Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	17102601	5800	5508	0.0079	NA	NA	NA	2.42593927327161e-08	17094326	17102601
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17104345	17112697	3	3	1.0151	2.42593927327161e-08	17094326	17102601	7.26270604189547e-09	17112697	17114337
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17114337	72537426	22091	20949	-0.007	7.26270604189547e-09	17112697	17114337	1.35171605917685e-31	72536231	72540240
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	0.8562	1.35171605917685e-31	72536231	72540240	7.47096282866648e-34	72571158	72589682
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	150823073	17557	16673	-0.0021	7.47096282866648e-34	72571158	72589682	6.78082013001921e-12	150818222	150836481
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150851439	10	10	0.6127	6.78082013001921e-12	150818222	150836481	2.48347894644011e-13	150847304	150857070
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	75	-0.0084	2.48347894644011e-13	150847304	150857070	3.93852402943777e-09	151024118	151028700
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.7797	3.93852402943777e-09	151024118	151028700	4.10155615107487e-07	151033188	151040463
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	161099582	4303	4107	8e-04	4.10155615107487e-07	151033188	151040463	1.10928404014344e-09	161099067	161099582
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161104752	161104791	2	2	-1.2713	1.10928404014344e-09	161099067	161099582	2.60560721920499e-10	161104791	161104791
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161108722	200596027	13838	13134	-0.0016	2.60560721920499e-10	161104791	161104791	5.14615691531279e-12	200582647	200612164
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200598243	200673525	29	29	-0.3601	5.14615691531279e-12	200582647	200612164	9.58091551423166e-12	200661094	200696309
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200676505	247186514	17419	16573	0.0013	9.58091551423166e-12	200661094	200696309	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	10934	0.0093	NA	NA	NA	2.70991069439031e-12	34539603	34554208
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34580533	15	15	0.5184	2.70991069439031e-12	34539603	34554208	1.56580738442580e-12	34574224	34589997
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34582272	146571330	33537	31890	0.0043	1.5658073844258e-12	34574224	34589997	1.43676024226605e-11	146571330	146571330
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	3	1.1121	1.43676024226605e-11	146571330	146571330	2.43994111312118e-12	146592775	146592775
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	203889616	18725	17769	-0.0042	2.43994111312118e-12	146592775	146592775	1.18027590523864e-09	203886922	203889616
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	203892886	203898334	4	4	-0.8673	1.18027590523864e-09	203886922	203889616	4.22315426183008e-09	203898334	203900226
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	203900226	242689978	14020	13284	0.0021	4.22315426183008e-09	203898334	203900226	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	4112650	1534	1450	0.0064	NA	NA	NA	5.24521982724183e-111	4109224	4114414
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	4114414	4269573	58	55	-0.7394	5.24521982724183e-111	4109224	4114414	1.19889199935133e-103	4265768	4276073
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	4276073	46769081	14333	13617	0.0077	1.19889199935133e-103	4265768	4276073	2.75436861568245e-15	46767765	46772869
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46771035	46825048	8	8	-0.7604	2.75436861568245e-15	46767765	46772869	1.17407232089771e-13	46819069	46827727
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46827727	47460892	285	276	7e-04	1.17407232089771e-13	46819069	46827727	7.59577837329528e-49	47460892	47460892
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	-2.7803	7.59577837329528e-49	47460892	47460892	5.31604231168577e-53	47466921	47466921
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	163347163	37179	35385	0.0027	5.31604231168577e-53	47466921	47466921	7.7709002666994e-09	163325000	163347163
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163364841	163433686	10	9	0.5642	7.7709002666994e-09	163325000	163347163	3.63771607229857e-10	163433686	163449758
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163442988	163992903	79	77	-0.0129	3.63771607229857e-10	163433686	163449758	8.89154338244372e-38	163989367	164001657
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164107951	28	24	0.7994	8.89154338244372e-38	163989367	164001657	3.63845735047967e-52	164100804	164112873
