Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	61884298	23631	22843	0.016	NA	NA	NA	1.64643007271474e-21	61881731	61884298
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	61887342	61890388	3	3	-0.7877	1.64643007271474e-21	61881731	61884298	5.59829167868309e-08	61890388	61892291
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	61892291	72537426	4260	4130	4e-04	5.59829167868309e-08	61890388	61892291	1.37782655227859e-38	72536231	72539143
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	0.7833	1.37782655227859e-38	72536231	72539143	2.18853993983693e-38	72574479	72596993
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	72589682	1	0	NA	2.18853993983693e-38	72574479	72596993	NA	NA	NA
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72596993	146273223	16253	15749	-0.0058	NA	NA	NA	4.33640394991742e-37	146267449	146286735
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	146274661	147497268	42	40	-0.4655	4.33640394991742e-37	146267449	146286735	4.5864951102565e-45	147467273	147510532
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147508217	150819879	1260	1223	0.0329	4.5864951102565e-45	147467273	147510532	3.24724242512176e-107	150819879	150823073
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	11	1.465	3.24724242512176e-107	150819879	150823073	3.66162795198164e-77	150851439	150851439
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151024118	77	73	-0.042	3.66162795198164e-77	150851439	150851439	2.11754983969315e-08	151020826	151024118
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151026228	151038091	6	6	0.5645	2.11754983969315e-08	151020826	151024118	2.41390864829774e-07	151038091	151042365
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151040463	157133150	2678	2580	0.0201	2.41390864829774e-07	151038091	151042365	1.55518350653549e-49	157133150	157133150
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-2.3571	1.55518350653549e-49	157133150	157133150	1.64336315640566e-48	157136342	157136342
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	246812425	32790	31772	-0.0021	1.64336315640566e-48	157136342	157136342	4.25697105290272e-09	246769018	246822838
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246816703	246860551	21	19	0.3434	4.25697105290272e-09	246769018	246822838	8.2961302606201e-09	246855902	246878405
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246862029	247186514	99	96	0.011	8.2961302606201e-09	246855902	246878405	NA	NA	NA
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	66357387	23294	22496	-0.0072	NA	NA	NA	5.63140388845325e-245	66357387	66357387
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	-5.3028	5.63140388845325e-245	66357387	66357387	2.97040541797138e-256	66360747	66360747
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	232917977	50932	49202	-0.0072	2.97040541797138e-256	66360747	66360747	1.92149576718726e-49	232915549	232926183
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	232920527	233024384	27	26	-0.6582	1.92149576718726e-49	232915549	232926183	6.03608227499158e-48	233009441	233026402
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	233026402	242689978	3572	3445	-3e-04	6.03608227499158e-48	233009441	233026402	NA	NA	NA
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10442	-0.0132	NA	NA	NA	7.3395648860408e-11	32074432	32074432
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.1292	7.3395648860408e-11	32074432	32074432	3.14788355737995e-22	32080848	32080848
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	89475107	19843	19190	-0.0016	3.14788355737995e-22	32080848	32080848	6.66065682286166e-42	89473678	89475107
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89477163	89499433	12	12	-0.8866	6.66065682286166e-42	89473678	89475107	1.27696465161514e-40	89499433	89500935
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89500935	164005577	22838	22080	-0.0056	1.27696465161514e-40	89499433	89500935	2.34386873830059e-78	164005577	164005577
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	-1.8919	2.34386873830059e-78	164005577	164005577	1.22593572965008e-79	164027724	164027724
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164036648	1	0	NA	1.22593572965008e-79	164027724	164027724	NA	NA	NA
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164038917	192546280	9567	9233	-0.0048	NA	NA	NA	1.84010590637493e-13	192544305	192546280
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192548135	192552734	4	4	-0.891	1.84010590637493e-13	192544305	192546280	4.1981219146158e-14	192552734	192554451
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192554451	199329592	2564	2488	-0.0017	4.1981219146158e-14	192552734	192554451	NA	NA	NA
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3296	0.0018	NA	NA	NA	6.83487851824811e-09	9800777	9815760
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	0.73	6.83487851824811e-09	9800777	9815760	3.98610865169678e-09	9842644	9853710
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	68899247	15034	14544	-0.0117	3.98610865169678e-09	9842644	9853710	4.99363899879233e-14	68896316	68905670
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	68901210	69144974	13	12	0.5117	4.99363899879233e-14	68896316	68905670	7.16058998398867e-14	69120776	69163312
