Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	4269590	1190	1131	0.0204	NA	NA	NA	3.35775399551979e-06	4267024	4269590
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	4275782	4283970	3	3	0.6314	3.35775399551979e-06	4267024	4269590	1.67231323279516e-07	4283970	4285831
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	4285831	17614133	4819	4563	-0.0144	1.67231323279516e-07	4283970	4285831	1.86481976478060e-07	17580376	17630705
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17615322	17736417	42	40	-0.1913	1.8648197647806e-07	17580376	17630705	7.4337040897036e-08	17715315	17765139
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17737952	51356475	13400	12722	-0.0129	7.4337040897036e-08	17715315	17765139	5.56255393375707e-10	51356475	51356475
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	51357642	51358801	2	2	-0.9026	5.56255393375707e-10	51356475	51356475	1.86180605644972e-10	51358801	51358801
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	51359919	54017002	1163	1110	-0.0246	1.86180605644972e-10	51358801	51358801	8.1467670492235e-11	54012580	54017002
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	54018873	54020088	2	2	-0.9152	8.1467670492235e-11	54012580	54017002	2.59466677787635e-11	54020088	54020088
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	54022288	72537426	7273	6937	1e-04	2.59466677787635e-11	54020088	54020088	0	72537426	72537426
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	12	-2.4006	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	100545896	9249	8837	0.0027	0	72579311	72579311	2.46830072472596e-10	100545896	100545896
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	100547338	100551071	2	2	-0.8659	2.46830072472596e-10	100545896	100545896	5.1843449363697e-11	100551071	100551071
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	100552814	108533257	1877	1783	0.0094	5.1843449363697e-11	100551071	100551071	6.54981941578854e-09	108531247	108533257
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108535814	108538662	3	3	-0.6364	6.54981941578854e-09	108531247	108533257	6.95069476390905e-07	108538662	108541074
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108541074	110014625	570	552	-0.0237	6.95069476390905e-07	108538662	108541074	1.66607632148324e-06	110006354	110014625
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110015739	110041712	6	6	-0.4465	1.66607632148324e-06	110006354	110014625	7.41033145088759e-08	110041712	110060587
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	113841017	1469	1413	-0.0034	7.41033145088759e-08	110041712	110060587	5.82885528829568e-17	113841017	113841017
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	113847479	113848985	2	2	-1.1122	5.82885528829568e-17	113841017	113841017	8.67557737921317e-18	113848985	113848985
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	113850483	146297175	3083	2921	-0.0031	8.67557737921317e-18	113848985	113848985	2.42902135185126e-40	146290772	147315217
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147203277	147203277	1	0	NA	2.42902135185126e-40	146290772	147315217	NA	NA	NA
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147306304	147510532	36	34	-0.4092	NA	NA	NA	2.67242126153371e-39	147490553	147847659
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147644831	150819879	1258	1202	-0.0071	2.67242126153371e-39	147490553	147847659	1.46561618458492e-33	150819879	150836481
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	11	0.6353	1.46561618458492e-33	150819879	150836481	2.51666478031485e-21	150847304	150852858
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	75	0.0577	2.51666478031485e-21	150847304	150852858	2.49687127893669e-22	151026228	151026228
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.9179	2.49687127893669e-22	151026228	151026228	2.94348012786059e-21	151036435	151036435
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2564	0.0034	2.94348012786059e-21	151036435	151036435	2.74172526323982e-13	157133150	157133150
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-1.0292	2.74172526323982e-13	157133150	157133150	1.18010741831080e-14	157136342	157136342
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167483267	4108	3929	0.0025	1.1801074183108e-14	157136342	157136342	1.72349675163718e-14	167481271	167493768
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	0.5152	1.72349675163718e-14	167481271	167493768	1.22805217233652e-14	167507882	167520743
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	195009358	9181	8795	-0.0014	1.22805217233652e-14	167507882	167520743	3.31192421475288e-29	195009358	195009358
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195011344	195065867	8	8	-0.723	3.31192421475288e-29	195009358	195009358	1.56492437329466e-27	195065867	195091758
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	200602881	2160	2064	-0.0117	1.56492437329466e-27	195065867	195091758	1.74904970562957e-15	200592050	200633348
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200609726	200701140	35	34	-0.2765	1.74904970562957e-15	200592050	200633348	3.63863707238543e-16	200668993	200803726
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200787319	227875096	9926	9466	-0.0081	3.63863707238543e-16	200668993	200803726	6.74637590473072e-129	227875096	227875096
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227879152	227882087	3	3	-2.5	6.74637590473072e-129	227875096	227875096	9.22690112771454e-131	227882087	227882087
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227882805	246769018	7356	7011	-0.0198	9.22690112771454e-131	227882087	227882087	3.13469375917825e-10	246738832	246811355
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246794552	246858820	25	23	0.2387	3.13469375917825e-10	246738832	246811355	1.93382446581656e-09	246853406	246875016
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246860551	247186514	100	99	-0.0451	1.93382446581656e-09	246853406	246875016	NA	NA	NA
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	52600588	18732	17884	-5e-04	NA	NA	NA	5.43215371969922e-11	52588009	52600588
