Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	54860193	21023	20606	0.0101	NA	NA	NA	6.59346731278036e-09	54857788	54860193
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	54862228	54866506	3	3	-1.0358	6.59346731278036e-09	54857788	54860193	1.04423855097374e-09	54866506	54866506
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	54876067	72537426	6868	6723	8e-04	1.04423855097374e-09	54866506	54866506	0	72537426	72537426
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	-3.6695	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	108533257	11128	10930	9e-04	0	72579311	72579311	1.22266495545428e-99	108533257	108533257
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108535814	108538662	3	3	-3.1566	1.22266495545428e-99	108533257	108533257	2.64989790384741e-92	108538662	108538662
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108541074	109987341	557	550	0.0056	2.64989790384741e-92	108538662	108538662	3.62335402571236e-11	109987341	109987341
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109988743	109989998	2	2	-1.3205	3.62335402571236e-11	109987341	109987341	5.41960248524991e-11	109989998	109989998
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109994195	150819879	5866	5752	0.0013	5.41960248524991e-11	109989998	109989998	1.26510083345816e-85	150819879	150819879
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	11	1.5376	1.26510083345816e-85	150819879	150819879	1.88263907719821e-77	150851439	150851439
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2715	0.0106	1.88263907719821e-77	150851439	150851439	1.67640374337890e-17	157133150	157133150
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-1.709	1.6764037433789e-17	157133150	157133150	2.34172691426569e-19	157136342	157136342
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	194978218	13296	13049	-6e-04	2.34172691426569e-19	157136342	157136342	2.69216663726636e-24	194977713	195011344
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195065867	9	9	-0.9001	2.69216663726636e-24	194977713	195011344	4.83351093625693e-23	195048208	195091758
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	246769018	19480	19105	-0.0013	4.83351093625693e-23	195048208	195091758	1.20722059399704e-37	246755225	246806669
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246794552	246902260	33	33	-0.5974	1.20722059399704e-37	246755225	246806669	1.30446317135740e-23	246875016	246906110
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246902470	247186514	92	91	-0.0113	1.3044631713574e-23	246875016	246906110	NA	NA	NA
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	11315	-6e-04	NA	NA	NA	7.34771488854339e-08	34539740	34543992
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34558824	5	5	0.727	7.34771488854339e-08	34539740	34543992	0.000327135929001281	34554208	34558824
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34561038	34580533	10	10	0.3598	0.000327135929001281	34554208	34558824	0.00146343281612348	34580533	34605203
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34582272	146571330	33537	32889	-3e-04	0.00146343281612348	34580533	34605203	0	146571330	146571330
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-4.9577	0	146571330	146571330	0	146592775	146592775
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	242689978	32749	32094	2e-04	0	146592775	146592775	NA	NA	NA
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	11383299	4087	4015	0.0136	NA	NA	NA	4.14226038956487e-13	11383299	11383299
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	11386892	11389624	3	3	-1.1544	4.14226038956487e-13	11383299	11383299	8.0005905781616e-12	11389624	11392863
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	11392863	17464363	2376	2330	0.0028	8.0005905781616e-12	11389624	11392863	2.01051894393842e-09	17462705	17464363
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	17474742	17477587	3	3	-1.0355	2.01051894393842e-09	17462705	17464363	1.18790611503566e-10	17477587	17477587
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	17479703	25913087	2576	2535	-0.0011	1.18790611503566e-10	17477587	17477587	5.80905664360505e-41	25901612	25913087
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	25918611	26035686	15	14	-0.9245	5.80905664360505e-41	25901612	25913087	1.19099503532170e-42	26035686	26035686
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	26045918	32074432	1736	1705	-0.0039	1.1909950353217e-42	26035686	26035686	1.26399741788000e-15	32074432	32074432
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.4839	1.26399741788e-15	32074432	32074432	8.4501369427119e-15	32080848	32080848
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	37953375	1883	1857	-0.0045	8.4501369427119e-15	32080848	32080848	3.41212275472281e-15	37951628	37953375
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37954819	37961110	6	6	-0.874	3.41212275472281e-15	37951628	37953375	2.49684217929493e-14	37961110	37963014
