Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72537426	27894	26860	0.0112	NA	NA	NA	2.48379598496445e-32	72536231	72539143
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	12	0.9125	2.48379598496445e-32	72536231	72539143	4.2000883899599e-36	72574479	72589682
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	109168265	11317	10910	-0.0051	4.2000883899599e-36	72574479	72589682	6.46463553698527e-11	109168265	109168265
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109169839	109173218	3	2	-1.2686	6.46463553698527e-11	109168265	109168265	2.40774329864117e-10	109173218	109175307
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109175307	146297175	4941	4738	-0.0056	2.40774329864117e-10	109173218	109175307	6.6210727940871e-15	146279228	147315217
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147203277	147467273	30	30	-0.3954	6.6210727940871e-15	146279228	147315217	2.12913939328813e-17	147438471	147497268
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147471665	150823073	1266	1212	0.0107	2.12913939328813e-17	147438471	147497268	2.37832732606146e-15	150818222	150836481
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150848509	9	9	0.6976	2.37832732606146e-15	150818222	150836481	5.34042733879764e-17	150847304	150851439
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150851439	151026228	79	75	-0.0252	5.34042733879764e-17	150847304	150851439	2.38532635695875e-09	151024118	151026228
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.7506	2.38532635695875e-09	151024118	151026228	5.81043053894406e-07	151036435	151040463
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2576	0.0136	5.81043053894406e-07	151036435	151040463	4.61766844518508e-14	157133150	157133150
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-1.443	4.61766844518508e-14	157133150	157133150	5.26196333557368e-15	157136342	157136342
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	161099582	1622	1559	-0.0094	5.26196333557368e-15	157136342	157136342	1.26123069920129e-16	161099582	161099582
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161104752	161104791	2	2	-1.5144	1.26123069920129e-16	161099582	161099582	1.10827678401052e-15	161104791	161104791
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161108722	200609726	13842	13343	-0.0041	1.10827678401052e-15	161104791	161104791	2.20287992981952e-11	200584100	200633348
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200612164	200803726	39	39	-0.2987	2.20287992981952e-11	200584100	200633348	2.96246950450264e-11	200696309	200815351
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200804838	247186514	17405	16760	-0.0023	2.96246950450264e-11	200696309	200815351	NA	NA	NA
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	14924467	4471	4292	0.0035	NA	NA	NA	5.3567834281344e-20	14919181	14924467
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	14939753	14982586	7	6	-0.9678	5.3567834281344e-20	14919181	14924467	1.16374651563256e-19	14982586	14988301
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	14988301	34543992	7044	6771	-0.0019	1.16374651563256e-19	14982586	14988301	1.54997378916023e-17	34539740	34552935
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34579933	14	13	0.6198	1.54997378916023e-17	34539740	34552935	1.06302666010117e-17	34574224	34582272
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34580533	227949124	60744	58480	-0.0058	1.06302666010117e-17	34574224	34582272	1.46810912340050e-08	227943049	227952131
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	227950459	227981126	12	11	0.484	1.4681091234005e-08	227943049	227952131	3.4024287603689e-08	227968956	227996401
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	227986221	242689978	5535	5310	-4e-04	3.4024287603689e-08	227968956	227996401	NA	NA	NA
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	37953375	12681	12172	-0.0071	NA	NA	NA	6.57237655901947e-11	37951628	37954819
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37954819	37961110	6	6	-0.7286	6.57237655901947e-11	37951628	37954819	1.93808430071913e-10	37960019	37963014
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37963014	164005577	40804	39222	-0.0046	1.93808430071913e-10	37960019	37963014	6.78860719194174e-12	164001657	164012645
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	0.8369	6.78860719194174e-12	164001657	164012645	2.89626615643365e-12	164019640	164036648
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	190844369	8933	8591	-0.0056	2.89626615643365e-12	164019640	164036648	2.38804301723279e-08	190840098	190844369
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	190847899	190850562	3	3	-0.9139	2.38804301723279e-08	190840098	190844369	1.29890363078888e-07	190850562	190854164
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	190854164	191217656	205	199	-0.0117	1.29890363078888e-07	190850562	190854164	1.94979846618444e-07	191215072	191217656
