Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	15047546	5017	4662	-0.3349	NA	NA	NA	5.78313292587105e-138	15045384	15052714
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	15048867	15179335	66	60	-1.5274	5.78313292587105e-138	15045384	15052714	1.60064952435067e-137	15174074	15180531
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	15180531	27600185	5083	4719	-0.358	1.60064952435067e-137	15174074	15180531	0	27585308	27611815
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	27601967	72537426	17728	16560	0.1856	0	27585308	27611815	4.6882777253263e-19	72534975	72543019
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	1.11	4.6882777253263e-19	72534975	72543019	3.12074484761021e-19	72571158	72589682
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	94060783	6990	6538	0.2048	3.12074484761021e-19	72571158	72589682	1.75551990151360e-32	94060783	94060783
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	94061619	94062928	2	2	-2.768	1.7555199015136e-32	94060783	94060783	2.16254311775920e-31	94062928	94062928
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	94064124	195009358	26635	24827	0.1989	2.1625431177592e-31	94062928	94062928	2.15659420565336e-10	194978218	195014129
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195011344	195062793	7	7	-0.7407	2.15659420565336e-10	194978218	195014129	8.47562867466e-11	195046932	195091758
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195065867	195065867	1	0	NA	8.47562867466e-11	195046932	195091758	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	226199163	11531	10785	0.1964	NA	NA	NA	3.72454300557482e-13	226199163	226199163
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	226200980	226203605	2	2	2.1193	3.72454300557482e-13	226199163	226199163	5.05991940981942e-13	226203605	226203605
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	226205079	247186514	8072	7547	0.1665	5.05991940981942e-13	226203605	226203605	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	7019	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	20341	34543992	11521	10743	0.1761	NA	NA	NA	1.36204066192333e-215	34543992	34551222
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	16	-2.5432	1.36204066192333e-215	34543992	34551222	1.41058158920576e-194	34583814	34589997
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	35818921	483	444	0.2036	1.41058158920576e-194	34583814	34589997	3.20169481074241e-12	35812322	35818921
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35821494	35844884	3	3	-1.3084	3.20169481074241e-12	35812322	35818921	2.83675195464398e-11	35844884	35844884
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	35851593	1	0	NA	2.83675195464398e-11	35844884	35844884	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35853977	37810001	882	834	0.1654	NA	NA	NA	7.9925665909892e-08	37779760	37823343
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37812045	37854350	21	20	-0.3189	7.9925665909892e-08	37779760	37823343	5.51544629698737e-10	37843380	37863712
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37855837	43934924	2537	2346	0.211	5.51544629698737e-10	37843380	37863712	2.41385890215724e-13	43932674	43934924
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	43937215	43949625	6	6	-0.8961	2.41385890215724e-13	43932674	43934924	2.11742527913453e-12	43949625	43953461
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	43953461	89231629	14821	13849	0.1919	2.11742527913453e-12	43949625	43953461	1.13390465170909e-49	89210958	89261600
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89231739	94892170	78	70	-0.4331	1.13390465170909e-49	89210958	89261600	9.754596944118e-46	91155301	94925331
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	94892766	141705032	13065	12213	0.1721	9.754596944118e-46	91155301	94925331	1.30793595673915e-05	141688878	141706915
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	141706915	141725356	9	9	-0.4512	1.30793595673915e-05	141688878	141706915	6.16511381865454e-06	141721503	141733017
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	141726693	141792110	31	31	-1.0249	6.16511381865454e-06	141721503	141733017	2.28662378362712e-08	141787248	141797686
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	141793689	141824529	14	14	-0.4178	2.28662378362712e-08	141787248	141797686	2.84178560807987e-11	141816452	141833936
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	141826272	146571330	1583	1477	0.1645	2.84178560807987e-11	141816452	141833936	7.89474078526874e-106	146571330	146582195
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-3.556	7.89474078526874e-106	146571330	146582195	7.73034344871212e-108	146589486	146592775