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	5.43215371969922e-11	52588009	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	0.5856	NA	NA	NA	1.15507231533296e-21	52635695	52639605
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	242689978	59090	56390	0.0068	1.15507231533296e-21	52635695	52639605	NA	NA	NA
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	37953375	12681	12086	-0.005	NA	NA	NA	1.87866151659821e-25	37953375	37953375
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37954819	37961110	6	6	-0.7797	1.87866151659821e-25	37953375	37953375	1.15248535739756e-23	37961110	37963014
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37963014	47460892	3531	3367	-0.0079	1.15248535739756e-23	37961110	37963014	6.17975850164064e-150	47460892	47460892
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	-3.3304	6.17975850164064e-150	47460892	47460892	1.08984990769438e-159	47466921	47466921
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	133189686	27489	26238	0.0022	1.08984990769438e-159	47466921	47466921	1.19809727731024e-33	133189686	133189686
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	-1.5454	1.19809727731024e-33	133189686	133189686	1.38711813514508e-34	133194685	133194685
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	164005577	9780	9368	0.0089	1.38711813514508e-34	133194685	133194685	1.71361079708529e-25	164005577	164009321
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	0.8544	1.71361079708529e-25	164005577	164009321	7.2197059176356e-25	164023502	164027724
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	191219222	9142	8717	0.0124	7.2197059176356e-25	164023502	164027724	6.04975347948296e-07	191215072	191219222
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191221758	191222891	2	2	0.7398	6.04975347948296e-07	191215072	191219222	4.10402681229127e-08	191222891	191222891
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191224191	193785530	809	783	0.0171	4.10402681229127e-08	191222891	191222891	6.83616179206017e-34	193785530	193785530
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	193787655	193794411	4	4	-1.0123	6.83616179206017e-34	193785530	193785530	3.57177551980157e-32	193794411	193794411
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	193797190	194354505	193	186	0.0013	3.57177551980157e-32	193794411	193794411	8.74892112644301e-316	194354505	194354505
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-3.1916	8.74892112644301e-316	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	199329592	1980	1893	-0.0144	0	194366950	194366950	NA	NA	NA
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3248	0.0011	NA	NA	NA	8.59609478217126e-12	9800777	9821327
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	0.6843	8.59609478217126e-12	9800777	9821327	5.17510436062239e-13	9832823	9842644
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	34445002	6167	5883	0.0025	5.17510436062239e-13	9832823	9842644	5.26855775374274e-11	34439897	34445002
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	0.5163	5.26855775374274e-11	34439897	34445002	3.55367341725173e-11	34491115	34506297
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	70190682	8995	8579	-0.0064	3.55367341725173e-11	34491115	34506297	4.99275908695441e-10	70150576	70190682
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70207908	70216707	3	3	-0.709	4.99275908695441e-10	70150576	70190682	1.45666782426587e-10	70216707	70294312
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70294312	119334954	16177	15451	8e-04	1.45666782426587e-10	70216707	70294312	1.22081979180329e-12	119333701	119334954
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119345371	119348829	3	3	-0.771	1.22081979180329e-12	119333701	119334954	1.94914488650557e-12	119348829	119348829
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119350354	173660684	15087	14382	0.002	1.94914488650557e-12	119348829	119348829	1.67707291106563e-64	173660684	173660684
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	2.104	1.67707291106563e-64	173660684	173660684	1.69443508699056e-64	173666072	173666072
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	187330240	4081	3895	-0.0077	1.69443508699056e-64	173666072	173666072	3.58714395511804e-44	187330240	187330240
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	1.7441	3.58714395511804e-44	187330240	187330240	3.70225204885442e-44	187333619	187333619
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	190717801	1132	1071	-0.0303	3.70225204885442e-44	187333619	187333619	1.42571301192682e-11	190655468	190767854
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190725579	190924564	65	62	-0.1999	1.42571301192682e-11	190655468	190767854	7.08002647130732e-07	190899545	190969247
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190927969	191153613	44	41	-0.0099	7.08002647130732e-07	190899545	190969247	NA	NA	NA
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	737829	222	213	0.0467	NA	NA	NA	2.34879151392253e-12	730853	737829
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	776194	819038	5	5	-0.5998	2.34879151392253e-12	730853	737829	1.40600564614348e-96	819038	829954
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	829954	78483453	21612	20624	0.0218	1.40600564614348e-96	819038	829954	1.13870962635690e-99	78467589	78489361
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	78485582	78485582	1	0	NA	1.1387096263569e-99	78467589	78489361	NA	NA	NA
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	78486743	78531091	20	19	-0.2406	NA	NA	NA	3.13671308236196e-06	78517989	78556670
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	78532750	80019777	587	561	-0.03	3.13671308236196e-06	78517989	78556670	5.30541934750081e-05	80018260	80019777
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	80020992	80025821	3	2	0.547	5.30541934750081e-05	80018260	80019777	2.39765140507794e-09	80025821	80029285
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	80029285	140200229	17628	16858	-0.0031	2.39765140507794e-09	80025821	80029285	1.00543666616164e-17	140198797	140201609
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140201609	140216524	9	9	-0.5301	1.00543666616164e-17	140198797	140201609	1.09419057120817e-14	140215187	140219465