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37963014	164005577	40804	40002	5e-04	2.49684217929493e-14	37961110	37963014	9.01398215345773e-67	164005577	164005577
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164012645	2	2	-3.1791	9.01398215345773e-67	164005577	164005577	1.22681711703449e-10	164012645	164012645
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164019640	164027724	3	3	-1.128	1.22681711703449e-10	164012645	164012645	7.40739131367408e-13	164027724	164027724
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	173912477	3103	3034	-0.0024	7.40739131367408e-13	164027724	164027724	1.20062988649043e-07	173912477	173912477
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	173913719	173915484	2	2	-1.0795	1.20062988649043e-07	173912477	173912477	3.98624566155375e-07	173915484	173915484
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	173916688	192546280	6463	6346	0.0053	3.98624566155375e-07	173915484	173915484	6.93519793745716e-294	192546280	192546280
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192548135	192550989	3	3	-5.4431	6.93519793745716e-294	192546280	192546280	3.32300585492163e-266	192550989	192550989
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192552734	199329592	2565	2514	-0.0139	3.32300585492163e-266	192550989	192550989	NA	NA	NA
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	64376590	17351	16996	0.0011	NA	NA	NA	3.122948131745e-198	64376590	64376590
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64381871	64390333	2	2	-5.4228	3.122948131745e-198	64376590	64376590	4.07252179122829e-223	64390333	64390333
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64398986	68905670	1080	1058	-0.0049	4.07252179122829e-223	64390333	64390333	1.77700041620499e-14	68899247	69085386
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	0.5314	1.77700041620499e-14	68899247	69085386	5.82101674865769e-13	69144974	69665979
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	173224400	31193	30585	-7e-04	5.82101674865769e-13	69144974	69665979	3.07896003516831e-22	173224400	173224400
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	1.8143	3.07896003516831e-22	173224400	173224400	1.14918806052907e-22	173228860	173228860
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	186676034	3968	3877	0.0063	1.14918806052907e-22	173228860	173228860	1.52103760269931e-28	186676034	186676034
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	-2.0165	1.52103760269931e-28	186676034	186676034	1.79511008189303e-30	186680176	186680176
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	187330240	306	303	0.0038	1.79511008189303e-30	186680176	186680176	9.0504703244351e-21	187330240	187330240
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	1.6673	9.0504703244351e-21	187330240	187330240	1.07329609067973e-18	187333619	187333619
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1213	0	1.07329609067973e-18	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	70984673	19147	18796	-0.0048	NA	NA	NA	1.09733022442432e-08	70978984	70984673
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	70987190	70987190	1	0	NA	1.09733022442432e-08	70978984	70984673	NA	NA	NA
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	70988408	70996742	6	6	0.6771	NA	NA	NA	1.11900828872831e-08	70996742	71000921
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	70998031	76116640	1744	1708	-0.0104	1.11900828872831e-08	70996742	71000921	2.91095195771401e-22	76108175	76122105
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	76120297	76165430	21	21	0.5715	2.91095195771401e-22	76108175	76122105	3.01517548577748e-22	76162585	76170329
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	76168011	180342860	32727	32112	0.0014	3.01517548577748e-22	76162585	76170329	2.43425532285533e-25	180194323	180342860
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	8	0.9844	2.43425532285533e-25	180194323	180342860	9.40927398659827e-22	180358977	180362342
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	108	-0.0476	9.40927398659827e-22	180358977	180362342	NA	NA	NA
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	29950805	10587	10382	0.0044	NA	NA	NA	7.9785456319583e-13	29935438	29962849
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30010234	15	15	0.5281	7.9785456319583e-13	29935438	29962849	1.20856428002436e-10	30005338	30030032
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30021908	31385778	580	566	0.0057	1.20856428002436e-10	30005338	30030032	1.12087370314787e-22	31385778	31385778
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31418006	6	6	-1.1893	1.12087370314787e-22	31385778	31385778	8.48797667340122e-25	31418006	31418006
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	32558677	489	478	0.0274	8.48797667340122e-25	31418006	31418006	1.11299820843260e-191	32558677	32558677
