Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	16713074	5782	5623	-0.5287	NA	NA	NA	2.53958301266751e-13	16668773	16814050
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16799711	16926444	11	11	-1.2453	2.53958301266751e-13	16668773	16814050	2.67016860907321e-10	16921319	17080364
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16961001	21570058	1929	1875	-0.545	2.67016860907321e-10	16921319	17080364	5.29233051474512e-16	21570058	21570058
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	21572796	21576546	2	2	-2.5717	5.29233051474512e-16	21570058	21570058	1.07273220917196e-17	21576546	21576546
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	21578725	21578725	1	0	NA	1.07273220917196e-17	21576546	21576546	NA	NA	NA
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	21581623	27853966	2563	2491	-0.5238	NA	NA	NA	7.8261508909466e-07	27848427	27853966
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	27857226	27860520	3	3	0.5376	7.8261508909466e-07	27848427	27853966	4.97413926548166e-07	27860520	27862523
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	27862523	72537426	17603	17171	-0.5614	4.97413926548166e-07	27860520	27862523	3.35362918766604e-69	72537426	72539143
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	0.9554	3.35362918766604e-69	72537426	72539143	6.94244812581191e-70	72574479	72579311
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	85742732	4043	3957	-0.546	6.94244812581191e-70	72574479	72579311	6.4128349908996e-08	85731877	85753561
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	85745222	85772922	13	13	-0.0063	6.4128349908996e-08	85731877	85753561	3.02151496853135e-08	85769496	85785843
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	85776171	85776171	1	0	NA	3.02151496853135e-08	85769496	85785843	NA	NA	NA
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	85778723	121023841	11532	11210	-0.5568	NA	NA	NA	4.94153382895547e-54	121007786	121038335
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	121024339	144093719	110	105	-0.0774	4.94153382895547e-54	121007786	121038335	1.19485102888471e-43	143971430	144108338
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144099302	146268572	553	534	0.3739	1.19485102888471e-43	143971430	144108338	2.97990577030031e-18	146242212	146286735
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	146273215	148081741	49	47	-0.052	2.97990577030031e-18	146242212	146286735	6.2000508614423e-23	147497268	148115321
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	148081769	150823073	1256	1224	0.3939	6.2000508614423e-23	147497268	148115321	3.15523113060448e-20	150819879	150836484
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150851439	10	10	1.2893	3.15523113060448e-20	150819879	150836484	3.1053418934707e-19	150847304	150852858
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	75	0.3158	3.1053418934707e-19	150847304	150852858	1.66312940607525e-102	151026228	151026228
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	-4.0863	1.66312940607525e-102	151026228	151026228	1.73419967204208e-186	151036435	151036435
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2605	0.3912	1.73419967204208e-186	151036435	151036435	4.8248554428792e-16	157133150	157133150
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	2.2596	4.8248554428792e-16	157133150	157133150	8.94966345332812e-17	157136342	157136342
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	161099582	1622	1588	0.3851	8.94966345332812e-17	157136342	157136342	8.08149094099326e-09	161099582	161099582
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161104752	161104791	2	2	-0.9899	8.08149094099326e-09	161099582	161099582	1.33029696807971e-08	161104791	161104791
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161108722	241340181	28881	28128	0.4013	1.33029696807971e-08	161104791	161104791	1.18799973292145e-09	241026683	241371839
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	241350083	241350083	1	0	NA	1.18799973292145e-09	241026683	241371839	NA	NA	NA
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	241351223	241440101	33	33	0.0404	NA	NA	NA	1.31617040101057e-08	241418448	241459225
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	241442091	247186514	2371	2326	0.3855	1.31617040101057e-08	241418448	241459225	NA	NA	NA
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	13113316	4162	4046	-0.0159	NA	NA	NA	5.89025465122856e-13	13095095	13119002
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	13119002	13199426	14	14	0.6061	5.89025465122856e-13	13095095	13119002	5.599902854278e-11	13196226	13204553
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	13200787	43934924	11291	11016	0.0262	5.599902854278e-11	13196226	13204553	8.32194623438363e-09	43930985	43934924
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	43937215	43949625	6	6	-0.7736	8.32194623438363e-09	43930985	43934924	5.48773556314778e-09	43949625	43955033
