Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72537426	27894	26781	-8e-04	NA	NA	NA	2.54709540560849e-97	72537426	72537426
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	1.556	2.54709540560849e-97	72537426	72537426	2.61650673540816e-107	72579311	72579311
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	109373255	11406	10948	0.0077	2.61650673540816e-107	72579311	72579311	9.20361024093403e-157	109373255	109373255
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109374790	109376249	2	2	-4.9347	9.20361024093403e-157	109373255	109373255	3.70962328770207e-158	109376249	109376249
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109379566	109987341	280	267	-0.0065	3.70962328770207e-158	109376249	109376249	6.28894675457238e-08	109984914	109987341
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109988743	109994195	3	3	0.9066	6.28894675457238e-08	109984914	109987341	7.25554416716774e-07	109994195	109997318
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109997318	150819879	5865	5608	-0.003	7.25554416716774e-07	109994195	109997318	9.11665583165479e-09	150811736	150819879
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	10	0.555	9.11665583165479e-09	150811736	150819879	7.22143592371384e-08	150851439	150859867
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2636	0.0102	7.22143592371384e-08	150851439	150859867	4.49699889391906e-42	157133150	157133150
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	2.752	4.49699889391906e-42	157133150	157133150	4.54479087957867e-46	157136342	157136342
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167497116	4111	3956	-0.0052	4.54479087957867e-46	157136342	157136342	6.51969412002469e-07	167495719	167497116
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167498254	167506259	3	3	-0.9075	6.51969412002469e-07	167495719	167497116	6.24657792594402e-07	167506259	167507882
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167507882	200596027	11348	10873	-5e-04	6.24657792594402e-07	167506259	167507882	7.56275827884827e-12	200584100	200612164
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200598243	200676505	30	28	-0.3811	7.56275827884827e-12	200584100	200612164	3.05842920521377e-11	200668993	200701140
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200678532	246794552	17294	16590	-0.0014	3.05842920521377e-11	200668993	200701140	7.16920488964358e-24	246753652	246811355
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246805521	246906110	34	34	-0.4943	7.16920488964358e-24	246753652	246811355	1.80522767751255e-11	246882156	246921317
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246907655	247186514	90	90	-0.0298	1.80522767751255e-11	246882156	246921317	NA	NA	NA
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	1619159	596	579	-0.0129	NA	NA	NA	1.09716484618131e-07	1617254	1619159
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	1621283	1622579	2	2	-1.1815	1.09716484618131e-07	1617254	1619159	2.19683405494384e-07	1622579	1624267
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	1624267	34542224	10923	10472	-0.005	2.19683405494384e-07	1622579	1624267	6.6429883439812e-14	34527334	34561038
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34543992	34589997	19	19	-0.5183	6.6429883439812e-14	34527334	34561038	4.58833283806522e-15	34574224	34597294
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	73785403	14386	13783	0.0035	4.58833283806522e-15	34574224	34597294	1.16311917364483e-11	73770615	73785403
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	73788398	73796888	5	5	-0.8968	1.16311917364483e-11	73770615	73785403	1.75471674874425e-11	73796888	73801164
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	73801164	242689978	51896	49718	0.0014	1.75471674874425e-11	73796888	73801164	NA	NA	NA
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	199324677	65631	62952	0.0011	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	199329592	199329592	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3238	-0.0054	NA	NA	NA	6.51299333351515e-262	9815760	9815760
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.9472	6.51299333351515e-262	9815760	9815760	5.94683412026299e-307	9842644	9842644
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	34445002	6167	5931	0.0106	5.94683412026299e-307	9842644	9842644	3.16031477801577e-08	34433787	34445002
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	0.6975	3.16031477801577e-08	34433787	34445002	1.07939673393686e-08	34491115	34509895
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	68905670	8863	8497	0.006	1.07939673393686e-08	34491115	34509895	1.83872442451312e-09	68896316	69085386
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69163312	13	13	0.495	1.83872442451312e-09	68896316	69085386	4.03459946516546e-10	69142044	69665979
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69165814	70190682	119	114	0.0098	4.03459946516546e-10	69142044	69665979	2.07090996869198e-14	70190682	70190682
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70207908	70216707	3	3	-1.1762	2.07090996869198e-14	70190682	70190682	1.26845835588185e-12	70216707	70216707
