Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72537426	27894	27216	0.0035	NA	NA	NA	1.69501000241248e-198	72537426	72537426
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72540240	2	0	NA	1.69501000241248e-198	72537426	72537426	NA	NA	NA
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72541443	72579311	12	11	-3.0681	NA	NA	NA	7.53345616598466e-227	72579311	72579311
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	108533257	11128	10882	0.0071	7.53345616598466e-227	72579311	72579311	4.80596742504676e-75	108533257	108533257
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108535814	108538662	3	3	-3.3846	4.80596742504676e-75	108533257	108533257	1.85257707719086e-61	108538662	108538662
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108541074	110023268	572	561	-0.0035	1.85257707719086e-61	108538662	108538662	3.38523444746984e-19	110023268	110023268
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110041712	4	4	-1.5816	3.38523444746984e-19	110023268	110023268	9.14068345946888e-21	110041712	110041712
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	194978218	21919	21372	0.004	9.14068345946888e-21	110041712	110041712	2.81793746392756e-12	194977713	195014129
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195065867	9	8	-0.8708	2.81793746392756e-12	194977713	195014129	3.07791744203825e-12	195046932	195091758
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	200592050	2155	2101	0.0013	3.07791744203825e-12	195046932	195091758	4.34781886547067e-11	200568838	200613454
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200594055	200787319	41	40	-0.3731	4.34781886547067e-11	200568838	200613454	1.42334021345143e-10	200670407	200813827
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200797743	247186514	17409	16981	0.0018	1.42334021345143e-10	200670407	200813827	NA	NA	NA
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	11224	0.0023	NA	NA	NA	1.15384370916550e-07	34524344	34552935
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34580533	15	13	0.5684	1.1538437091655e-07	34524344	34552935	2.58773505863754e-09	34571897	34589997
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34582272	37810001	1372	1336	-0.0137	2.58773505863754e-09	34571897	34589997	2.57111862206574e-10	37789939	37820898
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37812045	37854350	21	20	-0.5093	2.57111862206574e-10	37789939	37820898	3.26041923417651e-11	37842223	37862351
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37855837	43934924	2537	2474	0.0039	3.26041923417651e-11	37842223	37862351	1.64192324822342e-06	43929247	43937215
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	43937215	43949625	6	6	-0.7169	1.64192324822342e-06	43929247	43937215	5.32364421369941e-06	43944524	43958815
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	43953461	96703381	15360	14970	0.005	5.32364421369941e-06	43944524	43958815	6.45716846469303e-14	96700986	96706262
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	96706262	96724074	10	10	-0.8162	6.45716846469303e-14	96700986	96706262	3.46805137444411e-13	96722739	96726822
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	96725565	132726091	9511	9296	0.0052	3.46805137444411e-13	96722739	96726822	2.44515062475547e-05	132397397	132739926
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	132735656	132753228	7	7	0.6536	2.44515062475547e-05	132397397	132739926	4.42085636092067e-06	132753228	132753228
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	132754617	132755508	2	2	2.6919	4.42085636092067e-06	132753228	132753228	2.99035337788274e-32	132755508	132755508
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	132763461	146571330	4711	4591	-0.0046	2.99035337788274e-32	132755508	132755508	4.03061412417707e-253	146571330	146571330
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-5.3184	4.03061412417707e-253	146571330	146571330	3.6139975754358e-253	146592775	146592775
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	146597405	1	0	NA	3.6139975754358e-253	146592775	146592775	NA	NA	NA
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146601593	212890878	22056	21486	0.0031	NA	NA	NA	4.54271402915768e-12	212889077	212892884
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212892884	212898875	4	4	-1.1984	4.54271402915768e-12	212889077	212892884	1.09914637573072e-11	212896080	212900857
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212900857	227949124	5141	5020	0.0111	1.09914637573072e-11	212896080	212900857	1.59031282985024e-12	227946001	227950459
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	227950459	227981126	12	12	0.7331	1.59031282985024e-12	227946001	227950459	3.39067024749484e-12	227976902	227996401
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	227986221	242689978	5535	5378	-0.0089	3.39067024749484e-12	227976902	227996401	NA	NA	NA
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	89475107	30641	29827	0.0011	NA	NA	NA	1.34092703934408e-21	89473678	89477163
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89477163	89500935	13	13	-0.8976	1.34092703934408e-21	89473678	89477163	3.83840465964671e-22	89499433	89502757