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	43953461	87149187	14420	14011	0.0292	5.48773556314778e-09	43949625	43955033	2.49121007532156e-22	87131062	87260223
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	87245647	87721951	15	15	0.8102	2.49121007532156e-22	87131062	87260223	3.69710494153637e-23	87592184	87926461
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	87926461	110206301	4916	4792	0.0208	3.69710494153637e-23	87592184	87926461	1.22823203995342e-34	110195935	110216639
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	110210249	110340933	51	49	0.5533	1.22823203995342e-34	110195935	110216639	1.04294653729266e-32	110330114	111123107
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	111108666	146571330	10199	9953	0.029	1.04294653729266e-32	110330114	111123107	1.42313096245001e-105	146571330	146571330
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	3	-3.7385	1.42313096245001e-105	146571330	146571330	1.30634543394187e-106	146592775	146592775
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	242689978	32749	31911	0.0377	1.30634543394187e-106	146592775	146592775	NA	NA	NA
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	47460892	16218	15805	0.0109	NA	NA	NA	5.53874158425019e-73	47460892	47460892
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	-3.8019	5.53874158425019e-73	47460892	47460892	4.21794310137658e-73	47466921	47466921
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	174721900	40648	39551	0.0218	4.21794310137658e-73	47466921	47466921	1.23007049305045e-18	174714523	174722441
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	174722441	174772331	22	22	0.6158	1.23007049305045e-18	174714523	174722441	4.42651870052647e-19	174770313	174779589
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	174775059	199329592	8742	8507	0.0159	4.42651870052647e-19	174770313	174779589	NA	NA	NA
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	58159	9	9	-0.2965	NA	NA	NA	0.000360397794257130	42941	156454
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	61552	34445002	9555	9317	0.0055	0.00036039779425713	42941	156454	4.25146791689652e-208	34445002	34445002
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	-3.6952	4.25146791689652e-208	34445002	34445002	4.74389405738506e-215	34491115	34491115
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	48777988	4701	4574	0.0176	4.74389405738506e-215	34491115	34491115	0	48761640	52385001
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	52380712	69075140	4164	4046	-0.5609	0	48761640	52385001	4.03974607737713e-106	69075140	69075140
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69085386	69165814	12	11	-2.57	4.03974607737713e-106	69075140	69075140	3.74790246412201e-104	69165814	69165814
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	90916083	7413	7208	-0.5523	3.74790246412201e-104	69165814	69165814	1.07622301147215e-09	90916083	90916083
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	90921222	90922336	2	2	-2.0377	1.07622301147215e-09	90916083	90916083	4.9538625935229e-10	90922336	90922336
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	90924374	107275274	5290	5142	-0.5449	4.9538625935229e-10	90922336	90922336	1.66499500457883e-21	107275274	107275274
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107276428	107283257	5	5	-1.9057	1.66499500457883e-21	107275274	107275274	3.74294102908712e-21	107283257	107283257
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107284892	119550771	3679	3594	-0.5536	3.74294102908712e-21	107283257	107283257	1.75330277181875e-07	119507631	119639593
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119623202	119696168	20	20	-0.1417	1.75330277181875e-07	119507631	119639593	4.48602739268920e-07	119676881	119732017
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119698139	173224400	14784	14435	-0.5522	4.4860273926892e-07	119676881	119732017	3.28474928720469e-40	173224400	173224400
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-3.5101	3.28474928720469e-40	173224400	173224400	6.51365857481487e-41	173228860	173228860
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	187330240	4276	4163	-0.5495	6.51365857481487e-41	173228860	173228860	1.54844028381839e-15	187330240	187330240
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	1.2973	1.54844028381839e-15	187330240	187330240	3.77577423205419e-15	187333619	187333619
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1212	-0.5746	3.77577423205419e-15	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	127434789	35318	34434	0.0216	NA	NA	NA	5.11415760225381e-47	127434789	127434789
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	127436376	127438118	2	2	-3.0573	5.11415760225381e-47	127434789	127434789	8.06855106455318e-46	127438118	127438118
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	127439603	180644810	18446	17943	0.0087	8.06855106455318e-46	127438118	127438118	NA	NA	NA
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	240119	56	55	-0.049	NA	NA	NA	4.88219360549904e-09	227473	248239
