Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	34869589	12894	12501	-0.1559	NA	NA	NA	0	34869589	34869589
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34876833	34883375	4	4	-2.6737	0	34869589	34869589	4.56050047124965e-57	34883375	34883375
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34884849	72537426	14996	14542	0.2178	4.56050047124965e-57	34883375	34883375	1.49489302299277e-62	72537426	72540240
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	-1.6436	1.49489302299277e-62	72537426	72540240	1.48964146653479e-66	72571158	72579311
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	78984419	2152	2082	0.2557	1.48964146653479e-66	72571158	72579311	1.40549639993009e-08	78959878	78999265
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	78986806	79133231	32	32	0.7153	1.40549639993009e-08	78959878	78999265	8.4292228089836e-09	79122065	79149917
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	79135294	167483267	22254	21600	0.2432	8.4292228089836e-09	79122065	79149917	5.0326288899803e-78	167483267	167483267
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	-2.4469	5.0326288899803e-78	167483267	167483267	2.28893288593517e-135	167507898	167507898
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	247186514	28794	27934	0.2593	2.28893288593517e-135	167507898	167507898	NA	NA	NA
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	11173	-0.2166	NA	NA	NA	5.87696653158123e-91	34543992	34551222
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	18	-2.1568	5.87696653158123e-91	34543992	34551222	2.17417940697948e-114	34589997	34589997
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	34591681	1	0	NA	2.17417940697948e-114	34589997	34589997	NA	NA	NA
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34595734	35818921	482	468	0.1241	NA	NA	NA	1.04325497400530e-08	35810125	35818921
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35821494	35844884	3	3	-1.3824	1.0432549740053e-08	35810125	35818921	1.94643289993105e-15	35844884	35853977
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	35851593	1	0	NA	1.94643289993105e-15	35844884	35853977	NA	NA	NA
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35853977	45724645	4112	3979	0.1388	NA	NA	NA	3.17876627996103e-57	45700451	45745517
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	45726357	46182856	231	218	0.5515	3.17876627996103e-57	45700451	45745517	3.15351683624651e-43	46149231	46214806
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	46193795	62836268	5654	5470	0.1545	3.15351683624651e-43	46149231	46214806	6.2284431962163e-09	62625026	62837658
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	62837658	62844945	5	5	-0.2722	6.2284431962163e-09	62625026	62837658	1.99808835526773e-05	62844945	62856159
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	62847509	63138419	126	121	0.5544	1.99808835526773e-05	62844945	62856159	3.77771200627462e-40	63126819	63160014
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	63140853	82866421	6486	6295	0.0558	3.77771200627462e-40	63126819	63160014	2.02793983139086e-14	82799376	82881402
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	82870254	82975040	37	37	0.6009	2.02793983139086e-14	82799376	82881402	1.32395608828810e-74	82945638	83021799
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	82980877	137997652	13684	13254	-0.0496	1.3239560882881e-74	82945638	83021799	7.30981896489639e-68	137983436	138001370
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	137999190	138011117	7	7	0.7254	7.30981896489639e-68	137983436	138001370	1.43046953128799e-09	138007601	138028511
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	138014026	143516911	1681	1624	-0.0394	1.43046953128799e-09	138007601	138028511	6.8260338416077e-16	143497562	143528544
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	143519925	143601288	37	36	0.4829	6.8260338416077e-16	143497562	143528544	2.65240036549864e-07	143583292	143636554
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	143603462	159926894	4875	4735	0.0807	2.65240036549864e-07	143583292	143636554	1.72118701875520e-07	159900414	159936247
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	159928027	159982830	28	26	0.5589	1.7211870187552e-07	159900414	159936247	2.01326377434504e-08	159974814	159997592
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	159984432	160882178	403	392	0.0581	2.01326377434504e-08	159974814	159997592	6.64518297884013e-06	160865290	160890061
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	160884648	160909615	15	13	0.6515	6.64518297884013e-06	160865290	160890061	2.08021034900041e-06	160905639	160923178
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	160912161	162170006	334	323	0.0319	2.08021034900041e-06	160905639	160923178	4.79594724144657e-54	162160020	162179957
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	162175741	162363084	75	72	0.8663	4.79594724144657e-54	162160020	162179957	1.29500042694294e-47	162354464	162372842