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191219222	191219222	1	0	NA	1.94979846618444e-07	191215072	191217656	NA	NA	NA
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191221758	191222891	2	2	1.0817	NA	NA	NA	6.49806964831961e-09	191222891	191222891
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191224191	194354505	1006	970	-0.0189	6.49806964831961e-09	191222891	191222891	3.91614633884717e-200	194354505	194354505
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-2.9791	3.91614633884717e-200	194354505	194354505	1.88477724448269e-182	194366950	194366950
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	199324677	1979	1911	-0.006	1.88477724448269e-182	194366950	194366950	NA	NA	NA
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	199329592	199329592	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	34445002	9564	9217	0.0029	NA	NA	NA	2.28779355319059e-193	34445002	34445002
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	-3.0104	2.28779355319059e-193	34445002	34445002	1.77556104212198e-203	34491115	34491115
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	68905670	8863	8518	-0.0109	1.77556104212198e-203	34491115	34491115	1.51417397682700e-18	68899247	69085386
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	0.5926	1.514173976827e-18	68899247	69085386	5.82374180863116e-09	69144974	69165814
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	69700130	8	8	-0.0945	5.82374180863116e-09	69144974	69165814	3.19357148280826e-06	69700130	69725401
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69720805	69742449	6	6	-0.9047	3.19357148280826e-06	69700130	69725401	4.5486352580673e-17	69735776	69748111
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69748111	187330240	35457	34180	-0.0093	4.5486352580673e-17	69735776	69748111	6.49338410940749e-11	187329037	187330240
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187338465	4	4	0.8822	6.49338410940749e-11	187329037	187330240	2.05334258521839e-11	187338465	187346058
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187346058	191153613	1239	1195	-0.022	2.05334258521839e-11	187338465	187346058	NA	NA	NA
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	36217605	10182	9777	-0.0064	NA	NA	NA	9.86111708221295e-09	36217605	36217605
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	36220056	36226270	2	2	1.1279	9.86111708221295e-09	36217605	36217605	7.02953773905846e-09	36226270	36227691
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	36227691	68864742	8865	8541	-0.0107	7.02953773905846e-09	36226270	36227691	1.35456090365995e-12	68862665	68864742
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	68885350	68885350	1	0	NA	1.35456090365995e-12	68862665	68864742	NA	NA	NA
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	70343857	70405656	3	3	1.0847	NA	NA	NA	3.45635313061410e-12	70405656	70405656
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	70693444	180342860	34593	33319	-0.0033	3.4563531306141e-12	70405656	70405656	8.99456801028555e-18	180194323	180346557
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	8	0.7911	8.99456801028555e-18	180194323	180346557	8.93370261267663e-15	180355807	180362342
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	104	0.0117	8.93370261267663e-15	180355807	180362342	NA	NA	NA
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	40	-0.0181	NA	NA	NA	1.98521786017334e-15	186875	211079
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	326323	61	58	-0.4599	1.98521786017334e-15	186875	211079	1.18643678691230e-43	320854	331014
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	29950805	10486	10081	-0.0013	1.1864367869123e-43	320854	331014	1.71067773452095e-107	29950805	29962849
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30010234	15	15	-1.4128	1.71067773452095e-107	29950805	29962849	7.69322188320286e-89	30004636	30010234
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30021908	32558677	1075	1039	0.0168	7.69322188320286e-89	30004636	30010234	1.45069136528146e-16	32548736	32558677
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32595402	7	7	0.889	1.45069136528146e-16	32548736	32558677	3.93630631615732e-22	32595402	32600962
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	32597877	1	0	NA	3.93630631615732e-22	32595402	32600962	NA	NA	NA
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32600962	32745693	54	53	0.0129	NA	NA	NA	3.20092960529532e-16	32745693	32745693
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32756637	32762061	4	4	-0.9873	3.20092960529532e-16	32745693	32745693	2.12432594605479e-13	32762061	32766023
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32766023	54035000	8246	7951	0.0033	2.12432594605479e-13	32762061	32766023	1.34398341566684e-16	54035000	54035000