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	241674	329100	47	46	-0.4405	4.88219360549904e-09	227473	248239	1.06700445994021e-21	323898	339279
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	331014	29950805	10484	10215	-0.0021	1.06700445994021e-21	323898	339279	1.53922885408470e-11	29937319	29973024
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30010234	15	15	0.5652	1.5392288540847e-11	29937319	29973024	9.74561118503858e-11	29998009	30030032
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30021908	32558677	1075	1047	0.0134	9.74561118503858e-11	29998009	30030032	9.9803746649329e-95	32558677	32563252
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32590568	5	5	-2.871	9.9803746649329e-95	32558677	32563252	1.69142394388994e-103	32588005	32590568
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32593151	54035000	8307	8106	0.0082	1.69142394388994e-103	32588005	32590568	3.66215352797683e-120	54035000	54035000
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-3.9729	3.66215352797683e-120	54035000	54035000	1.58153300122628e-122	54042734	54042734
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	79018959	6432	6248	0.0463	1.58153300122628e-122	54042734	54042734	4.33363542840697e-31	79015901	79018959
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-0.9343	4.33363542840697e-31	79015901	79018959	1.17102820922800e-29	79091850	79095415
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	165643653	27872	27124	0.0243	1.171028209228e-29	79091850	79095415	1.13039518158243e-12	165642393	165643653
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.1778	1.13039518158243e-12	165642393	165643653	1.45380466132271e-12	165650610	165653315
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1755	-0.0098	1.45380466132271e-12	165650610	165653315	NA	NA	NA
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	109217320	34961	34077	0.0148	NA	NA	NA	2.65806122604730e-13	109214735	109230336
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109230336	109244233	6	6	0.8064	2.6580612260473e-13	109214735	109230336	9.4487837194034e-08	109240210	109247295
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109245944	125831554	7471	7260	0.049	9.4487837194034e-08	109240210	109247295	1.10041142775600e-23	125831554	125831554
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-1.7724	1.100411427756e-23	125831554	125831554	4.02048222340829e-23	125837524	125837524
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	141410894	7362	7158	0.0099	4.02048222340829e-23	125837524	125837524	0	141410894	141413352
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	14	-3.2344	0	141410894	141413352	2.0134303976119e-153	141438504	141440184
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141687978	114	110	-5e-04	2.0134303976119e-153	141438504	141440184	2.21202155914582e-07	141682488	141698634
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141689547	141714168	12	12	0.5516	2.21202155914582e-07	141682488	141698634	1.35262515439275e-07	141709835	141723354
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	158821263	6752	6564	0.0038	1.35262515439275e-07	141709835	141723354	NA	NA	NA
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	25022606	8129	7926	-0.0015	NA	NA	NA	6.26332870198458e-50	25022606	25022606
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	-2.6591	6.26332870198458e-50	25022606	25022606	4.37358982651491e-50	25039370	25039370
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	32797545	3061	2981	0.0084	4.37358982651491e-50	25039370	25039370	8.18902285215883e-23	32797545	32797545
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32800775	32808049	3	3	-1.8004	8.18902285215883e-23	32797545	32797545	3.16576939966807e-24	32808049	32808049
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32812909	76088299	11870	11557	0.0165	3.16576939966807e-24	32808049	32808049	2.36239891254246e-06	76075238	76092163
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	76089773	76118222	14	13	0.4822	2.36239891254246e-06	76075238	76092163	4.49830980713799e-06	76111270	76147911
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	76118344	82932528	1747	1712	0.047	4.49830980713799e-06	76111270	76147911	1.36942451957609e-06	82930028	82932528
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	82934833	82936654	2	2	1.1982	1.36942451957609e-06	82930028	82932528	2.23593229871406e-06	82936654	82939271
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	82939271	87255865	991	959	0.0477	2.23593229871406e-06	82936654	82939271	4.55408288874611e-80	87255865	87255865
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87258019	87262662	3	3	-3.185	4.55408288874611e-80	87255865	87255865	1.52366412584833e-75	87262662	87262662
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87265435	146264846	18743	18240	0.016	1.52366412584833e-75	87262662	87262662	NA	NA	NA
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	12274501	4233	4102	0.0012	NA	NA	NA	0	12239507	12299207