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70294312	173224400	31072	29843	0.0053	1.26845835588185e-12	70216707	70216707	1.12534750675485e-110	173224400	173224400
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-4.1391	1.12534750675485e-110	173224400	173224400	9.307669111091e-108	173228860	173228860
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	187330240	4276	4085	0.0148	9.307669111091e-108	173228860	173228860	2.59137706140017e-12	187329037	187331981
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187338465	4	4	1.031	2.59137706140017e-12	187329037	187331981	4.26370682519512e-12	187335827	187346058
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187346058	190710812	1129	1073	0.0067	4.26370682519512e-12	187335827	187346058	5.00448073384741e-13	190659468	190761029
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190717801	190917729	64	61	-0.2709	5.00448073384741e-13	190659468	190761029	3.51423564543334e-05	190891595	190979524
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190921041	191153613	46	43	0.0207	3.51423564543334e-05	190891595	190979524	NA	NA	NA
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	776194	223	219	-0.0388	NA	NA	NA	0.0001771492509262	725954	816789
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	812169	829954	5	5	-0.7396	0.0001771492509262	725954	816789	1.48175268405367e-07	816789	873365
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	21480789	6124	5865	-0.0054	1.48175268405367e-07	816789	873365	2.50543778761488e-58	21480789	21480789
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21485944	21487474	2	2	-3.1183	2.50543778761488e-58	21480789	21480789	3.53240965497938e-61	21487474	21487474
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21488938	97060205	21117	20286	0.004	3.53240965497938e-61	21487474	21487474	7.07335492668311e-11	97055188	97060205
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	97074064	97119376	7	7	-0.7226	7.07335492668311e-11	97055188	97060205	1.34123876185238e-10	97119376	97135634
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	97126918	150181399	16376	15651	-0.0011	1.34123876185238e-10	97119376	97135634	2.32999812828295e-15	150171154	150185190
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150185190	150202601	7	7	-0.8597	2.32999812828295e-15	150171154	150185190	1.50809792801618e-14	150201145	150207307
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	150204134	1	0	NA	1.50809792801618e-14	150201145	150207307	NA	NA	NA
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150207307	180342860	9784	9416	-0.0057	NA	NA	NA	2.91544226982001e-26	180194323	180342860
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	8	1.0563	2.91544226982001e-26	180194323	180342860	1.54135182308598e-18	180358977	180358977
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	104	-0.0424	1.54135182308598e-18	180358977	180358977	NA	NA	NA
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	29950805	10587	10134	0.0042	NA	NA	NA	9.74197273292092e-10	29939288	29972382
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	29992946	9	9	0.6207	9.74197273292092e-10	29939288	29972382	4.29879467310973e-08	29981912	30000990
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29995247	32558677	1081	1023	0.001	4.29879467310973e-08	29981912	30000990	2.16399092493519e-94	32558677	32563252
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32595402	7	5	-2.8383	2.16399092493519e-94	32558677	32563252	2.79461985443187e-11	32588005	32597877
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	32713363	38	38	-0.2498	2.79461985443187e-11	32588005	32597877	3.58652320897496e-11	32711957	32713363
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32721872	4	3	-3.2688	3.58652320897496e-11	32711957	32713363	9.13348125367803e-09	32721872	32723366
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32723366	32767722	19	18	-0.6925	9.13348125367803e-09	32721872	32723366	1.47108207506505e-25	32739800	32771725
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32771725	55931287	8918	8557	7e-04	1.47108207506505e-25	32739800	32771725	9.3481625454998e-17	55927729	55931287
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	55934816	55950498	5	5	-1.0642	9.3481625454998e-17	55927729	55931287	6.33635064536637e-18	55950498	55954697
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	55954697	95513554	10206	9804	0.0081	6.33635064536637e-18	55950498	55954697	9.49382430106932e-12	95499813	95520975
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	95520975	95545001	4	4	-0.9728	9.49382430106932e-12	95499813	95520975	4.49612452223885e-11	95535504	95553579
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	95553579	165643653	23431	22451	0.0041	4.49612452223885e-11	95535504	95553579	4.55706089839446e-19	165643653	165643653
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.2646	4.55706089839446e-19	165643653	165643653	7.65404198739353e-18	165650610	165650610