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32595402	7	7	-3.3647	1.1129982084326e-191	32558677	32558677	5.02679947541018e-10	32593151	32600962
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	32709263	36	36	-0.3878	5.02679947541018e-10	32593151	32600962	0.000553086906511954	32693779	32713363
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32711957	32728487	10	10	-1.8896	0.000553086906511954	32693779	32713363	0.000520993872175861	32721872	32734957
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	32762061	13	13	-0.6336	0.000520993872175861	32721872	32734957	1.06274322714240e-16	32736223	32767722
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32766023	32766023	1	0	NA	1.0627432271424e-16	32736223	32767722	NA	NA	NA
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32767722	65767409	10646	10433	5e-04	NA	NA	NA	2.44274662154546e-13	65767409	65767409
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65769146	65771532	2	2	-1.4501	2.44274662154546e-13	65767409	65767409	8.43024367655806e-14	65771532	65771532
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65778663	152212601	27395	26870	-0.0024	8.43024367655806e-14	65771532	65771532	4.36868957827261e-20	152212601	152212601
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	152214049	152219251	4	4	-1.2245	4.36868957827261e-20	152212601	152212601	1.92160920322102e-19	152219251	152219251
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	152221798	165643653	4518	4438	-0.006	1.92160920322102e-19	152219251	152219251	5.94432502284044e-82	165643653	165643653
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	2.4657	5.94432502284044e-82	165643653	165643653	6.37060771909254e-82	165650610	165650610
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	166772903	454	445	0.0012	6.37060771909254e-82	165650610	165650610	2.33388983438763e-06	166767865	166774817
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	166774817	166785274	6	6	-0.5701	2.33388983438763e-06	166767865	166774817	3.91624847980203e-05	166782955	166795188
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	166788512	170753106	1344	1330	-0.0135	3.91624847980203e-05	166782955	166795188	NA	NA	NA
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	86771217	26140	25660	8e-04	NA	NA	NA	2.36244838766070e-10	86769476	86771217
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	86777920	86785324	4	4	-0.9267	2.3624483876607e-10	86769476	86771217	2.67483368361499e-11	86785324	86790013
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	86789967	86789967	1	0	NA	2.67483368361499e-11	86785324	86790013	NA	NA	NA
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	86790013	100164752	4917	4825	0.0038	NA	NA	NA	5.39280674419876e-21	100164752	100164752
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100166257	100170227	2	2	-1.7695	5.39280674419876e-21	100164752	100164752	0	100170227	100170227
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100171204	100174991	2	2	-5.6351	0	100170227	100170227	8.54306580118058e-208	100174991	100174991
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100178968	147702365	21389	20975	0.0013	8.54306580118058e-208	100174991	100174991	7.22728207307774e-10	147702365	147702365
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.2793	7.22728207307774e-10	147702365	147702365	4.2278774462381e-09	147707161	147707161
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4160	-0.0085	4.2278774462381e-09	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	2234351	737	723	9e-04	NA	NA	NA	0	2234351	2234351
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2242849	2251011	4	4	-6.6949	0	2234351	2234351	0	2251011	2251011
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2257255	8143301	1663	1642	-0.0057	0	2251011	2251011	3.89679383768424e-10	7790934	8145219
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8145219	8182601	13	13	0.499	3.89679383768424e-10	7790934	8145219	6.78413869896255e-10	8179412	8193862
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8185460	39350798	10657	10454	-0.0015	6.78413869896255e-10	8179412	8193862	1.16905476796380e-15	39323411	39358419
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39475979	47	46	-0.3322	1.1690547679638e-15	39323411	39358419	2.74902286724872e-15	39465285	39493887
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39479971	40892587	453	449	-8e-04	2.74902286724872e-15	39465285	39493887	5.69547636649617e-139	40892587	40892587
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-4.6068	5.69547636649617e-139	40892587	40892587	6.3613461461955e-147	40897469	40897469
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	87258019	12245	12004	0.0011	6.3613461461955e-147	40897469	40897469	5.94743673277985e-10	87258019	87258019
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87259940	87262662	2	2	-1.2407	5.94743673277985e-10	87258019	87258019	6.3972727471791e-10	87262662	87262662