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	1.2701	1.34398341566684e-16	54035000	54035000	3.09177287657500e-18	54042734	54042734
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	72919733	4535	4376	-0.0045	3.091772876575e-18	54042734	54042734	2.42624705396023e-58	72919733	72919733
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72920894	72924440	3	3	-2.2618	2.42624705396023e-58	72919733	72919733	2.4112238736011e-53	72924440	72924440
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72931542	79018959	1894	1824	-0.0013	2.4112238736011e-53	72924440	72924440	1.23380493241535e-24	79015901	79024557
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-0.7425	1.23380493241535e-24	79015901	79024557	2.59411590666967e-25	79085247	79095415
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	103841482	6762	6519	-0.0079	2.59411590666967e-25	79085247	79095415	1.54093997286728e-12	103827105	103841482
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	0.9352	1.54093997286728e-12	103827105	103841482	2.02590224578189e-12	103868154	103873584
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	165643653	21106	20339	-0.0079	2.02590224578189e-12	103868154	103873584	2.16120950081178e-69	165643653	165643653
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	2.1596	2.16120950081178e-69	165643653	165643653	4.07921831312694e-69	165650610	165650610
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	168075043	898	865	-0.0128	4.07921831312694e-69	165650610	165650610	7.3822186122285e-85	168068481	168078164
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	168076928	168342734	106	101	0.4918	7.3822186122285e-85	168068481	168078164	4.66380011240584e-77	168336382	168357831
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	168349663	170753106	800	772	-0.0156	4.66380011240584e-77	168336382	168357831	NA	NA	NA
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	16135701	5388	5192	0.0096	NA	NA	NA	2.77420787296209e-10	16135701	16135701
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	1.2343	2.77420787296209e-10	16135701	16135701	3.87017338868620e-10	16140018	16140018
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	86771217	20750	19967	-0.0035	3.8701733886862e-10	16140018	16140018	7.48597322861447e-09	86769476	86771217
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	86777920	86781265	3	3	-0.9537	7.48597322861447e-09	86769476	86771217	2.95577382299532e-09	86781265	86785324
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	86785324	109216032	8817	8488	0.0074	2.95577382299532e-09	86781265	86785324	3.30737025937679e-08	109212149	109216032
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109217320	109244233	7	7	0.6026	3.30737025937679e-08	109212149	109216032	5.68245816595414e-09	109244233	109247295
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109245944	125831554	7471	7184	-0.012	5.68245816595414e-09	109244233	109247295	4.35794011942188e-17	125831554	125831554
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	1.2624	4.35794011942188e-17	125831554	125831554	2.25743733974541e-16	125837524	125837524
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	141410894	7362	7088	0.0017	2.25743733974541e-16	125837524	125837524	2.52776562701761e-13	141406414	141414719
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	13	0.5508	2.52776562701761e-13	141406414	141414719	8.03903934111625e-11	141434131	141443577
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	141690753	117	114	0.0213	8.03903934111625e-11	141434131	141443577	1.13472839480615e-186	141690753	141690753
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141712786	9	9	-3.348	1.13472839480615e-186	141690753	141690753	0	141712786	141712786
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141714168	158821263	6753	6481	-0.002	0	141712786	141712786	NA	NA	NA
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	39341524	13072	12568	-0.0043	NA	NA	NA	7.02051853727291e-103	39339800	39345557
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39345557	39505256	61	58	0.6986	7.02051853727291e-103	39339800	39345557	1.78129247016180e-101	39504332	39508035
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40892587	441	424	0.0083	1.7812924701618e-101	39504332	39508035	2.78165471584576e-10	40892587	40892587
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	1.1309	2.78165471584576e-10	40892587	40892587	1.14743484211359e-08	40897469	40904488
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	137748793	28138	27100	-0.0046	1.14743484211359e-08	40897469	40904488	1.14377910979108e-85	137737806	137751905
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	137751905	137922591	32	30	-0.8839	1.14377910979108e-85	137737806	137751905	5.04994536059489e-73	137919308	137931707
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	137931707	146264846	2820	2698	0.0047	5.04994536059489e-73	137919308	137931707	NA	NA	NA