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	140533456	137	128	-0.0072	1.09419057120817e-14	140215187	140219465	3.36068378291463e-12	140533456	140533456
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140535820	140538666	2	2	-0.9818	3.36068378291463e-12	140533456	140533456	9.39761653596811e-13	140538666	140538666
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140541178	180644810	13540	12920	-0.0078	9.3976165359681e-13	140538666	140538666	NA	NA	NA
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	39	-0.038	NA	NA	NA	4.43707347911681e-27	198124	202063
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	248239	20	19	-0.5282	4.43707347911681e-27	198124	202063	0.000239087063323361	230588	259527
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	249566	327962	42	40	-0.3228	0.000239087063323361	230588	259527	1.80261383397444e-28	323898	334423
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	329100	29950805	10485	10029	-0.0013	1.80261383397444e-28	323898	334423	2.31230574909631e-19	29941766	29966336
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30000990	12	11	0.5107	2.31230574909631e-19	29941766	29966336	8.7170991137829e-16	29995247	30004636
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30004636	31382291	581	560	-0.0151	8.7170991137829e-16	29995247	30004636	4.92296656507487e-07	31377756	31387708
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31383925	31418006	8	8	0.4027	4.92296656507487e-07	31377756	31387708	2.67772089314722e-09	31390982	31425144
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	31889575	199	191	-0.0117	2.67772089314722e-09	31390982	31425144	3.67911733541594e-40	31889575	31889575
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31893557	31902818	6	6	-0.9653	3.67911733541594e-40	31889575	31889575	9.55785587578693e-30	31902818	31902818
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31905636	32558677	284	261	-0.0178	9.55785587578693e-30	31902818	31902818	6.85895858185135e-74	32558677	32588005
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32600962	9	9	-1.59	6.85895858185135e-74	32558677	32588005	1.99699983613625e-116	32590568	32600962
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	35864636	1391	1337	-0.0096	1.99699983613625e-116	32590568	32600962	2.04395423264541e-09	35862270	35866245
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35866245	35880489	8	7	-0.4987	2.04395423264541e-09	35862270	35866245	2.22533948514368e-11	35878656	35885238
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35882448	54035000	6904	6590	-0.0023	2.22533948514368e-11	35878656	35885238	6.16342968733106e-224	54035000	54035000
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-3.2868	6.16342968733106e-224	54035000	54035000	7.25634239511117e-237	54042734	54042734
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	132154299	22751	21724	0.0013	7.25634239511117e-237	54042734	54042734	2.94568178862812e-11	132154299	132154299
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	132156778	132159522	2	2	-0.9082	2.94568178862812e-11	132154299	132154299	3.97792255112709e-11	132159522	132159522
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	132161292	165643653	11564	11038	-0.0057	3.97792255112709e-11	132159522	132159522	3.76397861396889e-29	165643653	165645537
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.0074	3.76397861396889e-29	165643653	165645537	2.08388056047831e-26	165649379	165650610
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1723	-0.0075	2.08388056047831e-26	165649379	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	136373	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	138059	1646591	490	469	0.0067	NA	NA	NA	4.11209824237878e-12	1646591	1646591
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1649086	1651106	2	2	-1.0091	4.11209824237878e-12	1646591	1646591	1.00622479726475e-12	1651106	1651106
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1652983	13838118	3983	3783	-0.0127	1.00622479726475e-12	1651106	1651106	6.06491918118887e-59	13838118	13843848
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	13843848	13874281	13	13	-0.8398	6.06491918118887e-59	13838118	13843848	5.16681958837705e-68	13872998	13874281
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	13875730	16135701	899	855	0.0023	5.16681958837705e-68	13872998	13874281	2.67811617337609e-08	16135701	16135701
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	0.7604	2.67811617337609e-08	16135701	16135701	7.2756403371548e-08	16140018	16141776
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	29635722	4989	4762	3e-04	7.2756403371548e-08	16140018	16141776	3.55919581544048e-22	29629600	29657803
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	29641884	29740081	25	25	0.3547	3.55919581544048e-22	29629600	29657803	5.90314018654695e-20	29723112	29753057
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	29747865	38269153	3199	3049	0.0042	5.90314018654695e-20	29723112	29753057	8.89389522481251e-10	38247267	38277728
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38270942	38335964	35	32	0.2231	8.89389522481251e-10	38247267	38277728	1.71676146660103e-17	38332055	38372692
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38337912	109216032	21322	20356	-0.0035	1.71676146660103e-17	38332055	38372692	2.11461713941425e-19	109214735	109216032
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109217320	109240210	6	6	0.6419	2.11461713941425e-19	109214735	109216032	6.54223977922124e-19	109240210	109244233
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109244233	109966116	300	285	0.0216	6.54223977922124e-19	109240210	109244233	1.20130330294801e-15	109966116	109966116
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109967918	109974402	3	3	-0.7746	1.20130330294801e-15	109966116	109966116	1.76164466718801e-13	109974402	109974402
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109976628	109976628	1	0	NA	1.76164466718801e-13	109974402	109974402	NA	NA	NA
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109980654	118611324	3995	3800	0.0192	NA	NA	NA	2.33271136119158e-09	118609124	118611324