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	184501938	12648	11806	0.2032	7.73034344871212e-108	146589486	146592775	1.61403358583575e-12	184501938	184501938
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	184505519	184505519	1	0	NA	1.61403358583575e-12	184501938	184501938	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	184509270	184510172	2	2	-1.6536	NA	NA	NA	1.20780461530044e-21	184510172	184510172
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	184517600	242689978	20098	18809	0.1946	1.20780461530044e-21	184510172	184510172	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	99891210	32183	30058	0.1853	NA	NA	NA	7.96066320151763e-20	99891210	99891210
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-2.1878	7.96066320151763e-20	99891210	99891210	3.35423442324648e-21	99897201	99897201
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	117674767	5644	5276	0.1952	3.35423442324648e-21	99897201	99897201	2.40505929231535e-136	117674767	117694827
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	117678703	117678703	1	0	NA	2.40505929231535e-136	117674767	117694827	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	117694827	117844643	38	38	-1.1784	NA	NA	NA	1.11885295028282e-32	117841640	117851057
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	117848280	118130278	73	65	-0.1793	1.11885295028282e-32	117841640	117851057	1.01183339820609e-58	118113773	118136488
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	118134295	133189686	5768	5398	0.5556	1.01183339820609e-58	118113773	118136488	5.5271320591746e-19	133189686	133189686
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	-1.8493	5.5271320591746e-19	133189686	133189686	1.93774677203031e-21	133194685	133194685
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	133197276	1	0	NA	1.93774677203031e-21	133194685	133194685	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133198618	139666341	2189	2049	0.5717	NA	NA	NA	1.08844378288187e-09	139666341	139666341
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	139667885	139670981	2	2	2.2137	1.08844378288187e-09	139666341	139666341	1.27088010032992e-08	139670981	139672185
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	139672185	164005577	7588	7079	0.5982	1.27088010032992e-08	139670981	139672185	5.99789575987514e-24	164005577	164005577
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	-1.0663	5.99789575987514e-24	164005577	164005577	3.96813228924125e-27	164027724	164027724
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164112873	21	20	1.1621	3.96813228924125e-27	164027724	164027724	2.60716816267419e-11	164093750	164126256
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164115417	192546280	9547	8941	0.5934	2.60716816267419e-11	164093750	164126256	8.45450642851487e-133	192546280	192546280
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192548135	192550989	3	3	-4.2971	8.45450642851487e-133	192546280	192546280	1.06633884251513e-119	192550989	192550989
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192552734	192552734	1	0	NA	1.06633884251513e-119	192550989	192550989	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192554451	199320046	2561	2397	0.5592	NA	NA	NA	0.0327007544274048	199246001	199320046
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	199321387	199329592	3	3	-0.0457	0.0327007544274048	199246001	199320046	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3160	-0.353	NA	NA	NA	8.09711283481953e-53	9815760	9827233
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9821327	1	0	NA	8.09711283481953e-53	9815760	9827233	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9827233	9842644	3	3	-3.6576	NA	NA	NA	1.80286114723580e-59	9832823	9842644
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	70190682	15168	14127	-0.4061	1.8028611472358e-59	9832823	9842644	4.42693581206955e-13	70190682	70190682
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70207908	70216707	3	3	-1.965	4.42693581206955e-13	70190682	70190682	2.87556752318974e-13	70216707	70216707
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70294312	186676034	35042	32774	-0.3842	2.87556752318974e-13	70216707	70216707	1.54994046927175e-43	186676034	186676034
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	3.0347	1.54994046927175e-43	186676034	186676034	2.78987640681802e-41	186680176	186680176
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	186681553	1	0	NA	2.78987640681802e-41	186680176	186680176	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186682959	191153613	1548	1450	-0.4617	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	32133136	8727	8133	0.1592	NA	NA	NA	1.72982083462743e-16	32118219	32144814
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	32137514	32209048	37	34	0.6066	1.72982083462743e-16	32118219	32144814	3.0676373368483e-10	32195805	32230421
