3.7369	1.51453703391446e-162	54035000	54035000	9.20281671716527e-166	54039814	54039814
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54042734	54042734	1	0	NA	9.20281671716527e-166	54039814	54039814	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	79018959	6432	6127	0.1928	NA	NA	NA	1.30934663525701e-41	79015901	79018959
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-0.5856	1.30934663525701e-41	79015901	79018959	4.107734753296e-39	79091850	79091850
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	86128814	1881	1786	0.1866	4.107734753296e-39	79091850	79091850	3.85035927997495e-10	86128814	86128814
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	86137153	86150753	3	3	-0.6433	3.85035927997495e-10	86128814	86128814	2.39874873648926e-11	86150753	86150753
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	86155999	89458223	984	935	0.209	2.39874873648926e-11	86150753	86150753	7.44452265373715e-08	89457180	89458223
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	89458409	89462738	2	2	1.083	7.44452265373715e-08	89457180	89458223	3.71528385198708e-08	89462738	89465253
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	89465253	103841482	3892	3661	0.1936	3.71528385198708e-08	89462738	89465253	1.26053481284979e-218	103841482	103841482
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-3.0072	1.26053481284979e-218	103841482	103841482	3.94282644722326e-177	103868154	103868154
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	106363651	576	550	0.1953	3.94282644722326e-177	103868154	103868154	8.25245228815297e-95	106363651	106371364
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	106371364	106517962	33	32	-0.5739	8.25245228815297e-95	106363651	106371364	1.98575366049406e-106	106511083	106517962
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	106532863	165643653	20497	19451	0.2004	1.98575366049406e-106	106511083	106517962	3.66557677554833e-46	165643653	165643653
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165645537	1	0	NA	3.66557677554833e-46	165643653	165643653	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165648188	165649379	2	2	2.2495	NA	NA	NA	2.09693909258576e-43	165649379	165649379
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165650610	165650610	1	0	NA	2.09693909258576e-43	165649379	165649379	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	167506629	803	764	0.1649	NA	NA	NA	2.92349399439735e-67	167500374	167529143
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	167517239	167517239	1	0	NA	2.92349399439735e-67	167500374	167529143	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	167528878	167692555	63	60	0.6562	NA	NA	NA	1.14872771664535e-07	167681402	167695323
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	167695323	167752329	14	13	1.0191	1.14872771664535e-07	167681402	167695323	1.50767591648352e-41	167752329	168040442
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	168040442	170753106	923	885	0.1735	1.50767591648352e-41	167752329	168040442	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	136373	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	138059	45655152	16223	15379	0.2006	NA	NA	NA	1.36900892036777e-78	45654090	45658681
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	45658681	45729236	31	30	-0.5086	1.36900892036777e-78	45654090	45658681	4.7728423357408e-66	45728020	45730598
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	45730598	64503984	3302	3131	0.1764	4.7728423357408e-66	45728020	45730598	6.51706736750079e-07	64501423	64515225
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64509220	64532949	7	7	-0.2976	6.51706736750079e-07	64501423	64515225	1.29860439397735e-08	64516764	64535845
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64534167	89666806	7526	7140	0.2043	1.29860439397735e-08	64516764	64535845	2.91801841627356e-21	89658699	89669184
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	89669184	89722512	25	22	0.6395	2.91801841627356e-21	89658699	89669184	9.6032837612e-21	89720524	89730323
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	89725322	109966116	8151	7709	0.2109	9.6032837612e-21	89720524	89730323	1.81488614264573e-10	109966116	109966116
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109967918	109974402	3	3	-0.6258	1.81488614264573e-10	109966116	109966116	1.23957290887236e-10	109974402	109974402
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109976628	116646307	3093	2919	0.1987	1.23957290887236e-10	109974402	109974402	3.44214470665270e-74	116641854	116649464
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	116649464	116785511	70	64	0.664	3.4421447066527e-74	116641854	116649464	7.44253594174383e-66	116776274	116790981
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	116788040	133437464	7665	7270	0.2047	7.44253594174383e-66	116776274	116790981	0	133437464	133437464
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133439454	133448277	6	6	-3.2326	0	133437464	133437464	0	133448277	133448277
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141410894	3700	3508	0.2103	0	133448277	133448277	8.85728545605489e-14	141406414	141419692
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	12	0.676	8.85728545605489e-14	141406414	141419692	2.19250452981650e-11	141432778	141443577
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	142152205	294	280	0.2364	2.1925045298165e-11	141432778	141443577	3.82508179448668e-08	142149857	142159173
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142156165	142166710	4	4	-0.4076	3.82508179448668e-08	142149857	142159173	6.2883661454688e-13	142166710	142166710
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142167901	142167908	2	2	-2.6384	6.2883661454688e-13	142166710	142166710	8.80684699503669e-81	142167908	142167908
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142176074	151728811	3971	3753	0.2048	8.80684699503669e-81	142167908	142167908	2.22224104184352e-12	151726377	151728811
