Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	16713074	5782	5522	0.0163	NA	NA	NA	2.40184114691756e-11	16668773	16814050
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16799711	16963812	13	13	-0.6209	2.40184114691756e-11	16668773	16814050	2.58877627891982e-11	16926444	17094326
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17080364	34869589	7099	6796	0.0122	2.58877627891982e-11	16926444	17094326	1.17123807530017e-148	34869589	34869589
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34876833	34883375	4	4	-4.0169	1.17123807530017e-148	34869589	34869589	1.16141210983549e-156	34883375	34883375
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34884849	72537426	14996	14348	0.0023	1.16141210983549e-156	34883375	34883375	3.83514630682585e-94	72537426	72537426
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	1.6709	3.83514630682585e-94	72537426	72537426	3.27068017533622e-97	72579311	72579311
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	120338395	15523	14837	0.001	3.27068017533622e-97	72579311	72579311	1.46811442109746e-07	120326821	120358263
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	120347824	120705146	12	12	-0.5261	1.46811442109746e-07	120326821	120358263	8.67009811759779e-07	120410287	120860077
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	120851476	143653780	81	80	-0.0413	8.67009811759779e-07	120410287	120860077	1.77602760402565e-13	143635542	143706582
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143656552	144093719	83	79	-0.4119	1.77602760402565e-13	143635542	143706582	6.7807809704447e-32	143928815	144107002
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144099302	150819879	1857	1774	0.0078	6.7807809704447e-32	143928815	144107002	1.46883876688966e-32	150818222	150819879
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	10	1.1756	1.46883876688966e-32	150818222	150819879	4.06146924106554e-33	150851439	150852858
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2634	0.0189	4.06146924106554e-33	150851439	150852858	4.89243332903065e-16	157133150	157133150
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	1.8319	4.89243332903065e-16	157133150	157133150	1.21249787029908e-15	157136342	157136342
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	227875096	25426	24297	8e-04	1.21249787029908e-15	157136342	157136342	2.86686697089047e-102	227875096	227875096
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227879152	227882087	3	3	-3.735	2.86686697089047e-102	227875096	227875096	1.70110880217214e-98	227882087	227882087
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227882805	246831381	7367	7062	-0.0097	1.70110880217214e-98	227882087	227882087	5.16354989769424e-07	246820980	246834936
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246834936	246853406	11	11	0.5304	5.16354989769424e-07	246820980	246834936	4.63997536811158e-07	246849755	246863179
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246855902	247186514	103	100	0.0156	4.63997536811158e-07	246849755	246863179	NA	NA	NA
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	1619159	596	563	0.003	NA	NA	NA	1.53572605168159e-07	1619159	1619159
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	1621283	1622579	2	2	-1.3477	1.53572605168159e-07	1619159	1619159	8.14315499650421e-08	1622579	1622579
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	1624267	146571330	44476	42495	-0.001	8.14315499650421e-08	1622579	1622579	7.6490792962498e-10	146562545	146571330
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	1.0528	7.6490792962498e-10	146562545	146571330	3.9744604294677e-10	146592775	146597405
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	242689978	32749	31308	-0.0039	3.9744604294677e-10	146592775	146597405	NA	NA	NA
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10281	6e-04	NA	NA	NA	3.592033022333e-15	32074432	32074432
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.8054	3.592033022333e-15	32074432	32074432	3.71043187307719e-15	32080848	32080848
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	99891210	21385	20397	0.0048	3.71043187307719e-15	32080848	32080848	7.94476942731606e-27	99891210	99891210
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-2.3614	7.94476942731606e-27	99891210	99891210	4.79033848061959e-27	99897201	99897201
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	163992903	21303	20371	0.0018	4.79033848061959e-27	99897201	99897201	5.50021795087167e-48	163992903	163997228
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164027724	8	8	1.5657	5.50021795087167e-48	163992903	163997228	0.0153998669824180	164005577	164056430
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	20	0.9871	0.015399866982418	164005577	164056430	1.86075460311416e-47	164101776	164112873
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	199329592	12116	11566	-0.0068	1.86075460311416e-47	164101776	164112873	NA	NA	NA
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	63346612	17223	16471	-1e-04	NA	NA	NA	1.59865885510172e-83	63346612	63346612
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	63357811	63358506	2	2	-4.1013	1.59865885510172e-83	63346612	63346612	4.76876780421268e-92	63358506	63358506