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	32210714	137833920	30325	28335	0.1887	3.0676373368483e-10	32195805	32230421	1.17319350642865e-84	137833920	137836466
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	137836466	137843309	4	4	-3.1797	1.17319350642865e-84	137833920	137836466	1.03116891792112e-81	137842107	137843309
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	137844931	180644810	14673	13710	0.1916	1.03116891792112e-81	137842107	137843309	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	32548736	11676	10932	-0.3991	NA	NA	NA	1.16449589925034e-35	32543054	32564884
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32633691	18	17	0.6827	1.16449589925034e-35	32543054	32564884	2.51529070268869e-36	32629848	32650672
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32634977	1	0	NA	2.51529070268869e-36	32629848	32650672	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32650672	79018959	14729	13737	-0.3942	NA	NA	NA	1.20762881150511e-82	79018959	79018959
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	12	-2.3137	1.20762881150511e-82	79018959	79018959	5.85393411707234e-82	79091850	79091850
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	162502077	26909	25154	-0.3905	5.85393411707234e-82	79091850	79091850	1.46152325409778e-14	162502077	162502077
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	162504290	162505819	2	2	-2.4264	1.46152325409778e-14	162502077	162502077	1.80539756225950e-14	162505819	162505819
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	162508430	165643653	961	900	-0.4379	1.8053975622595e-14	162505819	162505819	2.61850337047499e-30	165643653	165643653
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.5911	2.61850337047499e-30	165643653	165643653	5.5623959214559e-27	165650610	165650610
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1664	-0.4278	5.5623959214559e-27	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	95882399	29530	27517	0.1881	NA	NA	NA	0	95839132	95921666
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	95886806	101015785	1914	1787	0.582	0	95839132	95921666	0	100982939	101033316
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	101018257	158821263	25251	23543	0.1858	0	100982939	101033316	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	151472	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	166493	7226901	2392	2222	-0.4738	NA	NA	NA	6.48442484820973e-21	7156900	7322035
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7260442	7824059	8	7	-1.8402	6.48442484820973e-21	7156900	7322035	2.40082007054895e-25	7729311	7824059
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	25022606	5728	5354	-0.4036	2.40082007054895e-25	7729311	7824059	9.8063250639517e-12	25017905	25022606
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	1.1064	9.8063250639517e-12	25017905	25022606	9.27824501417665e-12	25039370	25057567
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	25047250	1	0	NA	9.27824501417665e-12	25039370	25057567	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25057567	39350798	4941	4628	-0.3888	NA	NA	NA	4.34400868846913e-120	39345557	39358419
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	57	-1.4798	4.34400868846913e-120	39345557	39358419	4.77906410976585e-72	39497514	39508035
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40149702	218	207	-0.3365	4.77906410976585e-72	39497514	39508035	1.20375970022188e-100	40137595	40186615
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40152521	40152521	1	0	NA	1.20375970022188e-100	40137595	40186615	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40156069	85420037	11885	11075	0.1808	NA	NA	NA	2.95506385309937e-09	85418745	85420037
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	85422157	85422157	1	0	NA	2.95506385309937e-09	85418745	85420037	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	85423938	85431319	5	5	-0.8555	NA	NA	NA	1.77176990098583e-09	85431319	85436597
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	85434122	85434122	1	0	NA	1.77176990098583e-09	85431319	85436597	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	85436597	99759232	4524	4207	0.1842	NA	NA	NA	0	99748576	99766498
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	99761772	102654979	1149	1069	-0.3673	0	99748576	99766498	0	102647246	102667735
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	102657056	146264846	13649	12751	0.1857	0	102647246	102667735	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	122676419	30630	28585	0.1652	NA	NA	NA	8.5442271383168e-09	122670362	122681701
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	122678597	122685111	5	5	1.1754	8.5442271383168e-09	122670362	122681701	1.05375358117606e-07	122680317	122687864