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87265435	98896527	3570	3506	-4e-04	6.3972727471791e-10	87262662	87262662	3.066232254292e-14	98896527	98896527
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	98898441	98901542	3	3	-1.2043	3.066232254292e-14	98896527	98896527	3.69597424720203e-14	98901542	98901542
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	98903372	142329141	13785	13527	0.0022	3.69597424720203e-14	98901542	98901542	2.67709061828053e-12	142329141	142329141
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	142331353	142334063	3	3	-1.1269	2.67709061828053e-12	142329141	142329141	4.42782809839221e-09	142334063	142336041
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	142336041	146264846	1382	1354	4e-04	4.42782809839221e-09	142334063	142336041	NA	NA	NA
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	11611097	4119	4028	-0.0013	NA	NA	NA	1.49673118699737e-15	11607342	11611097
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	11622688	11667942	7	7	-0.8092	1.49673118699737e-15	11607342	11611097	1.63347324387174e-14	11667942	11674649
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	11674649	100348045	18867	18527	-0.0057	1.63347324387174e-14	11667942	11674649	1.99342891146270e-44	100348045	100348045
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	-2.5913	1.9934289114627e-44	100348045	100348045	8.32860809137086e-43	100350814	100350814
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	112062107	3851	3789	-0.0143	8.32860809137086e-43	100350814	100350814	6.06382431019931e-119	112062107	112062107
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	112064860	112069192	2	2	-4.2369	6.06382431019931e-119	112062107	112062107	4.8118967863282e-108	112069192	112069192
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	112070666	140145683	11096	10880	0.0021	4.8118967863282e-108	112069192	112069192	NA	NA	NA
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9554	-0.0029	NA	NA	NA	4.84704868743978e-141	27038538	27038538
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-4.6778	4.84704868743978e-141	27038538	27038538	1.60072145963315e-146	27041812	27041812
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	45489823	4726	4621	-0.0107	1.60072145963315e-146	27041812	27041812	4.49464661832712e-32	45474003	46393097
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46384985	46568496	72	69	0.367	4.49464661832712e-32	45474003	46393097	2.70687956618359e-30	46552024	47060942
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47017598	77917893	10063	9865	-0.0016	2.70687956618359e-30	46552024	47060942	4.79617218405557e-135	77917893	77917893
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-4.5129	4.79617218405557e-135	77917893	77917893	1.18504422974511e-130	77928669	77928669
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	135285645	20214	19867	-5e-04	1.18504422974511e-130	77928669	77928669	NA	NA	NA
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	55118214	16905	16602	1e-04	NA	NA	NA	5.20332902236219e-51	55114405	55127355
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55217189	40	40	-0.6323	5.20332902236219e-51	55114405	55127355	9.35130036459216e-52	55205278	55221692
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	134450318	28359	27843	0.001	9.35130036459216e-52	55205278	55221692	NA	NA	NA
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	33854	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	59822	9523923	3741	3664	0.0042	NA	NA	NA	1.5583766827646e-184	9523923	9523923
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9554149	5	5	-3.4196	1.5583766827646e-184	9523923	9523923	1.96697782100263e-10	9554149	9554149
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	9610054	11	11	-1.1821	1.96697782100263e-10	9554149	9554149	2.10089125477639e-50	9604633	9610054
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	31173065	7400	7249	9e-04	2.10089125477639e-50	9604633	9610054	8.26388395208037e-19	31169263	31173065
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31177645	31248212	18	17	-0.5858	8.26388395208037e-19	31169263	31173065	1.33905231256687e-05	31242528	31257959
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31249495	31298659	22	21	-0.2611	1.33905231256687e-05	31242528	31257959	0.00109296834654437	31282463	31327151
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31299898	132289090	33963	33292	0.0016	0.00109296834654437	31282463	31327151	NA	NA	NA
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7193	-0.0058	NA	NA	NA	1.17864221814020e-177	37953582	37953582
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-5.2363	1.1786422181402e-177	37953582	37953582	1.16929811640577e-189	37957844	37957844
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4782	0.002	1.16929811640577e-189	37957844	37957844	8.28213722566131e-101	49964838	49964838
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-3.8243	8.28213722566131e-101	49964838	49964838	8.39901554932683e-99	49971732	49971732