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151730250	151730250	1	0	NA	2.22224104184352e-12	151726377	151728811	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151732266	151740878	6	5	-0.5138	NA	NA	NA	6.25119571759755e-11	151740878	151743145
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151743145	158804557	2598	2456	0.19	6.25119571759755e-11	151740878	151743145	9.04110420062224e-08	158804557	158804557
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158811268	158815157	2	2	-0.7559	9.04110420062224e-08	158804557	158804557	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158821263	158821263	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	114	-0.1323	NA	NA	NA	1.65949537872695e-22	581533	581533
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-1.5332	1.65949537872695e-22	581533	581533	6.08205846282546e-19	588865	588865
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	9092336	2606	2466	-0.1371	6.08205846282546e-19	588865	588865	1.98749008042038e-08	9092336	9092336
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	9094419	9098712	2	2	-1.0836	1.98749008042038e-08	9092336	9092336	2.33978718518233e-16	9098712	9098712
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	9100830	9393168	98	90	-0.064	2.33978718518233e-16	9098712	9098712	1.91868204521666e-16	9393168	9393168
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	9396495	9398400	2	2	-1.0824	1.91868204521666e-16	9393168	9393168	8.6755451542095e-10	9398400	9398400
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	9400746	39333945	10241	9665	-0.0844	8.6755451542095e-10	9398400	9398400	2.54942425462046e-18	39310815	39368509
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39339800	39530374	70	67	0.1485	2.54942425462046e-18	39310815	39368509	6.25921943583161e-18	39499752	39552040
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39533030	41632439	643	612	-0.0872	6.25921943583161e-18	39499752	39552040	1.36370907393597e-179	41622771	41638585
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	41633248	57416543	3502	3306	0.1709	1.36370907393597e-179	41622771	41638585	0	57393378	57490268
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	57449612	66945900	2615	2506	-0.0803	0	57393378	57490268	0	66937702	66954471
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	66954471	70944715	1499	1425	0.451	0	66937702	66954471	2.24791958346428e-297	70917620	70975495
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	70946576	80826102	2663	2525	0.6928	2.24791958346428e-297	70917620	70975495	3.82018827814431e-13	80826102	80826102
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	80826167	80831629	2	2	-0.4353	3.82018827814431e-13	80826102	80826102	4.49554873210413e-52	80831629	80831629
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	80831995	115701209	10807	10225	0.5958	4.49554873210413e-52	80831629	80831629	1.25405619687833e-54	115701209	115701209
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115705898	115711730	2	2	-0.5549	1.25405619687833e-54	115701209	115701209	2.37535893199758e-12	115711730	115711730
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115718942	142878805	8518	8042	0.5682	2.37535893199758e-12	115711730	115711730	0	142872281	142893223
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	142879808	146264846	1175	1111	0.2959	0	142872281	142893223	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	6685358	2471	2337	-0.5058	NA	NA	NA	3.57758572748439e-43	6685358	6685358
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	6692831	6698290	3	3	-2.2007	3.57758572748439e-43	6685358	6685358	6.74678426875806e-43	6698290	6698290
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	6701392	19873106	4430	4209	-0.5058	6.74678426875806e-43	6698290	6698290	0	19871500	19875132
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	19875132	21780832	751	716	0.1727	0	19871500	19875132	0	21776419	21784148
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	21784148	33605258	3070	2890	-0.494	0	21776419	21784148	0	33603514	33607671
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	33607671	36484088	1170	1119	0.1999	0	33603514	33607671	0	36478743	36497743
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	36497743	70926188	1177	1114	-0.4635	0	36478743	36497743	3.33620827768288e-21	70926188	70926188
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.1225	3.33620827768288e-21	70926188	70926188	1.83840567506001e-23	70930528	70930528
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	125167905	18688	17713	-0.4955	1.83840567506001e-23	70930528	70930528	4.26560926620045e-09	125152146	125180751
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	125171954	125171954	1	0	NA	4.26560926620045e-09	125152146	125180751	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	125172156	125198857	22	22	-0.183	NA	NA	NA	3.50025248505286e-07	125191783	125206397
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	125199808	129219834	1720	1630	-0.4602	3.50025248505286e-07	125191783	125206397	1.75201167973053e-43	129219834	129219834
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	129221786	129224728	3	3	-2.2447	1.75201167973053e-43	129219834	129219834	6.20492775656752e-38	129224728	129224728
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	129226241	140138841	4434	4158	-0.3876	6.20492775656752e-38	129224728	129224728	6.5202062165945e-41	140138841	140138841
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	140145632	140145683	2	2	-2.7489	6.5202062165945e-41	140138841	140138841	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	126361	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	128878	18645697	6593	6247	-0.4751	NA	NA	NA	0	18643739	18649783
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	18649783	19678838	296	281	0.1562	0	18643739	18649783	4.53045830540485e-06	19654466	19707294
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	19684451	19723973	9	9	0.5471	4.53045830540485e-06	19654466	19707294	8.48705578436033e-07	19702624	19739638