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69153675	107275274	12708	12310	-0.0044	7.16058998398867e-14	69120776	69163312	4.75593948503839e-249	107275274	107275274
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107276428	107281410	4	4	-3.6963	4.75593948503839e-249	107275274	107275274	6.38008317206698e-245	107281410	107281410
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107283257	191153613	24005	23225	-0.0095	6.38008317206698e-245	107281410	107281410	NA	NA	NA
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	737829	222	216	-0.0067	NA	NA	NA	6.02603212527267e-09	729262	737829
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	776194	829954	6	6	-0.6458	6.02603212527267e-09	729262	737829	3.87600284434533e-09	829954	873365
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	12857302	3747	3626	-0.0414	3.87600284434533e-09	829954	873365	9.30265099547064e-204	12857302	12857302
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	-4.8373	9.30265099547064e-204	12857302	12857302	1.2791551733466e-209	12873052	12873052
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	150181399	39877	38578	-0.0074	1.2791551733466e-209	12873052	12873052	1.17386772284876e-24	150171154	150181399
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150185190	150204134	8	8	-0.8504	1.17386772284876e-24	150171154	150181399	2.53002026687870e-25	150204134	150207307
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150207307	178040439	8874	8578	-6e-04	2.5300202668787e-25	150204134	150207307	2.42754666994785e-57	178040439	178040439
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178044111	178045608	2	2	-2.5559	2.42754666994785e-57	178040439	178040439	1.01130126977172e-48	178045608	178045608
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178047480	180342860	908	878	0.0232	1.01130126977172e-48	178045608	178045608	6.93035556810152e-17	180194323	180342860
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	8	0.7453	6.93035556810152e-17	180194323	180342860	1.88930953258172e-14	180358977	180362342
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180632269	111	104	0.0149	1.88930953258172e-14	180358977	180362342	NA	NA	NA
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180644810	180644810	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	26811016	9366	9026	-0.005	NA	NA	NA	3.26447467309216e-08	26801068	26853170
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26849722	26863540	5	5	-0.6344	3.26447467309216e-08	26801068	26853170	6.31817581116418e-09	26855591	26868404
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26865624	29950805	1216	1179	0.0014	6.31817581116418e-09	26855591	26868404	6.91583602793282e-27	29941766	29966336
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30010234	15	15	0.635	6.91583602793282e-27	29941766	29966336	2.71847142877783e-22	30004636	30021908
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30021908	31385778	580	558	0.0325	2.71847142877783e-22	30004636	30021908	1.57996008185001e-11	31383925	31385778
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31418006	6	6	-0.641	1.57996008185001e-11	31383925	31385778	3.64316823871773e-12	31418006	31425113
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	31977091	239	233	0.0471	3.64316823871773e-12	31418006	31425113	2.00836236080678e-11	31975491	31977091
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31979641	31982948	3	3	-0.8949	2.00836236080678e-11	31975491	31977091	5.4726042791632e-10	31982948	31988177
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31988177	32558677	247	238	0.0136	5.4726042791632e-10	31982948	31988177	2.36790342718051e-28	32548736	32567462
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32634977	18	18	0.6868	2.36790342718051e-28	32548736	32567462	3.32792085322415e-35	32628420	32650672
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32650672	38948531	2770	2680	0.0181	3.32792085322415e-35	32628420	32650672	8.70625787568541e-08	38945420	38952677
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	38951539	38962797	6	6	-0.5366	8.7062578756854e-08	38945420	38952677	7.37200914167033e-07	38957634	38970063
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	38966392	65767409	7919	7663	-0.0105	7.37200914167033e-07	38957634	38970063	1.58905066957272e-19	65767409	65767409
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65769146	65771532	2	2	-1.5039	1.58905066957272e-19	65767409	65767409	1.18434899487997e-19	65771532	65771532
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65778663	79015901	4031	3893	-0.0042	1.18434899487997e-19	65771532	65771532	3.00675507845961e-43	79011979	79015901
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79018959	79091850	14	12	-0.9031	3.00675507845961e-43	79011979	79015901	1.10428370055095e-42	79091850	79095415
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	83875399	1227	1187	-0.0169	1.10428370055095e-42	79091850	79095415	7.15578795228379e-11	83873814	83881479
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	83877148	83888753	6	6	0.628	7.15578795228379e-11	83873814	83881479	1.5462959304902e-10	83881479	83889868