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	122686622	140145683	7309	6806	0.1686	1.05375358117606e-07	122680317	122687864	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	126361	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	128878	76817293	24056	22434	0.1736	NA	NA	NA	4.79412676221485e-09	76797268	76840881
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	76818526	76942233	59	52	-0.147	4.79412676221485e-09	76797268	76840881	4.66110738815294e-10	76916217	76971460
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	76944693	76944693	1	0	NA	4.66110738815294e-10	76916217	76971460	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	76951697	124220897	16760	15696	0.1911	NA	NA	NA	7.39844566477574e-34	124210419	124226411
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124222623	124381319	63	59	-0.3753	7.39844566477574e-34	124210419	124226411	1.60024996746475e-27	124370487	124393306
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124383274	127566573	1151	1086	0.1772	1.60024996746475e-27	124370487	124393306	3.49342258708754e-08	127552919	127569849
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127568592	127608087	16	16	-0.4022	3.49342258708754e-08	127552919	127569849	7.15153901594423e-08	127598425	127620976
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127612608	132797428	1765	1651	0.1377	7.15153901594423e-08	127598425	127620976	1.65992667219584e-57	132797428	132797428
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132799212	132801463	2	2	-3.8788	1.65992667219584e-57	132797428	132797428	7.40187057371776e-45	132801463	132801463
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132802775	135285645	934	874	0.1835	7.40187057371776e-45	132801463	132801463	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	26540906	9660	8999	-0.3772	NA	NA	NA	0	26539661	26543451
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	26543451	29568373	872	816	0.6179	0	26539661	26543451	6.79319545917787e-265	29535326	29603699
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	29572923	98929154	21863	20431	0.1855	6.79319545917787e-265	29535326	29603699	3.79540862887714e-06	98911709	98940776
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	98931785	98963711	15	13	0.7335	3.79540862887714e-06	98911709	98940776	9.77413461944892e-21	98948768	98973258
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	98965705	134450318	12894	11973	0.1849	9.77413461944892e-21	98948768	98973258	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	31055497	11143	10434	0.1882	NA	NA	NA	5.7359574285521e-36	31048362	31062689
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31058854	31274223	44	40	-0.5207	5.7359574285521e-36	31048362	31062689	1.53700372066392e-36	31268595	31278548
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31277102	43122965	3024	2828	0.1802	1.53700372066392e-36	31268595	31278548	9.6205053302937e-22	43083898	43175847
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	43128106	43293744	61	56	0.6427	9.6205053302937e-22	43083898	43175847	1.41655144718116e-09	43274986	43317790
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	43295315	43555349	115	108	0.2316	1.41655144718116e-09	43274986	43317790	1.36855568314478e-23	43520712	43602117
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	43558399	66283814	8267	7727	0.5937	1.36855568314478e-23	43520712	43602117	0	66257752	66310452
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	66289366	71508454	1969	1835	1.1475	0	66257752	66310452	0	71508454	71508454
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	71513035	71513035	1	0	NA	0	71508454	71508454	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	71527726	80662066	2717	2559	-0.3899	NA	NA	NA	2.95330116176371e-41	80662066	80662066
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80663923	80666751	2	2	-3.6736	2.95330116176371e-41	80662066	80662066	7.43232540759117e-39	80666751	80666751
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80668695	112156444	10553	9818	-0.3904	7.43232540759117e-39	80666751	80666751	3.99810952562968e-15	112145214	112160978
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	112157742	112243818	42	36	0.0998	3.99810952562968e-15	112145214	112160978	7.2497404058388e-14	112239720	112258855
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	112245554	132289090	7223	6753	-0.3779	7.2497404058388e-14	112239720	112258855	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37950801	7337	6852	-0.1957	NA	NA	NA	2.52636244031523e-162	37950801	37950801
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37953582	37953582	1	0	NA	2.52636244031523e-162	37950801	37950801	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-3.5729	NA	NA	NA	1.63278535353042e-41	37957844	37957844