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1736	-0.0216	7.65404198739353e-18	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	25945672	8744	8392	0.006	NA	NA	NA	1.02260268800044e-07	25945469	25945672
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	25946290	25948315	3	3	-0.9639	1.02260268800044e-07	25945469	25945672	6.55634643170083e-08	25948315	25949466
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	25949466	36138920	3988	3823	-4e-04	6.55634643170083e-08	25948315	25949466	1.25084466695202e-59	36123955	36149826
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	36142871	36291010	65	63	0.5643	1.25084466695202e-59	36123955	36149826	2.84591576537103e-62	36283828	36294950
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	36292282	71894353	8987	8641	-0.0091	2.84591576537103e-62	36283828	36294950	3.69888278156853e-36	71894353	71894353
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71911940	71912065	2	2	-2.4622	3.69888278156853e-36	71894353	71894353	2.33349991843334e-37	71912065	71912065
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71914572	71914572	1	0	NA	2.33349991843334e-37	71912065	71912065	NA	NA	NA
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71917511	118611324	17475	16780	0.0026	NA	NA	NA	7.50366145766923e-08	118609124	118611324
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	0.9633	7.50366145766923e-08	118609124	118611324	2.81156045653500e-08	118620875	118622742
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	125829681	3169	3030	0.0027	2.811560456535e-08	118620875	118622742	3.99311108177374e-11	125827896	125829681
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125831554	125831554	1	0	NA	3.99311108177374e-11	125827896	125829681	NA	NA	NA
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	1.108	NA	NA	NA	1.15727820974747e-10	125837524	125839386
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133224516	3552	3396	-0.0025	1.15727820974747e-10	125837524	125839386	1.38894054304737e-07	133222744	133230801
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133224586	133232386	4	4	-0.8225	1.38894054304737e-07	133222744	133230801	1.35252210867610e-05	133230801	133235869
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133234522	133426938	95	93	-0.0269	1.3525221086761e-05	133230801	133235869	8.14571789977232e-05	133405371	133433384
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133426996	133448277	11	11	-0.467	8.14571789977232e-05	133405371	133433384	2.80166128108632e-07	133444486	133459759
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141410894	3700	3544	0.0094	2.80166128108632e-07	133444486	133459759	4.18914386545672e-15	141408013	141417702
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	13	0.6301	4.18914386545672e-15	141408013	141417702	4.72197120845183e-15	141432778	141442231
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	147702365	2639	2526	-5e-04	4.72197120845183e-15	141432778	141442231	8.1409845970111e-09	147699576	147702365
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147708382	3	3	-1.0138	8.1409845970111e-09	147699576	147702365	6.35417840329968e-08	147708382	147710037
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147710037	158821263	4237	4047	-0.0057	6.35417840329968e-08	147708382	147710037	NA	NA	NA
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	4365118	1649	1578	-0.0124	NA	NA	NA	2.43191517755873e-45	4363827	4365118
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	4367345	4401993	19	18	-0.9744	2.43191517755873e-45	4363827	4365118	9.08673549529986e-51	4401993	4404728
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	4404728	32797545	9525	9101	2e-04	9.08673549529986e-51	4401993	4404728	2.25859601157008e-59	32797545	32797545
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32800775	32800775	1	0	NA	2.25859601157008e-59	32797545	32797545	NA	NA	NA
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32805686	32808049	2	2	-3.1562	NA	NA	NA	2.58183676838754e-63	32808049	32808049
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32812909	40892587	2378	2285	-0.001	2.58183676838754e-63	32808049	32808049	9.62236827246672e-11	40892587	40892587
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	1.324	9.62236827246672e-11	40892587	40892587	3.39209544652746e-10	40897469	40897469
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	142329141	29605	28410	0.0012	3.39209544652746e-10	40897469	40897469	4.38422615353811e-08	142325349	142329141
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	142331353	142332708	2	2	-1.191	4.38422615353811e-08	142325349	142329141	1.01511273878553e-05	142332708	142336041
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	142334063	142334063	1	0	NA	1.01511273878553e-05	142332708	142336041	NA	NA	NA
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	142336041	146264846	1382	1319	-0.018	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	140145683	37944	36334	-0.0043	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9309	0.0036	NA	NA	NA	1.80715047124203e-117	27038538	27038538
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-4.4199	1.80715047124203e-117	27038538	27038538	1.82627628459458e-116	27041812	27041812