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56657371	1805	1771	-0.0073	8.39901554932683e-99	49971732	49971732	1.32047824284707e-14	56610886	56658479
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56658479	56686863	15	15	0.5394	1.32047824284707e-14	56610886	56658479	2.19034213358010e-16	56685341	56691355
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56688605	71375082	3622	3566	-0.0053	2.1903421335801e-16	56685341	56691355	9.08343839808436e-233	71375082	71375082
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-5.5159	9.08343839808436e-233	71375082	71375082	1.32731713071007e-199	71377671	71377671
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	114123340	13979	13721	-0.0037	1.32731713071007e-199	71377671	71377671	NA	NA	NA
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18864561	8	8	-3e-04	NA	NA	NA	8.0699022667598e-05	18864561	19297767
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19271102	19441654	29	28	0.4048	8.0699022667598e-05	18864561	19297767	0.000172911281726771	19422841	19453177
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19442895	19465322	11	11	0.7925	0.000172911281726771	19422841	19453177	0.00125927136271082	19453177	19471494
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19467512	19494416	12	12	0.4379	0.00125927136271082	19453177	19471494	7.13189518383154e-07	19490630	19542388
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	73061942	19359	18958	-0.0014	7.13189518383154e-07	19490630	19542388	5.33988350239297e-96	73061942	73061942
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73092112	8	8	1.9	5.33988350239297e-96	73061942	73061942	3.41766888676043e-89	73092112	73092112
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	105597555	12215	12001	-7e-04	3.41766888676043e-89	73092112	73092112	1.69374150462353e-15	105594189	105602602
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	0.6591	1.69374150462353e-15	105594189	105602602	4.59418279720818e-14	105630089	105681007
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	106358491	231	222	-0.0471	4.59418279720818e-14	105630089	105681007	NA	NA	NA
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	75115806	21885	21466	-0.004	NA	NA	NA	3.45961919078636e-27	75115806	75115806
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	-2.0933	3.45961919078636e-27	75115806	75115806	1.05492178045621e-26	75119713	75119713
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	100298352	9435	9257	-0.003	1.05492178045621e-26	75119713	75119713	NA	NA	NA
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	14876356	5468	5378	-2e-04	NA	NA	NA	2.02863605202638e-11	14674185	14956252
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14956177	15029941	14	14	-0.5347	2.02863605202638e-11	14674185	14956252	6.84682821207745e-12	15023848	15039224
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15034210	54352394	8214	8053	0.0073	6.84682821207745e-12	15023848	15039224	5.26602026695926e-90	54352394	54366535
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54353978	54379839	10	10	-1.7414	5.26602026695926e-90	54352394	54366535	0.000599862734028909	54365385	54379839
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	54408446	6	6	0.6645	0.000599862734028909	54365385	54379839	1.10905987576415e-07	54400475	54424734
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54410800	75093957	6811	6685	0.0063	1.10905987576415e-07	54400475	54424734	1.78160704973345e-51	75093957	75093957
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	-2.8406	1.78160704973345e-51	75093957	75093957	1.71730148373417e-46	75100865	75100865
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	5047	-0.0046	1.71730148373417e-46	75100865	75100865	NA	NA	NA
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	78653545	29634	29028	0.0062	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	53092949	16199	15906	-0.0037	NA	NA	NA	6.8315177898455e-126	53092949	53092949
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-4.3097	6.8315177898455e-126	53092949	53092949	9.9526515775205e-125	53099601	53099601
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6636	-0.0094	9.9526515775205e-125	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	481	0.0266	NA	NA	NA	2.54764826276431e-15	1398325	1398325
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.7304	2.54764826276431e-15	1398325	1398325	1.05770700616643e-15	1400840	1400840
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	21533555	9041	8860	0.0177	1.05770700616643e-15	1400840	1400840	4.41724523251044e-07	21521399	21533555
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	21537835	21549627	5	5	0.6795	4.41724523251044e-07	21521399	21533555	1.75740980281592e-06	21549627	21555247
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	21553424	41532062	3608	3542	-7e-04	1.75740980281592e-06	21549627	21555247	2.07249154222137e-104	41532062	41532062