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	19727728	20862602	460	432	0.1554	8.48705578436033e-07	19702624	19739638	0	20852611	20865538
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	20865538	27038538	2370	2238	-0.4775	0	20852611	20865538	3.42152886157474e-14	27038538	27038538
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	0.7709	3.42152886157474e-14	27038538	27038538	2.32888965359176e-12	27041812	27041812
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	28170202	421	405	-0.4514	2.32888965359176e-12	27041812	27041812	1.58049954411741e-138	28166398	28172173
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	28172173	28401992	100	95	0.1787	1.58049954411741e-138	28166398	28172173	6.34347453529027e-132	28400784	28403528
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	28403528	28767980	155	144	-0.4982	6.34347453529027e-132	28400784	28403528	0	28764219	28769431
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	28769431	43949353	3615	3442	0.1923	0	28764219	28769431	1.24515752464837e-08	43942380	43949353
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	43958486	43975914	3	3	-0.5683	1.24515752464837e-08	43942380	43949353	9.18235966392483e-08	43975914	43993784
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	43987680	43987680	1	0	NA	9.18235966392483e-08	43975914	43993784	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	43993784	56115736	3005	2852	0.1629	NA	NA	NA	1.99573260025593e-32	56114489	56115736
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	56118633	56138767	10	9	1.0046	1.99573260025593e-32	56114489	56115736	3.13045041735959e-31	56138767	56140996
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	56140996	70941924	4631	4412	0.195	3.13045041735959e-31	56138767	56140996	7.62995309434909e-13	70938362	70947915
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70945853	70960187	7	7	-0.4024	7.62995309434909e-13	70938362	70947915	7.98837659742924e-117	70952973	70964344
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70964344	114864599	15676	14852	0.1415	7.98837659742924e-117	70952973	70964344	3.91051923742419e-114	114858549	114868518
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114866642	114935182	33	33	0.5317	3.91051923742419e-114	114858549	114868518	2.46290941105387e-31	114928489	114946844
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114937168	124163720	3464	3277	0.1002	2.46290941105387e-31	114928489	114946844	2.86418231780854e-138	124161219	124165393
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124165393	124300548	62	58	-0.5816	2.86418231780854e-138	124161219	124165393	8.09155181274957e-120	124297847	124302738
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124302738	127563278	1176	1103	0.101	8.09155181274957e-120	124297847	124302738	2.85419087520779e-12	127556450	127568592
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127566573	127590461	12	12	-0.3772	2.85419087520779e-12	127556450	127568592	3.72509570511688e-11	127584068	127607438
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127592138	135285645	2706	2575	0.083	3.72509570511688e-11	127584068	127607438	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	11400790	4549	4286	0.1112	NA	NA	NA	3.18546146861541e-233	11398624	11405873
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	11402749	11605703	99	95	-0.6107	3.18546146861541e-233	11398624	11405873	1.94299389877430e-274	11602833	11608113
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	11608113	49663240	12069	11451	0.1516	1.9429938987743e-274	11602833	11608113	1.34439184074249e-61	49646824	49685235
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49666382	49699428	8	7	-0.2339	1.34439184074249e-61	49646824	49685235	2.55343279507327e-06	49689576	49728026
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49701463	66463477	4857	4605	0.1869	2.55343279507327e-06	49689576	49728026	2.84202742925267e-43	66463477	66463477
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	-1.9447	2.84202742925267e-43	66463477	66463477	3.32349092997982e-47	66469412	66469412
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	97298865	10404	9845	0.1698	3.32349092997982e-47	66469412	66469412	0	97297350	97306181
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	97306181	134450318	13316	12634	-0.3675	0	97297350	97306181	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	7905005	3254	3093	0.185	NA	NA	NA	1.56062012770194e-08	7884886	7915879
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7913049	7975671	27	23	0.4633	1.56062012770194e-08	7884886	7915879	1.73727108488225e-07	7961626	7989709
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7977034	8090628	43	40	0.1875	1.73727108488225e-07	7961626	7989709	2.35607094134479e-81	8088697	8092618
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	8092618	9523923	418	394	-0.4701	2.35607094134479e-81	8088697	8092618	6.72198136463512e-12	9523923	9523923
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9531133	2	2	-1.5779	6.72198136463512e-12	9523923	9523923	6.64752609472603e-10	9531133	9531133
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9543817	11109483	582	554	-0.4646	6.64752609472603e-10	9531133	9531133	2.12631263980664e-49	11109483	11109483
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11110735	11140421	10	10	0.6272	2.12631263980664e-49	11109483	11109483	5.20584152537351e-43	11140421	11140421
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	11395862	70	68	-0.4504	5.20584152537351e-43	11140421	11140421	3.78956935359088e-13	11389830	11395862
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11440927	7	7	0.259	3.78956935359088e-13	11389830	11395862	3.37600944874407e-17	11440927	11452868
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11452868	23758848	4132	3907	-0.4833	3.37600944874407e-17	11440927	11452868	8.0184154036913e-45	23753030	23758848
