Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	54860193	21023	20495	0.0202	NA	NA	NA	1.01571598002146e-07	54857788	54860193
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	54862228	54866506	3	3	-1.202	1.01571598002146e-07	54857788	54860193	2.15858348069865e-09	54866506	54876067
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	54876067	72537426	6868	6693	0.0173	2.15858348069865e-09	54866506	54876067	0	72537426	72537426
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	-3.795	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	150819879	17556	17116	0.0042	0	72579311	72579311	6.53475572082893e-19	150819879	150819879
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150839754	4	4	-1.4713	6.53475572082893e-19	150819879	150819879	0.000290232538865194	150839754	150844444
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150851439	7	6	-3.7385	0.000290232538865194	150839754	150844444	5.82132013260077e-163	150851439	150851439
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2708	0.0079	5.82132013260077e-163	150851439	150851439	1.14655161581109e-30	157133150	157133150
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	2.8206	1.14655161581109e-30	157133150	157133150	1.49515128309313e-35	157136342	157136342
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	200592050	15460	15060	2e-04	1.49515128309313e-35	157136342	157136342	3.52887409225994e-12	200571339	200618814
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200594055	200804838	46	44	-0.3599	3.52887409225994e-12	200571339	200618814	5.10174916652003e-12	200696309	200818194
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200806319	247186514	17404	16983	0.006	5.10174916652003e-12	200696309	200818194	NA	NA	NA
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34558824	11527	11201	0.004	NA	NA	NA	3.77320182874488e-07	34539603	34566082
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34561038	34599239	17	17	-0.4621	3.77320182874488e-07	34539603	34566082	1.38754591060014e-07	34591681	34613385
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34602813	106244482	22366	21784	0.0067	1.38754591060014e-07	34591681	34613385	3.15934333960826e-14	106244482	106244482
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106247167	106250718	2	2	-1.8153	3.15934333960826e-14	106244482	106244482	1.14852886798222e-14	106250718	106250718
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106253229	146546601	11159	10866	0.0066	1.14852886798222e-14	106250718	106250718	1.96923631275843e-08	146535528	146562545
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146552736	146592775	7	7	0.7587	1.96923631275843e-08	146535528	146562545	7.71065812564095e-08	146585707	146606708
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	146597405	1	0	NA	7.71065812564095e-08	146585707	146606708	NA	NA	NA
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146601593	241620772	32388	31551	0.0181	NA	NA	NA	4.68304840572863e-08	241617175	241620772
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	241623347	241638357	6	6	-0.7914	4.68304840572863e-08	241617175	241620772	2.97627601008923e-06	241638357	241645942
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	241642383	242689978	354	342	-0.03	2.97627601008923e-06	241638357	241645942	NA	NA	NA
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	48590956	16724	16310	-8e-04	NA	NA	NA	1.96862216253415e-11	48575894	48602209
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	48592491	48626999	17	17	0.4211	1.96862216253415e-11	48575894	48602209	6.61859792347622e-06	48615496	48649558
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	48631976	50527628	888	859	-0.0241	6.61859792347622e-06	48615496	48649558	1.29753494817448e-09	50525938	50536585
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	50530262	50542748	5	5	1.0166	1.29753494817448e-09	50525938	50536585	2.92946094513036e-10	50535026	50545560
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	50545560	53003136	1029	1005	-0.0385	2.92946094513036e-10	50535026	50545560	2.93218038973464e-07	53001678	53003136
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53006923	53011885	4	4	-1.0277	2.93218038973464e-07	53001678	53003136	1.51122705714055e-08	53011885	53014254
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53014254	65160634	4843	4721	-0.0116	1.51122705714055e-08	53011885	53014254	9.06591602391138e-151	65160634	65160634
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	65170560	65184180	2	2	-5.8486	9.06591602391138e-151	65160634	65160634	1.15999677923578e-160	65184180	65184180
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	65195223	164005577	29979	29254	0.0106	1.15999677923578e-160	65184180	65184180	2.50689786265066e-72	164005577	164005577
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164012645	2	2	-3.9343	2.50689786265066e-72	164005577	164005577	1.80437715003380e-26	164012645	164012645
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164019640	164027724	3	3	-1.3426	1.8043771500338e-26	164012645	164012645	4.60186967902195e-38	164027724	164027724
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	20	1.049	4.60186967902195e-38	164027724	164027724	3.94643978945757e-50	164105613	164112873