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	83889868	103827105	5528	5353	-0.0106	1.5462959304902e-10	83881479	83889868	8.91093944152309e-27	103827105	103827105
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103841482	103841482	1	0	NA	8.91093944152309e-27	103827105	103827105	NA	NA	NA
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	1.2143	NA	NA	NA	2.91725493976852e-26	103868154	103868154
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	165643653	21106	20467	-0.0076	2.91725493976852e-26	103868154	103868154	8.1323965722451e-20	165643653	165643653
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.0591	8.1323965722451e-20	165643653	165643653	4.32788589197992e-19	165650610	165650610
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1739	-0.0138	4.32788589197992e-19	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	16135701	5388	5191	0.0019	NA	NA	NA	4.8725793092371e-188	16135701	16135701
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-4.6248	4.8725793092371e-188	16135701	16135701	2.95432249400354e-192	16140018	16140018
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	109967918	29877	28908	-0.003	2.95432249400354e-192	16140018	16140018	2.9668564263818e-66	109967918	109967918
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109970524	109974402	2	2	-2.7351	2.9668564263818e-66	109967918	109967918	1.86226208912442e-65	109974402	109974402
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109976628	109976628	1	0	NA	1.86226208912442e-65	109974402	109974402	NA	NA	NA
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109980654	118611324	3995	3864	-0.0066	NA	NA	NA	1.07319484288067e-14	118611324	118611324
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	1.0469	1.07319484288067e-14	118611324	118611324	6.14966797359033e-14	118620875	118620875
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	141410894	10535	10184	-0.0046	6.14966797359033e-14	118620875	118620875	4.98976751563297e-24	141409512	141414719
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	14	0.6282	4.98976751563297e-24	141409512	141414719	1.46893963849621e-25	141435643	141442231
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141690753	116	114	-0.0056	1.46893963849621e-25	141435643	141442231	4.42022675518079e-62	141690753	141690753
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	9	1.1414	4.42022675518079e-62	141690753	141690753	3.17177410568753e-49	141714168	141714168
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	143503317	659	638	0.0077	3.17177410568753e-49	141714168	141714168	2.73507629760959e-15	143503317	143503317
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143582864	143584350	3	3	-1.097	2.73507629760959e-15	143503317	143503317	1.41152753533030e-14	143584350	143584350
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143705425	158821263	6090	5901	-0.0042	1.4115275353303e-14	143584350	143584350	NA	NA	NA
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	25120552	8159	7877	-0.0192	NA	NA	NA	1.09152943979408e-41	25120552	25120552
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25124428	2	2	2.2529	1.09152943979408e-41	25120552	25120552	7.07992209182703e-44	25124428	25124428
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25125700	25125700	1	0	NA	7.07992209182703e-44	25124428	25124428	NA	NA	NA
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	32797545	3031	2941	-0.0035	NA	NA	NA	3.23902890778572e-52	32797545	32797545
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32800775	32800775	1	0	NA	3.23902890778572e-52	32797545	32797545	NA	NA	NA
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32805686	32808049	2	2	-2.461	NA	NA	NA	1.35965945179475e-52	32808049	32808049
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32812909	39350798	1878	1812	0.0022	1.35965945179475e-52	32808049	32808049	3.88197478544049e-103	39345557	39354149
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39504332	58	57	0.6572	3.88197478544049e-103	39345557	39354149	4.11846195055071e-92	39499752	39505256
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39505256	40892587	442	431	-0.0161	4.11846195055071e-92	39499752	39505256	6.70465625372098e-185	40892587	40892587
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-4.7992	6.70465625372098e-185	40892587	40892587	5.8569182223903e-208	40897469	40897469
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	146253929	30989	29939	-0.0085	5.8569182223903e-208	40897469	40897469	NA	NA	NA
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	146264846	146264846	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5277	-0.0234	NA	NA	NA	1.46850489658040e-09	15801123	15802255
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15813356	3	3	0.8489	1.4685048965804e-09	15801123	15802255	4.99337968096346e-09	15813356	15813954
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813954	84556366	12129	11713	-0.0041	4.99337968096346e-09	15813356	15813954	9.66097667928482e-18	84556366	84556366
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	84564109	84568906	4	4	-1.0193	9.66097667928482e-18	84556366	84556366	5.96879131073894e-18	84568906	84568906