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	191215072	9120	8649	-0.0023	3.63845735047967e-52	164100804	164112873	4.03108291341156e-22	191215072	191215072
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191217656	191219222	2	0	NA	4.03108291341156e-22	191215072	191215072	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191221758	191222891	2	2	-1.8244	NA	NA	NA	3.97635127613052e-21	191222891	191222891
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191224191	199324677	2991	2844	-0.0173	3.97635127613052e-21	191222891	191222891	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	199329592	199329592	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3229	0.0338	NA	NA	NA	1.51276562127192e-147	9815760	9821327
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-3.4281	1.51276562127192e-147	9815760	9821327	9.1625798284425e-164	9832823	9842644
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	68905670	15036	14262	-0.0038	9.1625798284425e-164	9832823	9842644	4.71758703178187e-08	68896316	69075140
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69163312	13	11	0.4633	4.71758703178187e-08	68896316	69075140	9.85557586547917e-08	69139037	69665979
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69165814	69165814	1	0	NA	9.85557586547917e-08	69139037	69665979	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	94073863	8448	8050	-0.0039	NA	NA	NA	1.32300384834926e-09	94070673	94073863
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94076749	94084961	3	3	-0.9928	1.32300384834926e-09	94070673	94073863	9.39324922717385e-10	94084961	94086315
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94086315	158384367	18564	17644	-0.006	9.39324922717385e-10	94084961	94086315	6.24691615584992e-22	158378651	158389892
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	158386004	158440892	23	22	0.5283	6.24691615584992e-22	158378651	158389892	4.63748192832593e-22	158435533	158447946
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	158444104	191153613	9676	9176	-0.0031	4.63748192832593e-22	158435533	158447946	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	776194	223	207	0.0355	NA	NA	NA	7.54896470228786e-21	737829	776194
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	812169	873365	7	7	-1.0849	7.54896470228786e-21	737829	776194	2.94589062977737e-27	873365	873365
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	905462	180644810	53536	50870	0.0029	2.94589062977737e-27	873365	873365	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	26811016	9366	8917	0.0053	NA	NA	NA	5.55970752945817e-14	26811016	26811016
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26849722	26853170	2	2	-1.4676	5.55970752945817e-14	26811016	26811016	4.25245110504383e-13	26853170	26853170
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26855591	32558677	2309	2171	0.0055	4.25245110504383e-13	26853170	26853170	1.87600363835662e-83	32558677	32564884
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32605300	10	10	-1.6579	1.87600363835662e-83	32558677	32564884	4.45438375172068e-15	32597877	32609525
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32609525	32713363	35	35	-0.1134	4.45438375172068e-15	32597877	32609525	3.57397615805878e-13	32709263	32716255
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	8	-1.4672	3.57397615805878e-13	32709263	32716255	5.0782238382093e-10	32728487	32728487
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	32745036	8	8	0.0719	5.0782238382093e-10	32728487	32728487	1.43928894447836e-05	32739800	32756637
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32745693	32745693	1	0	NA	1.43928894447836e-05	32739800	32756637	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32756637	32762061	4	4	-1.1264	NA	NA	NA	2.67543226549668e-16	32760574	32762061
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32766023	54035000	8246	7845	0.001	2.67543226549668e-16	32760574	32762061	2.13911719264809e-52	54035000	54035000
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-2.2987	2.13911719264809e-52	54035000	54035000	7.33153769892787e-57	54042734	54042734
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	103841482	13207	12581	-0.0035	7.33153769892787e-57	54042734	54042734	2.33997123460570e-65	103841482	103841482
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-2.1357	2.3399712346057e-65	103841482	103841482	5.14878202891113e-62	103868154	103868154
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	165643653	21106	20079	-0.0034	5.14878202891113e-62	103868154	103868154	1.65353455972226e-65	165643653	165643653