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89502757	150748947	18567	18109	0.0021	3.83840465964671e-22	89499433	89502757	1.51957984007965e-07	150746918	150748947
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	150751433	150752600	2	2	-1.3854	1.51957984007965e-07	150746918	150748947	9.42309135239558e-08	150752600	150752600
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	150753766	164005577	4268	4145	-3e-04	9.42309135239558e-08	150752600	150752600	3.39492120306120e-11	164001657	164009321
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	1.0423	3.3949212030612e-11	164001657	164009321	4.15850370049649e-11	164023502	164036648
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	192546280	9568	9350	0.0089	4.15850370049649e-11	164023502	164036648	8.30541527759286e-10	192544305	192546280
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192548135	192550989	3	3	-1.2494	8.30541527759286e-10	192544305	192546280	7.85157147348224e-10	192550989	192550989
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192552734	192552734	1	0	NA	7.85157147348224e-10	192550989	192550989	NA	NA	NA
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192554451	194354505	578	569	-0.0017	NA	NA	NA	8.3712081336767e-09	194351567	194358882
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194368145	7	7	0.7759	8.3712081336767e-09	194351567	194358882	2.72032802023069e-08	194366950	194375211
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194371608	199329592	1979	1932	-0.0173	2.72032802023069e-08	194366950	194375211	NA	NA	NA
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3322	0.0062	NA	NA	NA	1.60678626659103e-204	9815760	9815760
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-5.2551	1.60678626659103e-204	9815760	9815760	1.38782343625485e-247	9842644	9842644
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	68905670	15036	14603	0.0062	1.38782343625485e-247	9842644	9842644	0	68905670	68905670
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	-3.6657	0	68905670	68905670	0	69165814	69165814
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	188112032	35784	34849	0.0068	0	69165814	69165814	8.3038757558393e-09	188112032	188112032
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	188116287	188131744	2	2	1.4868	8.3038757558393e-09	188112032	188112032	7.00627793138136e-09	188131744	188134132
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	188134132	191153613	928	912	0.0085	7.00627793138136e-09	188131744	188134132	NA	NA	NA
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	12857302	3975	3873	0.0123	NA	NA	NA	8.93967436623901e-90	12857302	12857302
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	-4.738	8.93967436623901e-90	12857302	12857302	5.33940376457668e-98	12873052	12873052
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	150181399	39877	38869	0.0012	5.33940376457668e-98	12873052	12873052	1.09098943350863e-16	150171154	150181399
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150185190	150202601	7	7	-1.0707	1.09098943350863e-16	150171154	150181399	7.32723020223478e-16	150202601	150204134
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	180342860	9785	9559	0.0061	7.32723020223478e-16	150202601	150204134	3.89296354908642e-15	180194323	180342860
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	8	0.9911	3.89296354908642e-15	180194323	180342860	6.7981676958925e-17	180358977	180362342
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	107	-0.0603	6.7981676958925e-17	180358977	180362342	NA	NA	NA
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	31385778	11182	10903	0.0125	NA	NA	NA	1.13174890236856e-08	31383925	31385778
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31393624	4	4	-1.064	1.13174890236856e-08	31383925	31385778	5.06092667001581e-08	31393624	31395330
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31395330	32558677	491	485	0.005	5.06092667001581e-08	31393624	31395330	5.41007599234507e-82	32558677	32567462
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32600962	9	9	-2.5626	5.41007599234507e-82	32558677	32567462	1.16972888524539e-10	32590568	32605300
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	32713363	36	36	-0.3064	1.16972888524539e-10	32590568	32605300	2.87151038280093e-13	32711957	32718991
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	8	-2.3325	2.87151038280093e-13	32711957	32718991	4.63852750926209e-11	32728285	32728487
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	32745036	8	8	-0.0278	4.63852750926209e-11	32728285	32728487	0.00293902014035889	32738443	32756637
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32745693	32762061	5	5	-1.0573	0.00293902014035889	32738443	32756637	5.25327742144771e-11	32762061	32766023
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32766023	54035000	8246	8056	0.0046	5.25327742144771e-11	32762061	32766023	7.23181123773267e-147	54035000	54035000
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-4.8577	7.23181123773267e-147	54035000	54035000	2.6003395723812e-169	54042734	54042734
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	65767409	2398	2348	-0.0039	2.6003395723812e-169	54042734	54042734	2.11118886633201e-78	65767409	65767409