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	84580673	133250165	17606	17006	0.001	5.96879131073894e-18	84568906	84568906	2.35968408774440e-15	133250165	133250165
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	133251786	133254922	2	2	-1.0752	2.3596840877444e-15	133250165	133250165	4.4469826824321e-10	133254922	133254922
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	133257756	140145683	2742	2645	0.0149	4.4469826824321e-10	133254922	133254922	NA	NA	NA
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	70949263	21675	20936	-0.0094	NA	NA	NA	1.54010903921892e-13	70949263	70949263
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70952973	70960187	4	3	-1.0461	1.54010903921892e-13	70949263	70949263	3.07935037385857e-14	70960187	70960187
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70964344	100676022	10678	10292	0.0018	3.07935037385857e-14	70960187	70960187	5.6586337525953e-08	100670683	100676022
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100678817	100693036	5	5	-0.6175	5.6586337525953e-08	100670683	100676022	3.9173264803848e-10	100693036	100698855
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100695568	135285645	12446	12025	-0.0031	3.9173264803848e-10	100693036	100698855	NA	NA	NA
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	55140052	16913	16371	0.0019	NA	NA	NA	3.17683267619401e-08	55124730	55142203
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55142193	55190146	20	17	0.3478	3.17683267619401e-08	55124730	55142203	8.96242602500175e-09	55184759	55200744
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55191277	66460753	4648	4508	0.017	8.96242602500175e-09	55184759	55200744	9.14991569320968e-12	66460753	66460753
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66463477	66463477	1	0	NA	9.14991569320968e-12	66460753	66460753	NA	NA	NA
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	-1.1389	NA	NA	NA	8.46811211098124e-11	66469412	66469412
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	134450318	23720	22965	-0.0039	8.46811211098124e-11	66469412	66469412	NA	NA	NA
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3617	0.0103	NA	NA	NA	0	9523923	9523923
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9554149	5	5	-4.0808	0	9523923	9523923	3.22757109462237e-15	9554149	9554149
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	9610054	11	9	-1.2825	3.22757109462237e-15	9554149	9554149	3.78651807715971e-47	9607363	9610054
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	11109483	568	549	-0.0274	3.78651807715971e-47	9607363	9610054	1.18571148864934e-09	11104973	11109483
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11110735	11123452	5	5	-0.7849	1.18571148864934e-09	11104973	11109483	4.11475383002168e-07	11123452	11125311
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11125311	11128557	3	3	-2.5723	4.11475383002168e-07	11123452	11125311	2.76940145382906e-84	11128557	11128557
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11130871	11130871	1	0	NA	2.76940145382906e-84	11128557	11128557	NA	NA	NA
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	31132762	6820	6569	-0.0099	NA	NA	NA	1.32243344418987e-20	31084265	31171313
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31169263	31248212	21	21	-0.4948	1.32243344418987e-20	31084265	31171313	2.47868997920474e-22	31245432	31251807
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31249495	132289090	33985	32820	0.0017	2.47868997920474e-22	31245432	31251807	NA	NA	NA
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	36969571	7039	6843	0.0017	NA	NA	NA	6.8086601080636e-08	36964477	36969571
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36976441	36982877	2	2	0.9732	6.8086601080636e-08	36964477	36969571	4.11336312109887e-08	36982877	36989091
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36989091	49964838	5178	5015	-0.0038	4.11336312109887e-08	36982877	36989091	2.48521020467215e-31	49964838	49964838
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-1.8739	2.48521020467215e-31	49964838	49964838	4.49980247201157e-29	49971732	49971732
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56664197	1810	1755	-0.008	4.49980247201157e-29	49971732	49971732	8.98208776943445e-11	56662112	56672324
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56666220	56685341	9	9	0.5363	8.98208776943445e-11	56662112	56672324	3.08892870361289e-12	56680346	56688605
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	68142120	2694	2613	-0.0105	3.08892870361289e-12	56680346	56688605	1.47656372691719e-32	68142120	68142120
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68144264	68163523	10	8	-0.9431	1.47656372691719e-32	68142120	68142120	5.02798186994575e-31	68163523	68163523
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68167758	114123340	14900	14405	-0.012	5.02798186994575e-31	68163523	68163523	NA	NA	NA
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18508651	3	3	0.2452	NA	NA	NA	0.00208892209796700	18505611	18537177
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18527871	19494416	57	56	-0.3819	0.002088922097967	18505611	18537177	6.08483675005285e-37	19484013	19540294
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	73061942	19359	18704	0.001	6.08483675005285e-37	19484013	19540294	9.39037944336781e-33	73061942	73061942