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	2.1859	1.65353455972226e-65	165643653	165643653	8.22510255650383e-57	165650610	165650610
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1708	0.0225	8.22510255650383e-57	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	136373	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	138059	20004156	6675	6351	0.0018	NA	NA	NA	7.9945052738956e-59	20000596	20008768
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	20008768	20113678	28	28	-0.7911	7.9945052738956e-59	20000596	20008768	1.52182934297966e-58	20109261	20116282
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	20116282	109217320	28257	26826	-0.0012	1.52182934297966e-58	20109261	20116282	2.30705486429185e-91	109217320	109217320
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109230336	109233214	3	3	-3.0073	2.30705486429185e-91	109217320	109217320	0.00355385739271492	109231462	109233214
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109236813	109240210	2	2	-1.2864	0.00355385739271492	109231462	109233214	9.35142587980626e-11	109240210	109240210
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109244233	118611324	4299	4085	-0.0087	9.35142587980626e-11	109240210	109240210	9.78487960409367e-22	118611324	118611324
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	-1.472	9.78487960409367e-22	118611324	118611324	1.04148450324047e-20	118620875	118620875
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	133433384	6827	6506	-5e-04	1.04148450324047e-20	118620875	118620875	4.4396937892742e-118	133433384	133436265
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	7	-2.2793	4.4396937892742e-118	133433384	133436265	3.47156214335112e-115	133447868	133448277
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	142967639	4351	4135	0.0075	3.47156214335112e-115	133447868	133448277	1.53262342845489e-16	142927390	143056351
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143056351	143097006	8	8	-0.8119	1.53262342845489e-16	142927390	143056351	1.20956114433337e-16	143065411	143150737
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143150737	156483966	5176	4897	4e-04	1.20956114433337e-16	143065411	143150737	7.74037601161927e-11	156480019	156483966
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156485711	156492262	4	3	1.0802	7.74037601161927e-11	156480019	156483966	1.79573851407272e-09	156492262	156494044
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156494044	158821263	1053	1001	0.0162	1.79573851407272e-09	156492262	156494044	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	25022606	8129	7701	0.0113	NA	NA	NA	8.16390241171346e-50	25022606	25022606
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	-2.2281	8.16390241171346e-50	25022606	25022606	1.15706559727446e-49	25039370	25039370
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	39350798	4942	4667	-0.0084	1.15706559727446e-49	25039370	25039370	0	39350798	39356595
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	56	-2.5801	0	39350798	39356595	0	39500219	39505256
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	144968840	30980	29442	0.0048	0	39500219	39505256	7.42835572700889e-10	144968840	144968840
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144970607	144970777	2	2	1.0998	7.42835572700889e-10	144968840	144968840	2.31325922031636e-06	144970777	144972090
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144972090	146264846	451	433	0.0012	2.31325922031636e-06	144970777	144972090	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	70926188	13072	12423	8e-04	NA	NA	NA	1.12893574456905e-27	70926188	70926188
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-1.9976	1.12893574456905e-27	70926188	70926188	3.40700795160427e-26	70930528	70930528
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	116124007	15468	14715	-0.0071	3.40700795160427e-26	70930528	70930528	4.25576183651892e-29	116124007	116124007
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	2.0873	4.25576183651892e-29	116124007	116124007	8.6334311055643e-28	116130333	116130333
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	118469713	872	826	0.0323	8.6334311055643e-28	116130333	116130333	1.46735915189714e-33	118466125	118472944
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	118472944	118508319	15	15	0.8652	1.46735915189714e-33	118466125	118472944	1.21048781151542e-33	118507634	118512861
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	118512861	140145683	8513	8048	-0.0032	1.21048781151542e-33	118507634	118512861	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9232	-0.0044	NA	NA	NA	1.51730541196342e-65	27038538	27038538