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	94386350	16897	15779	-0.2524	1.63278535353042e-41	37957844	37957844	5.36556243878843e-80	94349352	94427767
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	94389708	95160403	353	328	0.1096	5.36556243878843e-80	94349352	94427767	1.02778324321723e-78	95131226	95177645
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	95161786	114123340	7054	6574	-0.2642	1.02778324321723e-78	95131226	95177645	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	73061942	19419	18166	0.1792	NA	NA	NA	7.63267092125244e-11	73051686	73075500
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73123455	15	12	-0.5427	7.63267092125244e-11	73051686	73075500	5.50381056933067e-10	73107419	73129722
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73123697	105606424	12210	11369	0.1573	5.50381056933067e-10	73107419	73129722	6.2554461712769e-13	105597555	105606424
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105607572	105632168	10	10	1.0227	6.2554461712769e-13	105597555	105606424	1.58598947335543e-16	105632168	105673157
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	106358491	231	218	0.0466	1.58598947335543e-16	105632168	105673157	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.1303	NA	NA	NA	2.8400959773607e-06	18432558	18452491
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	18824622	6	6	-0.8438	2.8400959773607e-06	18432558	18452491	4.16317530260651e-16	18810004	19130748
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18826924	72258895	20632	19274	-0.4021	4.16317530260651e-16	18810004	19130748	7.08485296284308e-211	72238066	72282581
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	72260925	72260925	1	0	NA	7.08485296284308e-211	72238066	72282581	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	72262317	74669752	1067	996	-0.0492	NA	NA	NA	3.17470946304545e-29	74669752	74669752
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-2.092	3.17470946304545e-29	74669752	74669752	1.36269344419897e-28	74680439	74680439
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	100298352	9607	9009	-0.0857	1.36269344419897e-28	74680439	74680439	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	2040438	800	742	-0.2909	NA	NA	NA	9.31097217177088e-11	2032057	2046835
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2044316	2057807	11	11	-1.1489	9.31097217177088e-11	2032057	2046835	9.3110844762227e-11	2054752	2059943
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2059265	68693086	17488	16323	-0.3762	9.3110844762227e-11	2054752	2059943	1.4397377003683e-07	68681874	68712507
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68838384	11	10	-1.007	1.4397377003683e-07	68681874	68712507	1.85013046053644e-06	68751390	68849229
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68842364	88690571	7347	6881	-0.3642	1.85013046053644e-06	68751390	68849229	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	31457889	12037	11258	-0.3802	NA	NA	NA	8.68733938273448e-09	31437168	31468896
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31503774	19	19	-0.9089	8.68733938273448e-09	31437168	31468896	9.97291287088025e-10	31490899	31897238
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	36673853	1815	1691	-0.3679	9.97291287088025e-10	31490899	31897238	1.75627893738738e-47	36673853	36673853
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	1.7089	1.75627893738738e-47	36673853	36673853	3.81527587811177e-45	36684619	36684619
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	38800654	922	869	-0.3418	3.81527587811177e-45	36684619	36684619	5.84293500297101e-248	38784700	38815969
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	38801612	41549217	1101	1016	0.1943	5.84293500297101e-248	38784700	38815969	4.50709889327353e-38	41542491	41553226
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41550918	41710400	55	54	-0.44	4.50709889327353e-38	41542491	41553226	1.83300700782489e-36	41704093	42148637
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	78653545	13679	12780	0.1954	1.83300700782489e-36	41704093	42148637	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	21408	-0.412	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	446	-0.2124	NA	NA	NA	2.13008207144347e-08	1395246	1398325
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.4577	2.13008207144347e-08	1395246	1398325	7.32544752901014e-10	1400840	1400840
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	9556268	3749	3470	-0.3114	7.32544752901014e-10	1400840	1400840	2.43168575532971e-227	9528385	9579181
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	9572696	10834818	634	590	0.204	2.43168575532971e-227	9528385	9579181	1.44380890123852e-48	10813300	10879562