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65769146	65771532	2	2	-4.062	2.11118886633201e-78	65767409	65767409	6.87542936531275e-74	65771532	65771532
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65778663	103841482	10807	10534	0.0049	6.87542936531275e-74	65771532	65771532	1.38195372247506e-06	103827105	103845083
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	0.9066	1.38195372247506e-06	103827105	103845083	1.91647623380252e-06	103860573	103882598
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	139643729	12380	12100	0.0036	1.91647623380252e-06	103860573	103882598	1.12355462925011e-10	139641158	139643729
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139645417	139648318	3	3	-1.309	1.12355462925011e-10	139641158	139643729	4.07546688515169e-10	139648318	139651247
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139651247	165643653	8723	8504	6e-04	4.07546688515169e-10	139648318	139651247	2.08130870203885e-13	165642393	165645537
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.2962	2.08130870203885e-13	165642393	165645537	5.7011343829786e-13	165649379	165653315
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1762	-0.0113	5.7011343829786e-13	165649379	165653315	NA	NA	NA
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	118611324	39265	38318	0.002	NA	NA	NA	1.00611409455412e-121	118611324	118611324
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	-4.3863	1.00611409455412e-121	118611324	118611324	2.33328382138758e-120	118620875	118620875
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	141410894	10535	10272	0.0098	2.33328382138758e-120	118620875	118620875	2.025549150576e-15	141408013	141414719
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	13	0.7819	2.025549150576e-15	141408013	141414719	6.89907910966799e-15	141434131	141442231
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	158079333	6613	6445	-0.004	6.89907910966799e-15	141434131	141442231	6.91424027548877e-21	158077276	158085529
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158081622	158104731	11	11	-1.01	6.91424027548877e-21	158077276	158085529	5.57418019226178e-22	158098817	158113059
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158113059	158821263	255	252	0.0152	5.57418019226178e-22	158098817	158113059	NA	NA	NA
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	115	0.0344	NA	NA	NA	2.14907622916235e-17	581533	581533
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-2.0455	2.14907622916235e-17	581533	581533	4.74644224325251e-17	588865	588865
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	18894239	6063	5914	0.0076	4.74644224325251e-17	588865	588865	2.24139855145489e-15	18891449	18894239
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	18896032	18908287	7	7	-1.037	2.24139855145489e-15	18891449	18894239	1.67852631395387e-14	18908287	18910176
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	18910176	25022606	1938	1891	0.0093	1.67852631395387e-14	18908287	18910176	4.71678010316024e-15	25022606	25022606
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	1.635	4.71678010316024e-15	25022606	25022606	4.63628318804339e-16	25039370	25039370
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	32797545	3061	2970	0.004	4.63628318804339e-16	25039370	25039370	2.18923668277895e-19	32797545	32797545
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32800775	32800775	1	0	NA	2.18923668277895e-19	32797545	32797545	NA	NA	NA
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32805686	32808049	2	2	-2.1844	NA	NA	NA	2.47365697480124e-20	32808049	32808049
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32812909	40892587	2378	2326	0.0165	2.47365697480124e-20	32808049	32808049	2.25429688172249e-85	40892587	40892587
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-4.4442	2.25429688172249e-85	40892587	40892587	8.85999685802043e-89	40897469	40897469
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	71764822	8120	7905	0.0119	8.85999685802043e-89	40897469	40897469	2.04109205892526e-12	71762853	71779510
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	71776307	71789622	6	6	-0.9739	2.04109205892526e-12	71762853	71779510	2.38571974468780e-11	71783063	71789866
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	71789866	146264846	22864	22306	0.0043	2.3857197446878e-11	71783063	71789866	NA	NA	NA
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	256045	28	28	0.6341	NA	NA	NA	6.50248780442173e-24	249678	261257
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	257609	39146895	12703	12367	0.0017	6.50248780442173e-24	249678	261257	6.87262501559178e-65	39146895	43445839
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43445839	43599449	3	3	-3.1605	6.87262501559178e-65	39146895	43445839	6.01602004267011e-60	43530076	43599449
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43626920	137352394	24105	23493	-0.0042	6.01602004267011e-60	43530076	43599449	9.23847377287463e-09	137352394	137352394
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.5354	9.23847377287463e-09	137352394	137352394	6.8564564253303e-07	137356880	137359947