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73092112	8	7	1.0208	9.39037944336781e-33	73061942	73061942	2.26454961889366e-31	73092112	73092112
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	79172702	2913	2808	0.0057	2.26454961889366e-31	73092112	73092112	2.68482006335165e-10	79170216	79172702
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79174722	79183154	5	5	-0.5906	2.68482006335165e-10	79170216	79172702	1.56111231023431e-07	79183154	79186704
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	105597555	9297	8961	0.0016	1.56111231023431e-07	79183154	79186704	8.45800669055933e-27	105595302	105602602
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	0.7009	8.45800669055933e-27	105595302	105602602	1.7895017139347e-15	105630089	105673157
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105856972	50	50	-0.0271	1.7895017139347e-15	105630089	105673157	1.07676595215748e-06	105850033	105856972
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105872360	105875924	3	3	-0.8457	1.07676595215748e-06	105850033	105856972	1.22369181446016e-09	105875924	105881677
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881677	105923686	16	16	-0.0248	1.22369181446016e-09	105875924	105881677	6.48924240137329e-12	105923159	105948347
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105945006	106002179	20	17	-0.6523	6.48924240137329e-12	105923159	105948347	3.28698624302657e-14	105996176	106017453
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106216726	89	87	-0.0955	3.28698624302657e-14	105996176	106017453	0.00131956366692402	106144329	106260962
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106218059	106358491	53	51	0.0853	0.00131956366692402	106144329	106260962	NA	NA	NA
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.0802	NA	NA	NA	0.000489262144523931	18452491	18818949
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	19134391	32	32	-0.3389	0.000489262144523931	18452491	18818949	0.000276304314802665	18884436	19202505
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19137963	19845942	73	71	-0.0942	0.000276304314802665	18884436	19202505	8.87654024573534e-158	19845942	19845942
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19874677	19882711	3	3	-4.3857	8.87654024573534e-158	19845942	19845942	1.60509278399463e-260	19882711	19882711
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19910696	41676221	7399	7157	-0.0016	1.60509278399463e-260	19882711	19882711	1.03554597585601e-11	41676221	41676221
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41682925	41682937	2	2	1.1688	1.03554597585601e-11	41676221	41676221	1.84206401123838e-11	41682937	41682937
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41704248	96389619	22108	21367	0.0064	1.84206401123838e-11	41682937	41682937	1.57718133549024e-31	96389619	96392899
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	96392899	96408247	7	7	-1.0003	1.57718133549024e-31	96389619	96392899	1.93304685664118e-31	96406471	96408247
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	96411869	96411869	1	0	NA	1.93304685664118e-31	96406471	96408247	NA	NA	NA
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	96414042	100298352	1692	1631	0.0056	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	57203733	14909	14416	0.0098	NA	NA	NA	1.19823683081270e-11	57203733	57203733
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	1.1771	1.1982368308127e-11	57203733	57203733	1.58693981866747e-11	57206772	57206772
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	75093957	5612	5440	0.0147	1.58693981866747e-11	57206772	57206772	1.20558523916431e-16	75093957	75093957
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.1464	1.20558523916431e-16	75093957	75093957	3.29992449824549e-16	75100865	75100865
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76923844	609	588	-0.0205	3.29992449824549e-16	75100865	75100865	2.37296367847777e-243	76923844	76929598
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76925748	76925748	1	0	NA	2.37296367847777e-243	76923844	76929598	NA	NA	NA
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	-2.986	NA	NA	NA	6.71399998313137e-307	76940218	76940218
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4362	0.0014	6.71399998313137e-307	76940218	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	31461588	12038	11630	0.0212	NA	NA	NA	6.3551476385854e-30	31451114	31467971
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31462463	31503774	18	18	-0.586	6.3551476385854e-30	31451114	31467971	1.12055480107079e-31	31493990	31889566
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	36673853	1815	1761	0.0259	1.12055480107079e-31	31493990	31889566	4.99762180305919e-59	36673853	36673853
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	5	1.5999	4.99762180305919e-59	36673853	36673853	2.48398806244843e-54	36684619	36684619
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41522429	2013	1945	0.0301	2.48398806244843e-54	36684619	36684619	7.93960459849103e-11	41514481	41527705
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41526558	41568539	20	20	-0.3274	7.93960459849103e-11	41514481	41527705	3.34034194989766e-10	41562786	41576147