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	23760599	23807044	25	25	0.1445	8.0184154036913e-45	23753030	23758848	1.15972978301609e-60	23807044	23808415
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	23808415	24233245	219	204	-0.4788	1.15972978301609e-60	23807044	23808415	0	24233245	24233245
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	24234333	31132762	2366	2243	0.7687	0	24233245	24233245	2.89317863675084e-22	31081498	31188761
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31169263	31296973	42	40	0.426	2.89317863675084e-22	31081498	31188761	1.64632045771398e-21	31282463	31305068
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31298659	39601547	1840	1749	0.772	1.64632045771398e-21	31282463	31305068	0	39601547	39601547
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	39604209	41303729	626	595	-0.4827	0	39601547	39601547	9.24274356619439e-51	41303729	41303729
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	41307749	41312478	3	3	-2.3027	9.24274356619439e-51	41303729	41303729	1.88968638053343e-47	41312478	41312478
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	41315922	46440068	1570	1492	-0.4832	1.88968638053343e-47	41312478	41312478	0	46437463	46441367
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46441367	47809770	615	583	0.1712	0	46437463	46441367	0	47807525	47813448
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	47813448	52131764	1924	1809	-0.4372	0	47807525	47813448	0	52126796	52135536
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	52134037	52134037	1	0	NA	0	52126796	52135536	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	52135536	76384021	8005	7554	0.1765	NA	NA	NA	0	76376799	76387633
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	76387633	79040642	879	832	-0.4828	0	76376799	76387633	1.70856835683248e-11	79040642	79040642
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	79052277	79057793	2	2	-1.6092	1.70856835683248e-11	79040642	79040642	9.12997923515678e-13	79057793	79057793
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	79069482	85393337	1899	1792	-0.4745	9.12997923515678e-13	79057793	79057793	5.2655240254228e-148	85393337	85393337
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	85396905	85425614	13	12	-2.0382	5.2655240254228e-148	85393337	85393337	2.9450760626778e-129	85425614	85425614
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	85430884	93973231	2289	2152	-0.4854	2.9450760626778e-129	85425614	85425614	0	93971998	93976308
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	93976308	110545622	6358	6049	0.1646	0	93971998	93976308	0	110539652	110547703
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	110547703	117097341	2338	2210	-0.4657	0	110539652	110547703	0	117095905	117099410
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	117099410	123893481	2743	2582	0.2115	0	117095905	117099410	8.05957108273845e-27	123889071	123897630
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	123895520	123927025	16	16	-0.373	8.05957108273845e-27	123889071	123897630	2.26488711061861e-25	123922931	123929959
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	123929959	130943064	2291	2179	0.1719	2.26488711061861e-25	123922931	123929959	1.35246790626858e-31	130943064	130943064
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.8777	1.35246790626858e-31	130943064	130943064	5.46773314401733e-27	130946248	130946248
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	521	0.2205	5.46773314401733e-27	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	36969571	7039	6669	-0.4939	NA	NA	NA	1.78611724768471e-08	36964477	36969571
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36976441	36982877	2	2	0.5007	1.78611724768471e-08	36964477	36969571	7.12279218083846e-09	36982877	36982877
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36989091	47772195	4209	4014	-0.493	7.12279218083846e-09	36982877	36982877	3.25515496951228e-215	47772195	47774537
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	47774537	47819258	21	21	-1.9774	3.25515496951228e-215	47772195	47774537	2.77291546048504e-216	47817280	47819258
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	47821324	56650373	2754	2589	-0.4874	2.77291546048504e-216	47817280	47819258	8.89756457685036e-17	56610886	56658479
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56686863	16	15	0.0018	8.89756457685036e-17	56610886	56658479	5.72455605855955e-18	56680346	56691355
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56688605	72528550	4011	3793	-0.5078	5.72455605855955e-18	56680346	56691355	5.9322801210252e-106	72517558	72534337
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	72529749	73120817	173	170	-0.1398	5.9322801210252e-106	72517558	72534337	1.10091423202204e-97	73097174	73137009
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	73125434	90866466	4402	4187	-0.4885	1.10091423202204e-97	73097174	73137009	7.28087075657442e-26	90862207	90866466
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	90869131	90904640	16	15	0.1117	7.28087075657442e-26	90862207	90866466	1.24539211344736e-22	90904640	90907861
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	90906420	94300264	1564	1476	-0.48	1.24539211344736e-22	90904640	90907861	2.94382452733217e-274	94269029	94314154
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	94303014	99389333	2285	2155	-0.2261	2.94382452733217e-274	94269029	94314154	4.17023792333525e-09	99387760	99389333
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	99391127	99392556	2	2	0.7382	4.17023792333525e-09	99387760	99389333	1.99949106717851e-10	99392556	99392556
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	99393720	100690991	586	546	-0.2274	1.99949106717851e-10	99392556	99392556	1.7188088395468e-39	100690991	100690991
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-2.237	1.7188088395468e-39	100690991	100690991	1.06482189895149e-37	100693892	100693892