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1072	-0.0483	6.8564564253303e-07	137356880	137359947	NA	NA	NA
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	135285645	44808	43700	0.0038	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5741031	2138	2085	-0.0115	NA	NA	NA	1.70996207138282e-27	5738494	5742476
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	15	-1.0463	1.70996207138282e-27	5738494	5742476	7.57004545457541e-33	5763749	5766615
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	7762277	863	836	0.0139	7.57004545457541e-33	5763749	5766615	2.34446316147254e-18	7758275	7762277
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7771593	7783492	8	7	-1.1483	2.34446316147254e-18	7758275	7762277	2.30371955213570e-18	7783492	7797993
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7797993	134450318	42280	41216	0.0023	2.3037195521357e-18	7783492	7797993	NA	NA	NA
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	11395862	4406	4309	3e-04	NA	NA	NA	5.71273200496483e-11	11393473	11419189
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11435643	6	6	-0.9755	5.71273200496483e-11	11393473	11419189	8.14478769320578e-12	11433210	11440927
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	31173065	6746	6578	0.0091	8.14478769320578e-12	11433210	11440927	2.93468418251809e-10	31071789	31205252
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31177645	31298659	40	39	-0.3529	2.93468418251809e-10	31071789	31205252	2.96418439204266e-09	31279843	31331020
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31299898	130943064	33411	32608	0.0042	2.96418439204266e-09	31279843	31331020	1.55967001528475e-09	130943064	130943064
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.6013	1.55967001528475e-09	130943064	130943064	2.23330568531185e-09	130946248	130946248
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	536	-0.0276	2.23330568531185e-09	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	49964838	12219	11906	-0.0018	NA	NA	NA	2.00970904887482e-08	49964838	49964838
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-1.4714	2.00970904887482e-08	49964838	49964838	6.10690827567149e-09	49971732	49971732
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56657371	1805	1762	0.0113	6.10690827567149e-09	49971732	49971732	1.46810122783334e-09	56606183	56658479
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56658479	56686863	15	15	0.5711	1.46810122783334e-09	56606183	56658479	5.98365073203505e-10	56681665	56699800
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56688605	99417382	12466	12163	0.0076	5.98365073203505e-10	56681665	56699800	2.22917736251229e-07	99413204	99424551
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	99419235	99429032	6	6	0.7849	2.22917736251229e-07	99413204	99424551	3.62146590900346e-07	99421920	99433595
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	99431458	113791151	4980	4841	-0.0059	3.62146590900346e-07	99421920	99433595	2.19932770325255e-15	113791151	113791151
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113792974	113794669	2	2	1.9563	2.19932770325255e-15	113791151	113791151	2.75360015802274e-28	113794669	113794669
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113797828	113825670	13	13	-0.3058	2.75360015802274e-28	113794669	113794669	0.069406499859124	113815262	113920061
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113828449	114123340	136	135	-0.0026	0.069406499859124	113815262	113920061	NA	NA	NA
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19497023	61	61	-0.3622	NA	NA	NA	3.12674022767482e-17	19471494	19552203
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19535787	40680589	7588	7403	0.0097	3.12674022767482e-17	19471494	19552203	0	40680589	40680589
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40687108	40722360	6	6	-5.4825	0	40680589	40680589	0	40722360	40722360
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40726930	43884016	595	577	0.0224	0	40722360	40722360	4.39057352925098e-17	43866254	43890398
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	43890398	44000687	23	22	0.6101	4.39057352925098e-17	43866254	43890398	1.02826941601602e-16	43993011	44017102
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	44004727	73071404	11147	10892	0.0015	1.02826941601602e-16	43993011	44017102	8.89034435480182e-12	73061942	73071404
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73075500	2	0	NA	8.89034435480182e-12	73061942	73071404	NA	NA	NA
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73082262	73092112	5	5	1.0822	NA	NA	NA	6.86283381105951e-11	73092112	73101327
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	105597555	12215	11926	-0.0059	6.86283381105951e-11	73092112	73101327	2.20538809705009e-222	105597555	105597555
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	-3.0929	2.20538809705009e-222	105597555	105597555	1.16683454592142e-133	105632168	105632168
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	106358491	231	218	-0.0157	1.16683454592142e-133	105632168	105632168	NA	NA	NA
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.1976	NA	NA	NA	2.22436852720575e-16	18452491	18452491