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	162364880	166018339	1219	1165	0.126	1.29500042694294e-47	162354464	162372842	5.26930180348106e-18	165989524	166026078
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	166026078	166100379	24	23	0.9139	5.26930180348106e-18	165989524	166026078	1.63297539189779e-19	166098289	166110266
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	166103959	167587123	531	517	0.1018	1.63297539189779e-19	166098289	166110266	1.18886988656657e-06	167584710	167587123
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	167593005	167593017	2	2	-1.5114	1.18886988656657e-06	167584710	167587123	2.48171340655256e-06	167593017	167593017
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	167602088	170810411	1226	1186	0.0716	2.48171340655256e-06	167593017	167593017	1.42867928194191e-06	170788547	170825557
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	170811723	170880852	30	29	0.4985	1.42867928194191e-06	170788547	170825557	2.19934793028316e-05	170866926	170911407
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	170882284	188249623	5864	5681	0.0934	2.19934793028316e-05	170866926	170911407	8.25875357753913e-06	188156692	188289735
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	188254253	188436536	29	28	0.5202	8.25875357753913e-06	188156692	188289735	2.27924863182795e-06	188408916	188519452
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	188447405	189292162	278	270	0.054	2.27924863182795e-06	188408916	188519452	1.44580249550152e-06	189223532	189298629
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	189294139	189340419	20	19	0.6174	1.44580249550152e-06	189223532	189298629	2.16629475344400e-08	189333902	189360058
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	189343053	190380359	375	365	0.0607	2.166294753444e-08	189333902	189360058	3.21236021030081e-11	190380359	190380359
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	190382229	190386072	2	2	2.0167	3.21236021030081e-11	190380359	190380359	4.75017616594345e-12	190386072	190386072
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	190387368	190699435	109	107	0.0209	4.75017616594345e-12	190386072	190386072	2.51469131692676e-08	190664290	190711142
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	190701239	190760193	24	23	0.5359	2.51469131692676e-08	190664290	190711142	1.65160917357912e-06	190750029	190786327
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	190761367	191492892	255	246	0.0586	1.65160917357912e-06	190750029	190786327	1.86631350631770e-08	191478026	191498538
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	191494106	191543271	26	25	0.5778	1.8663135063177e-08	191478026	191498538	1.23018919082262e-148	191535354	191558585
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	191545895	229806799	13020	12586	0.0155	1.23018919082262e-148	191535354	191558585	1.68631934540977e-143	229773661	229820733
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	229809098	229840422	17	17	0.4374	1.68631934540977e-143	229773661	229820733	6.26639943895837e-30	229833632	229895666
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	229841640	240272039	4088	3973	-0.0596	6.26639943895837e-30	229833632	229895666	4.81178648391255e-32	240269706	240272039
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	240275320	240277072	2	2	1.7475	4.81178648391255e-32	240269706	240272039	0.00096352660357698	240277072	240281625
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	240278661	242689978	869	844	0.2909	0.00096352660357698	240277072	240281625	NA	NA	NA
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	99891210	32183	31176	0.1158	NA	NA	NA	0	99891210	99891210
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-1.7533	0	99891210	99891210	7.64800299050264e-10	99897201	99897201
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	124887354	8080	7862	0.0936	7.64800299050264e-10	99897201	99897201	2.85272243477926e-52	124872830	124919179
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	124891352	125257599	148	145	0.6149	2.85272243477926e-52	124872830	124919179	5.75905599385479e-82	125247316	125271431
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	125260279	164023502	13082	12667	-0.0067	5.75905599385479e-82	125247316	125271431	3.4966795015406e-55	164012645	164038917
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164027724	164112873	22	22	0.9223	3.4966795015406e-55	164012645	164038917	1.15117014647899e-26	164101776	164121847
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164115417	192542511	9545	9288	-0.0313	1.15117014647899e-26	164101776	164121847	2.77954868995173e-07	192538254	192546280
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192544305	192552734	6	6	-1.0168	2.77954868995173e-07	192538254	192546280	4.37580478233821e-07	192549325	192557162
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192554451	194354505	578	558	-0.0621	4.37580478233821e-07	192549325	192557162	1.67542151534419e-59	194354505	194354505
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-2.7784	1.67542151534419e-59	194354505	194354505	7.87160859766844e-51	194366950	194366950