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	41533405	41538649	2	2	-4.1497	2.07249154222137e-104	41532062	41532062	3.22962397870163e-102	41538649	41538649
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	41542955	63788698	9909	9705	0.0161	3.22962397870163e-102	41538649	41538649	NA	NA	NA
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	577	-0.0069	NA	NA	NA	2.10972281420803e-189	1506379	1511632
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	9	-2.9652	2.10972281420803e-189	1506379	1511632	5.89023513151556e-245	1528899	1531162
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	20585	6e-04	5.89023513151556e-245	1528899	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13166	-0.0052	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	34364849	8950	8790	0.0043	NA	NA	NA	2.84804987394389e-07	34363125	34364849
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	34365961	34368094	2	2	1.1644	2.84804987394389e-07	34363125	34364849	1.16598844053039e-07	34368094	34369219
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	34369219	35472378	599	589	0.0134	1.16598844053039e-07	34368094	34369219	2.48066128925395e-114	35472378	35472378
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-4.3215	2.48066128925395e-114	35472378	35472378	8.50414394546413e-108	35476942	35476942
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6876	0.0049	8.50414394546413e-108	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	1528282	854	827	0.0172	NA	NA	NA	8.74125307451523e-10	1526804	1528282
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1529356	1530474	4	4	-0.9289	8.74125307451523e-10	1526804	1528282	1.92871452529249e-09	1530474	1533361
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1533361	2426938	682	666	-0.0081	1.92871452529249e-09	1530474	1533361	1.10765123479638e-10	2426938	2426938
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2428167	2428307	2	2	1.3743	1.10765123479638e-10	2426938	2426938	9.36680542206032e-10	2428307	2428307
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2430156	2674962	228	224	-2e-04	9.36680542206032e-10	2428307	2428307	1.02560996426250e-05	2669410	2674962
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2676476	2693493	8	8	-0.5334	1.0256099642625e-05	2669410	2674962	0.00257622073020824	2692523	2699364
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2695630	2708291	15	14	-0.0795	0.00257622073020824	2692523	2699364	2.36592069016332e-37	2708113	2711273
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	154442377	45102	44213	0.9627	2.36592069016332e-37	2708113	2711273	4.7396677136911e-154	154442377	154442377
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	4	-2.9566	4.7396677136911e-154	154442377	154442377	4.49316021560399e-109	154450309	154450309
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	28	0.9556	4.49316021560399e-109	154450309	154450309	3.22501395187825e-85	154582414	154586690
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	197	-0.0291	3.22501395187825e-85	154582414	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	120	-4.2963	NA	NA	NA	1.07455414934139e-26	3219200	3772482
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-1.383	1.07455414934139e-26	3219200	3772482	2.99892130313204e-13	5422507	6692482
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	169	-3.815	2.99892130313204e-13	5422507	6692482	6.52895511080213e-05	6995785	7258171
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7653082	159	159	-3.1105	6.52895511080213e-05	6995785	7258171	0.000607281291826413	7470010	7672477
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7723783	44	43	-4.1185	0.000607281291826413	7470010	7672477	1.41588157992272e-09	7719658	7723783
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7745143	9	9	-1.7931	1.41588157992272e-09	7719658	7723783	5.83228657979292e-08	7745143	7755522
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7749796	7905286	46	45	-3.7836	5.83228657979292e-08	7745143	7755522	7.37909255436138e-05	7893056	7905286
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7905553	7914104	3	3	-1.1413	7.37909255436138e-05	7893056	7905286	0.000153514554348557	7914104	7926989
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	8036254	24	24	-3.683	0.000153514554348557	7914104	7926989	0.000490885851716495	7942730	8069958
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8043008	8245608	55	50	-4.4956	0.000490885851716495	7942730	8069958	0.000122533163848131	8208164	8394759
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8251785	10513747	310	303	-3.8232	0.000122533163848131	8208164	8394759	3.85553586200038e-32	10512616	10535786
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	11673476	18	18	-0.9602	3.85553586200038e-32	10512616	10535786	1.4679062883295e-20	11660512	11698871
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	12537944	12	12	-4.6293	1.4679062883295e-20	11660512	11698871	6.58969889483381e-06	12533900	12554612