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-3.1491	1.51730541196342e-65	27038538	27038538	1.92701013704987e-64	27041812	27041812
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	77917893	14861	14151	-0.01	1.92701013704987e-64	27041812	27041812	5.91460292219558e-40	77917893	77917893
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-2.4915	5.91460292219558e-40	77917893	77917893	8.77948785330379e-39	77928669	77928669
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	135285645	20214	19224	0.0079	8.77948785330379e-39	77928669	77928669	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4920907	1771	1675	0.0039	NA	NA	NA	4.5072914136892e-108	4920907	4920907
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4923300	4923300	1	0	NA	4.5072914136892e-108	4920907	4920907	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-2.714	NA	NA	NA	3.03448417182039e-119	4932214	4932214
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	18896166	5595	5308	0.0085	3.03448417182039e-119	4932214	4932214	1.78267972467089e-09	18890351	18896166
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18906505	18917191	6	6	-0.7111	1.78267972467089e-09	18890351	18896166	1.84105297922283e-09	18917191	18932031
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18929375	49671267	9341	8851	0.0054	1.84105297922283e-09	18917191	18932031	1.41960815953494e-11	49663240	49685235
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49683052	49701463	7	7	-0.7239	1.41960815953494e-11	49663240	49685235	1.57672179519813e-10	49697128	49721954
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49710027	55118214	179	175	-0.0716	1.57672179519813e-10	49697128	49721954	1.19862331799566e-25	55097806	55129329
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55217189	40	39	-0.55	1.19862331799566e-25	55097806	55129329	5.64817361410458e-39	55202450	55221692
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	134450318	28359	26910	0.0045	5.64817361410458e-39	55202450	55221692	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3556	0.0054	NA	NA	NA	1.95889166439834e-15	9456107	9531133
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9590351	12	11	0.6861	1.95889166439834e-15	9456107	9531133	7.65005188489433e-20	9582696	9604633
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9599999	9599999	1	0	NA	7.65005188489433e-20	9582696	9604633	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	10464018	330	312	-0.0419	NA	NA	NA	4.93700339837671e-07	10457163	10470425
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10465787	10484956	8	8	-0.5526	4.93700339837671e-07	10457163	10470425	7.5604146289693e-08	10477903	10498541
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10485848	10485848	1	0	NA	7.5604146289693e-08	10477903	10498541	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10491341	11395862	312	292	0.007	NA	NA	NA	1.01578827448073e-09	11389830	11395862
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11435643	6	5	-0.778	1.01578827448073e-09	11389830	11395862	6.04414389332985e-09	11435643	11440927
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	132289090	40749	38718	-0.0034	6.04414389332985e-09	11435643	11440927	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	56650373	14025	13294	-6e-04	NA	NA	NA	4.36186259715808e-16	56610886	56650373
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56681665	14	13	0.6179	4.36186259715808e-16	56610886	56650373	8.8220554656791e-18	56681665	56688605
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56685341	56685341	1	0	NA	8.8220554656791e-18	56681665	56688605	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	67868481	2634	2510	8e-04	NA	NA	NA	3.42881132573783e-16	67859182	67868481
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	67882690	67900173	4	4	-1.0626	3.42881132573783e-16	67859182	67868481	2.30345395649032e-15	67900173	67900173
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	67907098	114123340	14966	14209	0.0067	2.30345395649032e-15	67900173	67900173	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	105787390	31675	30064	-0.0078	NA	NA	NA	5.69906892513335e-10	105776293	105789767
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105788623	105798116	6	6	-0.7181	5.69906892513335e-10	105776293	105789767	1.54976113588764e-05	105794161	105800545
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105799261	105856972	23	23	-0.0886	1.54976113588764e-05	105794161	105800545	2.49849949591485e-08	105856591	105856972
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105872360	105875924	3	3	-1.0905	2.49849949591485e-08	105856591	105856972	7.28041816241976e-14	105875924	105875924