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196822133	996	961	-0.2723	7.87160859766844e-51	194366950	194366950	1.28386741605584e-13	196807153	196905767
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196942158	23	22	-0.9601	1.28386741605584e-13	196807153	196905767	2.07617548287102e-15	196929826	196946355
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196943380	199329592	961	932	-0.2196	2.07617548287102e-15	196929826	196946355	NA	NA	NA
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	68905670	18433	17867	0.2795	NA	NA	NA	5.13580849337696e-76	68905670	69069651
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	-1.7282	5.13580849337696e-76	68905670	69069651	1.47811367374723e-51	69153675	69165814
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	146466279	23011	22333	-0.0749	1.47811367374723e-51	69153675	69165814	0	146397687	146546569
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	146471467	150753323	1422	1386	0.3638	0	146397687	146546569	0	150722746	150786253
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	150753525	191153613	12281	11921	-0.0832	0	150722746	150786253	NA	NA	NA
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	21480789	6352	6165	0.2307	NA	NA	NA	7.18896365590637e-07	21472977	21480789
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21485944	21487474	2	2	-1.4338	7.18896365590637e-07	21472977	21480789	7.00514090603224e-83	21487474	21488938
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21488938	56193351	8719	8458	0.1132	7.00514090603224e-83	21487474	21488938	0	56179874	56211014
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	56195420	148714341	28060	27210	-0.3712	0	56179874	56211014	0	148695568	148729392
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	148716096	180342860	10513	10206	0.0741	0	148695568	148729392	2.0953658514582e-07	180189516	180355807
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	8	0.9343	2.0953658514582e-07	180189516	180355807	4.59316314077459e-09	180346557	180362342
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	106	0.0047	4.59316314077459e-09	180346557	180362342	NA	NA	NA
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	202063	41	39	0.0062	NA	NA	NA	1.35118675910662e-18	191387	218316
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	204881	327962	61	61	-0.7223	1.35118675910662e-18	191387	218316	1.39487878282217e-58	322557	331014
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	329100	32538115	11571	11259	0.1258	1.39487878282217e-58	322557	331014	4.06776934113538e-30	32536956	32563252
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32539864	32590568	9	9	-1.1657	4.06776934113538e-30	32536956	32563252	0.000244309842943000	32548736	32595402
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32593151	32713363	40	39	-0.0656	0.000244309842943	32548736	32595402	8.14505942142362e-05	32707427	32728487
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32739800	14	14	-1.0852	8.14505942142362e-05	32707427	32728487	2.22296559486238e-32	32731072	32742767
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32742767	79018959	14688	14255	0.22	2.22296559486238e-32	32731072	32742767	4.81427879004126e-208	79018959	79018959
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	12	-3.3112	4.81427879004126e-208	79018959	79018959	0	79085247	79091850
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	165643653	27872	27062	-0.0322	0	79085247	79091850	0	165642393	165643653
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.3578	0	165642393	165643653	1.57353300673887e-10	165650610	165653315
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1763	-0.0766	1.57353300673887e-10	165650610	165653315	NA	NA	NA
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	19259814	6528	6332	-0.5115	NA	NA	NA	0	19187881	19317876
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	19273900	158821263	50167	48628	0.0305	0	19187881	19317876	NA	NA	NA
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	32439001	11004	10686	-0.5588	NA	NA	NA	1.85133795248853e-70	32430993	32442973
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32441551	32593875	81	80	0.2654	1.85133795248853e-70	32430993	32442973	8.77330585671205e-39	32590879	32607879
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32595382	39114689	1909	1845	0.9438	8.77330585671205e-39	32590879	32607879	8.6505677652187e-34	39066676	39140588
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39121042	39350798	80	77	0.5365	8.6505677652187e-34	39066676	39140588	5.85522789283226e-99	39350798	39354149
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	54	-2.1903	5.85522789283226e-99	39350798	39354149	0	39500219	39505256
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	146250765	31431	30512	0.8037	0	39500219	39505256	3.84049382479348e-33	146193476	146250765
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	146253929	146264846	2	2	-0.145	3.84049382479348e-33	146193476	146250765	NA	NA	NA
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	21044957	7368	7161	-0.613	NA	NA	NA	0	21036296	21055167