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41570512	78653545	13724	13263	0.0139	3.34034194989766e-10	41562786	41576147	NA	NA	NA
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	40226609	11794	11410	-0.0128	NA	NA	NA	2.94245553401793e-20	40226609	40226609
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	40230827	40235901	3	3	-1.2563	2.94245553401793e-20	40226609	40226609	6.93564377220465e-20	40235901	40235901
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	40244566	76116026	11167	10829	-0.015	6.93564377220465e-20	40235901	40235901	NA	NA	NA
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	210395	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	216768	19694025	9026	8721	0.042	NA	NA	NA	2.78221186280704e-12	19694025	19694025
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19699024	19700620	3	3	-0.8895	2.78221186280704e-12	19694025	19694025	1.90742319302668e-08	19699485	19702214
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19702214	20420327	187	184	-0.053	1.90742319302668e-08	19699485	19702214	2.94849334973022e-24	20399700	20425020
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20422223	20510787	16	15	-0.7283	2.94849334973022e-24	20399700	20425020	1.62860477051649e-39	20493401	20517399
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20517399	58208527	11234	10862	0.0307	1.62860477051649e-39	20493401	20517399	3.6274878578993e-19	58204170	58213220
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58212113	58212113	1	0	NA	3.6274878578993e-19	58204170	58213220	NA	NA	NA
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58213220	58244012	14	14	0.5666	NA	NA	NA	2.56680151815407e-18	58239871	58249435
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58247367	63788698	2577	2479	0.0309	2.56680151815407e-18	58239871	58249435	NA	NA	NA
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1511632	587	563	-8e-04	NA	NA	NA	1.68142060155961e-133	1511632	1515948
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1515948	1531162	8	6	-2.5745	1.68142060155961e-133	1511632	1515948	4.44678770224568e-177	1528899	1531162
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	1532433	1	0	NA	4.44678770224568e-177	1528899	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	20301	0.0021	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12989	-0.0079	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	49571068	16557	16046	0.0191	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	2302065	1400	1356	0.0357	NA	NA	NA	2.20935717237562e-46	2302065	2302065
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	-1.5651	2.20935717237562e-46	2302065	2302065	7.0863171804445e-45	2304398	2304398
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2672401	362	347	0.0265	7.0863171804445e-45	2304398	2304398	1.69592430815679e-08	2666368	2687984
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672477	2708291	27	26	-0.2593	1.69592430815679e-08	2666368	2687984	2.93814651536705e-116	2708291	2708291
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	127454467	36217	34962	0.9404	2.93814651536705e-116	2708291	2708291	6.94647252205351e-28	127450133	127454467
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127457310	127546719	13	12	0.0645	6.94647252205351e-28	127450133	127454467	5.92939313782752e-27	127546719	127552514
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127552514	154038318	8771	8468	0.9288	5.92939313782752e-27	127546719	127552514	2.58490425715135e-10	154023900	154044828
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154078819	11	11	1.3785	2.58490425715135e-10	154023900	154044828	2.54746443504373e-08	154078401	154088378
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154582414	122	119	0.9068	2.54746443504373e-08	154078401	154088378	1.50145657306305e-259	154570196	154582414
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	199	0.0086	1.50145657306305e-259	154570196	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	119	-3.7243	NA	NA	NA	8.04502736620352e-19	3219200	3733715
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-1.0684	8.04502736620352e-19	3219200	3733715	3.93521236614801e-30	5593746	5672441
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6741838	14	13	-4.6321	3.93521236614801e-30	5593746	5672441	0.00182653639918093	6737995	6794058
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6749047	6955902	106	101	-3.0803	0.00182653639918093	6737995	6794058	0.000203202691427888	6897528	7019523
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6956705	7485594	181	178	-2.3259	0.000203202691427888	6897528	7019523	2.90354512253161e-07	7384405	7614571
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7491280	7723783	77	74	-3.4166	2.90354512253161e-07	7384405	7614571	0.000143456709489651	7707621	7723783
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7751430	11	10	-1.2558	0.000143456709489651	7707621	7723783	0.000322517172151902	7751430	7798534
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7755522	8010446	69	68	-3.0055	0.000322517172151902	7751430	7798534	2.66866623150753e-05	7936024	8058483