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	0.6865	2.33271136119158e-09	118609124	118611324	5.33042424027961e-09	118620875	118622742
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	133433384	6827	6537	0.0115	5.33042424027961e-09	118620875	118622742	1.29304965812423e-08	133426938	133433384
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.4165	1.29304965812423e-08	133426938	133433384	3.37617564206045e-09	133448277	133455682
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141413352	3701	3532	7e-04	3.37617564206045e-09	133448277	133455682	1.27835632580254e-21	141410894	141413352
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141414719	141440184	13	12	0.5131	1.27835632580254e-21	141410894	141413352	5.95579593430521e-17	141438504	141443577
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	142140540	290	282	0.0379	5.95579593430521e-17	141438504	141443577	1.77598318765064e-14	142135117	142149857
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142141101	142187073	11	11	0.5018	1.77598318765064e-14	142135117	142149857	4.16766994193656e-18	142176074	142187097
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142187097	147168935	2073	1965	0.0087	4.16766994193656e-18	142176074	142187097	6.73794724905775e-10	147168935	147168935
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147170276	147170312	2	2	0.87	6.73794724905775e-10	147168935	147168935	4.16193669531368e-09	147170312	147170312
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147176659	158821263	4502	4253	-0.0035	4.16193669531368e-09	147170312	147170312	NA	NA	NA
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	9346601	2815	2675	-0.0135	NA	NA	NA	8.63558160469505e-09	9343495	9353320
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	9351150	9359446	4	4	-0.6128	8.63558160469505e-09	9343495	9353320	8.70926597522122e-10	9359446	9367918
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	9367918	15457778	2250	2154	-0.0031	8.70926597522122e-10	9359446	9367918	1.31451641696656e-34	15453544	15457778
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	15464010	15478031	7	7	-0.8528	1.31451641696656e-34	15453544	15457778	1.25681056322593e-33	15478031	15478031
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	15484243	25022606	3053	2920	-0.0057	1.25681056322593e-33	15478031	15478031	1.20404074094547e-21	25022606	25022606
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	1.0377	1.20404074094547e-21	25022606	25022606	8.30790003015292e-23	25039370	25039370
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	32797545	3061	2908	-0.0179	8.30790003015292e-23	25039370	25039370	5.23051180099724e-12	32792898	32797545
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32800775	32808049	3	3	-0.7916	5.23051180099724e-12	32792898	32797545	1.42690330768921e-12	32808049	32812909
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32812909	39350798	1878	1795	-0.0065	1.42690330768921e-12	32808049	32812909	0	39350798	39352361
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	57	-3.0895	0	39350798	39352361	0	39500219	39505256
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	102688379	17800	16980	-2e-04	0	39500219	39505256	3.79152526804306e-19	102688379	102688379
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	102690502	102695889	4	4	-0.8173	3.79152526804306e-19	102688379	102688379	2.37729720171988e-18	102695889	102695889
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	102697333	144968840	13176	12556	0.0029	2.37729720171988e-18	102695889	102695889	1.58101625161515e-13	144968840	144968840
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144970607	144970777	2	2	1.0062	1.58101625161515e-13	144968840	144968840	2.2502047110729e-11	144970777	144970777
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144972090	146264846	451	432	0.0026	2.2502047110729e-11	144970777	144970777	NA	NA	NA
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5210	-0.0113	NA	NA	NA	1.71836197757517e-19	15802255	15802255
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	1.1586	1.71836197757517e-19	15802255	15802255	1.23614631710288e-18	15807123	15807123
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	22477358	2377	2282	2e-04	1.23614631710288e-18	15807123	15807123	6.62214589652995e-102	22477358	22477358
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	-2.6738	6.62214589652995e-102	22477358	22477358	1.28262788612208e-128	22492603	22492603
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	23343915	161	152	-0.0067	1.28262788612208e-128	22492603	22492603	1.74691463706321e-154	23343915	23343915
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	-2.6301	1.74691463706321e-154	23343915	23343915	7.1322772671328e-147	23365926	23365926
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	39088753	4725	4519	-0.0046	7.1322772671328e-147	23365926	23365926	7.47321472368658e-14	39048058	43530076
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	39091349	66245109	13	13	-0.4003	7.47321472368658e-14	39048058	43530076	4.64829472851597e-13	43776365	67903104
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	67859114	73133242	1281	1219	-0.0027	4.64829472851597e-13	43776365	67903104	0	73133242	73133242
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	73135012	73136820	2	2	-4.9076	0	73133242	73133242	0	73136820	73136820
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	73139210	140145683	23920	22829	-0.0062	0	73136820	73136820	NA	NA	NA
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9307	0.0053	NA	NA	NA	2.48985137262891e-57	27038538	27038538
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-2.0498	2.48985137262891e-57	27038538	27038538	4.67828273654597e-58	27041812	27041812
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	43434589	4145	3969	0	4.67828273654597e-58	27041812	27041812	5.56419349802876e-17	43434589	43434589
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	43436980	43437056	2	2	-1.1056	5.56419349802876e-17	43434589	43434589	7.11324305053649e-16	43437056	43437056