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5261	-0.0086	NA	NA	NA	3.42694130611894e-10	15802255	15802255
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	-1.2057	3.42694130611894e-10	15802255	15802255	3.09914755299375e-10	15807123	15807123
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	23343915	2540	2443	-0.0143	3.09914755299375e-10	15807123	15807123	1.42049299145856e-107	23343915	23343915
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	-3.1013	1.42049299145856e-107	23343915	23343915	2.13071511128489e-105	23365926	23365926
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	70926188	5069	4872	0.0013	2.13071511128489e-105	23365926	23365926	5.66380788714577e-24	70926188	70926188
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.8302	5.66380788714577e-24	70926188	70926188	3.65844474776522e-23	70930528	70930528
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	140145683	24870	23947	-0.0051	3.65844474776522e-23	70930528	70930528	NA	NA	NA
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	135285645	44808	43107	-0.0029	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1705	0.0027	NA	NA	NA	1.32398723452695e-26	4923300	4923300
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	4	1.4297	1.32398723452695e-26	4923300	4923300	1.19501974247252e-28	4932214	4932214
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	55118214	15128	14492	-8e-04	1.19501974247252e-28	4932214	4932214	1.93235017137302e-52	55112618	55124730
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	39	-0.6175	1.93235017137302e-52	55112618	55124730	1.28478417497618e-52	55205278	55217189
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	81177333	9874	9507	0.0126	1.28478417497618e-52	55205278	55217189	1.05215182718369e-28	81177333	81177333
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81187470	81192409	2	2	-2.0564	1.05215182718369e-28	81177333	81177333	1.42917164279886e-30	81192409	81192409
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81202118	134450318	18484	17762	-0.0075	1.42917164279886e-30	81192409	81192409	NA	NA	NA
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3604	2e-04	NA	NA	NA	9.03026009630822e-25	9456107	9543817
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9599999	13	12	0.7834	9.03026009630822e-25	9456107	9543817	1.03116331034924e-24	9578398	9604633
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	11110735	572	549	-0.0144	1.03116331034924e-24	9578398	9604633	2.13372756526483e-26	11109483	11112600
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11112600	11140421	9	8	0.9729	2.13372756526483e-26	11109483	11112600	3.68635929898996e-27	11130871	11143592
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	50989163	12904	12429	-0.0066	3.68635929898996e-27	11130871	11143592	1.46530062872791e-38	50986377	50992951
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	50991034	51064681	39	38	0.5273	1.46530062872791e-38	50986377	50992951	5.21495832594005e-37	51056070	51069245
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	51065971	132289090	27882	26832	4e-04	5.21495832594005e-37	51056070	51069245	NA	NA	NA
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	34578806	6015	5796	-0.0079	NA	NA	NA	1.03567466213485e-09	34572045	34582845
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	34580008	34598642	11	11	0.506	1.03567466213485e-09	34572045	34582845	3.80357400070545e-09	34592997	34606866
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	34601014	36969571	1013	974	-0.0083	3.80357400070545e-09	34592997	34606866	3.46075776615904e-96	36969571	36969571
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36976441	36982877	2	2	-3.8132	3.46075776615904e-96	36969571	36969571	2.53574454095307e-106	36982877	36982877
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36989091	49931231	5168	4958	-0.0077	2.53574454095307e-106	36982877	36982877	3.15585881565618e-35	49928169	49931231
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49932998	49974447	13	12	-0.9087	3.15585881565618e-35	49928169	49931231	5.83299357405122e-33	49974447	49981330
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49981330	56650373	1803	1739	0.0022	5.83299357405122e-33	49974447	49981330	1.06161636581575e-20	56610886	56650373
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56686863	16	16	0.6294	1.06161636581575e-20	56610886	56650373	4.86071295342588e-24	56686863	56693033
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56688605	89659397	8252	7933	-0.0016	4.86071295342588e-24	56686863	56693033	1.32560940592314e-15	89659397	89659397
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	-1.4508	1.32560940592314e-15	89659397	89659397	1.39759928241812e-14	89662326	89662326
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	100690991	4785	4610	-0.0101	1.39759928241812e-14	89662326	89662326	1.09007394692941e-148	100690991	100690991