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8016395	8178487	36	33	-4.2153	2.66866623150753e-05	7936024	8058483	1.25972520185158e-05	8167434	8178487
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8179883	8195174	6	6	-2.2713	1.25972520185158e-05	8167434	8178487	0.000269411958255622	8195174	8211300
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8199414	8289709	21	20	-4.3178	0.000269411958255622	8195174	8211300	2.42220873010328e-06	8251785	8300654
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8292347	8690572	113	110	-2.8488	2.42220873010328e-06	8251785	8300654	0.000249062721066126	8666055	8696392
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8692156	8725366	17	15	-4.2534	0.000249062721066126	8666055	8696392	0.000249244329260544	8705291	8748423
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8725431	8956787	63	60	-3.0061	0.000249244329260544	8705291	8748423	0.00054844352269605	8880912	9155283
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8958121	10513747	111	105	-3.7487	0.00054844352269605	8880912	9155283	8.53362016269462e-28	10511255	10515697
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	12452734	20	20	-0.79	8.53362016269462e-28	10511255	10515697	2.39570762571907e-16	11698871	12502304
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12541506	11	11	-3.732	2.39570762571907e-16	11698871	12502304	9.10295500535827e-06	12536761	12550566
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	52	-1.756	9.10295500535827e-06	12536761	12550566	6.06661900650944e-07	12651786	12700767
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12776542	15	14	-3.7868	6.06661900650944e-07	12651786	12700767	8.29926497797426e-08	12745259	12792780
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12786515	12905395	33	32	-1.7826	8.29926497797426e-08	12745259	12792780	4.19292331420548e-06	12899653	12905395
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12909643	12922667	5	5	-4.1197	4.19292331420548e-06	12899653	12905395	1.84437664101961e-05	12922667	12926941
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12924438	13129843	83	77	-1.7017	1.84437664101961e-05	12922667	12926941	2.67309485636472e-38	13119344	13138841
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13868296	256	247	-3.576	2.67309485636472e-38	13119344	13138841	3.11299202001045e-06	13749720	13922951
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13869106	14098914	110	106	-4.2598	3.11299202001045e-06	13749720	13922951	0.00661368766807038	14017919	14273899
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14100001	14343139	43	42	-3.5281	0.00661368766807038	14017919	14273899	0.000854810119195898	14321882	14404284
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14349668	14524829	97	93	-2.5958	0.000854810119195898	14321882	14404284	2.97822449063847e-05	14500820	14528771
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14526446	14547168	11	10	-0.6471	2.97822449063847e-05	14500820	14528771	0.00108889413059975	14539230	14566592
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14549297	14700040	36	35	-2.3841	0.00108889413059975	14539230	14566592	0.00127181349641407	14598838	14737877
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14701706	15095427	76	72	-3.3992	0.00127181349641407	14598838	14737877	2.44936293783721e-05	14952770	15115689
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15099698	15165820	31	31	-2.2306	2.44936293783721e-05	14952770	15115689	0.000566699987386195	15154705	15182292
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15169415	15206674	21	21	-3.3996	0.000566699987386195	15154705	15182292	1.66046496699185e-05	15201695	15209166
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15207522	15241527	12	12	-1.5408	1.66046496699185e-05	15201695	15209166	7.83576796601683e-09	15228303	15244992
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15242592	15433122	128	123	-3.5981	7.83576796601683e-09	15228303	15244992	9.59650176777006e-06	15413514	15469100
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15434486	15559959	61	61	-2.6502	9.59650176777006e-06	15413514	15469100	4.83065319157038e-05	15531144	15590299
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15560912	15920478	66	64	-3.729	4.83065319157038e-05	15531144	15590299	4.04410674156569e-07	15826121	15979526
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15928904	16387273	161	158	-2.6865	4.04410674156569e-07	15826121	15979526	1.18547362071826e-15	16253090	16552565
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	22157319	939	893	-3.5828	1.18547362071826e-15	16253090	16552565	2.68180185650463e-05	22051284	22157319
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22158616	22177335	8	8	-1.3734	2.68180185650463e-05	22051284	22157319	2.97164406671832e-22	22177335	22178964
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22268552	29	29	-4.6484	2.97164406671832e-22	22177335	22178964	0.00230216022482284	22243796	22803154
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22308420	22930737	64	61	-3.7263	0.00230216022482284	22243796	22803154	9.65197831093944e-42	22924754	25737663
MSK_252152918935_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	84	-1.2469	9.65197831093944e-42	22924754	25737663	NA	NA	NA