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	56115736	7300	6973	-0.0065	1.82627628459458e-116	27041812	27041812	1.53153938465248e-22	56114489	56118633
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	56118633	56138767	10	9	0.9203	1.53153938465248e-22	56114489	56118633	4.5556885763256e-23	56137463	56140996
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	56140996	77917893	7551	7242	-0.0014	4.5556885763256e-23	56137463	56140996	8.2318917632709e-136	77917893	77917893
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-4.6837	8.2318917632709e-136	77917893	77917893	1.19678947292550e-131	77928669	77928669
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	124881192	16560	15874	-0.0023	1.1967894729255e-131	77928669	77928669	1.08161572737036e-09	124881192	124881192
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124883493	124885174	2	2	1.3177	1.08161572737036e-09	124881192	124881192	4.13152052206431e-09	124885174	124885174
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124887380	135285645	3652	3510	-0.0189	4.13152052206431e-09	124885174	124885174	NA	NA	NA
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	18896166	7372	7061	6e-04	NA	NA	NA	5.17162261541149e-08	18890351	18906505
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18906505	18917191	6	6	0.7065	5.17162261541149e-08	18890351	18906505	9.43732591162897e-09	18915465	18932031
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18929375	55118214	9527	9145	-3e-04	9.43732591162897e-09	18915465	18932031	0	55118214	55118214
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	39	-4.9217	0	55118214	55118214	0	55209626	55209626
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	107284914	18285	17530	3e-04	0	55209626	55209626	1.77201208301311e-139	107284914	107284914
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107289887	107292148	2	2	-4.8061	1.77201208301311e-139	107284914	107284914	4.87308042834455e-139	107292148	107292148
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107293658	134450318	10073	9656	-0.0075	4.87308042834455e-139	107292148	107292148	NA	NA	NA
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	11116883	4329	4122	-0.0026	NA	NA	NA	2.1288046266922e-27	11116883	11116883
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	7	1.1555	2.1288046266922e-27	11116883	11116883	1.28797612193127e-25	11140421	11147675
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	11143592	1	0	NA	1.28797612193127e-25	11140421	11147675	NA	NA	NA
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11147675	12422129	465	446	0.0023	NA	NA	NA	9.27424408288605e-06	12410048	12433043
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	12423720	12448137	11	11	-0.4526	9.27424408288605e-06	12410048	12433043	1.01912250690681e-06	12433043	12469923
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	12449420	31098259	6340	6078	0.0116	1.01912250690681e-06	12433043	12469923	7.54329664279795e-14	31062689	31180019
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31132716	31298659	45	44	-0.3145	7.54329664279795e-14	31062689	31180019	1.79715313244859e-13	31282463	31313528
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31299898	46992235	4285	4112	0.0046	1.79715313244859e-13	31282463	31313528	5.1276119767761e-16	46992235	46992235
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46995053	46996769	2	2	-1.6163	5.1276119767761e-16	46992235	46992235	9.79806586425972e-16	46996769	46996769
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46998876	94705599	15704	15086	0.0047	9.79806586425972e-16	46996769	46996769	2.26997163717625e-08	94704314	94705599
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	94706960	94709021	2	2	1.213	2.26997163717625e-08	94704314	94705599	5.12070873556368e-08	94709021	94709021
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	94710849	132289090	13970	13376	-5e-04	5.12070873556368e-08	94709021	94709021	NA	NA	NA
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7060	-0.0088	NA	NA	NA	1.90230738471908e-178	37953582	37953582
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-5.4276	1.90230738471908e-178	37953582	37953582	8.07542050382041e-188	37957844	37957844
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4675	0.0028	8.07542050382041e-188	37957844	37957844	1.12682929729560e-97	49964838	49964838
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-3.9212	1.1268292972956e-97	49964838	49964838	4.75728646422682e-100	49971732	49971732
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56657371	1805	1737	0.0172	4.75728646422682e-100	49971732	49971732	3.83705229750069e-10	56610886	56658479
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56658479	56680346	12	12	0.5406	3.83705229750069e-10	56610886	56658479	5.02339559388914e-10	56679017	56686863
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56681665	75105505	4875	4687	0.0141	5.02339559388914e-10	56679017	56686863	6.25526568027402e-14	75105505	75105505
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	75107257	75108573	2	2	1.5231	6.25526568027402e-14	75105505	75105505	1.90343423976403e-13	75108573	75108573