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	43443788	135285645	30930	29527	-0.0069	7.11324305053649e-16	43437056	43437056	NA	NA	NA
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5741031	2138	2038	0.0024	NA	NA	NA	1.31441142009646e-43	5738494	5744034
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	14	-0.7151	1.31441142009646e-43	5738494	5744034	3.83762946021595e-49	5762182	5766615
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	55118214	14752	14055	0.0017	3.83762946021595e-49	5762182	5766615	1.20946919228084e-92	55114405	55124730
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	35	-0.6188	1.20946919228084e-92	55114405	55124730	2.89562274857711e-85	55205278	55217189
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	66463477	4638	4434	-0.0114	2.89562274857711e-85	55205278	55217189	2.82909982782347e-44	66463477	66463477
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	-1.8377	2.82909982782347e-44	66463477	66463477	2.19284949100087e-46	66469412	66469412
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	131426009	22480	21458	-0.0015	2.19284949100087e-46	66469412	66469412	1.30003002251626e-39	131426009	131426009
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	131427991	131434659	5	5	0.7216	1.30003002251626e-39	131426009	131426009	4.0124662963266e-18	131434659	131434659
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	131436397	134450318	1235	1171	-0.0185	4.0124662963266e-18	131434659	131434659	NA	NA	NA
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	736988	296	283	-0.0333	NA	NA	NA	1.63695360660483e-06	731485	736988
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	738240	743223	4	4	-0.5502	1.63695360660483e-06	731485	736988	8.04538188446515e-08	743223	745410
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	745410	7884886	2946	2810	-0.0044	8.04538188446515e-08	743223	745410	8.86816031805043e-107	7879321	7890143
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7890143	8015452	50	48	0.5654	8.86816031805043e-107	7879321	7890143	1.14195025330844e-91	8013470	8018443
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	8018443	9523923	446	428	0.0327	1.14195025330844e-91	8013470	8018443	1.07447671614261e-251	9523923	9528590
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9599999	13	11	-2.2276	1.07447671614261e-251	9523923	9528590	0.000477009873915032	9543817	9599999
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	9610054	3	3	-0.8732	0.000477009873915032	9543817	9599999	3.08076247955847e-17	9610054	9610054
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	11109483	568	544	0.0404	3.08076247955847e-17	9610054	9610054	1.84027155256255e-42	11109483	11109483
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11110735	11143592	11	9	-0.8183	1.84027155256255e-42	11109483	11109483	7.8143775269759e-25	11143592	11147675
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11147675	11395862	69	66	0.0532	7.8143775269759e-25	11143592	11147675	1.73802149465768e-09	11389830	11395862
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11440927	7	7	0.5249	1.73802149465768e-09	11389830	11395862	9.09417716239817e-12	11440927	11466807
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11452868	12422129	389	361	0.0192	9.09417716239817e-12	11440927	11466807	8.48498890701194e-18	12419910	12422129
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	12423720	12433043	5	5	-0.7171	8.48498890701194e-18	12419910	12422129	2.35084893226202e-20	12433043	12435301
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	12435301	20844331	2806	2671	0.0468	2.35084893226202e-20	12433043	12435301	1.20909787114206e-08	20838480	20854311
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	20847828	20876478	10	10	-0.3121	1.20909787114206e-08	20838480	20854311	2.04993259803620e-07	20858372	20889694
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	20876733	29769947	3217	3066	0.0251	2.0499325980362e-07	20858372	20889694	8.81785706303781e-22	29769947	29769947
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	29774307	29783059	5	4	-0.8653	8.81785706303781e-22	29769947	29769947	3.02909627588256e-21	29783059	29785503
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	29785503	31084265	307	297	0.0362	3.02909627588256e-21	29783059	29785503	3.25683787786813e-36	31081498	31132716
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31098259	31237505	20	19	-0.5315	3.25683787786813e-36	31081498	31132716	4.03254413486165e-37	31231952	31242528
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31242528	127951043	32199	30763	-0.003	4.03254413486165e-37	31231952	31242528	9.6775981458815e-30	127949714	127951043
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	127953574	127954857	2	2	-0.831	9.6775981458815e-30	127949714	127951043	1.32951961412022e-08	127954857	127954857
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	127956823	132289090	1788	1704	-0.007	1.32951961412022e-08	127954857	127954857	NA	NA	NA
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	114123340	31644	30204	-0.0014	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19492531	59	57	0.4312	NA	NA	NA	2.08550112655654e-71	19490630	19535787
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19494416	19494416	1	0	NA	2.08550112655654e-71	19490630	19535787	NA	NA	NA
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	21633170	1038	983	-0.003	NA	NA	NA	2.19618616442205e-56	21617995	21651053
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21635428	22051630	215	206	0.217	2.19618616442205e-56	21617995	21651053	5.19026949581096e-66	22034704	22062453
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22052799	40676611	6335	6058	-0.0016	5.19026949581096e-66	22034704	22062453	6.88247579030079e-13	40663660	40676611
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40726930	8	8	-0.492	6.88247579030079e-13	40663660	40676611	4.95877189118637e-14	40726930	40746865
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40741934	69086125	9972	9536	0.0024	4.95877189118637e-14	40726930	40746865	3.9084600785176e-09	69084841	69086125
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69092211	3	3	0.6623	3.9084600785176e-09	69084841	69086125	4.01778665200746e-08	69092211	69093444