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-4.5177	1.09007394692941e-148	100690991	100690991	3.30088417353437e-145	100693892	100693892
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4372	-0.0124	3.30088417353437e-145	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	46775775	9015	8654	-0.001	NA	NA	NA	1.16540450791788e-11	46774115	46786011
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	46778735	46799711	10	9	-0.6181	1.16540450791788e-11	46774115	46786011	3.80370810895839e-11	46787389	46802958
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	46800801	105597555	22617	21724	-0.0015	3.80370810895839e-11	46787389	46802958	3.24798863569052e-15	105594189	105607572
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105681007	14	13	0.5917	3.24798863569052e-15	105594189	105607572	1.28909345120808e-11	105630089	105681007
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105703388	105787390	19	19	-0.0665	1.28909345120808e-11	105630089	105681007	1.16111361575921e-13	105787390	105787390
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105788623	105795807	5	5	0.5704	1.16111361575921e-13	105787390	105787390	8.04323409150289e-05	105795807	105800545
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105798116	105856972	24	24	-0.032	8.0432340915029e-05	105795807	105800545	8.3438720564106e-38	105856972	105856972
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105872360	105881893	5	5	-1.9073	8.3438720564106e-38	105856972	105856972	6.72658278603457e-55	105881893	105881893
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	106358491	176	172	0.0255	6.72658278603457e-55	105881893	105881893	NA	NA	NA
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18867285	25	25	0.1009	NA	NA	NA	2.09082179380774e-10	18846835	18884436
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18874259	20088256	131	129	0.5276	2.09082179380774e-10	18846835	18884436	7.40019510942049e-123	20060061	20310916
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	37476468	5223	5012	-0.0065	7.40019510942049e-123	20060061	20310916	9.81346455827862e-09	37463219	37490318
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	37483173	37536104	10	10	0.5149	9.81346455827862e-09	37463219	37490318	2.56742348260963e-08	37516179	37556650
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	37544466	75115806	16496	15910	-7e-04	2.56742348260963e-08	37516179	37556650	9.8666686238485e-22	75115806	75115806
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	-1.8098	9.8666686238485e-22	75115806	75115806	8.80662876240592e-22	75119713	75119713
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	100298352	9435	9086	-0.0044	8.80662876240592e-22	75119713	75119713	NA	NA	NA
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	14876356	5468	5278	0.0086	NA	NA	NA	1.99911768684073e-34	14687636	14956177
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14956177	15029941	14	14	-0.8834	1.99911768684073e-34	14687636	14956177	1.55831442919229e-37	15028108	15034210
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15034210	31854794	5089	4890	0.0233	1.55831442919229e-37	15028108	15034210	4.87973855909492e-31	31841022	32513457
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	31862577	33647856	48	47	-0.4294	4.87973855909492e-31	31841022	32513457	2.56994498918191e-28	33536526	33846647
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33830585	54348362	3076	2960	-0.0046	2.56994498918191e-28	33536526	33846647	4.15548725756906e-08	54339225	54365385
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54352394	54379839	11	10	-0.5062	4.15548725756906e-08	54339225	54365385	8.30533223232853e-09	54366535	54400475
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	75093957	6817	6566	0.0052	8.30533223232853e-09	54366535	54400475	5.80329829880367e-22	75093957	75093957
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.4465	5.80329829880367e-22	75093957	75093957	1.03719226627942e-20	75100865	75100865
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	582	-0.0206	1.03719226627942e-20	75100865	75100865	1.81333441568206e-29	76925748	76929598
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	1.0581	1.81333441568206e-29	76925748	76929598	2.72647889159329e-27	76938723	76940218
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4344	-0.0035	2.72647889159329e-27	76938723	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	36673853	13871	13311	0.0132	NA	NA	NA	2.68661919752642e-66	36673853	36673853
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	1.8423	2.68661919752642e-66	36673853	36673853	1.16654288344011e-69	36684619	36684619
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41501967	2003	1927	0.0292	1.16654288344011e-69	36684619	36684619	0.309780213816104	41380286	41518222
