Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	8280958	2581	2497	0.0196	NA	NA	NA	2.56931164854662e-07	8278832	8280958
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	8283325	8285554	2	2	-1.2778	2.56931164854662e-07	8278832	8280958	1.82470770553267e-08	8285554	8285554
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	8288503	15158665	2491	2415	0.0095	1.82470770553267e-08	8285554	8285554	7.50167170715046e-09	15158665	15158665
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	15160803	15162189	2	2	-1.305	7.50167170715046e-09	15158665	15158665	2.51976836750752e-08	15162189	15162189
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	15163929	16963812	719	702	0.007	2.51976836750752e-08	15162189	15162189	1.52364091309241e-08	16917759	16963812
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17080364	17127039	12	11	0.5747	1.52364091309241e-08	16917759	16963812	9.20423364495174e-09	17127039	17155989
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17148592	72537426	22087	21513	0.0033	9.20423364495174e-09	17127039	17155989	1.42192164493569e-18	72534975	72540240
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	0.722	1.42192164493569e-18	72534975	72540240	4.77981697351366e-20	72568009	72596993
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	110023268	11703	11402	0.002	4.77981697351366e-20	72568009	72596993	8.92562892978045e-14	110015739	110023268
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110041712	4	4	1.1269	8.92562892978045e-14	110015739	110023268	6.29065731432464e-14	110041712	110058441
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	150823073	5850	5666	0.0026	6.29065731432464e-14	110041712	110058441	3.57181176565639e-10	150818222	150839754
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150836481	1	0	NA	3.57181176565639e-10	150818222	150839754	NA	NA	NA
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836484	150851439	9	9	0.6482	NA	NA	NA	2.66559351875394e-13	150848509	150852858
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151022179	76	74	-0.048	2.66559351875394e-13	150848509	150852858	3.92188224022811e-08	151020826	151022179
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151024118	151024118	1	0	NA	3.92188224022811e-08	151020826	151022179	NA	NA	NA
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151026228	151036435	5	5	0.6817	NA	NA	NA	8.82590259785374e-06	151036435	151040463
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2603	0.008	8.82590259785374e-06	151036435	151040463	1.14416262206343e-48	157133150	157133150
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	2.981	1.14416262206343e-48	157133150	157133150	7.8138261444565e-52	157136342	157136342
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	200598243	15463	15036	4e-04	7.8138261444565e-52	157136342	157136342	6.36094119431413e-10	200584100	200612164
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200600795	200673525	28	27	-0.3663	6.36094119431413e-10	200584100	200612164	2.46374593995596e-09	200665389	200696309
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200676505	246828744	17304	16807	-4e-04	2.46374593995596e-09	200665389	200696309	1.82465113245813e-08	246811355	246828744
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246831381	246862029	17	17	0.4404	1.82465113245813e-08	246811355	246828744	1.24143288744316e-09	246862029	246882156
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246863179	247186514	98	95	-0.0103	1.24143288744316e-09	246862029	246882156	NA	NA	NA
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34556434	11526	11209	0.0027	NA	NA	NA	7.82492458447586e-11	34543992	34563081
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34558824	34589997	14	14	-0.5417	7.82492458447586e-11	34543992	34563081	5.62988578918802e-11	34580533	34597294
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	120013719	25781	25043	9e-04	5.62988578918802e-11	34580533	34597294	1.55857807042851e-07	120010886	120013719
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	120015554	120018279	3	3	-0.9885	1.55857807042851e-07	120010886	120013719	9.49664038008565e-08	120018279	120020134
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	120020134	180117780	19065	18557	-0.0048	9.49664038008565e-08	120018279	120020134	1.00786100915835e-16	180115198	180117780
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	180121271	180129680	6	6	-0.9978	1.00786100915835e-16	180115198	180117780	5.08832078104478e-16	180129680	180131608
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	180131608	242689978	21432	20805	-0.001	5.08832078104478e-16	180129680	180131608	NA	NA	NA
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10500	0.006	NA	NA	NA	5.32139321687756e-54	32074432	32074432
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	-3.0799	5.32139321687756e-54	32074432	32074432	4.80441464768828e-54	32080848	32080848
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	163989367	42689	41471	-5e-04	4.80441464768828e-54	32080848	32080848	1.10273108257469e-52	163989367	163997228