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4332	-0.2335	1.06482189895149e-37	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	40676611	7648	7254	0.2143	NA	NA	NA	6.63834707559097e-09	40651178	40680589
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40741934	9	9	0.6433	6.63834707559097e-09	40651178	40680589	3.05622342237207e-09	40726930	40760176
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40746865	56202474	4641	4395	0.2022	3.05622342237207e-09	40726930	40760176	3.83656450632977e-12	56198249	56216571
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	56202503	56250873	11	10	-0.275	3.83656450632977e-12	56198249	56216571	2.80789676800321e-11	56228616	56258721
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	56255054	69086125	5319	5051	0.1985	2.80789676800321e-11	56228616	56258721	1.20204491307456e-10	69083716	69086125
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69092211	3	3	1.0385	1.20204491307456e-10	69083716	69086125	1.06981595684629e-11	69092211	69092211
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69093444	73061942	1788	1691	0.1645	1.06981595684629e-11	69092211	69092211	2.06664224256384e-21	73061942	73061942
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73082262	4	3	-1.0042	2.06664224256384e-21	73061942	73061942	2.65016805029312e-21	73082262	73082262
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73083141	79172702	2917	2739	0.1695	2.65016805029312e-21	73082262	73082262	5.17940825952172e-07	79171460	79172702
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79174722	79176037	2	0	NA	5.17940825952172e-07	79171460	79172702	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79177462	79183154	3	3	-0.5201	NA	NA	NA	1.32373354337794e-06	79183154	79185548
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	105787390	9330	8838	0.1684	1.32373354337794e-06	79183154	79185548	2.16889046314528e-12	105783533	105787390
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105788623	105795807	5	5	-0.5455	2.16889046314528e-12	105783533	105787390	6.8248770048698e-07	105795807	105799261
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105798116	105850033	22	22	0.1099	6.8248770048698e-07	105795807	105799261	1.39989900261026e-05	105843086	105850033
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105875924	5	5	-0.4475	1.39989900261026e-05	105843086	105850033	5.72333435892268e-07	105875924	105881893
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881677	105946993	18	17	0.1726	5.72333435892268e-07	105875924	105881893	2.72650318878369e-11	105945006	105951399
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105948347	106002179	18	16	-0.4098	2.72650318878369e-11	105945006	105951399	1.20934344043525e-18	105996176	106013552
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106358491	142	137	0.1429	1.20934344043525e-18	105996176	106013552	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.189	NA	NA	NA	7.59573169196073e-09	18450562	18692865
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	19109124	26	26	-0.2935	7.59573169196073e-09	18450562	18692865	1.37245979009358e-11	18886649	19126890
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19117783	19537035	68	65	0.0573	1.37245979009358e-11	18886649	19126890	5.37760253311481e-12	19430207	19800789
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	19845942	11	11	-0.4631	5.37760253311481e-12	19430207	19800789	1.90444233103307e-20	19845942	19845942
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19874677	19882711	3	3	-1.3986	1.90444233103307e-20	19845942	19845942	1.30465754533669e-15	19882711	19882711
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19910696	20088256	43	41	-0.4584	1.30465754533669e-15	19882711	19882711	4.80195090800694e-35	20079935	20316992
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	20308014	1	0	NA	4.80195090800694e-35	20079935	20316992	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20310916	21648018	275	256	0.0143	NA	NA	NA	1.70230479103988e-118	21622026	21669222
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	21653701	24508058	830	784	0.3811	1.70230479103988e-118	21622026	21669222	0	24502357	24511090
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	24509782	28370699	1146	1083	-0.0231	0	24502357	24511090	1.11293823417193e-16	28370699	28370699
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	28439781	28439781	1	0	NA	1.11293823417193e-16	28370699	28370699	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	28728864	28731195	2	2	-1.262	NA	NA	NA	6.17994796108544e-16	28731195	28731195
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	28736608	59152448	12444	11753	-0.0134	6.17994796108544e-16	28731195	28731195	2.89315087426232e-17	59152448	59152448
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	59153917	59155004	2	2	-1.0417	2.89315087426232e-17	59152448	59152448	1.72308729200456e-10	59155004	59155004
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	59156887	69675884	4641	4380	-0.0139	1.72308729200456e-10	59155004	59155004	2.4327645219099e-167	69675884	69678446
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	69678446	69716684	24	22	-1.224	2.4327645219099e-167	69675884	69678446	4.30988263303139e-08	69709553	69724132
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	69717843	69756846	21	21	-1.8199	4.30988263303139e-08	69709553	69724132	5.13373925327028e-189	69756846	69756846
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	69758371	69758371	1	0	NA	5.13373925327028e-189	69756846	69756846	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	69759452	70312441	287	274	-0.2523	NA	NA	NA	1.47484255996049e-131	70288877	70328095
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	70314883	99632987	11217	10626	-0.0304	1.47484255996049e-131	70288877	70328095	8.2150552837631e-99	99632987	99632987
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.2451	8.2150552837631e-99	99632987	99632987	2.67201647741802e-14	99635701	99635701