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	12276919	22697798	3642	3559	-0.2942	0	12239507	12299207	0	22658760	22723912
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22701594	70926188	5197	5046	0.0211	0	22658760	22723912	9.6060051996674e-11	70926188	70926188
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-1.4647	9.6060051996674e-11	70926188	70926188	1.00226033838379e-09	70930528	70930528
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	140145683	24870	24203	-0.0043	1.00226033838379e-09	70930528	70930528	NA	NA	NA
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	77917870	24591	23979	0.0048	NA	NA	NA	2.54254306065437e-28	77917870	77917870
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77917893	77928738	4	4	-1.702	2.54254306065437e-28	77917870	77917870	3.43943998370211e-28	77928738	77928738
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	135285645	20213	19681	0.008	3.43943998370211e-28	77928738	77928738	NA	NA	NA
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	134450318	45304	44104	0.015	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	10465787	4086	3976	-0.0013	NA	NA	NA	1.54923082211513e-11	10464018	10470425
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10466791	10485848	8	8	-0.7819	1.54923082211513e-11	10464018	10470425	1.06817637124408e-12	10482217	10491341
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10491341	46992235	11389	11084	0.0272	1.06817637124408e-12	10482217	10491341	8.31875158406524e-08	46992235	46992235
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46995053	46996769	2	2	-1.2628	8.31875158406524e-08	46992235	46992235	5.05743185719246e-16	46996769	46998876
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46998876	130943064	29124	28351	0.0211	5.05743185719246e-16	46996769	46998876	4.87656131417118e-16	130936199	130943064
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.378	4.87656131417118e-16	130936199	130943064	4.36301656016796e-08	130946248	130947790
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	528	0.0101	4.36301656016796e-08	130946248	130947790	NA	NA	NA
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	100690991	27080	26366	0.0255	NA	NA	NA	2.19889281940948e-20	100690991	100690991
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-2.0296	2.19889281940948e-20	100690991	100690991	7.6856241596104e-19	100693892	100693892
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	113788788	4410	4301	0.0122	7.6856241596104e-19	100693892	100693892	4.00903153729359e-19	113788788	113788788
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113791151	113794669	3	3	1.6857	4.00903153729359e-19	113788788	113788788	1.88202170480921e-13	113794669	113794669
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113797828	114123340	149	145	-0.0112	1.88202170480921e-13	113794669	113794669	NA	NA	NA
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19287128	11	11	0.4367	NA	NA	NA	0.00183255357585280	18544772	19377290
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19295733	19494416	49	48	0.8562	0.0018325535758528	18544772	19377290	6.25774216577084e-25	19484013	19542388
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	77276832	21336	20721	0.3888	6.25774216577084e-25	19484013	19542388	1.42404040918423e-08	77274830	77276832
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	77277905	77280732	3	3	-0.7264	1.42404040918423e-08	77274830	77276832	3.30173317902438e-09	77280732	77282460
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	77282460	85351640	2580	2520	0.3834	3.30173317902438e-09	77280732	77282460	6.43865134085875e-20	85347927	85356918
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	85356918	85381909	7	7	-0.6711	6.43865134085875e-20	85347927	85356918	2.95559831177886e-16	85376240	85390548
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	85390548	105948347	7740	7538	0.3397	2.95559831177886e-16	85376240	85390548	2.22472133047663e-42	105948347	105948347
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105951399	105989160	13	12	-0.8916	2.22472133047663e-42	105948347	105948347	1.24028261800031e-28	105989160	105994646
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105994646	106358491	146	143	0.2626	1.24028261800031e-28	105989160	105994646	NA	NA	NA
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.3561	NA	NA	NA	1.53089818967073e-10	18452491	18692865
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	19537035	94	92	-0.829	1.53089818967073e-10	18452491	18692865	1.84718758648830e-06	19382527	19845942
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	20079935	56	54	-0.4942	1.8471875864883e-06	19382527	19845942	3.62420946568725e-28	20029653	20321772
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20088256	32514939	3673	3569	-0.0173	3.62420946568725e-28	20029653	20321772	1.42645732439572e-20	32452971	32523241
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32517839	32594200	24	24	-0.6279	1.42645732439572e-20	32452971	32523241	2.46132946906956e-23	32580871	32667508