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881677	105945006	17	17	-0.0382	7.28041816241976e-14	105875924	105875924	1.32989984462980e-07	105923159	105951399
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105946993	106015449	21	20	-0.4924	1.3298998446298e-07	105923159	105951399	1.42097586796499e-15	106002179	106028863
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106017453	106358491	140	136	0.0345	1.42097586796499e-15	106002179	106028863	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	20742444	303	281	0.0371	NA	NA	NA	2.5063025329105e-06	20731330	20760283
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20760283	21218234	5	5	-0.6949	2.5063025329105e-06	20731330	20760283	6.54264452596672e-07	21213950	21243858
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	21236096	50258775	10789	10267	-0.0101	6.54264452596672e-07	21213950	21243858	3.22576198419598e-09	50258775	50258775
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	50259919	50261214	2	2	-1.245	3.22576198419598e-09	50258775	50258775	5.98632528347849e-09	50261214	50262943
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	50262943	75115806	10786	10219	-0.012	5.98632528347849e-09	50261214	50262943	4.65717947475183e-17	75115806	75115806
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	-1.6834	4.65717947475183e-17	75115806	75115806	2.41483807567574e-17	75119713	75119713
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	100298352	9435	8944	-0.001	2.41483807567574e-17	75119713	75119713	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	6595366	2570	2442	-0.0016	NA	NA	NA	3.8417710645341e-12	6584081	6604318
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	6597826	6634165	19	18	0.4926	3.8417710645341e-12	6584081	6604318	1.76747513208433e-13	6631089	6640639
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	6636496	32379126	7984	7575	-0.0077	1.76747513208433e-13	6631089	6640639	1.57940095650232e-07	31804884	32534410
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33527454	40	37	0.2583	1.57940095650232e-07	31804884	32534410	3.39503794954054e-07	33505210	34061029
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33528385	54348362	3082	2952	9e-04	3.39503794954054e-07	33505210	34061029	3.49748127054295e-11	54339225	54353978
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54352394	54379839	11	10	-0.6065	3.49748127054295e-11	54339225	54353978	4.0074290062589e-11	54376805	54399890
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	75093957	6817	6481	-0.0064	4.0074290062589e-11	54376805	54399890	3.8293037091276e-11	75092501	75093957
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-1.1018	3.8293037091276e-11	75092501	75093957	4.71352479981923e-10	75100865	75102639
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	4879	0.0057	4.71352479981923e-10	75100865	75102639	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	15727076	6302	5997	-0.0053	NA	NA	NA	8.14645132950856e-53	15727076	15727076
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15731356	15733964	2	2	-2.9662	8.14645132950856e-53	15727076	15727076	1.30599401170819e-53	15733964	15733964
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15737241	36673853	7567	7153	-0.0175	1.30599401170819e-53	15733964	15733964	6.33736137101563e-13	36672710	36673853
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	5	-0.9514	6.33736137101563e-13	36672710	36673853	7.28813776167427e-13	36683509	36684619
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	78653545	15758	14932	-0.0087	7.28813776167427e-13	36683509	36684619	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	1890337	640	616	-0.0248	NA	NA	NA	2.74670565435177e-30	1888264	1899725
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	1896337	1973621	21	19	-0.6816	2.74670565435177e-30	1888264	1899725	2.03694827231795e-29	1968531	1978605
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	1975578	36509250	10321	9802	-0.0033	2.03694827231795e-29	1968531	1978605	1.11390594779031e-32	36509250	36509250
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36514792	36519728	2	2	-2.2021	1.11390594779031e-32	36509250	36509250	3.3340161042533e-32	36519728	36519728
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36524577	76110964	11978	11363	0.0076	3.3340161042533e-32	36519728	36519728	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	76113758	76116026	2	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	461	-0.0157	NA	NA	NA	1.3566059129288e-09	1398325	1398325
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.2177	1.3566059129288e-09	1398325	1398325	2.55528501582307e-08	1400840	1400840