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	75109797	114123340	12729	12189	1e-04	1.90343423976403e-13	75108573	75108573	NA	NA	NA
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	57	-0.394	NA	NA	NA	6.10075303704449e-28	19484013	19543544
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	73061942	19359	18508	0.0062	6.10075303704449e-28	19484013	19543544	8.88139803877663e-26	73060301	73071404
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73092112	8	8	1.0324	8.88139803877663e-26	73060301	73071404	3.68146584706011e-24	73092018	73106558
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	73104540	2	0	NA	3.68146584706011e-24	73092018	73106558	NA	NA	NA
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73106558	105597555	12213	11706	-0.0032	NA	NA	NA	0	105597555	105597555
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	-3.1739	0	105597555	105597555	3.60059841621416e-117	105632168	105632168
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105856972	50	47	0.0468	3.60059841621416e-117	105632168	105632168	1.44279997911819e-08	105856591	105856972
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105872360	105875924	3	3	-0.8461	1.44279997911819e-08	105856591	105856972	3.5227011045373e-06	105875924	105881677
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881677	105948347	19	18	-0.0823	3.5227011045373e-06	105875924	105881677	4.36508534378494e-12	105948347	105961558
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105951399	105989160	13	10	-0.9209	4.36508534378494e-12	105948347	105961558	1.68583146294861e-24	105985458	105989160
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105994646	106358491	146	139	0.0214	1.68583146294861e-24	105985458	105989160	NA	NA	NA
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18450562	4	4	0.0585	NA	NA	NA	4.78886262409428e-05	18450562	18857376
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18452491	20088256	152	149	-0.4594	4.78886262409428e-05	18450562	18857376	1.09453271094329e-92	20042683	20321772
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	85614382	25592	24555	-0.0041	1.09453271094329e-92	20042683	20321772	3.16214896357096e-19	85600911	85614382
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	85634537	85671158	8	8	-0.9119	3.16214896357096e-19	85600911	85614382	3.62799043663240e-19	85671158	85678387
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	85678387	100298352	5566	5336	-0.0061	3.6279904366324e-19	85671158	85678387	NA	NA	NA
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	75093957	20523	19676	-0.0013	NA	NA	NA	1.00013184755725e-40	75093957	75093957
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	2.176	1.00013184755725e-40	75093957	75093957	2.29362400814523e-40	75100865	75100865
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	579	-0.0107	2.29362400814523e-40	75100865	75100865	8.04530433966626e-18	76923844	76929598
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	0.8845	8.04530433966626e-18	76923844	76929598	5.47963712344093e-18	76938723	76942679
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	80324295	1189	1142	0.0091	5.47963712344093e-18	76938723	76942679	1.76908913065782e-08	80322011	80324295
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	80329456	80333364	2	2	1.2251	1.76908913065782e-08	80322011	80324295	1.12383558831316e-07	80333364	80336768
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	80336768	88690571	3322	3197	-0.0151	1.12383558831316e-07	80333364	80336768	NA	NA	NA
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1903358	853	813	0.0168	NA	NA	NA	1.23366995075463e-09	1902148	1903358
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1904451	1904451	1	0	NA	1.23366995075463e-09	1902148	1903358	NA	NA	NA
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906319	1906391	3	3	1.1693	NA	NA	NA	3.13819129730574e-11	1906391	1909371
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	31457889	11180	10719	5e-04	3.13819129730574e-11	1906391	1909371	1.70817672622685e-17	31447686	31461588
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31503774	19	19	-0.5728	1.70817672622685e-17	31447686	31461588	8.99566028694943e-18	31499568	31893451
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	36673853	1815	1738	-7e-04	8.99566028694943e-18	31499568	31893451	6.46348442916035e-27	36673853	36675987
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	5	-1.3741	6.46348442916035e-27	36673853	36675987	3.51119956391339e-26	36682031	36684619
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	78653545	15757	15114	-0.001	3.51119956391339e-26	36682031	36684619	NA	NA	NA
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22055	-0.0012	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	210395	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	216768	19694025	9026	8658	0.0076	NA	NA	NA	3.07840695793229e-90	19694025	19694025
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19699024	19699485	2	2	-4.1936	3.07840695793229e-90	19694025	19694025	1.75723743698236e-95	19699485	19699485