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69093444	72312274	1406	1352	-0.0059	4.01778665200746e-08	69092211	69093444	7.2577221724816e-11	72312274	72312274
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	72313705	72317071	3	2	-0.9471	7.2577221724816e-11	72312274	72312274	2.71740201664065e-11	72317071	72317071
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	72318374	73061942	379	366	-0.0331	2.71740201664065e-11	72317071	72317071	3.28472057385717e-39	73061942	73061942
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73092112	8	7	0.8833	3.28472057385717e-39	73061942	73061942	4.93703086127816e-37	73092112	73092112
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	101704652	10671	10224	-0.0031	4.93703086127816e-37	73092112	73092112	1.14453718296807e-16	101704652	101704652
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	101707771	101707860	2	2	-1.1281	1.14453718296807e-16	101704652	101704652	6.74925711375343e-15	101707860	101707860
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	101713121	105850033	1602	1523	-0.0048	6.74925711375343e-15	101707860	101707860	1.62199658693801e-31	105850033	105850033
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105875924	5	5	-1.0296	1.62199658693801e-31	105850033	105850033	2.81500428801561e-17	105875924	105881677
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881677	106358491	178	171	-0.0349	2.81500428801561e-17	105875924	105881677	NA	NA	NA
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	19845942	110	106	0.2331	NA	NA	NA	8.20726085882398e-17	19845942	19845942
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19874677	19882711	3	3	-0.9412	8.20726085882398e-17	19845942	19845942	6.86572108322745e-39	19882711	19882711
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19910696	19985258	16	15	0.2523	6.86572108322745e-39	19882711	19882711	8.7577630515134e-05	19982333	19985258
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19986234	19991828	4	4	0.5517	8.7577630515134e-05	19982333	19985258	4.41858262405231e-05	19991828	20002463
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19992790	20308014	24	22	0.2113	4.41858262405231e-05	19991828	20002463	3.89942743056977e-07	20060061	20366670
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20310916	59468560	14824	14141	-0.0136	3.89942743056977e-07	20060061	20366670	9.00437529617611e-16	59468560	59468560
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	59475528	59480529	2	2	-1.0903	9.00437529617611e-16	59468560	59468560	9.64473413987376e-16	59480529	59480529
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	59483715	62863693	1520	1450	-0.0183	9.64473413987376e-16	59480529	59480529	5.87393984788645e-14	62863693	62863693
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	62866302	62869356	3	3	-0.8442	5.87393984788645e-14	62863693	62863693	1.30040501215234e-13	62869356	62869356
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	62871651	100298352	14816	14119	-0.0106	1.30040501215234e-13	62869356	62869356	NA	NA	NA
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	5757899	2219	2120	-0.0136	NA	NA	NA	8.97483857112449e-38	5757899	5757899
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	5762453	5785712	8	8	0.8453	8.9748385711245e-38	5757899	5757899	6.76766419585163e-42	5785712	5785712
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	5791437	5791437	1	0	NA	6.76766419585163e-42	5785712	5785712	NA	NA	NA
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	5797570	28523145	7388	7030	-0.0334	NA	NA	NA	9.55867516707985e-08	28512937	28523145
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	28525086	28529948	3	2	-0.8145	9.55867516707985e-08	28512937	28523145	1.62739754344298e-07	28529948	28536745
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	28536745	32379126	954	913	-0.0302	1.62739754344298e-07	28529948	28536745	3.14601617159067e-46	31854794	32513457
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33841331	48	45	-0.4416	3.14601617159067e-46	31854794	32513457	1.35104546729338e-55	33538171	33846647
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33842125	68693086	7678	7300	-0.0167	1.35104546729338e-55	33538171	33846647	2.64250554988158e-22	68693014	68693086
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68753209	10	10	-0.5914	2.64250554988158e-22	68693014	68693086	9.09421315354317e-23	68753209	68842364
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	68838384	1	0	NA	9.09421315354317e-23	68753209	68842364	NA	NA	NA
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68842364	72918129	1452	1372	-0.0283	NA	NA	NA	1.65912677332196e-26	72917554	72918129
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72929786	72964783	7	7	-0.7525	1.65912677332196e-26	72917554	72918129	1.45554658147662e-25	72956298	73022578
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73022578	75093957	754	719	-0.0402	1.45554658147662e-25	72956298	73022578	1.79058011859310e-78	75093957	75093957
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-1.9406	1.7905801185931e-78	75093957	75093957	1.26411901452896e-71	75100865	75100865
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	75102639	1	0	NA	1.26411901452896e-71	75100865	75100865	NA	NA	NA
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75104836	88690571	5130	4904	-0.0161	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	32828797	12421	11853	-0.0143	NA	NA	NA	4.13240169380163e-76	32828797	32828797
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	-2.3952	4.13240169380163e-76	32828797	32828797	1.89584937895573e-74	32832642	32832642
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36673853	1448	1385	-0.0187	1.89584937895573e-74	32832642	32832642	3.52625044025721e-62	36673853	36673853
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	4	-1.5567	3.52625044025721e-62	36673853	36673853	1.48824326247779e-61	36683509	36683509
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	41519702	2012	1910	-0.0153	1.48824326247779e-61	36683509	36683509	4.71542617686837e-118	41518222	41521544