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	21047453	26883484	1303	1248	-1.3265	0	21036296	21055167	5.99621030527096e-87	26857969	26904780
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	26886536	28530732	678	651	-0.8636	5.99621030527096e-87	26857969	26904780	9.2570795122919e-56	28494028	28564371
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	28533149	28533149	1	0	NA	9.2570795122919e-56	28494028	28564371	NA	NA	NA
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	28534485	31008279	604	583	-1.275	NA	NA	NA	0	30987434	31022478
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	31013099	70174301	2801	2716	-0.5224	0	30987434	31022478	0	68483889	70205801
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70205801	70923005	316	301	0.5668	0	68483889	70205801	2.89917574620961e-09	70923005	70923005
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70926188	70926188	1	0	NA	2.89917574620961e-09	70923005	70923005	NA	NA	NA
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	2.5015	NA	NA	NA	4.94951088162174e-10	70930528	70930528
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	71139963	86	85	0.6497	4.94951088162174e-10	70930528	70930528	4.90446789402244e-07	71134255	71140942
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	71140942	71147484	5	4	1.7841	4.90446789402244e-07	71134255	71140942	6.53433986126786e-09	71144862	71151402
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	71148916	77792308	2395	2318	0.6371	6.53433986126786e-09	71144862	71151402	0	77788704	77796196
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	77793899	90006212	3843	3719	-0.3309	0	77788704	77796196	1.46763646919442e-08	90006212	90006212
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	90007886	90009509	2	2	-2.1578	1.46763646919442e-08	90006212	90006212	2.11513405091244e-21	90009509	90009509
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	90015922	140145683	18539	17990	-0.3051	2.11513405091244e-21	90009509	90009509	NA	NA	NA
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9425	0.066	NA	NA	NA	1.79147674278247e-18	27038538	27038538
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-2.5885	1.79147674278247e-18	27038538	27038538	1.15240976060962e-57	27041812	27041812
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	77917893	14861	14428	0.087	1.15240976060962e-57	27041812	27041812	1.44098123276766e-59	77917893	77917893
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-2.7657	1.44098123276766e-59	77917893	77917893	3.21930120078504e-102	77928669	77928669
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	135285645	20214	19632	0.1087	3.21930120078504e-102	77928669	77928669	NA	NA	NA
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1731	-0.385	NA	NA	NA	4.8585038004138e-08	4920907	4926583
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4931000	4	4	-1.6495	4.8585038004138e-08	4920907	4926583	7.35093154494509e-07	4929502	4932214
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4932214	5741031	362	346	-0.491	7.35093154494509e-07	4929502	4932214	1.85344449998459e-23	5734978	5744034
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	15	-1.6037	1.85344449998459e-23	5734978	5744034	0	5763749	5766615
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	75130386	22738	22076	-0.3336	0	5763749	5766615	0	75125827	75134980
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	75133421	76462721	520	508	0.5645	0	75125827	75134980	1.05272317094026e-05	76453130	76464057
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	76464057	76483572	9	9	-0.1504	1.05272317094026e-05	76453130	76464057	2.95092246063913e-09	76479776	76491160
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	76485299	77073775	235	226	0.7417	2.95092246063913e-09	76479776	76491160	6.88248203990898e-122	77065846	77081788
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	77075365	81551675	1249	1205	1.5005	6.88248203990898e-122	77065846	77081788	1.973375867043e-07	81544262	81551675
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81554664	81557345	2	2	3.401	1.973375867043e-07	81544262	81551675	5.44310778037914e-07	81557345	81561626
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81561626	82612474	330	320	1.4861	5.44310778037914e-07	81557345	81561626	1.12100503386059e-33	82582016	82633910
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	82613714	82613714	1	0	NA	1.12100503386059e-33	82582016	82633910	NA	NA	NA
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	82615096	83536511	416	400	1.9112	NA	NA	NA	1.06279408688583e-43	83521532	83567373
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	83544205	83544205	1	0	NA	1.06279408688583e-43	83521532	83567373	NA	NA	NA
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	83545238	84145573	293	280	2.4226	NA	NA	NA	1.31678953515930e-75	84132026	84154677
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	84147228	85298234	467	455	1.7803	1.3167895351593e-75	84132026	84154677	9.56575428853189e-06	85143051	85304770