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	63360367	68899247	1206	1161	-0.0066	4.76876780421268e-92	63358506	63358506	3.96050350646737e-12	68893816	68905670
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	68901210	69144974	13	13	0.59	3.96050350646737e-12	68893816	68905670	1.56051471917268e-10	69120776	69165814
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69153675	186676034	35166	33653	-0.0019	1.56051471917268e-10	69120776	69165814	5.96639227667898e-24	186676034	186676034
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	-2.2179	5.96639227667898e-24	186676034	186676034	7.42443331352673e-21	186680176	186680176
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	187330240	306	290	-0.0368	7.42443331352673e-21	186680176	186680176	5.64508962670714e-12	187330240	187330240
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	1.6313	5.64508962670714e-12	187330240	187330240	5.26969641849239e-13	187333619	187333619
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1183	-0.0156	5.26969641849239e-13	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	180342860	53646	51324	-5e-04	NA	NA	NA	8.08209731938699e-11	180189516	180344964
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	8	0.7775	8.08209731938699e-11	180189516	180344964	1.59248524629769e-12	180357210	180362342
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	105	-0.0142	1.59248524629769e-12	180357210	180362342	NA	NA	NA
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	32558677	11677	11147	0.0049	NA	NA	NA	8.6557090914428e-21	32543054	32588005
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32634977	18	17	0.727	8.6557090914428e-21	32543054	32588005	1.95376185685794e-21	32626619	32653710
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32650672	79018959	14729	14056	0.0013	1.95376185685794e-21	32626619	32653710	1.74881438639722e-28	79015901	79018959
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	12	-0.9885	1.74881438639722e-28	79015901	79018959	9.44522458159878e-29	79091850	79095415
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	165643653	27872	26631	-0.0061	9.44522458159878e-29	79091850	79095415	3.39985476734308e-45	165643653	165643653
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	2.115	3.39985476734308e-45	165643653	165643653	8.89079476815863e-39	165650610	165650610
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1724	0.0073	8.89079476815863e-39	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	64523575	19562	18646	-0.0022	NA	NA	NA	2.39620844478248e-11	64523575	64523575
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64532019	64532949	2	2	-1.5929	2.39620844478248e-11	64523575	64523575	5.56334136104845e-12	64532949	64532949
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64534167	100166257	11499	11022	-0.0012	5.56334136104845e-12	64532949	64532949	1.11286182823234e-52	100166257	100166257
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100170227	100174991	3	3	-2.665	1.11286182823234e-52	100166257	100166257	9.59859996516068e-50	100174991	100174991
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100178968	109217320	3895	3726	0.0042	9.59859996516068e-50	100174991	100174991	2.67287072426410e-105	109217320	109217320
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109230336	109233214	3	3	-3.861	2.6728707242641e-105	109217320	109217320	4.28428172941234e-08	109233214	109233214
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109236813	109240210	2	2	-1.4615	4.28428172941234e-08	109233214	109233214	4.5563722789106e-10	109240210	109240210
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109244233	118611324	4299	4103	-0.0038	4.5563722789106e-10	109240210	109240210	5.86474654609995e-22	118611324	118611324
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	1.727	5.86474654609995e-22	118611324	118611324	9.47339274693709e-21	118620875	118620875
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	142156165	10843	10367	8e-04	9.4733927469371e-21	118620875	118620875	6.89928382446437e-21	142156165	142161005
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142159173	142167908	5	5	-1.3424	6.89928382446437e-21	142156165	142161005	1.62644081275977e-19	142166710	142167908
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142176074	158821263	6579	6279	-0.0064	1.62644081275977e-19	142166710	142167908	NA	NA	NA
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	25022606	8129	7751	0.004	NA	NA	NA	1.02578677750163e-13	25022606	25022606
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	1.4465	1.02578677750163e-13	25022606	25022606	1.74865908674824e-14	25039370	25039370
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	142329141	35049	33552	0.0075	1.74865908674824e-14	25039370	25039370	4.62485091064619e-11	142329141	142329141
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	142331353	142332708	2	2	-1.5492	4.62485091064619e-11	142329141	142329141	3.05660887892050e-10	142332708	142332708
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	142334063	142334063	1	0	NA	3.0566088789205e-10	142332708	142332708	NA	NA	NA
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	142336041	144355892	687	647	0.0267	NA	NA	NA	7.70390989425981e-06	144350304	144365211
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144360602	144370826	5	5	0.7925	7.70390989425981e-06	144350304	144365211	5.27994335635082e-07	144363771	144374639