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163992903	163992903	1	0	NA	1.10273108257469e-52	163989367	163997228	NA	NA	NA
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164027724	8	8	1.5207	NA	NA	NA	0.0617067370419071	164001657	164042397
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	19	1.0702	0.0617067370419071	164001657	164042397	4.67657288601429e-63	164107951	164112873
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	187890040	7836	7620	2e-04	4.67657288601429e-63	164107951	164112873	2.11726559469337e-13	187887798	187891716
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	187891716	187901855	6	5	-0.98	2.11726559469337e-13	187887798	187891716	6.03013733968718e-13	187899237	187903422
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	187903422	196822133	3290	3202	-0.0093	6.03013733968718e-13	187899237	187903422	1.27779450732031e-21	196809098	196907040
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196957322	29	28	-0.5368	1.27779450732031e-21	196809098	196907040	4.35005327084669e-20	196945209	196964180
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196958467	199329592	955	922	-0.0231	4.35005327084669e-20	196945209	196964180	NA	NA	NA
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	34020	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	35882	9815760	3392	3307	0.0234	NA	NA	NA	8.6677277942299e-206	9815760	9815760
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.3876	8.6677277942299e-206	9815760	9815760	2.64670480376399e-229	9842644	9842644
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	39380124	7695	7513	-0.0033	2.64670480376399e-229	9842644	9842644	1.30675571273934e-10	39378128	39380124
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	39382435	39391819	5	5	-0.8729	1.30675571273934e-10	39378128	39380124	1.2639700617962e-10	39391819	39394123
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	39394123	68893816	7331	7102	-0.0112	1.2639700617962e-10	39391819	39394123	9.90491847135618e-12	68886020	68897538
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	68896316	69163312	18	18	0.4651	9.90491847135618e-12	68886020	68897538	6.9805862987781e-11	69144974	69677857
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69165814	185300314	34620	33619	-0.0045	6.9805862987781e-11	69144974	69677857	5.1842465771106e-26	185288943	185307166
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	185303810	185366325	28	28	0.5625	5.1842465771106e-26	185288943	185307166	5.225420033221e-25	185360592	185373822
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	185372424	190710812	1957	1913	-0.0014	5.225420033221e-25	185360592	185373822	3.2138411362221e-40	190701706	190735382
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190717801	190921041	65	63	-0.48	3.2138411362221e-40	190701706	190735382	7.74834394384749e-17	190910126	190940021
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190924564	191153613	45	45	0.0071	7.74834394384749e-17	190910126	190940021	NA	NA	NA
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	180644810	53766	52242	-0.0013	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	29950805	10587	10291	0.0027	NA	NA	NA	6.42517253828429e-12	29939288	29962849
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	29995247	10	10	0.6726	6.42517253828429e-12	29939288	29962849	5.05043646323204e-10	29992946	30000990
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29998009	32558677	1080	1054	0.0195	5.05043646323204e-10	29992946	30000990	2.19480389400593e-19	32543054	32567462
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32634977	18	17	0.7158	2.19480389400593e-19	32543054	32567462	8.1244098912822e-25	32628420	32653710
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32650672	79018959	14729	14310	-0.0011	8.1244098912822e-25	32628420	32653710	6.1160175959139e-28	79015901	79018959
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-0.8687	6.1160175959139e-28	79015901	79018959	3.76843584893890e-28	79091850	79095415
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	165643653	27872	27098	-0.005	3.7684358489389e-28	79091850	79095415	7.81599724429191e-47	165643653	165643653
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165649379	3	3	2.2989	7.81599724429191e-47	165643653	165643653	8.29932786135826e-43	165649379	165649379
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165650610	165650610	1	0	NA	8.29932786135826e-43	165649379	165649379	NA	NA	NA
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1751	0.0099	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	163711	12	12	0.5388	NA	NA	NA	1.34698193192464e-07	157816	183594
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	176344	8790893	3148	3061	0.0151	1.34698193192464e-07	157816	183594	2.49434813331767e-08	8783165	8790893
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	8793843	8829893	5	5	-0.8308	2.49434813331767e-08	8783165	8790893	5.53910543933339e-09	8829893	8838768