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32661846	32661846	1	0	NA	2.46132946906956e-23	32580871	32667508	NA	NA	NA
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32664506	74669752	17858	17377	0.0069	NA	NA	NA	4.70641785773306e-165	74669752	74669752
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	3	-4.6926	4.70641785773306e-165	74669752	74669752	8.82463268043767e-166	74680439	74680439
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	75115806	170	162	0.0275	8.82463268043767e-166	74680439	74680439	3.41239144912915e-26	75115806	75115806
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	-2.2646	3.41239144912915e-26	75115806	75115806	4.89282025603601e-25	75119713	75119713
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	100298352	9435	9175	-0.0035	4.89282025603601e-25	75119713	75119713	NA	NA	NA
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	1296767	473	455	0.0243	NA	NA	NA	1.62134223559062e-11	1296767	1296767
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1299180	1300341	2	2	1.694	1.62134223559062e-11	1296767	1296767	2.01307086976432e-13	1300341	1300341
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1302875	75093957	20048	19537	0.0059	2.01307086976432e-13	1300341	1300341	6.10866047580582e-12	75092501	75093957
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.311	6.10866047580582e-12	75092501	75093957	2.38380864089889e-12	75100865	75100865
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76923844	609	598	0.0051	2.38380864089889e-12	75100865	75100865	2.52727094209112e-97	76923844	76931247
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76925748	76925748	1	0	NA	2.52727094209112e-97	76923844	76931247	NA	NA	NA
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	-2.4435	NA	NA	NA	4.6371008884262e-112	76937156	76940218
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4378	-0.0101	4.6371008884262e-112	76937156	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	31461588	12038	11714	-1e-04	NA	NA	NA	2.60773210573414e-14	31447686	31467971
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31462463	31503774	18	18	-0.5794	2.60773210573414e-14	31447686	31467971	2.19341041253054e-12	31492553	31897238
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	32828797	365	359	-0.0462	2.19341041253054e-12	31492553	31897238	8.43321787951461e-12	32828797	32828797
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	-1.5822	8.43321787951461e-12	32828797	32828797	1.40522136906856e-12	32832642	32832642
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36673853	1448	1413	-0.001	1.40522136906856e-12	32832642	32832642	1.37762257805206e-35	36673853	36673853
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36682031	4	4	-1.8695	1.37762257805206e-35	36673853	36673853	2.61120456462274e-33	36682031	36682031
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36683509	36683509	1	0	NA	2.61120456462274e-33	36682031	36682031	NA	NA	NA
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	78653545	15758	15329	0.0028	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22394	0.008	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	471	0.0444	NA	NA	NA	1.72066074297819e-10	1398325	1398325
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.4846	1.72066074297819e-10	1398325	1398325	6.14895472923849e-10	1400840	1400840
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	56825794	19380	18868	0.0079	6.14895472923849e-10	1400840	1400840	1.76139640231447e-08	56822197	56829614
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56828073	56840346	7	7	-0.7268	1.76139640231447e-08	56822197	56829614	1.90988097497129e-08	56834433	56844304
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	63788698	3178	3096	-0.0105	1.90988097497129e-08	56834433	56844304	NA	NA	NA
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	571	0.3604	NA	NA	NA	1.64433863504435e-08	1499421	1506379
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1516966	3	3	-0.7919	1.64433863504435e-08	1499421	1506379	0.0989018901896625	1516966	1525300
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1518825	1531162	6	5	-2.9696	0.0989018901896625	1516966	1525300	2.85593476343660e-132	1525300	1531162
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	20480	0.3868	2.8559347634366e-132	1525300	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13066	-0.0027	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	24832402	4028	3934	-0.016	NA	NA	NA	0	24824605	24837152
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	24833401	35472378	5523	5385	-0.5324	0	24824605	24837152	5.73914597181265e-26	35472378	35472378
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.0494	5.73914597181265e-26	35472378	35472378	5.24477636631079e-25	35476942	35476942
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6833	-0.519	5.24477636631079e-25	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	2708291	1793	1758	0.0377	NA	NA	NA	0	2708113	2711273