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	191219222	9122	8867	0.0118	3.94643978945757e-50	164105613	164112873	1.00903041118125e-102	191219222	191219222
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191221758	191222891	2	2	-4.6609	1.00903041118125e-102	191219222	191219222	2.66207096085989e-124	191222891	191222891
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191224191	192546280	424	414	0.0059	2.66207096085989e-124	191222891	191222891	2.66675771792036e-10	192544305	192546280
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192548135	192552734	4	4	-0.9631	2.66675771792036e-10	192544305	192546280	2.65624777800814e-08	192552734	192554451
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192554451	194353315	577	563	-7e-04	2.65624777800814e-08	192552734	192554451	2.17388884170148e-322	194353315	194353315
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194354505	194354505	1	0	NA	2.17388884170148e-322	194353315	194353315	NA	NA	NA
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-4.9428	NA	NA	NA	3.50206046730013e-314	194366950	194366950
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	199329592	1980	1915	-0.0221	3.50206046730013e-314	194366950	194366950	NA	NA	NA
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3310	0.0046	NA	NA	NA	2.44290908927022e-232	9815760	9815760
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-5.5705	2.44290908927022e-232	9815760	9815760	4.34626861287434e-300	9842644	9842644
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	185965288	49934	48638	-0.0104	4.34626861287434e-300	9842644	9842644	1.28807188664571e-08	185963457	185966876
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	185966876	185973770	5	5	-0.9061	1.28807188664571e-08	185963457	185966876	2.05553803538901e-08	185971416	185975042
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	185975042	191153613	1825	1780	-0.0108	2.05553803538901e-08	185971416	185975042	NA	NA	NA
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	55582377	14916	14565	0.0335	NA	NA	NA	3.18454249891984e-10	55576439	55585848
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	55584546	55591133	5	5	0.7297	3.18454249891984e-10	55576439	55585848	7.31122032056638e-09	55587134	55594311
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	55592605	90532927	10481	10212	-0.0225	7.31122032056638e-09	55587134	55594311	2.95256549788056e-10	90532927	90532927
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	90536563	90548101	3	2	1.4961	2.95256549788056e-10	90532927	90532927	1.56316561278073e-17	90548101	90548101
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	90555624	180342860	28241	27500	0.0031	1.56316561278073e-17	90548101	90548101	2.05685003437368e-18	180194323	180342860
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	8	1.0262	2.05685003437368e-18	180194323	180342860	5.1583399344237e-16	180358977	180364670
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180362342	1	0	NA	5.1583399344237e-16	180358977	180364670	NA	NA	NA
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180364670	180644810	111	109	-0.0473	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	32558677	11677	11389	-0.009	NA	NA	NA	4.68382838102551e-156	32558677	32563252
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32600962	9	8	-3.0329	4.68382838102551e-156	32558677	32563252	1.93262186660052e-09	32593151	32609525
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	32689775	26	26	-0.4902	1.93262186660052e-09	32593151	32609525	2.86708605094556e-13	32613538	32700719
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32693779	32695015	2	0	NA	2.86708605094556e-13	32613538	32700719	NA	NA	NA
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32697056	79018959	14710	14363	-0.0024	NA	NA	NA	2.18292077217637e-27	79015901	79018959
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-0.9718	2.18292077217637e-27	79015901	79018959	4.31413336568629e-28	79091850	79095415
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	139643729	19146	18638	-0.0111	4.31413336568629e-28	79091850	79095415	7.67907803735025e-08	139641158	139643729
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139645417	139648318	3	3	-1.1088	7.67907803735025e-08	139641158	139643729	1.63551861960530e-07	139648318	139651247
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139651247	165643653	8723	8483	-0.0133	1.6355186196053e-07	139648318	139651247	2.43510916956047e-23	165643653	165645537
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.6119	2.43510916956047e-23	165643653	165645537	9.2794526355971e-21	165649379	165650610
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1760	-0.008	9.2794526355971e-21	165649379	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	111727311	36103	35229	-0.0171	NA	NA	NA	4.71703675339356e-26	111725705	111727311
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	111729122	111746764	11	11	-1.0658	4.71703675339356e-26	111725705	111727311	9.26314224037076e-34	111746764	111751162
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	111751162	112213834	215	208	-0.0058	9.26314224037076e-34	111746764	111751162	1.36740884857346e-18	112207170	112218341