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	8838768	63516827	16150	15711	-0.0016	5.53910543933339e-09	8829893	8838768	1.20028776486504e-14	63513423	63523852
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	63523852	63544561	7	7	-0.8817	1.20028776486504e-14	63513423	63523852	1.02991181767995e-14	63542948	63546244
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	63546244	109217320	15639	15220	-0.0047	1.02991181767995e-14	63542948	63546244	2.23867809484187e-229	109217320	109217320
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109230336	109233214	3	3	-5.1635	2.23867809484187e-229	109217320	109217320	1.17035439581046e-232	109233214	109233214
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109236813	123868811	6637	6452	-0.0061	1.17035439581046e-232	109233214	109233214	3.6457410639782e-147	123865714	123871342
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	123871342	124036456	67	67	-0.879	3.6457410639782e-147	123865714	123871342	3.6110932239443e-135	124031008	124055051
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	124055051	126276522	971	944	0.0027	3.6110932239443e-135	124031008	124055051	9.48221057817636e-08	126271393	126276522
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	126279732	126292183	8	8	0.6076	9.48221057817636e-08	126271393	126276522	2.21928291964217e-07	126292183	126298856
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	126295264	141689547	7285	7064	0.0051	2.21928291964217e-07	126292183	126298856	0	141689547	141689547
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141690753	141690753	1	0	NA	0	141689547	141689547	NA	NA	NA
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	-3.5263	NA	NA	NA	4.73376435111139e-251	141714168	141714168
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	142140540	164	159	0.1499	4.73376435111139e-251	141714168	141714168	8.93534831602345e-07	142112002	142161005
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142141101	142194531	15	15	0.5849	8.93534831602345e-07	142112002	142161005	2.5662675711544e-15	142187097	142202274
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142196011	147702365	2333	2281	-0.0113	2.5662675711544e-15	142187097	142202274	2.53565830461119e-12	147699576	147704200
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147710037	4	4	-1.1009	2.53565830461119e-12	147699576	147704200	1.45545868109801e-11	147708382	147711471
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147711471	158821263	4236	4129	-0.003	1.45545868109801e-11	147708382	147711471	NA	NA	NA
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	25022606	8129	7894	-7e-04	NA	NA	NA	3.60377071389443e-18	25022606	25022606
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	1.5101	3.60377071389443e-18	25022606	25022606	9.52920241568551e-16	25039370	25057567
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	25047250	1	0	NA	9.52920241568551e-16	25039370	25057567	NA	NA	NA
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25057567	25120552	26	25	-0.0249	NA	NA	NA	9.60846255727246e-22	25120552	25120552
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	9.60846255727246e-22	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	2.3804	NA	NA	NA	1.36738066058872e-32	25125700	25125700
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	39350798	4912	4758	-0.0094	1.36738066058872e-32	25125700	25125700	1.44039939849598e-64	39341524	39352361
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	56	0.6253	1.44039939849598e-64	39341524	39352361	8.32635527011569e-64	39504332	39509423
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	76089773	9934	9646	-0.0018	8.32635527011569e-64	39504332	39509423	1.2245162748349e-07	76070684	76097467
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	76092163	76138492	18	18	0.3959	1.2245162748349e-07	76070684	76097467	5.16059468027372e-08	76124906	76166692
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	76145147	85422157	2153	2090	0.0023	5.16059468027372e-08	76124906	76166692	7.07195300061733e-12	85420037	85422157
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	85423938	85431319	5	4	-1.0028	7.07195300061733e-12	85420037	85422157	1.27759797234429e-10	85431319	85434122
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	85434122	146264846	19323	18793	0.004	1.27759797234429e-10	85431319	85434122	NA	NA	NA
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	140145683	37944	36838	-0.0035	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	766548	289	277	0.0202	NA	NA	NA	6.06622709778092e-08	763625	766548
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	771247	774846	2	2	1.292	6.06622709778092e-08	763625	766548	3.96187671466026e-09	774846	777917
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	777917	27038538	9438	9162	-0.0076	3.96187671466026e-09	774846	777917	3.72496842393707e-112	27038538	27038538
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-4.406	3.72496842393707e-112	27038538	27038538	1.27407381573965e-111	27041812	27041812