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100217283	268	258	-0.014	2.67201647741802e-14	99635701	99635701	0.000247637241147333	100212174	100282819
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	100278665	100298352	4	4	0.4891	0.000247637241147333	100212174	100282819	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	8397615	3213	3031	0.2001	NA	NA	NA	2.04984013912493e-18	8389710	8404775
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	8404775	8419134	3	3	-0.6125	2.04984013912493e-18	8389710	8404775	1.05789193052845e-08	8414592	8426716
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	8426716	27243115	5901	5606	0.179	1.05789193052845e-08	8414592	8426716	3.27341494911938e-12	27240165	27243115
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	27244587	27256211	6	6	-0.4775	3.27341494911938e-12	27240165	27243115	2.24284089505248e-13	27256211	27259091
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	27259091	31862577	1449	1370	0.2081	2.24284089505248e-13	27256211	27259091	1.91031460375365e-77	31854794	32379126
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32379126	33868686	52	50	-0.3631	1.91031460375365e-77	31854794	32379126	2.71330308130575e-62	33846647	34058222
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34054713	49277927	1665	1573	0.1608	2.71330308130575e-62	33846647	34058222	1.41420217514698e-19	49275084	49277927
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	49279995	49283872	2	2	1.0459	1.41420217514698e-19	49275084	49277927	1.49977642936260e-08	49283872	49283872
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	49285438	76925748	8845	8362	0.0872	1.4997764293626e-08	49283872	49283872	5.97492836836239e-62	76925748	76925748
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	1.3349	5.97492836836239e-62	76925748	76925748	2.21474501845221e-64	76940218	76940218
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	87308012	3921	3724	0.0675	2.21474501845221e-64	76940218	76940218	2.79537835594714e-09	87296625	87324785
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	87313483	87330963	9	9	-0.2788	2.79537835594714e-09	87296625	87324785	8.37756441222235e-06	87317585	87340712
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	87333773	88690571	583	558	0.1261	8.37756441222235e-06	87317585	87340712	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	13927318	5798	5489	-0.4522	NA	NA	NA	1.57422959290953e-21	13881571	13950640
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	13930944	13963264	17	17	-0.2273	1.57422959290953e-21	13881571	13950640	5.16905867700458e-05	13942648	13980743
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	13965221	15727076	487	464	-0.4933	5.16905867700458e-05	13942648	13980743	2.92775224330501e-07	15629313	15727076
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15731356	15733964	2	2	0.4044	2.92775224330501e-07	15629313	15727076	3.21086576946966e-11	15733964	15737241
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15737241	31461588	5734	5415	-0.455	3.21086576946966e-11	15733964	15737241	3.10013308309015e-17	31451114	31470227
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31462463	31499568	17	16	-0.9628	3.10013308309015e-17	31451114	31470227	1.15792994183789e-17	31486540	31889566
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31503774	36673853	1816	1727	-0.4312	1.15792994183789e-17	31486540	31889566	6.6891342373566e-38	36673853	36673853
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	5	-1.8027	6.6891342373566e-38	36673853	36673853	6.41137262845492e-41	36683509	36683509
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	36684619	1	0	NA	6.41137262845492e-41	36683509	36683509	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	40197977	1509	1419	-0.4091	NA	NA	NA	2.82566571801854e-07	40193392	40197977
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	40200362	40209353	6	6	0.1411	2.82566571801854e-07	40193392	40197977	2.28871926446768e-07	40209353	40216593
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	40213056	41519702	496	473	-0.3981	2.28871926446768e-07	40209353	40216593	2.94677142121058e-122	41518222	41521544
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41710400	67	65	-1.0927	2.94677142121058e-122	41518222	41521544	1.85128685177943e-133	41708551	42142363
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	78653545	13679	12955	-0.4066	1.85128685177943e-133	41708551	42142363	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	4316	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	108760	75273869	22647	21490	0.1938	NA	NA	NA	8.24387407268308e-13	75264292	75275503
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	75275503	75294258	9	9	0.6311	8.24387407268308e-13	75264292	75275503	2.07856958310162e-07	75291671	75300905
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	75295688	76116026	307	292	0.1879	2.07856958310162e-07	75291671	75300905	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	452	-0.3067	NA	NA	NA	4.14583992288232e-09	1398325	1398325
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	0.815	4.14583992288232e-09	1398325	1398325	1.45607315978469e-09	1400840	1400840
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	3743274	1103	1039	-0.342	1.45607315978469e-09	1400840	1400840	8.30618877205508e-12	3742137	3753646
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3745674	3757771	7	6	-1.0868	8.30618877205508e-12	3742137	3753646	5.65417286327764e-11	3753646	3759328
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3759328	7529598	1773	1678	-0.3878	5.65417286327764e-11	3753646	3759328	0	7523681	7534121
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	7531399	32977237	6794	6420	0.046	0	7523681	7534121	0	32929768	32989636
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	32979681	43712060	3939	3745	0.3972	0	32929768	32989636	0.0679486798280812	43624621	43717806
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	43715260	43722603	6	6	0.1538	0.0679486798280812	43624621	43717806	3.03109032357230e-07	43722603	43727219