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144372354	146264846	690	653	0.0222	5.27994335635082e-07	144363771	144374639	NA	NA	NA
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	99041477	22422	21430	-0.0072	NA	NA	NA	2.30313766068929e-22	99036544	99044861
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	99044861	99085751	13	13	-0.8534	2.30313766068929e-22	99036544	99044861	9.10967677185636e-23	99083313	99091105
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	99089716	134542664	13359	12781	-8e-04	9.10967677185636e-23	99083313	99091105	6.19006815229702e-09	134542664	134542664
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	134544331	134545846	2	2	1.3947	6.19006815229702e-09	134542664	134542664	2.43983842580095e-07	134545846	134548747
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	134548747	140145683	2148	2046	0.013	2.43983842580095e-07	134545846	134548747	NA	NA	NA
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	77917893	24592	23484	-0.0094	NA	NA	NA	3.09732126130598e-67	77917893	77917893
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-3.733	3.09732126130598e-67	77917893	77917893	1.56260564436465e-67	77928669	77928669
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	135285645	20214	19311	0.0044	1.56260564436465e-67	77928669	77928669	NA	NA	NA
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5738494	2137	2049	0.0084	NA	NA	NA	4.631810860508e-23	5734978	5738494
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5741031	5766615	17	17	-0.7723	4.631810860508e-23	5734978	5738494	3.84929751738281e-24	5766615	5774108
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5769776	134450318	43150	41159	0.0047	3.84929751738281e-24	5766615	5774108	NA	NA	NA
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3582	0.0142	NA	NA	NA	6.0220023298738e-67	9523923	9550789
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9599999	13	13	-1.4593	6.0220023298738e-67	9523923	9550789	7.07419477006741e-67	9578398	9599999
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	132289090	41406	39588	-0.0011	7.07419477006741e-67	9578398	9599999	NA	NA	NA
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	46215443	10823	10342	0.0025	NA	NA	NA	7.76554635735866e-07	46213907	46215443
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	46216799	46218538	2	2	1.2288	7.76554635735866e-07	46213907	46215443	6.2495010080969e-08	46218538	46219688
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	46219688	49964838	1394	1330	-0.0212	6.2495010080969e-08	46218538	46219688	1.04771859039535e-09	49964838	49964838
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	1.3553	1.04771859039535e-09	49964838	49964838	1.68102829602971e-08	49971732	49974447
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56657371	1805	1717	-7e-04	1.68102829602971e-08	49971732	49974447	7.59836874070449e-09	56607869	56662112
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56658479	56685341	14	14	0.5233	7.59836874070449e-09	56607869	56662112	1.79590971824078e-09	56679017	56691355
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	68142120	2694	2596	-0.0056	1.79590971824078e-09	56679017	56691355	1.11921448343552e-21	68136198	68142120
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68144264	68163523	10	9	-0.9873	1.11921448343552e-21	68136198	68142120	9.79075637842384e-21	68163523	68167758
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68167758	114123340	14900	14268	0.0022	9.79075637842384e-21	68163523	68167758	NA	NA	NA
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	55	-0.4023	NA	NA	NA	3.54961279231823e-21	19467512	19543544
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	73061942	19359	18466	-0.0014	3.54961279231823e-21	19467512	19543544	7.05608262644426e-19	73060301	73061942
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73092112	8	7	1.0597	7.05608262644426e-19	73060301	73061942	2.06239927853221e-16	73092112	73101327
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	73307681	94	91	-0.024	2.06239927853221e-16	73092112	73101327	8.12128934727025e-06	73304106	73309616
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73309616	73315317	4	4	-0.8825	8.12128934727025e-06	73304106	73309616	1.00476180141259e-06	73312152	73317195
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73317195	106358491	12360	11809	-6e-04	1.00476180141259e-06	73312152	73317195	NA	NA	NA
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	32514939	3828	3673	-0.004	NA	NA	NA	2.1448882022163e-29	32454294	32520164
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32517839	32664506	26	26	-0.7143	2.1448882022163e-29	32454294	32520164	1.7114540797142e-31	32594200	32669751
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32667508	100298352	27468	26213	0.001	1.7114540797142e-31	32594200	32669751	NA	NA	NA
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	2593067	1012	974	-0.002	NA	NA	NA	1.97119735046811e-09	2585197	2638581
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2600740	2672074	11	11	0.6521	1.97119735046811e-09	2585197	2638581	3.3952652888906e-10	2666932	2681780
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2677004	57203733	13886	13305	0.0056	3.3952652888906e-10	2666932	2681780	7.30189604600579e-07	57201427	57203733