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	10837359	10837359	1	0	NA	1.44380890123852e-48	10813300	10879562	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	10840040	11751891	424	394	0.5503	NA	NA	NA	3.5623608181765e-53	11727189	11779573
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11753690	13305994	672	630	0.1831	3.5623608181765e-53	11727189	11779573	7.411071355631e-81	13281162	13334481
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	13306955	16431670	1421	1334	0.532	7.411071355631e-81	13281162	13334481	8.35450045569209e-142	16406261	16450926
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	16432769	19385965	1444	1351	0.173	8.35450045569209e-142	16406261	16450926	0	19383619	19390136
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19386731	24152318	1324	1243	-0.47	0	19383619	19390136	0	24146680	24157855
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	24157855	40540618	2530	2340	0.5267	0	24146680	24157855	4.18095718534634e-75	40540618	40540618
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40543992	40553315	3	3	-3.4223	4.18095718534634e-75	40540618	40540618	4.78720306755364e-68	40553315	40553315
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40556205	41417118	428	401	0.5426	4.78720306755364e-68	40553315	40553315	7.89791147267615e-90	41391512	41500221
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	41418507	58008337	7284	6798	0.1689	7.89791147267615e-90	41391512	41500221	6.40145072759387e-16	57997071	58008337
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58010034	58044489	11	11	-0.7661	6.40145072759387e-16	57997071	58008337	4.90283077767216e-13	58044489	58059520
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58057185	59916917	868	803	0.116	4.90283077767216e-13	58044489	58059520	3.22028381057407e-55	59903453	60076984
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59919813	60580158	241	215	0.5628	3.22028381057407e-55	59903453	60076984	1.95849873258342e-53	60558816	60605442
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	60582406	62626986	962	903	0.1354	1.95849873258342e-53	60558816	60605442	4.1720293696487e-68	62601750	62655934
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	62630140	63788698	569	528	0.4827	4.1720293696487e-68	62601750	62655934	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1516966	589	553	0.1249	NA	NA	NA	7.44243144572883e-12	1511632	1516966
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1518825	1532433	7	7	1.1211	7.44243144572883e-12	1511632	1516966	5.12946567241322e-11	1532433	1546858
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	26142400	8435	7873	0.1637	5.12946567241322e-11	1532433	1546858	1.39017941627018e-07	26139120	26145205
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26144661	26161111	13	12	-0.4509	1.39017941627018e-07	26139120	26145205	1.12769141513757e-07	26156026	26173123
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26162094	62419534	12535	11690	0.1783	1.12769141513757e-07	26156026	26173123	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	14400645	87	78	-0.2423	NA	NA	NA	1.52446876516552e-15	14334542	14424317
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	14402228	14691885	142	136	0.1694	1.52446876516552e-15	14334542	14424317	1.82816697618233e-05	14686716	14691885
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	14695207	14703784	4	4	0.9918	1.82816697618233e-05	14686716	14691885	1.46825457343537e-06	14703784	14731621
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	14706221	46922972	13208	12354	0.1739	1.46825457343537e-06	14703784	14731621	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	18125356	1131	1049	-0.3666	NA	NA	NA	3.17955368805355e-07	18123761	18125356
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18127933	18131561	3	3	0.8465	3.17955368805355e-07	18123761	18125356	5.18575498221169e-07	18131561	18132555
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18132555	22643742	1846	1739	-0.3692	5.18575498221169e-07	18131561	18132555	7.76052898594002e-20	22603439	22696162
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22644243	22644243	1	0	NA	7.76052898594002e-20	22603439	22696162	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22667608	22725305	23	19	-1.1764	NA	NA	NA	4.69958995950876e-21	22712211	22736990
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	35472378	6547	6178	-0.3663	4.69958995950876e-21	22712211	22736990	3.72066749250144e-20	35472378	35472378
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-2.8012	3.72066749250144e-20	35472378	35472378	2.96717353770934e-19	35476942	35476942