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	112215891	112265575	23	22	0.5666	1.36740884857346e-18	112207170	112218341	1.09599973181102e-14	112259939	112275932
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	112266957	133426938	9740	9471	0.0123	1.09599973181102e-14	112259939	112275932	1.17133834256969e-07	133411367	133432281
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133426996	133453811	12	12	-0.5408	1.17133834256969e-07	133411367	133432281	6.9613705773919e-08	133447868	133459759
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133455682	141410894	3699	3611	0.0247	6.9613705773919e-08	133447868	133459759	1.32004377789354e-13	141408013	141414719
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	12	0.7582	1.32004377789354e-13	141408013	141414719	2.03885096312972e-10	141432778	141443577
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	141690753	117	113	0.0634	2.03885096312972e-10	141432778	141443577	3.31885479423700e-302	141690753	141690753
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	-4.2927	3.318854794237e-302	141690753	141690753	0	141714168	141714168
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	141720303	1	0	NA	0	141714168	141714168	NA	NA	NA
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720324	158821263	6751	6561	0.0116	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	117	0.019	NA	NA	NA	3.52134253698575e-12	581533	581533
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	1.8051	3.52134253698575e-12	581533	581533	2.90744536431026e-13	588865	588865
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	7156900	2271	2217	0.0247	2.90744536431026e-13	588865	588865	2.63748250545946e-22	6926661	7226901
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7226901	8139999	11	11	-0.9585	2.63748250545946e-22	6926661	7226901	6.9222502383276e-22	8137794	8143301
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8143301	25022606	5726	5588	0.0116	6.9222502383276e-22	8137794	8143301	1.08639436073933e-15	25022606	25022606
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	1.5891	1.08639436073933e-15	25022606	25022606	2.30316765910873e-16	25039370	25039370
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	39350798	4942	4806	0.0036	2.30316765910873e-16	25039370	25039370	0	39350798	39350798
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	58	-4.7666	0	39350798	39350798	0	39505256	39505256
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	146264846	31433	30626	0.027	0	39505256	39505256	NA	NA	NA
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5319	0.0478	NA	NA	NA	8.21321029280977e-09	15802255	15802255
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	1.4431	8.21321029280977e-09	15802255	15802255	1.24149786825115e-08	15807123	15813356
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	23343915	2540	2476	0.0566	1.24149786825115e-08	15807123	15813356	1.23547611089114e-164	23343915	23343915
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	-4.7433	1.23547611089114e-164	23343915	23343915	3.13552669826179e-160	23365926	23365926
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	39146895	4728	4609	0.0486	3.13552669826179e-160	23365926	23365926	4.04382928770566e-09	39062211	43626920
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43445839	67903104	12	11	-0.5684	4.04382928770566e-09	39062211	43626920	1.80021145785709e-07	45359327	67913672
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	67907649	70926188	329	319	-0.0202	1.80021145785709e-07	45359327	67913672	1.50439510060834e-16	70926188	70926188
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.8365	1.50439510060834e-16	70926188	70926188	1.8772429877625e-13	70930528	70930528
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	140145683	24870	24254	-0.0047	1.8772429877625e-13	70930528	70930528	NA	NA	NA
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9479	0.0126	NA	NA	NA	4.21299131432743e-94	27038538	27038538
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-4.6192	4.21299131432743e-94	27038538	27038538	3.44628766280801e-93	27041812	27041812
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	53683740	6571	6403	0.003	3.44628766280801e-93	27041812	27041812	4.82525165462549e-131	53683740	53683740
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53686515	53687880	2	2	-5.4721	4.82525165462549e-131	53683740	53683740	4.21269042891643e-133	53687880	53687880
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53689554	77917893	8288	8072	-0.0186	4.21269042891643e-133	53687880	53687880	9.01708409177438e-88	77917893	77917893
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-4.453	9.01708409177438e-88	77917893	77917893	5.92436684257787e-77	77928669	77928669
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	79228853	512	500	0.027	5.92436684257787e-77	77928669	77928669	6.2747119885401e-05	79221843	79230922
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	79230922	79239495	5	5	0.7691	6.2747119885401e-05	79221843	79230922	1.56285874587408e-05	79239495	79250271
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	79242556	135284109	19696	19229	-0.0106	1.56285874587408e-05	79239495	79250271	NA	NA	NA