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19700620	19700620	1	0	NA	1.75723743698236e-95	19699485	19699485	NA	NA	NA
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19702214	63788698	14029	13462	6e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	567	-0.0282	NA	NA	NA	4.79511787784525e-14	1499034	1511632
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	0.7191	4.79511787784525e-14	1499034	1511632	3.2366076185008e-15	1531162	1544485
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	45501092	14894	14319	-0.0083	3.2366076185008e-15	1531162	1544485	5.00158410617709e-12	45491855	45513712
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	45513712	45529573	8	8	0.7194	5.00158410617709e-12	45491855	45513712	2.66750369118447e-11	45527863	45535814
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	45531242	62419534	6081	5841	-0.0063	2.66750369118447e-11	45527863	45535814	NA	NA	NA
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	43645627	11898	11430	6e-04	NA	NA	NA	6.29410279480924e-11	43641648	43649217
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	43648176	43660918	8	8	0.6871	6.29410279480924e-11	43641648	43649217	6.39749342748974e-10	43656748	43663166
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	43661998	46922972	1535	1475	-0.0084	6.39749342748974e-10	43656748	43663166	NA	NA	NA
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22667608	2983	2837	-0.0165	NA	NA	NA	7.34307908371244e-29	22643742	22679305
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	21	0.7165	7.34307908371244e-29	22643742	22679305	2.30121929324758e-29	22715919	22736990
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	49571068	13552	12983	-0.0051	2.30121929324758e-29	22715919	22736990	NA	NA	NA
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.1146	NA	NA	NA	1.02662961862491e-12	94062	94062
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	95819	1	0	NA	1.02662961862491e-12	94062	94062	NA	NA	NA
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	98390	104732	6	6	-1.6452	NA	NA	NA	4.72708627341563e-40	104732	104732
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	2708291	1780	1706	-0.045	4.72708627341563e-40	104732	104732	0	2708113	2711273
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	8413301	1776	1707	0.9321	0	2708113	2711273	2.26181580365797e-09	8377593	8447855
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8417817	8473482	23	22	0.5596	2.26181580365797e-09	8377593	8447855	1.71038488856091e-20	8446489	8486398
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8475091	154442377	43303	41596	0.9645	1.71038488856091e-20	8446489	8486398	5.4968627787241e-102	154442377	154442377
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	3	-2.7724	5.4968627787241e-102	154442377	154442377	1.85598734991823e-55	154450309	154450309
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	27	0.9066	1.85598734991823e-55	154450309	154450309	2.00986134429029e-62	154582414	154586690
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	191	-0.0051	2.00986134429029e-62	154582414	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4174561	129	122	-4.3533	NA	NA	NA	3.40090328085969e-21	3780462	4413507
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	5593746	11	11	-1.3824	3.40090328085969e-21	3780462	4413507	1.68210201342192e-07	5422507	6715636
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6992372	135	128	-3.7006	1.68210201342192e-07	5422507	6715636	9.88231807685774e-06	6935203	7050720
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6993680	7653082	199	192	-2.9322	9.88231807685774e-06	6935203	7050720	2.91636978422982e-06	7612732	7666216
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7722458	43	43	-4.1655	2.91636978422982e-06	7612732	7666216	7.19414845438453e-09	7712882	7731490
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7723783	7782532	19	18	-2.1703	7.19414845438453e-09	7712882	7731490	2.60904005627780e-06	7756907	7798534
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7852359	26	26	-3.7802	2.6090400562778e-06	7756907	7798534	0.000111719394084194	7835361	7866716
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7853950	7914104	14	14	-2.3739	0.000111719394084194	7835361	7866716	1.43764663814125e-08	7897073	7930528
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	8277707	83	78	-4.0567	1.43764663814125e-08	7897073	7930528	4.98180056267437e-09	8245608	8277707
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8280065	8313045	12	11	-2.231	4.98180056267437e-09	8245608	8277707	0.000910781597938187	8304781	8363122
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8316416	8687580	101	97	-3.4718	0.000910781597938187	8304781	8363122	0.0357027477775482	8540974	8938284
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8689019	10513747	193	175	-3.8881	0.0357027477775482	8540974	8938284	3.00085676771933e-25	10512616	10535786
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	11673476	18	17	-0.9931	3.00085676771933e-25	10512616	10535786	3.64487467268688e-08	11249952	12452734