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41504832	41521544	9	9	-0.1938	0.309780213816104	41380286	41518222	0.0175716987808935	41508943	41539415
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41522429	41566540	20	20	-0.473	0.0175716987808935	41508943	41539415	2.07076414963996e-17	41564408	41572001
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	78653545	13725	13194	0.0119	2.07076414963996e-17	41564408	41572001	NA	NA	NA
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22093	-0.0067	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	3591120	1536	1464	0.0208	NA	NA	NA	1.14312323672375e-08	3588389	3591120
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3592564	3593646	2	2	-1.2044	1.14312323672375e-08	3588389	3591120	2.62610278768921e-09	3593646	3593646
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3596968	20399700	7678	7391	0.0338	2.62610278768921e-09	3593646	3593646	5.56571111422901e-33	20386500	20422223
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20420327	20493401	15	15	-0.7989	5.56571111422901e-33	20386500	20422223	2.80459830454346e-33	20472156	20507235
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20507235	63788698	13828	13287	0.0226	2.80459830454346e-33	20472156	20507235	NA	NA	NA
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1516966	589	565	4e-04	NA	NA	NA	2.11020772563369e-70	1516966	1518825
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1518825	1531162	6	6	-1.933	2.11020772563369e-70	1516966	1518825	8.80967730796312e-77	1528899	1531162
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	20195	0.0021	8.80967730796312e-77	1528899	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12935	-0.0047	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	37685496	10764	10383	0.0172	NA	NA	NA	7.72898659578127e-30	37683516	37690142
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37689058	37715385	16	16	-0.7473	7.72898659578127e-30	37683516	37690142	2.55246841925928e-28	37709300	37718669
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37718669	49571068	5776	5549	0.0118	2.55246841925928e-28	37709300	37718669	NA	NA	NA
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.1877	NA	NA	NA	3.00080517069883e-19	94062	95819
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	-1.1455	3.00080517069883e-19	94062	95819	1.83342868416897e-27	104486	104732
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	1427392	774	746	-0.0056	1.83342868416897e-27	104486	104732	5.0073586076633e-14	1427338	1427392
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	3	-1.2529	5.0073586076633e-14	1427338	1427392	1.37866575841609e-15	1432953	1432953
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	1894973	349	334	-0.0019	1.37866575841609e-15	1432953	1432953	8.54389585377909e-06	1891108	1898078
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1895343	1907678	5	5	-0.6106	8.54389585377909e-06	1891108	1898078	4.94800683370049e-07	1901223	1907912
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1907912	2673365	623	596	0.0198	4.94800683370049e-07	1901223	1907912	0.000152228093426336	2662104	2695951
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2674375	2708291	25	25	-0.2116	0.000152228093426336	2662104	2695951	1.5889570723171e-79	2708291	2711273
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	154017980	44992	43282	0.9168	1.5889570723171e-79	2708291	2711273	5.84042612355134e-17	153932168	154022916
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154019921	154019921	1	0	NA	5.84042612355134e-17	153932168	154022916	NA	NA	NA
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154021108	154054530	14	13	1.1747	NA	NA	NA	2.85001170939718e-06	154050185	154054530
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154056623	154078819	5	5	1.6121	2.85001170939718e-06	154050185	154054530	6.7426809852179e-07	154078819	154086636
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154441943	89	84	0.8959	6.7426809852179e-07	154078819	154086636	5.7173661498231e-106	154441943	154441943
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154442377	154442377	1	0	NA	5.7173661498231e-106	154441943	154441943	NA	NA	NA
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	4	-2.4781	NA	NA	NA	2.00673042660761e-101	154450309	154450309
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	28	1.0011	2.00673042660761e-101	154450309	154450309	1.65455868751616e-73	154582414	154586690
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	197	0.0152	1.65455868751616e-73	154582414	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	121	-2.8494	NA	NA	NA	7.58205764468975e-18	3219200	3733715
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-0.6796	7.58205764468975e-18	3219200	3733715	5.30631580896092e-09	5593746	6696721