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	45487335	4725	4584	-0.0108	1.27407381573965e-111	27041812	27041812	3.86209077718716e-56	45476905	46384985
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	45489823	46568496	73	72	-0.5359	3.86209077718716e-56	45476905	46384985	2.89084711051249e-57	46556477	47040444
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47017598	77917893	10063	9789	-0.0059	2.89084711051249e-57	46556477	47040444	2.57532855023376e-103	77917893	77917893
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-4.2497	2.57532855023376e-103	77917893	77917893	1.18601735477273e-100	77928669	77928669
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	114100979	12393	12048	0.0054	1.18601735477273e-100	77928669	77928669	1.55992123796035e-58	114100979	114100979
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114103547	114106460	2	2	-3.2489	1.55992123796035e-58	114100979	114100979	2.06541907350484e-57	114106460	114106460
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114108041	134739406	7608	7402	0.0065	2.06541907350484e-57	114106460	114106460	9.83490760134277e-09	134736198	134739406
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	134740920	134743423	2	2	1.3171	9.83490760134277e-09	134736198	134739406	1.67386760249321e-06	134743423	134746574
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	134746574	135285645	209	204	0.0213	1.67386760249321e-06	134743423	134746574	NA	NA	NA
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	1101451	362	354	0.0121	NA	NA	NA	1.95778025577624e-05	1099119	1101451
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	1103180	1105351	4	4	0.8709	1.95778025577624e-05	1099119	1101451	1.53741888911561e-07	1105351	1107301
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	1106234	48330328	16148	15701	0.0045	1.53741888911561e-07	1105351	1107301	8.44642521027701e-61	48322375	48345272
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	48332029	49001848	56	53	-0.6433	8.44642521027701e-61	48322375	48345272	6.34341517124977e-59	48959014	49075237
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49032039	83501039	11064	10724	0.0022	6.34341517124977e-59	48959014	49075237	4.01229798767678e-09	83496749	83507669
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	83504673	83504673	1	0	NA	4.01229798767678e-09	83496749	83507669	NA	NA	NA
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	83505923	83521532	10	9	0.6365	NA	NA	NA	2.03570378418042e-09	83517613	83525209
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	83522972	134450318	17659	17186	0.005	2.03570378418042e-09	83517613	83525209	NA	NA	NA
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9528590	3743	3630	0.0107	NA	NA	NA	1.60994380465181e-72	9528590	9528590
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9531133	9554149	4	4	-2.5535	1.60994380465181e-72	9528590	9528590	8.7774725785168e-12	9550789	9554149
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	9607363	10	10	-0.5386	8.7774725785168e-12	9550789	9554149	7.18129853252888e-07	9582696	9628897
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9610054	11104973	568	557	-0.0431	7.18129853252888e-07	9582696	9628897	2.53791923455609e-34	11104973	11109483
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11109483	11140421	11	11	0.9965	2.53791923455609e-34	11104973	11109483	1.63838042666222e-29	11128557	11143592
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	132289090	40825	39679	0.0059	1.63838042666222e-29	11128557	11143592	NA	NA	NA
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7107	-0.0023	NA	NA	NA	1.49453696330913e-107	37953582	37953582
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-4.397	1.49453696330913e-107	37953582	37953582	8.18953591743685e-115	37957844	37957844
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4752	-6e-04	8.18953591743685e-115	37957844	37957844	3.16117657017377e-11	49964838	49964838
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	1.4089	3.16117657017377e-11	49964838	49964838	1.10916868784817e-10	49971732	49971732
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56658479	1806	1771	-6e-04	1.10916868784817e-10	49971732	49971732	1.43917388964093e-15	56650373	56658479
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56660235	56686863	14	12	0.6899	1.43917388964093e-15	56650373	56658479	3.95012524455335e-17	56686863	56691355
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56688605	89659397	8252	8012	-0.0027	3.95012524455335e-17	56686863	56691355	7.47436954879175e-25	89659397	89659397
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	-2.0399	7.47436954879175e-25	89659397	89659397	2.98474574553863e-24	89662326	89662326
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	99417382	4212	4111	-0.0028	2.98474574553863e-24	89662326	89662326	1.51901683301361e-07	99414403	99417382
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	99419235	99421920	2	2	1.1554	1.51901683301361e-07	99414403	99417382	1.71640423149126e-06	99421920	99423114