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	18842565	11	11	-1.3002	2.22436852720575e-16	18452491	18452491	3.11978947962613e-10	18842565	18843998
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18843998	18848213	3	3	-3.6279	3.11978947962613e-10	18842565	18843998	8.70841743428016e-17	18846835	18848213
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18851513	19537035	80	78	-1.2591	8.70841743428016e-17	18846835	18848213	1.17396680058301e-07	19421704	19800789
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	19845942	11	11	-0.4413	1.17396680058301e-07	19421704	19800789	1.90340892580809e-44	19845942	19845942
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19874677	19882711	3	3	-5.7676	1.90340892580809e-44	19845942	19845942	2.73651795694306e-94	19882711	19882711
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19910696	20088256	43	42	-0.6755	2.73651795694306e-94	19882711	19882711	4.70836969129132e-38	20065525	20316992
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	59468560	14825	14429	-0.0109	4.70836969129132e-38	20065525	20316992	1.11050367766936e-08	59465473	59468560
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	59475528	59483715	3	3	-1.2382	1.11050367766936e-08	59465473	59468560	1.32066829609903e-08	59483715	59488251
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	59488251	82332155	9525	9278	-0.0042	1.32066829609903e-08	59483715	59488251	4.36975696029759e-23	82332155	82332155
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82333698	82334704	2	2	-2.4237	4.36975696029759e-23	82332155	82332155	1.27345361096269e-23	82334704	82334704
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82335935	100298352	6811	6623	-0.0054	1.27345361096269e-23	82334704	82334704	NA	NA	NA
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	76925748	21136	20637	0.0034	NA	NA	NA	2.41870399823167e-198	76925748	76925748
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	-3.5603	2.41870399823167e-198	76925748	76925748	2.84752754690037e-181	76940218	76940218
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4381	-0.0072	2.84752754690037e-181	76940218	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1904451	854	832	0.0172	NA	NA	NA	3.87393254355718e-12	1903358	1904451
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906319	1909371	4	4	1.3633	3.87393254355718e-12	1903358	1904451	4.91189840620796e-14	1909371	1909874
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909874	31457889	11179	10877	-0.0032	4.91189840620796e-14	1909371	1909874	3.38532471853778e-09	31439551	31462463
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31503774	19	18	-0.5316	3.38532471853778e-09	31439551	31462463	2.21431878547936e-09	31493990	31897238
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	36673853	1815	1767	-0.0011	2.21431878547936e-09	31493990	31897238	7.46421904985094e-33	36673853	36673853
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	1.6872	7.46421904985094e-33	36673853	36673853	7.5153934820853e-32	36684619	36684619
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41519702	2011	1960	0.0026	7.5153934820853e-32	36684619	36684619	7.82662277227405e-23	41500726	41533641
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41702238	63	63	0.4498	7.82662277227405e-23	41500726	41533641	1.72153326150596e-24	41644979	42147225
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41704093	78653545	13683	13313	-0.0041	1.72153326150596e-24	41644979	42147225	NA	NA	NA
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22385	6e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	210395	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	216768	40540618	12692	12383	-0.0036	NA	NA	NA	3.60243137476186e-92	40540618	40540618
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40543992	40553315	3	3	-4.2024	3.60243137476186e-92	40540618	40540618	8.13166457779606e-93	40553315	40553315
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40556205	48381822	3263	3189	0.0059	8.13166457779606e-93	40553315	40553315	3.90919149799423e-08	48211296	48497883
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	48437928	48536890	9	9	-0.7363	3.90919149799423e-08	48211296	48497883	2.96707403998615e-08	48531935	48551450
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	48548254	56825794	3906	3792	0.0092	2.96707403998615e-08	48531935	48551450	1.26837303307785e-07	56822197	56828073
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56828073	56840346	7	7	-0.8047	1.26837303307785e-07	56822197	56828073	8.31296824914576e-08	56834433	56844304
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	58208527	586	573	-0.0262	8.31296824914576e-08	56834433	56844304	1.33169010505444e-05	58193599	58208527
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58212113	58239871	13	13	-0.5123	1.33169010505444e-05	58193599	58208527	2.01845948174581e-05	58239871	58254174
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58241773	63788698	2579	2516	-0.0038	2.01845948174581e-05	58239871	58254174	NA	NA	NA
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	568	-0.0281	NA	NA	NA	3.98359422870673e-166	1506379	1511632