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	43725612	56825794	5758	5431	-0.414	3.0310903235723e-07	43722603	43727219	1.00421837227766e-111	56825794	56825794
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56828073	56840346	7	6	-2.5621	1.00421837227766e-111	56825794	56825794	1.99186582169153e-112	56840346	56840346
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	63788698	3178	3017	-0.4617	1.99186582169153e-112	56840346	56840346	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	567	0.0968	NA	NA	NA	6.79881107192164e-105	1506379	1518825
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	9	-1.7252	6.79881107192164e-105	1506379	1518825	4.92589141727616e-157	1521410	1531162
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	29501315	8534	8066	0.1241	4.92589141727616e-157	1521410	1531162	2.18625248801016e-08	29496085	29503997
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	29501535	29501535	1	0	NA	2.18625248801016e-08	29496085	29503997	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	29503997	29512137	5	4	-0.5318	NA	NA	NA	1.48854640047164e-09	29508960	29518550
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	29513496	29516335	2	0	NA	1.48854640047164e-09	29508960	29518550	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	29518550	62419534	12442	11788	0.1881	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	10165953	21	21	-0.432	NA	NA	NA	1.35896052812475e-32	10152384	10167413
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	10167413	20073260	2207	2097	0.111	1.35896052812475e-32	10152384	10167413	9.38750840337677e-129	20058687	20079737
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	20075847	21171378	243	234	0.4431	9.38750840337677e-129	20058687	20079737	5.03859731009063e-05	21169607	21171378
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	21172108	21173600	3	3	-0.0424	5.03859731009063e-05	21169607	21171378	0.00081141381338632	21173600	21185346
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	21174766	22573420	589	554	-0.509	0.00081141381338632	21173600	21185346	2.07020358581587e-59	22573420	22573420
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	22577751	22585040	3	3	-2.5698	2.07020358581587e-59	22573420	22573420	3.50253244485498e-56	22585040	22585040
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	22589739	46922972	10375	9814	-0.4755	3.50253244485498e-56	22585040	22585040	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	16521073	405	378	-0.4501	NA	NA	NA	6.82913878783433e-49	16521073	16521073
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16523019	16524408	2	2	-3.0802	6.82913878783433e-49	16521073	16521073	1.06365155701882e-54	16524408	16524408
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16525922	22667608	2575	2412	-0.416	1.06365155701882e-54	16524408	16524408	1.69830658338449e-46	22644243	22677959
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	22	0.3279	1.69830658338449e-46	22644243	22677959	9.70648929761136e-58	22721042	22735036
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	35472378	6547	6192	-0.4597	9.70648929761136e-58	22721042	22735036	2.51143490364576e-17	35472378	35472378
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-1.9097	2.51143490364576e-17	35472378	35472378	4.855017825957e-17	35476942	35476942
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49510491	6987	6614	-0.4102	4.855017825957e-17	35476942	35476942	9.5722037168476e-10	49383607	49525071
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	49511506	49571068	16	13	-0.6025	9.5722037168476e-10	49383607	49525071	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	-0.289	NA	NA	NA	9.9191829609933e-06	94062	98390
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	95819	1	0	NA	9.9191829609933e-06	94062	98390	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	98390	104486	5	5	-1.6246	NA	NA	NA	0.146804613903175	99430	104486
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	104732	104732	1	0	NA	0.146804613903175	99430	104486	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	109064	3	3	-0.913	NA	NA	NA	1.42544247817342e-05	108902	110101
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	110101	159609	37	36	-0.3084	1.42544247817342e-05	108902	110101	0.00901246068100109	147375	170802
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	159991	207612	12	11	-0.5669	0.00901246068100109	147375	170802	0.000158517172866594	164985	214780
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	207641	207641	1	0	NA	0.000158517172866594	164985	214780	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	208495	257005	50	46	-0.1611	NA	NA	NA	3.89817917884628e-06	242628	281091
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	258980	258980	1	0	NA	3.89817917884628e-06	242628	281091	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	259017	2672401	1649	1564	-0.3904	NA	NA	NA	6.75594532888241e-05	2659101	2695951
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672477	2708291	27	25	-0.6689	6.75594532888241e-05	2659101	2695951	1.35162744236365e-135	2708291	2708291
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	76998610	22939	21661	0.4218	1.35162744236365e-135	2708291	2708291	4.10107291392659e-47	76998610	76998610
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	-1.8627	4.10107291392659e-47	76998610	76998610	2.31175081077605e-50	77010018	77010018
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	147283730	19494	18367	0.4248	2.31175081077605e-50	77010018	77010018	3.21464931610954e-27	147274323	147283730
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	147289875	147337015	13	13	1.0891	3.21464931610954e-27	147274323	147283730	1.18053640126526e-20	147337015	147345138
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	147341079	147341079	1	0	NA	1.18053640126526e-20	147337015	147345138	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	147343471	152655026	2012	1899	0.4517	NA	NA	NA	1.66774227846399e-10	152652738	152655026