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	135285645	135285645	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	81530809	26899	26233	5e-04	NA	NA	NA	1.71004692848348e-160	81530809	81530809
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81536990	81540765	3	3	-5.038	1.71004692848348e-160	81530809	81530809	1.45103796574164e-172	81540765	81540765
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81544262	134450318	18402	17972	0.0027	1.45103796574164e-172	81540765	81540765	NA	NA	NA
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	2109441	920	908	0.0521	NA	NA	NA	8.60276162520939e-08	2105615	2109441
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2115933	2127537	7	7	-0.7094	8.60276162520939e-08	2105615	2109441	1.11330355568448e-07	2127537	2130138
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2128807	9523923	2815	2729	0.0508	1.11330355568448e-07	2127537	2130138	3.25986231296045e-172	9523923	9523923
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9554149	5	5	-4.1013	3.25986231296045e-172	9523923	9523923	8.30331283812449e-17	9550789	9554149
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	9555181	1	0	NA	8.30331283812449e-17	9550789	9554149	NA	NA	NA
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9563866	9610054	10	10	-1.074	NA	NA	NA	1.22094917022220e-29	9610054	9626623
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	10464018	327	318	-0.0428	1.2209491702222e-29	9610054	9626623	1.53633658824134e-05	10449680	10470425
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10465787	10485848	9	9	-0.5169	1.53633658824134e-05	10449680	10470425	8.74574537628823e-06	10482217	10540088
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10491341	11109483	232	226	-8e-04	8.74574537628823e-06	10482217	10540088	0.00150659528910481	11096366	11109483
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11110735	11116883	3	3	-0.6977	0.00150659528910481	11096366	11109483	0.000320037018877264	11116883	11125311
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11130871	6	6	-3.6308	0.000320037018877264	11116883	11125311	5.32693681515634e-182	11130871	11130871
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	31084265	6817	6634	0.0152	5.32693681515634e-182	11130871	11130871	2.56103294475436e-18	31062689	31173065
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31098259	31298659	46	46	-0.4081	2.56103294475436e-18	31062689	31173065	3.77821274980757e-16	31287684	31310779
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31299898	132289090	33963	33115	0.0049	3.77821274980757e-16	31287684	31310779	NA	NA	NA
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	56657371	14026	13690	0.0032	NA	NA	NA	2.08442609078802e-08	56606183	56660235
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56658479	56681665	13	13	0.5619	2.08442609078802e-08	56606183	56660235	5.31390351706479e-10	56680346	56691355
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56685341	63083245	1455	1403	-0.0029	5.31390351706479e-10	56680346	56691355	2.87563636013936e-16	63062496	63101199
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	63087645	63208221	22	21	0.5624	2.87563636013936e-16	63062496	63101199	1.72701061591929e-15	63187934	63242326
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	63209551	71375082	2147	2081	0.0149	1.72701061591929e-15	63187934	63242326	1.04635011271186e-144	71375082	71375082
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-5.2879	1.04635011271186e-144	71375082	71375082	1.18076466900988e-128	71377671	71377671
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	114123340	13979	13610	0.0111	1.18076466900988e-128	71377671	71377671	NA	NA	NA
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18864561	8	8	-0.1185	NA	NA	NA	9.97057797513392e-07	18544772	19273289
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19271102	19494416	52	50	0.4864	9.97057797513392e-07	18544772	19273289	1.55513977390211e-28	19489920	19542388
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	72595934	19124	18621	-0.0097	1.55513977390211e-28	19489920	19542388	2.82188137408201e-21	72594326	72595934
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	72597009	72600731	3	3	-1.0936	2.82188137408201e-21	72594326	72595934	6.77361046432464e-06	72600731	72602517
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	72602517	73061942	232	224	-0.062	6.77361046432464e-06	72600731	72602517	7.98538713373828e-24	73061942	73061942
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73092112	8	7	-1.4238	7.98538713373828e-24	73061942	73061942	5.94616347196293e-30	73092112	73092112
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	98804534	9288	9034	0.0081	5.94616347196293e-30	73092112	73092112	4.21811437211896e-07	98802173	98808915
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	98806332	98813502	6	6	0.789	4.21811437211896e-07	98802173	98808915	4.73575212401177e-06	98810142	98819356
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	98814660	105595302	2920	2851	-0.0146	4.73575212401177e-06	98810142	98819356	1.7161922029761e-234	105595302	105595302
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105597555	105597555	1	0	NA	1.7161922029761e-234	105595302	105595302	NA	NA	NA