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	36732075	10741	10186	-0.0251	2.55528501582307e-08	1400840	1400840	7.70588624857619e-08	36717520	36732075
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	36737097	36756022	5	5	-0.79	7.70588624857619e-08	36717520	36732075	3.38616781221040e-08	36756022	36760353
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	36760353	58208527	9227	8758	-0.0284	3.3861678122104e-08	36756022	36760353	3.3740352592726e-07	58197961	58213220
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58212113	58239871	13	12	-0.4918	3.3740352592726e-07	58197961	58213220	1.48085439839589e-06	58234974	58254174
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58241773	59414898	575	545	-0.0377	1.48085439839589e-06	58234974	58254174	4.61274236049593e-18	59414645	59421197
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434202	10	9	-0.897	4.61274236049593e-18	59414645	59421197	7.70827736751141e-19	59434159	59440262
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	63788698	1994	1891	-0.0307	7.70827736751141e-19	59434159	59440262	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1516966	589	559	-0.0077	NA	NA	NA	2.27891720824991e-55	1516966	1521410
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1518825	1531162	6	6	-1.7735	2.27891720824991e-55	1516966	1521410	1.41187989792896e-57	1525300	1531162
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	19957	9e-04	1.41187989792896e-57	1525300	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12750	-5e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	22667608	2982	2851	-0.0057	NA	NA	NA	2.90355906314345e-20	22643742	22682428
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22720195	20	18	0.6233	2.90355906314345e-20	22643742	22682428	1.07592881539400e-20	22713972	22725305
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22721042	37621766	7739	7367	0.0011	1.075928815394e-20	22713972	22725305	1.96936405851375e-54	37621766	37621766
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37624278	37626069	2	2	-2.9905	1.96936405851375e-54	37621766	37621766	2.71681030140216e-49	37626069	37626069
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37633961	49571068	5813	5504	-0.0058	2.71681030140216e-49	37626069	37626069	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	2303218	1402	1326	-0.0323	NA	NA	NA	3.77171261389644e-11	2303218	2303218
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2304008	2304398	2	2	-1.4321	3.77171261389644e-11	2303218	2303218	1.96008245722306e-11	2304398	2306110
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2708113	388	370	-0.0477	1.96008245722306e-11	2304398	2306110	0	2708113	2711273
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2708291	2708291	1	0	NA	0	2708113	2711273	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	28153808	9465	8969	0.849	NA	NA	NA	1.85632548515596e-12	28134551	28170223
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	28162390	28222454	9	9	1.4713	1.85632548515596e-12	28134551	28170223	4.23421752439763e-20	28208384	28241300
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	28227839	76998610	13465	12812	0.8271	4.23421752439763e-20	28208384	28241300	1.90852364489547e-19	76998610	76998610
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	-1.2392	1.90852364489547e-19	76998610	76998610	9.53966344351175e-21	77010018	77010018
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	94793449	2974	2800	0.843	9.53966344351175e-21	77010018	77010018	1.25441700689771e-10	94789265	94793449
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	94794639	94802907	7	7	1.6492	1.25441700689771e-10	94789265	94793449	2.00611559077928e-28	94802907	94812187
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	94803967	94803967	1	0	NA	2.00611559077928e-28	94802907	94812187	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	94805973	154028488	19075	18115	0.8445	NA	NA	NA	3.97338282706998e-24	154017980	154044828
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154031239	154078819	14	14	1.2884	3.97338282706998e-24	154017980	154044828	4.81901713589738e-06	154056623	154095976
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154582414	122	117	0.8161	4.81901713589738e-06	154056623	154095976	6.4179150552494e-135	154570196	154586690
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	189	0.0098	6.4179150552494e-135	154570196	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	115	-2.3451	NA	NA	NA	1.94273503804126e-14	2973379	3773948
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3733715	1	0	NA	1.94273503804126e-14	2973379	3773948	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-0.4698	NA	NA	NA	9.43373906069468e-09	4948824	6696721