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	-1.2601	7.30189604600579e-07	57201427	57203733	2.51529059409252e-07	57206772	57208375
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	68693086	3388	3229	0.0113	2.51529059409252e-07	57206772	57208375	3.20541917419879e-10	68685696	68712507
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68838384	11	11	-0.6237	3.20541917419879e-10	68685696	68712507	1.95633001108941e-09	68751390	68849229
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68842364	76923844	2825	2682	-0.0134	1.95633001108941e-09	68751390	68849229	2.87555203992552e-107	76923844	76931247
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76925748	76925748	1	0	NA	2.87555203992552e-107	76923844	76931247	NA	NA	NA
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	-2.3948	NA	NA	NA	6.23194864738004e-102	76937156	76940218
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4313	0.0051	6.23194864738004e-102	76937156	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	31457889	12037	11479	0.0109	NA	NA	NA	6.90031445295238e-13	31439551	31470227
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31895551	23	22	-0.4951	6.90031445295238e-13	31439551	31470227	5.7613962561335e-13	31499568	31906639
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31897238	36673853	1811	1725	6e-04	5.7613962561335e-13	31499568	31906639	8.83577536030589e-47	36673853	36673853
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	1.7724	8.83577536030589e-47	36673853	36673853	6.93236244285597e-45	36684619	36684619
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41529227	2016	1928	0.0142	6.93236244285597e-45	36684619	36684619	1.77798095608487e-06	41512318	41552048
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41533641	41533641	1	0	NA	1.77798095608487e-06	41512318	41552048	NA	NA	NA
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41535779	41570512	17	17	-0.3633	NA	NA	NA	0.000158736550758901	41553226	41576147
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41572001	41648545	36	35	-0.7041	0.000158736550758901	41553226	41576147	1.54487590405245e-40	41647135	41697532
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41652861	78653545	13687	13097	0.0021	1.54487590405245e-40	41647135	41697532	NA	NA	NA
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	10899956	3813	3649	-0.0088	NA	NA	NA	1.67546224212587e-15	10898465	10906903
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	10902247	10912756	7	6	-1.0314	1.67546224212587e-15	10898465	10906903	6.27576886472187e-15	10906903	10914186
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	10914186	76116026	19144	18349	-0.0035	6.27576886472187e-15	10906903	10914186	NA	NA	NA
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	210395	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	216768	1398325	491	467	0.0268	NA	NA	NA	5.89501341699386e-09	1398325	1398325
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.3691	5.89501341699386e-09	1398325	1398325	4.74769326060501e-08	1400840	1405308
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	58010034	19915	19078	0.0135	4.74769326060501e-08	1400840	1405308	3.13756357621271e-22	58008337	58010034
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58019853	58044412	9	9	-1.0141	3.13756357621271e-22	58008337	58010034	5.05865995062394e-21	58044412	58057185
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58044489	58044489	1	0	NA	5.05865995062394e-21	58044412	58057185	NA	NA	NA
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58057185	63788698	2640	2527	0.0091	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1516966	589	570	-0.0104	NA	NA	NA	2.48344253766495e-45	1516966	1518825
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1518825	1531162	6	5	-2.1641	2.48344253766495e-45	1516966	1518825	4.19410088958571e-56	1528899	1531162
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	20053	0.0049	4.19410088958571e-56	1528899	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12876	-0.0047	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	35472378	9551	9161	0.0094	NA	NA	NA	1.77584657471295e-54	35472378	35472378
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.4032	1.77584657471295e-54	35472378	35472378	2.24271498330870e-60	35476942	35476942
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	37685496	1211	1159	0.0319	2.2427149833087e-60	35476942	35476942	1.51769571580620e-28	37683516	37689058
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37689058	37715385	16	16	-0.8155	1.5176957158062e-28	37683516	37689058	5.96717172789516e-24	37709300	37721849
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37718669	49571068	5776	5507	0.006	5.96717172789516e-24	37709300	37721849	NA	NA	NA
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	2638587	1726	1645	0.0188	NA	NA	NA	6.55423829440143e-08	2637964	2638587
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2640451	2640484	2	2	1.36	6.55423829440143e-08	2637964	2638587	7.20105949624483e-09	2640484	2640484
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2642054	2708291	65	64	-0.0909	7.20105949624483e-09	2640484	2640484	1.18482993305742e-111	2708113	2711273