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	85300031	85308095	5	4	2.3705	9.5657542885319e-06	85143051	85304770	0.000152350878084216	85308095	85328344
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	85309401	88093692	918	887	1.3696	0.000152350878084216	85308095	85328344	4.21105901926187e-191	88091042	88103852
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	88096593	88096593	1	0	NA	4.21105901926187e-191	88091042	88103852	NA	NA	NA
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	88103852	88242948	58	58	-0.316	NA	NA	NA	2.39449711810751e-97	88241826	88252273
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	88252273	88813712	202	194	1.1449	2.39449711810751e-97	88241826	88252273	2.53054495012136e-317	88812168	88815394
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	88815394	99016880	2837	2750	-0.0843	2.53054495012136e-317	88812168	88815394	4.93936849211496e-46	99003189	99027331
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99020067	99072015	24	22	-0.7787	4.93936849211496e-46	99003189	99027331	4.89654735830745e-07	99054423	99091528
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99074552	134450318	12845	12459	-0.2738	4.89654735830745e-07	99054423	99091528	NA	NA	NA
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	22257931	8096	7858	0.4611	NA	NA	NA	0	22243755	22269486
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	22259967	25399871	1192	1160	-0.092	0	22243755	22269486	6.25536137995316e-232	25388430	25410878
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	25401187	34292801	2883	2781	0.3744	6.25536137995316e-232	25388430	25410878	1.13887179316472e-07	34282100	34292801
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	34302633	36734934	6	6	-0.6111	1.13887179316472e-07	34282100	34292801	1.95130379003613e-81	36734934	36783647
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	36739877	80662066	15164	14680	0.2968	1.95130379003613e-81	36734934	36783647	9.59960089507546e-80	80662066	80662066
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80663923	80666751	2	2	-1.9854	9.59960089507546e-80	80662066	80662066	1.21044350724936e-119	80666751	80666751
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80668695	121387135	13936	13548	0.4653	1.21044350724936e-119	80666751	80666751	4.15656407496393e-119	121377343	121391224
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	121389584	121401824	7	7	1.3333	4.15656407496393e-119	121377343	121391224	8.13077073142157e-07	121397840	121406604
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	121403277	132289090	3875	3735	0.4167	8.13077073142157e-07	121397840	121406604	NA	NA	NA
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	28701647	3903	3792	-0.0744	NA	NA	NA	1.48837129690770e-45	28661098	28707990
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	28704868	28735529	15	14	0.4295	1.4883712969077e-45	28661098	28707990	4.15327502563253e-06	28735529	28739281
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	28739281	28744246	4	4	1.4334	4.15327502563253e-06	28735529	28739281	0.000100369954331120	28741405	28758626
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	28745458	29287889	220	216	0.6311	0.00010036995433112	28741405	28758626	3.01581869957281e-39	29268887	29309190
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	29289231	30235102	361	352	0.1616	3.01581869957281e-39	29268887	29309190	4.27329738943076e-182	30228205	30243119
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	30236448	37953582	2835	2740	-0.513	4.27329738943076e-182	30228205	30243119	1.06171945185123e-18	37953582	37953582
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-3.2674	1.06171945185123e-18	37953582	37953582	4.44304107276034e-37	37957844	37957844
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	83013189	13654	13236	-0.5267	4.44304107276034e-37	37957844	37957844	1.24082993069395e-43	82998313	83024621
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	83017958	83082503	9	9	-1.5393	1.24082993069395e-43	82998313	83024621	1.50120132261402e-46	83072662	83102448
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	83090186	114123340	10641	10323	-0.6623	1.50120132261402e-46	83072662	83102448	NA	NA	NA
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19441654	37	36	0.4013	NA	NA	NA	1.44419079198979e-05	19420732	19446048
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19442895	19469681	13	13	1.1427	1.44419079198979e-05	19420732	19446048	0	19467512	19475864
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19471494	61350785	14310	13897	0.1233	0	19467512	19475864	0	61341764	61360406
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	61352811	65257719	1599	1547	-0.5189	0	61341764	61360406	0	65242906	65265439
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	65259336	69097052	1675	1633	0.1906	0	65242906	65265439	3.74369934168925e-312	69074777	69112052
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69098569	79176037	4708	4550	-0.2647	3.74369934168925e-312	69074777	69112052	2.14736748581428e-36	79176037	79176037