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	76998610	22939	22323	0.9136	0	2708113	2711273	3.62621959011877e-22	76992219	76998610
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	-0.6743	3.62621959011877e-22	76992219	76998610	2.05516640824744e-23	77010018	77014050
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154038318	22060	21482	0.9232	2.05516640824744e-23	77010018	77014050	4.56113445053571e-22	154008348	154047749
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154078819	11	10	1.4171	4.56113445053571e-22	154008348	154047749	3.18492566110318e-05	154070179	154093013
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154582414	122	119	0.92	3.18492566110318e-05	154070179	154093013	1.21101855618565e-163	154578922	154586690
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	195	-0.0349	1.21101855618565e-163	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	123	-3.1623	NA	NA	NA	2.24551876015612e-11	3034907	3772482
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	4846477	12	12	-0.7265	2.24551876015612e-11	3034907	3772482	0.000658782213999473	4597974	6730882
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4948824	7653082	338	331	-2.4143	0.000658782213999473	4597974	6730882	0.000365187886638508	7592063	7672477
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7708716	34	34	-3.4933	0.000365187886638508	7592063	7672477	0.00133043637767793	7686527	7749796
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7709619	7914104	68	65	-2.381	0.00133043637767793	7686527	7749796	0.00100613170942410	7829944	8043008
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	8289709	85	83	-3.2508	0.0010061317094241	7829944	8043008	1.47854666524584e-08	8204414	8316416
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8292347	8690572	113	111	-2.1897	1.47854666524584e-08	8204414	8316416	1.00304098532820e-07	8598718	8747044
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8692156	10512616	190	184	-3.0113	1.0030409853282e-07	8598718	8747044	8.87901317276295e-17	10504879	10513747
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10513747	11698871	20	19	-0.6429	8.87901317276295e-17	10504879	10513747	1.14741781857777e-34	11673476	11698871
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12537944	11	11	-3.7139	1.14741781857777e-34	11673476	11698871	4.84042491154936e-06	12537944	12556034
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12541506	13129843	191	185	-1.771	4.84042491154936e-06	12537944	12556034	1.24030703357866e-16	13089124	13149825
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13491995	151	148	-2.8706	1.24030703357866e-16	13089124	13149825	0.000462158377632083	13465108	13508776
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13493670	13537520	23	23	-3.8738	0.000462158377632083	13465108	13508776	0.00028700870777482	13529620	13563756
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13539170	13898474	99	96	-2.7116	0.00028700870777482	13529620	13563756	4.94711086289702e-07	13854528	13943325
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13903405	14122129	104	100	-3.6238	4.94711086289702e-07	13854528	13943325	0.00726538376631905	14076637	14321882
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14352278	34	33	-2.8394	0.00726538376631905	14076637	14321882	0.0788446969343978	14244120	14466597
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14353244	14644293	129	126	-2.1749	0.0788446969343978	14244120	14466597	0.000273776032213912	14492454	14771401
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	15204346	139	138	-2.8069	0.000273776032213912	14492454	14771401	3.81217475009706e-05	15182292	15208612
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15205160	15241527	14	14	-1.2819	3.81217475009706e-05	15182292	15208612	6.2390088891338e-05	15225775	15252823
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15242592	22192409	1368	1324	-2.9096	6.2390088891338e-05	15225775	15252823	3.53630407163618e-07	22158616	22200078
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22200078	22268552	24	23	-4.4221	3.53630407163618e-07	22158616	22200078	3.65635509997225e-09	22261337	22387293
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22308420	22930737	64	61	-2.9995	3.65635509997225e-09	22261337	22387293	6.23970355418672e-34	22924754	23283689
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	33	-0.654	6.23970355418672e-34	22924754	23283689	1.54268655337885e-07	26945084	26995399
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	20	-2.3801	1.54268655337885e-07	26945084	26995399	0.00251931641317089	26995399	27053237
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	27137064	16	16	-0.8588	0.00251931641317089	26995399	27053237	1.06462743941099e-08	27137064	27163598
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27163598	27171797	3	3	-3.143	1.06462743941099e-08	27137064	27163598	9.07691148481153e-17	27171797	27171797
MSK_252152918984_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27172283	57440809	13	13	-0.3767	9.07691148481153e-17	27171797	27171797	NA	NA	NA