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12541506	12682301	55	52	-2.4683	6.58969889483381e-06	12533900	12554612	3.08584426356474e-05	12618263	12741404
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12926941	56	56	-3.6747	3.08584426356474e-05	12618263	12741404	2.57639912826444e-08	12905395	12960717
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12928074	13048283	47	44	-2.2186	2.57639912826444e-08	12905395	12960717	4.42389575483888e-05	13021620	13059372
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13050965	13104920	23	23	-3.6393	4.42389575483888e-05	13021620	13059372	1.19429821647918e-06	13090026	13104920
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13106723	13128515	9	9	-1.467	1.19429821647918e-06	13090026	13104920	2.42841485588194e-17	13128515	13129843
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	14343139	410	401	-4.2707	2.42841485588194e-17	13128515	13129843	1.04832034440244e-07	14326935	14352278
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14349668	14380301	18	18	-2.9278	1.04832034440244e-07	14326935	14352278	1.65143143445013e-11	14379418	14381372
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14381372	14407293	12	12	-4.5532	1.65143143445013e-11	14379418	14381372	0.000374541464654241	14404284	14419903
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14409145	14484126	47	47	-3.0688	0.000374541464654241	14404284	14419903	0.00128238785532065	14451317	14489801
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14484920	14508894	19	19	-4.1482	0.00128238785532065	14451317	14489801	4.50966058521654e-17	14506319	14526446
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	25	-1.6613	4.50966058521654e-17	14506319	14526446	2.53595266984946e-11	14572190	14581797
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14598838	6	6	-4.6061	2.53595266984946e-11	14572190	14581797	6.84302674519456e-15	14598838	14598838
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14601309	14644293	4	4	-1.0544	6.84302674519456e-15	14598838	14598838	4.47165478567317e-06	14644293	14684159
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	15201695	137	135	-3.9661	4.47165478567317e-06	14644293	14684159	0.000421058998805676	15171394	15221212
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15203221	15244060	18	18	-2.7362	0.000421058998805676	15171394	15221212	7.68657728679917e-07	15222741	15251900
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15244992	15523178	163	161	-4.1211	7.68657728679917e-07	15222741	15251900	6.92104231192673e-05	15448670	15695261
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	16177411	193	188	-3.5739	6.92104231192673e-05	15448670	15695261	3.13034568572784e-10	16082040	16264358
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16178192	21036503	729	714	-4.1691	3.13034568572784e-10	16082040	16264358	7.9301537573055e-07	21028489	21042490
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054519	6	6	-1.7912	7.9301537573055e-07	21028489	21042490	9.01038456835377e-09	21047798	21057446
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	22139807	261	252	-4.0952	9.01038456835377e-09	21047798	21057446	3.76715535033591e-13	22055660	22139807
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.8197	3.76715535033591e-13	22055660	22139807	3.14496136531129e-17	22177335	22178964
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	25737663	95	92	-4.3782	3.14496136531129e-17	22177335	22178964	8.50501508491195e-51	25737663	25737663
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26909069	17	16	-1.0849	8.50501508491195e-51	25737663	25737663	0.000374851247326196	26903353	26909069
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26913408	26920247	4	4	-2.2269	0.000374851247326196	26903353	26909069	2.58831677851556e-12	26920247	26920247
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26924187	26945893	10	10	-0.9087	2.58831677851556e-12	26920247	26920247	1.22008372868456e-18	26945893	26945893
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	26980386	5	5	-3.7016	1.22008372868456e-18	26945893	26945893	0.000723334668301741	26980386	26995399
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26984336	27019256	12	12	-1.6763	0.000723334668301741	26980386	26995399	1.03454717754101e-05	27009433	27019256
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27039222	4	4	-4.2679	1.03454717754101e-05	27009433	27019256	3.0772334330935e-31	27039222	27039222
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	27137064	16	16	-0.7076	3.0772334330935e-31	27039222	27039222	5.50821417162477e-15	27137064	27137064
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27163598	27171797	3	3	-3.6377	5.50821417162477e-15	27137064	27137064	1.04198884208216e-16	27171797	27171797
MSK_252152919081_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27172283	57440809	13	13	-0.5781	1.04198884208216e-16	27171797	27171797	NA	NA	NA