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41710400	67	65	-0.5527	4.71542617686837e-118	41518222	41521544	3.15080549072239e-126	41708551	42142363
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	60986238	6883	6548	-0.0148	3.15080549072239e-126	41708551	42142363	1.40173750404052e-10	60986238	60986238
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	60988534	60989697	2	2	0.7657	1.40173750404052e-10	60986238	60986238	2.18273287126149e-07	60989697	60991800
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	60991800	78653545	6794	6466	-0.0112	2.18273287126149e-07	60989697	60991800	NA	NA	NA
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	21888	0.0113	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1395246	491	462	-1e-04	NA	NA	NA	8.70491636688602e-12	1395246	1395246
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1398325	1398325	1	0	NA	8.70491636688602e-12	1395246	1395246	NA	NA	NA
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	0.984	NA	NA	NA	1.63330497971617e-30	1400840	1400840
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	42703136	13126	12520	-0.025	1.63330497971617e-30	1400840	1400840	6.70577083425878e-30	42699956	42703136
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	42704547	42708572	3	3	-0.7692	6.70577083425878e-30	42699956	42703136	2.90899433424468e-10	42708572	42711501
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	42711501	58212113	6845	6506	-0.0296	2.90899433424468e-10	42708572	42711501	5.51606632227722e-10	58203159	58213220
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58213220	58241773	13	12	-0.3949	5.51606632227722e-10	58203159	58213220	2.23704413010213e-10	58237461	58252109
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58244012	63787171	2577	2476	-0.0279	2.23704413010213e-10	58237461	58252109	NA	NA	NA
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	63788698	63788698	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1499421	585	559	-0.0105	NA	NA	NA	5.50535531747873e-15	1499421	1499421
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1506379	1506379	1	0	NA	5.50535531747873e-15	1499421	1499421	NA	NA	NA
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1516966	3	3	-0.8291	NA	NA	NA	0.0805532209713176	1516966	1525300
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1518825	1531162	6	6	-2.0015	0.0805532209713176	1516966	1525300	4.8028018947083e-166	1525300	1531162
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	20065	0.0019	4.8028018947083e-166	1525300	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12807	-5e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	49571068	16556	15781	-0.018	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.068	NA	NA	NA	8.42281822548852e-13	94062	94062
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	-0.7648	8.42281822548852e-13	94062	94062	9.21394496938115e-19	104732	106242
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	2708291	1780	1701	-0.067	9.21394496938115e-19	104732	106242	0	2708291	2708291
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	49647571	17157	16409	0.8642	0	2708291	2708291	2.4447739953219e-37	49632715	49661442
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	49648413	49693021	37	35	0.6483	2.4447739953219e-37	49632715	49661442	0.000557452903156928	49661442	49732977
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	49693781	76998610	5745	5474	0.835	0.000557452903156928	49661442	49732977	3.45435081480188e-67	76998610	76998610
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	-2.1527	3.45435081480188e-67	76998610	76998610	4.10040219046138e-68	77010018	77010018
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	78250652	194	184	0.8593	4.10040219046138e-68	77010018	77010018	2.75537424180693e-05	78243618	78250652
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	78253661	78259689	2	2	0.0071	2.75537424180693e-05	78243618	78250652	8.97214097482818e-07	78259689	78275044
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	78275044	88039167	2109	2011	0.8831	8.97214097482818e-07	78259689	78275044	8.56651342212386e-24	88035247	88039167
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	88045012	88062186	7	7	0.0264	8.56651342212386e-24	88035247	88039167	1.27967690921518e-22	88062186	88065425
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	88065425	133479476	13308	12657	0.881	1.27967690921518e-22	88062186	88065425	3.06661152738077e-08	133472156	133482389
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	133480270	133498088	12	11	0.4574	3.06661152738077e-08	133472156	133482389	1.57612484209627e-08	133495488	133500513
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	133498929	146087729	3521	3365	0.8757	1.57612484209627e-08	133495488	133500513	1.24919813524309e-08	146086841	146087729
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	146095685	146095707	2	2	-0.1088	1.24919813524309e-08	146086841	146087729	1.22752451252794e-18	146095707	146098710
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	146098710	154038318	2905	2780	0.8375	1.22752451252794e-18	146095707	146098710	4.57042756666138e-17	154031239	154044828
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154078819	11	10	1.4175	4.57042756666138e-17	154031239	154044828	2.57380628746004e-13	154078401	154085354
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154442377	90	88	0.8749	2.57380628746004e-13	154078401	154085354	8.37164879492063e-113	154442377	154442377
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	4	-1.976	8.37164879492063e-113	154442377	154442377	3.54321385814815e-70	154450309	154450309
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	27	0.8343	3.54321385814815e-70	154450309	154450309	2.2595702439193e-108	154578922	154582414
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	191	-0.0016	2.2595702439193e-108	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	2710450	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2711665	3733715	123	115	-2.8524	NA	NA	NA	4.15879555924971e-23	3219200	3772482
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-0.5243	4.15879555924971e-23	3219200	3772482	7.61481863636245e-12	5531459	6692482