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	8450789	1790	1698	0.9262	1.18482993305742e-111	2708113	2711273	2.24782810878948e-07	8445177	8456422
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8452395	8473482	9	9	0.2166	2.24782810878948e-07	8445177	8456422	9.08088036185668e-09	8465433	8477126
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8475091	76998610	21140	20206	0.9373	9.08088036185668e-09	8465433	8477126	5.87716116338394e-09	76998610	76998610
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	-0.6063	5.87716116338394e-09	76998610	76998610	7.6117014234584e-09	77010018	77010018
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154582414	22193	21219	0.9433	7.6117014234584e-09	77010018	77010018	0	154578922	154586690
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	191	-0.0368	0	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	121	-3.2545	NA	NA	NA	4.59965768939663e-14	3034907	3772482
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-0.9197	4.59965768939663e-14	3034907	3772482	1.37063492201157e-11	5531459	6696721
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6954864	119	114	-2.9953	1.37063492201157e-11	5531459	6696721	2.14095440953173e-07	6926956	7005620
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6955902	6955902	1	0	NA	2.14095440953173e-07	6926956	7005620	NA	NA	NA
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6956705	7248437	102	97	-2.0469	NA	NA	NA	0.000353139391997061	7228333	7250951
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7249762	7262785	9	9	-3.9229	0.000353139391997061	7228333	7250951	0.000324084949528553	7259689	7284775
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7264547	7653082	103	100	-2.1299	0.000324084949528553	7259689	7284775	3.52343154044357e-07	7598374	7698960
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	8538835	245	239	-2.9681	3.52343154044357e-07	7598374	7698960	0.000131800098212623	8334196	8554113
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8539855	8697715	60	59	-2.1755	0.000131800098212623	8334196	8554113	5.5263733269179e-05	8663007	8786453
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8698878	10512616	185	176	-2.9049	5.5263733269179e-05	8663007	8786453	9.36459566152384e-17	10475426	11673476
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10513747	13129843	222	210	-1.8341	9.36459566152384e-17	10475426	11673476	1.53258177337745e-19	13076862	13151875
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13898474	273	264	-2.8792	1.53258177337745e-19	13076862	13151875	6.93649132384963e-09	13863657	13931125
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13903405	14098914	93	89	-3.7018	6.93649132384963e-09	13863657	13931125	1.22973828098613e-10	14084989	14210847
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14100001	14524829	140	135	-2.6965	1.22973828098613e-10	14084989	14210847	0.000106934730165661	14498784	14530134
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14526446	14547168	11	10	-0.963	0.000106934730165661	14498784	14530134	1.96453508509823e-06	14545228	14554415
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14549297	14899294	81	76	-3.0617	1.96453508509823e-06	14545228	14554415	9.02145540779799e-06	14823549	14903285
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14903285	15018205	17	17	-1.5591	9.02145540779799e-06	14823549	14903285	5.10233777974431e-05	15005207	15072515
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15022037	15206674	66	65	-2.8456	5.10233777974431e-05	15005207	15072515	3.51872107857152e-05	15200639	15220050
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15207522	15241527	12	11	-1.1776	3.51872107857152e-05	15200639	15220050	1.67872674490676e-05	15227049	15251900
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15242592	21691199	1258	1199	-2.9945	1.67872674490676e-05	15227049	15251900	1.30885967285758e-05	21674296	21691199
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21692175	21763911	12	11	-1.1654	1.30885967285758e-05	21674296	21691199	4.68397174252433e-06	21761022	21787090
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21768635	22165808	87	86	-2.8737	4.68397174252433e-06	21761022	21787090	4.02787520272996e-06	22139807	22165808
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22166564	22177335	6	6	-0.5752	4.02787520272996e-06	22139807	22165808	7.16844002305586e-05	22177335	22179794
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22182080	4	4	-2.6811	7.16844002305586e-05	22177335	22179794	0.00471703374564134	22179794	22203194
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22192409	22308420	26	26	-3.9897	0.00471703374564134	22179794	22203194	8.86029384548167e-05	22261337	22780866
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22367156	25737663	65	62	-2.829	8.86029384548167e-05	22261337	22780866	1.10181250301534e-10	22918955	26871442
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26945893	31	29	-1.1695	1.10181250301534e-10	22918955	26871442	1.31730957022595e-05	26941769	26990807
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	20	-2.6446	1.31730957022595e-05	26941769	26990807	2.92940449459888e-09	27009433	27053237
MSK_252152918934_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	29	-0.7315	2.92940449459888e-09	27009433	27053237	NA	NA	NA