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	9	-3.4389	3.98359422870673e-166	1506379	1511632	6.66111432849364e-206	1528899	1531162
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	20460	-0.004	6.66111432849364e-206	1528899	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	36789648	8545	8328	-0.0078	NA	NA	NA	1.13662980015412e-11	36789648	36789648
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36790648	36791668	2	2	1.6752	1.13662980015412e-11	36789648	36789648	1.15987792091231e-09	36791668	36791668
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36792708	46922972	4894	4761	-0.007	1.15987792091231e-09	36791668	36791668	NA	NA	NA
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	18125356	1131	1106	-0.0218	NA	NA	NA	1.22546587914246e-26	18125356	18125356
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18127933	18129194	2	2	2.7523	1.22546587914246e-26	18125356	18125356	1.00595043499798e-27	18129194	18129194
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18131561	37621766	9608	9387	-0.0069	1.00595043499798e-27	18129194	18129194	4.27409942086257e-20	37621766	37621766
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37624278	37626069	2	2	-2.3688	4.27409942086257e-20	37621766	37621766	1.00785773744703e-18	37626069	37626069
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37633961	49571068	5813	5654	-0.0161	1.00785773744703e-18	37626069	37626069	NA	NA	NA
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	124528	29	28	-0.1135	NA	NA	NA	1.03624395317871e-16	122273	124528
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	5	1.0976	1.03624395317871e-16	122273	124528	4.83059446286857e-06	130528	134946
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	266212	93	89	-0.0401	4.83059446286857e-06	130528	134946	3.05897279009283e-08	264886	266212
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	267060	267079	2	2	2.0705	3.05897279009283e-08	264886	266212	7.16557297050213e-15	267079	267079
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	268402	1528282	725	714	0.0494	7.16557297050213e-15	267079	267079	7.15395496290542e-07	1526804	1528282
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1529356	1530474	4	4	-0.9331	7.15395496290542e-07	1526804	1528282	1.17105170092311e-05	1530474	1533546
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1533361	2426938	682	667	0.0066	1.17105170092311e-05	1530474	1533546	1.51708635215067e-21	2426938	2426938
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2428167	2428307	2	2	2.5519	1.51708635215067e-21	2426938	2426938	4.29689483193486e-21	2428307	2428307
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2430156	2711273	252	244	-0.0145	4.29689483193486e-21	2428307	2428307	0	2708291	2713845
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2712641	8432497	1780	1740	0.9468	0	2708291	2713845	5.97984531009845e-08	8411159	8445177
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8437023	8473482	18	18	0.4108	5.97984531009845e-08	8411159	8445177	4.66102953918789e-10	8459880	8481902
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8475091	33953232	10191	9906	0.9711	4.66102953918789e-10	8459880	8481902	4.46386900931110e-11	33948621	33953232
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	33962643	33981492	4	4	-0.2709	4.4638690093111e-11	33948621	33953232	4.42504456596940e-10	33981492	33988646
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	33988646	154442377	33108	32273	0.9663	4.4250445659694e-10	33981492	33988646	2.4065599344133e-97	154442377	154442377
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	4	-2.7176	2.4065599344133e-97	154442377	154442377	6.90128116574933e-71	154450309	154450309
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	27	0.9194	6.90128116574933e-71	154450309	154450309	4.58814817062402e-42	154578922	154586690
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	196	-0.0281	4.58814817062402e-42	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3219200	122	121	-4.1965	NA	NA	NA	3.62093625886443e-30	3034907	3219200
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3223585	3223585	1	0	NA	3.62093625886443e-30	3034907	3219200	NA	NA	NA
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	4431527	11	11	-0.4101	NA	NA	NA	1.30410323570999e-12	4431527	4846477
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4597974	7057026	182	177	-3.6097	1.30410323570999e-12	4431527	4846477	0.000690116912002569	6971636	7247504
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7070931	7495687	127	124	-2.8833	0.00069011691200257	6971636	7247504	0.000260729630793829	7333934	7619927
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7722458	74	71	-3.8357	0.000260729630793829	7333934	7619927	2.48576651145700e-05	7711759	7729757
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7723783	7751430	12	12	-2.0016	2.485766511457e-05	7711759	7729757	1.07463684553053e-05	7744396	7781968
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7755522	7859390	36	35	-3.7254	1.07463684553053e-05	7744396	7781968	0.00036370802909519	7847379	7893056
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7860364	7914104	11	11	-2.2365	0.00036370802909519	7847379	7893056	2.81438270611899e-05	7897073	7919636