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	99423114	100690991	571	553	-0.0061	1.71640423149126e-06	99421920	99423114	5.39793901298996e-154	100690991	100690991
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-5.5078	5.39793901298996e-154	100690991	100690991	4.67214106136356e-172	100693892	100693892
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	113788788	4410	4297	0.0055	4.67214106136356e-172	100693892	100693892	6.0296451655925e-18	113788788	113788788
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113791151	113792974	2	2	1.8152	6.0296451655925e-18	113788788	113788788	1.05317707458415e-14	113792974	113792974
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113794669	114123340	150	148	0.0261	1.05317707458415e-14	113792974	113792974	NA	NA	NA
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	72595934	19184	18661	7e-04	NA	NA	NA	2.02302447848257e-10	72594326	72595934
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	72597009	72600731	3	3	-1.0589	2.02302447848257e-10	72594326	72595934	8.9479311862331e-07	72600731	72602517
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	72602517	73071404	233	227	-0.0271	8.9479311862331e-07	72600731	72602517	3.2775531737431e-18	73061942	73071404
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73092112	7	7	-1.1362	3.2775531737431e-18	73061942	73071404	3.13183770723238e-23	73092112	73101327
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	79174722	2914	2833	0.001	3.13183770723238e-23	73092112	73101327	2.55941527367241e-141	79174722	79174722
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79176037	79183154	4	4	-3.6817	2.55941527367241e-141	79174722	79174722	4.86828350937458e-143	79183154	79183154
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	105848335	9356	9092	1e-04	4.86828350937458e-143	79183154	79183154	1.11102237052761e-11	105843086	105848335
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105850033	105881893	8	8	0.7642	1.11102237052761e-11	105843086	105848335	2.93419300410484e-11	105881893	105898108
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	106358491	176	171	0.0046	2.93419300410484e-11	105881893	105898108	NA	NA	NA
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	74669752	21711	21152	-0.0018	NA	NA	NA	3.37817891188444e-245	74669752	74669752
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-4.6999	3.37817891188444e-245	74669752	74669752	4.75970874537387e-242	74680439	74680439
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	100298352	9607	9335	0.0017	4.75970874537387e-242	74680439	74680439	NA	NA	NA
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	34329518	10709	10423	-0.003	NA	NA	NA	2.47435191393032e-16	34297461	34357366
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34333833	34602318	50	50	0.3588	2.47435191393032e-16	34297461	34357366	7.21143888388737e-17	34568749	34635765
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34617260	57203733	4150	4035	-0.0037	7.21143888388737e-17	34568749	34635765	4.27721295566923e-51	57203733	57203733
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	-3.1007	4.27721295566923e-51	57203733	57203733	9.21367870060156e-52	57206772	57206772
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	76925748	6225	6061	-5e-04	9.21367870060156e-52	57206772	57206772	1.32535977882950e-268	76925748	76925748
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	-3.5325	1.3253597788295e-268	76925748	76925748	2.09256239445018e-254	76940218	76940218
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	79817743	959	934	0.0034	2.09256239445018e-254	76940218	76940218	3.38246392639006e-20	79816140	79819892
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	79819892	79836487	10	10	-0.8704	3.38246392639006e-20	79816140	79819892	1.8812989359194e-19	79832497	79838076
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	79838076	88690571	3544	3439	0.0021	1.8812989359194e-19	79832497	79838076	NA	NA	NA
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	31457889	12037	11697	6e-04	NA	NA	NA	1.08701127288045e-12	31441419	31468896
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31503774	19	19	-0.5106	1.08701127288045e-12	31441419	31468896	2.94028077356946e-12	31490899	31897238
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	31889566	1	0	NA	2.94028077356946e-12	31490899	31897238	NA	NA	NA
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31891535	36673853	1814	1775	-0.0138	NA	NA	NA	7.69893310266964e-55	36673853	36673853
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	1.8207	7.69893310266964e-55	36673853	36673853	2.89411952346921e-55	36684619	36684619
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41508943	2006	1948	0.005	2.89411952346921e-55	36684619	36684619	2.52074030159599e-09	41481857	41527705
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41512318	41601281	44	42	-0.2852	2.52074030159599e-09	41481857	41527705	2.44489682386293e-08	41581624	41644148
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41602646	78653545	13707	13304	0.0014	2.44489682386293e-08	41581624	41644148	NA	NA	NA