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6574	-0.3544	2.96717353770934e-19	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	95819	7	6	-0.1796	NA	NA	NA	5.57047985938019e-21	95819	95819
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	98390	104732	6	6	-2.3441	5.57047985938019e-21	95819	95819	2.58566308214893e-37	104732	104732
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	2708291	1780	1659	-0.319	2.58566308214893e-37	104732	104732	0	2706218	2712641
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	8450789	1790	1689	0.4986	0	2706218	2712641	1.41877986958523e-05	8442417	8450789
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8452395	8473482	9	9	-0.1795	1.41877986958523e-05	8442417	8450789	5.86135745451942e-07	8473482	8481902
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8475091	56800429	17195	16019	0.5458	5.86135745451942e-07	8473482	8481902	2.90903063316855e-09	56792140	56806966
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	56802632	56838339	14	12	-0.169	2.90903063316855e-09	56792140	56806966	4.19658157220966e-11	56831352	56846075
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	56840603	154582414	26126	24437	0.5377	4.19658157220966e-11	56831352	56846075	7.91144963183399e-258	154570196	154601146
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154586690	1	0	NA	7.91144963183399e-258	154570196	154601146	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154599547	154888224	200	185	-0.4046	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	119	-2.9086	NA	NA	NA	8.63536219602633e-10	2969891	3733715
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	5593746	17	17	-0.9326	8.63536219602633e-10	2969891	3733715	7.92037086211829e-09	5531459	6711090
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6955902	120	116	-2.8027	7.92037086211829e-09	5531459	6711090	1.31758735208415e-07	6926956	7005620
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6956705	7653082	214	208	-1.965	1.31758735208415e-07	6926956	7005620	2.56963154020730e-06	7619927	7664085
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7708716	34	31	-3.2466	2.5696315402073e-06	7619927	7664085	3.36090036145399e-08	7698960	7714929
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7709619	7914104	68	59	-1.8292	3.36090036145399e-08	7698960	7714929	6.02778415007714e-06	7859390	7997485
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	8277707	83	81	-2.882	6.02778415007714e-06	7859390	7997485	3.18766952249005e-05	8174858	8327467
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8280065	8280065	1	0	NA	3.18766952249005e-05	8174858	8327467	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8289709	8690572	114	105	-2.0271	NA	NA	NA	6.55918111989602e-06	8581286	8773734
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8692156	10512616	190	183	-2.771	6.55918111989602e-06	8581286	8773734	2.73556921884946e-17	10470608	11660512
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10513747	10513747	1	0	NA	2.73556921884946e-17	10470608	11660512	NA	NA	NA
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	13173328	245	233	-1.718	NA	NA	NA	2.23857593612566e-10	13153117	13215006
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13175367	13329968	43	41	-3.0827	2.23857593612566e-10	13153117	13215006	0.0620109042665885	13241682	13465108
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13330707	13922080	212	198	-2.5508	0.0620109042665885	13241682	13465108	1.46715666023921e-08	13873700	13976900
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13922951	14122129	98	92	-3.3877	1.46715666023921e-08	13873700	13976900	2.50375400589125e-14	14097679	14312365
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	15241527	316	298	-2.283	2.50375400589125e-14	14097679	14312365	6.53841032651531e-07	15146521	15311814
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15242592	15920478	255	238	-2.8723	6.53841032651531e-07	15146521	15311814	1.32370615908026e-05	15707307	16007396
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15928904	16184484	109	105	-2.1273	1.32370615908026e-05	15707307	16007396	5.58573892005792e-05	16087502	16404836
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16186896	22179794	1001	936	-2.7395	5.58573892005792e-05	16087502	16404836	1.10800475363027e-05	22051284	22182080
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22181855	22268552	27	25	-4.0032	1.10800475363027e-05	22051284	22182080	1.15534834392222e-07	22252795	22395796
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22308420	22923722	61	54	-2.8392	1.15534834392222e-07	22252795	22395796	1.48772326975250e-19	22916746	26870361
MSK_252152918985_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22924754	57440809	89	85	-1.2159	1.4877232697525e-19	22916746	26870361	NA	NA	NA