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6873825	71	67	-2.7721	7.61481863636245e-12	5531459	6692482	6.0114780381455e-06	6829322	6916241
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6876161	7653082	263	251	-1.9826	6.0114780381455e-06	6829322	6916241	0.000181969829728659	7485594	7682695
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7723783	44	43	-2.7992	0.000181969829728659	7485594	7682695	2.27168748476068e-05	7711759	7726921
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7782532	18	16	-1.3213	2.27168748476068e-05	7711759	7726921	0.00639073927504027	7776265	7853950
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	8010446	62	61	-2.3934	0.00639073927504027	7776265	7853950	0.000140830431895350	7938700	8057124
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8016395	8149413	28	27	-3.5225	0.00014083043189535	7938700	8057124	0.000180772192795193	8094987	8201959
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8155089	8450784	72	69	-2.5721	0.000180772192795193	8094987	8201959	0.00372088441600791	8300654	8554113
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8454258	8823361	123	120	-2.027	0.00372088441600791	8300654	8554113	0.0169671815404059	8681965	8961669
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8824539	9081196	48	46	-2.5088	0.0169671815404059	8681965	8961669	0.000317658391825483	8958121	9097219
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9087629	9153682	18	16	-3.7173	0.000317658391825483	8958121	9097219	0.000336940647853935	9129443	10004173
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9155283	10515697	79	76	-2.5706	0.000336940647853935	9129443	10004173	3.62921359293585e-14	10511255	10537808
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	12452734	19	19	-0.6439	3.62921359293585e-14	10511255	10537808	1.23126743960190e-19	11698871	12452734
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12541506	11	11	-3.143	1.2312674396019e-19	11698871	12452734	5.09043178303037e-11	12537944	12546917
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	52	-1.2294	5.09043178303037e-11	12537944	12546917	4.25685273806665e-13	12661168	12682301
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12687167	1	0	NA	4.25685273806665e-13	12661168	12682301	NA	NA	NA
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12696242	12776542	14	11	-3.2931	NA	NA	NA	1.45336508688955e-09	12776542	12804329
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12786515	13129843	121	116	-1.3993	1.45336508688955e-09	12776542	12804329	9.30128434322922e-47	13114169	13138841
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	14342834	408	393	-2.8938	9.30128434322922e-47	13114169	13138841	5.21390348473548e-05	14326935	14358464
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14376942	16	15	-1.6273	5.21390348473548e-05	14326935	14358464	1.04875703594606e-06	14370346	14379418
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14377844	14407293	15	15	-3.3536	1.04875703594606e-06	14370346	14379418	9.31403443814547e-05	14391767	14415559
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14409145	14426934	14	14	-1.8806	9.31403443814547e-05	14391767	14415559	0.000126754592717186	14419087	14434038
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14434038	14444446	9	8	-3.5926	0.000126754592717186	14419087	14434038	5.87192301785714e-05	14442815	14457286
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14445814	14694578	86	82	-1.9265	5.87192301785714e-05	14442815	14457286	8.35677163197822e-06	14585542	14742448
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14695441	15207522	134	128	-2.7194	8.35677163197822e-06	14585542	14742448	4.11746653078664e-05	15198015	15209166
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15208612	15241527	11	11	-1.0214	4.11746653078664e-05	15198015	15209166	8.61625663529511e-07	15228303	15249591
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15242592	15521958	164	156	-2.8085	8.6162566352951e-07	15228303	15249591	2.20620579371437e-05	15477260	15523178
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15523178	15543194	13	11	-1.2191	2.20620579371437e-05	15477260	15523178	8.26761298432394e-05	15541293	15553682
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15546378	15915466	77	73	-2.6147	8.26761298432394e-05	15541293	15553682	0.000145216346900149	15788556	16002819
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16175250	102	100	-1.8869	0.000145216346900149	15788556	16002819	7.70665329703888e-11	16110790	16206224
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16176562	21172258	793	747	-2.7019	7.70665329703888e-11	16110790	16206224	0.000176722663414553	21117823	21224074
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21182945	21329709	30	30	-1.7782	0.000176722663414553	21117823	21224074	7.35906314635779e-07	21324207	21349725
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21330576	22139807	175	167	-2.8111	7.35906314635779e-07	21324207	21349725	0.000239053928124402	22043133	22139807
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22175425	7	7	-1.1648	0.000239053928124402	22043133	22139807	3.94196267871674e-06	22175425	22179794
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22176501	22210081	15	14	-2.7738	3.94196267871674e-06	22175425	22179794	2.97301435083144e-05	22204143	22216169
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22214320	22261337	14	13	-4.0681	2.97301435083144e-05	22204143	22216169	1.30940717540308e-07	22252446	22367156
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22263267	22877495	48	45	-2.557	1.30940717540308e-07	22252446	22367156	1.25531460625393e-06	22864834	22880349
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22878671	22914005	10	10	-4.127	1.25531460625393e-06	22864834	22880349	0.00466054029734398	22908342	22923722
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22915679	22930737	8	8	-2.8896	0.00466054029734398	22908342	22923722	9.14950005129732e-05	22924754	26873861
MSK_252152918091_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	83	-1.1178	9.14950005129732e-05	22924754	26873861	NA	NA	NA