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152656332	152657445	2	2	-0.7183	1.66774227846399e-10	152652738	152655026	3.12837485461991e-08	152657445	152669192
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152669192	154038318	538	514	0.4385	3.12837485461991e-08	152657445	152669192	2.16015423582195e-17	154037006	154038318
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154078819	11	11	1.1551	2.16015423582195e-17	154037006	154038318	5.01187171834633e-17	154078819	154079002
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154442377	90	88	0.4793	5.01187171834633e-17	154078819	154079002	1.71469209819847e-59	154442377	154442377
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	4	-1.9088	1.71469209819847e-59	154442377	154442377	1.09389207563943e-35	154450309	154450309
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	28	0.4737	1.09389207563943e-35	154450309	154450309	5.13959221372112e-60	154578922	154586690
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	185	-0.3828	5.13959221372112e-60	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	117	-2.8222	NA	NA	NA	6.02502681917369e-14	3034907	3733715
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	4948824	13	13	-0.6912	6.02502681917369e-14	3034907	3733715	1.50770194286805e-10	4948824	6652845
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5422507	6953343	121	118	-2.8413	1.50770194286805e-10	4948824	6652845	2.80834454122331e-08	6925683	6998513
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6954864	7653082	216	203	-2.0445	2.80834454122331e-08	6925683	6998513	4.06739416932501e-05	7614571	7660965
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7688250	21	21	-3.27	4.06739416932501e-05	7614571	7660965	3.25408866473917e-05	7679075	7693377
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7688718	7702787	9	9	-1.7184	3.25408866473917e-05	7679075	7693377	1.64778733079483e-11	7702787	7702787
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7703962	7708716	4	4	-4.3294	1.64778733079483e-11	7702787	7702787	3.05608463744603e-05	7708716	7712882
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7709619	7914104	68	66	-1.9645	3.05608463744603e-05	7708716	7712882	8.15824991451826e-07	7905553	7914104
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	7930528	5	5	-4.3796	8.15824991451826e-07	7905553	7914104	8.05101534359686e-14	7930528	7936024
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7936024	8005148	16	16	-1.8255	8.05101534359686e-14	7930528	7936024	7.48445977896363e-05	7996758	8059682
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8010446	8289709	64	62	-2.9505	7.48445977896363e-05	7996758	8059682	5.49684824905386e-07	8219845	8327502
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8292347	8690572	113	109	-2.1366	5.49684824905386e-07	8219845	8327502	5.30646854013888e-05	8573516	8770463
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8692156	10501368	185	170	-2.7251	5.30646854013888e-05	8573516	8770463	4.3515833181885e-15	10480759	10506718
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10503821	12452734	26	26	-0.9536	4.3515833181885e-15	10480759	10506718	1.71896324443153e-14	11673476	12452734
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12536761	9	9	-3.6965	1.71896324443153e-14	11673476	12452734	8.55130327866647e-13	12536761	12542979
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12537944	12687167	57	55	-1.5777	8.55130327866647e-13	12536761	12542979	3.09060423741826e-07	12658135	12715696
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12696242	12792780	16	16	-2.8743	3.09060423741826e-07	12658135	12715696	1.67485470881432e-05	12764220	12852769
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12796639	13129843	119	114	-1.6689	1.67485470881432e-05	12764220	12852769	7.9735294758986e-17	13101234	13151875
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13918652	275	262	-2.6055	7.9735294758986e-17	13101234	13151875	8.97947565257829e-05	13773971	13978955
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13918766	14098914	91	89	-3.1683	8.97947565257829e-05	13773971	13978955	1.27675946174041e-10	14083239	14169526
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14100001	14694578	182	166	-2.2613	1.27675946174041e-10	14083239	14169526	0.000100200195402388	14596156	14696387
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14695441	14729413	21	18	-3.4022	0.000100200195402388	14596156	14696387	6.19580426109507e-06	14721033	14734647
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14731122	14765141	10	9	-2.1672	6.19580426109507e-06	14721033	14734647	0.000187145335579431	14747796	14796505
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14771401	14875973	16	15	-3.3597	0.000187145335579431	14747796	14796505	0.0435514494532727	14841337	15146521
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14883615	15313932	149	140	-2.4223	0.0435514494532727	14841337	15146521	1.89054085744555e-05	15287893	15329893
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15315201	15382506	42	40	-3.4179	1.89054085744555e-05	15287893	15329893	0.00080528152059503	15354021	15429742
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15383973	15915466	161	152	-2.6192	0.00080528152059503	15354021	15429742	0.00534810087581683	15583573	16036892
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16191571	115	113	-2.1354	0.00534810087581683	15583573	16036892	8.22564249112104e-07	16156464	16377188
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16194420	16194420	1	0	NA	8.22564249112104e-07	16156464	16377188	NA	NA	NA
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16195788	22930737	1086	1013	-2.7181	NA	NA	NA	1.35815776321271e-40	22918955	26871442
MSK_252152918087_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	83	-1.1265	1.35815776321271e-40	22918955	26871442	NA	NA	NA