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22343	-0.0053	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	423647	85	82	0.0705	NA	NA	NA	4.0638657193118e-06	410015	426614
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	425082	470998	16	15	0.5331	4.0638657193118e-06	410015	426614	1.02585973024828e-09	463510	485055
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	477932	63788698	22958	22329	0.0038	1.02585973024828e-09	463510	485055	NA	NA	NA
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1511632	587	567	-0.0113	NA	NA	NA	4.71977174916319e-114	1511632	1511632
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1515948	1531162	8	7	-2.7512	4.71977174916319e-114	1511632	1511632	2.20411716464776e-144	1531162	1531162
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	20367	0.0025	2.20411716464776e-144	1531162	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	10057408	11	11	-0.5877	NA	NA	NA	9.8408876710557e-10	10004854	10101956
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	10075714	46922972	13430	13046	-0.0026	9.8408876710557e-10	10004854	10101956	NA	NA	NA
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22644243	2982	2898	-0.0089	NA	NA	NA	1.09868119215884e-28	22643742	22682428
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22667608	22667608	1	0	NA	1.09868119215884e-28	22643742	22682428	NA	NA	NA
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	22	0.7326	NA	NA	NA	1.43939089308519e-28	22718614	22736990
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	49571068	13552	13155	0.0076	1.43939089308519e-28	22718614	22736990	NA	NA	NA
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	124528	29	27	0.0731	NA	NA	NA	1.60394786431051e-46	124528	124528
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	5	1.6036	1.60394786431051e-46	124528	124528	2.77628800227882e-33	130528	130528
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	2638587	1692	1629	0.0031	2.77628800227882e-33	130528	130528	5.07169212567229e-07	2636208	2638587
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2640451	2642054	3	3	0.9764	5.07169212567229e-07	2636208	2638587	6.25407270040308e-09	2642054	2642145
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2642145	2708291	64	60	-0.1062	6.25407270040308e-09	2642054	2642145	8.84137657204952e-140	2708113	2711273
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	8450789	1790	1742	0.9462	8.84137657204952e-140	2708113	2711273	8.51573902587146e-09	8445177	8456422
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8452395	8473482	9	9	0.2537	8.51573902587146e-09	8445177	8456422	1.03821279004466e-10	8465433	8477126
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8475091	33948621	10190	9929	0.972	1.03821279004466e-10	8465433	8477126	3.5214065401193e-16	33939974	33948621
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	33953232	33981492	5	5	-0.1994	3.5214065401193e-16	33939974	33948621	7.29423071178945e-15	33981492	33988646
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	33988646	152655026	32467	31570	0.962	7.29423071178945e-15	33981492	33988646	9.70986271510371e-09	152652738	152655026
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152656332	152657445	2	2	-0.4788	9.70986271510371e-09	152652738	152655026	7.91288138826152e-07	152657445	152669192
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152669192	154028488	535	514	0.8897	7.91288138826152e-07	152657445	152669192	1.83781996428935e-05	154010542	154037006
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154031239	154070953	12	12	1.3951	1.83781996428935e-05	154010542	154037006	8.2548212247221e-07	154054530	154088378
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154078401	154582414	124	116	0.9534	8.2548212247221e-07	154054530	154088378	6.41583117748271e-204	154578922	154586690
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	194	-0.01	6.41583117748271e-204	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	122	-3.8338	NA	NA	NA	6.25441470795103e-32	3223585	3773948
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-0.8091	6.25441470795103e-32	3223585	3773948	5.13621488662985e-16	5422507	6688691
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6998513	140	136	-3.5237	5.13621488662985e-16	5422507	6688691	0.00013314790800625	6971636	6998513
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6999891	7013903	9	9	-1.656	0.00013314790800625	6971636	6998513	5.41008080219907e-07	7013903	7017919
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7016002	7054924	26	25	-3.6117	5.41008080219907e-07	7013903	7017919	0.00438766541677834	7045224	7211779
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7485594	126	125	-2.5382	0.00438766541677834	7045224	7211779	8.50853418760728e-06	7367173	7614571
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7491280	7709619	68	64	-3.5169	8.50853418760728e-06	7367173	7614571	0.00131371446858418	7677056	7719658