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6953343	118	115	-2.0893	9.43373906069468e-09	4948824	6696721	3.55748951230003e-05	6900119	7020318
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6954864	7481187	182	175	-1.5104	3.55748951230003e-05	6900119	7020318	0.000306165678164590	7342985	7640681
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7485594	7485594	1	0	NA	0.00030616567816459	7342985	7640681	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7491280	7709619	68	65	-2.1506	NA	NA	NA	0.000589385878020263	7679075	7717556
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7782532	27	26	-1.2052	0.000589385878020263	7679075	7717556	7.46123967355268e-05	7751430	7832896
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	8414160	156	148	-2.1729	7.46123967355268e-05	7751430	7832896	1.94583063484733e-05	8230756	8490437
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8427047	8432342	2	0	NA	1.94583063484733e-05	8230756	8490437	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8437780	8697715	85	82	-1.5511	NA	NA	NA	3.41521522695202e-05	8666055	8802502
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8698878	10515697	187	179	-2.1374	3.41521522695202e-05	8666055	8802502	1.43829813120027e-11	10506718	10515697
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	11673476	17	14	-0.2629	1.43829813120027e-11	10506718	10515697	7.44862010053286e-17	11673476	11673476
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	12502304	3	3	-1.6285	7.44862010053286e-17	11673476	11673476	0.00339441709053411	12502304	12527445
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12511461	12541506	10	10	-2.8967	0.00339441709053411	12502304	12527445	7.52424537437956e-10	12537944	12546917
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	53	-1.1825	7.52424537437956e-10	12537944	12546917	1.10632903560996e-09	12661168	12700767
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12776542	15	14	-2.7675	1.10632903560996e-09	12661168	12700767	7.72363909814204e-10	12745259	12804329
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12786515	13129843	121	114	-1.1646	7.72363909814204e-10	12745259	12804329	2.5959002159121e-26	13111594	13147329
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13596448	202	193	-2.3113	2.5959002159121e-26	13111594	13147329	1.33219767501129e-05	13568153	13606316
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13597813	13705594	16	16	-1.1145	1.33219767501129e-05	13568153	13606316	1.13348089863609e-05	13692518	13760710
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716000	14407293	221	208	-2.2566	1.13348089863609e-05	13692518	13760710	3.15354244834566e-09	14370346	14425003
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14409145	14579298	91	88	-1.5444	3.15354244834566e-09	14370346	14425003	0.00121688947417671	14503185	14758901
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15201695	147	143	-2.0488	0.00121688947417671	14503185	14758901	6.53772787861486e-05	15176870	15205160
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15203221	15241527	16	16	-0.9003	6.53772787861486e-05	15176870	15205160	6.64294813800998e-05	15227049	15257187
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15242592	15915466	254	239	-2.0877	6.64294813800998e-05	15227049	15257187	0.000600576221410569	15580942	16042014
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16325391	152	148	-1.653	0.000600576221410569	15580942	16042014	1.41806519470416e-10	16224597	16449115
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16330184	17482749	183	176	-2.3918	1.41806519470416e-10	16224597	16449115	0.00357530027552732	16899198	17893954
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17487972	22192409	779	730	-2.086	0.00357530027552732	16899198	17893954	4.51315383886623e-06	22157319	22205568
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22200078	22263267	23	23	-3.1822	4.51315383886623e-06	22157319	22205568	7.35939590053104e-06	22244581	22393417
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22268552	22268552	1	0	NA	7.35939590053104e-06	22244581	22393417	NA	NA	NA
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22308420	22877495	46	44	-2.1294	NA	NA	NA	0.00887634611434695	22845338	22915679
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22878671	25737663	20	20	-2.8922	0.00887634611434695	22845338	22915679	9.29674014965368e-15	22930737	26872527
MSK_252152918090_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	57440809	84	82	-1.0775	9.29674014965368e-15	22930737	26872527	NA	NA	NA