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79177462	79183154	3	3	-3.3809	2.14736748581428e-36	79176037	79176037	2.39886789506032e-32	79183154	79183154
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	99129366	6529	6323	-0.5066	2.39886789506032e-32	79183154	79183154	0	99118475	99136606
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	99131046	106358491	3011	2939	0.0826	0	99118475	99136606	NA	NA	NA
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	32514939	3828	3683	-0.1195	NA	NA	NA	7.52966832398643e-31	32454294	32525865
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32517839	32594200	24	24	-1.1474	7.52966832398643e-31	32454294	32525865	1.91748740141782e-76	32576881	32667508
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32661846	32661846	1	0	NA	1.91748740141782e-76	32576881	32667508	NA	NA	NA
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32664506	58398370	10555	10240	-0.2519	NA	NA	NA	0	58394733	58400457
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	58400457	59011576	344	339	0.8607	0	58394733	58400457	0	59009112	59013767
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	59012624	100298352	16570	16092	-0.1867	0	59009112	59013767	NA	NA	NA
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	32379126	10573	10243	-0.1078	NA	NA	NA	1.20602884407081e-23	31841022	32518665
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33538171	44	44	-0.7411	1.20602884407081e-23	31841022	32518665	8.25189779000528e-13	33519338	33868686
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33559207	34995910	194	192	-0.2185	8.25189779000528e-13	33519338	33868686	3.90175251787836e-23	34981772	45058242
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	35003634	45195038	47	44	0.4773	3.90175251787836e-23	34981772	45058242	3.14209572108673e-42	45186779	45205010
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	45197955	57549392	4168	4042	-0.199	3.14209572108673e-42	45186779	45205010	0	57530077	57566127
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57552427	64539371	1478	1429	0.3931	0	57530077	57566127	0	64495212	64583968
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	64544067	75092501	4018	3888	-0.1937	0	64495212	64583968	4.10177570321726e-61	75092501	75092501
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75093957	75093957	1	0	NA	4.10177570321726e-61	75092501	75092501	NA	NA	NA
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	2.1277	NA	NA	NA	5.39254243240184e-24	75100865	75100865
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76923844	609	589	-0.3343	5.39254243240184e-24	75100865	75100865	6.00926575611024e-16	76922411	76934755
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76925748	76925748	1	0	NA	6.00926575611024e-16	76922411	76934755	NA	NA	NA
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76942679	9	9	-1.5364	NA	NA	NA	4.15990774996304e-16	76934755	76944661
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76944661	78789576	614	603	-0.3586	4.15990774996304e-16	76934755	76944661	5.52088564362316e-08	78781830	78789576
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	78792844	78800074	2	2	1.3605	5.52088564362316e-08	78781830	78789576	4.66457235196595e-07	78800074	78807093
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	78807093	88690571	3896	3787	-0.3069	4.66457235196595e-07	78800074	78807093	NA	NA	NA
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	9143314	3979	3848	-0.0913	NA	NA	NA	2.39432681793379e-193	9139267	9152964
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	9146457	9607525	212	205	0.7526	2.39432681793379e-193	9139267	9152964	0	9606168	9610853
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	9610853	18831714	3242	3140	-0.7164	0	9606168	9610853	0	18826735	18837392
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	18833620	31457889	4604	4468	0.111	0	18826735	18837392	7.68313653661462e-18	31437168	31462463
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31889566	20	20	-0.4844	7.68313653661462e-18	31437168	31462463	7.07014527046348e-08	31493990	31906639
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31891535	36673853	1814	1756	0.0601	7.07014527046348e-08	31493990	31906639	1.13982468515630e-43	36673853	36673853
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	2.3476	1.1398246851563e-43	36673853	36673853	7.32195054308318e-41	36684619	36684619
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	78653545	15757	15266	0.0788	7.32195054308318e-41	36684619	36684619	NA	NA	NA
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22282	-0.108	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	20841320	9322	9018	-0.1819	NA	NA	NA	1.00725490797116e-16	20823632	20854536
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20847760	20865349	5	5	-1.2537	1.00725490797116e-16	20823632	20854536	4.02318591808829e-29	20857921	20872378
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20870473	42438772	4202	4076	-0.1738	4.02318591808829e-29	20857921	20872378	0	42431393	42490972