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6953343	118	116	-2.5987	5.30631580896092e-09	5593746	6696721	1.45347174710025e-05	6904303	7017919
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6954864	7485594	183	176	-1.8833	1.45347174710025e-05	6904303	7017919	1.56575510484572e-06	7368837	7612732
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7491280	7709619	68	65	-2.803	1.56575510484572e-06	7368837	7612732	8.06783166958075e-06	7693408	7716001
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7782532	27	25	-1.5194	8.06783166958075e-06	7693408	7716001	0.0139719196274884	7745143	7895945
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	8043008	65	65	-2.3901	0.0139719196274884	7745143	7895945	8.90317970222728e-05	7926989	8074535
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8047462	8245608	54	52	-3.2821	8.90317970222728e-05	7926989	8074535	3.13309884979248e-12	8214803	8293425
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8251785	8697715	124	116	-2.1873	3.13309884979248e-12	8214803	8293425	1.39075660756103e-05	8652693	8832773
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8698878	10480759	176	167	-2.8586	1.39075660756103e-05	8652693	8832773	6.25920599156197e-12	10448819	10501368
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10483757	12452734	30	29	-1.1044	6.25920599156197e-12	10448819	10501368	1.28877443074022e-05	11249952	12452734
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12536761	9	9	-3.2566	1.28877443074022e-05	11249952	12452734	2.6370728141027e-07	12533900	12542979
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12537944	12682301	56	55	-1.3427	2.6370728141027e-07	12533900	12542979	2.23863828751676e-10	12661168	12700767
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12776542	15	14	-3.2965	2.23863828751676e-10	12661168	12700767	4.74713266630771e-11	12745259	12804329
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12786515	13129843	121	119	-1.4113	4.74713266630771e-11	12745259	12804329	2.39423684580621e-38	13114969	13140274
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13566041	190	185	-2.9091	2.39423684580621e-38	13114969	13140274	0.000214862032599003	13536327	13587025
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13566905	13705594	28	26	-1.975	0.000214862032599003	13536327	13587025	3.94121532479417e-06	13670791	13718946
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716000	13823928	28	27	-3.1492	3.94121532479417e-06	13670791	13718946	2.37295554308809e-08	13820955	13836933
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13828384	13863657	8	8	-1.3097	2.37295554308809e-08	13820955	13836933	4.09149737738166e-05	13854528	13870089
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13866668	14342834	154	149	-2.9238	4.09149737738166e-05	13854528	13870089	2.83405126422325e-10	14335755	14354682
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14379418	18	16	-1.2804	2.83405126422325e-10	14335755	14354682	5.37909435824415e-14	14376942	14379418
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14380301	14407293	13	13	-3.2857	5.37909435824415e-14	14376942	14379418	0.000248056539714248	14404979	14423860
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14409145	14503185	62	62	-2.2187	0.000248056539714248	14404979	14423860	0.0412548735286907	14464288	14506319
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14503927	14508894	4	4	-3.5503	0.0412548735286907	14464288	14506319	0.00210135648179190	14508894	14538156
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14700040	48	48	-1.5443	0.0021013564817919	14508894	14538156	4.67525845248081e-09	14689490	14721033
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14701706	15137457	89	84	-2.8049	4.67525845248081e-09	14689490	14721033	0.000898642187821742	14958284	15198015
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15139441	15295719	89	84	-2.086	0.000898642187821742	14958284	15198015	1.52201646517288e-07	15268792	15308025
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15296498	15408015	72	69	-3.0927	1.52201646517288e-07	15268792	15308025	3.34922238875071e-06	15386844	15458280
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15409110	16224597	277	269	-2.2756	3.34922238875071e-06	15386844	15458280	0.678611934516089	15998663	16377188
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16228031	16387273	29	29	-2.5855	0.678611934516089	15998663	16377188	3.85475521394972e-05	16318293	16426834
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	16659030	39	38	-3.6879	3.85475521394972e-05	16318293	16426834	2.57387462372989e-07	16635994	16707690
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16660742	22930737	1001	955	-2.6521	2.57387462372989e-07	16635994	16707690	1.97221814031324e-39	22916746	26872527
MSK_252152918097_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	84	-1.0343	1.97221814031324e-39	22916746	26872527	NA	NA	NA