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	-3.4554	NA	NA	NA	6.34479855808888e-177	105632168	105632168
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	106358491	231	228	-0.0309	6.34479855808888e-177	105632168	105632168	NA	NA	NA
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.1872	NA	NA	NA	1.23624529518338e-05	18452491	18749895
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	20088256	151	149	-0.6868	1.23624529518338e-05	18452491	18749895	8.66428720265783e-143	20053008	20310916
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	100298352	31166	30361	-0.0188	8.66428720265783e-143	20053008	20310916	NA	NA	NA
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	75093957	20523	20003	-0.01	NA	NA	NA	1.82216767101015e-25	75093957	75093957
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	-2.5413	1.82216767101015e-25	75093957	75093957	1.00367983255983e-23	75100865	75100865
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	5000	-0.0095	1.00367983255983e-23	75100865	75100865	NA	NA	NA
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1906319	855	831	-0.0226	NA	NA	NA	2.20917255994965e-12	1906319	1906319
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906352	1906391	2	2	1.9201	2.20917255994965e-12	1906319	1906319	6.44759930575364e-15	1906391	1906391
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	31457889	11180	10874	-0.0272	6.44759930575364e-15	1906391	1906391	1.76161145294952e-09	31439551	31468896
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31503774	19	18	-0.5523	1.76161145294952e-09	31439551	31468896	1.89467400811469e-09	31489333	31895551
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	36673853	1815	1758	-0.0275	1.89467400811469e-09	31489333	31895551	6.00601402603439e-40	36673853	36673853
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	5	-2.0315	6.00601402603439e-40	36673853	36673853	3.86039368725524e-40	36684619	36684619
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	78653545	15757	15349	0	3.86039368725524e-40	36684619	36684619	NA	NA	NA
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22375	0.0033	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	479	-0.0176	NA	NA	NA	1.22783230048612e-15	1398325	1398325
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	2.2295	1.22783230048612e-15	1398325	1398325	1.16974842850482e-16	1400840	1400840
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	4224784	1334	1303	-0.0703	1.16974842850482e-16	1400840	1400840	6.52162482108037e-95	4216124	4235935
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	4228250	4682757	217	213	0.5002	6.52162482108037e-95	4216124	4235935	3.69619772759130e-99	4674113	4692975
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	4684423	63788698	21014	20457	-0.0115	3.6961977275913e-99	4674113	4692975	NA	NA	NA
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	575	-0.0312	NA	NA	NA	6.21301522009032e-53	1506379	1506379
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	1.6515	6.21301522009032e-53	1506379	1506379	1.44082813923587e-54	1532433	1532433
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	20460	-0.0027	1.44082813923587e-54	1532433	1532433	NA	NA	NA
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13102	-0.0164	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	15448186	3	3	-0.4827	NA	NA	NA	4.73257694138272e-05	15448186	15459877
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	15457366	15676496	47	47	0.354	4.73257694138272e-05	15448186	15459877	2.47706581997643e-11	15662614	15695679
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	15678530	15678530	1	0	NA	2.47706581997643e-11	15662614	15695679	NA	NA	NA
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	15679933	22667608	2932	2858	-0.0267	NA	NA	NA	6.25658501656248e-21	22642519	22682428
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22720195	20	20	0.758	6.25658501656248e-21	22642519	22682428	2.90657340009181e-21	22713972	22735036
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22721042	45982956	12006	11695	-0.0097	2.90657340009181e-21	22713972	22735036	6.05717424405281e-09	45982956	45982956
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	45985025	45986561	2	2	-1.6196	6.05717424405281e-09	45982956	45982956	1.69461424928943e-08	45986561	45988943
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	45988943	49571068	1546	1511	-0.0057	1.69461424928943e-08	45986561	45988943	NA	NA	NA
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	266212	127	122	-0.1438	NA	NA	NA	1.22398889762616e-08	264886	266212
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	267060	267079	2	2	1.7352	1.22398889762616e-08	264886	266212	2.50096795418662e-12	267079	267079
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	268402	1528282	725	707	-0.1018	2.50096795418662e-12	267079	267079	3.10999206970306e-08	1528179	1528282
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1529356	1530474	4	4	-1.1688	3.10999206970306e-08	1528179	1528282	5.19254168744033e-07	1530474	1533546
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1533361	2426938	682	667	-0.1262	5.19254168744033e-07	1530474	1533546	2.37333748431159e-08	2426938	2426938