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	42441469	45289269	1270	1230	0.6072	0	42431393	42490972	9.04942785083608e-07	45273770	45314752
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	45313341	45333556	10	9	-0.1778	9.04942785083608e-07	45273770	45314752	0.00285645309833229	45322661	45335536
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	45335536	45355250	7	7	0.4553	0.00285645309833229	45322661	45335536	0.00164866935666493	45349401	45369738
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	45357523	45384145	12	12	1.162	0.00164866935666493	45349401	45369738	0.000487055055576792	45371135	45403160
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	45386656	45476438	54	54	0.6063	0.000487055055576792	45371135	45403160	1.39471501136108e-62	45474973	45477851
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	45477361	63788698	8177	7895	-0.3643	1.39471501136108e-62	45474973	45477851	NA	NA	NA
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	18410236	6676	6478	-0.5674	NA	NA	NA	0	18391024	18426024
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	18412420	41743182	7248	7042	-0.109	0	18391024	18426024	0	41727700	41764472
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	41744496	62419534	7655	7423	0.3556	0	41727700	41764472	NA	NA	NA
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13048	0.0434	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22696038	2989	2893	-0.1367	NA	NA	NA	8.0894275111953e-103	22686731	22696162
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22696162	22720195	14	14	1.1719	8.0894275111953e-103	22686731	22696162	2.12433217630426e-41	22718614	22721042
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22721042	36074159	6890	6675	-0.051	2.12433217630426e-41	22718614	22721042	8.8781744614093e-37	36074159	36074159
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	36075796	36078157	2	2	-2.2585	8.8781744614093e-37	36074159	36074159	4.34461430808437e-15	36078157	36078157
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	36079268	37685496	870	839	-0.0131	4.34461430808437e-15	36078157	36078157	1.14131532141330e-59	37685496	37690142
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37689058	37715385	16	16	-1.6187	1.1413153214133e-59	37685496	37690142	1.58796218437138e-48	37706998	37715385
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37718669	41638011	2024	1966	-0.1048	1.58796218437138e-48	37706998	37715385	0	41630914	41643662
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41638925	49571068	3752	3643	-0.7479	0	41630914	41643662	NA	NA	NA
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	-0.1669	NA	NA	NA	6.26799054689433e-25	94062	94062
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	95819	1	0	NA	6.26799054689433e-25	94062	94062	NA	NA	NA
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	98390	104732	6	6	-2.4901	NA	NA	NA	6.62448635433407e-50	104732	104732
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	159609	40	37	-0.2613	6.62448635433407e-50	104732	104732	9.66785968458552e-09	158967	159609
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	159991	164913	5	5	-1.2128	9.66785968458552e-09	158967	159609	0.00380109413031218	164913	208682
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	164985	2751284	1753	1712	-0.3688	0.00380109413031218	164913	208682	0	2740068	2766962
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2754701	8452395	1773	1717	0.2911	0	2740068	2766962	1.49495719027579e-07	8447855	8458058
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8456422	8473482	8	8	-0.6208	1.49495719027579e-07	8447855	8458058	0	8465433	8477126
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8475091	154582414	43335	42064	0.4782	0	8465433	8477126	0	154570177	154601295
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	195	-0.3128	0	154570177	154601295	NA	NA	NA
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	120	-1.9813	NA	NA	NA	3.03142712099868e-08	2973379	3773948
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	4948824	13	13	-0.207	3.03142712099868e-08	2973379	3773948	4.16527406594868e-09	4597974	5672441
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5422507	6955902	123	117	-2.0785	4.16527406594868e-09	4597974	5672441	0.000795144457074173	6864479	7124918
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6956705	8919165	584	571	-1.6379	0.000795144457074173	6864479	7124918	0.0353806569655183	8630377	10257096
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8921205	10504879	117	113	-1.9621	0.0353806569655183	8630377	10257096	1.15803263504347e-07	10399102	12527445
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10506718	13129843	225	219	-1.2951	1.15803263504347e-07	10399102	12527445	5.29797704600672e-16	13061201	13176983
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	25737663	2151	2091	-1.9054	5.29797704600672e-16	13061201	13176983	2.02645825660601e-10	22877495	26913408
MSK_252152919058_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	57440809	84	77	-1.0908	2.02645825660601e-10	22877495	26913408	NA	NA	NA