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7782532	27	26	-2.4021	0.00131371446858418	7677056	7719658	0.00528024870626711	7740903	7841425
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	8057124	68	66	-3.3398	0.00528024870626711	7740903	7841425	0.00104996029233418	7859390	8090502
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8058483	8280065	56	54	-4.0883	0.00104996029233418	7859390	8090502	1.19581968518902e-05	8218072	8340407
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8289709	8641679	100	97	-3.2912	1.19581968518902e-05	8218072	8340407	0.00093362787682292	8583720	8652693
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8647327	8685946	11	11	-2.0234	0.00093362787682292	8583720	8652693	8.33387225947306e-07	8681965	8692156
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8687580	10513747	194	183	-3.676	8.33387225947306e-07	8681965	8692156	6.42791367295586e-29	10512616	10513747
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	13	-0.5922	6.42791367295586e-29	10512616	10513747	0.0856066185507017	10631941	11673476
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12452734	7	7	-2.0633	0.0856066185507017	10631941	11673476	0.00594308794357542	10655750	12502304
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12541506	11	11	-4.3153	0.00594308794357542	10655750	12502304	2.54372978864834e-11	12537944	12545716
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	53	-1.9366	2.54372978864834e-11	12537944	12545716	1.39420151599583e-09	12661168	12682301
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12733867	9	9	-4.29	1.39420151599583e-09	12661168	12682301	0.000194127443300376	12733867	12786515
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12741404	12926941	47	45	-2.8393	0.000194127443300376	12733867	12786515	0.0079812056636209	12890628	13022741
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12928074	13104920	70	67	-2.0477	0.0079812056636209	12890628	13022741	0.254606721971726	12959689	13109337
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13106723	13128515	9	9	-1.046	0.254606721971726	12959689	13109337	2.58105348102377e-14	13128515	13133803
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13922080	280	267	-3.7653	2.58105348102377e-14	13128515	13133803	1.69667617823967e-05	13781193	13956735
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13922951	14122129	98	96	-4.3404	1.69667617823967e-05	13781193	13956735	0.0285915143541759	14084989	14338189
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14343139	32	32	-3.7341	0.0285915143541759	14084989	14338189	0.0301168595698548	14273899	14416385
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14349668	14480242	74	69	-2.9184	0.0301168595698548	14273899	14416385	0.0346933533464698	14386474	14491287
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14481337	14508021	21	20	-3.8058	0.0346933533464698	14386474	14491287	6.99833124026911e-10	14506319	14528771
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14579298	26	25	-1.6223	6.99833124026911e-10	14506319	14528771	0.000201186250786226	14561228	14579298
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14598838	6	6	-3.8727	0.000201186250786226	14561228	14579298	7.74147786644364e-15	14598838	14598838
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14601309	14644293	4	4	-0.9026	7.74147786644364e-15	14598838	14598838	0.000281003902236374	14644293	14687556
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	15920478	408	398	-3.5624	0.000281003902236374	14644293	14687556	7.91386398587683e-06	15713288	16006096
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15928904	16177411	103	99	-2.8654	7.91386398587683e-06	15713288	16006096	4.85496230412133e-11	16110790	16218742
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16178192	21036411	728	697	-3.7278	4.85496230412133e-11	16110790	16218742	3.29886940908725e-05	21025500	21042490
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21036503	21036503	1	0	NA	3.29886940908725e-05	21025500	21042490	NA	NA	NA
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054519	6	6	-1.4598	NA	NA	NA	6.88358510533937e-07	21047798	21060047
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	21689031	164	157	-3.7203	6.88358510533937e-07	21047798	21060047	0.000474075987792886	21666200	21693809
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21691199	21761022	12	11	-2.4239	0.000474075987792886	21666200	21693809	2.04850123258029e-07	21708241	21775274
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21763911	22139807	85	83	-3.864	2.04850123258029e-07	21708241	21775274	1.98763693300339e-19	22058759	22139807
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.3933	1.98763693300339e-19	22058759	22139807	1.66902512271084e-16	22177335	22178964
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	25737663	95	91	-4.0126	1.66902512271084e-16	22177335	22178964	2.87075133429153e-62	23283689	26872527
MSK_252152919082_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	57440809	84	79	-1.3048	2.87075133429153e-62	23283689	26872527	NA	NA	NA