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	7992095	16	15	-4.1544	2.81438270611899e-05	7897073	7919636	4.64370083498431e-07	7985612	7992095
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7992221	8005148	5	4	-1.7387	4.64370083498431e-07	7985612	7992095	3.76812056579681e-07	8005148	8016395
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8010446	8289709	64	60	-4.2545	3.76812056579681e-07	8005148	8016395	1.00880499735525e-11	8277707	8289709
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8292347	8313045	10	9	-1.9933	1.00880499735525e-11	8277707	8289709	2.42408888671847e-06	8308608	8333193
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8316416	10513747	294	283	-3.8837	2.42408888671847e-06	8308608	8333193	6.87585042910819e-29	10512616	10515697
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	13	-0.5917	6.87585042910819e-29	10512616	10515697	0.0258960549414986	10631941	11673476
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12452734	7	6	-2.5651	0.0258960549414986	10631941	11673476	0.0300785390292483	10655750	12502304
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12541506	11	11	-4.7029	0.0300785390292483	10655750	12502304	9.4254987977687e-07	12537944	12554612
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	53	-2.3908	9.4254987977687e-07	12537944	12554612	3.78784848270147e-05	12649357	12696242
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12733867	9	9	-4.6226	3.78784848270147e-05	12649357	12696242	0.000492286349742878	12725675	12804329
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12741404	13129843	127	121	-2.5216	0.000492286349742878	12725675	12804329	4.53130206670181e-26	13104920	13140274
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13558000	186	181	-4.0502	4.53130206670181e-26	13104920	13140274	0.00049668809978876	13511347	13603478
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13559743	13716000	33	31	-3.1793	0.00049668809978876	13511347	13603478	3.00674837825993e-09	13663517	13765657
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716331	14342834	189	177	-4.3914	3.00674837825993e-09	13663517	13765657	6.27154453629573e-13	14325320	14374313
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14508894	97	94	-3.4198	6.27154453629573e-13	14325320	14374313	8.93241017001483e-06	14488060	14555872
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14694578	43	42	-2.2678	8.93241017001483e-06	14488060	14555872	7.61025830604983e-14	14681738	14697315
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14695441	14994704	64	62	-4.0978	7.61025830604983e-14	14681738	14697315	1.75970312144193e-07	14969835	14994704
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15005207	15018205	3	3	-0.8189	1.75970312144193e-07	14969835	14994704	0.000114660091093280	15018205	15032971
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15022037	15521958	242	236	-3.7931	0.00011466009109328	15018205	15032971	0.000230398494053846	15470132	15542314
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15523178	15558235	24	23	-2.6769	0.000230398494053846	15470132	15542314	2.59089996974633e-05	15546378	15580942
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15559959	15920478	67	64	-4.0766	2.59089996974633e-05	15546378	15580942	1.92368942382076e-05	15843146	15974702
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15928904	16071977	59	58	-2.9913	1.92368942382076e-05	15843146	15974702	0.0169413856791365	15979526	16162358
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16072965	16387273	102	98	-3.6799	0.0169413856791365	15979526	16162358	0.0167464266266616	16139806	16759093
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	21036411	670	651	-4.1057	0.0167464266266616	16139806	16759093	1.27572205925505e-05	21025500	21041164
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21036503	21054519	7	7	-1.9395	1.27572205925505e-05	21025500	21041164	6.21721642306756e-09	21047798	21057446
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	22139807	261	251	-4.1401	6.21721642306756e-09	21047798	21057446	1.00240006640564e-13	22058759	22139807
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.791	1.00240006640564e-13	22058759	22139807	2.28784205008823e-18	22177335	22178964
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	25737663	95	94	-4.2354	2.28784205008823e-18	22177335	22178964	5.38809012288999e-79	25737663	26870361
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26945893	31	29	-1.1492	5.38809012288999e-79	25737663	26870361	0.00133058232998158	26938967	27006628
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	20	-2.4041	0.00133058232998158	26938967	27006628	2.51023493507719e-05	27003308	27039222
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	27137064	16	16	-0.5509	2.51023493507719e-05	27003308	27039222	2.95820634377966e-07	27137064	27171797
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27163598	27176933	5	5	-2.3992	2.95820634377966e-07	27137064	27171797	3.54424682010963e-08	27171797	27176933
MSK_252152919078_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27188740	57440809	11	10	-0.1881	3.54424682010963e-08	27171797	27176933	NA	NA	NA