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2428167	2428307	2	2	1.4804	2.37333748431159e-08	2426938	2426938	1.49199859967489e-14	2428307	2428307
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2430156	2510846	70	68	-0.0919	1.49199859967489e-14	2428307	2428307	4.02008747486728e-14	2510846	2510846
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2512844	2512881	2	2	1.4318	4.02008747486728e-14	2510846	2510846	7.52706547108962e-09	2512881	2512881
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2514651	2708291	179	173	-0.1421	7.52706547108962e-09	2512881	2512881	0	2708113	2711273
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	152655026	44461	43320	0.91	0	2708113	2711273	2.70906975009178e-09	152655026	152655026
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152656332	152657445	2	2	-0.659	2.70906975009178e-09	152655026	152655026	4.05400358001079e-06	152657445	152669192
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152669192	153320618	250	242	0.8437	4.05400358001079e-06	152657445	152669192	2.25095475877535e-05	153308468	153328351
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153322116	153322116	1	0	NA	2.25095475877535e-05	153308468	153328351	NA	NA	NA
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153323915	153344718	11	11	0.2274	NA	NA	NA	3.80975015967077e-08	153340901	153352463
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153348763	154582414	409	399	0.8915	3.80975015967077e-08	153340901	153352463	5.88516455687318e-252	154578922	154586690
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	196	-0.1143	5.88516455687318e-252	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	121	-4.512	NA	NA	NA	2.96998838717164e-35	3223585	3772482
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-1.0208	2.96998838717164e-35	3223585	3772482	4.90587226046769e-18	5422507	6652845
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6955902	120	117	-4.0845	4.90587226046769e-18	5422507	6652845	0.000806105595881958	6902863	7138628
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6956705	7782532	276	271	-3.4123	0.000806105595881958	6902863	7138628	0.0604148268229754	7614417	7833760
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7905286	37	36	-4.0926	0.0604148268229754	7614417	7833760	1.71204370200721e-06	7895945	7905286
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7905553	7914104	3	3	-0.8273	1.71204370200721e-06	7895945	7905286	1.66950522222019e-06	7914104	7926989
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	10513747	389	375	-4.08	1.66950522222019e-06	7914104	7926989	6.80320821959364e-32	10512616	10513747
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	13	-0.6574	6.80320821959364e-32	10512616	10513747	3.80260275383155e-05	10631941	12511461
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12682301	72	69	-2.6465	3.80260275383155e-05	10631941	12511461	0.00291365442856436	12593244	12710000
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	22	-3.9048	0.00291365442856436	12593244	12710000	9.99803213584834e-05	12804329	12882767
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	13129843	113	110	-2.5432	9.99803213584834e-05	12804329	12882767	3.15026032491166e-61	13112411	13138841
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	14342834	408	393	-4.3929	3.15026032491166e-61	13112411	13138841	8.38075831162855e-11	14312365	14381372
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14508021	96	92	-3.5798	8.38075831162855e-11	14312365	14381372	2.20942687146956e-08	14498784	14530134
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14579298	26	25	-1.9332	2.20942687146956e-08	14498784	14530134	1.40737327856078e-15	14566592	14596156
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15915466	417	411	-4.0354	1.40737327856078e-15	14566592	14596156	7.955014327378e-05	15617621	16042014
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16217583	127	122	-3.4196	7.955014327378e-05	15617621	16042014	1.18867720090672e-15	16173830	16300643
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16218742	22139807	973	943	-4.2716	1.18867720090672e-15	16173830	16300643	4.70609706489159e-08	22052726	22139807
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	8	-1.9505	4.70609706489159e-08	22052726	22139807	3.7640034464927e-15	22177335	22178964
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	25737663	95	94	-4.4208	3.7640034464927e-15	22177335	22178964	3.70539618603658e-66	23283689	26871442
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	27019256	48	47	-1.6	3.70539618603658e-66	23283689	26871442	4.30809241423628e-06	27007874	27019256
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27039222	4	4	-4.4593	4.30809241423628e-06	27007874	27019256	4.06598830258843e-53	27039222	27039222
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	27137064	16	16	-0.8847	4.06598830258843e-53	27039222	27039222	2.57662898709462e-21	27137064	27137064
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27163598	27171797	3	3	-3.3422	2.57662898709462e-21	27137064	27137064	9.02968661389833e-16	27171797	27171797
MSK_252152919079_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27172283	57440809	13	13	-0.5449	9.02968661389833e-16	27171797	27171797	NA	NA	NA