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	12527445	7	7	-4.3795	3.64487467268688e-08	11249952	12452734	0.0694319235581452	12452734	12530596
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12530596	12541506	6	6	-3.8799	0.0694319235581452	12452734	12530596	0.154948185777094	12541506	12649357
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	13104920	180	173	-2.512	0.154948185777094	12541506	12649357	0.0489864848541873	12999095	13109337
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13106723	13106723	1	0	NA	0.0489864848541873	12999095	13109337	NA	NA	NA
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13109337	13128515	8	8	-1.1397	NA	NA	NA	1.52974509001219e-13	13128515	13133803
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13823928	247	239	-3.9873	1.52974509001219e-13	13128515	13133803	6.40690109457677e-05	13782396	13828384
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13828384	13863657	8	8	-2.2469	6.40690109457677e-05	13782396	13828384	8.42152496895974e-10	13863657	13868296
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13866668	14122129	123	116	-4.429	8.42152496895974e-10	13863657	13868296	4.7293582326567e-06	14112932	14210847
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14318786	17	15	-3.106	4.7293582326567e-06	14112932	14210847	0.00101784688136518	14214157	14325320
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14320016	14342834	14	13	-4.4026	0.00101784688136518	14214157	14325320	0.000190011521573030	14338189	14370346
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14480242	75	71	-3.0287	0.00019001152157303	14338189	14370346	0.00032671233546761	14456240	14484920
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14481337	14508021	21	20	-4.1152	0.00032671233546761	14456240	14484920	2.30726973996532e-11	14506319	14530134
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	2.30726973996532e-11	14506319	14530134	NA	NA	NA
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	24	-1.8038	NA	NA	NA	2.12705647629759e-14	14563486	14597771
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15523178	328	310	-3.8103	2.12705647629759e-14	14563486	14597771	1.36693945236524e-05	15497443	15527805
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15546378	13	12	-2.0758	1.36693945236524e-05	15497443	15527805	0.00103139635992747	15540379	15566377
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15547576	15687088	39	39	-3.5208	0.00103139635992747	15540379	15566377	0.00496583268089088	15590299	15690301
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15690301	15761232	12	11	-4.9468	0.00496583268089088	15590299	15690301	0.00211160470561026	15727116	15798021
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15765251	15838612	14	14	-3.9701	0.00211160470561026	15727116	15798021	1.68570276651999e-05	15810752	15854496
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15843146	15915466	11	10	-5.1992	1.68570276651999e-05	15810752	15854496	3.42563866794209e-08	15915466	15937162
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16175250	102	96	-2.9407	3.42563866794209e-08	15915466	15937162	1.45504631617344e-15	16156464	16194420
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16176562	21036411	730	696	-3.9758	1.45504631617344e-15	16156464	16194420	9.71581507844592e-06	21025500	21041164
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21036503	21054519	7	7	-1.7551	9.71581507844592e-06	21025500	21041164	2.30349385061003e-07	21047798	21059229
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	22139807	261	252	-3.8679	2.30349385061003e-07	21047798	21059229	1.73437272912511e-05	22049641	22139807
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	8	-2.1729	1.73437272912511e-05	22049641	22139807	2.15893446976349e-07	22177335	22181855
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	25737663	95	92	-4.1492	2.15893446976349e-07	22177335	22181855	2.82418265590144e-52	23283689	26870361
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26945084	30	28	-1.1728	2.82418265590144e-52	23283689	26870361	5.98223720112846e-15	26943701	26950080
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26945893	26945893	1	0	NA	5.98223720112846e-15	26943701	26950080	NA	NA	NA
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	26990807	8	7	-3.6548	NA	NA	NA	2.60110525018918e-06	26980386	26998633
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26995399	27019256	9	8	-1.5574	2.60110525018918e-06	26980386	26998633	4.30369401135257e-08	27009433	27019256
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27039222	4	4	-3.8473	4.30369401135257e-08	27009433	27019256	3.85736022860422e-25	27039222	27039222
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	27137064	16	15	-0.7315	3.85736022860422e-25	27039222	27039222	1.39647275062007e-18	27137064	27137064
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27163598	27171797	3	3	-3.9963	1.39647275062007e-18	27137064	27137064	2.90686019349574e-13	27171797	27172283
MSK_252152919080_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27172283	57440809	13	13	-0.5815	2.90686019349574e-13	27171797	27172283	NA	NA	NA
